1J6ZA

Uncomplexed actin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN ALPHA 1
publication title The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 125
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1j6zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1j6zA04
1KXPA 2IIRA 4M63C 4DQ8A 1S3XA 2P9IB 3J8AA 1GLFO 2HF4A 4FPBA 4H0XB 2NZTA 4BRKA 2IVOA 3MMVA 4CZMA 4BRFA 4IZ9A 5FPDA 2F9WA 2P9UA 4JHDA 1YAGA 1Z05A 3LDPA 1NGBA 2Q31A 3GDQA 1GLLO 3H6EA 5JLFA 3VEZA 1E4GT 4BROA 3VEWA 4GNIA 3QMLA 5BREA 1Z6RA 4M7YA 4BGAA 2W41A 1V4TA 5ADXA 4H0OA 4WQ4C 5BRFA 5BN8A 2Q36A 4BC4A 1YXQA 4H03B 5FPMA 2A42A 3DAWA 3VEOA 2QW9A 3SMPA 3O8MA 1QHAA 5BRHA 4BRGA 3L0QA 2V52B 4B1VA 1IJJA 3GBTA 2V7YA 1RFQA 2QWQA 2VWBA 3O4WA 3SLCA 2NLXA 1DGKN 3O5BA 4BG9A 3D2EA 1X9JA 4Z94A 3HZ6A 4FWMA 3FE1A 2KHOA 3JXUA 5BPLA 4XH4A 4WQ5C 3VEYA 1KAZA 1C0FA 3GE1A 4BRDA 4RWTA 2D0PA 3ZETB 2A40A 2P9LB 4B1XB 4MO5A 1KAYA 3B8AX 5KPTA 4BR9A 2YJFA 1GLAG 2I7PA 2AA4A 1XQSC 2GUPA 3FZKA 4BVOA 3C7NB 4BR7A 3FZMA 1U2VB 4I6MB 2EWSA 5AQHA 5AQIA 4CZIA 4BRAA 2ASPA 4BRIA 3D2FA 4A2BA 4BRHA 2H3GX 2ZGZA 3ZEUA 1HX1A 2UYTA 3LDOA 3I33A 3WXLA 4NO7A 3IDHA 3WQUA 4A61A 2Q0UA 3TPQA 5E84A 1V4SA 3DXMB 1TUUA 2P9NB 3AARA 1QQOA 3ENOA 3F9MA 2P9IA 3MN7A 3O08A 3OHRA 4FWPA 5BN9A 3VGKA 3FFKB 5LJVA 3C0BA 1T44A 3O1BA 1NGFA 3BEXA 4O5FA 3VF6A 1XUPO 1NGHA 1WUAA 4PKHA 4RCHA 5JMVA 1HKCA 3QB0A 2P9PB 1GLDG 4M7XA 3M1FA 3FLCO 4DB3A 2PAVA 4XH1A 4H0TB 5BPNA 1E4FT 3BUZB 4L3QA 5AQPA 2CH5A 3IFRA 3CJBA 2OANA 3H46O 3U8XA 4AM7A 3QBWA 5AQJA 4BRLA 3M6GA 2F9TA 4BRPA 4PL8A 4MLEA 4CD1A 3FZFA 1LOTB 4A2AA 2WUSA 3IMXA 3EZWA 2FSNA 3VEVA 5BRDA 4CZGA 4IJNA 4K43A 3ULEB 1S22A 4XH5A 4B1ZA 3AY9A 2GWJA 5AZIB 1RDWX 1IG8A 3G25A 2FXUA 5F2RA 3EL2A 4K41A 4BC3A 4FOEA 3MN6A 3WEEA 1EQYA 3EO3A 3LM9A 2A6AA 3A8YA 3TU5A 5EX5A 3SK3A 2ZWHA 5AQTA 2QWRA 3GL1A 1U2VA 4I6MA 3ENHA 3EKUA 3HI0A 4H0YB 1NBWA 5AQWA 1BWFO 4BRNA 3MK6A 1JCEA 3BP8A 2J4RA 1ATNA 1LCUA 3CETA 2Q0RA 3VF2A 3DXMA 2P9NA 4BR0A 4BR5A 1P8ZA 3ZX0A 3DXKB 1KAXA 1JCGA 1HLUA 2W40A 4CBUA 4HWIA 4DCHA 4WYBA 1NGJA 2E2QA 3UKRB 5LY3A 1QZ6A 3H3OB 2ZGYA 1YUWA 5AQMA 2GWKA 3HSCA 5AQNA 4CBWA 2I7NA 1H1VA 4FOIA 3QICA 3RSEB 4FWQA 5LJWA 1K8KA 3U4LA 1ZC6A 4HTLA 4IXCA 1YVNA 2YI1A 1MWKA 3VGMA 3P4IA 2CGKA 1GLEG 4IO8A 4MO4A 2HOEA 2FF6A 2E2NA 2YJEA 4B1WB 1JCFA 4JNEA 2QWPA 3EN9A 4PL7A 1NM1A 3ULEA 2YCHA 3VENA 2YHWA 3LM2A 3S41A 2GTDA 4O8KA 2CH6A 3WXJA 4H0VB 4FWLA 4FWNA 3QFPA 3QDKA 2FSJA 4CZJA 1RGIA 3VF4A 1BDGA 5I9EB 5B8HA 4Y0WA 2P9UB 2QWOA 1SAZA 1QZ5A 2BTFA 4H5RA 3FZHA 4H0PA 5EXWA 3MCPA 3CQYA 1SZ2A 2Q1NA 4B1YB 4BGBA 3R8EA 4IJAA 3FR0A 5AQFA 1BA0A 2E88A 1NGGA 3FZLA 3LDNA 3ZX3A 5F0XA 2CGJA 2P9KB 3DWLA 4FWOA 4CBXA 3A5NC 5KQ8A 4IWVA 3DXKA 2VCPA 1BOTO 3BF3A 3M3ZA 1CZAN 3D2EB 3MN9A 1HJOA 4K25A 1ZXOA 2P9SB 2ITMA 3BF1A 4K42A 4FPAA 4JD2B 1T6DA 1ESVA 3H3NO 5AQVA 4YDUA 3VEXA 4BR4A 4FWSA 3AAQA 3H45C 3WUHA 3U9DA 2QWLA 4KBOA 5KPRA 3LDQA 5EOYA 5AR0A 3H1VX 3ZETA 4E1JA 2P9LA 3LL3A 3VGLA 3A5LC 2E2OA 4EIAA 2CGLA 1OKJA 1TYQB 2FF3B 5ELZA 1ZBSA 4BQZA 3C7NA 5AQRA 3A5OC 3CJ7A 1GLCG 4CZEA 2NRHA 3WXKA 3CIPA 1NWKA 4PKIA 3ZEUB 4NB4A 1HKGA 3QFUA 5EVZA 4MLHA 2IVPA 3ATUA 1XC3A 4PKGA 2GELA 4H5NA 4CZLA 3DJCA 2GEMA 2ASOA 3U9ZA 3CJAA 3FGUA 4QS7A 4BREA 1G99A 3CHWA 5AQKA 3UKUB 2E20A 1HPMA 1NGIA 4FWKA 3L4IA 3ATVA 4FL9A 1HUXA 1HKBA 4LC9B 4EHTA 1WOQA 4BG8A 3ID8A 3A5MC 5AZJB 4BRCA 4CD3A 1ATSA 5BPMA 2QWNA 1BU6O 4H5TA 2P9PA 4J8FA 5AQUA 4EFHA 1X3MA 5FPEA 3VOVA 2A41A 5BR9A 1BA1A 3UB5A 4BC2A 3GG4A 3KHYA 4ISGA 3O6WA 2P9KA 4CJ7A 3W3DA 3HM8A 3JS6A 4JN4A 4WQ4A 3VPZA 1D4XA 2DPNA 2HMPA 2Q2RA 4CZHA 3I8BA 1NGCA 5E26A 3VETA 4H5WA 4BR2A 3CJCA 1MA9B 1Q18A 3R9PA 4BC5A 1MDUB 1NMDA 3O80A 5AQGA 2A5XA 3CI5A 2P9SA 3CJ1A 4CI6A 4JD2A 3O1WA 4DHYA 4B9QA 5AQLA 4C23A 1NGAA 2BUPA 4WQ5A 3SMSA 4JAXA 5AZIA 2E8AA 3WEEB 2AP1A 1NGDA 4QS8A 3QBXA 1Y64A 5AQYA 1SQKA 3SJHA 4FSVA 3W0LA 1BUPA 5AQOA 5JLHA 1ATRA 1TYQA 4JHDB 2E2PA 3KVGA 3WT0A 3MN5A 1T6CA 3HBTA 2VYPA 2FLOA 1R59O 1QQMA 2Q97A 3HTVA 3A0IX 4ISFA 4CZFA 1BG3A 3H1QA 4FWRA 2PBDA 1C0GA 3AAPA 4XEIA 1BO5O 4QS9A 1TUYA 1DEJA 5AQZA 3EKSA 3R6MA 5AFUH 4BRMA 3KZBA 1X3NA 3UE5A 3WQTA 4ISEA 4AM6A 1NLVA 4H5VA 2HF3A 1GLBG 3IUCA 5TKYA 3UKUA 3VERA 2A3ZA 1QQNA 4B1UB 4F9OA 2QXLA 2ZF5O 2IVNA 2D4WA 5AZJA 4YDUC 5FPNA 5AQSA 4RTFD 4FO0A 2ASMA 5JICA 3UKRA 3GOIA 1NGEA 2V51B 3ZX2A 3LDLA 5KQDA 4BVPA 2E1ZA 4GY2B 1K8KB 2QM1A 5AQQA 4CZKA 4BQLA 3RSEA 5F1XA 3L6QA 5ADXH 1J6ZA 4BRQA 5KPZA 5AQXA 4EAHD 1U6ZA 1DKGD 2FSKA 3D7EO 3CJ9A 3WXIA 2QWMA 5AFUA 4EHUA 2D0OA 1MWMA 3VESA 3D2FB 3MDQA 5EY4A 1GLJO 2V7ZA 2D1KA 3CQXA 2E1YA 5CE3A 2YHXA 3CERA 2YHYA 4A62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KTQA 4AHSA 4DQ8A 4LSNA 4A5BA 2E5LK 4CJSA 3J8AA 4FPBA 4DLEA 4CF0A 4N47A 1N8RO 4IZ9A 5FROA 5CYQA 3O9SA 3K5MA 3BDPA 3CCEN 2PY5A 4CFAA 1YHQN 4H8KA 1TKDA 1GLLO 1ZBHA 3SJJA 1CLQA 4FM1A 1S1XA 3HL8A 4M7YA 1XHXA 4WQ4C 5BRFA 4OKKA 1YXQA 3VEOA 3AA3A 2QW9A 4FLWA 2VGMA 5BRHA 4BRGA 4M42A 3CCSN 3GBTA 2V7YA 3E01A 4DV2K 2VWBA 4I2PA 4JI0K 2NLXA 1DGKN 3O5BA 3D2EA 3HZ6A 4LH5A 2YHBA 3ZT1A 1YI2N 3JXUA 5HOOA 4WQ5C 2HNYA 4CJRA 4KI6A 1IKWA 1KAZA 1S1VA 2ITGA 3GE1A 3J80O 2A40A 2P9LB 4B1XB 4W5TA 4JI6K 4AHRA 4CJTA 3B8AX 2XY5A 5KPTA 3CPEA 2QI2A 4BVOA 3I55N 4FJKA 2D0CA 4A59A 3VQDA 4CZIA 4B9NA 3AVIA 3D2FA 5C25A 3P38A 4AH9A 2NRVA 3HYFA 1HX1A 4BE0A 1K73O 3I33A 4NO7A 3IDHA 2RN2A 4J2AA 5HRSA 1NMNA 3TPQA 4B9TA 2NRRA 3E66A 4E7HA 2F8TA 2P9NB 3QEXA 2P9IA 4HCBA 3J81O 1JLAA 5LJVA 1T44A 3O1BA 1BHLA 5HBMA 1NGHA 1WSEA 4ELUA 2QKBA 3SZ2A 4Z4GA 4DSJA 4DB3A 4CJWA 1BL3A 2G8FA 3TABA 3NE6A 5AQPA 4HVJA 3IFRA 3H46O 4DR7K 4JKGA 3VN5A 3QBWA 3TTDA 1NNEA 3M6GA 4BRPA 3NDKA 1VSEA 3NBPA 4MLEA 4F3OA 2HNDA 1XMOK 3IMXA 3DLKA 3VEVA 4CZGA 4JKDA 3LAMA 4NCAA 5J1EA 4XH5A 2HMIA 2O4GA 3LZIA 1J5EK 3ZSXA 3OJUA 4NCGA 2QKKA 1WSIA 4BACA 3M8RA 5HRPA 3EO3A 4DR3K 4M3TA 2A6AA 4B9UA 2ZWHA 2QWRA 1YT3A 5SZTA 4I6MA 3ENHA 3EKUA 1XNRK 4KH4A 3QINA 4F2SA 5CHIA 1N33K 1NBWA 5AQWA 1BWFO 2YNHA 3MK6A 1I94K 2D0BA 1ATNA 2Q3SA 4CCHA 3QEVA 3LZJA 4FJ7A 1YITN 1U45A 3VF2A 4NYNA 4B8AB 4BEBA 4MQ3A 4CGJA 1NOZA 2PFUA 3LPTA 3V9XA 3RRHA 4JKAA 1P8ZA 3ZT2A 4FK0A 3QETA 4CBUA 5GIPA 4DTSA 2KTQA 4K8ZA 4CGFA 1S1UA 2E2QA 3UKRB 3H3OB 4XJXA 1KCFA 5AQMA 1WAFA 4N76A 3KWGA 1QQCA 3THXA 3QO9A 2I7NA 3QICA 4JKFA 2IGIA 3U4LA 4HTLA 4B9LA 2YI1A 3N4PA 1MWKA 3CCQN 3CG7A 4U7BA 4CEEA 4MO4A 3C6AA 1KFSA 2E2NA 4B1WB 5GAEP 1NK8A 3EN9A 1ASUA 4DR2K 4YOWA 3VENA 5TKWA 3SQ2A 5SWMA 2VG5A 4C8OA 4O8KA 1JJ2M 2Y1JA 2WOMA 4ID5A 1G15A 4FWLA 4E7KA 1W0HA 4DQSA 3VTIA 4CESA 5HL7L 3T69A 2OZSA 3SAHA 4ID1A 1SAZA 4AHCA 1QZ5A 2HBLA 1E3MA 4OGEA 3OS2A 5EXWA 1SZ2A 4MDAA 3PY8A 3R8EA 1RT6A 2ZJPL 3M8PA 2E88A 2Z1JA 3C94A 3ZT4A 1Q7YO 3TTFA 2C1IA 4M3UA 3C95A 5GAGP 3KLIA 2CGJA 3CFPA 1RTDA 2O8EA 3J7AP 4FWOA 4KKOA 4GV3A 4LFBK 4O0IA 4YOUA 3HPHA 4CVNE 2VCPA 3BF3A 1JLFA 1CZAN 4CK3A 3OYHA 3OS0A 4DG1A 2G8IA 2P9SB 1KRPA 4JD2B 3PSFA 1B9FA 3U9DA 3CCVN 4DV4K 3PLAA 3R3LA 3LDQA 3MXJA 4TSXA 2PZSA 4LY7A 4IOAL 4JEPA 1NKEA 4JRQA 3C65A 3H1VX 4GV6A 4M3XA 3KD5E 2FF3B 4WFAL 1P90A 4CZEA 3WXKA 3OYNA 1NWKA 4NB4A 3BZCA 3A2FA 3QFUA 4MLHA 3ZSRA 2IVPA 2BE2A 3MWTA 5M1PA 3U9ZA 3FGUA 3NF9A 3I56N 1G99A 5AQKA 3SBTA 4FM0A 4I9LA 5CY4A 4M41A 3HO1A 4IOXA 4M45A 2HHTA 1HUXA 1HKBA 4LC9B 4EHTA 3E1YA 3TR8A 5HROA 3A5MC 2O8FA 4Q0BA 1BU6O 2WONA 4BDZA 2E6LA 4J8FA 4EFHA 4AF1A 5LMUK 2HHWA 3OS1A 2O8CB 4KH5A 4U67L 1NOYA 4JK7A 1L3UA 1HQEA 4BWMA 4Y1CA 1VQ7N 3SPZA 3W3DA 3HM8A 4EP5A 4KTQA 2Q2RA 5E26A 5JVHL 5FLXO 1TAQA 2QXFA 4JI4K 1QHTA 3K9JA 3T1HK 1Q18A 4BC5A 1D5AA 3O80A 3ENBA 5AQGA 2A5XA 3CI5A 5JENA 3CJ1A 4CI6A 4OKJA 3V9WA 3DLBA 1BI4B 1ZBUA 5AQLA 4G1QA 3AVKA 2BUPA 3KK2A 2A1RA 1N6QA 3NGIA 4DFPA 3SMSA 5AZIA 3RWUA 4QS8A 2JWLA 5AQYA 5H1SQ 3SJHA 3J7ZO 1Q82O 2ZE2A 3F5TA 1K6YA 4JHDB 4LF4K 4FW2A 4F4KA 3DMJA 3NF6A 4RW9A 2Q97A 4CEZA 3HTVA 4CZFA 3O3GA 1QVFM 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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