1J6ZA

Uncomplexed actin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN ALPHA 1
molecule tags Contractile protein
total genus 125
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1j6zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1j6zA04
1Z6RA 4CZFA 3EL2A 2YJFA 3ZX3A 4H5RA 1NGIA 3FZKA 4BRQA 4CD1A 3C7NB 1KAZA 5AZIB 2ITMA 5FPDA 4FWNA 5FPEA 2QWMA 4XH4A 4B1UB 4BVOA 1JCFA 4BR2A 4NB4A 4B1XB 4EFHA 1XQSC 4JD2A 2P9LA 2FF3B 5CE3A 1MDUB 1QQNA 5AFUH 3QBXA 3G25A 4BC5A 5JLFA 5E26A 3DJCA 4K42A 4CZGA 1QQOA 2AA4A 3HI0A 5F0XA 1DGKN 3JS6A 3LDLA 4BRIA 4BRKA 4E1JA 1Y64A 3QFUA 3WT0A 5FPMA 2NRHA 4Y0WA 3RSEA 2ASPA 4Z94A 2J4RA 5AR0A 3O80A 3ID8A 3FZLA 3GL1A 2D0OA 3ZEUA 3GG4A 4CZHA 2ZF5O 4EAHD 1HUXA 2P9NA 3M6GA 3MN5A 2VYPA 1GLEG 1MWKA 4XH5A 4CZLA 2FF6A 2GWJA 5AZJB 1HPMA 3QB0A 3R8EA 4FO0A 2V7YA 2FXUA 4LC9B 3O8MA 3GE1A 1HLUA 2P9IB 3F9MA 4L3QA 3UKRB 2A3ZA 1Z05A 1HKCA 2Q0RA 5AQKA 2YJEA 5EVZA 2PBDA 4JHDA 2A41A 3U4LA 5EX5A 4GNIA 4FWPA 3SK3A 4CZMA 2IVPA 4FWQA 1JCEA 2V51B 1NMDA 5AQMA 3FGUA 1GLLO 2QXLA 4PKHA 3MN7A 1HKBA 2GELA 1TYQB 3QICA 4O8KA 2GTDA 3CI5A 5BRHA 4H0VB 5JMVA 2IVOA 5AQNA 3WXLA 4JNEA 3FFKB 1RGIA 3A8YA 5F2RA 2QW9A 1U2VB 2QWOA 1EQYA 4DQ8A 1TUYA 5ELZA 3C7NA 3H3OB 3ATVA 3O08A 3O6WA 4IZ9A 3H6EA 5AZIA 2Q97A 1IG8A 4FPBA 4EHTA 2QWLA 3S41A 1S22A 1NLVA 5AQUA 3MN9A 2UYTA 2Q31A 4H5VA 5LY3A 3QMLA 1HKGA 3C0BA 3J8AA 4CD3A 5BR9A 1C0GA 4IO8A 1MWMA 3O1WA 4I6MB 3BUZB 2VCPA 3GDQA 4O5FA 1IJJA 4BRCA 4BRLA 2ZWHA 2ZGZA 2CGKA 3IDHA 1SQKA 2E88A 3A5OC 2Q1NA 1YXQA 2A5XA 2P9KB 3AARA 3DAWA 3UKUB 4WYBA 4MLHA 3H1VX 1GLAG 3KZBA 5TKYA 1NGJA 2YHWA 3QFPA 4DCHA 2AP1A 4GY2B 5AQZA 3UE5A 3VERA 5AZJA 3VEWA 4YDUC 5ADXA 3EKUA 3JXUA 3LDOA 1ATSA 1BA1A 1E4FT 1NM1A 1XC3A 4H0OA 4F9OA 2P9IA 4IJAA 4AM7A 4CZIA 3UKRA 2PAVA 3VF4A 4PKGA 2FSKA 2D0PA 4BC4A 3BP8A 5AQTA 1NGFA 4FOEA 2P9SB 4BGBA 2QWRA 3L4IA 2ASOA 4BGAA 3BF1A 3MMVA 4K41A 3VGLA 1U6ZA 1ZC6A 3VETA 3IUCA 5AQLA 2QWPA 4A62A 1T6DA 3CERA 3VEXA 4BQZA 4K43A 5AQXA 4RCHA 5AQQA 1D4XA 3DXMB 5BN8A 3QBWA 4IXCA 4ISGA 3A5NC 5EOYA 4MO5A 1E4GT 4FPAA 4C23A 3SMSA 1KAYA 1TYQA 2FLOA 2WUSA 1KAXA 3UB5A 3VEYA 5AFUA 3R9PA 1KXPA 2GWKA 5KPTA 3LM9A 3A0IX 2W41A 4BRFA 4DB3A 3CJAA 3OHRA 5BN9A 1NGBA 2YCHA 4M7YA 3VEOA 1U2VA 2E2NA 4RTFD 4ISFA 5KPRA 2H3GX 1V4TA 4NO7A 3DWLA 4BRMA 1BG3A 1OKJA 2DPNA 3LDNA 1CZAN 3DXKB 2ASMA 1X3MA 1YUWA 2E2OA 3AAQA 4BROA 2E2PA 4H03B 5B8HA 5LJWA 1R59O 2YHYA 4WQ4A 3WQUA 3SJHA 4I6MA 4BRHA 2YI1A 4CBWA 5BPMA 3WUHA 4BC2A 1TUUA 1ZBSA 1YVNA 3CJ7A 4CBUA 2IIRA 3BEXA 2F9TA 2P9PB 4BREA 3CQXA 5AQOA 2P9KA 4QS7A 4A2BA 3I33A 4BRAA 3UKUA 4B9QA 3TPQA 3U9ZA 1WUAA 2CGJA 4B1WB 3TU5A 2CGLA 3VEVA 1QQMA 3SMPA 2QWNA 1NGCA 1G99A 3P4IA 1V4SA 1DKGD 4H0TB 3H45C 5AQIA 3I8BA 4BR9A 3HZ6A 5BREA 2NZTA 2D1KA 2E2QA 5AQRA 2IVNA 2ZGYA 4WQ5A 2EWSA 3WXJA 4BG8A 2V52B 3FZFA 5AQYA 4BVPA 5KQDA 1BUPA 3A5LC 2CH5A 4H0XB 4H5NA 2P9SA 1X9JA 5AQPA 3AY9A 2A42A 1NWKA 4XEIA 2A6AA 1BU6O 1NGGA 5JICA 4A61A 2FSNA 2D4WA 4BRPA 4BRGA 3DXMA 1BOTO 3EO3A 3GOIA 1BO5O 3QDKA 3L6QA 1GLJO 5F1XA 5EXWA 3ZETB 3LDPA 3VF2A 4MO4A 4HTLA 1H1VA 2P9UB 1S3XA 3D2EB 4WQ5C 4PL7A 5EY4A 2HMPA 3LM2A 3U9DA 2V7ZA 4CJ7A 4FOIA 2A40A 3MCPA 3LL3A 1J6ZA 5ADXH 3FZHA 3KHYA 4EIAA 3DXKA 3HTVA 1MA9B 4M7XA 5BRDA 3FE1A 4ISEA 2NLXA 3D2FB 2QWQA 2E8AA 1ATRA 2VWBA 3ENOA 1Q18A 1T44A 3EKSA 4H5WA 2OANA 1ATNA 3ZX0A 1NGAA 3WXIA 2KHOA 3ULEB 5KPZA 4CBXA 2CH6A 3CJCA 4DHYA 4IJNA 4BR0A 3CJ1A 3EN9A 4FWLA 3H1QA 1P8ZA 4M63C 1HJOA 3MDQA 4BQLA 5AQJA 2P9PA 1K8KB 3W0LA 3ENHA 1YAGA 3W3DA 3GBTA 3CHWA 4CZEA 3R6MA 3WEEB 3WQTA 1QZ5A 3MK6A 1GLDG 3CJBA 1QZ6A 4XH1A 2GEMA 2QM1A 4FL9A 4PL8A 3ZX2A 1LCUA 4FWOA 2I7NA 1DEJA 5E84A 1RFQA 1NBWA 3CQYA 4BR7A 4EHUA 1ESVA 1NGHA 3HSCA 5AQHA 3VOVA 4FWRA 4BC3A 5FPNA 4QS8A 3FLCO 3M3ZA 4H0PA 1GLBG 5BPLA 1X3NA 4BG9A 3O1BA 3SLCA 4B1ZA 4QS9A 5AQFA 3MN6A 3CIPA 5I9EB 4CZJA 4B1YB 1GLCG 1NGDA 1JCGA 3AAPA 4JD2B 2P9LB 2I7PA 3VESA 2HF4A 3H3NO 4H5TA 5BRFA 3ZETA 1BWFO 2W40A 3CETA 4BR4A 1SAZA 5AQVA 2Q0UA 5LJVA 4AM6A 1T6CA 4FWSA 1NGEA 2P9UA 3FZMA 3IFRA 3RSEB 2BUPA 3D2EA 1HX1A 5AQWA 1C0FA 4BRNA 5JLHA 1GLFO 1QHAA 2YHXA 3L0QA 4J8FA 4BRDA 4JN4A 4PKIA 3FR0A 3ZEUB 5BPNA 4FWKA 4WQ4C 2P9NB 1SZ2A 5AQGA 3B8AX 3VPZA 3KVGA 3M1FA 3D2FA 4IWVA 1LOTB 3CJ9A 4CZKA 5AQSA 1RDWX 2E20A 2BTFA 3VF6A 5KQ8A 3WXKA 3ULEA 4K25A 4MLEA 3HBTA 1ZXOA 1XUPO 1BDGA 4FWMA 3U8XA 3VGMA 2E1YA 2Q2RA 3HM8A 3ATUA 4YDUA 4A2AA 3H46O 2FSJA 4JHDB 1K8KA 3D7EO 4JAXA 3O4WA 3VEZA 2HF3A 3O5BA 4HWIA 2F9WA 2E1ZA 1WOQA 2HOEA 3A5MC 4FSVA 3WEEA 3VGKA 4B1VA 2GUPA 1BA0A 4KBOA 4H0YB 3VENA 4RWTA 3LDQA 4BR5A 3BF3A 3IMXA 2Q36A 4CI6A 3EZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LMUK 1LWEA 4CZFA 4FJ9A 4CHNA 5D3GA 4IOAL 2OPQA 4FJ5A 3O9UA 4DLEA 3ZX3A 3OYDA 2F96A 1NGIA 3O9SA 3C7NB 3L2UA 4JYAK 1KAZA 1WBBA 2ZQBA 4X65K 3MXMA 5FPEA 4DSIA 4OKEA 4PA1A 5KI6A 4C1NI 1KFDA 3NVKA 4EP4A 3AA3A 1U45A 2OTLN 4NB4A 1C6VA 2HHTA 3I8DA 2Y1IA 2P9LA 2FF3B 5CE3A 3TTFA 3SV4A 1UA1A 1QQNA 5CZ1A 3QBXA 3TANA 2EHGA 5E26A 4B3OA 1HNIA 2W6LA 4K42A 4E0DA 3NH0A 2PY5A 1QQOA 2AA4A 3HI0A 5F0XA 3JS6A 4BRKA 2R7YA 1NK9A 3LP2A 5FPMA 2NRHA 2VGMA 1TK8A 1IBLK 3AO2A 3MX2A 4F4KA 3O80A 3V9ZA 2O8DB 3GL1A 4JRQA 2NUBA 3RMBA 1KCFA 4ELVA 2ZF5O 3OYHA 2P9NA 3MN5A 4LFBK 1CXUA 2VYPA 4LF6K 5AZJB 3QB0A 1GOBA 5CYQA 4DV2K 2HBLA 3MEGA 4B8AB 2FXUA 3SQ1A 1FK9A 4JI2K 2P9IB 3F9MA 4C1NK 4J2EA 3SI6A 2O4GA 2QKKA 4J2AA 3RRHA 4CJEA 4KHPK 4E7LA 4B9NA 5EX5A 1IH7A 3IAYA 3AGKA 4CFAA 5AQMA 3FGUA 3P5JA 4CJTA 4CJQA 1HKBA 4DFKA 2GTDA 3CI5A 3AVJA 3WXLA 1X9MA 4JNEA 4JKCA 5F2RA 2QW9A 1U2VB 4WE1A 3T1HK 1HNXK 2WFBA 1TUYA 1VSFA 5DM6L 3H3OB 4IZ9A 2Q97A 3CM6A 3ENBA 1YVUA 4FLZA 1S1XA 4GVMA 1W9HA 1HQUA 3S41A 2G8UA 1XNQK 1NLVA 3HOTA 1FKOA 1TKDA 4DR2K 4H5VA 5LY3A 3QMLA 1HKGA 3C0BA 4DQPA 5C2FA 4I2QA 3E9PA 4I6MB 4ILGB 4XIUA 3BUZB 3GDQA 1IJJA 2ZWHA 5MLCQ 3T1YK 3SAFA 4FW2A 2Z1GA 1N34K 3OYIA 3PO5A 3H1VX 3RMDA 3KD5E 5TKYA 4DFMA 4FJLA 4M3YA 4C8OA 4AHUA 1VQ4N 4RW8A 1Q7YO 3JXUA 4KRFA 1ATSA 2P51A 1VK0A 5SWMA 2D0PA 4E7JA 5GAEP 4CF9A 3SQ0A 4BGBA 3L4IA 2XY8A 4JKEA 3BF1A 1BCMA 4A62A 3J7YP 5BN8A 5C15A 1VQMN 3QBWA 4BEBA 4IG0A 4MO5A 1Q8IA 2VWKA 3SMSA 3ZSXA 5E41A 1NNEA 1TYQA 3UB5A 2WUSA 5AFUA 5KPTA 3LM9A 5FROA 1C1CA 5FDLA 4Z4EA 1YF5L 3ZSQA 3O9TA 4N41A 1HRHA 1BG3A 2DPNA 1S1TA 1BL3A 1IO2A 1UA0A 1WN7A 3DRSA 3TAEA 1X3MA 4M41A 2OTJN 4BROA 4H03B 2NRVA 1R59O 1JLBA 2YHYA 4KPYA 4KH6A 4B3TK 3U3GA 4BRHA 4DG1A 4CGHA 4K8XA 1ZBSA 1F21A 2IIRA 3OS2A 3BEXA 3CQXA 1E3MA 3I33A 4KHQA 1W97L 2WOMA 4OPAA 1ZBLA 5GADP 1L3TA 1LAWA 1DLOA 2CGJA 4CGJA 3CMEN 1OVQA 1W0HA 3SQ4A 1NGCA 1G99A 3P4IA 4B9SA 4JEPA 3HZ6A 2E2QA 2YKMA 4KH5A 3RTVA 3AO5A 2BH1A 1YJWN 3EE9A 2ATQA 3FZFA 4JKHA 3L3UA 4H5NA 2YNIA 5AQPA 2OPRA 4JI3K 3PV8A 1NWKA 1EKEA 1YJNN 1HNZK 4W5QA 4A61A 5J2MA 5JVHL 3NFAA 3Q7CA 5F1XA 3KLEA 4M3TA 3DOLA 3AVNA 2KQ2A 1H1VA 3P83D 3ZSYA 4LF7K 1TAUA 3SAHA 4W5NA 4ELUA 4C8LA 4JI5K 2V7ZA 4FOIA 3MCPA 2JWLA 3LL3A 3OVNA 3KK3A 1KTQA 1KVCA 3DXKA 1MA9B 3FE1A 4PWDA 1XWLA 4C8MA 1VQ5N 1ATRA 1X9SA 1YTAA 2Z1IA 3V9SA 1QQCA 3PUFA 2OANA 2HSTA 2KW4A 3ULEB 3CJCA 1JLCA 2NRZA 4FWLA 3H1QA 2Z1JA 1P8ZA 2GUIA 4M63C 3HPHA 1HJOA 1S9EA 1JL2A 1FW6A 3ENHA 4CZEA 5M1OA 3NGZA 1QZ5A 1GLDG 1QZ6A 4QAGA 4B9TA 4TSXA 4PL8A 4KHUA 4OKJA 1LCUA 4FWOA 2I7NA 5LL6Z 4BR7A 1X1PA 2YX6A 3K58A 4EHUA 2W42A 1ESVA 4FWRA 2XHBA 2HNYA 4KFBA 5FPNA 2KKZA 3AA4A 3FLCO 3CMAN 1NK5A 4IEEA 4DQSA 4WFAL 1T05A 3AV9A 5AQFA 1NK0A 1DTTA 3MN6A 4FJHA 2WONA 4NLBA 3DMJA 1GLCG 3VQBA 3AO3A 3BGRA 3HOSA 1T7PA 2P9LB 2YNHA 1S6QA 2YHAA 4CESA 3OBYA 3MAQA 4FLYA 4LH4A 3V9UA 3V1QA 1T6CA 4FK0A 4FWSA 3IFRA 1NK8A 4CGIA 3CC4N 1HX1A 5AQWA 5HP1A 4BRNA 3L0QA 5BPNA 3HK2A 1GOCA 5KGXA 3O3FA 2FBTA 2P9NB 1XHZA 3VPZA 1IV0A 3KVGA 1QSYA 4IWVA 1LOTB 1LW0A 1XC9A 2KFNA 3MEDA 1REVA 2E20A 3QESA 4JI0K 3WXKA 1Q9YA 4FLXA 4HCBA 2GX9A 4WCEL 3AVMA 1WNSA 1XUPO 1BDGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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