1J6ZA

Uncomplexed actin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
molecule keywords ACTIN ALPHA 1
total genus 125
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1j6zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1j6zA04
2FXUA 1QQOA 4K43A 3LM2A 5AQXA 3CERA 4E1JA 4I6MB 4B9QA 3O6WA 1NM1A 2HF3A 3IDHA 4WQ5A 1X3MA 1LOTB 4FWMA 4MO4A 4RWTA 3FZHA 2D1KA 3O08A 3QDKA 4H5RA 2ZWHA 2E1YA 1KAZA 5BRHA 1BG3A 3QFPA 5AQMA 2P9PB 1OKJA 4Z94A 1TUYA 1DEJA 4BREA 5ADXA 3VENA 5AR0A 3RSEB 5JLHA 3BF1A 4H0PA 5BR9A 1GLAG 3C0BA 4BROA 3F9MA 5JMVA 4O8KA 3TPQA 4H0TB 1NGDA 1YXQA 3ATUA 4C23A 2Q1NA 5EOYA 1BWFO 5AQLA 5AQPA 4FWPA 4XH5A 2P9NA 3CETA 3QFUA 4CBXA 3EKSA 3HSCA 3ZEUB 1BUPA 3ZETA 3ZX0A 2H3GX 3DAWA 3SMSA 4RTFD 3IUCA 4H0XB 3VEOA 4BC5A 4IJAA 3A5LC 4AM7A 1BA1A 3O4WA 4BRCA 2F9WA 2IVOA 4RCHA 2E2PA 3EO3A 2Q2RA 4B1UB 2CGKA 2P9UA 4FL9A 3ZEUA 2ASMA 2ASOA 2YHXA 3M6GA 5AZIB 2P9NB 2P9IB 3VERA 5ADXH 1GLCG 4XH4A 5B8HA 4FWQA 2NLXA 3EL2A 3EZWA 4WQ5C 3LL3A 3AAPA 1KXPA 1GLEG 3EKUA 3QBXA 3R9PA 2YCHA 3VF6A 1HKBA 2QXLA 4WQ4A 4BRLA 2HMPA 2GWKA 2QWMA 1JCEA 1YUWA 2E20A 3L0QA 5LJVA 5AQGA 4JHDA 4EHTA 4GNIA 1RFQA 2E88A 4H03B 3M3ZA 3I8BA 4BRIA 4LC9B 3TU5A 4MLHA 2Q0UA 3A5MC 3I33A 4PKGA 4J8FA 3CJ1A 5FPNA 4BRKA 1P8ZA 4B1YB 1NGGA 2GWJA 4BR9A 4BVOA 4H5TA 4GY2B 2KHOA 4CZKA 4WYBA 3MCPA 4JHDB 3FLCO 5I9EB 2QWLA 3ZX2A 3FZKA 1MDUB 3MN9A 3O1BA 3O5BA 1NBWA 1IG8A 5AZIA 1R59O 4A62A 4EAHD 1Y64A 5E84A 4DCHA 3H45C 1BU6O 1E4GT 2V7YA 5AQZA 3EN9A 2HF4A 2AP1A 1GLDG 3OHRA 4BRMA 3UB5A 2I7NA 4KBOA 3U8XA 4CBUA 1H1VA 2ZGYA 3BEXA 5KPZA 3FZMA 4CD1A 5KQDA 3FGUA 5BRDA 2QWQA 4EIAA 1GLJO 3J8AA 1NGHA 5AQHA 4EHUA 3CJBA 3A5NC 3GE1A 2PAVA 4K25A 4BGAA 3ULEB 5BPLA 1NGJA 3BUZB 3L6QA 4MLEA 1SQKA 5EXWA 4HWIA 4IJNA 2P9IA 4K42A 5AQIA 2YJEA 4QS7A 3LDLA 3RSEA 4M63C 2EWSA 3UKUA 1TUUA 2FF6A 3VGKA 2Q0RA 1ZC6A 4BR2A 4BVPA 3DXKA 5AQKA 4CZFA 1HX1A 3CHWA 5EX5A 3LDPA 4FO0A 2P9SA 3L4IA 3SLCA 3ENHA 3DXKB 2ZGZA 3D2EB 3VGLA 2ITMA 3O8MA 3JS6A 4WQ4C 5F2RA 3C7NB 1V4TA 1NWKA 3HBTA 2W41A 3VPZA 3VF2A 3IFRA 5AQVA 3A5OC 3IMXA 3U9DA 4BC3A 2I7PA 1U2VA 2QM1A 2YHWA 1NGCA 3U9ZA 2GUPA 1JCGA 1ZBSA 1HPMA 4BG9A 2WUSA 1KAXA 3H3OB 4AM6A 1LCUA 3W3DA 2P9LB 3GOIA 5AQYA 5BRFA 4FWKA 5KPRA 4K41A 4QS9A 3HZ6A 4JNEA 3A0IX 2IVPA 3QBWA 2CH5A 4A2AA 1ESVA 4CI6A 4CZIA 4H5WA 1YAGA 4BR0A 2P9SB 2UYTA 4ISGA 3S41A 2AA4A 1E4FT 2P9KB 1EQYA 3D2EA 5BPMA 3H1QA 1S3XA 1Z6RA 1G99A 2Q97A 1T6CA 1BOTO 1K8KA 5AQTA 3H1VX 2P9PA 2BUPA 2D0OA 3O1WA 1C0GA 4CZGA 1XC3A 3M1FA 5AQOA 1WOQA 4BRQA 5AQQA 2OANA 1SAZA 4FWLA 3GBTA 1QZ5A 2E2NA 1QHAA 2P9KA 3FZLA 2V7ZA 3WEEB 1CZAN 4BC2A 2IIRA 3VGMA 1X9JA 2QWPA 4XH1A 5JICA 4FWOA 1NLVA 4CZHA 1SZ2A 1HLUA 3WT0A 3ULEA 2HOEA 5LJWA 2CGJA 3UKUB 2D4WA 4YDUC 5AZJA 2QWOA 2YHYA 2PBDA 4PKHA 3SMPA 2J4RA 2VCPA 2P9LA 2V52B 4JN4A 4QS8A 4CD3A 4NO7A 5BN9A 1GLBG 1WUAA 3ID8A 3WQTA 3WXJA 3VF4A 1T6DA 3QICA 5BREA 5FPMA 1C0FA 4H0YB 2A42A 4CZJA 3O80A 4BGBA 3G25A 3D7EO 1U6ZA 4Y0WA 5EY4A 4BRPA 3UKRB 3CQYA 3VEZA 3A8YA 1NGEA 5TKYA 4B1WB 1BO5O 3H46O 3B8AX 3FFKB 2YI1A 3ZETB 3MDQA 3MN6A 4H0VB 3H6EA 3LDQA 4NB4A 2A5XA 1XQSC 3VEWA 4CBWA 3KHYA 2VWBA 2V51B 5F1XA 1MA9B 4FWSA 3SK3A 3KVGA 2A6AA 3WQUA 4FPBA 4FOIA 4FSVA 4BR5A 2Q31A 3GL1A 5CE3A 4PKIA 2ASPA 2E2OA 1GLLO 3U4LA 4BR7A 2FSJA 1D4XA 3R8EA 3VETA 2DPNA 3VEYA 2NRHA 3HI0A 4BRNA 3C7NA 1NGBA 1Q18A 1S22A 3MN7A 2IVNA 1QQMA 4JAXA 5FPDA 3CJAA 4EFHA 4F9OA 5LY3A 3DJCA 3AAQA 3CJ9A 4H0OA 4CZEA 3ATVA 3VEXA 5AQRA 5KPTA 1ATNA 3ZX3A 4B1XB 4CZLA 5BN8A 1NGAA 2ZF5O 1HKGA 4A2BA 3KZBA 1X3NA 4DQ8A 3UKRA 5AQSA 3D2FA 3AY9A 4BRDA 1RDWX 2CGLA 2E1ZA 4ISFA 3H3NO 1ATSA 4B1ZA 2D0PA 3QMLA 4IXCA 4I6MA 5AQFA 2FF3B 3WXKA 3LM9A 3R6MA 5ELZA 3WXLA 1XUPO 5AQJA 3MMVA 3CIPA 3FE1A 2E2QA 5AFUH 3UE5A 2GELA 3DXMB 5AFUA 3FZFA 4BG8A 4BQLA 3SJHA 5E26A 2VYPA 3FR0A 1TYQB 3MN5A 4MO5A 1DKGD 2QW9A 1IJJA 4BC4A 3VEVA 1HUXA 4IO8A 3LDNA 4IWVA 3VOVA 3ENOA 4PL7A 4BRAA 5FPEA 1U2VB 5KQ8A 1HKCA 2CH6A 4B1VA 1ATRA 3LDOA 5EVZA 3WXIA 3BF3A 1HJOA 2GTDA 3DWLA 3QB0A 2FSNA 2YJFA 3CJ7A 1MWKA 3MK6A 5AQNA 4BRHA 5BPNA 4YDUA 2E8AA 4XEIA 4O5FA 1J6ZA 1BDGA 1TYQA 3GDQA 4FOEA 2A41A 3CJCA 1Z05A 1ZXOA 2QWNA 1RGIA 4H5VA 5AZJB 1BA0A 1KAYA 2P9UB 4FWNA 4IZ9A 1NGFA 4FPAA 4HTLA 3WUHA 3CI5A 2A40A 3BP8A 4DB3A 2BTFA 4M7XA 1NMDA 4FWRA 1NGIA 2W40A 1GLFO 2QWRA 4H5NA 2GEMA 4BQZA 4ISEA 1K8KB 3HTVA 4CJ7A 4M7YA 3VESA 4PL8A 2A3ZA 4BRFA 4JD2B 4L3QA 5F0XA 4BRGA 5AQUA 1QZ6A 2NZTA 3GG4A 5JLFA 2FLOA 5AQWA 3HM8A 3W0LA 4BR4A 1QQNA 2FSKA 1JCFA 1T44A 2F9TA 4A61A 1YVNA 3WEEA 3DXMA 1V4SA 3JXUA 2Q36A 3AARA 4JD2A 1MWMA 1DGKN 3D2FB 4CZMA 3P4IA 4DHYA 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FXUA 3OYKA 4K43A 1LWEA 4E1JA 2IGIA 4CE9A 3RTVA 2HF3A 1W7AA 4C8KA 5JS1A 1LOTB 3O08A 2HBJA 3BY5A 4OGCA 3QDKA 4H5RA 1TGOA 2ZWHA 4E7JA 4LFBK 3G0ZA 5AQMA 1OKJA 4Z94A 4BREA 1FJGK 5KI6A 4H0PA 4UQGA 3K59A 4DWIA 2Z1HA 4CJWA 5EU7A 1C0UA 4N41A 1BL3A 3ATUA 5EOYA 5J2QA 1NK9A 3CETA 3K5MA 3AVBA 3C65A 1HMVA 5LMNK 4KAZA 1BUPA 1XHXA 4O0JA 4FM2A 2H3GX 3CCVN 4RW4A 4RTFD 3IUCA 1W9HA 4H0XB 1VQ9N 3VEOA 3DM2A 2HBLA 5C10A 4FJ8A 4IJAA 3A5LC 4AM7A 3O4WA 2F9WA 4RCHA 2E2PA 3EO3A 1FXXA 4CESA 4CHOA 1N5YA 5GAHP 4B3RK 3T69A 3HJFA 3M6GA 5AZIB 3VERA 4IFVA 3V1OA 2KLAA 2Z1GA 4PA1A 5B8HA 4WQ5C 3AAPA 3R9PA 1T3VA 4CEBA 4U7BA 2UXCK 3DRRA 4ZTJA 4FLVA 1S1WA 1U48A 4CJEA 2NRZA 3CFOA 3CC2N 2VGMA 4MQ3A 3HO1A 4DKWA 2AJQA 2RN2A 4DR5K 2QKBA 1GOCA 1CZBA 3MWTA 3M3ZA 3I8BA 3CD6N 1X9SA 5A2QO 4E19A 5C2DA 3TU5A 2Q0UA 3CG7A 3CCLN 3NF6A 4PKGA 4J8FA 1P8ZA 3LPTA 4FLUA 4GV6A 2GWJA 1KVCA 4BY9C 3KK2A 4DSIA 3FZKA 4W5RA 3KK3A 2KFZA 1IG8A 4CJKA 1R59O 1UA1A 3H45C 1CXQA 1E4GT 4DFKA 2IOCA 5AQZA 3EN9A 1WBBA 3HXMA 5M1NA 1C0TA 3M8RA 1VSDA 3THYB 2I7NA 3TAMA 4KBOA 4IOCL 4CBUA 5KPZA 3J7YP 1WSIA 2O8DA 3QLHA 3KKSA 5HRPA 4X64K 1S1XA 3G10A 4YOUA 4J2AA 3CJBA 1Z26A 2PAVA 4K25A 3ULEB 3SBTA 4M3TA 4RW9A 2UXDK 5E41A 3Q7CA 3CPWM 3LDLA 5BR8K 4AF1A 2EWSA 3UKUA 1TUUA 4M45A 3QEXA 4BR2A 5AQKA 1W97L 1WLJA 3J7ZO 3L4IA 4W5OA 4X62K 4CHQA 2NUBA 4N56A 4M3WA 3DXKB 3KWGA 3D0PA 4ELUA 2G8WA 1WNSA 3NVMA 3HL8A 4O44A 3ZT1A 3V9XA 4NXNK 4PUOA 5FROA 4FJXA 4GVEA 2W41A 4CF0A 3VPZA 1WBDA 3O4QA 3CF5L 3K0SA 3IFRA 4JI5K 1U2VA 2QM1A 2YHWA 3U9ZA 2GUPA 1JCGA 2GV9A 2KZZA 3H3OB 3QIPA 3W3DA 2X6SA 1M90O 3THXA 3RR7A 3PX0A 4K41A 2HVIA 3HZ6A 4JNEA 3OYDA 4JK8A 3LP3A 1XMOK 3QBWA 2P5GA 4W5QA 4KKOA 4JI0K 3N4QA 4CI6A 1WAFA 4YOXA 3C6TA 4BECA 3SUQA 4Z4CA 5J1EA 4E3SA 1E4FT 4KHWA 3TSQA 3WNFA 3NCIA 2YX6A 3LP1A 3RMDA 3AA4A 3H1VX 2P9PA 2BUPA 3M1FA 3IG1A 2WFBA 4L8RB 1RDAA 1WOQA 4HTUA 4FWLA 3GBTA 2OTJN 1QHAA 4CFCA 4KHUA 3LZIA 3WEEB 1CZAN 3TANA 2QWPA 4ILGB 3MX5A 1NLVA 2HBMA 1SZ2A 3WT0A 1LW2A 3UKUB 3OYJA 3PO5A 1S6QA 3HYFA 1FW6A 2PBDA 4PKHA 1XNRK 4NCGA 4QAGA 2DFHA 2VCPA 3IKMA 4FZYA 4FLXA 4CIFA 1NK0A 4NO7A 4OO1J 1GLBG 4JKGB 3TAGA 1J53A 5GAEP 2YKNA 1YJNN 3QICA 4RG8A 3MXMA 1C0FA 4EZ6A 1MU2A 2A42A 4OKKA 1IBMK 5EY4A 4FM0A 2HHQA 1Q81O 1DT9A 3MEGA 3SAGA 1IV0A 4AHUA 1WSEA 1TV6A 1IBLK 4B1WB 1BO5O 3H46O 4K8ZA 1IKVA 4JLHA 3SQ2A 1QSLA 2YI1A 4G9ZA 4C8NA 5J2PA 3CCJN 4A57A 3DLEA 3F2KA 3D6RA 3LP0A 3SK3A 1MA9B 4FWSA 3WQUA 2A6AA 3O4NA 4JKFA 4E7LA 2RF2A 3M8QA 1J9AA 2IAJA 4BR5A 2Q31A 4HCCA 4KPYA 2W6KA 3F9KA 2O4IA 2OPSA 3U4LA 4BR7A 3SV4A 3A2FA 3VETA 2NRHA 4BRNA 4H4OA 4OLBA 1S22A 3MN7A 4JAXA 3HPHA 1U4BA 3CCUN 4EFHA 5LY3A 4CEEA 3DJCA 5M1FA 4H0OA 3NF9A 3ATVA 3OYHA 5AQRA 1NJYA 4A2BA 1HKGA 5HRRA 3HP6A 1O1WA 3SAHA 5HOOA 1X3NA 4CJTA 3UKRA 3AV9A 2CGLA 4KI6A 4FZXC 4AILC 1L3SA 3L2QA 2HW3A 2D0BA 4CHYA 4AHTA 4DV7K 4DQPA 4CF8A 4OPKA 1IKYA 5ELZA 4F2SA 2ETJA 3WNGA 1RTJA 3E9OA 3AO4A 3PSIA 1W2BM 3DXMB 4YORA 5AFUA 4JI2K 4BQLA 3SJHA 5E26A 2VYPA 3FR0A 3MN5A 1T05A 1IJJA 3WXMB 1HUXA 3PV8A 3RRGA 4IWVA 4PL7A 2VGNA 4CGGA 3ULDA 4K0KK 1NNEA 4JI6K 4M3XA 3SNNA 2DY4A 3T1HK 3VQ5A 4B9UA 4DR3K 3BF3A 2GTDA 5T7BA 3QB0A 3HPGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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