1J6ZA

Uncomplexed actin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN ALPHA 1
publication title The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 125
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1j6zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1j6zA04
3RSEB 5KQDA 2F9TA 4L3QA 3MDQA 4BC2A 1T44A 2YHWA 5TKYA 4EIAA 1YXQA 1NGEA 2J4RA 5AQTA 4CD1A 3O1BA 4IO8A 3EL2A 3CIPA 3VENA 2F9WA 3UKUA 2E2QA 1YVNA 4FWPA 4K41A 1YAGA 3D2EA 3CHWA 1YUWA 3IFRA 3L6QA 2IVNA 3SK3A 4EHUA 4XH1A 4K43A 1BA1A 2HOEA 3LM9A 4CI6A 1S3XA 1HKBA 1LOTB 3FGUA 5BR9A 5AQLA 4A2BA 3I33A 4CBUA 3LM2A 1U2VB 4BGAA 2E88A 2BTFA 3H3NO 3KHYA 5AQXA 4FOEA 4GY2B 5I9EB 1WOQA 1XUPO 2ZGYA 5BRDA 1QZ6A 1TUUA 3P4IA 3AAPA 3U4LA 2P9NB 5AQFA 2DPNA 2P9PA 3VGLA 2GELA 4H0XB 4CBWA 1E4FT 4BRIA 5BRFA 5JMVA 1T6CA 3QFPA 1Y64A 4PKGA 1BG3A 2P9LA 4BRMA 3LDPA 4BVPA 4B1YB 1SAZA 4A61A 4H0YB 4FWOA 3WEEA 3MCPA 4CZHA 3ENHA 3JXUA 1QHAA 3DWLA 4NB4A 4ISFA 3H45C 5FPNA 3MN5A 2P9UA 4CZIA 3HTVA 5AQOA 4FWNA 5AZIA 1V4SA 5BPLA 2HMPA 1J6ZA 3WXKA 2PAVA 4EAHD 3LL3A 4H0PA 1GLDG 2IIRA 3D2FB 5ADXH 3VF4A 3VETA 2UYTA 4BR5A 2VWBA 2VCPA 4WQ4C 4WQ4A 4H0OA 2E2PA 3DXMA 4FO0A 4K42A 4JD2A 1JCFA 1ESVA 1BA0A 3DJCA 3CJAA 2NLXA 4DB3A 3GL1A 2QWMA 3QFUA 3B8AX 4I6MB 4XH5A 5KQ8A 4FWQA 3W0LA 1SQKA 3VEZA 2YHXA 3VGKA 1NGHA 3VF6A 1D4XA 4EHTA 1MWMA 5CE3A 2D1KA 5LY3A 3TU5A 3VF2A 1BU6O 3O6WA 1K8KB 2QXLA 5BN8A 1LCUA 1RFQA 4HWIA 3TPQA 1QZ5A 5AZJB 5KPZA 2EWSA 2E2OA 5AQKA 4CZGA 3UKRA 4BRPA 2Q0RA 4BRLA 2GWJA 4QS9A 4Y0WA 2CH5A 5LJWA 5AQJA 5AQRA 4JHDA 2P9IA 4EFHA 2YI1A 2Q31A 2W41A 5AQNA 1NWKA 1QQNA 2Q97A 3AY9A 3H3OB 3CQXA 3L4IA 3MN9A 2ZF5O 3U9ZA 2AA4A 4KBOA 3O1WA 3VESA 1TUYA 4BR9A 3UKUB 4PL7A 4IJNA 4FWLA 5AQUA 4BRDA 2A6AA 4BG8A 5B8HA 3D2EB 5BPNA 3CJ7A 3MN7A 3VEYA 2E20A 4B1ZA 3R9PA 4FPBA 2V52B 3DXKA 3FLCO 2Q0UA 3IDHA 1Z05A 3ID8A 5AQSA 2A3ZA 4JNEA 3FFKB 3GOIA 4QS7A 2CH6A 1E4GT 3QBWA 3ZEUB 4AM7A 2V7YA 4HTLA 3EKSA 3OHRA 4B1UB 1NLVA 5KPRA 3ULEB 1U6ZA 2I7PA 2E1YA 4B9QA 3MK6A 5AR0A 1HJOA 3H46O 2NRHA 4M7YA 1NGBA 3VEVA 3VOVA 5JLFA 4BGBA 1DEJA 2H3GX 5FPEA 2I7NA 4H03B 5AQQA 1GLFO 3VEXA 5F2RA 2ZGZA 3ZETA 1RGIA 1NGIA 2GEMA 1IG8A 2IVOA 4BQZA 4PKIA 3W3DA 1QQMA 2P9SA 3QMLA 4BG9A 4BRKA 3UB5A 1HUXA 1KAZA 2P9LB 4JN4A 4WYBA 2Q36A 2D4WA 3IMXA 4PL8A 1ATSA 1MA9B 3BF3A 2P9KB 1S22A 4CZEA 1RDWX 1R59O 1P8ZA 3GBTA 4FL9A 5AZIB 3FZHA 1XQSC 1BOTO 5JICA 3IUCA 3CJ9A 4BC5A 2A40A 1HLUA 2BUPA 3EN9A 5ADXA 2VYPA 4WQ5C 4BC3A 4WQ5A 5FPDA 1HPMA 2D0PA 3SJHA 3F9MA 3FR0A 4CBXA 3EO3A 1G99A 3M3ZA 1HKCA 2A5XA 5LJVA 4MO4A 1ZXOA 3WT0A 4AM6A 4RWTA 2Q2RA 3I8BA 3VGMA 1GLAG 5AQWA 1KXPA 3BUZB 2E8AA 3G25A 4BRGA 2HF3A 2NZTA 3MN6A 4CZLA 5EY4A 1JCEA 5F1XA 3CJCA 2ASOA 3ATVA 1JCGA 5EXWA 3VERA 3CJBA 1HKGA 4BRNA 2QWRA 4ISGA 4M7XA 3L0QA 3FE1A 3JS6A 1DKGD 3KVGA 4H5TA 3A5MC 1NGCA 2ASPA 3LDNA 4FWKA 4MLEA 1BWFO 2CGLA 3WXIA 4BREA 4CZJA 3FZLA 3ZX0A 4JHDB 4LC9B 2P9IB 2QWNA 1TYQA 2CGKA 3C7NA 4CD3A 5BREA 4FWSA 2FSKA 3O80A 4YDUA 3SMSA 3CJ1A 4I6MA 3R6MA 4DHYA 3FZMA 2GWKA 1H1VA 2FSNA 1Z6RA 3WXJA 4MO5A 3KZBA 2W40A 3A5OC 1BO5O 1OKJA 1T6DA 4RTFD 1GLEG 1K8KA 1NBWA 5AZJA 4H5VA 4O5FA 5BPMA 4J8FA 3GDQA 4A2AA 3WQUA 2FSJA 3CERA 1Q18A 2A42A 1NGJA 4DCHA 3ZX3A 4ISEA 3DAWA 3SLCA 5E84A 2GTDA 4B1WB 3O08A 3QB0A 1XC3A 4BR4A 2KHOA 3RSEA 4XH4A 5EOYA 1QQOA 1WUAA 1NGFA 4XEIA 3AARA 3EKUA 4CJ7A 3A8YA 3O8MA 2PBDA 2FXUA 5AQHA 5AFUA 3J8AA 2CGJA 3QBXA 1BUPA 1NMDA 3ZX2A 4H5WA 3WXLA 5EVZA 4NO7A 3BP8A 3QDKA 4FWRA 2IVPA 1BDGA 5AQZA 3ZETB 3HZ6A 1ATNA 1ZBSA 2P9PB 5AFUH 1KAYA 2ASMA 3FZKA 4IWVA 2Q1NA 3U8XA 3VEOA 1CZAN 2ITMA 2P9SB 4BC4A 4FPAA 3ZEUA 1X3MA 4CZKA 3BF1A 5BN9A 4B1VA 3UE5A 3A5LC 3CQYA 1NGGA 2QWPA 4M63C 3ULEA 2QWLA 4GNIA 1U2VA 4H0TB 5EX5A 3WEEB 5JLHA 2YHYA 3O5BA 4F9OA 3LDLA 4BRQA 2P9UB 4A62A 4MLHA 2QM1A 1GLJO 1HX1A 4K25A 3GE1A 2YJFA 2AP1A 2P9NA 2QW9A 4FSVA 3GG4A 3HBTA 1IJJA 3QICA 1EQYA 3HI0A 4BROA 5AQMA 4BR0A 3ATUA 1KAXA 1V4TA 3WUHA 3O4WA 3U9DA 3CETA 4BRCA 1SZ2A 4Z94A 1C0GA 5AQYA 1C0FA 2GUPA 2V7ZA 3DXMB 2YJEA 3M6GA 1GLLO 3VEWA 5ELZA 4BR7A 4CZFA 4JD2B 1GLCG 2P9KA 4BRHA 4IJAA 4B1XB 4JAXA 3S41A 3A5NC 1MWKA 3VPZA 2QWQA 4BRAA 3HM8A 3HSCA 1MDUB 3LDQA 1ATRA 3BEXA 1NGAA 3H1QA 4IZ9A 3C0BA 5AQPA 1GLBG 3D2FA 4E1JA 2QWOA 4RCHA 4BQLA 4IXCA 3A0IX 3UKRB 3EZWA 4H5NA 5AQGA 5F0XA 2A41A 1TYQB 3M1FA 3C7NB 4BVOA 4C23A 4PKHA 3AAQA 2OANA 2V51B 3D7EO 2WUSA 4O8KA 2E1ZA 4BRFA 3R8EA 4YDUC 1NM1A 2E2NA 4H0VB 3CI5A 5AQIA 5BRHA 3H1VX 2YCHA 2D0OA 3WQTA 4DQ8A 2ZWHA 4FOIA 4H5RA 2FLOA 3MMVA 3SMPA 2FF3B 4BR2A 1X3NA 5KPTA 3H6EA 1X9JA 3DXKB 5FPMA 1DGKN 1ZC6A 2FF6A 4FWMA 2HF4A 3LDOA 1NGDA 5E26A 4QS8A 3FZFA 5AQVA 4CZMA 3ENOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LWEA 1A5WA 2F9TA 1NKEA 1NK0A 4L3QA 4HUFA 3P1GA 1HQUA 3SPYA 4JKBA 1VQPN 4E7HA 3O3GA 3I0RA 1HMVA 3CCQN 4CD1A 1O13A 3S3MA 2OCEA 1KCFA 3CIPA 3CCSN 3DYAA 2F9WA 3AO2A 4X65K 3CHWA 1U4BA 1YUWA 3KD1E 1IKVA 4LFAK 4GKKK 1SS6A 3VQPA 4CJVA 4E89A 4MDBA 1KFDA 1Q9XA 4K43A 2HOEA 2I5JA 3TSQA 3OBYA 4IEIA 2HBKA 3HVTA 3NH2A 1RDAA 4YNQA 4DKWA 1L3TA 1BGXT 3LM2A 4YOTA 4BGAA 3KHYA 2ZGYA 4H4MA 3V9XA 1S1VA 1BIZA 1J54A 4KKOA 3U4LA 3THXA 5C2DA 1TK0A 1FJGK 3OS2A 2KLAA 4B3SK 3PUFA 4CJWA 3OYBA 3OYMA 3JSMA 2GELA 1WBBA 4OKJA 3CFPA 1E4FT 4FJ9A 2NRVA 1NK7A 3QFPA 4CF9A 3CCLN 1JXBA 2P9LA 5CYMA 1OH6A 3QNOA 3CPEA 4H0YB 4FWOA 1OVQA 3ENHA 4K8XA 1QHAA 1WSHA 3DWLA 3OVNA 4ISFA 1HQEA 4YFUA 3ZT0A 3QEWA 4DV5K 4DSLA 1Q86O 5H1SQ 4CJSA 2E4LA 5AZIA 4CEZA 1V4SA 3J81O 1ZBIA 4Q5VA 3NAEA 1NOZA 4K0KK 4W5RA 4Z4CA 3PX6A 2VWBA 3O9UA 1K6YA 5A2QO 3THWB 1XWLA 3HT3A 1SV5A 4BE7B 4FJJA 3IRXA 4DTJA 2ATQA 3D0PA 1HPZA 4JI7K 3TTFA 2YHBA 1ESVA 1IO2A 1IH7A 3DJCA 3CJAA 3MEEA 4CCHA 2VG7A 3QFUA 1ZBLA 3DRSA 3CPWM 4FWQA 1SQKA 3VEZA 4NCGA 1D4XA 5CE3A 2NRZA 3VF2A 4RW6A 3NGYA 1HJRA 1K8KB 4C8OA 4HWIA 3TPQA 1CZ9A 4B3OA 2E2OA 4BECA 4CZGA 4BRPA 1JLAA 2Q0RA 4GKJK 2GWJA 3ZSWA 4NLBA 2P9IA 3C6AA 4FXDA 2HNYA 3V1RA 2HHQA 1TL3A 4DLGA 3OYGA 2OYQA 4F3OA 4BDYA 2D5RA 3AY9A 4CHNA 3L4IA 1C0TA 2O8DB 4KPYA 3SBTA 4BR9A 3DI6A 4CK1A 4FWLA 1UA1A 3D2EB 5BPNA 3VEYA 1RT5A 3OA9A 4B1ZA 1S1UA 4YOVA 3VA3A 4FPBA 1QSYA 3FLCO 4RW8A 3HK2A 2OPSA 3IDHA 1NU0A 4JNEA 1RDCA 4JI3K 1DTQA 2CH6A 3SZ2A 3ZEUB 4EZ6A 3EKSA 4A5AA 3OHRA 4JRQA 2ITGA 4LSLA 4I2QA 2E1YA 3BZCA 4HCCA 1TKTA 3VTHA 1WNSA 3H46O 3VEVA 4M7YA 1NGBA 1RDBA 1SKRA 5JLFA 5FPEA 1VSEA 4H03B 3HVRA 4FJKA 4O0IA 3HP6A 1GLFO 4TSXA 2KW4A 1RGIA 3MEGA 1NGIA 1TL1A 2F4VK 3R3LA 3NF9A 4HUGA 3MXIA 3AV9A 4JN4A 4CFDA 4I9QA 4A5BA 2D4WA 3K58A 1KRPA 1UOCA 4E0DA 4DR2K 2C1IA 1S22A 4CZEA 1Q7YO 1R59O 4CJLA 2W00A 1P8ZA 3TI0A 5IWAK 4AF1A 3FZHA 1XQSC 1BOTO 4PHTX 5GAHP 4CIFA 2A40A 2QI2A 2YKMA 3EN9A 3DRRA 1D9FA 2VYPA 3THYA 5C25A 1I39A 3OW2M 4ELUA 1KLNA 2A5XA 4MDAA 4MO4A 2RKIA 3VGMA 3O3HA 5GADP 1T3VA 4CF1A 3V6DA 4CW7B 4FJ8A 4E1MA 4LF8K 4BRGA 3G25A 1VRTA 5EY4A 1W2BM 1BCOA 4CEEA 1WSFA 4DG1A 5JS1A 3VERA 1YTAA 3CJBA 4BRNA 2VGMA 4ISGA 4M7XA 4F8RA 4FZYA 3L0QA 4Z4IA 3MWPA 1UA0A 1BL3A 2P51A 4H5TA 5J2NA 4J2BA 3THWA 1VAZA 2NRRA 1BWFO 3WXIA 1VSKA 2QWNA 2CGKA 1BI4A 2NNWA 3V9ZA 3AO5A 1RBVA 2KFZA 3KK7A 2GWKA 2HHSA 1XI1A 2FSNA 1Z6RA 1XHZA 4AQYK 1SUQA 1N32K 1K8KA 1XNQK 1NJXA 5BPMA 2YV0X 3GDQA 4A2AA 1WBDA 5J2QA 2UXBK 3MX5A 1NGJA 3F73A 3QLHA 4B1WB 5GAEP 1A5XA 3ENBA 1XC3A 3RSEA 4XH4A 5CYQA 1QQOA 2WTUA 1W97L 1NGFA 4M3WA 4XEIA 4CJ7A 4JYAK 2O8DA 1QE1A 2PBDA 4FJHA 3ZLJA 2CGJA 1KC8O 3ZX2A 3E9LA 1X9WA 5EVZA 4NO7A 4CF0A 5AQZA 1BDGA 3ZETB 5K14A 4DV3K 2P9PB 3U6FA 4CHQA 1I3AA 1KAYA 3VQQA 4DFJA 4CGFA 4YORA 4DQSA 2P9SB 5GIPA 3ZEUA 2VGNA 4M3RA 4CJFA 4C8MA 4M3ZA 4FJIA 3CQYA 1NGGA 3PV8A 4PUOA 3HO1A 4GNIA 5JLHA 4CGJA 3ZT3A 3O5BA 4F9OA 1NG9A 4IBNA 4BRQA 2P9UB 4A62A 2QEXN 3CF5L 4K25A 1T7PA 2IC3A 3ZSVA 2X74A 3GG4A 4WCEL 4GMJB 5FRNA 3LDSA 1KAXA 3L2WA 1JXEA 1V4TA 4LH5A 3U9DA 1SZ2A 4CIEA 4PY5A 3PO5A 2RPIA 5KGWA 4I9LA 1Z25A 2V7ZA 1B9DA 1GLLO 4PA1A 5ELZA 1TKZA 4JI2K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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