1JCFA

Mreb from thermotoga maritima, trigonal
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 110
structure length 336
sequence length 336
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcfA03
1NGFA 4BC2A 1T6CA 5AQHA 2YI1A 3O80A 4M7YA 5AQMA 4FWQA 1KAXA 4BRGA 4H5WA 4GY2B 1ZXOA 4JN4A 2F9TA 1GLDG 4CBWA 4BR9A 1S22A 2F9WA 4DHYA 3CIPA 2OANA 1TYQA 1JCGA 3FR0A 2ZWHA 3UKUA 2E2PA 3CJAA 3VEVA 4CI6A 3HTVA 1DKGD 2V51B 5ADXH 3WUHA 1K8KB 5FPNA 3R6MA 1Q18A 3R8EA 3QBWA 1GLEG 1SQKA 1D4XA 3GDQA 2V7ZA 1GLJO 3FGUA 4A61A 4CZMA 4WQ4A 4BREA 5AQXA 2E2NA 4BRAA 3ZX3A 4IJAA 1NGHA 1YUWA 2A42A 2QWRA 5AQLA 2V52B 4H0PA 2FLOA 1YXQA 3CJ7A 3A0IX 3CERA 3KZBA 4KBOA 4FWKA 3CI5A 3CJ1A 4FOIA 4M63C 4BROA 3UKUB 3VF2A 4CZGA 2ZGZA 4MLHA 3WEEB 1MWKA 3SLCA 4FWMA 4MO4A 2I7NA 4XEIA 3MN7A 3O8MA 3LM9A 2Q1NA 3H3NO 3RSEA 2E2QA 4JNEA 4HTLA 5LJVA 3VGKA 3DAWA 3U8XA 3MMVA 1T44A 4A2AA 1P8ZA 5AQUA 1XUPO 2QWPA 5TKYA 4FL9A 1CZAN 2P9KB 4WQ4C 2GUPA 3FZKA 4ISGA 3C0BA 4JHDB 2HF4A 2A41A 2QWLA 4H5NA 4FWNA 3L6QA 2E1YA 3M1FA 5AFUA 5B8HA 2Q36A 4F9OA 3DJCA 1ZBSA 4DQ8A 4CZLA 1S3XA 1SZ2A 3JS6A 4C23A 5KQDA 3CJBA 4IJNA 2BTFA 3H1QA 3W0LA 4CJ7A 3F9MA 2W40A 1Z6RA 4EFHA 4CZHA 1NGEA 5AR0A 1HKGA 4CD3A 3RSEB 3U9ZA 4K41A 4BRFA 1X3MA 4BR0A 4BRPA 1X3NA 3IUCA 3VF6A 4FO0A 3QB0A 3AAQA 3H45C 5BPNA 2QWNA 1ATRA 2AP1A 3LM2A 2HOEA 5AQJA 4B1UB 1GLBG 3IDHA 4CBUA 1V4TA 2VWBA 4O5FA 1ATNA 4BVPA 3GG4A 3AARA 2D0PA 1K8KA 1G99A 3LDPA 4MO5A 4AM7A 3VEXA 4AM6A 4BR4A 3OHRA 4XH1A 3I33A 4FSVA 2QWMA 4BRMA 5AQKA 3EL2A 5JLFA 4BC4A 4BQZA 4CZJA 4MLEA 4CD1A 1OKJA 5AQZA 3I8BA 3H46O 4H0TB 4QS9A 2VYPA 1HLUA 3S41A 4H0YB 4PL7A 3VEYA 3FFKB 3O5BA 3FLCO 2P9NA 5KPRA 2PBDA 5AQNA 3FZFA 3IMXA 5AZJB 1GLFO 2IIRA 5BRFA 4DB3A 3CQXA 1KXPA 3WEEA 1ESVA 3H6EA 5BREA 3VETA 1NGAA 3DXKB 3ZX0A 1BUPA 2FF6A 3ATVA 4BRHA 4DCHA 5F0XA 4Y0WA 2A6AA 4K43A 3GL1A 4NO7A 5I9EB 1YAGA 3CJCA 1QQOA 2ZGYA 3DXMA 1BG3A 4BG8A 4BQLA 3EKSA 2P9KA 5BPMA 4RCHA 1NM1A 5JLHA 2J4RA 4JHDA 2P9IA 2D1KA 3UKRB 3VEOA 1ATSA 4ISEA 4A2BA 2Q97A 4IO8A 1SAZA 2P9NB 3CETA 3ULEA 4BRNA 1TUYA 3LDLA 1NGIA 3MN5A 4FPBA 5F2RA 2FSNA 3SK3A 4RTFD 2AA4A 5AQPA 5AZIB 1NMDA 2GELA 4FWPA 4BR2A 5BR9A 1LCUA 2QW9A 3CQYA 5AQWA 3JXUA 5AFUH 3H1VX 3MDQA 3L4IA 1U6ZA 1Z05A 2NLXA 3LDNA 4BRQA 3GE1A 3VERA 4GNIA 5FPMA 1RDWX 1C0GA 4H0XB 1HKCA 1IJJA 3KVGA 2H3GX 2QWOA 1HUXA 3TPQA 1NLVA 3HI0A 3DXMB 3WT0A 5BRHA 3WXKA 4XH5A 3M3ZA 1NBWA 5AQFA 3G25A 2P9IB 3QICA 1NGBA 3A5LC 2HF3A 2YHWA 2ASPA 4BVOA 3ZX2A 3O08A 2PAVA 1DEJA 1R59O 3ULEB 1YVNA 2A40A 3WQUA 3EZWA 3VGLA 3ZETA 3MK6A 4CBXA 4H5TA 4IXCA 1BU6O 3UB5A 4I6MB 4Z94A 2QM1A 4O8KA 4K25A 5AQYA 5KPTA 2W41A 3SMSA 1QQNA 4QS7A 4PKHA 3HZ6A 4L3QA 4B1YB 4A62A 2ASOA 1NGGA 2BUPA 5AZJA 2Q0RA 2GWJA 3A5OC 3VOVA 1WUAA 5JICA 4BRCA 3DXKA 1EQYA 1QZ5A 2IVOA 4WQ5C 4PKIA 2P9PA 3P4IA 4B1WB 3QBXA 4B1XB 2IVPA 4BC3A 5EOYA 4BR5A 2VCPA 4H5RA 2A5XA 2CGLA 4BC5A 3BF3A 1TUUA 3QFUA 3ZETB 5ELZA 4LC9B 4PKGA 2Q0UA 2GEMA 2KHOA 3MCPA 4BGBA 4WYBA 1QHAA 1NWKA 2FF3B 2CH6A 1U2VB 3UKRA 2HMPA 2E8AA 1KAZA 4B9QA 4IWVA 3A8YA 3LDOA 1BA1A 3VENA 5FPEA 3QFPA 1RFQA 3U9DA 2E20A 1T6DA 3ZEUA 2E2OA 4PL8A 3BP8A 5AZIA 3WQTA 1NGCA 4XH4A 1JCEA 3WXIA 4CZIA 4FOEA 4FPAA 4JAXA 5KQ8A 3ATUA 1E4FT 2ASMA 3VESA 4E1JA 2IVNA 4JD2B 3H3OB 1MA9B 3O4WA 4H5VA 1GLLO 2P9PB 5AQSA 3SJHA 3SMPA 5LJWA 5BN8A 3B8AX 2Q31A 2GWKA 5AQRA 3C7NB 4BGAA 3CHWA 2P9LA 1ZC6A 3VEWA 2WUSA 4EHTA 5EXWA 4EAHD 2YHYA 2FXUA 3DWLA 3MN6A 1HX1A 4ISFA 5E26A 4BRDA 5KPZA 1Y64A 3FZHA 2CGJA 1IG8A 3ZEUB 5JMVA 1HKBA 4M7XA 3EO3A 5AQQA 3L0QA 3D2EA 2ITMA 5AQVA 4HWIA 3WXJA 5BRDA 3VPZA 1JCFA 2P9UA 3O1BA 5EX5A 4I6MA 5ADXA 4QS8A 3FZLA 3HSCA 5EVZA 1MWMA 4EIAA 4YDUA 1RGIA 5AQOA 1QZ6A 3D2FA 1BOTO 3LDQA 3EN9A 4J8FA 2P9LB 1NGDA 5LY3A 4BG9A 1TYQB 2DPNA 3ENOA 3KHYA 4FWOA 2CH5A 3ENHA 3QMLA 1GLCG 3AAPA 3EKUA 4WQ5A 2A3ZA 4H0OA 3CJ9A 4H0VB 2YJEA 5F1XA 1HJOA 1C0FA 4BRLA 5CE3A 1XC3A 3GBTA 5EY4A 2NRHA 3VEZA 3W3DA 2I7PA 3A5MC 4BR7A 5BN9A 4CZEA 3D2EB 3LL3A 1BWFO 2YCHA 3M6GA 2P9UB 3A5NC 2P9SA 5E84A 2D4WA 1BO5O 1XQSC 1GLAG 2ZF5O 3IFRA 4CZKA 2QXLA 2YHXA 3FZMA 3R9PA 2CGKA 1QQMA 4BRKA 1U2VA 3QDKA 4B1VA 3ID8A 3BF1A 4NB4A 3O1WA 4FWSA 3J8AA 1H1VA 3D2FB 2YJFA 4YDUC 2V7YA 3BEXA 3U4LA 3MN9A 4FWRA 4RWTA 3GOIA 2E1ZA 5BPLA 1J6ZA 4IZ9A 3AY9A 1X9JA 2FSKA 2D0OA 4JD2A 5AQTA 4B1ZA 1KAYA 4H03B 2NZTA 1WOQA 5AQGA 1V4SA 3UE5A 2Q2RA 1MDUB 4CZFA 3C7NA 5FPDA 3BUZB 3D7EO 1LOTB 2P9SB 4K42A 3HBTA 1BA0A 1NGJA 2EWSA 1E4GT 4EHUA 3FE1A 5AQIA 2E88A 3WXLA 1BDGA 4FWLA 2GTDA 3TU5A 3VF4A 3VGMA 4BRIA 2FSJA 2UYTA 3HM8A 3O6WA 1DGKN 1HPMA 2QWQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E01A 1NGFA 4M3RA 5MLCQ 3S3OA 5AQHA 4JI2K 3KD1E 4E1MA 3AVCA 1J5OA 1C0MA 3OYHA 4H5WA 1L3TA 4ZTFA 4GY2B 1ZXOA 4Z4IA 1GLDG 2F9WA 5CY4A 2OANA 4CJTA 1RT6A 2HHWA 3CJAA 3VEVA 1NJWA 3SNNA 2V51B 3WUHA 1K8KB 1NJYA 3CPWM 4DV1K 2RN2A 3R8EA 1TK5A 4Z4GA 1D4XA 1XC9A 2QKBA 3FGUA 4A61A 4CZMA 5C10A 4BREA 2HVIA 1RBTA 4B8AB 1C1CA 2O8DA 4CHOA 3AV9A 1YUWA 3T19A 4FJNA 4H0PA 2KFNA 3TTFA 1K8AO 1YXQA 3A0IX 3KZBA 4FWKA 2PY5A 4B3MK 1MU2A 1LW2A 3U6FA 4CGHA 4CK2A 5M1PA 1HNXK 1JLEA 1MWKA 4CJ5A 1TV6A 3O8MA 1SKWA 4XJXA 4JNEA 1WAFA 3VGKA 3O9SA 3HVTA 4DV4K 4A2AA 3T1YK 4NCBA 1P8ZA 5AQUA 4WE1A 3D0PA 1U04A 4BE7B 2QWLA 1XI1A 4CGGA 3L6QA 3M1FA 3VTIA 3TAEA 3TSPA 4CEOA 3KK1A 1QQCA 2O8EB 1ZBSA 3E66A 4DQ8A 4CZLA 5IWAK 4C23A 1BIZA 5KQDA 3KKRA 4IJNA 3W0LA 4CZHA 5AR0A 1EP4A 2WONA 1B9DA 3RSEB 4CD3A 3JYTA 3TI0A 4JYAK 1S1WA 3G0ZA 3MEEA 1W2BM 2G8VA 2G8HA 3AVHA 1FKOA 1KD1O 5BPNA 3LM2A 4FLTA 1N33K 1GLBG 4CJFA 3IDHA 4YOVA 4CBUA 3LZIA 2D0PA 4B3SK 4OLAA 3HOSA 2BH1A 4QOZB 4DSJA 2ZD1A 3C6UA 3I33A 1T7PA 1RT1A 4X64K 3J7AP 4XIUA 4LF8K 5JLFA 4BC4A 4CCHA 3B6OA 3DRRA 4MLEA 3NGZA 2E4LA 1OKJA 4KH4A 5I42A 3TR8A 1D9FA 4QS9A 2VYPA 1FXXA 1HLUA 3I0SA 4DV5K 4DFMA 1O1WA 1T05A 4FW1A 3OYBA 1W97L 4X62K 4JEPA 2PBDA 2EHGA 3ZSRA 2YV0X 2WBNA 1YJWN 3WEEA 1JLAA 1ESVA 3H6EA 4C8MA 1Z26A 4OKEA 3CCLN 3V9SA 2GUIA 3D6RA 4CK1A 4Y0WA 4K43A 4J2AA 3GL1A 3CD6N 3QESA 4OLBA 3QETA 4LF5K 3HJFA 4G1QA 1QQOA 2ZGYA 2F8TA 4BQLA 2HHXA 3CG7A 1TK0A 4JHDA 3RMCA 2B6AA 1N5YA 3UKRB 3VEOA 3HM9A 3ASMA 1SAZA 3AA5X 1O13A 1NKCA 3ULEA 3LDLA 3MN5A 1KFDA 2FSNA 5AZIB 3P31A 1IBLK 1NMDA 1LAWA 4KTQA 2YNHA 3EEQA 4X65K 5GAHP 4N5SA 4DS4A 4MFBA 4BRQA 3WNHA 3MEGA 2UXCK 5FPMA 4UY8O 1C0GA 3CFOA 4DR5K 1IJJA 4BY9C 1JJ2M 3M3ZA 5AQFA 2RE2A 4OKJA 2O8CB 4CGIA 4B9LA 4GV9A 3A5LC 3TSQA 2YHWA 2HHTA 4DSLA 1YVNA 5HBMA 4FJMA 2A40A 3ID6A 3SQ1A 5HP1A 3WQUA 3VGLA 3ZETA 1GOCA 1L3UA 3RMDA 4B9VA 4CJWA 3LP1A 1M1KO 4Z94A 2QM1A 4C8LA 2VWJA 1XMQK 1N34K 3O9TA 3H08A 1EWQA 3ZYYX 3VTHA 3U3YA 3CCEN 4Q0BA 2Q0RA 1I3AA 1TGOA 1TAQA 5JVGL 1WUAA 4DU1A 3EZ5A 3F2KA 1BI4A 3T69A 4BRCA 1VSIA 1KVBA 3LZJA 3QBXA 4BR5A 4MDAA 2VCPA 2CGLA 1UA0A 2ZQBA 1TUUA 3QFUA 4LC9B 4L8RB 4OPHA 3I55N 2G8FA 4PKGA 5H1SQ 1UA1A 4BGBA 4BEBA 1TK8A 2VWKA 1JLQA 2FF3B 1A5WA 2E8AA 4N41A 3A8YA 3VENA 1BA1A 3THWB 2A1RA 3CM5A 3RRHA 2E20A 1T6DA 4CF9A 4PL8A 4WCEL 4FZYA 3BP8A 4XH4A 4FOEA 5KQ8A 1VSHA 3ATUA 1E4FT 2C1GA 4E1JA 4JD2B 4CJVA 1EO1A 3R1XA 4FLYA 1RT2A 5BN8A 2BANA 3CC2N 3E9PA 5AQRA 4GW6A 2UUBK 5DK5A 2P9LA 2Q3SA 2VG7A 4FJ9A 2WUSA 3DLGA 3ALYA 2XHBA 3G10A 1VSDA 3J7ZO 3KLGA 1Y64A 2CGJA 1C0TA 4FK4A 3KLFA 3T1HK 4EZ9A 4DS5A 2DY4A 3C6AA 4LD0A 2ZJRL 3D2EA 3WXJA 1JCFA 2KTQA 3O1BA 5M1NA 1TVRA 3BY5A 1TKZA 4QS8A 4RW6A 2UXDK 3FZLA 4DF8A 3K5MA 4FJKA 3AGRA 5EVZA 4FLUA 4YDUA 4CJKA 1RGIA 4LH4A 5AQOA 1BOTO 4J8FA 4N56A 4BE0A 1NGDA 5I3UA 1G15A 2CH5A 5LL6Z 3OJUA 3QMLA 3WNEA 4RW9A 2A3ZA 3CJ9A 2Z1HA 5KRTA 2BE2A 1X9SA 1C0FA 5CE3A 2HNZA 1XC3A 5HOOA 5EY4A 2NRHA 3A5MC 1SV5A 3VA3A 1Q9YA 1BWFO 4IG3A 5KRSA 2P9SA 4IFYA 4O5BA 2O8DB 4CF1A 5C2DA 4LF6K 2O8BA 1NMNA 2QXLA 2YHXA 3J81O 1Q81O 4BWMA 3O1WA 1VRUA 5HROA 3NDKA 2V7YA 3MN9A 2PYJA 4DV0K 4RWTA 1J6ZA 3VQ4A 3QINA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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