1JCFA

Mreb from thermotoga maritima, trigonal
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 110
structure length 336
sequence length 336
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcfA03
4RCHA 1DEJA 1U2VA 3HM8A 3H3OB 2ITMA 5BREA 4CZJA 3WUHA 3KVGA 3DXKB 2CH6A 3QFPA 3U8XA 1IG8A 1YXQA 4JNEA 4FWSA 1YUWA 2HOEA 4H5TA 1GLBG 4JAXA 3LDQA 1V4SA 2P9IA 4FWPA 4JD2B 5AQGA 2I7NA 2OANA 4FL9A 1U6ZA 3A5OC 4BRPA 4IO8A 4M7XA 2AP1A 4BC2A 3BEXA 4IJAA 4ISGA 1NGCA 3D2EA 4K42A 4L3QA 4BRGA 1MDUB 5FPEA 3B8AX 3FZLA 2A40A 4ISEA 4BRNA 3IUCA 5B8HA 4PKHA 2QWMA 4HWIA 3MN6A 2HF3A 4IXCA 4BR7A 4H5RA 4O8KA 4IWVA 5AQFA 1NGGA 3FLCO 2ZGYA 3HBTA 5F2RA 3VF6A 4BRMA 4BREA 1GLAG 3R6MA 1JCFA 3MN5A 3CIPA 3VGKA 2P9NA 1NBWA 1Q18A 2CGJA 2YHWA 4CJ7A 4FWRA 2NRHA 4I6MA 3ULEA 2ZWHA 2DPNA 3VEVA 3ZX2A 1NWKA 3H3NO 2E2QA 4CZIA 1QZ6A 4FWKA 5EVZA 3MDQA 2V7ZA 1KAYA 2FF3B 5BN8A 3VETA 3FZKA 5AZIB 3P4IA 4BGAA 3C7NA 3QBWA 2P9KA 4XH4A 2A42A 3O8MA 1RGIA 3GL1A 4MO5A 3VEZA 5F1XA 2QW9A 1GLJO 1BO5O 1TUYA 4BGBA 4A61A 5AQKA 2ZF5O 4CZMA 2A41A 4WQ5C 3U4LA 4BR0A 3MN9A 4CBWA 4RWTA 1MWMA 3MN7A 2NZTA 5AFUA 3VOVA 5BRHA 3LM2A 4H0OA 2YHXA 3LDOA 2GWKA 4ISFA 1HLUA 2PBDA 1IJJA 4CZFA 3DJCA 2QWLA 1D4XA 5LY3A 3SMPA 1XC3A 3BF3A 2IVOA 4K43A 5AQTA 2P9UB 3SMSA 1T6CA 1CZAN 1NGBA 2CGLA 3H6EA 1NMDA 3DWLA 2H3GX 1YAGA 3LM9A 3AAQA 2E1ZA 3O5BA 1MA9B 3H1QA 3W0LA 4EIAA 3AY9A 1GLEG 1LOTB 3UB5A 1HPMA 4BRHA 5AQWA 2FXUA 4A2AA 4BVPA 5I9EB 1C0GA 3UE5A 4IJNA 1QQOA 4PKGA 2Q31A 3CJ1A 5AQRA 3R8EA 4XH1A 3WT0A 1LCUA 1Z05A 2Q0UA 3M6GA 2GTDA 4BC4A 4BG8A 3VERA 3QB0A 1NGJA 3QMLA 4CD3A 4HTLA 4KBOA 5JICA 4H5VA 3EN9A 2E2NA 3ZEUB 3L6QA 3FZFA 2P9NB 3G25A 1Y64A 4MLEA 3SLCA 1BWFO 1V4TA 3LDPA 1ESVA 4FO0A 1ZBSA 5KPTA 4DCHA 3CETA 4AM7A 4EHTA 3WEEB 1GLDG 1ATNA 4DQ8A 1OKJA 3CJCA 1HKGA 4BRAA 3M3ZA 4BG9A 3U9DA 1E4GT 3O1BA 3HSCA 1XUPO 4RTFD 3ZETA 3A0IX 3O1WA 4NO7A 3UKRB 5JMVA 3OHRA 3CQXA 2FF6A 1JCEA 1BA0A 1R59O 3CQYA 4CI6A 5KPRA 1ZC6A 2V7YA 2D4WA 4CZLA 4Z94A 4CBUA 1HKBA 2D0OA 3CJ9A 3QFUA 3FZMA 3FGUA 3A5MC 5EOYA 5AQPA 5AZIA 3R9PA 1X3MA 4YDUA 3H46O 4XEIA 4MLHA 2UYTA 4BRQA 3L0QA 4WYBA 4BRLA 1T44A 2QXLA 3EL2A 3ENHA 4BR2A 3O08A 3FR0A 4BR4A 4H0VB 4B1YB 4K25A 1G99A 3VEWA 2FSJA 3CJAA 5BRDA 4FOIA 5AQMA 4CZEA 1NGAA 5ELZA 2QWNA 2IIRA 4B9QA 4BQZA 4I6MB 3ULEB 4PKIA 5AQLA 3CI5A 4DHYA 3IDHA 5AQJA 2GUPA 4FOEA 4PL8A 5BPLA 3ENOA 4JHDA 2V51B 1NM1A 1S3XA 3O6WA 4FPAA 1J6ZA 4JN4A 2FSNA 5AQVA 1KAZA 3C7NB 2ASMA 2QWPA 4H5WA 5LJWA 1X3NA 1EQYA 1BDGA 4FWQA 2P9LB 3BP8A 1DGKN 1NGEA 2Q2RA 3UKUA 4BC3A 1H1VA 2P9LA 5KPZA 1ZXOA 4GY2B 3EKSA 4QS9A 3CJ7A 5AFUH 4QS8A 1NGHA 2Q97A 3LDLA 3IFRA 3KHYA 2J4RA 5BPNA 2VWBA 1WUAA 3A5LC 3LDNA 3VEXA 3ZEUA 3GBTA 3HI0A 1WOQA 3KZBA 4BQLA 4CBXA 2HMPA 2YJFA 1TYQA 1SZ2A 5BN9A 2E2OA 2YCHA 1QQMA 1KAXA 1TYQB 2P9IB 3CERA 3GOIA 3ID8A 4JD2A 4K41A 3W3DA 2A3ZA 4H0PA 3WXKA 2D1KA 3I33A 3J8AA 3WXIA 3RSEB 5KQDA 4Y0WA 3GE1A 2E88A 1BG3A 1JCGA 2FSKA 4EAHD 5ADXH 3EO3A 2W40A 3D2EB 4AM6A 5LJVA 3UKRA 4B1ZA 5EX5A 3WQUA 2IVNA 4QS7A 4CZHA 3BUZB 4M63C 1NLVA 5BR9A 1ATRA 2YJEA 4BRIA 2CH5A 1U2VB 4H0YB 1NGFA 1BA1A 3O80A 5AQOA 3ZX3A 2Q1NA 1X9JA 5AQUA 5AQNA 2BTFA 2YHYA 3BF1A 2F9WA 3D2FB 2ASPA 3JXUA 2W41A 5AQSA 2E2PA 4H03B 4WQ4A 5F0XA 5FPMA 4FWNA 3VGMA 2GELA 3CJBA 3VF2A 2P9PB 3L4IA 3WEEA 1KXPA 5E26A 4B1UB 1ATSA 4NB4A 3VESA 4BRKA 4MO4A 4H0XB 3M1FA 3C0BA 1DKGD 5AR0A 5BRFA 5FPDA 2P9KB 3O4WA 4FWLA 1HUXA 5AQXA 2QM1A 1QHAA 1GLFO 3FFKB 2QWRA 4LC9B 2KHOA 4M7YA 3ZX0A 3ATVA 2F9TA 4BROA 3A8YA 2GWJA 5AQHA 4O5FA 3VEYA 2ASOA 2QWQA 4JHDB 3LL3A 4H0TB 3H1VX 4PL7A 1GLLO 1RDWX 2E1YA 3QICA 3RSEA 3VENA 3DXMA 3WXJA 4BVOA 3D2FA 5EXWA 2I7PA 2Q36A 3MCPA 1T6DA 4B1XB 1HX1A 1TUUA 3VF4A 5KQ8A 1GLCG 4EHUA 3SK3A 3UKUB 3CHWA 4B1WB 5E84A 2P9UA 2AA4A 5CE3A 3WXLA 3ZETB 3GDQA 3GG4A 1MWKA 2WUSA 3S41A 4WQ5A 3U9ZA 1QQNA 5AZJB 1BU6O 2CGKA 2E20A 1S22A 5TKYA 3DAWA 4CD1A 5AZJA 3TPQA 3DXKA 3H45C 4YDUC 4FWOA 4A2BA 4BRFA 1NGDA 4FSVA 4EFHA 5AQZA 2EWSA 2E8AA 1Z6RA 3QDKA 5EY4A 3WQTA 1BUPA 4F9OA 1C0FA 1BOTO 4BR9A 3SJHA 1HKCA 2YI1A 2BUPA 3AAPA 4IZ9A 3VEOA 4DB3A 3EKUA 2V52B 3F9MA 5AQYA 1P8ZA 2P9SA 5BPMA 1SQKA 2VCPA 5AQQA 2FLOA 2P9SB 4CZKA 4XH5A 1SAZA 3MMVA 3AARA 5FPNA 3FZHA 4CZGA 3EZWA 2QWOA 1XQSC 4FWMA 2A5XA 2IVPA 1NGIA 2HF4A 2D0PA 3DXMB 4J8FA 5ADXA 2A6AA 2ZGZA 2PAVA 5JLHA 4BRCA 3VPZA 1HJOA 1K8KA 5JLFA 4GNIA 4BC5A 4BRDA 4C23A 4WQ4C 1QZ5A 1K8KB 3JS6A 3FE1A 3QBXA 3VGLA 3HTVA 3I8BA 3IMXA 2GEMA 3HZ6A 3A5NC 5AQIA 1YVNA 4H5NA 2Q0RA 3ATUA 3MK6A 4BR5A 2P9PA 2NLXA 2VYPA 4FPBA 3D7EO 4B1VA 4E1JA 4A62A 3TU5A 1E4FT 1RFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NDKA 1A5VA 2XHBA 4FJGA 4ILHA 3RR8A 3MXIA 2CH6A 2ITGA 1IG8A 4CJRA 4FLUA 4JNEA 5GAEP 3E66A 1S9EA 4H5TA 1YT3A 3MAQA 3SBGA 3VQPA 4YFUA 4FWPA 4JD2B 1Q8IA 5AQGA 4H4MA 2OANA 5M1QA 4X66K 3LP1A 4E0DA 4MDAA 4CF8A 3HK2A 4IO8A 4ZHRA 3CCLN 2NRRA 1OH6A 5LMUK 3RTVA 3KK7A 3SQ0A 5FPEA 4DR1K 4DFPA 2PYLA 3BZKA 4BRNA 3IKMA 4O44A 4NYFA 3O9SA 4N5SA 1HYZA 4YOTA 3N4QA 4IXCA 4CJVA 4JKFA 4O8KA 4IWVA 5AQFA 4CEBA 4DFJA 3OYGA 3VF6A 1KCFA 3R6MA 1L3SA 1JCFA 4CJLA 3MN5A 5GAGP 3CFOA 3VGKA 3V9XA 1Q18A 4QCLA 3KK2A 1EX4A 2XY7A 4WE1A 3J7ZO 4J2AA 4DG1A 4CJSA 3ULEA 4DLEA 4JEPA 2UUBK 3VEVA 1GOCA 4OPHA 3LP0A 1NWKA 4OGCA 3IG1A 4FWKA 1OVYA 4JRPA 2V7ZA 2XRIA 4BWJA 4C1NK 1NK8A 1S1TA 3OYHA 3QLHA 3DLGA 4KTZA 3KKRA 4FJKA 2WFBA 4OKJA 4JI2K 5F1XA 1BL3A 1NK5A 1TUYA 3WXMB 4A61A 2ZF5O 1NMNA 3RVCA 2Y1JA 5MLCQ 3M8QA 1MWMA 1VRTA 1RTJA 3VOVA 5C2FA 1WSGA 3LM2A 2X78A 1WSJA 4C8LA 5FROA 2WBNA 1K6YA 3V9ZA 3T1YK 5HP1A 1G15A 2IAJA 3SMPA 3IRXA 4KH6A 4RW7A 4IKFA 4CEEA 2ZJQL 1W9HA 2VQEK 4YOWA 1KLMA 1NOYA 1ZBFA 3DWLA 4E7IA 3B6OA 5IWAK 1IKXA 4CHZA 1YJWN 4KH4A 2FXUA 2W42A 1WB9A 3OY9A 4HUEA 1NJZA 1QQOA 3R8EA 5AQRA 2Y1IA 4CCHA 3HSTB 1LCUA 1D9DA 4KHSA 1Z05A 3MECA 3TI0A 2GTDA 3SUQA 4NLCA 4CD3A 3E01A 5JICA 3KLFA 2RKIA 4AF1A 2E2NA 1Z26A 1CZBA 3TANA 1N33K 3NVKA 3G25A 4LF6K 2G8IA 1BWFO 4R79A 1ESVA 4FO0A 3ZT4A 1JLQA 5KPTA 5HROA 3I55N 4AM7A 4PQUA 4Z4IA 3CFPA 1RT2A 4LY7A 4UQGA 4I9LA 3OBYA 4Z4EA 4BG9A 4IDKA 1C0TA 2HNYA 1Y97A 1VSJA 5J2MA 3O1BA 4RTFD 1XUPO 3SZ2A 3ZETA 4U67L 5CHIA 3CQXA 2FF6A 1JCEA 1BA0A 3KTQA 3NVMA 2V7YA 2FBTA 2HNZA 3F73A 4Z94A 3PLAA 1MU2A 3AVHA 1JLCA 4FXDA 3FFIA 3THXB 4YOYA 3QFUA 5J2QA 1QTMA 5C0YA 1CZ9A 3A5MC 3FGUA 3I0SA 3KLIA 3EYZA 3F9KA 3DLLL 3CYGA 5M1NA 3C65A 1VQNN 3MWTA 4WYBA 2W6KA 1T44A 4FLTA 3ENHA 3EL2A 4CIGA 3DOLA 4DR3K 3T1HK 1T8EA 1VQ5N 1HNZK 3AA5X 1QHTA 4DR4K 4BE7B 5AQMA 4CZEA 1W0HA 3SAHA 4CF1A 2QWNA 2IIRA 1X9SA 4B9QA 4I6MB 5AQLA 3IDHA 3LANA 4PL8A 2V51B 1NM1A 5M1FA 4HCBA 4CGDA 2FSNA 4CF0A 3AA4A 4JLHA 4GVEA 3TAPA 1C0MA 2Q2RA 1FJGK 2OZMA 4DTNA 1ZXOA 3QEIA 3NMUA 3QERA 3QO9A 4QS9A 1OH5A 5AFUH 1YJ9N 4QS8A 3KHYA 2VWBA 2FBXA 3QIOA 1RDDA 3GBTA 3J81O 1YJNN 1ZBLA 4BQLA 4FCYA 4N47A 2YJFA 3CFRA 1VSIA 1U49A 4CEAA 1QQMA 2BANA 1LW0A 1WBBA 1KVAA 3WXIA 3SPZA 3VQQA 4Y0WA 3RWUA 4C8OA 1BG3A 1TK8A 4PUOA 4IBNA 2PFUA 4AM6A 3MX2A 1RCHA 4B1ZA 1P90A 3K5OA 4FK0A 3PSIA 1L3TA 1NLVA 2YJEA 1VSFA 3ITHA 2QK9A 4IOAL 4H0YB 2P5GA 2O8EA 1WAFA 4JI7K 2NRWA 2Q1NA 4CFDA 3S9HA 2ZM6K 1JL1A 3AVBA 1B9DA 4B8AB 5CR4A 2G8HA 4JKEA 4WQ4A 4FWNA 3QEVA 3CJBA 3PIOL 2P9PB 1DTTA 3WEEA 3HVTA 4GMJB 4JI1K 4DS5A 3UIQA 1JLGA 1W97L 3PX4A 5AR0A 3OYFA 3P39A 4DQSA 1VSKA 1HMVA 3OBWA 4M7YA 4DU1A 1JLAA 4BE2A 1X1PA 3V9UA 2UXDK 4M3ZA 3U3YA 4FYDA 3CPWM 3RR7A 4OPJA 3AVAA 2YNHA 3VENA 2E1YA 3QICA 5DK5A 2WTUA 1OH7A 2QI2A 3QESA 3MXMA 2O8DA 3WXJA 3K5NA 1NKCA 3ZLJA 2OA8A 5KQ8A 1GLCG 3M5RA 3NF9A 4DR7K 4GV9A 1VSHA 4E72A 2P9UA 4CJUA 4CHOA 4WF9L 5CE3A 3VQ9A 1RT6A 3JYTA 3WXLA 3HYFA 2KFZA 4LFAK 3C6UA 4DTMA 3HP9A 3VQDA 3KKSA 1BHLA 1C1AA 1QQNA 1L3UA 2B5JA 5GIOA 3EZ5A 3DAWA 4E1MA 4TSXA 3DXKA 3H45C 3QEPA 5KRSA 1NGDA 4FJ9A 5FDLA 2P5OA 5EY4A 1Z6RA 3QDKA 1UA0A 1BUPA 1DTQA 3V1OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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