1JCFA

Mreb from thermotoga maritima, trigonal
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
total genus 110
structure length 336
sequence length 336
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcfA03
1YXQA 3CIPA 5AQTA 4CZFA 2E1YA 3ID8A 3VEZA 1QQMA 2EWSA 3DXKA 4B1UB 1HKBA 3GL1A 3L6QA 5BRHA 3D7EO 2QM1A 2P9SA 1S3XA 3AAQA 1WOQA 4FWNA 4IWVA 5BREA 3WQTA 4BROA 2VYPA 3MN6A 4MLEA 1NBWA 1BWFO 2YHWA 3L0QA 1QQNA 4M63C 5JICA 2IVPA 2QXLA 3C7NA 2I7NA 3GDQA 4BGBA 5AZIA 5F0XA 4RCHA 1TUUA 3ZX3A 2VCPA 1XC3A 5F1XA 2P9LB 4BRNA 3VF2A 1XQSC 4FL9A 1C0FA 2YJEA 4BQZA 3EZWA 2H3GX 4K25A 4BRKA 3VERA 3ZEUB 2E88A 4BG9A 2Q1NA 4CZKA 1K8KA 1LCUA 3O1WA 1NGHA 1NGFA 1BA1A 4B1XB 3BEXA 2GWKA 4H0YB 3MN5A 2W41A 3HSCA 3SLCA 2GEMA 3QDKA 3D2EB 5EXWA 4CZIA 3FLCO 2P9UB 2NZTA 1U6ZA 4BRDA 3RSEA 5KPRA 2A42A 1YAGA 3BF3A 3VEVA 4AM7A 4MLHA 1DGKN 1GLCG 4DCHA 1JCEA 3LM9A 4K41A 3UKUB 3ZETB 3ENOA 2FLOA 4YDUC 3QBWA 5AQIA 1NGCA 3CETA 2Q97A 3DXMA 1TYQA 5AR0A 2CGLA 4HTLA 5AZJA 4WQ5C 4XH4A 1BDGA 2Q0UA 5AQHA 1D4XA 2BTFA 1NM1A 5AQKA 4JD2A 2AA4A 4FWOA 1X3MA 4CI6A 3WXKA 3QB0A 2DPNA 4H03B 3O1BA 5LJWA 1ATSA 5FPNA 4XH5A 4H5WA 1V4TA 3IUCA 4F9OA 3CJ1A 3B8AX 4FOEA 3VF4A 1RFQA 3FZFA 3GBTA 3MN7A 4YDUA 1YVNA 1ATRA 3SK3A 4PKHA 3UKRB 3BP8A 3MMVA 5LJVA 3FFKB 3R6MA 4QS8A 4BRPA 5AQRA 3WXLA 5AQMA 5KPZA 1OKJA 5JMVA 4IZ9A 2PAVA 4BR7A 4BRHA 3FR0A 3HZ6A 4BRLA 3MN9A 3ULEB 2YCHA 5FPEA 1R59O 2ITMA 4XH1A 3CQYA 3LDNA 3GG4A 3I8BA 2YHXA 3M6GA 2IIRA 1SAZA 4I6MA 1E4GT 4WYBA 2E2OA 4JHDA 3ZX0A 3VPZA 1BG3A 4EFHA 4BVPA 1DEJA 4IJNA 3S41A 5ADXA 1CZAN 4Y0WA 4FWPA 2ASMA 2QWNA 4H0VB 1HLUA 1Y64A 3HTVA 2P9SB 4BR5A 3CJ9A 3H1QA 3ZX2A 2YHYA 1JCFA 1NGJA 2V51B 2ZGZA 3P4IA 5BPNA 1ZXOA 2YI1A 1KAZA 1SZ2A 4CZEA 3R9PA 2E2NA 2HF4A 2ZWHA 3BUZB 2I7PA 5EX5A 2A5XA 2QWRA 5AZIB 3TU5A 1E4FT 5AQFA 4PKIA 3C0BA 3KHYA 5ELZA 3D2FB 4DB3A 5KQDA 2P9NA 1NGGA 3LDQA 3AAPA 1HPMA 4EHUA 1GLJO 1C0GA 3WUHA 4NB4A 4CBUA 4CJ7A 1QZ6A 4FWSA 3TPQA 4MO4A 5FPDA 3CERA 3SJHA 2GWJA 2D1KA 1KAXA 1K8KB 3I33A 1BA0A 4A61A 3WEEB 5BN9A 2A40A 4H0XB 3CJ7A 4M7XA 3O5BA 4QS9A 4BRCA 4O5FA 5LY3A 2OANA 5AQNA 3MDQA 1HJOA 2GTDA 2HMPA 2IVNA 4BREA 3AY9A 1NWKA 5EVZA 1LOTB 1BU6O 4MO5A 4JNEA 4EHTA 5CE3A 5AQPA 3A5LC 5BRFA 1T44A 3O80A 1NMDA 1DKGD 2GELA 4ISFA 1MWKA 2IVOA 3W3DA 2ZGYA 3DXMB 1TYQB 4LC9B 5KQ8A 4FSVA 5AZJB 3U4LA 3G25A 3IMXA 1V4SA 4BG8A 4E1JA 4K43A 1ESVA 3QFUA 2FXUA 3O6WA 4H5NA 4B9QA 4JD2B 2HOEA 4QS7A 5BPMA 2HF3A 2V7ZA 3CI5A 4DHYA 3CQXA 2AP1A 3CHWA 4CZHA 2P9UA 3SMSA 2QW9A 5AQGA 4B1YB 4CZMA 4EAHD 1H1VA 3QICA 4BRIA 1RDWX 5I9EB 4EIAA 4BRGA 3R8EA 1GLEG 3UKUA 4H5RA 4IO8A 1BO5O 1SQKA 5BN8A 2FSJA 3CJCA 5EOYA 1NLVA 2F9WA 5AQSA 5AQJA 4NO7A 1TUYA 3A5NC 3VEWA 2CGJA 4PL8A 3HI0A 1RGIA 3QFPA 4GY2B 2P9KA 3VOVA 3FZKA 3FZLA 5AQUA 4C23A 1Z05A 4BRFA 1NGAA 4BGAA 3IDHA 4FWLA 4H5VA 4I6MB 3VEXA 3VGMA 4KBOA 4JHDB 1U2VA 3H6EA 4JN4A 3CJBA 4FOIA 4H0OA 3WT0A 2A41A 2P9IA 4GNIA 3DXKB 3O08A 3H46O 3U9ZA 3H1VX 3FZHA 4FWRA 3KZBA 4BR9A 2D0PA 5BPLA 5AFUH 3U9DA 3JS6A 1HKCA 2Q0RA 2A6AA 3WQUA 3FGUA 3M1FA 3GE1A 4BR0A 5JLFA 2UYTA 3LDLA 3IFRA 1G99A 2P9PA 5F2RA 1X3NA 1NGDA 4H0TB 2FF6A 1MWMA 1GLBG 5EY4A 3VEYA 3VETA 5BRDA 3C7NB 4K42A 2P9NB 4FWMA 2Q2RA 2FSKA 2ASPA 4IXCA 2QWPA 5AQQA 4H0PA 4A62A 5B8HA 2QWMA 2E8AA 2NRHA 4HWIA 3O4WA 2Q36A 1QHAA 2FSNA 3VENA 5JLHA 1Z6RA 2D0OA 4AM6A 3VEOA 4B1WB 4BVOA 2J4RA 1MA9B 4WQ4C 1GLLO 2V52B 5E84A 1NGEA 2QWOA 3FE1A 5AQXA 4PKGA 2CH6A 4BRQA 4BC3A 3D2FA 4CZLA 4IJAA 3RSEB 3SMPA 3EL2A 2CH5A 2E2QA 3W0LA 4CZGA 5AQLA 2YJFA 4CZJA 2P9LA 2E1ZA 2GUPA 2QWLA 4FPAA 4BR4A 3EKUA 3VESA 5AQWA 4WQ4A 4BC2A 2QWQA 5E26A 3VF6A 3WEEA 3ZEUA 2BUPA 3LL3A 4B1ZA 5AFUA 2FF3B 4O8KA 3EKSA 1X9JA 4BRAA 3AARA 1NGBA 3ATVA 3A8YA 3H3NO 4JAXA 3VGLA 2ASOA 3VGKA 1HUXA 2E2PA 5BR9A 4B1VA 1QZ5A 1KAYA 1S22A 4RTFD 4BC4A 1J6ZA 3D2EA 5AQYA 1T6CA 5AQOA 1JCGA 3MCPA 5ADXH 5KPTA 1ZC6A 3WXJA 3LM2A 3ENHA 4H5TA 4DQ8A 4A2BA 2VWBA 4PL7A 5TKYA 3A5MC 2PBDA 3WXIA 2KHOA 4L3QA 5AQVA 1BOTO 1IG8A 4BC5A 1HX1A 3FZMA 3A5OC 1HKGA 3LDPA 4FO0A 3UE5A 2A3ZA 3J8AA 3ZETA 3JXUA 1P8ZA 1T6DA 3MK6A 5AQZA 3F9MA 2CGKA 1GLAG 3QBXA 4XEIA 4CBXA 1ATNA 2D4WA 3A0IX 3GOIA 2Q31A 3CJAA 2P9KB 3M3ZA 4FWKA 4FWQA 4A2AA 2E20A 1GLFO 3BF1A 3EO3A 4BQLA 4BRMA 2WUSA 3HM8A 2W40A 1NGIA 4Z94A 3ATUA 3EN9A 1YUWA 3HBTA 4CBWA 3UB5A 1ZBSA 1U2VB 3QMLA 1WUAA 3KVGA 4FPBA 2P9IB 3DJCA 3H45C 3LDOA 3O8MA 3U8XA 3H3OB 4J8FA 2V7YA 1QQOA 4ISGA 1EQYA 4WQ5A 2NLXA 1Q18A 4CD1A 3UKRA 2F9TA 1KXPA 1MDUB 3OHRA 4CD3A 1BUPA 4BR2A 1GLDG 2ZF5O 3DWLA 4RWTA 4ISEA 2P9PB 1IJJA 1XUPO 3ULEA 4M7YA 3DAWA 3L4IA 5FPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YJWN 2E1YA 3VEZA 1NKBA 2Q3SA 1HKBA 1RDDA 3HK2A 1HQUA 1Q8IA 4RW7A 1ASUA 3GL1A 4DQIA 3HP6A 3D7EO 3AAQA 3QEIA 4WFNL 4E1NA 1VQLN 1SUQA 1VSIA 5KGXA 2HBLA 1NK7A 1T05A 1NJIO 4F8RA 3G6EN 1NBWA 2YHWA 3OYNA 2G8IA 3THYB 1DT9A 5F0XA 5J2PA 1VQPN 4HTUA 1XC3A 3QIOA 2P9LB 3PIPL 4BRNA 2G8HA 5CY4A 5FROA 2HHTA 1VAZA 1J9AA 3TAMA 4DU4A 3OYBA 3VERA 3DRSA 3ZEUB 5C2FA 4K8XA 4FZYA 2Q1NA 3OJSA 4OLAA 4FJNA 2O4IA 3AVMA 3OYHA 1LCUA 1BA1A 4ZTJA 4EZ9A 1BCMA 4YOYA 3HSCA 3SLCA 2GEMA 2OPQA 3FLCO 2NZTA 2UXBK 4DV4K 3EZ5A 3T69A 3SZ2A 1KLMA 4NXMK 4DF4A 1X9WA 4F4KA 4DCHA 2G8VA 4KB1A 3VQ8A 3QBWA 3K2PA 4H4OA 3DXMA 1RILA 3K58A 4WQ5C 2ITGA 1WBBA 1NM1A 2AA4A 1X3MA 3I0SA 3QB0A 2DPNA 3ID6A 4H03B 4AHRA 1OVYA 1QQCA 4Z4FA 1RTJA 3CJ1A 5M1QA 4OGCA 2F8TA 2HHWA 4CJLA 4YDUA 1TVRA 3SK3A 3R6MA 4KO0A 3WXLA 5AQMA 4LSLA 1E3MA 1WSIA 1JXBA 3TSUA 1VRUA 2B4JA 2QA4N 4FLZA 1D8YA 1R59O 3O9UA 3CQYA 1ASWA 3G71N 3I8BA 1SAZA 3QEWA 3LWMA 5C24A 1K8AO 2E2OA 4J2EA 3VPZA 4EFHA 4BVPA 1DEJA 1FKPA 2O8EA 1CZAN 1YTUA 1IKVA 2DFHA 4FWPA 3V81A 1K6YA 4IOCL 4BR5A 4BWMA 3NF7A 3H1QA 3LP1A 3OBYA 4CE9A 2YHYA 2XO7A 5J1EA 2ZM6K 3V4IA 4CGIA 1RT7A 3VQ9A 2BE2A 4Z0UA 3R9PA 4ILHA 5EX5A 3OYEA 2A5XA 1Y97A 2QWRA 3TU5A 1LW0A 4A57A 5CHIA 1YJ9N 4CF9A 4CEEA 3B6PA 4PKIA 3KHYA 4DB3A 3D2FB 3SV3A 3V9ZA 4LF5K 2O8CA 1KFDA 1NGGA 3LDQA 1HPMA 3MECA 4JI3K 1C0GA 4NB4A 1EP4A 4EP5A 3VTIA 4HVJA 4EP4A 3AGRA 2NRTA 3TSPA 4CEZA 3TPQA 5FPDA 3RR7A 3CERA 2GWJA 3I33A 3AA5X 4YOVA 4A61A 3WEEB 1X9MA 4X65K 4LH5A 4LSNA 4U67L 4QS9A 2OANA 4DFMA 2W00A 3J7AP 3ULDA 4O0JA 1O13A 3T7ZA 3OYMA 1IBMK 4XJXA 2HHVA 5CE3A 5BRFA 4CF8A 1NMDA 5GIOA 1T8EA 2GELA 2IVOA 3T1AA 3W3DA 2ZGYA 1DTTA 2FBXA 1VQ8N 1HYSA 4KHNA 5AZJB 4K43A 2UXCK 3CMEN 4JD2B 2HOEA 4JKAA 2OPPA 3V6DA 2HF3A 4B9SA 3CI5A 1JXEA 4DHYA 3CQXA 2P9UA 2QW9A 5AQGA 4B3MK 4GKJK 3HPGA 4EAHD 1ILYA 3V1RA 3O9RA 1RDWX 3G10A 4EIAA 3LZIA 4E7LA 3DLGA 2E4LA 1FXXA 3MWTA 1U4BA 5D3GA 1NU0A 4CHOA 4E7HA 1HQEA 4H5RA 4JK7A 4E7JA 4IBNA 4DFKA 4LF4K 5JENA 2FSJA 1XNQK 4CJ4A 5EOYA 3QESA 4DQPA 4JI8K 4OPHA 4DV2K 1HPZA 3VEWA 2Z1JA 4E7IA 2XY7A 4DG1A 4DLGA 3FZLA 3SQ0A 4BGAA 3M8QA 4CK1A 4I6MB 1VQ4N 3TANA 4E19A 4DUZK 3CFOA 4KHYA 3VTHA 3QO9A 4OJRA 4JHDB 2F96A 5JVHL 1TK5A 1WLJA 2C1IA 1TAUA 3O08A 2E5LK 3FZHA 4FWRA 3AVFA 4A5BA 3ZT0A 4KPYA 3GE1A 2QXFA 2UYTA 3LZJA 2X6NA 5F2RA 3KK2A 4FW1A 4GVMA 4KI4A 1QE1A 1VSLA 3KKSA 1GLBG 2AJQA 3C65A 3AVNA 5EY4A 3MX5A 4CJ3A 5BRDA 5MLCQ 4DR2K 1JLAA 3CYGA 3ZSYA 4JKEA 3N4PA 5AQQA 2O8BB 2JGUA 2OPRA 4H0PA 4A62A 3VQ5A 5CYQA 4M3XA 4JI5K 4G9ZA 2Q36A 4HUEA 1NOYA 1KFSA 1QHAA 2FSNA 3L2VA 2X6SA 2NRZA 5I3UA 4CJSA 1NJXA 4B1WB 4WQ4C 4CEQA 1W2BM 1KVCA 4NCAA 3DRPA 4IEIA 4QCLA 2QWOA 1D9FA 4WE1A 5HRSA 3P83D 3THYA 3K5NA 4JI4K 1A5VA 3EL2A 2KLAA 4KHSA 2E2QA 3LPUA 3W0LA 4DMNA 4CZGA 2YJFA 4R5PA 4FPAA 2P9LA 2E1ZA 1WSEA 4PHTX 5AJ3K 3NF8A 4BR4A 4DSJA 3U3GA 3VA0A 1VQNN 5AQWA 3JSMA 3P31A 4BC2A 3SYZA 1LWEA 3ZEUA 3OYKA 4KV8A 2JLEA 2FF3B 3MCAB 4O8KA 1Q86O 2ZE2A 4LD0A 4CFBA 4BRAA 3AARA 4FCYA 4IFEA 1CZBA 3AVJA 3KK3A 2E2PA 4OGEA 1XHXA 4DR7K 4RTFD 3NF9A 1JCGA 5AQOA 1ZC6A 3OYJA 2NRRA 2DFEA 4A2BA 2VWBA 4PL7A 3WXIA 5AQVA 4DTUA 1BOTO 4BC5A 2ZJPL 1HX1A 3FZMA 3A5OC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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