1JCFA

Mreb from thermotoga maritima, trigonal
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 110
structure length 336
sequence length 336
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcfA03
4BRLA 1GLCG 5ADXA 5AZIB 2IVNA 2FSJA 1D4XA 3QBWA 3D7EO 2CH6A 3IMXA 2E1YA 2F9TA 3G25A 2P9NB 5EX5A 3WEEB 5AR0A 2Q0UA 1NGCA 3TU5A 4XH4A 1SAZA 4H5WA 2FF6A 1HKBA 4IXCA 3TPQA 2QWPA 1X3NA 2PAVA 2IVOA 3MN7A 4BROA 1DEJA 2Q1NA 2GWKA 2HF3A 3FZHA 4WQ4C 1U6ZA 4H0OA 3FE1A 4GY2B 4IJAA 5AQQA 4BR7A 5F1XA 5AQRA 1V4TA 3FFKB 3GBTA 4CJ7A 1LCUA 4RCHA 1BA0A 5FPDA 2ASMA 1Q18A 3A5LC 1K8KB 4BRPA 5KQ8A 2P9KB 2P9LB 4KBOA 1ATSA 4CZGA 2QM1A 4BRIA 4B1WB 5JICA 2ASPA 2P9KA 2P9LA 3M3ZA 3MCPA 2H3GX 1NGAA 3VEXA 1ESVA 2HMPA 4CBWA 4NO7A 3H6EA 4CI6A 5AQLA 2KHOA 1TYQB 4WQ5C 2J4RA 4FWMA 4H03B 2WUSA 2ZWHA 4K25A 5AQKA 4BRAA 4EHUA 1HJOA 1CZAN 3H3OB 4BC2A 3VPZA 4CD1A 4QS9A 1JCFA 5AQHA 1RGIA 1MWMA 1ZXOA 4MO5A 4DCHA 4BRMA 4FPBA 5EOYA 3W3DA 4BR2A 5KPRA 3H45C 1QHAA 4H0VB 1OKJA 3HBTA 2W41A 5F0XA 4BRHA 5AQGA 1IJJA 3U9ZA 4ISGA 4BQLA 3HM8A 4IWVA 3ZX3A 3GDQA 1GLFO 3CI5A 3UKUB 1C0FA 3UKUA 1HKCA 3DXMB 4EFHA 3S41A 3RSEA 3A5MC 4CZEA 5JLFA 1Y64A 5F2RA 3O08A 3WXLA 3EZWA 3ZX0A 3R9PA 3F9MA 1GLDG 3VGLA 3ULEA 5AZIA 3U8XA 2A5XA 3D2FA 3IUCA 1BWFO 1KXPA 1NM1A 3VEZA 3WXJA 1GLJO 4BR4A 2D0PA 4B1VA 4WYBA 5FPMA 3CERA 1HKGA 1WUAA 2QWLA 3CHWA 1TUUA 2E2QA 3VF2A 4J8FA 1NGGA 4XEIA 1NGJA 4FOIA 3AAPA 4BRDA 4BVPA 4BRGA 5KQDA 1E4FT 1NMDA 3MN5A 3H3NO 3DWLA 3EL2A 3AAQA 3VEYA 5AQYA 2P9SB 4M63C 2NZTA 1BO5O 2E1ZA 3FZKA 1NGHA 4FWLA 5AQVA 3ULEB 4MO4A 4BGBA 1Z6RA 4FWRA 3VF6A 1DKGD 4Y0WA 4BG8A 3MMVA 3VERA 3ENHA 1GLBG 3O1BA 2E2PA 2Q2RA 4BRCA 2P9IB 3DAWA 1ATNA 2YHXA 4JD2B 3CQXA 1GLLO 2IIRA 4QS7A 2AP1A 2F9WA 3MN6A 4H5TA 4ISEA 4NB4A 2OANA 1H1VA 1LOTB 1HLUA 2AA4A 5AQMA 2FSKA 4CD3A 1TYQA 1BU6O 1R59O 3CJAA 2ZGYA 3L6QA 3EKUA 3SMSA 2GTDA 5AQUA 4JNEA 3CIPA 5E84A 2P9PA 3AARA 3HSCA 1YAGA 3JXUA 3M1FA 1HX1A 3CQYA 4B1UB 3KVGA 1BUPA 2GELA 1K8KA 4I6MA 2Q0RA 4CZKA 5AQOA 4FWQA 2V7ZA 3BF1A 4I6MB 4L3QA 4PKHA 3BEXA 3A0IX 5ELZA 4IO8A 3O8MA 3C7NB 3IDHA 2YCHA 2IVPA 4FWPA 4CZJA 3A8YA 5BN8A 4PKIA 5BREA 1Z05A 3H46O 5EXWA 4BC4A 3LL3A 4RTFD 4C23A 3BUZB 3SK3A 5AQZA 3VEWA 5AFUH 4A2AA 4BC3A 4CZHA 2A41A 2V51B 4BRQA 4PL8A 2FLOA 2DPNA 5AQWA 2FXUA 3VOVA 3LDNA 3KZBA 4B9QA 1J6ZA 4BG9A 5BR9A 1XUPO 4B1XB 4JD2A 3ZEUB 5AQJA 1IG8A 5ADXH 4BRKA 4A61A 3VEOA 3WQTA 5EVZA 1NGBA 1T6CA 5E26A 3HI0A 5KPZA 3LDLA 3SLCA 3U9DA 1KAZA 2QWOA 5BPMA 3QDKA 1ZBSA 2QWNA 3FZMA 2YHYA 5FPEA 2A40A 5AFUA 3GE1A 2BTFA 4CZIA 4BR0A 1NGDA 2P9PB 2QWQA 1SQKA 3QFPA 2ZF5O 2QW9A 3L4IA 4XH1A 2NRHA 4H5NA 4H0PA 2GUPA 2V52B 1U2VA 5JMVA 4PKGA 3LDQA 4K43A 4M7YA 1X9JA 2Q97A 2CGKA 4LC9B 4DB3A 3EO3A 3ATVA 3ZEUA 5LJWA 1RDWX 3IFRA 1QQNA 4FWNA 4DQ8A 1GLEG 5I9EB 3UKRB 3AY9A 1G99A 5AQPA 3GOIA 5BRHA 2A42A 2QWMA 2Q31A 1KAYA 1YUWA 3FGUA 3M6GA 1NGIA 4O5FA 2E2OA 4CZMA 1EQYA 3D2FB 4WQ4A 3WXKA 2CGLA 5AZJA 2YJEA 3UE5A 1NGEA 1NBWA 2I7PA 2YI1A 3MDQA 4FWSA 3O80A 3GG4A 3QBXA 1QZ6A 1MWKA 2W40A 3VGKA 3QICA 4CBXA 2FF3B 2P9UB 3DXMA 3EKSA 1S22A 3I8BA 3MN9A 3CETA 2P9SA 2NLXA 3CJ7A 4ISFA 4H0XB 3B8AX 2UYTA 2FSNA 4FOEA 2GWJA 3ZETA 4Z94A 5BRDA 1P8ZA 3R8EA 2QWRA 3EN9A 1XC3A 2V7YA 4H5VA 4CBUA 1TUYA 3UB5A 3CJ1A 1MDUB 1YVNA 2P9IA 3VF4A 5BPLA 1NLVA 5AQXA 1HUXA 3A5OC 3P4IA 2QXLA 4MLHA 3FZLA 3OHRA 5AZJB 4BRNA 1S3XA 4RWTA 5FPNA 3UKRA 1V4SA 3RSEB 3LDPA 2E2NA 1BG3A 4BVOA 4EHTA 3VESA 3VEVA 3ID8A 5BPNA 3LM9A 5JLHA 1ATRA 2HF4A 4FWKA 5CE3A 1BA1A 1BOTO 1C0GA 1QQMA 1NGFA 1BDGA 1YXQA 3H1VX 1HPMA 4BRFA 5LJVA 3O4WA 1MA9B 4AM7A 2EWSA 4FL9A 4BC5A 3D2EA 4YDUA 3ZX2A 2PBDA 4JN4A 3FLCO 3CJBA 4HWIA 1GLAG 3HZ6A 5EY4A 5BN9A 1JCGA 2YHWA 4AM6A 3H1QA 3C7NA 3LDOA 2D0OA 2P9NA 4HTLA 4MLEA 3O1WA 4E1JA 3WQUA 4B1ZA 4CZLA 4FPAA 2E8AA 2Q36A 1KAXA 2VCPA 1QZ5A 3JS6A 2E20A 1SZ2A 4B1YB 2VYPA 4FO0A 2GEMA 2YJFA 4M7XA 3C0BA 3WUHA 4K41A 5AQSA 4BQZA 4JHDA 3VETA 4A62A 4IJNA 2ZGZA 4A2BA 4CZFA 4BR9A 1U2VB 1E4GT 2D1KA 4K42A 2E88A 3R6MA 1WOQA 4WQ5A 2I7NA 5AQIA 4F9OA 4H5RA 3O5BA 4IZ9A 3WT0A 3WXIA 3WEEA 4H0TB 4JAXA 4XH5A 3DXKA 3KHYA 4FWOA 2CGJA 3QB0A 3VENA 2ASOA 1T6DA 3GL1A 3DXKB 4DHYA 4BREA 3DJCA 1JCEA 3O6WA 5BRFA 4EIAA 3BF3A 2BUPA 2A3ZA 4YDUC 3MK6A 1ZC6A 5AQFA 3A5NC 3ENOA 1NWKA 4QS8A 3HTVA 1DGKN 3I33A 4EAHD 4H0YB 3CJ9A 1RFQA 5B8HA 2CH5A 2VWBA 3D2EB 1X3MA 5TKYA 3L0QA 4FSVA 4O8KA 2ITMA 3U4LA 1QQOA 1XQSC 3LM2A 3SJHA 3W0LA 3QFUA 3BP8A 2P9UA 3VGMA 5AQNA 3FZFA 2A6AA 3J8AA 1T44A 3FR0A 3CJCA 2HOEA 4PL7A 4BR5A 2D4WA 5LY3A 3QMLA 4BGAA 3ATUA 3ZETB 4JHDB 3SMPA 4GNIA 5KPTA 5AQTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHNA 1NK8A 4JKHA 5ADXA 1YJNN 1DTQA 3BZCA 2YNFA 4JK8A 4H4MA 3SQ1A 3V9XA 5HRSA 3D7EO 3PV8A 3SJJA 3G25A 5EX5A 4C8KA 1NGCA 3HVTA 4JK9A 1S6QA 1SAZA 4X64K 4IXCA 1WSEA 1FKPA 5HBMA 2Q1NA 2HF3A 3FZHA 2ZD1A 1J5OA 4WQ4C 3K5MA 4GY2B 5AQQA 4JS4A 3HJFA 1S72N 1TL1A 3FFKB 3GBTA 4KHUA 1EP4A 3A5LC 4DU3A 1XWLA 4BRPA 2P9KB 2P9LB 1ATSA 4E7KA 4FJHA 2ASPA 1JLCA 4O44A 2P9KA 2P9LA 3MCPA 4PHTX 4CEEA 2YX6A 3AO4A 4NO7A 3H6EA 4HVJA 2KHOA 4WQ5C 3O4QA 3F2KA 4NXMK 1FW6A 4HUEA 3MCAB 3A2FA 5AQKA 4BRAA 2D0AA 3OYBA 1HJOA 1BIZA 1CZAN 3N4PA 4BC2A 3VPZA 4CD1A 3I8DA 3DLEA 2ZJQL 1SUQA 3O9SA 5AQHA 1JCFA 3SV4A 5C10A 4JK7A 5KI6A 3W3DA 2YNIA 4WFAL 3ASMA 1OKJA 3HBTA 3N4QA 3SQ4A 1NKBA 4BRHA 3SAHA 4FJGA 4ISGA 3HM8A 4IWVA 3GDQA 3SBTA 1VQLN 4CGHA 2OCEA 4YORA 3UKUA 1HKCA 1KVAA 3DXMB 4B9NA 4EFHA 3CCMN 4EP5A 4M42A 3A5MC 4ILJA 4YFUA 1UA1A 3J80O 1Q9XA 1RCHA 5AJ3K 3T7ZA 3TSPA 1VQON 3ULEA 3D2FA 3IUCA 3VEZA 3WXJA 4BR4A 4AHCA 3M8PA 1OH6A 2HHHK 3D45A 4DU1A 3CERA 2IAJA 5EU7A 1HNWK 4B8CA 3AA2A 1UA0A 2E2QA 3VF2A 3ZLJA 2A1RA 4O5BA 3KK3A 2R7YA 4BRDA 4BVPA 2XO7A 4X66K 3IS9A 3E9LA 1RT3A 3DWLA 1YI2N 4KHQA 3CFRA 5AQYA 4LD0A 2P9SB 2NZTA 5LMUK 1YTAA 2E1ZA 2XY8A 1NJZA 4LH4A 3FZKA 4Y1CA 4W5RA 4I2PA 4LY7A 3VF6A 4AHRA 1DKGD 1RTHA 1R0AA 4MQ3A 1GLLO 2AP1A 3MN6A 4H5TA 4ICLA 4NB4A 2HHQA 1H1VA 4FW1A 4IFVA 1HLUA 1IKXA 4CEAA 4CD3A 4CJ5A 3CJAA 3B6OA 3PO5A 1HNIA 4MDBA 3AVCA 4F4KA 1UWBA 5AQUA 2UUBK 1RTDA 2OPPA 2F8SA 1QQCA 4CGDA 3JXUA 3D6RA 1A5XA 3QNOA 1HX1A 3CQYA 4B1UB 1BUPA 2GELA 1TL3A 3AO2A 1TAQA 1JXBA 4M45A 4HHTA 5AQOA 4DKWA 3BF1A 4I6MB 1NK7A 3BEXA 3SQ0A 2PY5A 4B9VA 4FJ8A 4CJTA 4WFBL 4KFBA 2VG5A 2Q3SA 4FWPA 1BQNA 3RMBA 4PKIA 3CD6N 3H46O 5EXWA 1X1PA 1D5AA 2X74A 3QINA 3E9PA 4C23A 3OTOK 4A2AA 3SK3A 1JLGA 5AFUH 1NKCA 5JVHL 2O8FB 4GVMA 3Q7CA 4PL8A 4L8RB 3RR8A 4CIEA 2DPNA 5AQWA 3VOVA 1ASUA 1TKTA 2X6NA 1XNRK 4BG9A 1SKWA 4B1XB 2HHWA 4JD2A 5AQJA 1NK9A 1RBVA 3VEOA 1WSGA 1YITN 3U9DA 4JKDA 1KAZA 2HNYA 3OYMA 1VSMA 4CEOA 5FPEA 3OS2A 2A40A 3RWUA 2BTFA 1NK6A 5M1QA 4FK0A 3C95A 4BR0A 3K59A 1NGDA 1K8AO 2ZF5O 2QW9A 4XH1A 5KRSA 3LDSA 4DV0K 2GUPA 4U67L 2P5GA 1B92A 1U2VA 4CK1A 1VSIA 2VWJA 4K43A 4M7YA 3P38A 4LC9B 1RNHA 1T05A 2XHBA 3KIOA 3C6AA 1RDWX 3IFRA 3L2WA 3SQ2A 1EKEA 3P83D 2KW4A 4J2DA 4FWNA 4DQ8A 1Q82O 1GLEG 5JS1A 1YIJN 4DSLA 3PUFA 4NCGA 3GOIA 4KHYA 4YNQA 4BACA 3S3OA 1ZBFA 3HO1A 3FGUA 3SAFA 4GKJK 1VSJA 4EP4A 4DU4A 1EQYA 3D2FB 2JGUA 3RRGA 1UOCA 4KH5A 1Z25A 3LAMA 3LWLA 2YJEA 1NBWA 2YI1A 2WTUA 4E7JA 4DSIA 4FW2A 4CJQA 4JLHA 4DSEA 1QZ6A 1MWKA 1RT5A 1W7AA 1CZ9A 5JS2A 3VA3A 2P9UB 3DXMA 3TAPA 4YOUA 3K5LA 1Y97A 1J53A 3P5JA 4ISFA 3CMAN 3B8AX 2O8CA 2UYTA 2FSNA 4DLGA 5BRDA 4CESA 3CPEA 2G8KA 4BDPA 3DI6A 1TUYA 3WNHA 3UB5A 4N47A 1YVNA 2YHAA 2YKNA 2C1IA 3VQQA 4KTQA 4CGGA 2F96A 3MX2A 3RSEB 3ITHA 3K2PA 3OJUA 4BVOA 1JL1A 3VEVA 4M3RA 5CE3A 2I5JA 4NXNK 5C0YA 1YXQA 3QIPA 5LJVA 3OYGA 3MXIA 3ZT0A 1OVQA 1VRTA 4IFEA 3J7ZO 4AM7A 5GAGP 4BC5A 3D2EA 3V9UA 1ZYQA 2YHBA 3FLCO 4FZXC 4DFKA 2HBLA 1ZBIA 1JCGA 3AGRA 1C0TA 3H1QA 3LDOA 2D0OA 3DLHA 1KVCA 3HPHA 3O1WA 4CHQA 4CF1A 5GADP 4FPAA 3V9WA 4LFBK 1QSLA 3TAGA 3BDPA 3AVMA 2NRZA 1KLNA 2E20A 4CJWA 3CQ8A 4FO0A 4JI2K 5JENA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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