1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
3J8AA 4EIAA 2QWPA 3VOVA 1NMDA 4IXCA 3FLCO 5AQUA 1MWMA 3WQUA 1BWFO 4CZHA 1E4FT 3W3DA 3VEZA 3DXMB 2FXUA 2Q36A 4BC2A 3BF3A 3C7NB 3VF6A 3LDNA 4IJNA 3O5BA 2ZGYA 5EX5A 1HUXA 4ISFA 3P4IA 4BG9A 3VEWA 3VGMA 4RWTA 3JXUA 1E4GT 2Q2RA 2VYPA 3C7NA 4H0YB 3VF4A 3VGKA 3WXKA 2GUPA 4CZGA 1HKBA 1QZ5A 2QW9A 4CBXA 1GLCG 3QFUA 1OKJA 4JHDA 3LM2A 1SAZA 4JD2A 3WXJA 4FPAA 4PL7A 1ESVA 1QHAA 1QQMA 4BGAA 4WQ4A 3QDKA 5BPNA 2ASPA 1DEJA 2QWOA 1HX1A 4IZ9A 4DQ8A 5FPMA 4CBWA 3QICA 5KPZA 1TYQA 3L4IA 2GWJA 2A6AA 4B1XB 1BA1A 5AQGA 5JMVA 3U9ZA 3O80A 4RTFD 1MA9B 3DXKA 1NWKA 1YUWA 4H5WA 3FZLA 3UKRB 2VCPA 5KQ8A 5FPNA 3FZKA 3LL3A 5JICA 3FFKB 2YJEA 4DCHA 3CIPA 1BA0A 2V7ZA 4PKHA 2F9TA 4BR7A 3DJCA 3L0QA 4ISEA 2WUSA 3CJ9A 3QFPA 3WXLA 1D4XA 1KAZA 4BR2A 1QQNA 3SMPA 3EL2A 1IG8A 1HPMA 3HI0A 1NGAA 2Q31A 2YI1A 4M7XA 4BRIA 1NBWA 2YCHA 3QMLA 5BRFA 4O5FA 2EWSA 3A5NC 3IDHA 4QS7A 1U2VB 4H5VA 3UB5A 4BQZA 3O1WA 3O6WA 1TUUA 1NGHA 5AQVA 4H5TA 1WUAA 2HOEA 1QZ6A 2P9NB 2ASMA 3W0LA 3O8MA 3SMSA 4CJ7A 2I7PA 2P9PA 5AQWA 1DGKN 3FZFA 4DHYA 1NGBA 4I6MB 4M7YA 4K25A 5AQSA 2P9IB 2PBDA 3BP8A 4CZIA 3A5MC 3A5OC 4K42A 4K43A 2FLOA 5AQIA 5BRHA 3L6QA 4BC3A 4CZLA 4BRNA 4JD2B 3FZHA 2YHYA 1TUYA 3VETA 2IVOA 4HWIA 2QWQA 1X9JA 2GWKA 3TU5A 4M63C 5AQMA 2OANA 4H0VB 1HJOA 3S41A 4A2AA 3EN9A 3MDQA 1LOTB 2P9LA 2Q0RA 1MDUB 4H5RA 1WOQA 2GTDA 4BRLA 3MN9A 1QQOA 1NM1A 3FE1A 3UE5A 2P9KB 1K8KA 3WEEB 3AARA 2ZWHA 3ZEUB 4H0PA 2E88A 4GY2B 1ZBSA 4BG8A 2NZTA 2CGLA 5AFUA 1Q18A 2VWBA 4DB3A 2E2OA 4WQ4C 4B1UB 1BUPA 4FWKA 3CQXA 3VEYA 1SZ2A 3MMVA 4I6MA 4MLHA 3ZEUA 1NGCA 4B9QA 2CGJA 5LJWA 5EXWA 2CH6A 4Z94A 3D2EA 2Q97A 1J6ZA 1TYQB 2ASOA 3ZETA 5FPEA 4AM6A 5AZJA 3HM8A 2E2QA 1NGIA 4WQ5A 1S22A 2V52B 1Z6RA 4MLEA 4YDUC 3BUZB 4BRKA 1G99A 4O8KA 3DAWA 4JNEA 4BVOA 2GELA 5ADXH 4FPBA 3UKRA 1GLFO 5EOYA 2P9UB 1T44A 1LCUA 1XQSC 3QBXA 5KPTA 5B8HA 4CZEA 3H1QA 4RCHA 2FF3B 5AQTA 3ULEB 5AZJB 3GG4A 5BREA 3B8AX 4BRGA 4J8FA 3R6MA 2AP1A 4H0XB 3M1FA 5AQXA 3ENHA 4CZFA 4MO4A 4BROA 1HKCA 4FWPA 3ULEA 1NGDA 1KAXA 1C0GA 1BO5O 3QBWA 4BRFA 3CHWA 3OHRA 2CGKA 4FO0A 3IMXA 4FSVA 4BR5A 4FWQA 2A3ZA 2A5XA 2E8AA 3ZETB 4PKGA 2IVNA 5AQRA 2QWRA 5E26A 2FSJA 4MO5A 3GDQA 4XH5A 5AZIB 3VEOA 5F0XA 3RSEA 3U4LA 4H0OA 5KPRA 2DPNA 2P9PB 3HSCA 1V4SA 2F9WA 1ATSA 3CJCA 3KVGA 4B1VA 3C0BA 4A62A 4PKIA 4B1WB 5AQFA 2E2PA 3M3ZA 4BRHA 4XH4A 3WUHA 3ENOA 3VGLA 1RGIA 1P8ZA 4A2BA 2A41A 5BN9A 2FSKA 3EO3A 3ZX0A 3VPZA 3ID8A 4BREA 2YHXA 2P9SA 5AQNA 4BQLA 1T6CA 4LC9B 4BR0A 5LY3A 5BPMA 3DWLA 4YDUA 3CI5A 4QS8A 4CD3A 4CZJA 3SK3A 4AM7A 3FZMA 3AAPA 2IVPA 4JAXA 4CI6A 2V7YA 3ZX2A 4NO7A 4JN4A 2P9UA 4NB4A 1EQYA 3CERA 1XUPO 4BRAA 3EKSA 4Y0WA 3U8XA 3MN5A 1RFQA 1YAGA 3KZBA 3RSEB 2Q0UA 4CBUA 5AQLA 1ATRA 3CETA 1NGFA 3H3NO 4BR9A 3VEXA 5CE3A 4C23A 5ELZA 5AQJA 3VENA 3HBTA 2P9KA 3O08A 3LDLA 2FF6A 3A8YA 4WQ5C 5I9EB 3UKUB 4IJAA 4EHTA 4FWRA 1RDWX 2P9IA 2A42A 3A0IX 4FL9A 4H5NA 5AFUH 4FOIA 1DKGD 1JCFA 2BUPA 2YHWA 4H03B 2A40A 2NLXA 1BU6O 4BRPA 4EFHA 2QM1A 2QXLA 3ATUA 3WXIA 3D2EB 3O4WA 3I8BA 5AQYA 2D0PA 3ZX3A 4BVPA 3VF2A 2ZF5O 3A5LC 3LDOA 1C0FA 3EKUA 4EAHD 1K8KB 3M6GA 3WEEA 1YVNA 5FPDA 3H46O 1X3NA 2UYTA 1SQKA 1HKGA 5AQKA 2ITMA 2QWNA 4ISGA 4H0TB 4CZKA 5TKYA 4FOEA 1ATNA 2H3GX 5F1XA 1NGJA 3KHYA 3VESA 1T6DA 2BTFA 2W40A 3D7EO 3MN7A 2I7NA 3QB0A 4WYBA 4BRDA 5BN8A 2AA4A 5AQHA 3BEXA 2ZGZA 3DXKB 2HF3A 5AQOA 4K41A 1GLEG 3CJ1A 4FWSA 2E1YA 4PL8A 3JS6A 3LM9A 3IUCA 1BDGA 5JLFA 3H6EA 5EVZA 4HTLA 5EY4A 3TPQA 3FR0A 3LDQA 3O1BA 4FWNA 4L3QA 4BC5A 1U6ZA 1ZC6A 2Q1NA 3WT0A 4IWVA 1HLUA 3VEVA 2QWMA 2D0OA 3H1VX 3FGUA 2J4RA 3H45C 1KAYA 3GOIA 5LJVA 2P9NA 1CZAN 4XH1A 4B1ZA 2GEMA 2FSNA 1NGEA 3CJAA 1XC3A 1R59O 1NGGA 4E1JA 1JCGA 1V4TA 3GE1A 5AZIA 1X3MA 4FWLA 3EZWA 4KBOA 1U2VA 5ADXA 1GLBG 3H3OB 3HTVA 2HF4A 1YXQA 5F2RA 2QWLA 5AQPA 3GL1A 2E1ZA 3R8EA 4A61A 1NLVA 2P9LB 2E2NA 4FWOA 4BC4A 4BRCA 3CJBA 1BG3A 2PAVA 3ATVA 4XEIA 3DXMA 1ZXOA 4BRQA 3SLCA 2HMPA 3HZ6A 3R9PA 1H1VA 5KQDA 2D4WA 1Y64A 2D1KA 4CD1A 1GLJO 2IIRA 2YJFA 2W41A 1GLAG 1GLDG 4BGBA 3F9MA 2V51B 2KHOA 2CH5A 1GLLO 2P9SB 3UKUA 4F9OA 3IFRA 3GBTA 2E20A 3CQYA 3MN6A 3LDPA 3D2FB 3MCPA 3VERA 5BRDA 1BOTO 4IO8A 3BF1A 2NRHA 1MWKA 3I33A 5BR9A 4CZMA 1Z05A 3G25A 5JLHA 4QS9A 3CJ7A 4JHDB 4EHUA 5AQQA 5AQZA 3AAQA 4GNIA 4BR4A 3MK6A 5E84A 1IJJA 4B1YB 3AY9A 1JCEA 3D2FA 3SJHA 1KXPA 1S3XA 4FWMA 4BRMA 3WQTA 3U9DA 5AR0A 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSHA 1KC8O 1IH7A 4IXCA 4IKFA 1YF5L 2KFNA 5AQUA 1BWFO 2PFUA 1E4FT 4NYNA 4CK2A 3DXMB 2Q36A 4JI7K 2A1SA 1LV5A 2NUBA 3BF3A 3C7NB 3DLEA 3VF6A 4FJJA 3QEXA 1XNRK 1D9DA 4Z4HA 2OPPA 3VEWA 1XMQK 5FRMA 3OS2A 4F2SA 5HRRA 4H0YB 1GOAA 4IBNA 3O3HA 1ZBLA 4DSJA 1LAWA 2KQ2A 3HPGA 4AHUA 1QHAA 4BGAA 4WQ4A 3QDKA 3RRGA 2WBNA 1DEJA 2QWOA 1R0AA 4FK0A 4DQ8A 5FPMA 4CBWA 3QICA 1TGOA 2G8IA 5KPZA 1VQNN 2GWJA 3AA4A 1BA1A 5AQGA 1BI4B 4KREA 3U9ZA 1OH8A 4LF9K 4IDKA 1ZBHA 3OW2M 4H5WA 3ZLJA 4E72A 1VSDA 3UKRB 5KQ8A 3AVJA 4DQIA 2HNYA 4DR2K 3FZKA 3TAPA 1NK6A 5JICA 4B8AB 2YJEA 1KVBA 1BA0A 2V7ZA 4C1NI 5KI6A 4PKHA 3S3MA 4CIGA 1JXBA 4ISEA 4OPKA 3BDPA 2Z1GA 3MWPA 4M3TA 1EP4A 4FK2A 3VN5A 2BGGA 1IG8A 3HI0A 4O44A 1CZBA 1NGAA 2Q31A 1YTUA 1NBWA 2F96A 3C6TA 4FYDA 3ULDA 3SBTA 3A5NC 3LDSA 3AVHA 4JS4A 2FBXA 3O6WA 1NGHA 3AO4A 4DFKA 3VQPA 4BWMA 5J2PA 4B9NA 2P9NB 3W0LA 1NK7A 2HMIA 1DGKN 5KGXA 4JKHA 4I6MB 2HHTA 4M7YA 4K25A 2P9IB 3OJSA 2PBDA 2YHAA 4DSKA 3MECA 4CVNE 3L6QA 4BRNA 4JD2B 2BH1A 4JRQA 3MWTA 3CCEN 4KKOA 1X9JA 2GWKA 1RT3A 3TU5A 1I39A 2YNFA 5AQMA 4N56A 1VQ5N 3MDQA 3ZSYA 4B3SK 4JKFA 3P31A 1MDUB 3V6DA 1FK9A 3DRRA 4BRLA 4AQYK 3O9UA 1NG9A 3IS9A 3LPTA 3NF9A 3AARA 4JK8A 3SAHA 3NF7A 4FJNA 3P1GA 4BG8A 2E88A 3CPWM 3PUFA 5AFUA 2GX9A 3QINA 2O8EB 1Q18A 2VWBA 1JLGA 4DB3A 1KFDA 2E2OA 1BUPA 3CM5A 4IEIA 4MLHA 1A5XA 1NGCA 3M8PA 5LJWA 1A5WA 1IBKK 1UWBA 3AO2A 4CERA 1LWEA 1ASUA 1NK0A 4DR4K 3E66A 1J6ZA 3L2VA 2ASOA 3Q7BA 2RHKA 3HM8A 3SNNA 2V52B 4KHPK 4BRKA 4X65K 1GOBA 4O8KA 4W5RA 4DKWA 3M8SA 1TK0A 1FJGK 5EOYA 4AH9A 1LCUA 2E6LA 1IG9A 4J2AA 4CGGA 2R7YA 4RCHA 3NH1A 3ULEB 5AZJB 4CK3A 1N32K 1NJZA 1QSYA 2JGUA 3WNGA 3R6MA 5AQXA 3OYLA 3ENHA 3RVCA 3HK2A 4WF9L 1HKCA 4FWPA 4DR3K 3ULEA 1NGDA 3MX2A 4B3OA 4GVMA 4I9QA 3CHWA 1FW6A 2CGKA 4CJ5A 4FWQA 1XWLA 3PIPL 3ZETB 3DOLA 4JKDA 5CZ1A 5C15A 1SKWA 5E26A 4MO5A 3DM2A 1K73O 1IV0A 5AZIB 3VEOA 3RSEA 3TAEA 3T1YK 4H0OA 5KPRA 2DPNA 2P9PB 3OYGA 3L4QA 3D45A 2VGMA 4IFEA 4PKIA 4B3MK 1REVA 4BRHA 2HHSA 3ENOA 1IKXA 3RMDA 3VGLA 3CCJN 4AHTA 2PY5A 2HHHK 2FSKA 4BACA 2ZJRL 4DTRA 3ID8A 5HL7L 4BREA 4YOVA 3CQ8A 2O4GA 3AVGA 4CHOA 1T6CA 4LC9B 4OKKA 5LY3A 4YDUA 3THXA 3SK3A 4OLBA 1TKZA 4GVEA 4ZTFA 1TV6A 2NRRA 3MXJA 3FZMA 4CI6A 2YHBA 4FLZA 3CCQN 3AVKA 3T69A 4DFJA 1C0UA 2O8FB 1XMOK 4BRAA 4CJEA 1RFQA 3AVCA 4CBUA 3AO5A 3QETA 3H3NO 3HT3A 3THWA 2P5OA 5CE3A 3PSFA 4C23A 5AQJA 3J7ZO 3PX4A 2UU9K 3CF5L 4ILHA 2UUBK 3UKUB 4IJAA 5E41A 2HVIA 1RDWX 2OA8A 5HOOA 4M41A 3NGZA 4M3WA 4DV7K 4H5NA 1CXUA 1SV5A 3I56N 2BUPA 1P90A 2G8UA 4WCEL 1BU6O 4NYFA 2QM1A 4U67L 1WN7A 3WXIA 3D2EB 4DV0K 4B9SA 2D0PA 4X62K 3VF2A 5SWMA 1NK4A 1BHLA 4CEAA 4OPHA 4EAHD 5FPDA 1HKGA 2UYTA 4CEDA 2QWNA 4O8UA 1VSFA 4CZKA 4FOEA 5F1XA 3KHYA 1VSEA 3D7EO 3J81O 5AQHA 3QO9A 1VQ6N 5GIOA 2GBZA 3IRXA 2D0BA 1Z26A 1BDGA 4A5BA 4C8NA 1S72N 1C0MA 1VRTA 3BZCA 4FWNA 1ZC6A 4E7LA 4IWVA 2HVHA 1BCOA 1ILYA 3QNNA 1TL1A 1KVAA 5J2QA 3FGUA 3CG7A 2YNGA 4FW1A 4KH6A 2GEMA 3J7AP 4JYAK 3F5TA 1R59O 1YJWN 3KD1E 4Y1CA 3NF6A 1X3MA 2VG5A 4I2PA 4FWLA 3T3FA 1W97L 1KD1O 1SL1A 4TSXA 2KKZA 3K9JA 3HTVA 5F2RA 3CC4N 5AQPA 4ELTA 3B6OA 4A61A 4DUYK 4DLGA 4FWOA 5IT9O 2PYLA 4BRCA 1NJIO 5IWAK 3ATVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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