1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
4MO5A 4WQ5A 2P9LB 1S3XA 1NGHA 4IZ9A 3VEXA 4JHDB 3L0QA 1BO5O 5EX5A 4F9OA 3C0BA 4LC9B 4WQ5C 1CZAN 3IMXA 4YDUC 4BRGA 3FR0A 3KVGA 1DGKN 3EKUA 4M7YA 2ITMA 2VCPA 1JCEA 2VYPA 3F9MA 1DEJA 4BRDA 5AR0A 4J8FA 2A6AA 5LJWA 2YHYA 2E1YA 4BRCA 1BDGA 4H5VA 3VESA 3VGMA 2FLOA 4ISFA 4BVOA 4IJNA 4JD2B 3VF4A 2A42A 1WUAA 5AQLA 4K42A 1U2VB 3CI5A 4FWPA 2A40A 4FWMA 4PKIA 2P9UB 4CD3A 3DWLA 4ISEA 4B1WB 2D0PA 3UKUB 3S41A 5AZJA 1Z6RA 5CE3A 2QW9A 2HOEA 4XEIA 1QQMA 2QWOA 1HPMA 2P9IB 4PKGA 3L4IA 5E26A 5AQUA 3RSEB 3SMPA 1BUPA 3WXKA 3CQYA 4CJ7A 1V4SA 3TPQA 3WEEA 1K8KB 3GG4A 3UKRB 4DHYA 1P8ZA 1BU6O 3QBWA 3VEYA 5JMVA 4FWSA 4H5TA 3GDQA 5BRDA 5JLFA 4H0TB 1T44A 3C7NA 3O5BA 3QFPA 2CGJA 1XUPO 3DJCA 1ZC6A 4CZIA 2NLXA 3U4LA 3SLCA 5EOYA 1HX1A 4BRHA 3SJHA 1HKBA 4XH1A 1HJOA 4B1ZA 5I9EB 3ZEUB 1R59O 3FZKA 3CERA 4B1YB 1MA9B 3EKSA 3FLCO 2Q0UA 4CZJA 2NRHA 1RDWX 5JICA 4NO7A 4CZGA 1BG3A 3UKUA 4A2AA 3BP8A 2I7PA 3RSEA 4BRFA 4RCHA 3VETA 1TYQB 4BREA 1GLDG 1SZ2A 5EY4A 3ZETB 1Q18A 3QFUA 1NGIA 2FSJA 5AQPA 5EVZA 1NGEA 2HF4A 4B1UB 4E1JA 4BRIA 4FL9A 2H3GX 3A5MC 1IG8A 5AQFA 4QS9A 3QICA 3DXKA 4GNIA 5ELZA 3CETA 4WYBA 3I8BA 3QB0A 4BG8A 4IJAA 1GLLO 4FWLA 3EL2A 3UE5A 5AFUA 3O08A 1ATNA 1RFQA 2D4WA 2CH6A 4MO4A 1MWKA 4ISGA 4Y0WA 3GBTA 3MK6A 2V7YA 4KBOA 1SAZA 5B8HA 3U8XA 4H5RA 4CZMA 2CGLA 4M7XA 2ASOA 4GY2B 3WXJA 4QS7A 2P9NA 2P9IA 3ENHA 4DCHA 2AA4A 4B1XB 3VEVA 1NWKA 4H5WA 3D2EA 3OHRA 5E84A 4EHUA 4BRAA 4AM7A 3HI0A 2ZGZA 3TU5A 4BRLA 1NMDA 2FXUA 4BRKA 1K8KA 3EN9A 2E88A 3LDPA 5BPMA 3CIPA 4FWNA 1TUYA 2GUPA 3O4WA 4EFHA 4I6MB 1BA0A 5FPDA 1X3NA 4BGAA 4B9QA 1BWFO 2VWBA 1GLAG 3DXMB 5F2RA 2PBDA 3QBXA 2P9LA 4XH4A 3J8AA 4DB3A 1SQKA 3HTVA 3QMLA 2P9PA 2P9KB 3M3ZA 2ZGYA 2KHOA 4EAHD 5AQYA 3H1VX 4EIAA 2IIRA 3VOVA 5BRFA 4L3QA 2QWRA 2YJFA 4FPBA 3UB5A 5KPTA 3A5NC 3H6EA 4EHTA 2W40A 2V52B 1YUWA 3SMSA 4CI6A 5KQ8A 2PAVA 3WQTA 1ZXOA 2FSNA 3VEWA 5BPLA 3MN6A 5LY3A 5AQXA 4FWOA 2E2QA 5AQIA 5ADXA 3QDKA 3ID8A 2E2PA 3W3DA 1J6ZA 1JCGA 3MDQA 4MLEA 4I6MA 2AP1A 4K41A 5AQTA 5AZJB 5KPZA 1TUUA 3KZBA 4PKHA 4QS8A 4FWRA 3WXLA 5AQKA 3G25A 5AZIB 1QHAA 4H5NA 4PL7A 2A3ZA 3ULEA 2IVPA 1V4TA 3H45C 1D4XA 3FZLA 3D7EO 1BOTO 5AQWA 5FPEA 3CJCA 4BQZA 2YHWA 1QZ5A 2EWSA 3P4IA 4BR9A 3ZEUA 1ZBSA 4IO8A 2P9SA 4JNEA 4CZHA 2CGKA 3R8EA 3VEOA 2P9UA 1JCFA 3VENA 1Z05A 5BRHA 3MN5A 4AM6A 3I33A 3U9ZA 5BN8A 1LCUA 5KQDA 3IUCA 3D2FA 2YI1A 4A62A 5EXWA 3IDHA 2Q1NA 2IVOA 1NM1A 3R9PA 3FZMA 3BUZB 1C0GA 1Y64A 3H3NO 1TYQA 2QWPA 2E2OA 3WEEB 4JHDA 3UKRA 4BC2A 2NZTA 4BR4A 3WQUA 3MN9A 1YVNA 5FPNA 5LJVA 3O1BA 1DKGD 1NGJA 2A41A 1KAYA 2J4RA 4CBXA 5AQZA 3O8MA 4A61A 4H0VB 5KPRA 2WUSA 1NGAA 4FWQA 1U6ZA 3LDOA 2QWNA 5AQVA 4FSVA 3L6QA 4JD2A 3CJBA 3LDNA 4BG9A 3HSCA 3A0IX 3CJ1A 3VGKA 1NGDA 3GOIA 4XH5A 4BR7A 2E8AA 3VERA 2P9NB 3HM8A 3H3OB 2IVNA 2ZF5O 4H0PA 1WOQA 2D0OA 3ZX2A 1G99A 4MLHA 1ESVA 3D2EB 2HF3A 3R6MA 1NGFA 5AQOA 3ULEB 4CZFA 2BTFA 3ZETA 2V7ZA 4BR0A 3ZX3A 5AQHA 5JLHA 5TKYA 1NLVA 4O5FA 2Q31A 3EO3A 1T6DA 3A5LC 3CJ7A 2OANA 4A2BA 1NBWA 3DXKB 3B8AX 3HZ6A 3BEXA 3U9DA 5AQRA 3DXMA 2HMPA 3FZFA 3C7NB 5AQQA 2QXLA 4DQ8A 4Z94A 1NGBA 3IFRA 1HLUA 2YCHA 4WQ4A 3BF1A 1E4FT 5AQSA 3AAPA 3M1FA 3JXUA 2ZWHA 3H1QA 1GLCG 1LOTB 2GWJA 4HTLA 2F9WA 1GLFO 4PL8A 3LDQA 3CHWA 4K43A 3VEZA 4BR2A 5ADXH 3AY9A 1ATRA 1X3MA 4FOEA 3LM2A 2F9TA 4BRMA 2QWQA 4IWVA 4RWTA 4YDUA 1XC3A 2GWKA 2Q2RA 5AQJA 3GL1A 3CJ9A 1X9JA 4NB4A 4WQ4C 4BRNA 5BREA 3VGLA 4O8KA 2QWLA 2UYTA 5BN9A 2A5XA 1YAGA 2ASMA 4H0XB 4JAXA 2FF3B 4K25A 3DAWA 4C23A 3ATVA 3A8YA 2P9KA 2QM1A 3WUHA 1QQNA 1QZ6A 5FPMA 4BC5A 3LDLA 2QWMA 3VF6A 2YJEA 3HBTA 4IXCA 2E20A 1E4GT 4JN4A 4BVPA 1HKCA 1T6CA 3MMVA 4BC4A 2GTDA 3AAQA 5BPNA 2CH5A 3MN7A 4RTFD 4FWKA 3FFKB 3VF2A 5F1XA 2ASPA 1MDUB 2Q0RA 4CZKA 2V51B 3EZWA 2FSKA 3LL3A 4B1VA 2Q97A 2FF6A 1BA1A 1HUXA 2P9SB 5BR9A 2GEMA 1GLBG 1EQYA 1KAXA 3O80A 4FO0A 1S22A 5AFUH 2D1KA 3O6WA 2E1ZA 1C0FA 3D2FB 2DPNA 3GE1A 5AQNA 3KHYA 1GLJO 2YHXA 5AZIA 4CBUA 2BUPA 3FE1A 4H0YB 1NGGA 3CJAA 1MWMA 1ATSA 4H0OA 4BRQA 2P9PB 5F0XA 4CZEA 3LM9A 3FZHA 1IJJA 4FOIA 4BC3A 1KXPA 1QQOA 4CZLA 5AQGA 3AARA 1NGCA 3ATUA 2Q36A 4BRPA 3FGUA 4FPAA 5AQMA 3VPZA 3W0LA 3WXIA 3MCPA 2GELA 4CD1A 2E2NA 2W41A 4BR5A 4H03B 3CQXA 4BROA 3ZX0A 1XQSC 4BGBA 2I7NA 1HKGA 3WT0A 1YXQA 4CBWA 3A5OC 3ENOA 1U2VA 3BF3A 4HWIA 1KAZA 3H46O 4M63C 1OKJA 3JS6A 3O1WA 1RGIA 3SK3A 1H1VA 4BQLA 1GLEG 3M6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VN5A 2P5OA 2P9LB 2HVHA 4IEIA 3OS1A 1HNWK 1L3UA 1KSPA 4YOWA 3PX4A 1WSFA 2HHXA 2IS3A 4F9OA 3RRHA 3L2RA 3NGYA 3EKUA 1NK0A 3AVMA 1JCEA 2VYPA 1BL3A 2OYQA 2KLAA 2A6AA 4FJKA 2QA4N 2E1YA 4H5VA 1ZBUA 2ETJA 4ISFA 1EWQA 3QEWA 2YNFA 2YNHA 2QKBA 4KKOA 3MCAB 3AVLA 4E7LA 2RPIA 4FWPA 3LAMA 3TAEA 3HRGA 4B3SK 2KW4A 3L4QA 3K0SA 3DLGA 4CHZA 1NJIO 4ISEA 4R5PA 4B1WB 4A57A 4CE9A 3L3VA 3B6OA 3A2FA 2P51A 5DK5A 2BDPA 2HOEA 4W5NA 1HPMA 3L4IA 3SMPA 2OPQA 1C1AA 3S3MA 2GX9A 4FK0A 3NF7A 1KTQA 3F2KA 3T1HK 1WAJA 3KTQA 4I2PA 3GG4A 3UKRB 4DHYA 5IT9O 1P8ZA 2G8FA 3K5MA 2D0AA 4E7HA 1S6PA 1N33K 3LANA 3O5BA 4JS4A 3QFPA 2CGJA 2O8CB 3DJCA 3K5OA 1RTDA 3U4LA 4JRPA 1NKEA 3SBGA 4CF0A 1RNHA 1ZBLA 2UXBK 4XH1A 1HJOA 3DLEA 3WNEA 1REVA 3ZEUB 3NH2A 4GV6A 3R3LA 1JLCA 4AHRA 4PA1A 3M8PA 1QHTA 4YOUA 4FJ5A 3EKSA 4CZJA 2NRHA 5JICA 4Z4HA 1BG3A 1R0AA 1C0MA 4HUFA 4A2AA 1VQNN 1TVRA 3HPHA 4F2SA 3QLHA 3RR8A 3RSEA 4RCHA 1GOBA 1T3VA 4CEAA 3OVNA 3VETA 3KD1E 5CY4A 5AQPA 1DTTA 4YOYA 4B1UB 3OYJA 1KQSM 4FM0A 4M3RA 1RDUA 3ALYA 5ELZA 1ASVA 3QB0A 3ZT0A 5AFUA 5BR8K 4OLBA 4CK3A 1LW2A 2CH6A 4MO4A 1XNQK 3NF6A 4ISGA 4Y0WA 1SAZA 1VSMA 3CCVN 4FW2A 4DQSA 4GY2B 4B08A 4Q5VA 3RRGA 2UXDK 4EZ6A 2GBZA 3VEVA 1NWKA 4AILC 1BGXT 3D2EA 4BRAA 3SQ0A 1VSKA 4BRLA 1S1UA 4BRKA 5BPMA 3K9KA 2HHSA 1YF5L 4FWNA 1C6VA 2WFBA 2GUPA 3SJJA 4I6MB 2C1GA 4B9QA 1SKRA 1GLAG 3DXMB 2HHUA 2PBDA 1JLBA 3VQ5A 4DQQA 2P9PA 4LF8K 3HT3A 4ZTFA 4EAHD 3H1VX 3OYNA 4B8AB 5E41A 3O9TA 4NXMK 2IIRA 1A5XA 2YNGA 4FK4A 2QWRA 5KPTA 4F3TA 4JI8K 4Z4FA 4IKFA 4FJ9A 1NK5A 4B9NA 4DTMA 3DI6A 1JJ2M 1EETA 4FLTA 3IG1A 4FWOA 3KK3A 1ASWA 3SQ2A 5AQIA 3ID8A 4JI4K 4CGIA 1BIZA 2AP1A 5AQTA 2NRZA 2BANA 3OS0A 1ITGA 4QS8A 5J2MA 3TAFA 3WXLA 2KZZA 4R79A 1QHAA 1TGOA 3LP3A 3ULEA 1EO1A 2IVPA 3OYAA 4HHTA 4F2RA 3FZLA 1QVFM 1C0TA 4DSEA 1HQUA 4U7BA 4AHTA 1D9DA 3HL8A 4BEBA 2VQFK 3V9SA 5DM6L 2DTUA 1QZ5A 1RT7A 3P39A 3MEDA 3OY9A 1IBLK 4CZHA 1IH7A 4CEDA 3R8EA 5KGXA 3VENA 5BRHA 4GV9A 3MN5A 4LF5K 4AM6A 4CEZA 3SUQA 3K5NA 5KQDA 4A62A 4B9LA 3QEIA 2Q1NA 3RVCA 1VQON 3HP9A 4HCCA 3H3NO 1VQMN 3AVFA 4H4OA 3NMUA 3LZIA 5MLCQ 3UKRA 3MN9A 3QESA 4DR7K 1DKGD 3ENBA 4CBXA 5AQZA 4NCGA 2UUCK 2XY8A 3PIOL 4OKEA 4FLVA 2DY4A 3SAFA 5KPRA 4W5QA 3SBTA 4DU3A 2ZD1A 3EY1A 2RKIA 3BDPA 1LWCA 3LDOA 2QWNA 4JD2A 3LDNA 3WXMB 4BG9A 3HSCA 4CGFA 1XHXA 1RBUA 4KH5A 3CYMA 4LFBK 3GOIA 4CFBA 4BR7A 4X65K 2ATQA 4MLHA 2HF3A 3ULEB 4CZFA 2KZMA 2XO7A 1DLOA 2V7ZA 4OPAA 3V1OA 4CJQA 1JKHA 3R1XA 1L5UA 4LFCK 5TKYA 1JLEA 3S3NA 2O8FB 3OYDA 4JV5K 4H4MA 4OPHA 3OBYA 2PYJA 3C6UA 3DXKB 3DXMA 1XHZA 2QXLA 1LWFA 1VAZA 4Z94A 1NGBA 3CG7A 5A2QO 4X64K 3ULDA 3CYGA 1HLUA 2O8EA 4Q0BA 4W5TA 3SQ4A 4DTRA 3SAHA 1YITN 1YI2N 3M1FA 3JXUA 2ZWHA 1LOTB 1UOCA 3PX6A 4PL8A 3CHWA 3THYB 4ILHA 5ADXH 3U6FA 2A1SA 3LM2A 2F9TA 4FVMA 4MQ3A 4BRMA 4FXDA 1RT2A 3CFRA 1BCOA 1RDCA 4KTZA 2WC9A 4Z4EA 1VQ7N 1XC3A 4IEEA 3MEGA 3CJ9A 5M1NA 4BRNA 5BREA 5BN9A 2A5XA 1YAGA 4K25A 3VA3A 3UIQA 1S9EA 4F8RA 4NXNK 1QZ6A 1RCHA 4M3XA 2UXCK 1JL2A 1QTMA 5M1OA 1VSJA 2Y1JA 1T6CA 3MMVA 2O8BB 2HHIA 5JVHL 4DV5K 2F96A 4KB1A 4RTFD 4DFMA 4AQYK 2C1IA 3TTFA 5F1XA 3RMAA 1Q9YA 4CZKA 1IBKK 1BA1A 1HUXA 2GEMA 3N4QA 3O80A 4FO0A 4JLHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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