1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
1MWKA 1SQKA 3VETA 3D7EO 2IVPA 3HTVA 4B1ZA 5AQLA 4BRIA 2YHYA 3W0LA 5BREA 1T6DA 1NGAA 5AR0A 3VEXA 3BF1A 3R6MA 4IJAA 2P9KB 2ITMA 4WQ5C 3O80A 3IMXA 1T44A 3R9PA 4FL9A 1HX1A 3D2EB 3GE1A 3EN9A 3DAWA 1TYQA 2P9PA 5AQHA 4BRGA 3LDQA 5AQUA 3UKUB 1NGCA 3H3NO 3VOVA 2QWOA 2ZWHA 2A41A 3DXMA 5FPNA 3WQUA 4HTLA 4XH4A 1X3NA 4ISGA 3MN9A 3AAPA 4WQ4C 2QWMA 5AZJB 4JN4A 1GLEG 3VEYA 1G99A 4B1WB 3LDLA 3UKRA 1K8KA 3C7NA 5CE3A 4EFHA 3GBTA 3EO3A 4H0XB 3B8AX 3KVGA 1V4SA 1U6ZA 4WQ5A 4QS7A 4H0TB 5AQFA 1KAYA 3FZHA 4BRCA 5JICA 2ASOA 2CH5A 1E4GT 3VPZA 2QWNA 3ZX3A 4CZGA 1ATSA 1NM1A 4WQ4A 3FZMA 3WQTA 3GDQA 1BG3A 4H5TA 3S41A 2QWLA 4H0VB 1NMDA 2P9LB 4MO5A 3VF4A 4E1JA 3ATUA 3VEOA 1YVNA 2E2QA 1GLLO 5EY4A 1NGJA 3BEXA 4BR5A 2YHXA 1DGKN 1GLJO 1LCUA 3LDOA 4CZLA 5JLFA 4BC3A 1NGEA 4M7XA 3VF6A 2NLXA 5AQJA 4H03B 5ADXH 3O5BA 3CJ1A 3MK6A 1BDGA 3HSCA 1CZAN 4CZIA 4FPBA 1JCGA 3VEZA 3R8EA 3CJ7A 1QQNA 3QFPA 3A0IX 2GTDA 3LM9A 3U9DA 4CBWA 2W40A 4MLHA 3VF2A 4A2BA 3CHWA 1BOTO 1KAZA 3GG4A 2VWBA 5LJVA 4RCHA 1NGGA 2YCHA 3CETA 2I7PA 3A5MC 5AQZA 2QWPA 4BR7A 1HKBA 2A6AA 1U2VB 2P9LA 4Z94A 4B1VA 2Q0RA 3VENA 4BRAA 4BGBA 4BR4A 4BQLA 3FZKA 4PKGA 1TYQB 2P9PB 1QQOA 4BVPA 1E4FT 3DXMB 3VESA 3CIPA 3M6GA 4CD1A 3MCPA 4FSVA 3UB5A 2GWJA 3HI0A 4BC4A 4A2AA 4FWQA 2Q0UA 3CJCA 4FWPA 3VGKA 4CD3A 1JCEA 4H5WA 1NGFA 5EXWA 5EVZA 3UKRB 5FPMA 5KQDA 1K8KB 3D2FA 3L4IA 3C7NB 5AQMA 1ATNA 1DKGD 3TPQA 3L6QA 3ULEA 5BPMA 1T6CA 5AQQA 3A8YA 3IFRA 3WXKA 2Q31A 3I8BA 3O6WA 1BA0A 2P9UA 4DQ8A 1HLUA 3WT0A 4PKHA 2FF6A 2P9SA 4FWOA 2FSJA 1RGIA 4H5RA 1U2VA 4BRKA 3FR0A 3IDHA 4Y0WA 5AQVA 2OANA 1BO5O 1GLFO 4F9OA 4FWSA 2FSNA 3J8AA 4CZFA 2HF3A 2QWRA 3ZX0A 5AQXA 3O1BA 3LDPA 4JHDA 4IWVA 2Q2RA 3KZBA 4FOIA 3EL2A 3UE5A 1WOQA 4BRFA 1MWMA 2NRHA 1NLVA 2KHOA 3RSEA 3WXLA 2F9TA 5AFUA 4CBXA 3F9MA 1HPMA 3SJHA 5ELZA 3FGUA 1GLBG 5F2RA 1RDWX 3ZETA 2A5XA 1LOTB 4DHYA 2I7NA 3FE1A 4HWIA 4BRHA 4JAXA 3VERA 5LY3A 5KPZA 1YAGA 5LJWA 4BC2A 3AY9A 5B8HA 1NGIA 4EHUA 3EKUA 2E8AA 2D1KA 3ENOA 1P8ZA 3SMSA 4BG8A 3BF3A 2QM1A 3QBWA 3MDQA 3H1VX 3O8MA 4K42A 2UYTA 3O4WA 4BR9A 4CZMA 4I6MA 2E1ZA 3HZ6A 3LDNA 1IJJA 2E2NA 2ASPA 3EZWA 3M3ZA 4RTFD 5EOYA 3BUZB 2P9IA 5AQPA 3MN6A 4DB3A 4J8FA 5KPTA 2A42A 2D0PA 4A62A 1MDUB 5BN8A 3QB0A 4BRNA 3BP8A 3MN5A 2IVOA 5AQTA 5JLHA 3G25A 4YDUC 3H46O 2W41A 4BREA 1ZC6A 3ATVA 4BRPA 4H5NA 2Q97A 4O8KA 1QZ6A 2H3GX 4FOEA 3D2FB 4BR0A 1HKCA 4CZJA 5BRDA 1TUUA 4FWRA 3ULEB 5AQIA 4C23A 3CI5A 3FLCO 1NGHA 3IUCA 3H6EA 2PAVA 2P9UB 3QFUA 3CQXA 2P9SB 2QXLA 3WEEA 3GL1A 2WUSA 4FPAA 4MLEA 4XEIA 3A5OC 3QMLA 1HKGA 3CJBA 4FWNA 1ATRA 2D0OA 3JXUA 3O1WA 4YDUA 2F9WA 3SLCA 4NB4A 4BQZA 5E26A 4K43A 4M63C 1GLCG 2GELA 1TUYA 4JHDB 3CERA 2P9NA 4K41A 1S22A 3QBXA 1QQMA 3H1QA 1NBWA 4FWKA 3SMPA 1C0GA 1S3XA 3RSEB 2Q1NA 1Z6RA 1SAZA 2D4WA 2QW9A 2E1YA 4JD2A 3ZETB 4BRQA 4EHTA 3HBTA 1QHAA 2QWQA 2FLOA 3M1FA 1J6ZA 4H5VA 4KBOA 5AQNA 5AQYA 3TU5A 4QS8A 2EWSA 4LC9B 4BRDA 4B1XB 4IZ9A 1Z05A 3DXKA 3HM8A 2V51B 5ADXA 5BR9A 4BRLA 5F1XA 5AQGA 3VEVA 3CJAA 5AZIA 2V7YA 4L3QA 3QICA 4QS9A 1DEJA 2J4RA 3DWLA 1H1VA 4I6MB 1R59O 3C0BA 2GEMA 3ID8A 4BROA 1XQSC 4BR2A 4H0YB 3WUHA 5FPEA 5AQWA 2A40A 2GWKA 2FF3B 1IG8A 5JMVA 2E20A 4JNEA 4H0PA 2P9IB 1RFQA 1KAXA 1X9JA 4ISEA 3CQYA 4GY2B 3WXJA 5BPNA 2ASMA 5BRHA 5I9EB 1EQYA 1MA9B 4M7YA 3AAQA 4B1UB 1HJOA 1WUAA 2CGKA 1ESVA 3QDKA 4IO8A 4AM7A 4CJ7A 2ZGYA 5AQSA 5AQKA 3ZEUA 2HF4A 2HMPA 5BPLA 4CBUA 5F0XA 1NGDA 2VCPA 2YJFA 4BVOA 3FFKB 5FPDA 1HUXA 1YUWA 3VEWA 4O5FA 4MO4A 3U4LA 3KHYA 2YJEA 3EKSA 2Q36A 3WEEB 1SZ2A 3VGLA 2A3ZA 3H45C 3FZLA 2VYPA 2YI1A 1ZXOA 4B1YB 4CZEA 4CZKA 5AQRA 5KQ8A 1NWKA 2CH6A 3P4IA 1NGBA 4RWTA 4NO7A 1XUPO 2CGJA 3MN7A 1BWFO 4IJNA 2P9NB 2P9KA 2ZGZA 5BN9A 2BUPA 3MMVA 4GNIA 2YHWA 2AP1A 3D2EA 2FSKA 5TKYA 3ENHA 3UKUA 4JD2B 2AA4A 2IVNA 5EX5A 4BRMA 3U8XA 4K25A 2FXUA 4EIAA 5AQOA 3CJ9A 4BG9A 3H3OB 5AZJA 3I33A 1XC3A 3ZX2A 3DXKB 3SK3A 4BGAA 1D4XA 4A61A 4PKIA 4DCHA 2IIRA 5AZIB 3A5LC 3W3DA 3GOIA 3A5NC 4BC5A 1Y64A 3LL3A 4PL8A 4PL7A 4FWLA 2PBDA 1JCFA 1OKJA 1ZBSA 3L0QA 1QZ5A 3OHRA 2V7ZA 3LM2A 3VGMA 3AARA 2V52B 4FO0A 4B9QA 1BU6O 2DPNA 4EAHD 5AFUH 3WXIA 4ISFA 2GUPA 2BTFA 4XH1A 1GLDG 4CZHA 1BA1A 3O08A 4FWMA 4WYBA 2CGLA 1YXQA 5KPRA 2E2PA 5E84A 2E2OA 4IXCA 3ZEUB 2E88A 2HOEA 4AM6A 1V4TA 1X3MA 4XH5A 3FZFA 1KXPA 5BRFA 2NZTA 3JS6A 4H0OA 4CI6A 1Q18A 2ZF5O 1BUPA 1GLAG 1C0FA 3U9ZA 3DJCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IVPA 4KHSA 1S1XA 4W5OA 1VRTA 3HT3A 3TAEA 3HTVA 1S1TA 5AQLA 5HL7L 4BRIA 3AO1A 5BREA 1R0AA 1L3TA 1HNVA 5HP1A 2KZZA 4DV6K 4CEEA 4OX9K 4WQ5C 4KTQA 3HOSA 1WB9A 3V1RA 3QNOA 3EN9A 4JKBA 3UKUB 4B9LA 1VQ6N 1BIZA 3RRGA 1VQ9N 1LWEA 4ISGA 1WSHA 3ULDA 4CEZA 1HMVA 4JN4A 5EU7A 4BE2A 4ID5A 1RTDA 3AVFA 3LDLA 4W5RA 4KI6A 2WTUA 3B8AX 4LH5A 5CZ2A 1V4SA 3ZSOA 4WQ5A 1Q9XA 2O8EB 1A5WA 4H0TB 4BRCA 5BR8K 5JICA 3PIOL 2B6AA 3CFOA 2QI2A 4LF6K 1SKSA 4CJWA 2D0CA 2QWNA 3EY1A 3CCRN 5GAGP 5GADP 3TAPA 2IAJA 4HCBA 3FZMA 3GDQA 3THVA 4H5TA 2HB5A 4H0VB 3VF4A 4MO5A 2D0AA 4E1JA 3V9SA 4DTUA 3CC7N 1GLLO 3EYZA 5JLFA 3VF6A 4C1NK 3KK3A 4FJXA 5AQJA 1N33K 4CK3A 3M5RA 3O5BA 4FPBA 3VEZA 3G6EN 1T05A 4DTPA 1LV5A 4E89A 5GIOA 2PYLA 2UU9K 3A0IX 5J2PA 4V19S 3M8SA 3OYMA 4CBWA 2XY5A 1KLNA 1VSIA 3CXCM 4CJSA 4M3TA 2NUBA 1KAZA 4LH4A 3P5JA 2HSTA 1BQNA 2UUBK 1XWLA 4L8RB 3O9TA 3CETA 3DM2A 3F73A 5C15A 1Q8IA 2P9LA 2A1RA 4KPYA 2Q0RA 4QOZB 1C0MA 1YJWN 4DQPA 4B9SA 4BGBA 2HNYA 4BQLA 3FZKA 1U48A 2O8BA 3DI6A 1JLCA 5LL6Z 5C24A 4DFMA 4FM0A 3NDKA 4KH4A 1B9FA 1E4FT 3VESA 3M6GA 4CD1A 3MCPA 2ITGA 3G0ZA 3UB5A 4BC4A 3VGKA 1D5AA 1C1BA 1RBUA 2YNIA 4CIGA 1NGFA 4CESA 2ZJPL 1P90A 4OPKA 3LPTA 5T7BA 4JI3K 3K2PA 1T6CA 4DLEA 1JLBA 1VHXA 1TV6A 2P9UA 3AO2A 1IV0A 4DV1K 2FF6A 3CCEN 4CHQA 4A57A 2P5OA 1JLEA 4N5SA 1ASWA 1RGIA 2Y1JA 3SUQA 1U2VA 1RDDA 4Y0WA 2OANA 3TI0A 4B3RK 4OLBA 4JS5A 1XNRK 1N34K 4DR5K 3KZBA 3UE5A 2KHOA 1HNZK 2RF2A 4M3YA 3RSEA 4YY3K 4O8UA 4CBXA 3F9MA 4IEIA 3I0SA 2O8FA 3ZETA 1RDWX 1NJIO 1T8EA 4R5PA 1LOTB 4DHYA 3DOLA 4HWIA 4BRHA 4KH5A 5KPZA 1X1PA 3AY9A 4O4GA 5B8HA 4BE7B 3ENOA 2E8AA 1HR0K 1S6QA 3K0SA 4W5TA 3CC2N 3PLAA 3QBWA 3H1VX 4BWJA 4K42A 4DV5K 4KFBA 4YNQA 1NK4A 4K8ZA 5JVHL 4FZXC 4Q0BA 3TR8A 1ZBHA 2RKIA 4B9VA 2Q3SA 3VTHA 3ISNC 3CCJN 1IJJA 2E2NA 3DLHA 3TARA 3RMDA 4FK2A 2O8BB 3BUZB 2P9IA 4PQUA 1WN7A 1NK7A 2D0PA 4M3ZA 3SAFA 3HP6A 3MX5A 4M42A 4BRNA 1JLQA 3BP8A 3MN5A 5C0YA 3K5LA 3Q7BA 5AQTA 1VQ5N 4KHWA 1WNSA 5JLHA 1RDAA 1D9DA 4DFJA 1VQLN 4GV9A 4DV4K 4CEFA 3L2UA 4B8CA 4IOXA 2Q97A 4FLVA 2YKNA 4YORA 4BR0A 1HKCA 4LFBK 1E3MA 4I2PA 2ZE2A 4CEOA 3LP3A 1TUUA 3PV8A 3CFPA 4KHYA 3TAFA 1NKCA 1JJ2M 4CGGA 2P9UB 4Z4EA 3CQXA 3KLIA 4XEIA 4AHTA 3A5OC 1U49A 4JI6K 1K6YA 5CY4A 3JXUA 4Z4IA 2OPSA 4BQZA 1W2BM 4N47A 3M8QA 3O3HA 2JWKA 3OVNA 1VQ8N 3NBPA 4FYDA 4K41A 4DTMA 1S22A 3QBXA 1QQMA 3SMPA 4E1NA 1C0GA 3RSEB 4MFBA 2Q1NA 1NG9A 2O8FB 3F5TA 3ZETB 4BRQA 4EHTA 1QHAA 2F7TA 2FLOA 2ZD1A 1Z25A 1YVUA 4JK9A 1J6ZA 3TU5A 3SQ0A 4FW1A 4Q5VA 4OLAA 4LC9B 4DR7K 1EO1A 4IZ9A 4FLTA 5HOOA 5ADXA 5AQGA 3VEVA 4RW8A 3OBWA 5AZIA 2V7YA 3LP1A 3K59A 2QXFA 3QICA 2GEMA 4XIUA 1J54A 1D9FA 4H0YB 2HBKA 3SQ2A 2A40A 1S1UA 4CJRA 4DQIA 4JNEA 3VQ4A 2P9IB 4JI5K 1FW6A 1IKWA 4CIFA 3R3LA 1TK8A 3LALA 3WXJA 4RW7A 2ASMA 1YT3A 3OYNA 3L2WA 3CM6A 5HBMA 3QDKA 1JXEA 2ZGYA 3I55N 5AQKA 4M41A 2HF4A 4E0DA 4NLBA 5F0XA 1NMNA 4LD0A 3VEWA 1C1AA 4LF9K 2QKBA 1GOBA 2NRWA 5CZ1A 3DLEA 1QVGM 4AQYK 2A3ZA 4OPJA 2X78A 2VYPA 4DFPA 1N6QA 4B1YB 1M1KO 4Y1CA 4WCEL 3BY5A 3OYDA 3B6OA 5M1FA 3S9HA 5KQ8A 4CJEA 4DQRA 3SUPA 1WSFA 3OYLA 1XUPO 4CJ5A 2PZSA 1BWFO 1CXUA 3OYEA 4GNIA 2VQFK 2DFEA 2YHWA 3KWGA 3D2EA 3KK7A 4CJKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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