1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
2GWKA 4ISEA 2E1ZA 2GTDA 3FZHA 3DXMA 1NGCA 1QZ6A 3CJ7A 3FFKB 1NWKA 4EAHD 5AQZA 1YUWA 3SLCA 1DKGD 1DGKN 4WQ5A 4CZHA 2P9UB 4B1XB 3S41A 4K42A 4BRLA 3EN9A 1TUYA 3MDQA 5F0XA 1QZ5A 2FSKA 1SAZA 3O80A 1K8KB 2WUSA 4H03B 3U9ZA 1OKJA 4CZKA 3KZBA 1NGJA 4BGAA 2YJFA 3M3ZA 4H5NA 5LJWA 2CGKA 3WEEB 4A62A 2Q31A 1X3MA 2UYTA 4H0XB 4BRPA 5FPDA 3LM9A 5BR9A 3D2EA 3FGUA 4DCHA 1NGHA 5AQPA 1LOTB 1GLCG 2A5XA 3MN5A 3VERA 3P4IA 4HWIA 4H0OA 5ADXH 3ZX0A 3A0IX 3HZ6A 4I6MA 4LC9B 1HPMA 4GNIA 4CZIA 4ISFA 4NO7A 1GLDG 5JLHA 4EHTA 3IMXA 4PKGA 3CHWA 2F9TA 3C7NB 1ATRA 2V7ZA 1S22A 1BA0A 4M7YA 4RWTA 1KXPA 1BU6O 1YVNA 4BQZA 2ASPA 4NB4A 2P9SA 2E2OA 5TKYA 4FPAA 2P9NB 1GLAG 2QWRA 3IFRA 2ZGZA 2YCHA 1T6CA 3WXKA 1HLUA 3U4LA 2HOEA 2J4RA 1QQMA 3R6MA 4BRHA 2ZF5O 2ASMA 3VGMA 1IG8A 2Q0UA 4JHDB 4CI6A 4IZ9A 2IIRA 2P9PB 1MWMA 1SZ2A 1NGIA 1GLBG 3WQTA 5KPZA 2A42A 3H46O 4AM6A 2QWPA 3CJ1A 1JCGA 2P9UA 4BRAA 3O08A 4K41A 3A5NC 4DHYA 5AQNA 1CZAN 3FZLA 2GWJA 4BRGA 5BPMA 1K8KA 4B1ZA 3I8BA 3QMLA 2P9IB 1RDWX 4CD3A 2CGJA 1TYQB 2HMPA 2VWBA 3FZFA 1V4TA 3WEEA 3VEZA 4B9QA 2ITMA 5AZIB 4HTLA 1ESVA 3HBTA 2BUPA 5EVZA 3UB5A 5B8HA 2NRHA 5AQFA 5JMVA 2FSNA 1YAGA 3CETA 3SMPA 3VEYA 1LCUA 2YJEA 3DXKB 4DQ8A 3KVGA 3QBWA 5AQJA 3A5OC 2D0PA 4CZEA 3L0QA 4O8KA 2E1YA 2I7NA 3H3OB 4BC2A 3H3NO 4YDUA 1SQKA 1ZXOA 5AQOA 4JNEA 4CBXA 4Z94A 5LJVA 3AAQA 5AQVA 3UKUB 4GY2B 4QS9A 4BROA 3I33A 3VGLA 4BRMA 2FF3B 4EFHA 1G99A 2P9NA 4IJNA 5AR0A 3CERA 2P9LB 3TU5A 1ZC6A 4H5VA 3D7EO 4JN4A 3ULEB 1C0GA 5KQ8A 1X3NA 1QQNA 4CD1A 1WOQA 1DEJA 1GLJO 2QWNA 4JHDA 3MK6A 3CIPA 5F1XA 3DAWA 2FXUA 3B8AX 4YDUC 3LDNA 4MO4A 2P9PA 4BR0A 4O5FA 4QS7A 4PL8A 3AY9A 4BRNA 2QWLA 1E4FT 3TPQA 2ZWHA 3VOVA 2Q97A 2VCPA 3DWLA 1EQYA 2QWQA 4BREA 3QFUA 1HUXA 1S3XA 2YI1A 4ISGA 4H5RA 3VEXA 2P9IA 3QICA 1TYQA 3KHYA 4XH1A 2GEMA 3O8MA 2AA4A 3GBTA 5AZIA 1X9JA 3H6EA 3MN6A 3HM8A 4FWPA 5BREA 4H0VB 1NLVA 4BRIA 3UKRB 4BC3A 5EX5A 1Z05A 4BRQA 2HF3A 4PKIA 3DXKA 2IVOA 5AFUH 1HKGA 3SJHA 4FWLA 5AQUA 4C23A 3A5MC 4FWSA 1MWKA 3ENOA 2E2QA 3ZX3A 3CI5A 4B1VA 2PAVA 1NMDA 4BRFA 3VETA 3LM2A 4CZJA 4JD2B 3VEVA 2A6AA 3U8XA 4B1WB 5AQMA 5AQSA 2W41A 4MLHA 1GLLO 3FE1A 5LY3A 3VF2A 4FO0A 2D1KA 3UKUA 1GLFO 3MMVA 2QWMA 5AQKA 1BA1A 5EOYA 1V4SA 1NGAA 2GELA 5KQDA 3BEXA 2P9LA 2QM1A 4BC4A 1WUAA 4XEIA 4IWVA 3ULEA 3M6GA 2F9WA 5BRFA 5EY4A 5FPEA 1GLEG 5BRHA 4A2BA 3LL3A 2VYPA 1KAYA 3ATUA 4BRDA 2FLOA 4CZMA 4BR4A 4FWMA 1BWFO 1HKBA 4FOIA 4PKHA 4MO5A 5AQYA 2IVPA 2DPNA 2Q1NA 3JS6A 3HSCA 3O1BA 1TUUA 3WXJA 2P9KA 2Q0RA 3F9MA 4FWOA 5AQTA 4A2AA 2V52B 5ADXA 3CQXA 3WQUA 4EIAA 4QS8A 3H1QA 3EO3A 4H5TA 3GG4A 3LDLA 2FF6A 4IXCA 3GE1A 2D4WA 3VEWA 3EKUA 3LDPA 4FWRA 1BG3A 1NM1A 5E26A 3WXIA 3BF3A 3W3DA 2V51B 3UKRA 2E2NA 1NBWA 4BGBA 4BVOA 5AZJB 4RTFD 3DJCA 2CGLA 3VF4A 2W40A 3IDHA 2YHXA 2PBDA 3A8YA 3G25A 4H5WA 2ZGYA 4CJ7A 3HI0A 3VESA 5JICA 2NLXA 2NZTA 2QXLA 4K43A 4JD2A 3EL2A 4B1YB 4H0PA 4FOEA 4H0TB 5AQWA 4CBUA 4A61A 3O6WA 3L4IA 4L3QA 4Y0WA 4FWNA 3GDQA 3O5BA 4BR2A 3EKSA 1IJJA 4F9OA 2IVNA 4BR5A 2E2PA 5ELZA 2CH6A 3CJAA 3FZKA 1E4GT 2FSJA 2ASOA 4IJAA 4B1UB 1NGGA 3L6QA 5AQIA 3QB0A 5CE3A 1HX1A 5EXWA 1U2VA 4FWQA 4BR9A 2GUPA 4J8FA 4BVPA 4WYBA 2P9KB 1JCEA 3O1WA 4BG8A 2BTFA 4BC5A 3WXLA 3ZETA 4FSVA 1D4XA 4H0YB 5AQRA 4EHUA 3CQYA 3VPZA 1T6DA 3UE5A 3R9PA 2HF4A 3IUCA 2E20A 2H3GX 3EZWA 1HKCA 3D2FB 3M1FA 3VGKA 1QQOA 5AQLA 4FL9A 5E84A 3QFPA 4WQ4C 3GOIA 3QDKA 4BRCA 2QWOA 4M63C 3LDOA 1U6ZA 1BDGA 5AZJA 1NGFA 1YXQA 5BN9A 4KBOA 4XH4A 1NGBA 5BN8A 4BRKA 3AARA 4WQ5C 2I7PA 4E1JA 5BPLA 2AP1A 5AQHA 2Q2RA 2OANA 2D0OA 3MN9A 3OHRA 1C0FA 1NGEA 3BP8A 3FLCO 1P8ZA 2A40A 1MA9B 3ENHA 4RCHA 1XQSC 3ZEUA 3CJ9A 3MCPA 5JLFA 1BO5O 3C0BA 3JXUA 3RSEB 5F2RA 4CZFA 3A5LC 4M7XA 3SMSA 1BOTO 1NGDA 5AQGA 2A3ZA 2Q36A 1U2VB 3H1VX 2YHYA 5KPRA 3DXMB 2QW9A 4CZLA 4BQLA 4DB3A 3VF6A 1H1VA 3ZETB 3BF1A 3W0LA 5I9EB 3H45C 1Y64A 3J8AA 1XC3A 1Z6RA 1KAZA 4K25A 4JAXA 3R8EA 3GL1A 1BUPA 1ATNA 4CZGA 3AAPA 4FPBA 4BG9A 5AQXA 2EWSA 1R59O 1HJOA 5KPTA 4FWKA 5AFUA 2V7YA 2KHOA 2E88A 2E8AA 3D2FA 3U9DA 3D2EB 3FZMA 3SK3A 1RFQA 4I6MB 3O4WA 3QBXA 3MN7A 4XH5A 3WT0A 1JCFA 4PL7A 3VENA 3FR0A 3ID8A 3CJCA 4AM7A 1QHAA 1T44A 1ATSA 1MDUB 5BRDA 3LDQA 1J6ZA 3WUHA 5FPNA 5FPMA 3ZEUB 3C7NA 5BPNA 2CH5A 1KAXA 3ZX2A 3CJBA 4MLEA 5AQQA 1Q18A 1XUPO 2P9SB 3ATVA 3VEOA 2A41A 1ZBSA 2YHWA 4CBWA 3BUZB 1RGIA 3HTVA 3RSEA 4IO8A 4WQ4A 4BR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JVGL 3M8SA 1VSEA 4FM0A 1FW6A 4AHSA 2B5JA 3AVKA 4YOTA 4CF8A 4Y1CA 4YOVA 3RRGA 4IOAL 4WQ5A 3OYJA 3CCUN 3S41A 4BRLA 4GV6A 1TUYA 4DFPA 3U9ZA 3THYA 2OTLN 3O3GA 3KZBA 3T1YK 2YJFA 2UYTA 4H0XB 2B4JA 3D2EA 3FGUA 4CK2A 2VWKA 3MN5A 3F2KA 4FXDA 3ZX0A 2HHXA 1NKBA 3A0IX 4FLUA 2RE2A 3HZ6A 4DV7K 4CZIA 3KLFA 1ASWA 1L5UA 3O9SA 1RBRA 3CHWA 3C7NB 2V7ZA 4KHYA 4BQZA 1VAZA 4BWJA 1K8AO 2WTUA 4A5BA 4NB4A 2P9SA 1XWLA 3CXCM 3I55N 3OA9A 4FPAA 3NVKA 1GLAG 3OYKA 4E7HA 2F96A 3R6MA 4BRHA 3TANA 1EKEA 2ZF5O 1EWRA 3MWTA 3SYZA 4V19S 4CI6A 4IZ9A 4DTSA 1ITGA 2A42A 3DRSA 3OYIA 3H46O 4RW6A 2P9UA 3O08A 1T8EA 1LW2A 5AQNA 2KFZA 2C1IA 4BRGA 2YKNA 4DR6K 3I8BA 1TAQA 1OVYA 1HNXK 1JLBA 2GX9A 1NU0A 1YTUA 4OGCA 1N33K 4CVNE 2E4LA 3WEEA 1NK9A 1LAWA 4QOZB 2O4IA 4B9QA 1CLQA 5AZIB 3J7YP 2Z1GA 1C0MA 3QEIA 3V6DA 3HBTA 4CCHA 5EVZA 4DV6K 4Z4GA 4DV2K 3OYHA 4CJFA 5TKWA 2QA4N 2YJEA 3ASMA 4CE9A 3DXKB 1NJYA 1KVCA 4DTMA 3QBWA 5AQJA 3L0QA 4IFVA 4O8KA 1GOBA 2I7NA 3ENBA 3H3OB 5HRPA 4YDUA 1QHTA 3O9UA 4IOXA 1SQKA 1N32K 5AQOA 5LJVA 3AAQA 3KWIA 3SQ0A 3LWLA 1TK0A 4E89A 4BROA 3P1GA 3I33A 3LP0A 3SV4A 2FF3B 1W0HA 2P9NA 3CERA 3ZYYX 1ZC6A 2QI2A 3OYDA 3ZT0A 3ZSVA 5KQ8A 1X3NA 2PZSA 3ZSQA 4DU4A 5F1XA 4IEEA 3CIPA 4HUGA 3LDNA 3OS2A 4PL8A 1UA1A 1O1WA 4HUEA 1UAXA 1S1TA 1HYZA 1S3XA 1WBBA 3SUOA 1RBUA 2O8DA 4ISGA 4H5RA 3F9KA 2P9IA 1FKPA 1LWCA 4CJEA 1KFSA 4O5BA 1TYQA 3JSMA 2GEMA 4LF4K 4DKWA 3HPHA 2VG5A 3H6EA 4K8ZA 4FWPA 1BQNA 4DSFA 4FZYA 1ZBIA 4M3XA 4H0VB 4LF6K 4CFBA 3QLHA 1RTDA 2HF3A 3C95A 3EE8A 4ILJA 5AFUH 4CK3A 2O8CA 3KWGA 3RMBA 5I3UA 4C23A 1OH7A 4FWSA 1MWKA 3ZX3A 1WSIA 3VQPA 1X9WA 1NMDA 1U48A 3FFIA 4CZJA 3IRXA 4JD2B 1B9FA 4B1WB 5AQMA 5SZTA 2W41A 4CJLA 2O8FB 3HO1A 3FE1A 1QVGM 1JKHA 2ZQBA 4FO0A 2D1KA 3MMVA 2BDPA 4JI7K 1Z25A 4F2RA 2OTJN 5EOYA 1V4SA 4PWDA 5KQDA 3BEXA 2P9LA 4LF7K 4XEIA 4IO9L 1A5XA 4HCBA 3ULEA 5BRFA 5EY4A 4CFCA 1CZ9A 5M1NA 3NH0A 3ZCMA 3KK2A 2VYPA 1BISA 4DQPA 1BWFO 4ELUA 4J2BA 2W6KA 3CC2N 4PQUA 3CFOA 3SBGA 4FK0A 3PIOL 1TUUA 3WXJA 4OPKA 2DY4A 4A2AA 2IGIA 3NHGA 1RDBA 3H1QA 1SUQA 4JK7A 3KTQA 2VGNA 5MLCQ 2FF6A 3GE1A 1RDDA 1C1AA 1RDAA 3PSIA 5FDLA 3NFAA 1U4BA 5E26A 4BE0A 4EP4A 2V51B 3CM5A 1NBWA 4IBNA 5AZJB 3VF4A 2XO7A 2CGLA 2W40A 3IDHA 1UOCA 2YHXA 2PBDA 4FZXC 4J2AA 1IBKK 3G25A 1E3MA 4H5WA 3OBYA 4BDZA 1CXQA 3C94A 2NZTA 2RKIA 3LAMA 4FW2A 1IKYA 3TAEA 4B9MA 3O6WA 4Q0BA 4FWNA 3GDQA 4CJWA 3LP1A 2O8EA 1TK5A 1IJJA 2CH6A 3QEVA 3S9HA 1E4GT 1IG9A 1BI4A 3WNGA 3AVGA 2HBKA 4DSEA 1HNWK 3C6AA 2IS3A 2QEXN 3U6FA 4J8FA 1JCEA 1IO2A 3J80O 4WCEL 2D0CA 4HHTA 4G9ZA 4FJ9A 4WFAL 1VQPN 3CQYA 1T6DA 4FJ7A 2HF4A 4AF1A 3VGKA 1M90O 3AO5A 4DV0K 1WN7A 5AQLA 1U49A 3IKMA 3QFPA 3KK3A 4WQ4C 3P31A 1S6PA 3PV8A 4M63C 1U6ZA 4FCYA 1BDGA 1NGFA 2HNZA 4KH5A 1S5JA 2HNYA 1KLNA 2NRXA 4BRKA 4WQ5C 4GVMA 3OS1A 4LFBK 3VQ7A 2DFFA 4KAZA 3CCSN 3KLEA 3B6PA 3FLCO 2G8VA 5T7BA 1I94K 4RW8A 3ZEUA 3PY8A 2KW4A 3CJ9A 1LAVA 1L3SA 4M3UA 3RSEB 3F5TA 4E0DA 4NLBA 3QIPA 5F2RA 3A5LC 5C10A 5AQGA 4OPHA 4UQGA 3H1VX 5KPRA 4MQ3A 4LF9K 4BQLA 1H1VA 1KVBA 1SKSA 3KLHA 1YI2N 5I9EB 3KJVA 2BGGA 3J7AP 2HHQA 2B6AA 3L8BA 1IBMK 3GL1A 4DF8A 4CEFA 3THYB 1VSKA 2F4VK 4FPBA 4BG9A 4H4MA 4JEPA 1HJOA 4FWKA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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