1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
2W40A 4FWOA 3MN9A 4H0VB 5BN9A 4DQ8A 2ASMA 3MN7A 1SQKA 1HJOA 3VESA 3U9DA 5FPMA 2ZWHA 2F9TA 2P9LA 4FSVA 4M7XA 4GY2B 4NB4A 1YXQA 2E2OA 4BRKA 3FR0A 1Z6RA 4LC9B 3SMSA 3CJAA 3QB0A 4HTLA 3JXUA 4FWPA 4CBXA 1BA1A 3WEEA 4BC4A 1NGGA 3DXMB 5AQPA 5BPMA 4F9OA 1NLVA 1QZ6A 3A5LC 1T6DA 4CZIA 2ASPA 1E4GT 4Z94A 1BO5O 1TYQA 3FFKB 3ULEA 3CI5A 4H0YB 4JD2A 4WQ5C 1Q18A 4CJ7A 2E2NA 3LDLA 3IDHA 2F9WA 5E26A 3M6GA 2QWMA 4JNEA 1NGCA 4JHDA 1BU6O 4J8FA 3H6EA 3A8YA 1BDGA 2Q31A 3A5NC 4BR5A 5I9EB 4H0PA 4M7YA 4XH4A 2NRHA 1LCUA 4I6MA 3HBTA 2P9NA 4EIAA 2VCPA 4FWMA 4BR2A 5AQOA 2CGKA 1BOTO 2ASOA 3VETA 3H1VX 1QQOA 2E2PA 5AZIA 5AQLA 3GBTA 5AQHA 3J8AA 1SAZA 1HUXA 4E1JA 4C23A 4BG8A 3AAPA 3H3NO 4B1UB 1YAGA 4BVPA 5JLHA 5LJVA 2P9KA 4JN4A 2V51B 4FWLA 5F2RA 4PL7A 1NGDA 3L0QA 1XC3A 1NWKA 3UKRA 3BP8A 3AAQA 3SJHA 3GE1A 2HMPA 4BRHA 3MK6A 2GWKA 1GLAG 4A61A 2QXLA 3HM8A 3C7NA 3D2EA 2A3ZA 3O80A 5KPTA 2WUSA 3ZEUA 3F9MA 2GELA 2IVNA 1GLLO 1T44A 4PKIA 2P9PA 4CZJA 3BEXA 4L3QA 2QWRA 1GLEG 5AQTA 1IG8A 3CJBA 3IUCA 2HF4A 4BQLA 1NGHA 1NGFA 1SZ2A 4EHTA 3ZX0A 1QHAA 1JCEA 4IO8A 3VEZA 5EOYA 3RSEB 2YHWA 4GNIA 4XH5A 3WQUA 4FWKA 4CD3A 4FPAA 4K41A 3W3DA 4BR0A 3O6WA 5AQUA 3D2FB 1DEJA 5JMVA 2I7PA 1GLCG 4BGBA 3WXLA 2BTFA 4MLHA 1BA0A 2UYTA 4MO5A 1X9JA 2E8AA 2ZGZA 4IWVA 1X3NA 1U6ZA 1ATRA 1H1VA 3DXKA 3M1FA 1P8ZA 5AFUH 4BRFA 5CE3A 2GUPA 3CJ9A 3MN5A 2P9SA 5EXWA 5BRFA 1KAYA 1QQMA 3LDNA 1NGEA 2P9UB 3OHRA 1RGIA 3LDQA 4BRDA 2QWNA 4ISGA 3S41A 4H5TA 3GDQA 2Q1NA 3WXKA 3CHWA 4IJNA 2Q2RA 4PL8A 4EAHD 1U2VB 3DJCA 2ZF5O 4QS9A 4RCHA 4B1XB 5AQVA 4WQ5A 5FPDA 3CIPA 3FZKA 3LDPA 2CGJA 2P9IB 1GLJO 3WT0A 3GG4A 3GOIA 1EQYA 1QZ5A 2YJFA 3VF6A 3CJ7A 3A5MC 3SLCA 3ENOA 5E84A 2A6AA 3WEEB 3IFRA 3R9PA 1ESVA 3VPZA 4O8KA 4EHUA 3O5BA 5KPRA 2V7YA 5BPLA 4XEIA 4H5RA 4BR4A 1IJJA 5AQGA 5KQDA 4A2BA 4BQZA 1HKCA 3ULEB 1C0FA 1NGIA 4ISEA 4JD2B 3O4WA 3WQTA 4CZLA 4FWSA 3VENA 2QM1A 3EN9A 3FE1A 3R6MA 4BVOA 1ATNA 3UKUA 4QS8A 3QICA 4I6MB 3VOVA 4CZGA 4MLEA 4BRAA 1G99A 2IVOA 3ZETB 1NMDA 4IZ9A 4WQ4A 4H5NA 5BRHA 1HKGA 5AZIB 2FSJA 2GTDA 2GWJA 1KAXA 4RWTA 1RFQA 1S3XA 2CH6A 2E88A 3VEYA 1R59O 3MCPA 5F0XA 2BUPA 1MWMA 4K42A 3VEOA 3MMVA 4FL9A 3UKRB 2QWOA 3QDKA 3QMLA 4BRGA 4IXCA 4BRPA 3VGLA 3C7NB 3D2EB 3A5OC 3I33A 4B1VA 1MDUB 3ZEUB 2YHYA 3O1WA 2V7ZA 5AQKA 5ADXA 2QW9A 3QBXA 2W41A 3WXIA 5AZJA 2IIRA 2P9PB 4FWNA 4DHYA 2NZTA 1XQSC 3DWLA 3H46O 5AQZA 5AQFA 2E2QA 1YVNA 4BRMA 1YUWA 2A40A 2FF3B 4B1YB 3CJCA 3BUZB 1XUPO 5EVZA 2D1KA 5ELZA 4ISFA 5JLFA 3AY9A 2J4RA 1BUPA 5AQXA 1BWFO 4DB3A 2E1ZA 1X3MA 2PAVA 3FZLA 1E4FT 2Q97A 4IJAA 2A42A 3TU5A 1ATSA 2ZGYA 5AR0A 5AQMA 4B1WB 1TUUA 2ITMA 5AFUA 4DCHA 3KHYA 1WOQA 3ENHA 3EO3A 1NBWA 3DXKB 5FPEA 3ATUA 3O08A 1HKBA 1GLBG 3HSCA 4JAXA 2P9SB 2Q0UA 1JCFA 3I8BA 2A5XA 4CI6A 1K8KA 3R8EA 4H03B 3BF1A 3CQYA 4BC2A 3JS6A 3D7EO 3WXJA 2IVPA 3IMXA 4RTFD 3EL2A 4BRNA 2A41A 4K43A 2P9LB 4A62A 1DKGD 1BG3A 4BR7A 1U2VA 2I7NA 5AQQA 4CZKA 1MWKA 1ZBSA 2FF6A 4YDUC 5B8HA 4BRLA 2FLOA 5BREA 1ZXOA 5EX5A 2P9IA 3UB5A 3EZWA 3G25A 3DXMA 1TYQB 3MDQA 1C0GA 5AQYA 4PKHA 3ID8A 4FWQA 3SMPA 3P4IA 1V4TA 3U9ZA 3M3ZA 5KQ8A 4FOEA 4JHDB 5AQIA 2E1YA 1HPMA 3CJ1A 5AQWA 2CH5A 1MA9B 1WUAA 5AQNA 1JCGA 2H3GX 3SK3A 3KVGA 4H5VA 3ZX3A 3HTVA 5KPZA 2AA4A 2P9NB 3KZBA 2QWPA 5BPNA 1NGBA 2Q0RA 5TKYA 4NO7A 3UKUB 3VEXA 3L6QA 3FZMA 2YHXA 5FPNA 2NLXA 3WUHA 2FSNA 2V52B 3CERA 2P9KB 5JICA 3VF2A 1T6CA 3ZETA 4BGAA 2Q36A 2D0OA 3C0BA 3ZX2A 3CETA 4QS7A 2QWQA 2HOEA 3FZHA 4AM6A 4BC5A 4CZEA 1Y64A 4PKGA 4EFHA 4M63C 2YJEA 1S22A 3VF4A 5LJWA 4FO0A 2E20A 4BG9A 2YCHA 4BR9A 4H5WA 2DPNA 4MO4A 4A2AA 4BRIA 2D4WA 1V4SA 5BR9A 4AM7A 2GEMA 5BRDA 1HX1A 1RDWX 4BC3A 3W0LA 3CQXA 2HF3A 3HZ6A 3LDOA 4XH1A 5F1XA 3EKSA 1GLDG 4K25A 5AZJB 1TUYA 2AP1A 4BROA 3QFUA 3QBWA 4WQ4C 4B1ZA 4H0XB 1NGJA 2EWSA 3DAWA 4B9QA 1NGAA 2FXUA 3O1BA 1Z05A 4O5FA 3ATVA 4FWRA 3VEWA 3U8XA 3FGUA 5ADXH 1CZAN 2FSKA 2OANA 3AARA 3MN6A 5AQRA 3FLCO 3VEVA 4CZHA 1D4XA 3TPQA 3H3OB 3RSEA 3VGKA 1ZC6A 3L4IA 3GL1A 4CBUA 3H45C 4KBOA 3VERA 4H0OA 2VWBA 3EKUA 4BREA 2VYPA 5AQJA 3UE5A 4CZFA 3B8AX 3D2FA 3QFPA 1NM1A 4HWIA 3U4LA 5LY3A 5BN8A 4CZMA 4H0TB 5EY4A 1KAZA 1GLFO 1HLUA 1LOTB 3H1QA 3LM9A 3A0IX 2YI1A 3HI0A 3FZFA 4WYBA 3VGMA 3LM2A 4YDUA 4BRQA 1J6ZA 4FPBA 2D0PA 4BRCA 3O8MA 2PBDA 4CD1A 1DGKN 2QWLA 4FOIA 4Y0WA 2CGLA 2P9UA 5AQSA 1K8KB 4CBWA 1KXPA 3LL3A 1OKJA 1QQNA 2KHOA 3BF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWOA 4H0VB 5BN9A 4J2AA 4MFBA 3MN7A 2DFEA 3L2QA 1RBRA 3VMFB 3V9WA 1BQNA 1Q81O 4FSVA 4BWMA 1HQEA 3LP3A 2ZQBA 2VQFK 2G8FA 5DK5A 4HTLA 4C8OA 4FWPA 4DSFA 3KWGA 1BA1A 3SUNA 3ULDA 4DLEA 5BPMA 1XNQK 3V1QA 1QZ6A 2ATQA 4YORA 1RTIA 1S1XA 4OGCA 4CJRA 1TYQA 1U4BA 1HNWK 3DLGA 3LDLA 3ID6A 1GOBA 3M6GA 1VSFA 3KD5E 1BDGA 4F3TA 4BR5A 4X64K 4H0PA 2JGUA 4O55A 4XH4A 4DV1K 3KD1E 4CJQA 3AO2A 1JLGA 4FWMA 4BR2A 3MCAB 3HPHA 3JSMA 3VETA 4DTNA 3H1VX 1QQOA 5DM6L 1RBSA 3VTHA 4GVMA 2HNZA 1HUXA 3OBWA 3WNHA 3KK3A 1BGXT 4KI4A 1QE1A 1HQUA 1JLEA 3O9UA 1NWKA 3ZYYX 4CHNA 4YHHK 3CCQN 4BRHA 2GWKA 2NUBA 3L3VA 4A61A 2QXLA 5KPTA 4KREA 1JL2A 2Z1JA 1XMOK 1L3UA 2P9PA 3KKRA 4EP4A 1KTQA 4CZJA 3BEXA 1E3MA 3L2VA 4CEZA 1RDUA 2KQ2A 5AQTA 1IG8A 2W00A 2HF4A 4H4OA 4EHTA 3TSPA 1QHAA 1JCEA 4IO8A 3KLGA 3KK7A 3THXA 4BE7B 1NK5A 4CFAA 1REVA 3G4SN 3LANA 3W3DA 1KLMA 3PUFA 4BR0A 3DLLL 3D0PA 1SUQA 3NVKA 2W6LA 3D2FB 4BY9C 3CFOA 1DEJA 1VSLA 5JMVA 1VK0A 3RVCA 3AO1A 1GLCG 3DLEA 3WXLA 4MLHA 4JKCA 3O3FA 1U6ZA 3AA4A 3S9HA 4QAGA 3TTFA 4CW7B 3O3GA 4Z4FA 3J7YP 1Q86O 1OVQA 4DV7K 4CEFA 5DMRA 1RGIA 3K9KA 4LFCK 4H5TA 2DY4A 2FBXA 1X1PA 3WXKA 1XHZA 2Q2RA 1U2VB 3NGZA 2ZF5O 4O0JA 4JKHA 3BY5A 4JK7A 2WOMA 4X65K 3EEQA 1YIJN 1ILYA 1DT9A 3MXJA 4JI4K 4CEBA 4JS4A 5J1EA 5IWAK 3K5MA 3DM2A 4FJGA 4BDZA 3CJ7A 1ZYQA 3WEEB 3IFRA 4EP5A 4ICLA 5C24A 1VQ5N 4B9VA 2HBKA 4YNQA 4W5OA 4FLZA 1HKCA 3THWA 1C0FA 3CCUN 4BDYA 1KD1O 4OPKA 4JRPA 1I39A 3EN9A 1Z26A 3QNNA 3R6MA 4BVOA 5LL6Z 4KRFA 3UKUA 4PQUA 4KFBA 4QS8A 4FJ7A 4JS5A 3SV4A 1UAXA 2IVOA 3ZETB 1NMDA 4H5NA 4M3ZA 4LFBK 4DF8A 1IBKK 2QK9A 3OYGA 1KAXA 1S6QA 4CHZA 1TK5A 4QOZB 4B3SK 1YITN 5F0XA 3C65A 4NCGA 4NYFA 2OZSA 4DR4K 3N4QA 3VEOA 3MMVA 3ZSXA 1NJYA 1CZBA 5T7BA 2QWOA 3QMLA 4IXCA 1RT2A 3L4QA 3LAMA 4BRPA 3D2EB 4OVLA 3P5JA 4CK1A 3O1WA 5AQKA 3AVFA 2BGGA 4BE0A 4KH6A 1S9EA 3WXIA 3CFPA 4N56A 5SWMA 2Y1IA 1XQSC 1OVYA 1RBTA 2W42A 3H08A 3TTDA 2E2QA 2BE2A 4ILHA 2Y1JA 2PFUA 2FF3B 3CJCA 2NRRA 1QS4A 3BUZB 1EX4A 4IFYA 3ZSWA 5JLFA 2O8EB 2O8CA 2B6AA 3CYGA 2YNIA 4DB3A 2RN2A 2PAVA 2KZZA 1E4FT 2Q97A 3B6OA 3I56N 3TU5A 4B9MA 1XHXA 3CPWM 3TAFA 4CEQA 3KHYA 2XY8A 4M3RA 1JL1A 1O13A 3EO3A 2A1RA 3ATUA 1WSHA 4DV0K 3QIOA 4JAXA 3HVTA 1TK8A 1BI4A 2OCEA 4CF8A 3SAGA 1S1TA 4BECA 1VQ9N 4OPHA 3R3LA 3S3NA 1K8KA 3QEWA 4H03B 4CJSA 3BF1A 4FLVA 3JS6A 2WC9A 2IVPA 3EL2A 2A41A 3MAQA 3ZLJA 3VA3A 4A62A 2KFZA 4BR7A 1G15A 2I7NA 4CZKA 2Z1HA 3DLBA 2D5RA 4E3SA 4E1MA 1KC8O 2HHIA 4BRLA 2FLOA 4JI1K 3L8BA 1SKRA 4FZZA 5EX5A 3ZSRA 5E41A 1QVGM 3DXMA 4O8UA 3SQ4A 3C6TA 3MDQA 2YHBA 5AQYA 3BGRA 3HPOA 4HHTA 1Z25A 2ZJPL 1NG9A 1YTAA 1C0UA 1WBDA 4JHDB 2D0BA 1C0TA 4FM1A 1W2BM 4GVEA 1MA9B 5DM7L 3VQEA 1WUAA 5AQNA 3SK3A 4AHTA 1S6PA 3HTVA 5K14A 2AA4A 4DV6K 4E19A 3QESA 2Q0RA 5TKYA 4NO7A 4ELUA 3SV3A 3RMCA 3FZMA 4YOWA 3AVAA 5FPNA 2NLXA 3MX2A 3OYHA 4I2QA 4KH5A 2UUAK 2P9KB 5CYMA 3ZT3A 2W6KA 4Z4HA 1X9MA 3HOSA 2D0OA 3CETA 2QWQA 4AM6A 4FJ9A 1S1WA 4YOUA 4DV4K 2XY5A 1NMNA 2X74A 4YFUA 4RG8A 5BRDA 2JWKA 3CQXA 3HZ6A 3OYLA 3LDOA 1IBLK 4CJUA 3NH1A 2OPQA 2VWKA 2C1IA 1TUYA 4DUZK 4K8ZA 2NRWA 3QFUA 4LH4A 4WQ4C 4B1ZA 1NGJA 2EWSA 1Z05A 3ATVA 3HYFA 3AO3A 4CHPA 5AQRA 4OKJA 4CZHA 4A57A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SUP A;  3VF2 A;  3WNG A;  4W5T A;  4BGA A;  2Q36 A;  1RTD A;  3FZH A;  4BC5 A;  4PKG A;  4EFH A;  3VQ4 A;  3CD6 N;  1KFD A;  1N36 K;  1KLN A;  4GV9 A;  3HXM A;  1WAJ A;  5I42 A;  2YCH A;  4Y1D A;  4B3T K;  4BRI A;  4LF7 K;  5M1K A;  4I9L A;  3SPZ A;  4JI8 K;  4BC3 A;  3W0L A;  1GLD G;  4K25 A;  3I0S A;  4N76 A;  2LSN A;  4B9Q A;  1LAW A;  3VEW A;  2ZM6 K;  3CCV N;  3U8X A;  3FGU A;  5C42 A;  2G8K A;  2OAN A;  3NCI A;  1IV0 A;  4WCE L;  3MN6 A;  3FLC O;  4JEP A;  3RSE A;  3VGK A;  1CZ9 A;  4CGH A;  4M3T A;  3OJU A;  1N6Q A;  2VWB A;  4KHS A;  4KB0 A;  4XJX A;  3A2F A;  3UE5 A;  4DQI A;  1KSP A;  2NRX A;  3HVR A;  2E6M A;  3NMU A;  1J5E K;  2OPR A;  4O4G A;  4CZM A;  4H0T B;  5LMU K;  2HHX A;  5EY4 A;  3ALY A;  1C0M A;  3CPE A;  3V1O A;  3NF9 A;  4BRQ A;  5M1F A;  3LAK A;  4FPB A;  4DTJ A;  3RWU A;  2PBD A;  4CD1 A;  2QWL A;  1N8R O;  4Y0W A;  4LF5 K;  5AQS A;  2QXF A;  4E7L A;  4FVM A;  3KLE A;  3M8R A;  4E7J A;  4O44 A;  3M8S A;  3IS9 A;  3VQ9 A;  2HHS A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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