1JCNA

Binary complex of human type-i inosine monophosphate dehydrogenase with 6-cl-imp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
490
structure length
395
Chain Sequence
TGYVPEDGLTAQQLFASADDLTYNDFLILPGFIDFIADEVDLTSALTRKITLKTPLISSPMDTVTEADMAIAMALMGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKNFEQGFITDPVVLSPGIPITEVGIVTSRDIDPRIELVVAPAGVTLKEANEILQRSKKGKLPIVNDCDELVRTDLKKNRDYPLASKDSQKQLLCGAAVGTREDDKYRLDLLTQAGVDVIVLDSSQGNSVYQIAMVHYIKQKYPHLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDGLRVGMGCGSICITQEVMACGRPQGTAVYKVAEYARRFGVPIIADGGIQTVGHVVKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEKGSIQKFVPYLIAGIQHGCQDIGARSLSVLRSMMYSGELKFEKRTMSAQI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords INOSINE MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE I
publication title Crystal Structure of the Human Type I Inosine Monophosphate Dehydrogenase and Implications for Isoform Specificity
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 395
sequence length 490
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2001-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jcnA00
2EF9A 2Z2UA 3O63A 1FWRA 4ZQRA 1AW1A 2C18A 1W3IA 3CB8A 5IBXA 5TIMA 5F4SA 4HN4A 3W2UA 4AWTA 4M7SA 1JQXA 4IMCA 5DLCA 3TUUA 3PBUA 3S5YA 3C6CA 2HSAA 2CU0A 1GG1A 1R46A 4KFPA 3FJLA 3TK7A 1WX0A 5FF4A 4OHQA 3NG3A 4IGHA 1B57A 4N6FA 4IQLA 4AAJA 5G1TA 3TSDA 3SSJA 1VCGA 3TMQA 4S2BA 5EPDA 2WNZA 3RF9A 4A29A 4XBKA 3TIMA 1G4EA 3O8AA 5CPMA 4M7TA 3MYOA 1IXOA 1LCOA 4C1KA 2ZRZA 4QNWA 2CLMA 4ZQNA 4MY8A 3W1LA 4K8EA 1T0OA 4MLRA 2QUVA 3G3DA 5GVJA 3WJSA 2QCHA 4QNEA 4WY0F 1CX9A 2X1TA 3HG3A 4O14A 2ZDRA 3IIPA 5K2ZA 3UQNA 3QRHA 3AJXA 5AC7A 4WY0A 1IXPA 1T96A 4NNAA 1KV8A 2YXGA 1OX4A 3DAQA 1TV5A 1MXSA 5F2IA 2NXHA 2A7NA 3VI2A 3DZ1A 2Y88A 4IXXA 1I2NA 4W9TA 4CCEA 3W84A 3F1QA 1IIHA 2Y62A 1MEWA 1A5CA 3MBFA 3R89A 2Q8ZA 4YWIA 5BRBA 5LNWA 1W31A 2HS8A 3C8FA 4O0ZA 1TTIA 4DELA 3TFCA 2V81A 3C3NA 3CQ0A 1VCVA 2FLIA 2H3DA 4UTTC 4N2YA 3W1UA 2ZA3A 5AHNA 2E68A 2W79A 1MEIA 4EWND 4H3DA 4NXKA 5KMYA 4Z08A 2J27A 3QZEA 2I1OA 3ZWTA 2ZBTA 3RFAA 2CLEA 3QMRA 4JTEA 2FPYA 1O94A 4FX6M 2OT0A 3MO7A 3GDLA 1AL8A 2PRMA 2V2DA 3I65A 1YTKA 3E12A 1BEUA 3P5ZA 1H7RA 3KVLA 2Y7GA 3QMSA 4NT0A 3TQ0A 1JUBA 4HPXA 2WSYA 1ZAIA 4OU1A 4U28A 3PSWA 3HO8A 1FUYA 3TE9A 1TO3A 2FB3A 4GRSA 4JTFA 4UTJA 1WYIA 1RD5A 3TH6A 2CWNA 1LROA 5AHLA 2DP3A 4Z0JA 1ICSA 3RK8A 3HG4A 3QSTA 1XUZA 3LBCA 2QCLA 4R34A 1XI3A 3HOJA 3PUDA 1F6PA 2NUWA 4JDYA 1TPUA 1KM3A 3CIWA 4JGDA 3SI9A 1XM3A 1N8FA 5LKYA 5U4NA 1X7FA 3YPIA 2R94A 3IGSA 3NM1A 3USBA 4E2BA 3UWUA 1R2SA 2AQWA 4NX0A 3UY8A 1SR9A 2P1FA 4MVAA 3P81A 3QF0A 3HGOA 1A5AA 3KVMA 1KFLA 2V8ZA 4YMZA 5EL1A 2QJIA 2E5DA 4N4PA 4MKNA 4HNVA 4NQ1A 3HGSA 2BXVA 1VGAA 3CEUA 5FEZA 4GC4A 5AHEA 3PB2A 3BG5A 4NNBA 4YLWA 3UZ5A 1TPEA 2AAMA 2ZZ2A 4GNJA 4AHOA 3LI1A 5HWMA 1OYAA 3RLVA 1Z42A 4O1CA 3Q2DA 3EWUA 1H5YA 1F05A 3W23A 4EIVA 1J2WA 3CPRA 2BZNA 3LB0A 2P10A 3I7SA 3GAKA 1YXYA 3BV4A 1YPFA 3ZR4A 1KFJA 3CEPA 2QCDA 3NQ6A 1BWKA 1AMKA 2GOUA 4QISA 4O0KA 2GJLA 4RZ6A 2GUUA 4IMEA 1YADA 1PHWA 3R13A 5LZLA 4O1BA 1SQ7A 1OF6A 4Q4KA 1K8ZA 1F5ZA 1FXPA 3ABSA 3W7KA 2GQ8A 4DF2A 5K9XA 1N7KA 5HNRA 1G7UA 4O8RA 2E5BA 4JX5A 3DBPA 5AYZA 1QMLA 4L4LA 1H63A 2AGKA 1JCNA 5LNRA 4GUIA 2CW6A 3W2NA 1TYGA 1JCXA 1N55A 2EPHA 3R12A 3LXBA 4QQ3A 1WA3A 5F4XA 2E5CA 2VXNA 4OWGA 1WDWA 3BVJA 1ZNNA 1GPWA 5AYYA 4QIUA 5C55A 5KZMA 2C1HA 2ZCGA 4U4MA 2QR6A 1WOBA 3MHUA 4Y8FA 3BG9A 3G1AA 4I7WA 2R8WA 4M5PA 3TSBA 4DEFA 2QUTA 3MUXA 3BGGA 5TQLA 4AF0A 2BSLA 1SZEA 2QDGA 1PCKA 5J5DA 4PCFA 3W2MA 5AB3A 1ZAHA 3M5VA 5FF7A 4AVFA 5LSMA 1VH7A 2VENA 1KV5A 1KLYA 4RLIA 4UMCA 2YCEA 4JY9A 4JIQA 1UJPA 3GDMA 3QFEA 5D2VA 4AMAA 4UNKA 3EWWA 4LOCA 5C5YA 4KFNA 4A22A 3NL3A 3NPVA 5LNSA 3S5NA 2B7PA 5LNVA 3B8DA 3G18A 4MIMA 2NUYA 3FYOA 2C14A 3STFA 3DI1A 3TV8A 4O54A 4N9EA 4CQAA 1Q3NA 1KLZA 3AO0A 2QAFA 1OK4A 3SECA 1TRDA 3EX2A 1YDOA 1XBXA 3NPXA 4PTNA 2YPIA 3W83A 3W7OA 4JTTA 4UTUA 1H7WA 3W9ZA 3ATYA 1EX5A 4ZZ9A 3TJLA 5G2WA 4IX2A 2QCMA 3P82A 3NVTA 3G0XA 3N14A 5U7SA 3P60A 1QFEA 2ZFAA 4K38A 1KW1A 4RX0A 1SSDA 1XKYA 2NUXA 3W7LA 2HS6A 4UFJA 2QCFA 3PBYA 5FEXA 3TR2A 3G1XA 2TPSA 2OJPA 4GJ1A 4DBEA 2E77A 3W2LA 3L2IA 3A5VA 3W2KA 4DF0A 1B4KA 4O19A 1H1YA 4KWWA 3L9CA 4AF0B 5F2MA 3DXIA 3HMJG 2DZWA 1OFPA 4R33A 4AB4A 1JR1A 1AG1O 3EXSA 3GLCA 3G1DA 5D05A 1M7PA 5CKSA 1S5TA 1EIXA 2NLIA 3A5FA 2X30A 1VPXA 4UTHA 1PS9A 3NZRA 3TSMA 4NX5A 3GR8A 3KVKA 5FF0A 3FFSA 3EX6A 4O10A 5CZ0A 2A1YA 5CZSA 3HIJA 1M5WA 1DJQA 1QCWA 4O50A 3EX1A 4UFIA 4BR1A 1IXQA 1EWEA 3KX6A 1GZGA 3TXVA 2EGZA 3IGXA 2ZA1A 4HSNA 5L6UA 2V9DA 1OYCA 3LDVA 4LVAA 3LX9A 3TCEA 3A24A 3THAA 3NQVA 5K9CA 4Z1AA 2YSWA 3GAYA 3JS3A 2GPTA 3FJ6A 4PL2A 3W1PA 2TSYA 3C2VA 3UY7A 2ALDA 1FCBA 2OCZA 4HT3A 3BLEA 4QSHA 3C56A 3L0NA 3UWYA 1JCMP 4FNUA 1YPIA 4O15A 1RZMA 4LT9A 3P62A 3MW7A 4NJKA 2JGQA 1DKWA 4IPIA 3BARA 3OVRA 3O06A 1O5XA 1GT8A 2EKCA 2RFGA 3R8RA 4AEOA 3W7CA 3U6WA 5LGZA 2B0MA 5HUPA 2Z1BA 3LV5A 2E6AA 3DI0A 1ZCOA 1GYNA 2W0UA 1TTJA 1ZJIA 1BTMA 5D37A 5KZDA 3DH7A 4LC8A 4UTMA 4DBDA 4ORIA 3MWAA 1LOQA 1I2OA 3PBWA 3DENA 3OVQA 4LS0A 3NQ7A 4WXYA 2BLEA 2OX1A 3T4CA 3S9YA 2ZZ7A 4JX4A 4RZ5A 4PC8A 2XN2A 1NSJA 1WBHA 3NAVA 1JULA 3NR0A 4NJHA 4NU7A 3ELFA 2E6DA 4NZJA 3TXZA 3GB6A 1QNVA 1SO4A 4LW7A 4PODA 2R14A 1FXQA 2H8ZA 1FY6A 2YR1A 4A21A 2C13A 5C54A 2ZRYA 4FNRA 2C6QA 1DVJA 3FYPA 2NV1A 1D3GA 1YLVA 3MHFA 8TIMA 3MP3A 3FS2A 1F73A 2F7FA 3IVTA 4FX8A 1GVSA 5D04C 3QYQA 1XBYA 2WJZA 1LDCA 4UTIA 3A22A 3GK0A 3I7RA 1OF8A 1TRIA 3UXDA 2OMAA 3Q94A 1SW3A 1W3TA 2VEKA 1S3HA 3KXQA 2E1DA 1QO5A 2JK2A 4LRTA 4JEQA 3C0JA 3DHFA 4O16A 3TW6A 3LHZA 4FB7A 2Y7DA 3G1HA 4G1KA 4MFEA 3ANYA 4ML9A 1VYSX 4XKYA 1QPOA 4XUGA 3GKFA 2A6LA 1WBJA 3W86A 2DZVA 4CCDA 1LZOA 2J9ZA 1OFAA 2Z6IA 3GXPA 2OT1A 1Q6QA 2Y7FA 3B05A 2J9YA 4ZMGA 1VYPX 2NV2A 3EEGA 3W1AA 5IM51 5IBXC 3OA3A 4A3UA 5AHFA 5AC6A 2VEIA 1RPXA 2RKXA 4FX7A 2QJHA 4BI7A 1HUVA 4UC5A 4RR4A 3WJZA 2YGYA 2EAWA 5EYWA 3C2FA 4ZQOA 3TMLA 1GVFA 4N9DA 3BW4A 1WOAA 3OVPA 5EMUA 3W71A 2WPBA 2CLFA 3QH2A 2V30A 3NA8A 1XXXA 1WXJA 4FNSA 3L68A 3MI6A 3E49A 3W7EA 5HR7A 1FDYA 2DJLA 4ICNA 1AW5A 4H4IA 2ISSA 1VR6A 3ABOA 1QR7A 3S1WA 4Y6GA 1HL2A 3NQEA 3N34A 3PM6A 3IIOA 3B0PA 4ZQPA 2FIQA 3E0IA 2JBMA 3KVJA 4O13A 1QOPA 1V7YA 4JYDA 4DQWA 5I3KA 1RQEA 2XN1A 3CHVA 2X1RA 4YL2A 2A6NA 2ZZ3A 2VELA 1WV2A 3LXAA 3TDFA 4OV4A 4LS2A 4OGZA 1SU5A 1JCLA 2O7QA 4Q33A 5G4EA 2NX3A 3W22A 4JX6A 3M5ZA 4XKYB 5D02A 3S0CA 1J4EA 3TAOA 2TRSA 4JICA 4QITA 3UPWA 1P1XA 2YFNA 4O1AA 3W74A 1EB3A 3PSVA 2GQ9A 4RXFA 4Q32A 4GFSA 2LLEA 3NM3A 5BNKA 4NVTA 1KBIA 5CGQA 2VFDA 1MZHA 2BTMA 4X3ZA 2GQAA 3W7MA 2D73A 3LTSA 2IQTA 1OK6A 3PB0A 2JKEA 4DO6A 3F4WA 4MJZA 4LVBA 4MYAA 5HJLA 1KA9F 1KTBA 1K8XA 5DCEA 3LTPA 2ZZ6A 2Y63A 2B7QA 1AL7A 1K8YA 1DQWA 4HSOA 4UR8A 3HPZA 4FNTA 6TIMA 4IOTA 4WY0B 3T55A 1R2RA 1ZY9A 1TPWA 1OX4B 1C8VA 4OQVA 2EHHA 4LC6A 1L6WA 3UD6A 4CQ8A 4BWLC 3F4NA 1UASA 1EPXA 1GYLA 4TMCA 4LUIA 1GQNA 1VQTA 3TQKA 3LHUA 2PCQA 5C6MA 5D32A 3W85A 4CLMA 4XTDA 3UPBA 4HNTA 1TSIA 3QQ0A 3NL6A 1O5KA 4BK9A 5F1VA 5D2WA 3SY5A 5EBUA 3QEZA 2DZUA 2JKAA 2VOMA 5CPNA 1QPRA 1P0KA 1G4PA 4FF7A 1PL9A 4TMBA 1B4EA 3LHWA 3W1MA 2QCNA 4DF1A 3C61A 3FEMA 5AYXA 4K37A 1WAUA 2A7RA 5DXXA 1OABA 5HMSA 4JYFA 5T26A 2DZSA 1VCFA 4K7YA 5AC8A 4E0CA 1SZNA 1LRNA 1SZFA 3WJYA 3O6DA 3W70A 3Q37A 1OYBA 4PH6A 2A4AA 2X1UA 3PG9A 4NJGA 3O16A 2V2HA 1SUXA 3M43A 3KFTA 4S1FA 3ZFHA 4JR5A 4UUIA 1GTHA 5BMXA 3LERA 3BGJA 4LTSA 5F2GA 3P67A 1K7XA 2ZTKA 4WJEA 4OV9A 5DN1A 3WFAA 1LOSA 1LM1A 2DJXA 2FPTA 2WNQA 3PULA 4UIOA 1Z41A 4N4QA 3U2OA 3P80A 2Y61A 4OBTA 1S5VA 4RCXA 5LGXA 5DXYA 2Y89A 4XWUA 1RR2A 5D03A 4QAIA 1U5JA 4UFMA 4J9JA 3W72A 2QCGA 4EVZA 1TREA 5LHFA 1J5TA 1B3OA 4LNYA 4BI5A 1W8SA 1PE1A 2GVJA 3GZ3A 2VFFA 1JJKA 1K7EA 1YTEA 2O7SA 4FEZA 5EKYA 2V5LA 3NQAA 1GVRA 3P61A 1SO3A 4IXHA 3O05A 3U8GA 3W1RA 3W7DA 4GE8A 4Z1DA 1QPQA 2C0AA 3IV3A 4X2RA 3S5OA 1VHCA 4AH7A 3TX9A 3KRSA 5D09A 5D2XA 5D38A 4RZ4A 5DCBA 2CLOA 1TPH1 1U83A 4M6VA 5D2YA 3MHGA 1L6YA 1W0MA 3QQ1A 3PG8A 3LCWA 2G5WA 2YDAA 1W56A 2NWSA 3EWBX 3DFSA 1G6CA 2DORA 5HWNA 1Z48A 4GUGA 1D3HA 1HTIA 1YDVA 3I68A 1X8FA 2VKZG 4BI6A 4R53A 5CG7A 3O15A 1D9EA 4WZHA 3N2XA 4X9SA 2QCDB 4MPQA 1F74A 1H51A 3P84A 5I3IA 3T78A 2DU2A 5E93A 1TTQA 4HNUA 2PRHA 3N2MA 1A5SA 1SZGA 4PA8A 3W7IA 4DPQA 4NJIA 5MHBA 5DY2A 1I45A 3MI2A 2DZXA 3NEVA 4P61A 4RV8A 5CPLA 1PCWA 1TPDA 3MMTA 3N3MA 1L6SA 4HHPA 1F76A 2HMCA 4LY8A 3FIGA 5FEPA 1DHPA 4NJJA 3IGUA 3CLMA 1LP6A 3RMJA 2WOQA 3W1XA 3P5YA 2H3BA 1X1OA 2C19A 3QC3A 3HF3A 1KFCA 1XBVA 1IGSA 1VS1A 3LCIA 4JTGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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