1JCN | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	490
structure length	395
Chain Sequence	TGYVPEDGLTAQQLFASADDLTYNDFLILPGFIDFIADEVDLTSALTRKITLKTPLISSPMDTVTEADMAIAMALMGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKNFEQGFITDPVVLSPGIPITEVGIVTSRDIDPRIELVVAPAGVTLKEANEILQRSKKGKLPIVNDCDELVRTDLKKNRDYPLASKDSQKQLLCGAAVGTREDDKYRLDLLTQAGVDVIVLDSSQGNSVYQIAMVHYIKQKYPHLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDGLRVGMGCGSICITQEVMACGRPQGTAVYKVAEYARRFGVPIIADGGIQTVGHVVKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEKGSIQKFVPYLIAGIQHGCQDIGARSLSVLRSMMYSGELKFEKRTMSAQI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of the Human Type I Inosine Monophosphate Dehydrogenase and Implications for Isoform Specificity rcsb
molecule keywords	INOSINE MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE I
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
total genus	106
structure length	395
sequence length	490
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2001-06-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1jcnA00

4GWEA 3A23A 3PUDA 4UTHA 3E49A 1TTJA 4CNOA 4UFIA 2X1SA 3TK7A 4HPXA 5AHNA 3WK2A 4HN4A 2E6FA 2C13A 3P74A 1SO3A 5I3FA 4CNPA 4R7JA 3B04A 3PC0A 4DQWA 3W7NA 5LHFA 3QH2A 4LVGA 2DZVA 3GXPA 3LI1A 3N14A 3KVLA 5TQLA 3GVGA 3PB0A 5I3GA 1W3IA 1EWDA 3NQGA 4QITA 3RLVA 2A2IA 5C54A 3H55A 3H54A 1I2RA 1KFCA 1FQ0A 3G1HA 3GYEA 4QISA 1G4TA 1JUBA 4O4WA 3C56A 1XBVA 1F5ZA 1DORA 1QNVA 3GK0A 2QDHA 3WJSA 3M7WA 3LHTA 1XUUA 3JRKA 2QUUA 4ZQOA 3PBWA 4AMAA 3L0NA 3PAJA 4I7UA 2Q3RA 3EKLA 1M7OA 3WK0A 5L9FA 3P8IA 5DLCA 3ZFHA 2EF9A 2ABAA 3A21A 1LOSA 2NWSA 5HUOA 4O13A 1GYNA 2WSYA 3W1NA 3UNDA 4LTSA 3GAYA 2E5CA 4WOZA 3O6CA 1VR6A 1QDSA 4GRSA 5I3IA 2RKXA 4A29A 2PC4A 3BLEA 4AVFA 5FF2A 3HJZA 3PS7A 3TFXA 1SFJA 5D2TA 3U2OA 3IVUA 3M44A 4FHAA 3C2OA 3W74A 3LHZA 1VCGA 2YSWA 1SFLA 1WA3A 4ORIA 1AG1O 4QJ1A 3LBMA 5F2GA 3I65A 1L2UA 3PWAA 4AF0B 2I14A 3W7JA 5HQEA 2TRSA 4I9AA 3G1VA 3LCGA 4UTKA 3W9ZA 3IGSA 5L6UA 4EOUA 1ZFJA 4LW7A 1J5TA 1F76A 3BG5A 1WBJA 1TREA 1GG0A 4M7TA 3Q94A 1KA9F 5D03A 2H3BA 4RJEA 3EX1A 2ZZ6A 2R91A 4P61A 1XUZA 4CCDA 3W6YA 3QC3A 1MSSA 1D3HA 3R5EA 4AWUA 3N73A 4Y9AA 2C18A 3NQ6A 3W7IA 5HULA 3L5AA 4MZ8A 4ADTA 4IQLA 2ZA1A 1KW1A 1BWKA 1CI1A 2J9ZA 1ZALA 3LERA 1OX6A 2QJIA 3KRUA 1VHNA 4FX8A 1GVFA 1ZENA 4AHPA 1N7KA 4DO4A 5BOOA 3CIXA 4MOZA 4PL1A 1SUXA 3TKFA 5G5IA 3W2JA 4UMBA 1N8FA 3MJYA 1JRBA 3PSVA 3MP4A 2J88A 1GVSA 1BKSA 1L6SA 5F2LA 4S1FA 3SFKA 2GUUA 2VEMA 1OHLA 3ELFA 1H1ZA 5DCEA 4FIQA 3G22A 5CSSA 3PF3A 1TB3A 2NXIA 3G1YA 1FWRA 4FIRA 3DZ1A 2ABBA 3K30A 4O18A 1GTHA 1W5PA 3DI1A 4JTFA 5DXXA 5CZJA 2R14A 2XN0A 4JIPA 2QCFA 1OK4A 1R46A 1W5OA 5C5YA 5FF4A 4Z1CA 4FX6M 4IJBA 3L68A 1KFBA 5I3HA 1D3GA 4IUOA 1VYPX 1G69A 1ME8A 3TQKA 3FJLA 1TV8A 4A21A 3S1VA 3KVJA 1WV2A 2I9EA 3E12A 1P5BA 3TR2A 1TRDA 1IF2A 4ZMGA 1TV5A 3BGJA 1JCNA 4RK8A 2WKJA 1XDMA 2V2HA 4WD0A 1KBJA 1OX4B 3HG4A 4TX9A 1SU5A 3STFA 2ZBTA 3C3NA 4NNBA 3F1QA 4O52A 2BX7A 4UTJA 4WZHA 4PEKA 4MUZA 4N9DA 3P80A 1VYRA 5G2IA 5ABTA 4ADSA 5D32A 3KRZA 2HSAA 1SZNA 1VYSX 3HMJG 3IIOA 2CLOA 2E5DA 5E1QA 3TAKA 4X9SA 5FF0A 2ATMA 4HNNA 4O57A 5D2VA 3S6DA 2EAWA 1BWLA 3CU2A 1WDWA 3RNDA 3LCWA 4OE7A 3BV4A 1OK6A 2J24A 2PURA 2YZRA 4E38A 5AC8A 2WO5A 1H60A 3LRLA 4RR4A 2VXNA 1F05A 1W56A 3FLUA 1GYLA 4XKYB 2Y62A 4JY9A 2NX9A 4WOQA 4EWND 3W7EA 1YTKA 4IMCA 4C1LA 4HSOA 5D2WA 2VKZG 1LCOA 2QCDB 1S5VA 1A5BA 3O06A 3KX6A 5CZ0A 3N2XA 3SW6A 4CCCA 4UUIA 4DPPA 3PM6A 1JUKA 3T44A 1UCWA 1ZAIA 5HJLA 1ZY9A 1H7OA 1B3OA 1PHWA 1NEYA 2Z6IA 2CZ5A 2NLIA 2FPVA 4JYDA 2E6YA 2IQTA 3RFAA 1AMKA 4UNLA 1FXQA 4FNTA 4NJHA 4HKPA 5AYYA 3G3DA 3W1PA 3DBPA 5FEZA 3LTPA 2BTMA 1YPFA 4CQ9A 1IIGA 1OFPA 4N9EA 2ZZ1A 4AHOA 3E9AA 2ZRYA 5LKYA 4UTWA 5AC6A 3LHWA 4N9BA 1CW2A 2PRLA 3NL3A 1K7EA 2V8ZA 3RU6A 2V2CA 4O16A 4MY8A 3LCXA 4PH6A 1L9WA 3L66A 1B4KA 1KV8A 3VI2A 3W75A 3BVJA 3GIYA 4M6VA 2TMDA 3OG3A 2DZPA 2X16A 3EWXA 4O8RA 4Z08A 4R33A 5HR7A 2YCEA 2FB2A 2VFEA 4NX5A 1G4SA 3G8RA 3LDVA 3MHFA 4RKAA 5TIMA 1KM5A 4N9CA 2GQ9A 3G24A 4O53A 5AN7A 2PCQA 1F74A 3CPRA 2A6LA 3HOJA 1W31A 3TDFA 4IMDA 4ML9A 3NO5A 5GVJA 3G0UA 2YX0A 2NXGA 3M47A 3W1UA 1WAUA 4HSNA 3W1RA 1NFBA 3LTYA 3G8EA 3DHFA 1TPUA 4Q32A 1ICQA 3NQDA 5K2ZA 1I2QA 4HIBA 1H63A 5KZDA 1IXQA 2FPYA 3O1NA 3PVFA 2PE4A 1B9BA 5HINA 3JS3A 3KVKA 2ZQ0A 4L4LA 6TIMA 4DO6A 2Z1BA 2LLEA 1TCDA 2UV8G 5HUPA 3PULA 1C8VA 3W1LA 3UXAA 4K8HA 3DKJA 3B4UA 3KOFA 3S1WA 5FI8A 3HIJA 3TE9A 1G4EA 3W1TA 4A2RA 3QQ0A 1E51A 5LSMA 3I7RA 3RLUA 2QCCA 4OT7A 2ZDRA 4UTTA 1TPC1 2Y7FA 3NQEA 3NPUA 3Q37A 1GVOA 4JDBA 4UR7A 4NNAA 1EIXA 1SO5A 4ZQMA 4FXSA 4BFAA 3DH7A 3L2IA 1JQXA 2JGQA 3CTLA 3EWYA 4XTIA 4NZFA 3TV8A 3PB2A 1KM2A 4YCPA 1OF8A 4LVDA 3F4WA 4UTMA 1UASA 3W2NA 4JD4A 3ZWSA 3E96A 1MEHA 3DXIA 4FF7A 1DKWA 1O5KA 4JEQA 1WXJA 2J6XA 4NJJA 1JCYA 1UB3A 2JKPA 2QCEA 5CZSA 1HG3A 4BR1A 4K37A 3GDLA 2ZA3A 2EGZA 1W3TA 1PL9A 1I4NA 3SY5A 4TIMA 1EUNA 1FDJA 1JVNA 1A53A 1P0KA 1QFEA 1KFEA 2OT0A 3L0GA 1H62A 1KV5A 4DBEA 4UFKA 5IBXC 5EYWA 2OT1A 3PUOA 4RX0A 1Z48A 3O16A 4BWLC 3GNDA 1PV8A 1TPDA 3MMTA 3UD6A 3BLFA 1LRNA 4FNRA 5F1VA 3EWBX 4Y96A 1VH7A 4NXKA 3USBA 1G67A 4AEOA 4LVFA 3O6DA 2CLIA 3QSRA 1I2OA 5A5WA 2R8WA 3M6YA 1SPQA 3HBLA 3W72A 3SIZA 1TPWA 1VCFA 2E68A 1SO4A 2VEKA 3GNNA 1Q6QA 4KFPA 1DHPA 1B4EA 3GKAA 3TU9A 4JX5A 4NJIA 1MXSA 2C14A 3NNTA 3UY8A 3QQ1A 4ORMA 1TPH1 1VQTA 3O8AA 3ABRA 3NR0A 1EP3A 1W54A 3NDOA 1TPB1 2J9YA 1DV7A 4LWWA 3W22A 1TPFA 3S1XA 3DENA 5BMWA 3HG3A 4JY8A 4XBKA 4WQ6A 1K8ZA 3UY7A 1W5NA 1EWEA 1TSIA 1YLVA 1ONRA 3LHYA 2ZZ4A 4MFDA 2VFFA 1XBYA 5LNWA 1XC4A 3OIXA 4X22A 3MHGA 3TSMA 3MBFA 3PSWA 1F73A 4W9TA 1JCJA 2H8ZA 2VEIA 3INPA 5LGZA 2BLEA 2C16A 4Q4KA 5D30A 3W3OA 5K9XA 1ZAJA 1TTQA 1LOQA 2A6NA 4UFLA 4N6FA 1QMLA 2YR1A 5D09A 1ZJIA 2ZRUA 1LROA 5K9CA 3HPZA 4OHQA 4NJKA 3LGEA 3RMJA 4O1AA 4CQAA 1XI3A 3EX6A 4LVBA 1TJPA 2VFGA 5C6MA 4WXYA 4JTTA 4MZ1A 4RCXA 1W1ZA 3NVTA 4BK9A 3FJ6A 3GDTA 3TH6A 2NWRA 4KWWA 2NX1A 2E6AA 3LX9A 1TV7A 2J27A 1R2TA 1A5AA 5HNRA 3UWWA 3BARA 1OF6A 4DO5A 1W0MA 2V81A 1HO1A 2FJKA 1DL3A 1GTEA 3W1MA 5BNKA 3BK0A 3LXCA 4LS0A 3S5ZA 2X1UA 2Y88A 4OV4A 4IWWA 2FLIA 4MKNA 3DI0A 3F4NA 1TIMA 5KSWA 5DCBA 4POCA 3C0JA 4KFOA 4FEZA 5CGQA 3F03K 1V5XA 3M9YA 4O19A 1SW7A 3TQ0A 1IXPA 2TPSA 2B7NA 2X2GA 3GLCA 1IXNA 4BI6A 4O11A 1H61A 3W7DA 3S9YA 1NF0A 4TMBA 3WJWA 3A5FA 5J5RA 1U5JA 3GR8A 2QCLA 3EXTA 1DJNA 2QF7A 3MBDA 3VFLA 2NV1A 2W79A 3FIGA 3CWOX 4OGZA 4JX6A 1AW2A 2NUWA 3N34A 4CCEA 3EB2A 4LRSA 5KZEA 2DJXA 1XCFA 1S5WA 3I6RA 3I68A 2BSLA 1JUEA 4QNWA 2CZEA 3NPVA 1XL9A 2C15A 3W71A 1R47A 4MVAA 4C1KA 1K3UA 4HNUA 2GJNA 4QQ3A 4LVAA 4UFMA 2RDWA 2VFHA 1J2WA 3NQ2A 3TC7A 2QDGA 2Z0IA 1TMHA 4UXDA 1A50A 4FNUA 4O54A 1KM3A 3QMRA 3GB6A 3TNOA 1GZGA 3KFTA 3W2KA 3JR2A 3T55A 4GFSA 2OMAA 2F84A 4O1BA 3G18A 1Q6RA 4X3ZA 4LS1A 4N2YA 3A22A 5DELA 1DBTA 4MLJA 1XBZA 2VEPA 1YADA 2OCZA 2Y63A 5AHIA 2C19A 4MYAA 5G4WA 1AW5A 2QCHA 4RZ6A 4MJZA 4AWTA 1AL7A 1YTDA 3BG9A 1TRIA 1C9DA 1W37A 1WQ5A 2GOUA 4BI7A 4DF0A 4M19A 1UJPA 3LHVA 1KLZA 3ZR4A 5SWUA 4M7SA 1LP6A 3P62A 4UMCA 1TQJA 1SSDA 3TMLA 4K38A 4I7VA 3NG3A 2QR6A 1RQBA 4LC8A 2JGYA 3OA3A 4XQ6A 4GUFA 2CLHA 1VLWA 3W7CA 3TSBA 1T8XA 3B0VC 2HMCA 3VKJA 2CLEA 3UPBA 2X30A 2B7OA 3FFSA 4KWVA 1EA0A 3W7RA 2CZFA 4BI5A 1YYAA 5FESA 5CSRA 4WY0A 1RZMA 4FXRA 1AK5A 2V9DA 5AFDA 2H3DA 3M43A 5EPDA 2ZFAA 4GUHA 3PBYA 1ALDA 2WSRA 3MHUA 2B7PA 1Y0EA 2WOQA 4N6EA 3A5VA 2DORA 1P1XA 3L21A 4I7WA 4E2BA 4LV4A 3IRDA 1H7WA 4GUJA 4IPIA 4JX4A 3TX9A 1ICPA 3YPIA 3W1AA 3R2GA 1LRTA 4E2DA 2YYUA 3NXFA 5AC7A 5LHEA 3KXQA 5AHLA 3GDMA 5EBUA 3NM3A 1LLZA 3IVTA 2W0UA 1OFDA 2WNZA 3N9SA 3H53A 3LXAA 3NQVA 4UC5A 4HNTA 1DJQA 2PRHA 3Q2DA 5AOUA 4R34A 1SO6A 1VCVA 5H2ZA 5LNVA 3DFOA 2A7PA 3NGJA 2R94A 4WJEA 3U8GA 4JTHA 1KFLA 1X1ZA 3FS2A 5DXYA 4MPQA 1Q45A 4U28A 4OBTA 3QM3A 3S42A 2OX1A 1F7BA 1SZFA 3PG8A 4XTDA 1LBLA 3IGUA 1KM4A 3TMQA 4PA8A 4NT0A 4K7YA 5AYZA 3FKRA 1VRDA 2DJLA 1TTPA 1B57A 2VENA 3NL6A 2P0OA 3DFQA 5D2YA 3L5LA 3LM7A 1O60A 1QOQA 2B7QA 1KM6A 4N4QA 3HGSA 5DY3A 5KITA 1XXXA 3CEPA 3GR7A 2ZRVA 3W7GA 1RV8A 3NZ1A 2FPTA 3G1FA 4JDYA 4JTJA 2FFCA 2YW4A 1RVGA 4UTWC 4WXZA 3CT7A 8TIMA 4LU0A 3IV3A 4UTIA 4PFMA 1XFBA 3D0CA 1FUYA 1SQ7A 3MI6A 2G97A 3M0ZA 3OEXA 2XN1A 3IVSA 1XBXA 3BLIA 3C8FA 3SGZA 2VC6A 4GUGA 3C2FA 3PUEA 2Q8ZA 1GJPA 1ZAHA 4LNYA 3W7QA 1YXYA 4EVZA 3MUXA 2X1RA 3ANYA 3T7VA 1H7PA 1TPEA 1T96A 1YPIA 4R53A 4DBDA 1PVNA 2ZZ3A 4ZL1A 2ZYFA 4HHPA 3W83A 1TTIA 4PODA 3S0CA 4LC6A 5G2HA 3W2LA 2ZTJA 4NQ1A 1JRCA 1Q3NA 1DQXA 4GUIA 3UYCA 4UIOA 2EPHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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