1JHBA

Human glutaredoxin in fully reduced form, nmr, 20 structures
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
AQEFVNCKIQPGKVVVFIKPTCPYCRRAQEILSQLPIKQGLLEFVDITATNHTNEIQDYLQQLTGARTVPRVFIGKDCIGGCSDLVSLQQSGELLTRLKQIGALQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The NMR solution structure of human glutaredoxin in the fully reduced form.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 29
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1jhbA00
2KOKA 2Z9SA 4WXTA 4MCUA 5DJLA 22GSA 3RHCA 4HJ2A 4QL7A 4IBPA 1HNCA 1B4QA 3KCMA 1QFNA 1XW6A 5G2ZA 1ZOFA 1EEJA 4OO4A 4BVXA 3UVTA 3LFLA 3P7XA 2JACA 1ZCPA 2QGVA 4WF4A 4HU7A 2ALBA 4FIWA 4MP4A 1U6TA 4K0NA 1WWJA 3GYKA 5J41A 1Z3EA 1ST9A 2YNXA 1QUWA 5LD0A 1OKTA 1XIYA 3QPMA 3ERGA 2GDRA 3TRPA 4FH8A 2GLRA 5ABRA 2AUVA 2GQKA 2F3MA 4MPGA 4KCEA 2JSZA 1JZOA 2HZEA 1EP7A 5HR0A 3F0IA 1VRSD 1PA3A 4K0GA 5J9CA 2GSTA 4IGJA 2GT5A 1WE0A 3ZL5A 3LEFA 3UMAA 4N10A 3WGEA 1SL2B 4OFTA 4ISDA 4MA9A 1SYXA 3GNJA 3KD0A 3IDVA 3F3RA 1GSSA 3CMIA 1ZGNA 1XVWA 4ZBDA 3L9SA 3D22A 5D9XA 3L9VA 1X5EA 2VOCA 5GAND 2F8AA 2ON5A 1Z9HA 3D5JA 4X0XA 2AJQB 1MEKA 5J3RA 5ENUA 4P3YB 1A2LA 2KHPA 3M3MA 2MYGA 4Q5RA 1GL8A 3P90A 1WOUA 2NDOA 2R6KA 3LGCA 2P0GA 2FWFA 3ZMLA 3WT2A 1GP1A 4KDXA 2K8VA 4RQRA 5EPFA 2GTUA 5D9VA 5F05A 3ZFBA 5HFKA 3TJJA 2IFQA 3HZ8A 3UVHA 3F4RA 1Z6NA 1GTUA 3VI7A 2H0GA 5FWGA 1R4WA 4IELA 4OFMA 1OC8A 3UL3A 2YN1A 4G9HA 2YV9A 2LQOA 4ZIJA 1F3AA 6GSWA 4WETA 1T4YA 4V2NA 1WMJA 2QSIA 2B1KA 3FR9A 3H4KA 4N30A 4CDOA 4MMMA 1JLWA 4RUVA 5HR2A 4GF0A 3EMXA 3CSJA 12GSA 3EC3A 1GUHA 3Q74A 4E8EA 1X9SB 1RK4A 4GQCA 3UARA 5F0GA 2H8LA 2LS5A 1GSFA 1EZKA 1JZWA 4ZILA 1J9BA 5G30A 1ERWA 3Q6OA 5HR3A 2VCTA 4XRAA 4V2LA 3RBTA 1MTCA 2GT6A 2MBSA 5J4UA 1TRSA 4GTUA 3H79A 2GGTA 4I6XA 3NOFA 1MDKA 3I69A 2A2SA 3IOSA 5IQYA 3TKSE 2PN8A 3GSSA 2LTKA 2B6MA 5AN1A 5JWRB 2CT6A 1BQ7A 3FZ4A 2O7KA 4EXJA 5HFIA 3CSHA 4GSSA 4MF6A 4Z7XA 2MBTA 2M80A 4TW5A 4O32A 3APSA 5C00A 2AAWA 1T7PB 2E7PA 4MJAA 2AV4A 2KP2A 2VCZA 1BAYA 3WGDA 1FO5A 4DSSB 2LRTA 2P5RA 2RIIA 2JL4A 3HVXA 4E8HA 2LJAA 3LJRA 3UAPA 5ECNB 3TRXA 1GRXA 2MMAA 4WBJA 3L78A 2CA8A 3HJOA 2YJ7A 4HQZA 2H1GA 2YWIA 2VAFA 1THOA 2ZNMA 4ECIA 1T4ZA 3GMFA 3QDNA 3RPPA 4QQ7A 2J9HA 4L0WA 1FOVA 1EEMA 5DCGA 2AHEA 3KIJA 1WJKA 1PD21 1AQWA 1FAAA 1SK0A 4K1FA 4ECCA 4I97A 2AB6A 1TI3A 5LCZA 3GFKA 6GSTA 1U88A 4XIHA 1OYJA 2HT9A 3UIWA 4K7IA 3BD2A 3TUEA 2VCWA 1OKDA 2R37A 4BWQA 2HI7A 1B9XC 1PKWA 1V2AA 1RW1A 4HUAA 4O7HA 3MWHA 3ZIVA 4OD7A 1DSBA 1S3DA 2K18A 4I2TA 1PX7A 2H1AA 3FY7A 1GWCA 5E59A 1TRWA 1AW9A 3APQA 4POBA 5A4WA 2ES7A 4IJ3A 2XPEA 3SBCA 2FD3A 5AIXA 3DEXA 2H71A 4OO5A 5DALA 3LXTA 2FA4A 4HEA2 4NXIA 1XW5A 3GHAA 2N5BA 4ML6A 1K3OA 3VK9A 2ON7A 3M8NA 2TIRA 2E2MA 2JZTA 4L0UA 2DJ1A 1B9YC 1OE8A 1F2EA 4V1Ap 5DDLA 1K0AA 2HSHA 4J57E 1A0FA 2DJKA 3VLNA 5DVBA 4YQUA 2WB9A 2DJ3A 1TW9A 3HJMA 4HDEA 4ACSA 1Y6EA 1B8XA 1KEBA 5COHA 5IO0A 5B6NA 1NHYA 2HRNA 5ELGA 3Q18A 3IK9A 2C0GA 3ED3A 4YH2A 1G6YA 1TXXA 4DSQA 3IHQA 2XBIA 3IC4A 1S3CA 4TR1A 3VWWA 2C0FA 2PBJA 1B4PA 2WZ9A 3ERFA 2CVBA 4XS1A 2FUG2 4KA0A 2L5OA 1O7UA 1UVZA 4EKZA 3KH9A 3J7Yb 1PKZA 3G7YA 5ECRB 4OFNA 1FW1A 1ZL9A 4EE0A 4IP1A 3CTGA 3L0HA 1I9DA 4NV5A 1M0UA 3JCML 1JZRA 1EOGA 4MZBA 3F9UA 2XHFA 3HKRA 4HJMA 3CSIA 2PU9C 5IMVA 4AGSA 5G31A 3DXBA 4WR5A 5GZZB 5GSTA 1OC3A 1H75A 2V2GA 4JEDA 4RI7A 2NTOA 3IPZA 1OVNA 1I5GA 2JZRA 3HVSA 3QAWA 2R5GA 3DD3A 4TXVA 3NIVA 2PVQA 2X8CA 1YKAA 3HHVA 4TR3A 2IMFA 1YDKA 2CQ9A 1GSQA 3QMXA 1EP8A 2L57A 3GSTA 4IQ1A 4YAVA 1HQOA 2YZUA 1F37A 5L71A 4GSNA 4AJ6A 1O6JA 2L4CA 2YWNA 4EC0A 3F3QA 3KP9A 3LYKA 4EDZA 2DSAA 1ZMAA 1V9WA 2LUSA 2V6OA 14GSA 2L6DA 1YEXA 2CV4A 3QCPA 5KEJA 4ECBA 5B6MA 1G7EA 3GL5A 2B1LA 3H1NA 4MH2A 4YQMA 1V98A 1BEDA 5CYYA 5F06A 1SL0B 3F4TA 4KE3A 4LA1A 1TU8A 4PNFA 1J0FA 3IE3A 5CP1A 1OE7A 5IPHA 2XBQA 1M2AA 3GKNA 2HE3A 1O85A 4MF5A 3ZRDA 1SJZA 2B3SA 4HQSA 4TOPA 2WCIA 1GSUA 4MJEA 5ECPB 1B48A 1Z7PA 4TXOB 2OE1A 1XWKA 4I5QA 4XCSA 2H72A 3KJYA 2FWHA 1GULA 2WDUA 3GIXA 4YAPA 1CQHA 2KUCA 2LSTA 2O89A 3U5RE 3ZTLA 5AIVA 3WT1A 4NHWA 5A4UA 3VPQA 2CZ2A 4MK3A 3GKXA 2JZSA 2BMXA 1HNAA 2GZYA 1HD2A 4IW9A 4I2UA 4K2DA 1GSEA 2HFDA 5JWQB 3A2WA 3E9JB 1ERVA 4TR4A 1HYUA 1QK8A 4TN8A 1M9AA 1U3IA 1XFLA 3GURA 2N5FA 2RM6A 1AXDA 2WS2A 3HZ4A 2PMTA 1V57A 4ZL8A 4NWYA 3FK8A 4ZL7A 1GH2A 1GSDA 4G2EA 4X1UA 2OA7A 1VF4A 2FA8A 4NAXA 4XHMA 1N8JA 3BOAA 3O6TA 5IM9A 2VUPA 1URMA 2H76A 1SD8A 2DIZA 4N0VA 5HFGA 3DYRA 3M9KA 3V1WA 2I81A 2GQLA 5DQYA 2HRFA 2CX4A 1GNWA 5J9BA 1MDJA 3C1SA 3H8QA 3KGKA 5IMCA 4KSOA 2RUEA 4FYCA 2OJLA 1YJ6A 5CRGA 2H1DA 4ZBAA 4JBBA 4ML1A 1W4VA 1OC9B 4MF7A 1PGTA 1K0CA 1QXHA 4JZQA 1XXUA 5D93A 1XWCA 3VURA 19GSA 3LORA 2CVKA 5GSSA 1O73A 2IWTA 5ECQB 1FG4A 4MPFA 3LWAA 1AIUA 2D2ZA 4DSSA 3UBKA 4EO3A 1BG5A 2FLSA 4IHUA 5JCGA 4KCAA 4POLA 4YQVA 5E4WA 2H1BA 2VD1A 2IMIA 4N0ZA 3EWLA 1O8XA 3VWVA 1YEPA 1Z6MA 5LNKe 5INYA 4RI6A 3PR8A 1EWXA 3LQ7A 1SYRA 3IBHA 2V6KA 3UOMA 2YPMA 4KDYA 2MMZA 2R4VA 4GLTA 3GH6A 2VCVA 3EYTA 3EU4A 5D8IA 1A23A 4KAEA 4KDUA 4IKHA 4LMVA 2PGTA 2OE0A 1WPIA 1J08A 5D9WA 3AY8A 2K8SA 4PQIA 3A2VA 1TK5B 5AGYA 2OACA 4H86A 4F03A 5DAKB 1X5CA 1Q4JA 1X9WB 2FHEA 2OBIA 3U6VA 2H74A 1XWAA 4ZB8A 2F51A 4LL4B 2PERA 3ZMKA 4IP6A 2EC4A 4MLYA 1X9MB 4ZL9A 5ECHB 4XTSA 3DVWA 5DJMA 3GX8A 5CRWA 1GNEA 3US3A 4L5OA 2VLUA 1ACVA 3A2XA 4F0CA 1M9BA 3I43A 4QL9A 1PMTA 2EIQA 2YV7A 3IXRA 1XBSA 1HNBA 4F0BA 4TVEA 2WULA 1T8EB 1PL2A 2IMKA 1A8LA 1TK8B 3ZITA 2FNOA 3ZREA 2HNLA 3ZVJD 1E6BA 1CQGA 5IMAA 1SK1A 3MSZA 1K0OA 3GN3A 1NHOA 2P5QA 2H73A 3QD9A 1ZYQB 3F6FA 1M2DA 1Y25A 4CHSA 2IN3A 4IN0A 3N5OA 2H0HA 2CAQA 3TCOA 3ZZXA 4GXZA 1R26A 4L8EA 2AYTA 4FO5A 2H75A 1YY7A 7GSSA 4MJBA 1X0RA 3DVXA 3FW2A 2BJXA 1A2MA 4KSMA 1EOHA 1LJRA 3KM6A 3M9JA 4MH3A 2JADA 3GX0A 3IV4A 4HS1A 2C4JA 2HZFA 3DGQA 1NSWA 2A2RA 4ZXGA 3BCIA 2R2JA 3A5WA 4XRDA 2OBKA 1GSYA 2HSYA 3FEUA 3TJFA 1FHEA 3W6GA 2FWEA 3EMPA 1FVKA 4FYBA 5IMDA 2K6VA 1MDIA 2LKUA 2TRCP 4PGTA 3EE2A 2EIRA 1DE1A 1FB0A 3IAS2 1GLQA 2H30A 3TJGA 5IOXA 1F9MA 5DQSA 2QKEA 4POKA 3QFBC 2LQQA 2HYXA 4OCEA 3KEBA 2H01A 5ECMB 1BX9A 4X43A 4D73B 1ON4A 1VF2A 4K8MA 2PVOC 1ZYEA 2VIMA 4ID0A 3LYPA 2C3QA 3GKMA 2B5YA 5G5EA 4J2FA 2GSSA 3WGXA 17GSA 2OKAA 1K3LA 4PUAA 20GSA 1GUKA 2C0DA 2IJYA 2ZUPA 2VLTA 2E2GA 3ME8A 1DBYA 3F6DA 4JU5A 3KMNA 4EUYA 4PX1A 1FB6A 3K8NA 4PNGA 5HR1A 1YQ1A 4G10A 2DJJA 1TKDB 1ZZYA 4O92A 2BTOT 4BVYA 4HZ2A 1T3BA 3FZ5A 3BCKA 6GSXA 1M99A 1EGRA 1SKWB 2LEGA 1NM3A 3QAGA 4HI7A 1YKCA 1A24A 5ID2B 4LMWA 2YZHA 5EVOA 2M72A 2FGXA 3BJ5A 4TXOA 1SD9A 2DBCA 3DMLA 3TKRA 1TJDA 1SU9A 1X5DA 1BYEA 2C80A 4KH7A 1YF0A 3DRNA 2OE3A 5EL8A 3HYPA 2JSYA 2GSRA 3EURA 3FHKA 5H5QA 4DEJA 1IYIA 1SENA 2B5EA 2IMDA 3ME7A 2LNTA 5DCHA 2WRTA 3HJPA 1AAZA 4I8BA 1WP0A 1IYHA 4XS6A 2H6ZA 3KXOA 1S3AA 3C8EA 1V40A 3UJ1A 2YOIA 4TRXA 3QR6A 2V32A 3GRXA 4ECJA 4WBRD 2IL3A 3HVVA 1TK0B 3F8UA 2WGRA 16GSA 1LBKA 2JU5A 3P8WA 3EU3A 3GTUB 1GTIA 2L59A 1SJIA 2XPDA 1DE2A 4FYUA 5ELAA 2L4QA 1TU7A 5IIZA 4WF5A 1GTAA 4BL7A 2B7JA 2V1MA 1W89A 2G0FA 1A8YA 4IVFA 3QOUA 4WKWA 3Q19A 3KP8A 1N2AA 2REMA 1XWBA 3D0ZA 3FZ9A 1MD3A 2VL3A 2VO4A 4GRFA 3O76A 1EGOA 2LRCA 2NBSA 2DIYA 4XS4B 2RLIA 2VD0A 2VL9A 2C8UA 5IPGA 4NV2A 5F8BA 1DUGA 2HLSA 2F8FA 4L5LA 3TOUA 4MJCA 2H66A 3TOTA 3UBLA 3S9FA 5B7CA 2H6YA 2L6CA 3G7JA 1OC9A 1UN2A 3KTBA 3D4TA 2B7KA 1GUMA 1M2BA 4KNDA 4BPYA 4JR6A 4WR4A 2C0EA 3N9JA 4EL1A 13GSA 2KLXA 4K9ZA 1XWGA 4V2MA 1UA5A 1JLVA 4HOJA 3G7IA 3CBUA 4JRRA 3G9BA 1ERUA 2KP1A 1O81A 2ZCTA 3WYWA 3DIEA 4MDCA 3TJKA 4EDYA 4IQAA 1OAZA 5FHIA 3D6IA 2YJHA 4GSTA 4K7OA 4HZ4A 2DJ2A 1AQVA 3HD5A 1TTZA 3VWUA 4Q5NA 1QQ2A 2X8HA 1SL1B 1R5AA 4N11A 4LLRA 1T1VA 4EF0A 5C04A 2PPTA 3E0UA 1LU4A 2YP6A 3KTLA 1E2YA 4TKYA 3GV1A 3CYNA 3TKSC 3VFIA 2A4VA 3GUSA 2QC7A 4K6XA 1EV4A 6GSSA 3IRAA 1PL1A 3MAKA 1PN9A 1ERTA 5CREA 5DAKA 2K9FA 2MMNA 1R7HA 2DMLA 2WFCA 1ILOA 2C3TA 5IMZA 1QGVA 1NW2A 2IIYA 2YANA 4MZWA 2V41A 2P31A 3FR6A 1KNGA 1PQNA 5A4VA 3GL3A 4PQHA 2CX3A 1PSQA 2HZEB 2VCQA 5G5FA 1VF1A 4F2IA 4PUFC 2DC5A 1A0RP 1PX6A 2LJKA 2YWMA 4K7NA 4PXOA 5A5KA 2O8VB 2PUKC 1K0NA 3J7Yk 1KTEA 1EV9A 4ZBBA 1H4OA 2VCXA 1AUCA 5B8BA 4WEYA 5FT3A 3GH9A 3RDWA 2VL2C 2GQMA 3ZIJA 3FKFA 4O5RA 2J23A 2X64A 5D96A 2WJUA 5CAXA 4Q5FA 1VF3A 2O87A 5IOWA 3I9V2 4KB3A 2GSQA 5KN2A 4GWRA 3GA4A 1RQMA 5ECIB 3RAZA 2NPBA 2TRXA 1MD4A 5ECLB 2I9HA 3ISOA 1YF1A 2MMOA 5CRHA 2L5LA 4PQ1A 1C72A 4ZB6A 3C73A 2GZZA 3L4NA 2H19A 2FY6A 2E0QA 1JFUA 3E3EA 4F9ZA 4IJIA 2IFQB 3KZQA 3HY2A 2FWGA 3TDGA 3CRTA 3W8SA 8GSSA 2C1YA 3O3TA 3TKPA 2RUFA 4POMA 5DBQA 3MDKA 11GSA 4KW6A 3APOA 4OWYA 3EVIA 1VGLA 3TB2A 5CO3A 3KH7A 1TP9A 5IMFA 3TJBA 1XOAA 3FR3A 4GCIA 3L9UA 5H5SA 3TKQA 1K0BA 3SWLA 4BWSA 1TRVA 2RM5A 1SJ6A 3WD6A 4GQFA 3TKSA 5G1LA 4JE1A 2N5AA 2VLVA 5ECKB 4D73A 1TOFA 3VI5A 3VPTA 3ZLPA 1G0TA 1XZOA 2X8GA 6GSUA 1K3YA 3ZYWA 1YZXA 3R2QA 3FYGA 3QAVA 3DKSA 4ILFA 3HA9A 4V1Ag 3P2AA 2X99A 5KN0A 3D4MA 4NMUA 9GSSA 1Q98A 4EVMA 1K0MA 2LV3A 2CAIA 3MNGA 1O8WA 1XPVA 5CNWA 5HQPA 3FZAA 1SKSB 4F82A 4OMVA 4LL1B 1A2JA 5KN1A 4DVCA 4AJ8A 5G1KA 5ECSA 1WRYA 2H6XA 3LSZA 5ID2A 1XW9A 2OADA 3ZFLA 3PH9A 10GSA 1XOBA 2EIOA 5B8AA 5JCWA 5IO2A 2CVDA 1BJXA 1AC1A 4ULXA 2VL2A 3C1RA 3CRUA 1WIKA 1TRUA 2GVPA 3PGTA 1SK2A 1U87A 4G19A 1JZDA 1ABAA 1K0DA 4KUNA 3TGZA 1GTBA 4DSRA 2C3NA 1GLPA 5KN3A 3HXSA 3TRQA 4PURA 2F9SA 3F63A 4MABA 3EINA 1M7TA 3C7MA 3M1GA 3RHBA 4J56E 1Z7RA 3HCZA 4RQXA 3IA1A 3LG6A 4AJ7A 4BA7A 6GSYA 1U3AA 2DLXA 4IS0A 3OR5A 3CXGA 2NVLA 5CRDA 3IAM2 2B5XA 1G6WA 5GAPD 4ZB9A 4Q5QA 2H0IA 3GTUA 2I1UA 1V58A 1THXA 3KMOA 4NHZA 4NPBA 2IMEA 4AF2A 4TR0A 3C71A 5JCUA 2M46A 1SKRB 4OCFA 1TI1A 1AQXA 2DMMA 2I4AA 2VM2A 3H93A 2I3YA 1TDIA 2LNSA 3BBYA 3GKKA 3F4SA 5H5RA 3UEMA 1PRXA 2XC2A 3LXZA 6GSVA 5DALB 2DJ0A 4JR4A 1R5PA 2PWJA 3D21A 2VM1A 4XS4A 2H70A 3HDCA 3M0FA 4KX4A 1F6MC 1F3BA 1JHBA 5JWOB 18GSA 3QFAC 1FVJA 3ZVJA 2FCHA 5AISA 5J5NA 1G7OA 1Z5YE 1ML6A 5ECOB 1T00A 3CTFA 2YWOA 2MZCA 4HU9A 1XVQA 4CW9A 2G2QA 3DWVA 3A3TA 3FRCA 5F07A 1XCCA 2IPAA 2LRNA 5D9TA 3PINA 3IK7A 3RPNA 3W8JA 2CZ3A 3VWXA 1USBA 3I6AA 1QMVA 1UC7A 3NZNA 1KBNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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