1JNFA

Rabbit serum transferrin at 2.6 a resolution.
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
EKTVRWCAVNDHEASKCANFRDSMKKVLPEDGPRIICVKKASYLDCIKAIAAHEADAVTLDAGLVHEAGLTPNNLKPVVAEFYGSKENPKTFYYAVALVKKGSNFQLNELQGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLLCDLPEPRKPLEKAVASFFSGSCVPCADGADFPQLCQLCPGCGCSSVQPYFGYSGAFKCLKDGLGDVAFVKQETIFENLPSKDERDQYELLCLDNTRKPVDEYEQCHLARVPSHAVVARSVDGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSGDFQLFSSPHGKNLLFKDSAYGFFKVPPRMDANLYLGYEYVTAVRNLREGICPDPLQDECKAVKWCALGHHERLKCDEWSVTSGGLIECESAETPEDCIAKIMNGEADAMSLDGGYVYIAGQCGLVPVLAENYESTDCKKAPEEGYLSVAVVKKSNPDINWNNLEGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNRINHCRFDEFFRQGCAPGSQKNSSLCELCVGPSVCAPNNREGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKSQTVLQNTGGRNSEPWAKDLKEEDFELLCLDGTRKPVSEAHNCHLAKAPNHAVVSRKDKAACVKQKLLDLQVEFGNTVADCSSKFCMFHSKTKDLLFRDDTKCLVDLRGKNTYEKYLGADYIKAVSNLRKCSTSRLLEACTFHKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal and molecular structures of diferric porcine and rabbit serum transferrins at resolutions of 2.15 and 2.60 A, respectively.
pubmed doi rcsb
molecule keywords serotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 219
structure length 674
sequence length 674
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA03
1LB9A 3T93B 3PD9A 3T9XB 5KDTA 2QS4A 4KI0E 4PP0A 5H8HA 4QRZA 3TTLA 3D4CA 3HN0A 1QVSA 4U1OA 2YPNA 5DVJA 1TWYA 2PT2A 3MPLA 1MPCA 1MY4A 5DTBA 3HV1A 3T9HB 1MM6A 3PPRA 2ALUA 2NOOA 3L6GA 4YZZA 4QHQA 4G68A 3CRBA 1NH8A 3KOSA 3THIA 1OVBA 5DVFA 5M2VA 1B40A 1UTHB 2O7UA 1ZKBA 2P0SA 2I3WA 1AMFA 3HPIA 1H43A 5I84A 4RXLA 3RTFB 1BKAA 3IJXB 1QJMA 2XXQA 3IK6B 2R6GE 4TLMB 4F3PA 2A5TB 2GRVA 4KCCA 4GD5A 3C35A 1LLSA 3DP8A 5CMMA 4R2BA 1B5JA 3ZKKA 1MY1A 2F5XA 1MQDA 2V3TA 3FVOA 4H8JA 1SW5A 1PB9A 3CG1A 2Z8DA 1URSA 2VD3A 4DIGA 5I56A 1LFHA 2IA4A 4THIA 5I59B 1A7LA 4EF2A 1LGBC 3MP6A 4UACA 5K2YA 3PV0E 1B3GA 3LSWA 3G3JA 1Q35A 4G8HA 3PUYE 4DDDA 2XD2A 3IORA 1A40A 4R75A 3EPEA 3EF7A 2QS3A 3W9WA 3DP4A 4ELOA 1B2HA 2OCUA 2DE3A 3UGWA 4JDFA 1FTLA 5H8NA 3MZ1A 2UVJA 3FASA 3DP6A 2RKMA 4GL0A 3L6HA 3OMBA 4NF4A 3IO4A 1IXHA 1JEUA 1XHYA 4YB6A 4NF6A 3H7MA 3M8UA 4OEUA 5ISUA 3PUVE 2X26A 3KFMA 4F29A 1FCKA 2QS2A 5AA2B 2LAOA 1B3EA 4JWYA 1B52A 4ISUA 3U8QA 3I3VA 4ZZAA 4H67A 1SW2A 1R1NA 4YKPA 1Y3QA 5CMKA 2AIXA 3T96B 2F34A 2Z8EA 3IR1A 1Y1ZA 4M4GA 1VSOA 1SI0A 3IOWA 4KYEA 3FD3A 4GF8A 1FQAA 3PU5A 2DWIA 1PEBA 1M5EA 4OWDA 1UTBA 2O51A 4U4SA 3QAXA 3IX1A 1SW4A 3PPQA 3RLFE 4DXBA 5KDTB 1TFDA 4F1YA 5H8HB 3K0VA 4EDPA 3GLBA 3VLUA 2RINA 1USYE 2Q9TA 4R6YA 1Y9UA 3C32A 1XOCA 1JW5A 1VE4A 3O28A 5IAIA 1RYOA 1D9YA 2ESNA 3OELA 4LP2B 5H8FA 1XVYA 1OQGA 3T9VA 4JXIA 3GXAA 3CVGA 2Z23A 1IXIA 4QFKA 3VFJA 5I2KA 5HBCA 1A8FA 2ZYKA 4H6DA 1EZOA 1MG1A 3U72A 1A54A 4QFPA 3N6TA 4Q30B 3G3IA 3FJ7A 4G2ZA 2FNCA 3TKDA 2W7YA 2DWAA 3IB1A 3H6VA 3T9UA 5L8DA 4TQUQ 1MM7A 3KEIA 4KHZE 5F7VA 4R9GA 5HPQA 5CM6A 2PBWA 3TEPA 4XKRA 3O2AA 1QUKA 4ND9A 4H5GA 2UVHA 3HO7A 4XTCQ 3FXRA 4AB6A 3CIJA 1IUDA 4GL8A 1B3FA 1MRPA 3FZVA 1JQFA 4ECFA 3FUZA 4OFLA 3CFXA 3N6UA 5I56B 1TFAA 1FTJA 1Z7NE 1N76A 4KQPA 2DYXA 4YKJA 1Y3PA 3SEWA 2Y7KA 3Q25A 3FV1A 2XXXA 4R74A 4F19A 2DQVA 2VD2A 2Y7WA 2YJPA 3HCQA 4HCWA 4JWOA 1S7YA 3MBPA 4F1UA 5KCJA 3HHFA 4R6HA 2V93A 3FVKA 3R6UA 1P99A 4OESA 4F18A 3R26A 3EQ1A 3C4MA 2D21A 3KG2A 1QKAA 4ZE8A 4WEDA 1B1XA 4RYAA 4GVOA 3TCHA 5L9SA 3TTNA 1J1NA 1DPPA 3MW0A 2XXIA 4QFLA 4GFRA 1GVCA 3K01A 4PFUA 2OWTA 4DLDA 4C0RA 4DZ1A 5AA1A 2XXYA 3W15C 1MH4A 4TOZA 4IO7A 5HM4B 3A3CA 4NF5B 3K6VA 1OLAA 4I62A 4NF8A 1A99A 5CBRA 4JBZA 3K00A 1LFGA 3RN8A 2DE2A 2OLBA 3K6UA 1LAHE 1A8EA 1UTBB 4KFQA 1VFEA 2P1SA 1MDQA 4IO5A 1SBPA 4NWCA 2Z22A 2QMXA 3N5LA 2Y7IA 4ELQA 3IO6A 3MUQA 2HZKA 2HCAA 4MF3A 1DPEA 2RF1A 4WXJA 5FTIA 2THIA 1WDNA 1GR2A 3QYTA 4BDOA 3MZ9A 5DT6A 5H8FB 3TELA 3Q26A 4R9FA 2R9JA 5JTYA 1LCFA 2DVCA 2XXRA 4IY6A 3GBBA 2ABHA 3UORA 2HXWA 2QPQA 4OHNA 5I2KB 4EXLA 2NXOA 4BDQA 1Q1KA 1B3LA 3OXNA 4OERA 2Y7RA 5DEXB 1B5HA 2I3VA 4BLAA 3EHSA 1TXFA 3AXFA 3K6XA 4BDMA 1D4NA 1NNFA 1B46A 4RK2A 4P11A 1IQ7A 1MXVA 1POY1 4FEDA 1Y4CA 1IXGA 5I2NA 1T0KA 2AL5A 2HZLA 1WVJA 1I6QA 3RGYA 3VVEA 3P7IA 3PUZE 2KLFA 2HQ0A 2Y84A 5CRYA 3V5AA 4C1UA 4JSDA 3T22A 2PVUA 1PDAA 4ZZEA 2XXPA 2XXUA 2F97A 4EQ7A 1ZMGA 3K2DA 3M3KA 3G3KA 3H6TA 4E0WA 4F39A 4GWOA 4U21A 3H4ZA 1YPNA 3TODA 3TPAA 3S9LC 1UIVA 2I0BA 5KCJB 3O9PA 3ZS6A 1NH7A 1MXWA 4LA9A 2H99A 5IKBA 5H8SA 2YLNA 1SYIA 3DELB 2O6AA 3ILUB 2DP8A 2D5WA 3S9NC 1MQHA 4FE8A 3HHGA 4BDRA 2X7PA 3EHTA 3RT8A 2HAUA 4DXCA 3PUXE 4U1ZA 4EUOA 4IO4A 4LZ8A 4XKQA 4FECA 1MQJA 4WEPA 5I57A 1MXZA 4NTLA 4F2OA 2DE4A 2IEEA 3K4UA 1N3XA 2UVIA 2ZNSA 3OSRA 3TQWA 4H0WA 4Z7EA 1LCTA 2OBGA 3FJGA 1M5DA 3A09A 4TLLB 1B0HA 4NF8B 2RCBA 3Q27A 2AL4A 3KGCA 4XXUA 3MZBA 2Q88A 3OENA 2V84A 4OEVA 4P0IA 2UVGA 4R6KA 3FVGA 4U2RA 4FAJA 1M5FA 4NWDA 4RPNA 5FHNA 1EZ9A 1D3KA 4ESXA 3QSLA 4KD5A 4MH5A 2AYSA 2CMOA 4PFTA 1BIYA 3FJMA 3OO7A 3KN8A 2UXAA 4IGTA 5TPAA 2V3UA 2NWJA 4X1DA 3MVWA 3U92A 2VOZA 2FA7A 4PETA 5ICTA 1B4HA 4QFOA 1MXUA 1MXYA 3PUWE 2REJA 3Q29A 1MH3A 3O6GA 1Y1MA 4R73A 4DE8A 4NMYA 5CC2A 3SEVA 1QKBA 3TMGA 4C1TA 3B6WA 3IJOB 2F36A 3USDA 1A55A 3S4UA 2DXRA 4GOTA 3PMWA 3MAMA 4QFNA 2XX7A 3CR9A 3OEKA 5B7DA 2I6EA 3MPKA 2PMSA 3ZKLA 4RA1A 3LSLA 1B32A 1WODA 3QUJA 4BDLA 3W9VA 3KJTA 1B5IA 1LBCA 1NMUA 4U4XA 4X1BA 3C36A 2XXWA 2O1LA 2XXTA 1YAEA 1PBPA 3MWBA 4G68B 5FTHA 1ZBMA 3KN7A 1H44A 5CI5A 1P1NA 3IOTA 1I6AA 1RYXA 3PD8A 5FHOA 5L9OA 1LFIA 3MVXA 4EQBA 3OO9A 3VDFA 2GHBA 3O29A 1N7WA 4F3GA 3LBSA 4GRKA 3IOVA 3R7XA 2R71A 3PGFA 5K2XA 3E13X 4G8NA 4F22A 3ZSFA 5AA4A 5H8QA 4RJZA 3K1MA 3C34A 1FQBA 2H9BA 4Q5TA 2NUVA 1NL5A 4F3BA 3S2VA 2VP1A 4GQOA 4ZEBA 5TU0A 1EH3A 2M8CA 2BJJX 5AA3A 4I1DA 1BTJA 4XIGQ 2H98A 1LAGE 2O7IA 3LUYA 3MC2A 2VHAA 1B3HA 3LSXA 5I58A 2I58A 3QXMA 1D9VA 1R9LA 1F9BA 1LB8A 4IY5A 4WKMA 3V83A 1KWHA 3FXUA 3S9MC 4OMBA 2B3FA 2PYYA 1UTHA 3B6QA 4MLVA 1R6ZA 2O68A 1NNPA 2B3BA 1URDA 2ZXTA 1ATGA 4ZS9A 3I6VA 5DYHA 3DM0A 1FQDA 4DXUA 1B7ZA 1DSNA 5H8NB 4NEDA 1GTKA 2FYIA 1B9JA 4DCXA 1MQGA 3IL1B 3SERA 1PBQA 3MVZA 1ANFA 1AOVA 2XX8A 3SETA 1N7XA 4NF4B 1DOTA 2XXVA 1CE2A 1HSJA 2Y7PA 1O64A 1B51A 4NF6B 4YAHX 3SKPA 2Q2CA 3TQLA 1N0TA 5L9MA 2GHAA 4R72A 3RTWB 2O84X 3TYHA 5TPAB 4U23A 4LATA 1MS7A 1H76A 3B6TA 3KSXA 5EYFA 3TCGA 4I8CA 1OLCA 5EHMA 4H5FA 3SEYA 5I59A 1IITA 1JVXA 4HS7A 3Q28A 4Q8RA 1B58A 2XHDA 1I69A 4LUBA 4KCDA 2HFBA 4IGRA 3VXCA 4U22A 4AB5A 1ELJA 3DLNA 1US5A 4O3CA 4MBPA 3WAFA 3E9XA 3OSQA 3TUSA 2ONKE 2O1MA 2ZYNA 4ZEKA 2ONSA 2QRYA 1TT1A 1EZPA 3TTMA 3K1PA 3MJNA 1H3DA 1B1HA 1USYH 2V3QA 1RKMA 2I48A 4NE4A 3H06B 3FVNA 2F6GA 4JSOA 1O63A 3G3HA 2HEUA 3G3FA 4GXSB 3CFZA 1PB8A 4N13A 3F11A 5AA2A 3RT6B 1POTA 4XKNA 3KJ7A 5ELVA 4HTGA 1HSEA 2DXYA 4OFOA 1BLFA 2Q2AA 5TP9A 4FEBA 1FTMA 4YB5A 1XVXA 5BUUA 4QF9A 4LZ7A 1UQWA 2F7BA 1HSLA 1OMPA 2UYFA 3BBRA 5AA4B 5H8QB 1MY0A 5CMCA 1NNKA 1JW4A 1XC1A 3GZGA 4FORA 4N6PA 3C33A 1YCJA 4MFIA 1SDXA 4PFWA 3WAEA 3EHUA 4F31B 2I0CA 3HSTA 4DCYA 3SEUA 4FATA 4MLQA 1IXCA 5FHMA 1OIBA 2OZZA 4OQOA 4KPTA 5I58B 1MPDA 2NVUB 2GH9A 3CSGA 3VV5A 4FJPA 4N07A 2OWSA 1ZLQA 3FIRA 4GIZA 1P1WA 4YKIA 3LC8A 2Q89A 3IB2A 1DTGA 3KSJA 4G8MA 3N26A 3SEXA 1MXXA 1N84A 4YB7A 4EF1A 1IEJA 4ESWA 4PE5B 3BKIB 2VGQA 3MP1A 1MQIA 1I6BA 4IO6A 2OJTA 1NKXA 2DVZA 1VR5A 1FQFA 2X7QA 2ZYOA 1VFDA 1Z7ME 2F7CA 1QUJA 1B7HA 3ILTB 2QJEA 4RPOA 4ZECA 2ZMBA 4LQ5A 3V89B 2QSXA 1AL3A 2XD3A 1SVXB 3LR1A 3K1NA 4RK9A 3VLWA 3QUFA 1DMBA 1US4A 3O97A 3MP8A 3GBAA 3FGSA 4POWA 3KN3A 3O66A 3S9EA 4X9TA 4ZDMA 4JWXA 3PMXA 3RNNA 3RY3A 5CMBA 1O7TA 4GLIA 4IO3A 1IIWA 2DOJA 1SI1A 2DS9A 4HW8A 3EN3A 4R2FA 1N04A 4OFJA 4F1VA 4P0GA 4YMAA 4OXVA 4LZ5A 5A5XA 4ONYA 4ELRA 1B0LA 3G7WA 1LAFE 3SDFA 1ZU0A 3U1OA 3VVDA 1BP5A 4EXKA 1UIUA 2G93A 5JTYB 3T66A 3PPPA 2G29A 4X48A 3G3GA 2ZYMA 3VXBA 2H5YA 4ZEDA 2OK2A 4O3AA 2RCAA 1XS5A 4YU0A 2DWHA 2HAVA 1P1UA 1Y4TA 3OEMA 5TP9B 4NF5A 3O6IA 3UIFA 3VE1B 3PMVA 2F7AA 1MY2A 2Q8JA 4Z0IA 4IO2A 4OETA 4KYSA 2QMWA 1M5BA 1B05A 5I2NB 1M5CA 3UK4A 2XX9A 1FQEA 5DVIA 3RUMA 1Y3NA 3TTRA 3K6WA 1PC3A 3TAJA 3UP9A 5JEIA 4RY1A 4F3SA 1FQCA 4H65A 4H1XA 4PFYA 4BDNA 3UN6A 3QK6A 2F8DA 4ZE9A 4OYVA 4LONB 4QSEA 3OO8A 2WKYA 2CZLA 3OOAA 3IB0A 2D3IA 3CI8A 3JZJA 1S9TA 3ECRA 1SYHA 5ITOA 3C31A 1SQYA 5J1DA 1EU8A 1JNFA 5F1QA 2H25A 1DTZA 1JW1A 5DEXA 3D4GA 4F2QA 1GV8A 3PPOA 2RC9A 1OVTA 4EQ9A 3TDJA 2F35A 3KBRA 3TFLA 1GGGA 2F78A 1B7UA 1URGA 4KR5A 3H6UA 3UA8A 3K02A 4POXA 4FIMA 4IB2A 3SESA 1PB7A 1MDP1 1SW1A 3U94A 1II5A 3BFUA 3JYRA 3I5OA 1R9QA 2B65A 1OQHA 2E0SA 3BFTA 5I57B 2QL3A 2ANJA 3TTKA 3LSFB 3VLVA 1MY3A 5LOMA 4O3BA 1MPBA 5KZTA 1NNTA 3CFLA 1QUIA 2RC8A 3O6HA 4RNSA 1FTKA 2A5SA 2E1SA 3H6WA 3PPNA 5EHSA 3C9HA 2F6PA 4QSDA 4QSCA 4LVQA 2I49A 1P1OA 2O69A 2H4IA 4H8IA 5ITPA 2GFEA 3M3FA 4GXAA 3MVYA 4JB7A 1XT8A 4Q0CA 4ZEFA 2A5TA 1N3WA 5AE4A 3JV9A 4OTEA 3V8XB 3VVFA 5BWJA 1JEVA 3OD7A 1CB6A 4E0XA 5A5XB 4LQ2A 4L17A 2PT1A 1Y20A 1SD3A 3KOTA 3A3UA 3TCFA 2RC7A 2I4CA 3RPWA 2UYEA 3MQ9A 4M1VA 2DWJA 1NFTA 4YMBA 1ZIUA 2ZNUA 2ONRA 4YKKA 1H45A 1ZJLA 4K3FA 3KZGA 3H03A 3TZAA 1AH5A 1AIVA 3ONMA 2REGA 3ODBA 4I9DA 2XXHA 4G77A 4KYDA 3E4RA 3U93A 1QW0A 3IOUA 5B70A 1ZTYA 4AQ4A 1B4ZA 4G4PA 5JK4A 3FXQA 4OVJA 5CBSA 1JVYA 3H3GA 3N94A 2V25A 1L5TA 4ELPA 4OENA 4G68C 3QIMA 1FTOA 1LSTA 2P2AA 1LAXA 1S50A 3FATA 1YTVA 4XKPA 3CG3A 2Z8FA 1P1QA 3E3KA 1IZ1A 3B7DA 4OZ9A 2I4BA 1B6HA 2PX1A 3IAZA 4ZEIA 4PQJA 4HCYA 4UA8A 1LBBA 5ICQA 4YICA 1JETA 3FV2A 5AA2D 3M3LA 3CSBA 2DSFA 1QULA 3RQTA 2ZNTA 3OO6A 2QS1A 1FW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LB9A 4QBAA 3T93B 3PD9A 4P1EA 5I5PA 4PBQA 3T9XB 3LV0A 5KDTA 2QS4A 4KI0E 4PP0A 5H8HA 4QRZA 4O7IA 3TTLA 5T3JA 3D4CA 3HN0A 1QVSA 4U1OA 2YPNA 5DVJA 1TWYA 4X04A 2PT2A 3MPLA 2XWVA 1MPCA 1MY4A 5DTBA 3HV1A 3T9HB 1MM6A 3PPRA 2ALUA 2NOOA 3L6GA 4YZZA 4QHQA 4G68A 3CRBA 4OVRA 1NH8A 3KOSA 1FPDA 3THIA 1BK4A 1OVBA 5DVFA 5M2VA 1B40A 1UTHB 5LDZA 2O7UA 1ZKBA 2FBPA 2P0SA 2I3WA 1AMFA 3HPIA 1H43A 5I84A 1CNQA 4RXLA 1FPLA 3RTFB 1BKAA 3IJXB 1QJMA 2WBBA 2XXQA 3IK6B 2R6GE 4TLMB 4F3PA 2A5TB 1NUZA 2GRVA 4KCCA 4GD5A 2CZHA 3C35A 1LLSA 4PFBA 3DP8A 1YXIA 5CMMA 4R2BA 1B5JA 3ZKKA 1MY1A 1DBZA 2F5XA 1MQDA 2V3TA 3FVOA 4H8JA 1SW5A 1PB9A 3CG1A 4NAPA 2PFZA 2Z8DA 1URSA 2VD3A 4DIGA 5I56A 1LFHA 2IA4A 4THIA 5I59B 1A7LA 4EF2A 1LGBC 3MP6A 4UACA 5K2YA 3PV0E 1B3GA 3LSWA 3G3JA 2MKZA 1Q35A 4G8HA 3MSTA 3MYUA 3PUYE 4DDDA 2XD2A 3IORA 1A40A 4R75A 3EPEA 4G61A 3EF7A 2QS3A 3W9WA 3DP4A 4ELOA 1B2HA 2OCUA 2DE3A 2WYKA 3UGWA 4JDFA 1FTLA 2XWKA 5H8NA 3MZ1A 2UVJA 3FASA 2Y5LA 3DP6A 5FBPA 2RKMA 4GL0A 3L6HA 3OMBA 4NF4A 1EYJA 3IO4A 1IXHA 2PFYA 4NGUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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