1JNFA

Rabbit serum transferrin at 2.6 a resolution.
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
b'EKTVRWCAVNDHEASKCANFRDSMKKVLPEDGPRIICVKKASYLDCIKAIAAHEADAVTLDAGLVHEAGLTPNNLKPVVAEFYGSKENPKTFYYAVALVKKGSNFQLNELQGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLLCDLPEPRKPLEKAVASFFSGSCVPCADGADFPQLCQLCPGCGCSSVQPYFGYSGAFKCLKDGLGDVAFVKQETIFENLPSKDERDQYELLCLDNTRKPVDEYEQCHLARVPSHAVVARSVDGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSGDFQLFSSPHGKNLLFKDSAYGFFKVPPRMDANLYLGYEYVTAVRNLREGICPDPLQDECKAVKWCALGHHERLKCDEWSVTSGGLIECESAETPEDCIAKIMNGEADAMSLDGGYVYIAGQCGLVPVLAENYESTDCKKAPEEGYLSVAVVKKSNPDINWNNLEGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNRINHCRFDEFFRQGCAPGSQKNSSLCELCVGPSVCAPNNREGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKSQTVLQNTGGRNSEPWAKDLKEEDFELLCLDGTRKPVSEAHNCHLAKAPNHAVVSRKDKAACVKQKLLDLQVEFGNTVADCSSKFCMFHSKTKDLLFRDDTKCLVDLRGKNTYEKYLGADYIKAVSNLRKCSTSRLLEACTFHKH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The crystal and molecular structures of diferric porcine and rabbit serum transferrins at resolutions of 2.15 and 2.60 A, respectively.
pubmed doi rcsb
molecule keywords serotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 219
structure length 674
sequence length 674
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA03
2NOOA 3D4GA 3MJNA 3U72A 4LATA 1I69A 5H8NA 1OQGA 2XXIA 1EH3A 3T9XB 3TYHA 1SW4A 5F1QA 4R72A 3IOVA 1PBPA 1ANFA 4YAHX 1D3KA 2ZNUA 2XXXA 4R9FA 2ZNSA 4LQ2A 4OZ9A 1UTBB 4P0IA 1B5IA 4NF5B 2REGA 1QW0A 1B2HA 1MQHA 2F6GA 1IIWA 4KYDA 1SQYA 4X1BA 3QUFA 3A3UA 1IXHA 4ZZEA 4G77A 3O2AA 4BDLA 4R6KA 4YU0A 3RPWA 3IX1A 2F7CA 5ICQA 1URDA 4IY5A 2X26A 1A40A 3TTMA 2I0BA 2O84X 4ECFA 4RYAA 4R6YA 3H03A 3A09A 1A54A 4GRKA 1N0TA 2PMSA 1SI1A 2HAUA 3EHSA 4N07A 4KPTA 1PEBA 4UA8A 2DWHA 4ELQA 2H5YA 4KHZE 1QULA 1ZMGA 1AOVA 3MP8A 5I59A 3SEUA 2GRVA 1S9TA 3S4UA 3EF7A 3KN3A 2Y7KA 3PMVA 1Y4TA 3CFXA 1EZ9A 3RTFB 1US4A 5CMBA 1D9YA 3VLWA 2F7AA 1UTBA 4OXVA 2VD3A 2ZYNA 4EF2A 4NF5A 4RK2A 1VE4A 2O51A 1Z7ME 1R9QA 2OZZA 4FEDA 3BFTA 5FHMA 2VD2A 1M5BA 4EUOA 3WAEA 4YKIA 1CB6A 3TPAA 2E0SA 3P7IA 3KJ7A 3MP6A 3KGCA 2RINA 1H76A 3TDJA 3FVKA 3FUZA 3PPNA 3IO6A 4KCDA 2R6GE 3U92A 3MZ9A 2W7YA 3LSXA 3CSBA 2XXYA 4LONB 4Q5TA 4XKRA 4ND9A 2NXOA 3IORA 4P0GA 1R6ZA 1SW2A 1SW1A 4OFOA 1JVXA 2VHAA 4EQ9A 3O28A 5FTIA 2XXHA 1IUDA 5HM4B 1OLCA 5H8FB 4U23A 3EPEA 1Y3QA 2F8DA 1SI0A 3DLNA 1TWYA 3VXBA 4BDQA 3H6VA 1B58A 3I5OA 3JYRA 3HHFA 5A5XB 4KQPA 4YKJA 5L9OA 1P1UA 4NE4A 4DXUA 3IOTA 3VVFA 2DE3A 4LA9A 1N84A 2FNCA 4U4XA 4BLAA 2UYFA 4ZEFA 1LB8A 3ZKKA 2Y84A 1B52A 1RYXA 3TQLA 3K1PA 4GXAA 2RC8A 3FZVA 4IY6A 1PB9A 4U1OA 3MZBA 1I6BA 1OMPA 3H6TA 1FQEA 1JEUA 4U22A 4DIGA 4ZEBA 4FE8A 2RKMA 4ELPA 3OOAA 5CMKA 4YB7A 4OEVA 5ISUA 5CC2A 4TOZA 2Y7RA 3OSRA 3RTWB 1DPPA 1QKBA 5I57A 4Q8RA 4MF3A 1F9BA 1MXYA 3T93B 5KDTB 4AQ4A 1MY4A 5EYFA 4OQOA 3A3CA 4H6DA 1LB9A 2OBGA 5H8FA 1LLSA 4QFKA 4XTCQ 3MP1A 3U93A 2ONKE 3LUYA 2Q8JA 4F2QA 3FASA 5M2VA 1FQBA 2O69A 2REJA 1QUKA 3PUWE 1FQAA 3ILTB 3QIMA 5A5XA 4I62A 2ZYOA 3PUXE 4R74A 3SERA 2GFEA 2RCBA 1Y20A 3CFZA 4DXBA 3RN8A 1OQHA 1XOCA 5CI5A 4WKMA 4R73A 4LVQA 2QSXA 3GBBA 5AA2D 2XXQA 2VP1A 1HSEA 1SW5A 2XD3A 5L9SA 2OLBA 3CIJA 4YICA 5I58A 4KFQA 2Q9TA 1NH8A 3OO8A 4AB5A 1NNKA 3MVWA 2VGQA 3T66A 5FHOA 5KZTA 3MBPA 1II5A 1QUJA 1NL5A 4YMAA 3K1NA 4MBPA 4OERA 2KLFA 1NNTA 4YKKA 4AB6A 3V5AA 3L6HA 2B65A 4GWOA 2G93A 1R1NA 4OHNA 3FXUA 1FTJA 1SBPA 3FVGA 4KYSA 4QSDA 3ECRA 3FV1A 5BUUA 3O9PA 3PPQA 5KDTA 4LZ8A 3TKDA 4HCYA 1SVXB 3FJMA 3FVNA 2NVUB 1S50A 3E9XA 1P99A 4XKQA 1H3DA 3UIFA 2I4BA 1NFTA 1B7HA 1IITA 3SEVA 1RYOA 1URSA 1Y3PA 4QRZA 1B3LA 3OELA 1QVSA 2DSFA 3K02A 1PB7A 1TT1A 4ISUA 3M8UA 3T9HB 1SYHA 5IKBA 3THIA 1RKMA 1NMUA 4MH5A 5LOMA 1UTHB 3BBRA 4ESXA 2PVUA 4R75A 1FTLA 2I48A 3KSXA 1XVYA 5DVJA 3AXFA 4OFLA 3PMWA 2B3BA 1JVYA 4H8IA 3B6WA 3OO9A 1BLFA 2A5TB 1IEJA 3K6UA 3KJTA 1ELJA 1DSNA 3KN7A 3B7DA 4MLVA 5DTBA 3FATA 2F35A 4KCCA 4F3BA 3Q27A 2R71A 1B1XA 4OTEA 3I6VA 1MPBA 2NWJA 2QS2A 1MY2A 5AA2B 2H9BA 3UP9A 3TCFA 2UVHA 3ILUB 3OO7A 2Y7IA 4F2OA 4EF1A 3S2VA 3H4ZA 2QL3A 1ZKBA 2NUVA 1P1WA 4K3FA 1GV8A 2UVGA 4KR5A 1B5HA 3QAXA 3N26A 4XXUA 4RA1A 2XX7A 3O6GA 4GFRA 1B40A 4G4PA 3N94A 2F6PA 3EHTA 5DT6A 1B3EA 2GHBA 3KN8A 1A8FA 4RY1A 1UIUA 4NF6B 4JXIA 3OMBA 2ZNTA 5B70A 5JEIA 4NWDA 3V83A 1YCJA 1HSLA 2O7IA 1B3HA 1YTVA 4ZE8A 3C4MA 3MPLA 5CMMA 1LAGE 4FECA 3UN6A 1B0HA 3HV1A 2XXVA 3QYTA 2A5TA 2Y7WA 5L8DA 3G7WA 4IO6A 5ELVA 1NH7A 5DVFA 3FXQA 3G3JA 1PDAA 1LFIA 1BKAA 1D4NA 1FTMA 5K2YA 5AA2A 1JEVA 4EQBA 1NKXA 3PGFA 4NMYA 3DP6A 4H67A 2Y7PA 4I1DA 3E13X 4LZ5A 1MS7A 4POWA 3B6TA 1B05A 4DE8A 5H8SA 1P1NA 2R9JA 3GZGA 4FJPA 1Z7NE 1EU8A 4UACA 3PPOA 4LP2B 4G8HA 3O66A 1IZ1A 3SDFA 2O1MA 3H6WA 4ZDMA 4OVJA 2F5XA 1P1QA 3RGYA 2Q2CA 4C1TA 5H8HB 4BDRA 3PU5A 4IO7A 2P1SA 3RY3A 3LBSA 2DOJA 2XXWA 4NF6A 3UGWA 2Z8EA 2FA7A 3G3FA 3IB0A 1B5JA 1A55A 3EQ1A 1B7UA 1MPDA 1DTGA 3K6WA 1GR2A 4NF8B 5AA4B 1OVBA 1TFAA 2F7BA 5I2NB 4ZEIA 2HZLA 2IEEA 3DP8A 2O1LA 3V8XB 4DXCA 2H25A 4MLQA 3SEWA 2XX9A 5CBRA 1BTJA 4Q0CA 3SKPA 2QS4A 1MM7A 1T0KA 4FORA 1CE2A 4OFJA 5JTYB 4BDOA 3TCGA 5BWJA 4QFLA 2IA4A 1NNFA 2P0SA 5DVIA 3G3KA 1FQDA 1MXWA 4HS7A 4OETA 2E1SA 3MVZA 3SESA 4G2ZA 1Y1MA 3HO7A 3TTRA 1Q35A 3SEYA 1US5A 1EZPA 3BKIB 3K2DA 2XX8A 1MDP1 3RT6B 4QHQA 2ZYKA 1LBCA 1O7TA 2FYIA 1XC1A 4F19A 3FD3A 2O6AA 2PT2A 4Z0IA 3VE1B 5H8HA 2XXTA 4RXLA 3BFUA 3W9VA 1JETA 1MXZA 4H1XA 4ZEKA 3S9LC 2Q2AA 1SDXA 3GXAA 2DWIA 4QFOA 3TTNA 1N04A 2B3FA 4DDDA 4X9TA 3E3KA 4NF8A 4RK9A 1LAFE 2H99A 2RC9A 5AA4A 1MPCA 3OEKA 4LZ7A 3K1MA 5I2NA 1LSTA 4N6PA 2I3WA 1JQFA 3HHGA 3KFMA 1A99A 3C9HA 3R7XA 1WVJA 2DWAA 3QSLA 4H0WA 2OJTA 2Q88A 3H7MA 4JSOA 2XD2A 1L5TA 3IR1A 2DE4A 5JTYA 4U4SA 1B4ZA 4N13A 4ZECA 1YPNA 1GGGA 4TLLB 4KI0E 4U21A 2O68A 1DTZA 5AA1A 3O6HA 1FTOA 1LFGA 3FJ7A 1PB8A 1N7XA 4F1UA 1B32A 1QJMA 3K0VA 4U2RA 4H8JA 1LAHE 3I3VA 5CMCA 4THIA 4TQUQ 4M1VA 2ZMBA 3LR1A 2V84A 4IO3A 1B0LA 4HTGA 1M5DA 2QS1A 2XXPA 3T22A 4H5FA 4PQJA 4H5GA 3UORA 4IB2A 1Y9UA 4F3GA 4QFNA 3OSQA 5L9MA 3C32A 3TMGA 4IGTA 4DLDA 2ONRA 5DYHA 2AL4A 1VFEA 2ESNA 5AE4A 3M3LA 4NF4B 4ZE9A 2DQVA 3OXNA 2Z22A 2QMWA 3TZAA 4IO4A 2XHDA 5K2XA 1MXXA 2YPNA 2UXAA 1ZU0A 5F7VA 4F3SA 4GL8A 4O3AA 2F36A 4Q30B 1AH5A 3PV0E 3U1OA 2HQ0A 3VV5A 4F18A 2M8CA 3C31A 1Y1ZA 2RF1A 1MQJA 5DEXB 4ONYA 1JW1A 2PX1A 4OESA 2V3UA 2V3QA 4EXLA 1KWHA 3FXRA 2HZKA 4HW8A 2PYYA 2Z8DA 4R9GA 5KCJB 4WXJA 4QSCA 3SEXA 1BP5A 3O29A 1QUIA 4FATA 1MQIA 4O3CA 3M3KA 3VLVA 4ELOA 2D3IA 1Y3NA 3FV2A 3MPKA 5IAIA 4F1YA 4NEDA 1M5CA 1URGA 1FTKA 1Y4CA 2H98A 4GQOA 1S7YA 2D5WA 3S9NC 2F97A 4XKPA 1B4HA 4NF4A 3RQTA 2LAOA 4EDPA 1WDNA 4POXA 4I8CA 3K6XA 2V93A 2BJJX 2DXYA 4HCWA 3S9MC 3GBAA 1LCFA 4EQ7A 2V25A 2A5SA 4OEUA 1I6QA 3V89B 4R2BA 1B3FA 3IJXB 2QS3A 3IJOB 5I59B 4YMBA 2OWTA 4TLMB 1B1HA 3MVYA 5DEXA 1IXGA 1PBQA 4GIZA 3TEPA 2X7PA 1H44A 3W15C 3G3IA 4RNSA 3HCQA 3Q29A 3RT8A 3H3GA 1UTHA 5KCJA 3MZ1A 3S9EA 4LUBA 4XIGQ 3TTKA 2GH9A 1GVCA 3PUYE 1N7WA 1WODA 4GL0A 3VVEA 4I9DA 4PFTA 2HXWA 2DXRA 2OK2A 4PFWA 2RC7A 2DVZA 3N5LA 4OWDA 5B7DA 3MWBA 2ZYMA 1A8EA 4Z7EA 3DELB 3IL1B 4F31B 2ANJA 3HSTA 3CFLA 3Q26A 1I6AA 1ZLQA 2O7UA 4JBZA 3EN3A 3E4RA 3U8QA 3VLUA 1N3WA 1VSOA 5EHSA 1VFDA 4G68B 1ZTYA 3OD7A 2ZXTA 4G8MA 4FAJA 3C35A 3KOSA 5J1DA 1USYH 4YZZA 3G3GA 4IO2A 1H43A 1BIYA 1FCKA 2X7QA 3QXMA 2RCAA 1QKAA 2PBWA 4E0WA 3CI8A 2DVCA 2ALUA 3QUJA 3KZGA 4DZ1A 4NWCA 4RPNA 3LSLA 1SD3A 3N6UA 3ZSFA 5TPAB 4ESWA 1MQGA 3R6UA 1DOTA 3ODBA 4FEBA 1SYIA 4QF9A 5CRYA 3L6GA 3UA8A 5I2KB 1GTKA 2I58A 2I3VA 3OEMA 2ABHA 4G68C 1AL3A 1JW4A 3B6QA 1LFHA 3IO4A 2XXUA 1MY3A 2DWJA 3N6TA 1MDQA 4YB6A 1AMFA 3O97A 3U94A 1HSJA 1B7ZA 4F3PA 4GOTA 2HAVA 5TP9B 4GLIA 4OMBA 1B46A 4G68A 4GXSB 2Q89A 1ATGA 4JDFA 3CRBA 2G29A 2DP8A 2OWSA 4C1UA 1MH3A 1O63A 2CMOA 4R6HA 4DCXA 1M5FA 4JSDA 4MFIA 3CVGA 5I57B 1MXUA 3DP4A 3UK4A 2HEUA 5I84A 2DYXA 4OYVA 4JWYA 1LGBC 4ZS9A 1B9JA 4U1ZA 3RNNA 2AYSA 3LC8A 3HPIA 2H4IA 4BDMA 4IO5A 1P1OA 2Z23A 1VR5A 3ZS6A 4QFPA 1PC3A 1JNFA 3C36A 3K00A 5CBSA 2UYEA 4RJZA 5AA3A 2YLNA 5TPAA 2CZLA 2V3TA 4P11A 1ZJLA 5FHNA 1TFDA 3PUVE 1EZOA 4IGRA 1J1NA 5I2KA 1R9LA 1ZBMA 3VXCA 2QPQA 1FW0A 3CR9A 3CG3A 3PMXA 5I58B 4DCYA 3FGSA 3H06B 1N76A 4QSEA 3VVDA 4X48A 1MXVA 4BDNA 4JWXA 3H6UA 1MG1A 3KBRA 5FTHA 4F29A 1N3XA 1AIVA 1ZIUA 1OLAA 4WEPA 1IXIA 2UVIA 3G3HA 5TP9A 3Q25A 4YB5A 1MH4A 3Q28A 3KG2A 3TUSA 1XS5A 3C34A 4PFYA 4R2FA 3MC2A 3RLFE 5H8QB 4KD5A 3IOWA 3F11A 3VFJA 2I6EA 4M4GA 1FQFA 2QMXA 1LBBA 3T96B 1DPEA 3PPPA 2I4CA 4G8NA 4PFUA 5EHMA 3OENA 3CSGA 4EXKA 3WAFA 3MAMA 5HBCA 3JV9A 4FIMA 3K6VA 3PD8A 2QJEA 4YKPA 4F1VA 3C33A 3VDFA 2QRYA 1MQDA 4ZEDA 1MRPA 5ITOA 3FIRA 3FJGA 3TELA 2F34A 4GD5A 3IB1A 4KYEA 3IOUA 1IXCA 2P2AA 4PE5B 3TODA 1B3GA 1LAXA 1YAEA 2GHAA 1OIBA 4ZZAA 1D9VA 4F22A 1DMBA 4ELRA 1Q1KA 1POY1 3PUZE 3DM0A 3EHUA 1O64A 3T9UA 4WEDA 1LCTA 2DS9A 1MY1A 5I56B 3FVOA 3TCHA 3KEIA 3RUMA 2ONSA 4F39A 2WKYA 2I0CA 1B6HA 3PD9A 4PETA 2OCUA 2AL5A 5TU0A 3LSFB 4PP0A 3MVXA 2F78A 5H8QA 2PT1A 1M5EA 3SETA 4NTLA 5H8NB 1XHYA 3MUQA 4JWOA 2HCAA 2XXRA 3GLBA 4L17A 3MW0A 5HPQA 4RPOA 3R26A 1B51A 1UIVA 2THIA 3TTLA 3ZKLA 4C0RA 3USDA 3PPRA 4XKNA 3IB2A 3CG1A 3T9VA 1MY0A 1MM6A 3TFLA 3KOTA 3MQ9A 1OVTA 1NNPA 3KSJA 1JW5A 4GF8A 4H65A 1TXFA 4LQ5A 2Z8FA 2AIXA 1XVXA 3OO6A 2VOZA 3IAZA 3M3FA 3QK6A 2YJPA 2HFBA 1USYE 3ONMA 5I56A 3D4CA 3IK6B 5CM6A 3JZJA 1H45A 4X1DA 4O3BA 5ICTA 2DE2A 3LSWA 3TAJA 3TQWA 2UVJA 4GVOA 4E0XA 3K01A 1A7LA 3W9WA 1XT8A 1IQ7A 1POTA 2I49A 3O6IA 4OENA 2D21A 1FQCA 1UQWA 5JK4A 5ITPA 3HN0A 3K4UA 4JB7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YZ0A 2NOOA 3D4GA 3MJNA 3U72A 4LATA 1I69A 5H8NA 1OQGA 2XXIA 1EH3A 5DW8A 3T9XB 3TYHA 1SW4A 5F1QA 4R72A 3IOVA 1PBPA 1ANFA 4YAHX 1D3KA 2ZNUA 2XXXA 4R9FA 2ZNSA 4I3EA 4LQ2A 4OZ9A 3ROJA 1UTBB 4P0IA 1B5IA 4NF5B 2REGA 1QW0A 1B2HA 1MQHA 1CNQA 1G0HA 2F6GA 1IIWA 4KYDA 1SQYA 4X1BA 3LUZA 3QUFA 3A3UA 1IXHA 1NV6A 4ZZEA 4G77A 1Q9DA 3O2AA 4BDLA 3ISPA 4R6KA 4YU0A 3RPWA 3IX1A 2F7CA 5ICQA 1URDA 4IY5A 1NV1A 1A40A 2X26A 3TTMA 1SPIA 2I0BA 2O84X 4ECFA 4PGPA 4RYAA 3GYYA 4R6YA 3H03A 3A09A 1A54A 4GRKA 1N0TA 2PMSA 1SI1A 2HAUA 3EHSA 4N07A 4KPTA 1LBXA 1PEBA 4UA8A 2FVZA 2DWHA 4ELQA 2H5YA 4KHZE 1QULA 1ZMGA 1AOVA 3MP8A 5I59A 3SEUA 2GRVA 1S9TA 3S4UA 1FSAA 3EF7A 2WX9A 3KN3A 4AS4A 2Y7KA 3PMVA 1Y4TA 3CFXA 1FPFA 1EZ9A 3RTFB 1US4A 5CMBA 1D9YA 3VLWA 2F7AA 4P8BA 1UTBA 4OXVA 2VD3A 2ZYNA 4EF2A 4NF5A 4RK2A 1VE4A 2O51A 4G61A 1Z7ME 1R9QA 2OZZA 4FEDA 4HXVA 3BFTA 5FHMA 2VD2A 1M5BA 4EUOA 3WAEA 4YKIA 1CB6A 3TPAA 2E0SA 3P7IA 2B4MA 3KJ7A 4PAFA 3MP6A 3KGCA 2RINA 1H76A 3TDJA 3FVKA 3FUZA 3PPNA 3IO6A 4KCDA 4P47A 2R6GE 3U92A 3MZ9A 2W7YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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