1JW4A

Structure of ligand-free maltodextrin-binding protein
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords maltodextrin-binding protein
publication title Structural evidence for a dominant role of nonpolar interactions in the binding of a transport/chemosensory receptor to its highly polar ligands.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 123
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw4A01
4H67A 4PP0A 2UVJA 3FJMA 2V3UA 3KBRA 4I8CA 4OXVA 4YB6A 3OD7A 1IIWA 3MP8A 4JWYA 2DXRA 3KGCA 1JETA 3LR1A 2Y7WA 2QS1A 4G8NA 5H8HA 2DWHA 5DT6A 3V89B 5M2VA 1QKAA 1FTOA 3EQ1A 1VFEA 3KEIA 2YLNA 1HSEA 1N3WA 1URDA 2HEUA 4KYEA 4C1TA 3SERA 1PB7A 3IAZA 5CI5A 4IO2A 2R9JA 2X7QA 3VVDA 3HN0A 1Z7NE 5I57B 3CR9A 4IY5A 5K2XA 1EZ9A 5TP9A 2X7PA 3UK4A 4X9TA 3W9WA 4R72A 4KCDA 1IEJA 4NEDA 2RINA 4Z0IA 4EQ9A 4P0GA 2Y7IA 1DMBA 3THIA 4LZ8A 3FXRA 4U1ZA 2XXPA 4DCXA 5AA3A 3B6TA 3IOVA 1LSTA 1AIVA 3ZKKA 3FIRA 2PYYA 3AXFA 4FEBA 4I1DA 5DVFA 1B5HA 3IB2A 5J1DA 1P1OA 4PFYA 3KOTA 2V3TA 2XXHA 3G3FA 3N5LA 1A55A 2RC7A 3LSLA 4QSDA 4AQ4A 2Q9TA 2ZNTA 4G68B 1A99A 1N3XA 4ELPA 3M3LA 3A3UA 2ONKE 4E0XA 1N04A 1WDNA 1TXFA 2ONRA 3G3GA 5CBRA 2I48A 1M5CA 1URSA 5L9SA 1OVTA 3C9HA 2DYXA 3CG1A 1UTBA 4XKQA 3EPEA 1PBPA 1MPDA 5H8QB 1URGA 1S7YA 2QRYA 4OQOA 5I58A 5ICQA 4QSEA 3ZS6A 4NMYA 4ELOA 3F11A 1IXCA 3OEKA 1XT8A 2H99A 1O7TA 2GHAA 4RK9A 3M3KA 1LAGE 1BP5A 2CMOA 1QUKA 2RCAA 4HCYA 1AL3A 2ESNA 3PUYE 3VLUA 4IO4A 1QVSA 3HV1A 4PFTA 3CFLA 4U21A 3FVGA 1JVXA 2F5XA 2DOJA 1D9VA 4JXIA 4OERA 3SEUA 1R6ZA 1ZKBA 3RN8A 4FJPA 1B3LA 4U22A 4UA8A 4TLMB 3RQTA 4FECA 5CMCA 1N7WA 3IR1A 3QXMA 4QFNA 2NUVA 4FORA 1B7ZA 2AIXA 3TDJA 3IOUA 2IA4A 1H3DA 5H8FA 4LZ5A 1MDQA 1VR5A 3T66A 4DE8A 1MXYA 2RF1A 1Q1KA 2DXYA 3PD9A 3TTNA 5JEIA 3FASA 2AL4A 5AA1A 5ELVA 4EQ7A 3BFUA 1QULA 5K2YA 4H6DA 1YPNA 3K2DA 5H8FB 3K1MA 1OQGA 3LUYA 3T9XB 4F2QA 1B7HA 3IOWA 4NF6B 1LCTA 3VLWA 1B5JA 1Y3NA 2QMXA 4RA1A 1MXVA 5JTYB 1JW1A 4GF8A 1MY0A 3FJGA 4FE8A 3V8XB 3HO7A 3PUVE 4IO5A 1P1QA 3UP9A 3G7WA 4OYVA 2HQ0A 3I5OA 3PPPA 3OO9A 4KD5A 2NVUB 1US4A 1MQHA 4Q8RA 2VD3A 1DOTA 2FNCA 4IB2A 3MVYA 1JNFA 4PFUA 3ZSFA 3MP6A 2F6PA 4GXSB 1Z7ME 1BKAA 1MY4A 4QFOA 2I6EA 4O3CA 4EXLA 2H4IA 2YPNA 3LSWA 3CFXA 3DP6A 4G68C 2H25A 1R1NA 2D21A 4G8HA 3EHUA 3BFTA 1N84A 4KHZE 4ZS9A 4GOTA 4U2RA 3H6TA 3QYTA 1I6BA 5F7VA 2AL5A 1XOCA 4U4XA 4RPOA 4KYDA 3ODBA 1YAEA 4EDPA 3JV9A 2DWIA 2A5SA 1N7XA 4PE5B 1TT1A 4PQJA 3TPAA 1FQFA 3TEPA 3N26A 1JW5A 3U92A 2QSXA 2Z8EA 3H6UA 3VFJA 3TQLA 1MQIA 1JEVA 4RK2A 3OMBA 4IY6A 1B0LA 4DCYA 3QAXA 3LC8A 4N07A 1B32A 3K00A 3FV1A 1FW0A 4LQ5A 1M5BA 4XXUA 1MPCA 2G93A 1FQBA 1USYH 4R75A 1SW2A 1M5FA 1P1UA 4RY1A 1A8FA 2I49A 3PPRA 3RY3A 3W15C 5KCJA 3S9LC 2I3VA 2O69A 4BDMA 5H8NA 4YU0A 1BTJA 3O29A 2M8CA 2HFBA 3T9VA 3O66A 2ZXTA 3T93B 1MG1A 2F35A 1QJMA 3FXQA 1A40A 4ONYA 5KCJB 4MFIA 5H8NB 4Z7EA 1N0TA 2PT1A 1SI0A 3PPQA 5L9MA 3FVKA 4KI0E 2OLBA 3K01A 2DE3A 3S2VA 3B7DA 4LQ2A 1IXIA 4NF5A 1Q35A 1AMFA 4DXCA 1NH7A 4P11A 3L6GA 1SD3A 3QUJA 1B5IA 1FQAA 2VGQA 4BDQA 3OO6A 3ECRA 1IUDA 2UYFA 3TTKA 3PGFA 5KDTA 1WVJA 3E9XA 2QJEA 4POXA 1SYIA 3Q27A 5H8SA 3ONMA 3MZ9A 1LCFA 3K4UA 5LOMA 2XD3A 1T0KA 2H9BA 3FD3A 4IO6A 5CM6A 2DE2A 4GQOA 4EUOA 3TZAA 3SEWA 2Y7KA 3T22A 4TLLB 3K6UA 1MM6A 5FHMA 4F18A 3O9PA 2H98A 2NOOA 1NNKA 2G29A 3KJTA 3MBPA 4DXUA 3MQ9A 2P1SA 4H8IA 1ZJLA 2OZZA 2A5TA 1NKXA 3MPLA 3DELB 3USDA 2DP8A 1PB8A 4WEPA 5TU0A 3CRBA 4QF9A 2REJA 4NWDA 1M5DA 3Q28A 4OZ9A 5H8HB 5DTBA 4G8MA 1A7LA 1FTLA 2XHDA 1SQYA 2F7CA 2XXRA 3S4UA 1NH8A 4NF8A 3C34A 3JZJA 3TTMA 4AB5A 1JW4A 2PX1A 4GVOA 3K02A 2F36A 2Y7PA 1CB6A 3CSBA 4AB6A 2UVHA 1ELJA 5IKBA 3I6VA 4YZZA 1PBQA 4F39A 1B52A 5TP9B 2OCUA 3QK6A 3PD8A 5I2KA 5BWJA 1SVXB 4PFWA 1FCKA 2VD2A 1A8EA 1LBBA 3QUFA 1US5A 3D4CA 2Y84A 3V83A 4QHQA 4BDNA 2DSFA 1RKMA 5L8DA 1POTA 4GD5A 3OO7A 3FVNA 1LAXA 3R26A 3MPKA 1MPBA 1SBPA 1UTHA 4NE4A 3KJ7A 2RKMA 3UORA 3RGYA 4LUBA 2R6GE 3A3CA 1XVYA 3TTRA 3FATA 4JWXA 3CI8A 3Q25A 1B05A 4ZDMA 3K6XA 1OLAA 5HBCA 3HSTA 5I2NA 3MWBA 4XTCQ 4F3SA 1XHYA 4ISUA 1Y3PA 3GXAA 2OJTA 1VSOA 4GL0A 3UA8A 3IL1B 1GV8A 4LA9A 5IAIA 1D4NA 4XKPA 5I2NB 4MLVA 4M4GA 2X26A 2I0CA 4LONB 1MY2A 3P7IA 2PBWA 4O3AA 4FEDA 5KZTA 2UVIA 1MXXA 1LB9A 1MY1A 2VOZA 2ZMBA 3HHFA 3VLVA 1UTBB 4KPTA 2Z22A 3HCQA 3LSFB 5ITPA 2O84X 3H7MA 1B3HA 2VHAA 3IB1A 2XXIA 4DLDA 1XS5A 1R9LA 3S9MC 1I69A 5I58B 4DXBA 3CIJA 4WKMA 3E13X 2Q89A 3GBBA 3PU5A 4GWOA 2ALUA 3MVWA 4OMBA 2V84A 3U94A 3GBAA 2ONSA 1FQEA 5TPAA 4R9FA 4KFQA 2V3QA 4F22A 4H0WA 3KG2A 3RTWB 3TFLA 4BDOA 2NWJA 3VV5A 3PMVA 1N76A 1OMPA 4G4PA 5TPAB 4XKNA 2BJJX 1D3KA 4OESA 2CZLA 4EF2A 2H5YA 4ZEBA 2QPQA 1QUJA 2FA7A 2UVGA 1B2HA 3FXUA 4XKRA 4THIA 1JVYA 1O63A 3O28A 3RT8A 1B58A 3OSQA 3L6HA 4NF4A 4R2FA 2F78A 1B6HA 3SETA 2XXYA 4KCCA 1DPPA 3U8QA 1MQDA 1XVXA 3UGWA 2O6AA 2B3FA 3T9HB 1PDAA 4F3BA 1KWHA 4OEVA 4M1VA 4NF4B 1SDXA 3IB0A 4G77A 4U23A 4EQBA 5DEXA 4OFJA 2OK2A 1B3GA 5CMKA 1B4ZA 4QFKA 1PB9A 3U1OA 1B3EA 3IO6A 4OENA 5B7DA 2XX8A 4TQUQ 4PETA 4H1XA 1AH5A 4DDDA 1ANFA 3OXNA 4X1BA 2UYEA 1WODA 3FJ7A 3K6VA 1MXUA 3IK6B 4IO3A 5AA4A 2XX7A 1IQ7A 1SI1A 1YTVA 3TELA 3FUZA 3MUQA 3K1NA 3LBSA 5I56A 5I59A 4U4SA 4YKPA 1IXGA 3BBRA 3TTLA 1SW4A 2Z8FA 3EHTA 4C1UA 3C35A 4YMAA 1S9TA 5I59B 1MH4A 3KOSA 2PMSA 5DYHA 3UN6A 5A5XA 1NNPA 2GRVA 4QSCA 4YAHX 2F97A 3OEMA 4ZE9A 2HCAA 2XXTA 5AA2A 1GGGA 5CBSA 5FHOA 1H44A 1NL5A 2Q2AA 3G3HA 3MJNA 4F1YA 2I0BA 3MZ1A 3IJXB 3D4GA 3VVEA 3KSJA 3VVFA 3RNNA 1IITA 1MDP1 3IOTA 3JYRA 4JWOA 1Y4TA 1O64A 4N6PA 2Z8DA 4N13A 3PPNA 2I4BA 3EHSA 1MH3A 2XXVA 3U72A 1II5A 4RPNA 1EH3A 1ZTYA 1DPEA 3K1PA 2R71A 1RYOA 3C4MA 2AYSA 4RXLA 2FYIA 4F29A 1IZ1A 3PUWE 1M5EA 1QKBA 1LLSA 4GFRA 4NWCA 3MZBA 1LFGA 2QS3A 1Y4CA 3ILTB 2XXWA 2I4CA 2RC9A 3PUXE 2F7AA 4LATA 4WEDA 4QFLA 4NF5B 5ISUA 2DQVA 4JB7A 3T9UA 2Q8JA 4LZ7A 3DM0A 2P2AA 5L9OA 2OBGA 1LFIA 3SESA 3SDFA 2OWTA 3C36A 1TFDA 1ZU0A 4R6YA 5JK4A 3C33A 3TAJA 5KDTB 4H5FA 2ZNSA 2O7IA 5AE4A 3H03A 4I62A 1P99A 3FV2A 4FATA 4H5GA 3N6UA 1B7UA 5EHSA 3UIFA 3B6QA 1B4HA 1UIUA 2UXAA 5I84A 4KR5A 4YICA 3KSXA 2Y7RA 3KFMA 3SKPA 1LB8A 1MM7A 1ZMGA 1B1XA 1Y1MA 2HZKA 3DP4A 3PPOA 1DSNA 1POY1 4BLAA 1I6AA 1LAFE 2XX9A 1ATGA 2A5TB 1F9BA 3MVXA 4LP2B 4OHNA 5I57A 2GHBA 4ESXA 1QW0A 1MQJA 4GL8A 4WXJA 3CVGA 3PMXA 1I6QA 5HM4B 3TUSA 4NF8B 2F6GA 1Y1ZA 3ILUB 4F1VA 4R6KA 4XIGQ 1P1NA 3KN8A 2OWSA 3VXCA 2DVZA 4X48A 3M3FA 1Y3QA 1OVBA 4YB7A 3RLFE 3PV0E 1B9JA 2Q88A 5I2KB 2HXWA 3K6WA 2D5WA 2E1SA 2F8DA 3RPWA 1OIBA 1H76A 3MVZA 2IEEA 5CRYA 1UIVA 4Q30B 2KLFA 1H45A 4R74A 4ZE8A 2YJPA 3SEXA 3VXBA 5EHMA 4G68A 2Q2CA 4KQPA 1MS7A 1B1HA 3N6TA 4DZ1A 2WKYA 4ZEKA 3TQWA 3O6GA 5F1QA 4F3GA 3CG3A 3TYHA 2GH9A 1L5TA 2QS4A 4F31B 3C32A 4Q5TA 4QFPA 4ZEIA 1B46A 3Q26A 3LSXA 1UTHB 4R73A 2F34A 1MRPA 3MP1A 1LFHA 1UQWA 2V25A 5DVJA 4IGTA 3WAFA 1S50A 3B6WA 3OOAA 4HW8A 1RYXA 3G3KA 4YKJA 3BKIB 2B3BA 1IXHA 3O6HA 4YB5A 3M8UA 4GXAA 5H8QA 5CC2A 3R7XA 3V5AA 1A54A 1FQCA 3G3JA 1NMUA 1R9QA 3CFZA 5BUUA 1NFTA 1USYE 1EZOA 1VFDA 5FHNA 3TMGA 3O97A 3ZKLA 2V93A 3R6UA 3OELA 3TODA 3DP8A 1JQFA 4JDFA 4ESWA 2O1MA 1MXZA 2ZYKA 4EF1A 3KN3A 2DWJA 2ZYOA 3K0VA 1AOVA 3O6IA 1LGBC 4ZEFA 4EXKA 1B40A 3KZGA 3MAMA 4OFLA 3Q29A 3I3VA 3VE1B 2RCBA 4POWA 5ICTA 3S9NC 1MY3A 1JEUA 1LBCA 3GLBA 4E0WA 2O68A 5FTIA 3SEYA 3TCGA 2B65A 3RTFB 3QIMA 2O1LA 3FVOA 1FTKA 1D9YA 3S9EA 4F2OA 5EYFA 3H06B 3T96B 1GR2A 4QRZA 4ZZAA 4NF6A 3EN3A 1YCJA 3IX1A 4U1OA 2ZNUA 1DTZA 4BDLA 1EU8A 5JTYA 1HSLA 4MBPA 3H3GA 2XD2A 4ZZEA 4FAJA 2W7YA 4ND9A 1LAHE 5AA2D 4JSOA 1Y20A 5FTHA 1HSJA 4ELQA 4OVJA 1MXWA 1B3FA 5DEXB 1DTGA 4GLIA 3IORA 4LVQA 2LAOA 2DS9A 2DWAA 4R6HA 4H65A 3IJOB 2QS2A 1ZBMA 1GTKA 4DIGA 4F3PA 2XXQA 4O3BA 4P0IA 4OTEA 1ZLQA 3RT6B 2HAUA 2QL3A 4X1DA 4HTGA 5HPQA 5AA4B 3W9VA 2PT2A 4GRKA 4OWDA 4K3FA 3OO8A 4OEUA 4YMBA 4RJZA 3MC2A 5I56B 1FQDA 4MH5A 1SW1A 2QMWA 2NXOA 5B70A 1H43A 4IGRA 2DE4A 3SEVA 1ZIUA 3DLNA 4R9GA 5CMBA 4GIZA 1P1WA 4OETA 1MQGA 3WAEA 3H6VA 2O7UA 3GZGA 4NTLA 4HCWA 3TCHA 4ZECA 4JSDA 2HAVA 4ELRA 5A5XB 4KYSA 4C0RA 1B51A 2D3IA 4H8JA 2Z23A 2E0SA 2GFEA 3TCFA 1XC1A 2ANJA 2I58A 2P0SA 2F7BA 4OFOA 2HZLA 4G2ZA 4RYAA 3G3IA 1BLFA 4RNSA 3FGSA 1SYHA 5AA2B 3QSLA 5ITOA 3OENA 3E3KA 4JBZA 2RC8A 3CSGA 4ZEDA 1FTJA 2REGA 3OSRA 1NNTA 1BIYA 1FTMA 2THIA 2DVCA 1PC3A 2ZYNA 2PVUA 3IO4A 3H4ZA 3RUMA 1EZPA 4Q0CA 3KN7A 2VP1A 4FIMA 4YKIA 3A09A 2ZYMA 1CE2A 1NNFA 4MF3A 1QUIA 4L17A 4F19A 3N94A 1J1NA 3O2AA 1TFAA 3EF7A 4UACA 3HPIA 4YKKA 4ECFA 4F1UA 1B0HA 4IO7A 1OQHA 4I9DA 3MW0A 2ABHA 2I3WA 2O51A 4BDRA 1TWYA 4TOZA 1GVCA 3E4RA 3TKDA 3C31A 1SW5A 5DVIA 1VE4A 1Y9UA 3FZVA 4R2BA 5CMMA 3HHGA 4MLQA 3PUZE 3VDFA 2XXUA 3H6WA 4HS7A 1OLCA 3PMWA 1PEBA 3U93A 2XXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H67A 4PP0A 2UVJA 3FJMA 2V3UA 4MJOA 3KBRA 4I8CA 4OXVA 4YB6A 2XWOA 3OD7A 1IIWA 3MP8A 4JWYA 1LBZA 2DXRA 3KGCA 1JETA 3LR1A 2Y7WA 2QS1A 4G8NA 5H8HA 2DWHA 5DT6A 2V4CA 4PF8A 4MAGA 4PFRA 3V89B 5M2VA 1QKAA 1FTOA 3EQ1A 5DW8A 1VFEA 3KEIA 2YLNA 2Y5KA 1HSEA 1N3WA 1URDA 2HEUA 4KYEA 4C1TA 3SERA 1PB7A 3IAZA 5CI5A 4IO2A 2ZZXA 2R9JA 2X7QA 3VVDA 3HN0A 1Z7NE 5I57B 3CR9A 4IY5A 5K2XA 2PFZA 1EZ9A 5TP9A 2X7PA 3UK4A 4X9TA 3A29A 3W9WA 4R72A 4KCDA 1IEJA 4NEDA 2RINA 4Z0IA 4EQ9A 4P0GA 2Y7IA 1DMBA 3THIA 4LZ8A 3FXRA 4U1ZA 2Y5LA 2XXPA 4DCXA 5AA3A 3B6TA 3IOVA 1LSTA 1AIVA 2XXKA 3ZKKA 3FIRA 4PAIA 2PYYA 3AXFA 1K9YA 4FEBA 4I1DA 5DVFA 1B5HA 3IB2A 5J1DA 1P1OA 2CZKA 4PFYA 3KOTA 2V3TA 2XXHA 3G3FA 3N5LA 1A55A 2RC7A 3LSLA 4QSDA 1KA1A 4AQ4A 2Q9TA 1LBXA 2ZNTA 4G68B 1A99A 1N3XA 4ELPA 3M3LA 3A3UA 4PTKA 2ONKE 5LTCA 4UABA 4E0XA 1N04A 1WDNA 1TXFA 2ONRA 3G3GA 4OVQA 5CBRA 2I48A 1M5CA 1URSA 5L9SA 1OVTA 3C9HA 2DYXA 3CG1A 1UTBA 1AWBA 5IZ1A 4XKQA 4GWXA 3EPEA 1PBPA 1MPDA 5H8QB 1URGA 1S7YA 2QRYA 4OQOA 5I58A 5ICQA 4QSEA 2CZIA 3ZS6A 4NMYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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