The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPKEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of mutant human carbonmonoxyhemoglobin C (betaE6K) at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HEMOGLOBIN ALPHA CHAIN
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-09-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YGF A; 1OUT B; 2B7H A; 4NI0 B; 2O5S X; 1Y7G A; 1FDH G; 3E5O A; 2MHB B; 1DO3 A; 2OH8 A; 3LB3 A; 1LFL B; 2KSC A; 1DLY A; 3ARK A; 1G0B A; 3ZJO A; 1MLQ A; 3WCT D; 3WTG A; 2V1H A; 3UHZ A; 2EVP A; 1CH4 A; 1XQ5 A; 1YOH A; 3S48 C; 1EBC A; 1Q1F A; 1DWS A; 1XZ2 B; 1Y0C A; 1MCY A; 3PI9 A; 1MLM A; 1S5Y B; 2SPN A; 1A6M A; 1A9W A; 2ZS1 A; 1OFJ A; 2GKM A; 1YH9 A; 1Y46 A; 1VXG A; 1GZX A; 1UIW A; 1XYE A; 1HGA B; 2D2M D; 3K8B A; 2R50 A; 5HY8 B; 3UGZ A; 1NIH B; 1YCA A; 3ZJM A; 2D2N A; 2AV0 A; 3LB2 A; 1X3K A; 2DN2 B; 2Z8A A; 1RPS A; 1Y09 A; 1XXT A; 2ZSR A; 2D2N C; 1FHJ B; 1XY0 A; 5JDO E; 1UVY A; 3G53 A; 2ZT3 A; 3EDB A; 4ROM A; 2GTL D; 2ZSX A; 2ZLX B; 5EU2 A; 1Y35 A; 1U7S A; 2D60 A; 5E6E B; 2ZT1 A; 1SPG B; 2XYK A; 2W6W A; 1XZ7 B; 2QFK A; 2ZFB A; 1YEN B; 3ZJQ A; 2CMM A; 3HEO A; 5KDQ B; 3ECX A; 1V07 A; 2HBS B; 1N9F A; 1HBR A; 2V1K A; 4U8U A; 3UHQ A; 4N7N A; 3UHS A; 1V75 B; 1YDZ A; 3FS4 A; 3MJU B; 1ITH A; 1NEJ B; 1L2K A; 1YMC A; 5F2A A; 1MBI A; 3GDJ A; 1A00 B; 4HSX A; 3HHB A; 1CMY A; 1S56 A; 3MYN A; 1MBS A; 4HRT A; 3EU1 A; 3LHB A; 3LQD A; 1KFR A; 3S66 A; 2HBD A; 1CLS A; 2MGH A; 1HBA B; 1YIH A; 2D5X B; 1CQ2 A; 3GQG B; 1HGB B; 3DUT A; 1MNO A; 1HDA A; 1HAC B; 2MGC A; 1VWT B; 3PIA B; 3FH9 B; 1HLM A; 6HBW B; 1DTM A; 2MGA A; 1UVX A; 4VHB A; 2ZFO C; 1DXT A; 2W6V A; 2OIF A; 1GCW B; 1IT3 A; 1GBU B; 4ROL A; 3ZJI A; 1J3Z B; 1MBN A; 3P5Q B; 2R4Y A; 2D5Z A; 1O1I B; 1A3O A; 1N9H A; 1LFZ A; 1NZ3 A; 1SWM A; 5CN6 A; 4X0L B; 4XS0 B; 1Y4B A; 5CMV A; 1A0Z B; 1JW8 A; 3K3U A; 4UUR A; 3VAU A; 3AT5 A; 4M4B B; 2R4Z A; 2MBW A; 1PMB A; 1MLU A; 4F6I A; 2VYY A; 2XKI A; 4B3W A; 3HEP A; 1COH A; 1QSH B; 3WFX A; 1X9F D; 1Y4P B; 3E55 A; 3ECL A; 3NG6 B; 3A5A A; 4NXA A; 3MKB A; 1Y5J A; 1LHS A; 1V4W A; 1CPW A; 1YEQ B; 3OJ1 A; 1Y7D A; 1XZ5 B; 2LH3 A; 1QXD A; 4C0N A; 101M A; 1RQ4 A; 4JYQ A; 1BBB A; 2D6C A; 3B75 B; 4AVD A; 4C44 A; 4NK2 A; 5KER A; 2HCO A; 3ODQ B; 3DHT B; 2HBC A; 3UHX A; 1MTJ A; 2ZSP A; 1XZU A; 1YIE A; 1Y7Z B; 5CNG A; 1JWN A; 3ZH0 A; 3WCV C; 3BJ1 A; 3D7O B; 2RAO A; 2AUQ A; 3ECZ A; 3G4R A; 1YG5 A; 2IG3 A; 4FWZ A; 3M39 A; 3HRW B; 1Y0A A; 2MYE A; 1DO1 A; 1MLS A; 1MNJ A; 2FRF A; 4O35 A; 4ILZ A; 1MYT A; 1JY7 A; 3NML A; 3QJE A; 1LFY A; 1Y8I B; 2GKN A; 1F5P A; 1YE0 B; 5E29 B; 4FC3 A; 3MOU A; 2VEE A; 1HDB B; 2DN3 A; 1G0A A; 2Z6S A; 3S1J A; 3QM7 A; 1LFT A; 4MQG B; 1BVC A; 1Y31 B; 1O1N A; 1MLN A; 110M A; 3OVU C; 1KD2 B; 1NS6 A; 3MYM A; 3ZHW A; 2PEG A; 2VLX A; 3SDN A; 1LUE A; 1JZK A; 4F6G A; 4MQK A; 2H8D B; 3H58 A; 3GKT A; 5EUI B; 1YE2 B; 1YVQ B; 2SPL A; 1NWN A; 1VRF A; 5CN4 A; 5ILE A; 1BZR A; 1RTX A; 2BWH A; 3UGY A; 1Y83 A; 1MBC A; 1Y5F A; 5SW7 A; 2QSS B; 3ZJP A; 2AA1 A; 1HV4 B; 103M A; 2G3H A; 3MN0 A; 1VXH A; 5CND A; 1J40 B; 5CHQ A; 2VM0 A; 1QI8 B; 1QSI A; 1BUW A; 2VYZ A; 1Y4R A; 1OR4 A; 4F6J A; 2GTL B; 3PI2 A; 3WCV B; 1YVT B; 1XCH A; 3M3A A; 3GKV B; 2E2Y A; 1YZI B; 2ZT2 A; 3D4X A; 1IRD B; 1VXD A; 2BLH A; 1Y45 A; 3VRF A; 1YHE B; 3AQ6 A; 3G4Y A; 3WCU A; 1HDS B; 1K0Y B; 5CN5 A; 2DHB A; 2ZSZ A; 4ESA B; 2M6Z A; 4MQJ B; 1YHU A; 2HZ3 A; 3D1A B; 1R1X B; 4HRR A; 1YHU C; 2LH2 A; 2BMM A; 4MPM A; 2WY4 A; 1O1L A; 2EKU A; 1MOA A; 2FRK X; 2HHE A; 3WCW A; 3V2Z A; 2HZ2 A; 3GYS A; 1NZ2 A; 2EKT A; 1OUT A; 1IBE B; 1RQA B; 1VRE A; 1JPB A; 4TYX A; 1A3N B; 1OR6 A; 4NI0 A; 1YGD A; 4O2G A; 1VHB A; 3D17 A; 1V9Q A; 1HBB B; 2MHB A; 3QM9 A; 3BJ3 A; 1M9P B; 2ZS1 D; 3IXF A; 4NI1 A; 2O5O X; 3ZJH A; 1Y7C B; 1CG5 A; 1NQP A; 3RGK A; 2W72 B; 1Y22 B; 4F4O A; 2D2N D; 1RQ3 B; 3RJN B; 2G12 A; 4OOD A; 1CBM A; 1HHO B; 3UHR A; 5HY8 A; 1HGA A; 2WTH A; 1FSX B; 4MQI A; 1GCV A; 1V4X B; 1YHR B; 1G9V A; 5AZQ A; 5ILP A; 1ABY B; 3OO5 A; 1MLJ A; 2DN2 A; 1MYF A; 4MQC B; 1FHJ A; 3D1K B; 1V5H A; 3HYU B; 1AJG A; 2ZLT B; 2MGE A; 1HBH A; 1WVP A; 1JZL A; 1RVW A; 2PGH B; 1X46 A; 2ZLX A; 3KUO A; 3QJD A; 1CIO A; 4U8U D; 1HBS A; 1WLA A; 1LTW A; 1BZ0 B; 2QMB A; 2BLJ M; 1J7W B; 1C7C B; 2Z85 A; 1EWA A; 1MOC A; 1YOI A; 2HBF B; 4MAX A; 3UH5 A; 2HHB B; 4WJG A; 5KDQ A; 2R80 A; 3G46 A; 105M A; 1S61 A; 2Z6T A; 3ONZ B; 2HBS A; 1UFP A; 2ZLU B; 1D8U A; 5HU6 B; 2BK9 A; 2ZSN A; 1XZV B; 1GDL A; 1G09 B; 1F65 A; 4GZG A; 3MJU A; 5JGG B; 1YEV A; 2IN4 A; 1G08 A; 3BCQ B; 3PI3 A; 3AQ5 A; 2QSP B; 1URY A; 3OZV A; 3S65 B; 5E83 B; 2AV3 A; 1C7D B; 1FAW A; 1LJW A; 1Y85 B; 2WTG A; 3G4Q A; 1OJ6 A; 1HBA A; 3ZOM A; 4F6D A; 2LHB A; 4HHB B; 3FH9 A; 1A0U B; 1MNI A; 1O1J B; 1MTI A; 1JL6 A; 1Y5K B; 5JDO D; 3AT6 A; 1GCW A; 1GBU A; 1MLK A; 3VRE B; 1MYZ A; 3P5Q A; 1O1I A; 1MOD A; 1F63 A; 1WMU B; 3AQ9 A; 1Y4F A; 4FH7 A; 2R1H B; 4ZVB A; 2ZSO A; 1C40 B; 1GBV B; 2FAL A; 1J41 B; 1FLP A; 1O1M B; 1HGC A; 3NL7 B; 1CBL A; 1Y8H B; 1DWR A; 2VHB A; 1SDK B; 2QLS A; 108M A; 3TLD A; 4ZVA A; 3HXN B; 3OGB A; 1O1K B; 2HHD A; 1MLL A; 5EYJ A; 1BZP A; 3NMM B; 1DWT A; 1A6N A; 4G1V A; 1Y0T A; 4ODC B; 1VXF A; 1CH9 A; 1MOB A; 3NG6 A; 3QQR A; 4DWU A; 1YFF A; 3BOM B; 4NK1 A; 3EOK B; 1B86 B; 4G1B A; 1R1Y B; 5B85 A; 4G51 B; 3DR9 A; 5C6E A; 4N7P A; 3B75 A; 4B4Y A; 3ODQ A; 1MWD A; 4NXC A; 5ILM A; 4PQC A; 1IWH B; 1Y7Z A; 1RSE A; 1LFQ A; 1K1K A; 2H8F A; 1LH5 A; 1NPG A; 3VRG B; 2O5L X; 1MKO B; 1QPW A; 1YGF B; 1VXE A; 2QU0 A; 5F0B A; 1OUU A; 1AJ9 A; 3G4V A; 3WHM B; 3GQR B; 2B7H B; 2ZFO A; 2BKM A; 1C7B A; 1J3Y B; 1Y7G B; 1NPF A; 2ZS0 C; 1SDL B; 1CQX A; 1LA6 A; 1G0B B; 5C6Y A; 1DXD A; 1S6A A; 1HCO B; 3G4W A; 3WCP B; 1XQ5 B; 1ECN A; 1HDB A; 3E4N A; 1HJT A; 1Y0C B; 1UFJ A; 1RTE A; 1ABW A; 1CO8 A; 1CIK A; 3ZJL A; 4MU5 A; 1Y31 A; 3O7N A; 1BIJ A; 3G52 A; 1Y46 B; 5IKS A; 3K8B B; 1GZX B; 1XYE B; 3LR9 A; 1KD2 A; 1V4U A; 1XZ4 A; 4KJT A; 3UHG A; 1MOH A; 1ECO A; 5CHR A; 1CP5 A; 1RPS B; 2G11 A; 2H8D A; 5MBN A; 4WCH D; 1Z8U B; 2HBE B; 2ZST A; 1YVQ A; 3WR1 A; 2GDM A; 2D2M C; 1IOP A; 1DXV A; 1O1O A; 4O4Z A; 1THB B; 3PI1 A; 1Y35 B; 4WJG 1; 1SPE A; 3M3B A; 2D60 B; 1S0H A; 2O5M X; 1JEB A; 1J40 A; 1QXE B; 1QI8 A; 3A59 A; 1JP9 A; 2ZFB B; 4L2M A; 1AZI A; 3WCU D; 3WCV A; 3HEN A; 4U8U B; 5EET A; 4N7N B; 1ECD A; 1YZI A; 2GTL C; 3PT8 B; 1HBG A; 2O5Q X; 3A0G B; 3WI8 A; 1YDZ B; 3WFU A; 2ZLW A; 1MGN A; 3FS4 B; 1YHU D; 1YHE A; 2ZWJ A; 5EE4 D; 3GDJ B; 2DXM A; 1HDS A; 1LH2 A; 2NX0 A; 1Y8W B; 2ZS0 B; 1MDN A; 1IT2 A; 1URV A; 2G0V A; 3SDH A; 1DXU B; 2YRS A; 4ESA A; 3S66 B; 2HBD B; 3WCW D; 1CLS B; 1JP8 A; 4DC8 A; 3DUT B; 1PBX A; 3PI8 A; 2G0X A; 1HDA B; 1NXF A; 1A4F A; 1JF4 A; 1LFV A; 3W4U A; 2QFN A; 1DXT B; 2EB8 A; 2W6V B; 106M A; 2XKH A; 1YMB A; 1CG8 A; 1LH3 A; 1UMO A; 3WCT B; 2G0S A; 1ASH A; 5EOH A; 4KMW A; 2AUR A; 1A3O B; 6HBI A; 1A01 B; 1Y4Q A; 3PEL A; 5HLX A; 3IC2 A; 4L7Y A; 2H35 A; 4MQH A; 1HBB A; 3IC0 A; 3UHH A; 2MGF A; 3V2V A; 3GOU A; 3GQP A; 2D2M B; 2G10 A; 2O5B X; 3AG0 A; 2W6X A; 1HAB B; 2ZT4 A; 1BAB A; 3ORD A; 1Y7C A; 1MWC A; 4FWY A; 1BJE A; 2W72 A; 3TM3 A; 1Y22 A; 3HF4 B; 4UZV A; 2V1G A; 1Y0W B; 1NS9 A; 2W72 C; 2VLZ A; 3QM8 A; 1HHO A; 3MKB B; 1Y5J B; 4PQ6 A; 1MLF A; 1BZ1 A; 5JOM A; 1FSX A; 7HBI A; 1V4X A; 1YHR A; 1J7Y A; 1NZ5 A; 4N8T B; 1CH2 A; 1ABY A; 1Y7D B; 5ILR A; 1QXD B; 1RQ4 B; 3UH3 A; 1X9F C; 4MQC A; 1O1P A; 1DXC A; 5KER B; 1GLI A; 1DUO A; 2SPM A; 1GJN A; 5M3S A; 2ZLT A; 1Y01 B; 1XZU B; 1YIE B; 2MGJ A; 5HAV A; 2MGM A; 1FN3 B; 3MJP A; 1YEU A; 3BJ1 B; 4YU4 B; 1BZ0 A; 1YG5 B; 3UHY A; 3QJC B; 2HBF A; 3OO4 B; 1J3F A; 4H2L A; 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1LH7 A; 1IWH A; 2ZFO D; 3OZW A; 2AUO A; 1FDH A; 5CN8 A; 1T1N B; 3TM9 A; 1CH5 A; 3UHU A; 2D5X A; 3GQG A; 1NGK A; 1HGB A; 1UT0 A; 3WHM A; 3GQR A; 3NFE B; 1YGD B; 1H97 A; 1HAC A; 2LH7 A; 1HRM A; 1VWT A; 3D17 B; 1J3Y A; 3PIA A; 1MYG A; 6HBW A; 2MGB A; 3BJ2 B; 1SDL A; 3BJ3 B; 1J3Z A; 4NI1 B; 1CG5 B; 2GNV A; 1HCO A; 1NQP B; 3WCP A; 1JZM A; 5HLQ A; 2NRM A; 4X0L A; 4F4O B; 4XS0 A; 1A0Z A; 2MGL A; 4M4B A; 4YU3 B; 3UHB A; 2ZSY A; 4NZI A; 4MQI B; 3O89 A; 1GCV B; 2ZS1 C; 5CNC A; 1G9V B; 4LPI A; 2W6Y A; 3OO5 B; 1MYM A; 1SI4 B; 1DTI A; 1QSH A; 3QJB B; 1Y4P A; 5AB8 A; 5MBA A; 1H1X A; 1SHR B; 1JL7 A; 2VEB A; 2HBE A; 5EQM A; 1HBI A; 3SZK B; 4MXK A; 1HBH B; 1JF3 A; 1RVW B; 1YEQ A; 1EW6 A; 1THB A; 3WCV D; 1BVD A; 2GLN A; 3ED9 A; 3QJD B; 4NS2 A; 1HBS B; 1XZ5 A; 3UHN A; 2RI4 B; 1MTK A; 2QMB B; 3S1I A; 1MYJ A; 2HBG A; 3DHT A; 1QXE A; 2R80 B; 3A9M A; 1Y4V B; 2MGG A; 2MGI A; 1HSY A; 1MZ0 A; 3PT8 A; 1MYI A; 2DN1 B; 3D7O A; 3A0G A; 104M A; 1BZZ B; 4U8U C; 1YEV B; 1G08 B; 3HRW A; 1ECA A; 5D1V A; 1Y8W A; 2ZS0 A; 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