The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPKEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN ALPHA CHAIN
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| publication title |
Structure of mutant human carbonmonoxyhemoglobin C (betaE6K) at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-09-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4IT8 A; 1YG5 B; 3V2V A; 1CH9 A; 1B86 A; 3QM9 A; 1LFQ B; 3QM5 A; 3PT8 A; 3D17 B; 3NL7 A; 1CG8 A; 2ZSN A; 5CN5 A; 1NEJ A; 1BJE A; 1GLI B; 2G10 A; 3HYU A; 1N9F A; 2DXM B; 1BIJ B; 3ARK A; 5EET A; 1Y7D B; 1HAB B; 3GQR B; 1SPG A; 2W6Y A; 1BZ1 A; 1Y2Z A; 2AA1 A; 3P5Q B; 4UUR A; 1MYI A; 4MXK A; 3S1J A; 1J40 A; 3GYS B; 1SI4 A; 1BUW B; 3PT7 A; 4O2G A; 3HXN B; 2BNL A; 1Z8U B; 2OLP A; 4F6J A; 3UHW A; 1XQ5 B; 2GLN A; 1CQX A; 3RGK A; 1MBD A; 1K0Y B; 1CBL A; 1MWD A; 3AT5 B; 1IRD B; 1O1L B; 1HGA B; 3K3U A; 3HHB B; 3B75 A; 2HBD B; 1N9I A; 2O5L X; 3GDJ B; 4GZG A; 1FN3 B; 1JP9 A; 1G0A A; 1GCV B; 3WFT A; 2ZLT A; 3D1K B; 4MQC A; 1CG5 A; 1SHR B; 2RI4 A; 1FSX A; 1A6G A; 3WR1 A; 1YHE B; 1YHU C; 2G0V A; 3HF4 B; 3OZV A; 3QM6 A; 1O1I A; 2NSS A; 3WCU C; 2H8F B; 2R4Y A; 1VXG A; 3H57 A; 1YMA A; 1O1O A; 1QPW A; 3TM3 A; 1NAZ A; 112M A; 3ASE A; 1Y0D B; 1MYJ A; 2QLS B; 1V75 A; 2MHB B; 3PI4 A; 1Y4F A; 1DXD A; 1Y22 B; 2G3H A; 4F4O A; 3DUT B; 1J7W B; 2D5Z B; 1YE0 A; 1A6K A; 4MQJ A; 3FS4 B; 3PI9 B; 1A3N B; 1Y83 A; 4WCH D; 3UHB A; 3ZJO A; 1YOG A; 4TWU A; 1YIH B; 5CMV A; 5ILR A; 1Y4R B; 4C0N A; 1G0B B; 1RQA A; 2MGE A; 1RQ4 A; 2BK9 A; 1A0U B; 2ZFB A; 2V1F A; 5D5R A; 3UHK A; 1YHU B; 1X9F A; 3GQG A; 3ECL A; 108M A; 3A5A A; 1HGB A; 1YGF B; 3MOU A; 2MYD A; 5HAV A; 1IBE A; 1Y0A B; 107M A; 2FRF A; 3CY5 B; 2QSS B; 1MYF A; 2Z6N B; 1MNO A; 2VYZ A; 1J7S B; 2ZSX A; 2HHE B; 1GDJ A; 4O4Z A; 1V4W B; 1Y45 B; 1R1X B; 2QMB A; 3MYN A; 3A59 A; 5AZR A; 2G0Z A; 3QJD A; 1M6M A; 3ECX A; 1Y7Z A; 1F5P A; 1RTX A; 2ZFO D; 4F6G A; 3PEL A; 1J3Y A; 2D2M C; 4JAC A; 4NK2 A; 1O1J B; 3WCW A; 4YU4 B; 1MLR A; 2HZ2 A; 2DN3 B; 1Y8I B; 1ITH A; 1HV4 A; 5EUI A; 4XDI A; 2V1I A; 1IRC A; 1QI8 A; 3S48 C; 1EW6 A; 1N9H A; 3FH9 B; 3G4V A; 3NFE B; 1HDA A; 103M A; 1JP6 A; 4H0B A; 3QZZ A; 4N8T A; 5B85 A; 1SDK B; 1Y5K A; 1FDH A; 3D1A A; 4MQH A; 3WFW A; 3WCP B; 3OO5 A; 1Y4Q B; 1YEU B; 2ZSQ A; 1C7C B; 1VXB A; 3UHG A; 2R1H B; 1XZ5 A; 3HRW B; 3A0G A; 1S5X A; 1LH2 A; 2D60 A; 2LH7 A; 3BCQ A; 1WMU A; 1HBB B; 1YOH A; 1YEV B; 1O1K B; 1NWI A; 1Y7C B; 3UHT A; 1ABS A; 4ODC B; 1S6A A; 3E5O A; 5C6E A; 101M A; 2ZT1 A; 3IA3 B; 3LB3 A; 1MOD A; 1DO4 A; 2MYE A; 4FWZ A; 3UHQ A; 2CMM A; 1Y4P B; 3MJP B; 1HCO B; 3UH7 A; 2HBF B; 3CIU B; 4FWY A; 3BJ3 A; 5SW7 B; 5E6E B; 1Y5J A; 3EDA A; 2MGF A; 1FHJ A; 3R5I B; 106M A; 2WY4 A; 1IT2 A; 1DXC A; 1QXE A; 1BZ6 A; 3D7O B; 1YZI A; 5HU6 B; 2W31 A; 3QJC B; 1J3Z A; 1RVW A; 1V4U B; 4HBI A; 1AJ9 A; 2GDM A; 4MQG B; 3AT6 B; 2EVP A; 2O5O X; 1CH4 A; 1O1N A; 1MNH A; 1V4X A; 3WCV C; 1THB A; 2LH1 A; 1QXD B; 1YVT A; 1DWS A; 4OF9 A; 3QM7 A; 5JDO E; 2B7H B; 4DC8 A; 4ROM B; 1JF3 A; 1IWH B; 1QSH A; 5HY8 A; 1ABY B; 1HLB A; 2MGB A; 2VRY A; 2O5S X; 1A3O A; 1TES A; 4DC7 A; 2RAO B; 1LFL A; 1MBN A; 3VAU A; 1CBM A; 3OO4 A; 4HRT B; 2DN2 B; 2LH2 A; 3IC2 B; 3IXF A; 1Y8K B; 1C7B B; 6HBW A; 1LFV A; 2XKH A; 1Y09 A; 5HLU A; 2YRS A; 4F68 A; 1CMY B; 5CN7 A; 1HDB B; 3VRE B; 4MQI A; 3GKV A; 4F6I A; 4TYX A; 3QJE A; 2D6C A; 3TM9 A; 1Y85 B; 1MNK A; 4M4B A; 2OH9 A; 2GRH A; 3EU1 B; 1EMY A; 1OUU A; 1J41 A; 1X9F D; 4G51 B; 1DWT A; 3QM8 A; 1LFT B; 1YFF B; 5CNG A; 1IOP A; 1YE2 B; 1TU9 A; 5ILM A; 2W72 C; 4UIQ A; 3IC0 B; 1Y31 A; 2HBC B; 1O1P B; 1DXT A; 2D2N A; 3DR9 A; 3AQ7 A; 1OFJ A; 2BKM A; 3O7N A; 2GRF A; 1JP8 A; 3AG0 A; 3UHN A; 3WHM B; 2DN1 A; 2MGK A; 4U8U A; 1LA6 A; 2AV3 A; 1R1Y A; 2DHB B; 1A00 B; 3DHT B; 1XY0 A; 1GBU A; 3WTG B; 2MYA A; 1MLF A; 3WCW D; 1VWT A; 1F5O A; 1GCW A; 4YU3 A; 2LH5 A; 1XXT A; 1Q1F A; 3ODQ B; 1HBR B; 1MBO A; 1XZ4 B; 4B4Y A; 3SZK B; 1HBI A; 2ZFO B; 2Z8A A; 1MWB A; 2O5T X; 3GQP A; 4L7Y A; 2GTL C; 2M6Z A; 5JOM A; 1S5Y B; 1JY7 B; 2BWH A; 3WCT C; 2ZS1 C; 1MNJ A; 2ZLW A; 1MLN A; 3S65 A; 1YCB A; 3ZJP A; 3DHR A; 2MB5 A; 5EE4 D; 2SPO A; 2HBG A; 1Y8W A; 2EB9 A; 2R80 B; 3S66 A; 1SWM A; 4JYQ A; 1A9W E; 3E4N A; 1B86 B; 3PI3 A; 1NZ4 A; 1Y4G A; 1SDL A; 1GBV A; 3PT8 B; 4NXC A; 3NL7 B; 1CG8 B; 2VLX A; 4NI0 A; 2QU0 A; 1GZX A; 5KKK A; 2XYK A; 2GNW A; 2MYB A; 4ILZ A; 3R0G A; 1NEJ B; 4N7N A; 4F6D A; 3HYU B; 1ABW A; 1BZP A; 3M38 A; 5CNB A; 1DXV A; 1BZ1 B; 1FAW A; 1Y2Z B; 2AA1 B; 1YHR B; 4SDH A; 5EYS A; 1RQ3 A; 1NS6 A; 5CHR A; 1A4F B; 3ZJI A; 1MLM A; 4PQB A; 1J40 B; 3PT7 B; 1SI4 B; 2G0X A; 5C6Y A; 4O35 A; 2PEG A; 1T1N A; 5HLQ A; 3G4W A; 1S56 A; 1MYM A; 5ILE A; 2BMM A; 3AQ6 A; 2O5B X; 1DUK A; 2ZT4 A; 1BVC A; 2DC3 A; 1Y0C B; 1YMB A; 1XZ2 A; 1OJ6 A; 1G0A B; 3MBA A; 5CND A; 4X0L A; 1HBA B; 4O4T A; 1CIO A; 2ZLT B; 1LFZ A; 3M3B A; 4MQC B; 2V1J A; 1UMO A; 5D1V A; 3ZOL A; 1CG5 B; 5KDQ B; 1C7D B; 1YEQ B; 1CLS B; 1UC3 A; 2V1E A; 1MLL A; 1CH1 A; 1O1I B; 1M9P B; 1NZ3 A; 3VRG B; 1HBG A; 4HHB A; 4NK1 A; 4ESA A; 2V1K A; 3S1I A; 3ONZ A; 1LFY B; 2FAL A; 3MKB A; 1CO8 A; 1JWN A; 3G53 A; 5F2A A; 3PI1 A; 1V5H A; 4HSW A; 3VHB A; 1V75 B; 2GRZ A; 2MGD A; 3MJU A; 1Y4F B; 1ECA A; 1BZZ A; 2VYW A; 3ZJR A; 4F4O B; 5JDO C; 1HDS A; 1MBS A; 1YE0 B; 2MGJ A; 1MBI A; 1YIE A; 3GKT A; 3UHC A; 1Y83 B; 1H1X A; 5CNC A; 1YG5 A; 2D2N D; 3NMM A; 1COH A; 2HZ3 A; 2ZS0 A; 1ECN A; 1RQA B; 4C44 A; 6HBI A; 3QJB A; 3HEN A; 2ZFB B; 3LB1 A; 3NG6 B; 4U8U D; 3ZJM A; 3H58 A; 1X9F B; 1MLO A; 3GQG B; 1OUT B; 3A5G A; 1XZU A; 3HEP A; 1HGB B; 1UIW A; 1GLI A; 3HEO A; 1MOB A; 2HHD A; 3K8B A; 1VXE A; 2ZLX A; 1DTI A; 3GQR A; 1YVQ B; 2SPM A; 3ARJ A; 2ZSY A; 1Y0T B; 1UVX A; 2JHO A; 5E29 B; 3P5Q A; 1AJG A; 1Y8H A; 1F65 A; 2QMB B; 1HBS A; 3EDB A; 3A59 B; 1BUW A; 1YDZ B; 4NZI A; 1Y7Z B; 4PQ6 A; 3W4U B; 1CH3 A; 2ZSO A; 2NX0 A; 2G14 A; 1XQ5 A; 1K0Y A; 1RSE A; 1HBH A; 3UI0 A; 1HV4 B; 1CP5 A; 3AT5 A; 5EUI B; 1BVD A; 3ZOM A; 1MLU A; 3HHB A; 4BJA A; 1G08 B; 5CN6 A; 1EWA A; 3NML A; 2QFN A; 3WFX A; 3BOM B; 1GCV A; 1Y4V B; 1G9V B; 1Y5K B; 3D1K A; 4MQH B; 1SHR A; 2LHB A; 3ECZ A; 1WVP A; 3HF4 A; 1XZ5 B; 3ZJL A; 2O58 X; 2AUO A; 3A0G B; 1S5X B; 2D60 B; 4F6B A; 2VM0 A; 1NIH A; 3BCQ B; 1VXA A; 4HRR A; 3ZH0 A; 4WJG 1; 2QLS A; 1YCA A; 2MGC A; 1JEB A; 3OJ1 A; 1MOA A; 1U7S A; 4MAX A; 2EKU A; 1GDK A; 2VEB A; 1HHO A; 1EBC A; 1Y4B B; 3FS4 A; 3BJ3 B; 4FC3 B; 1Y5J B; 5JGG A; 1FHJ B; 2QSP A; 4ROL B; 1DWR A; 1YIH A; 5KER A; 1G0B A; 1YZI B; 1Y5F A; 5EU2 A; 1I3D A; 4UZV A; 2GKN A; 1J3Z B; 1MDN A; 1RVW B; 1AJH A; 3M39 A; 3UGZ A; 5E83 A; 5M3S A; 1YHU A; 3HC9 A; 1KFR A; 5EQM A; 3TLD A; 2NSR A; 1BAB A; 1Y46 A; 3PIA B; 3WCU A; 3MYM A; 4XS0 A; 3CY5 A; 3OGB A; 2R4W A; 3ZJH A; 2GNV A; 1YVT B; 2HHE A; 2ZSR A; 2O5M X; 4M4A A; 1QSH B; 5HY8 B; 1LH1 A; 2V1G A; 3GOU B; 3ZJQ A; 2MYC A; 1YH9 B; 1MLK A; 1A3O B; 1LFL B; 1A0Z B; 4FH7 A; 1G09 A; 1BBB A; 1UT0 A; 4ZVB A; 2DN3 A; 1XZ7 A; 2W6X A; 4L2M A; 1BZ0 B; 1LFV B; 1Y8I A; 1Y09 B; 4MPM A; 2VLZ A; 3FH9 A; 1XZV B; 1VXD A; 1KD2 A; 2ZS0 D; 3QJE B; 2D5X B; 1JL7 A; 4M4B B; 3KMF C; 3PI8 B; 1S61 A; 4H2L B; 1OUU B; 1J41 B; 2MGI A; 1MZ0 A; 1Y4Q A; 1YEU A; 1EBT A; 2R1H A; 1Y31 B; 2D2N B; 1K1K A; 1NXF A; 1RPS A; 1VXH A; 1Y7G A; 4U8U B; 1HBB A; 1LA6 B; 1YEV A; 1O1K A; 3UH3 A; 1R1Y B; 4N7P A; 1QSI B; 1LH3 A; 1CH5 A; 2ZLU A; 4N7O A; 1PMB A; 2ZWJ A; 3OZU A; 4NXA A; 2D2M A; 1YEN A; 1DXU A; 1GBU B; 2R4Z A; 3SDH A; 1A9W A; 1UX9 A; 2EB8 A; 1JF4 A; 1JPB A; 1BIN A; 4MU5 A; 1Y35 A; 3M3A A; 1VWT B; 1GCW B; 1Y4P A; 1HCO A; 4YU3 B; 1V07 A; 1XXT B; 5E6E A; 109M A; 2NRM A; 3SDN A; 2ZFO C; 5B84 A; 2IN4 A; 3R5I A; 3EOK A; 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1MKO A; 1HDS B; 1ECO A; 3B75 B; 2QFK A; 2W72 A; 3UHS A; 2H35 A; 1YIE B; 4PQC A; 3NMM B; 2ZLV A; 1COH B; 2RI4 B; 1FSX B; 1DLW A; 1CH7 A; 2ZS0 B; 3WR1 B; 1MGN A; 1MOC A; 1X9F C; 3QJB B; 4O1T A; 1I3E A; 3U3E A; 1MLQ A; 1XZU B; 2MGA A; 1UIW B; 1HSY A; 2HHD B; 5CHQ A; 2D2M D; 2SPN A; 1NWN A; 1DO3 A; 3K8B B; 2ZLX B; 1O1O B; 1QPW B; 2HCO A; 1HGC A; 3UHI A; 1F63 A; 1DO7 A; 1NS9 A; 1YHR A; 1Y8H B; 1YMC A; 3BJ1 A; 1HBS B; 3D4X A; 2FRI X; 1MTJ A; 1A4F A; 3MN0 A; 3ORD A; 4WJG A; 1MLH A; 3UHX A; 2GTL A; 3WCW C; 1S0H A; 1XCH A; 4MQJ B; 3WCT A; 2ZS1 A; 1NZ5 A; 1NPG A; 1HBH B; 4G1V A; 1CH2 A; 2VHB A; 1LFQ A; 4FH6 A; 1RQ4 B; 3D17 A; 1Y0C A; 3E55 A; 1S69 A; 2AV0 A; 2ZSZ A; 1HBA A; 1YOI A; 1IBE B; 2DXM A; 1BIJ A; 1Y7D A; 1HAB A; 5EE4 C; 5KDQ A; 1C7D A; 1YEQ A; 1FLP A; 1MTI A; 1CLS A; 2BLJ M; 4AVD A; 1X46 A; 4NS2 A; 4DWT A; 3A5B A; 1M9P A; 3A9M A; 2ZT2 A; 3VRG A; 1CQ2 A; 3GYS A; 1NIH B; 3QJD B; 1LFY A; 110M A; 3G52 A; 1LTW A; 3HXN A; 4HRR B; 1IDR A; 3PEL B; 1J3Y B; 3WCW B; 3UBC A; 3BA2 A; 3GLN A; 1JEB B; 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