The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTADVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| total genus |
18
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QMT A; 2JXT A; 2EEL A; 5HG2 A; 1XCT L; 2NMQ A; 2IGG A; 1MI0 A; 2RMM A; 3FIL B; 5HHD G; 4MAC A; 1PGA A; 4GLS C; 3UI3 A; 1IGC A; 2I38 A; 2ZW0 A; 2IGD A; 1K50 A; 3MP9 A; 1PGX A; 2QSD A; 1HZ5 A; 4HJG E; 1C9F A; 1GB1 A; 2ON8 A; 4OZA A; 2OED A; 4HKZ E; 1JML A; 2KWD A; 1Q10 A; 2PW9 A; 2JSV X; 1ZXH A; 3V3X A; 2KQ4 X; 2LGI A; 4IKG A; 1F2R I; 2PTL A; 1P7F A; 1XF5 L; 1FCL A; 1GB4 A; 2ONQ A; 1IBX A; 2LHE A; 2KDM A; 2J53 A; 1K53 A; 2J52 A; 1F2R C; 2KN4 A; 1HEZ E; 2N9L A; 2N9K A; 1IBX B; 1YMH E; 2K0P A; 5JXV A; 1IGD A; 2PLP A; 3GB1 A; 2JWU A; 2LHD A; 2I2Y A; 1FCC C; 4KGR A; 2JU6 X; 4D2K A; 5BMI A; 1PGB A; 2KAC A; 1EM7 A; 1MVK A; 1MHX A; 4KGT A; 1MPE A; 2GI9 A; 1K51 A; 1HZ6 A; 5BMH A; 1FD6 A; 2N7J A; 3FIL A; 1YNT E; 2ZW1 A; 5HI1 A; 1MHH E; 1QKZ A; 2RPV A; 2JZP A; 1XCQ L; 4OZB A; 1UWX A; 4OZC A; 4WH4 A; 1KH0 A; 1P7E A; 1D4B A; 2LUM A; 1K52 A; 5HFY A; 2GB1 A; 2IGH A; 4KGS A; 4IOI E; 5BMG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KD0 A; 2HJ8 A; 1WJU A; 2I1K A; 3W5V B; 1E7P B; 1XD3 B; 1D6E C; 1VZ6 A; 2JXT A; 2K8B A; 1MFW A; 1XT9 B; 1UGJ A; 3OJ4 B; 1VJK A; 2L0F A; 3MC9 A; 3PZD A; 2JYT A; 4RH6 A; 2KJ6 A; 2LJ5 A; 2IGD A; 1NI3 A; 4WJQ A; 4FBJ B; 2KAJ A; 4EZJ A; 3W2D A; 2VH2 A; 4PT5 A; 5MPO A; 4ICU A; 3NHE B; 1CZP A; 4DXG A; 4W9K A; 3MC0 B; 2Y3A A; 1EU3 A; 1EWY C; 3A1Q B; 5AEK B; 2EKI A; 1T5X D; 2PVO D; 1F2R I; 1P7F A; 1PQS A; 2XK5 A; 3KYC D; 2K6Q A; 1TS4 A; 1ZW7 A; 4OVU A; 4ZRP A; 3AB5 A; 4MT5 A; 1FFU A; 4IDI A; 4MH0 E; 2N9L A; 1XLQ A; 3BII D; 4B0E A; 3GE3 C; 2MBE A; 3I3T B; 2WXO A; 3AEB B; 1CK1 A; 1IGD A; 4USA A; 2PLP A; 1X1M A; 2G45 B; 2D11 A; 4HEA 1; 2CJN A; 2Q5W D; 2Y5B B; 1HXY D; 4XDC A; 4NAM A; 2LVO A; 1EU4 A; 1MPE A; 1FXI A; 4WWM A; 3I63 C; 1UWM A; 4DHJ D; 2D3B A; 3PZ7 A; 1EWC A; 1WJN A; 4C4V B; 4PS7 A; 2KWC A; 4OZC A; 4S17 A; 4KIK A; 4GDL B; 4XDD A; 3GZN I; 2SAK A; 1JQ4 A; 3TEW A; 1WXS A; 4JE3 B; 3DVG X; 4M01 A; 3KVF B; 4US8 A; 3AED B; 2NTS A; 2ZEQ A; 5HG2 A; 1I4G A; 3RZW C; 1ESF A; 3RD2 A; 1VD2 A; 3HVD A; 3VUY A; 1S1Q B; 4MGI E; 1L5P A; 1VRA B; 4RM8 A; 1N6Z A; 4FLH A; 1PGX A; 5AUI A; 1QOA A; 1FM0 D; 3ZJV A; 2O2V B; 1FEH A; 3AEC B; 2FCS A; 3UF8 A; 2MLB A; 3A1Q A; 3TMP B; 1K8R B; 3B2G A; 5KHO A; 2NCN A; 5L83 A; 2MCN B; 3NY5 A; 1SBB B; 3WAL A; 1GB4 A; 3GZN B; 3AE7 B; 4P6V F; 4WWN A; 2XN9 C; 4WWP A; 2N9K A; 3ABV B; 3Q3J A; 5JXV A; 3DBR I; 3NZS A; 3DWM A; 3KWL A; 1IUE A; 4AP4 C; 4DXF A; 3AE1 B; 1ISN A; 2BWE S; 2ZPN A; 1R7S A; 2WU2 B; 3BK2 A; 1V5O A; 3ZVV A; 1MHH E; 1ZDV A; 2L76 A; 4HRS A; 1DOX A; 4GDL A; 1T6B X; 1YQ4 B; 2PPH A; 1RM6 C; 4WUR A; 3O65 B; 4W9D A; 4ACF A; 2PE9 A; 1WX8 A; 4WH4 A; 5AUK A; 4WQO B; 2IYD B; 4WJO A; 3EA6 A; 1D4B A; 3DVN V; 3NOB A; 4JWS C; 4M8M A; 4IM2 A; 4W9J A; 2JPH A; 3P42 A; 3ZUN A; 2UYZ B; 1QZE A; 4C80 A; 1FMA D; 1V97 A; 3P2B A; 3DBR B; 3RT3 B; 1UUP A; 1I42 A; 3ZJT A; 2N7E A; 4GLS C; 2DLB A; 2KN5 A; 1Q5W B; 3MJW A; 2JRI B; 1YN5 A; 3VR9 B; 3UQB A; 3SEB A; 3VTU A; 2K8H A; 1WXV A; 4N58 A; 3BVZ A; 2LZ6 A; 1C79 A; 1XEE A; 3V3X A; 1NDD A; 3I9V 1; 2MRP A; 3NZ3 A; 2LAS A; 3ZDT A; 4KVG B; 4BFR A; 2J52 A; 1F52 A; 1SJE D; 1WJ6 A; 3NG0 A; 1E7V A; 2M17 A; 1SJH D; 1V9J A; 3KH0 A; 1TZO A; 2YVC A; 4HPP A; 2MWS B; 1XLP A; 4ASW C; 3VH3 B; 1LXD A; 4H2A A; 3X0W A; 3ETR A; 4EZK A; 1ROE A; 3APD A; 1PFD A; 4LDT B; 2PJH A; 2BVC A; 1E10 A; 1V80 A; 1SB3 C; 2CU1 A; 3Q3N C; 3AV8 A; 2GBM A; 5D3I B; 1QOG A; 2PE6 B; 4B6W A; 4KZC A; 2FE8 A; 2KWV B; 4XC2 A; 4LK0 M; 3AE4 B; 1SSN A; 1J19 A; 3ONS A; 2L00 B; 2CS4 A; 1CMX B; 1KFY B; 4W9C A; 3DBH I; 3LB8 C; 3R2T A; 1OQR A; 3VQI A; 4KGS A; 2KX0 A; 4IOI E; 2O6V B; 3AI5 A; 4CQN A; 4YTN B; 4LLG M; 1IYF A; 2W55 A; 4FJY A; 1P3Q U; 3MHZ A; 5J17 A; 2MW5 A; 5E6P A; 2RD0 A; 1MI0 A; 2KC2 A; 3ZXV A; 1EUV B; 2JY6 A; 3ZQ4 A; 3W1Y A; 2IO3 B; 2LXC A; 1TYG B; 4HJG E; 4RMA A; 2L32 A; 5JHB A; 4LCD E; 2N9X A; 2WLB A; 4AJY B; 3PT2 B; 5KHQ A; 3ZO5 B; 2IDY A; 1Q10 A; 3AXC A; 2PW9 A; 5EE1 A; 2KWU B; 2EMT A; 1E6E B; 4B9K A; 5E6N A; 3ZNH B; 1I4R A; 1RFA A; 1J0G A; 3CIR B; 3Q2A C; 1H8C A; 3W5U B; 3DBH B; 1WGH A; 1QOF A; 1D5M C; 4XYC A; 3RCZ A; 1Y56 A; 3Q8B A; 4FJV B; 1LM8 B; 3PV1 A; 1TS3 A; 1KTK A; 2MP2 B; 2V1Y A; 1L4Z B; 5BMI A; 3Q3M C; 2G1E A; 3ZNI D; 1ZXI A; 2K1F A; 2BB6 A; 2DEN B; 2LFI A; 3WIM A; 4EE2 A; 2CHW A; 1QIL A; 2DAJ A; 4LDT D; 4ARC A; 4JGH B; 1XCQ L; 5G2N A; 3MFG A; 4R3D A; 3BVM A; 1MJD A; 3K9O B; 4TUU A; 1UEL A; 2UWQ A; 2BS3 B; 4BVU C; 1SE2 A; 3DHG C; 3FKY A; 2BKR B; 4B95 A; 3P1M A; 2MBH A; 4K7U A; 1QT9 A; 2O6V D; 3M63 B; 4URK A; 4MH8 A; 5HHD G; 3U4E G; 1V5T A; 2OJW A; 2ZNV B; 1KM7 A; 4N59 A; 1JW9 D; 4M0W B; 1V1P B; 2M0A A; 2DBY A; 3N1Z C; 1QF6 A; 1N5W A; 3HUI A; 3AE8 B; 4FAD A; 2CHZ A; 3GS2 A; 1YJJ A; 2MJD A; 3S2A A; 1T0Y A; 4L1B A; 4RFB A; 2ZCC A; 2DNF A; 5AZH A; 1L0V B; 1Q1O A; 2HD5 B; 2KQ4 X; 1E7U A; 2KDF B; 3U30 A; 3TL5 A; 4K1R B; 4NJ6 A; 2M4N A; 1SXT A; 4ICV A; 2DYB A; 1D5X C; 1H4R A; 1EF5 A; 1FFV A; 3EFC A; 1NEK B; 4KSL C; 4TQ1 A; 2BB5 A; 2IZV B; 2H89 B; 3RUI B; 1S3S G; 4BKS A; 3DCG A; 2LHD A; 2I2Y A; 2QJL A; 1WJ4 A; 4KSK C; 3HVZ A; 4WQM A; 1N63 A; 5EE3 A; 1EM7 A; 1HE8 A; 3T8M A; 1GUA B; 3FC4 A; 3PHX B; 3MJ5 A; 3U7Z A; 2GI9 A; 3T9L A; 5JZE B; 4M8N A; 2E3T A; 5JHA A; 3QJZ A; 3FIL A; 2V4I B; 1YNT E; 1P9D U; 2XK5 B; 4A90 A; 2Z0D B; 2JX5 A; 4IWQ A; 4BZA A; 2WXQ A; 4ANV A; 2DYO A; 3QAQ A; 4HDO A; 1T0S C; 1P7E A; 1VR9 A; 2BT6 A; 2LJI A; 2PVG C; 3B0A A; 1WF9 A; 2MJE A; 3PTF C; 2IY1 B; 5EDS A; 4A6Q A; 1YN4 A; 2INP E; 2M0X A; 1FXA A; 4IWO A; 1XCT L; 2NMQ A; 2IGG A; 2HE7 A; 2ZPY A; 4UDU C; 3AE2 B; 4DXA B; 4M0W A; 3U7D A; 2Z59 B; 2D3G A; 4IM3 A; 1B1Z A; 4ZHO A; 4DHZ E; 4ANU A; 4NY0 A; 3DQV A; 2BTE A; 1ZGU B; 4OZA A; 1I7H A; 1LQB A; 1UBI A; 3NUH B; 4REZ A; 4KDL B; 1YJI A; 1WGR A; 2QIE B; 3UIO B; 3I57 A; 4IUM B; 2JXX A; 1JWU D; 1FCL A; 4IWP A; 1JAL A; 5BO4 B; 2L52 A; 2KMA A; 1YQ3 B; 1Z2M A; 1ACC A; 3NZU A; 4ITK A; 4G11 A; 4MGZ E; 4P16 A; 4ANW A; 5DPS A; 1YOV B; 2JWU A; 1SE3 A; 4HCP B; 3TEX A; 2KTF A; 3IT4 B; 2WS3 B; 3OLM D; 1OTR B; 1TT5 B; 3ZTC A; 3ZJU A; 2XNA C; 1V2Y A; 2GBK A; 1FRD A; 2LMC A; 4A3P A; 2X8X X; 1K51 A; 1ZOY B; 1P1A A; 2N7J A; 2DX5 B; 2D07 B; 1J7B A; 1SGH A; 2ZVO A; 4BBN F; 1C4A A; 2JWZ A; 2K3U A; 3BK1 A; 3ZKJ C; 2DZK A; 4BKT A; 1C77 A; 3RNE C; 2BS4 B; 2JZP A; 2LGY A; 2L3Z A; 3SFD B; 2WXN A; 4GU2 A; 3R3M A; 2FUH B; 2FNJ B; 1E8X A; 3E56 A; 2WXI A; 1VCB A; 2KMC A; 2G4S A; 2ZNV C; 5D6J B; 2LGX A; 2PIA A; 3I5J C; 1HTQ A; 1TKG A; 2WQY B; 3BYT B; 3PSE B; 1VLB A; 5LLI A; 3A33 B; 3V05 A; 4EUT A; 3C8Y A; 1DOY A; 3QCA A; 1WGD A; 1C4P A; 3CWI A; 2D10 A; 1NYQ A; 2E6X A; 3ZYY X; 2BPS A; 1MG4 A; 1WIA A; 2IPK D; 1SIF A; 3Q8A A; 1EO6 A; 3ML8 A; 2BYT A; 2B76 B; 3KWV A; 4GIV A; 3HIZ A; 1FO4 A; 4A3O A; 1JML A; 4IM0 A; 2PEA A; 2FUG 1; 2J0J A; 4C00 A; 1N60 A; 2KVR A; 5HKH A; 1AN8 A; 4YSY B; 3EEC A; 3RNB C; 3TUO A; 2KHW B; 2DZI A; 4IG7 B; 2PTL A; 4JQW C; 4BOS C; 1JWS D; 2EKE C; 4LNO A; 5J18 A; 2I1J A; 1GJZ A; 2Y5P A; 2J0K A; 3LJ3 A; 4M00 A; 2WDR B; 3SFE B; 1GPX A; 2L83 A; 4GN1 A; 2DYM A; 4DQO C; 1QOB A; 1QLB B; 5CHF A; 1I4X A; 3AU5 A; 4WJP A; 3SDL C; 3IFW B; 2KDE B; 3KYD D; 3RMK C; 1PGB A; 2WHI A; 1ZDX A; 2WDQ B; 3EUB 2; 3NS8 A; 5G55 A; 5TR5 A; 3Q3F A; 1UF0 A; 2GMI C; 1GC6 A; 2WYQ A; 1RLF A; 2WXF A; 4II3 B; 3ZXR A; 2QHO A; 5DCN A; 2MHJ A; 3L16 A; 2RPQ A; 4RCO A; 1KRH A; 1FPY A; 2B3A A; 3LYY A; 3RI7 C; 5C23 A; 2BYV E; 4JWU C; 3SU8 X; 4CO7 A; 1K52 A; 3C0R B; 1C3T A; 3ECI A; 4JLC A; 5D94 A; 5L95 C; 1NYR A; 2MH7 A; 1L0Y B; 2W54 A; 3ENE A; 1E0Z A; 2NPT A; 1SF0 A; 1I4H A; 2KJR A; 3NS1 A; 2LI5 A; 4ZRJ A; 2V3N A; 5I4D A; 1HZ5 A; 2IY0 B; 5IKC M; 3B2F A; 3R8B A; 4A8X C; 3PO0 A; 4ANX A; 4LJP B; 4US9 A; 3WCQ A; 1XLN A; 3TEY A; 1TIF A; 3DHI C; 5DPW A; 3W9C B; 3IG3 A; 1J7A A; 3EFU A; 4O1N A; 1YIW A; 2JQR B; 3PPA A; 1NEN B; 1L0X B; 1CJE A; 4K3B A; 3KLS X; 2LHE A; 2J53 A; 3RFZ B; 2KN4 A; 1TKE A; 4HK2 A; 3L4P A; 1C78 A; 3ZNG C; 3PRM B; 2CU3 A; 4WIP A; 4RGT A; 2HDE A; 5JH5 C; 3QK0 A; 2OOB B; 4HRO A; 2DHZ A; 4KDI C; 1TY2 A; 2NS5 A; 1WR6 E; 3ZIM A; 1JRP A; 4EZL A; 2JU6 X; 2KKC A; 5EE0 A; 3MTN B; 1YJ1 A; 4A9A A; 4XX5 A; 5BMH A; 2X38 A; 3QQ8 B; 5HI1 A; 2A5U A; 3BIN A; 4GXB A; 3GE8 C; 1E8W A; 1JCK B; 1AYF A; 2K8C A; 1ZPS A; 2WXR A; 1UWX A; 1TS5 A; 2R61 A; 2AQ2 B; 4HLE A; 1RAX A; 2L05 A; 1N5X A; 2V3P A; 1Q0W B; 4HPM B; 2KDI A; 1QQR A; 2L7R A; 2PKO A; 3VHT C; 2BYF A; 4RM9 A; 2MJ3 A; 1WGK A; 4XWW A; 1F0Z A; 1UD7 A; 3PZ8 A; 1PGA A; 1WX7 A; 3UI3 A; 3AE9 B; 4N6E B; 4DDI D; 1K50 A; 2D3A A; 3QHT A; 1KOT A; 2R2O A; 3V60 A; 3T3N A; 4RGM A; 3APC A; 5T8I A; 3DVG Y; 1RYJ A; 2JVC A; 2KO3 A; 3ZRF A; 2HTM E; 1ZXH A; 3Q8E A; 1L6V A; 4GDK A; 4TSS A; 5IA7 A; 3E9S A; 3HRD D; 3BY4 B; 2KDM A; 2NTT A; 2MX2 A; 1HEZ E; 2N4F A; 1WZ0 A; 2MSE D; 2L8J A; 2LVP A; 1YD8 U; 1A5R A; 3AE5 B; 3GB1 A; 5C3J B; 2WXM A; 3D32 A; 3SR6 A; 3VTW A; 1BML C; 2WXH A; 3AE6 B; 2Z0E B; 3NVW A; 3WAP A; 1ET9 A; 2MQJ A; 1FD6 A; 2RDH A; 1Z5S B; 4DWF A; 4EOY A; 2ZW1 A; 4J3O D; 4LJO B; 3WA0 A; 1U4A A; 1T0R C; 4RF1 A; 1E8Z A; 3MC8 A; 2RPV A; 2N1V A; 1IP9 A; 1WWT A; 3P4R B; 3QX1 A; 1RFK A; 1ZP0 B; 4EFO A; 1OEY J; 2KQ7 A; 2KMM A; 2YLM A; 4IC7 B; 3KUZ A; 4I6L B; 3H8H A; 3U2S C; 3N3K B; 5BMG A; 1BT0 A; 1NBF C; 2AQ1 B; 1XLO A; 2FCN A; 2ZJD A; 2LGS A; 2WWZ A; 4CHK A; 3QIJ A; 3B9J A; 1L2N A; 2MBB B; 5H92 C; 4XE0 A; 3Q8C A; 3LDZ E; 2JZ3 B; 1RRB A; 3L17 A; 4XGA B; 3FIL B; 2K25 A; 3B1L X; 2YEP B; 4ZRQ A; 1UNS A; 2GBR A; 2FBW B; 2JZZ A; 3A9J B; 2FAZ A; 4FXC A; 1WM2 A; 4IW0 A; 1NI2 A; 1VZ7 A; 2LXA A; 2MBQ A; 4J6I A; 2BF8 B; 1YX5 B; 2ON8 A; 3H7S A; 2DZM A; 2M56 B; 1KLV A; 2GBN A; 4RNA A; 2N0S B; 3L0W B; 1WRI A; 1OQQ A; 2WXJ A; 2JYE A; 2KQS A; 4W9F A; 3QA8 A; 2KNB A; 3H6N A; 2JSV X; 2J4X A; 3RYT A; 1TTN A; 3VRB B; 5TSS A; 4MM3 B; 1WI0 A; 3VUW A; 1L7Y A; 2CR5 A; 3URY A; 3ZDM C; 2IBI B; 4Q2J A; 2G9H D; 3AEF B; 4A20 A; 5CHW A; 2IJ0 A; 2WXK A; 3DBL I; 2N9E B; 1KLG D; 4ZHP A; 3Q6B A; 3PHW B; 4K81 A; 4YTM B; 1BUI C; 1N61 A; 2Y5C A; 3ZNZ B; 2VH1 A; 3HM6 X; 3CMM B; 2N7D A; 3VVW B; 5LNK 1; 3QWZ B; 4MEL A; 2DAF A; 2WDT B; 4HDQ A; 2WDV B; 3K9P B; 4MSQ B; 1CQV A; 3KQ4 A; 1B9R A; 4HXD A; 2W3S A; 2VRR B; 3AE3 B; 1WGG A; 4PYU A; 4QAY A; 1WMH A; 3W1S A; 5DPR A; 3NVZ A; 5HFY A; 3VH4 B; 2KOX A; 2V0G A; 2D3C A; 5CHV C; 4W9E A; 4BKS D; 3PRZ A; 3VTV A; 4FN2 A; 4GSW A; 3DBL B; 3A9J A; 3AMZ A; 1WE7 A; 3CST A; 2RMM A; 2KFK A; 4N9F 4; 4KKJ A; 4AS1 A; 2NVU I; 4FHK A; 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