The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTADVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| molecule keywords |
Protein L
|
| total genus |
18
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MPE A; 4KGR A; 1MI0 A; 2QSD A; 1F2R C; 2JXT A; 1PGX A; 2LGI A; 1P7E A; 4OZC A; 1KH0 A; 4KGT A; 1QKZ A; 2GI9 A; 2JZP A; 4HJG E; 1HZ6 A; 5HG2 A; 2J52 A; 5HHD G; 1K53 A; 2KAC A; 2IGD A; 1ZXH A; 4MAC A; 2PW9 A; 1Q10 A; 1JML A; 1PGB A; 5BMG A; 1XCQ L; 5HI1 A; 1C9F A; 2PTL A; 2ZW0 A; 5BMI A; 4D2K A; 4WH4 A; 2I2Y A; 3GB1 A; 2ONQ A; 2K0P A; 2N9K A; 3UI3 A; 3V3X A; 2RPV A; 1P7F A; 2N7J A; 2IGH A; 2LHD A; 4HKZ E; 2PLP A; 2N9L A; 5JXV A; 4IKG A; 2ZW1 A; 1IGC A; 1GB1 A; 2LUM A; 1K52 A; 4OZA A; 1MHX A; 2JSV X; 3FIL B; 2I38 A; 2OED A; 2KDM A; 2KQ4 X; 1MHH E; 4OZB A; 4GLS C; 1IBX B; 3MP9 A; 3FIL A; 2KN4 A; 1IGD A; 1HEZ E; 2JU6 X; 1PGA A; 4KGS A; 1FCC C; 1UWX A; 1K50 A; 1FCL A; 1FD6 A; 1F2R I; 1IBX A; 5BMH A; 2EEL A; 5HFY A; 2ON8 A; 1K51 A; 2LHE A; 4IOI E; 1XF5 L; 1EM7 A; 2J53 A; 1GB4 A; 1HZ5 A; 2RMM A; 1YNT E; 1D4B A; 2IGG A; 1YMH E; 1MVK A; 1XCT L; 2JWU A; 2NMQ A; 2KWD A; 2QMT A; 2GB1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JPH A; 1WMH B; 1V97 A; 3RPF C; 2K6Q A; 2MHJ A; 3L10 B; 4KKI A; 5G2N A; 2J7Q B; 1WGK A; 3U8Z A; 2N0S B; 1MI0 A; 4AJW A; 2BW2 A; 1PGX A; 2MA9 B; 1RFA A; 4ICU A; 4MGZ E; 2MBO A; 5IN7 A; 3KUZ A; 4II3 B; 4E3C A; 4YTP B; 1E7U A; 3Q3J A; 4XWT A; 3KLS X; 1SJE D; 2PE6 B; 2IGD A; 2N4F A; 4BKS A; 1CZP A; 1YN4 A; 2MRP A; 4AOF A; 3SFD B; 2DEN B; 5GXG B; 2FCQ A; 3APF A; 3P1M A; 3ZJT A; 1UBQ A; 4PK1 A; 2WU2 B; 1UD7 A; 2E3T A; 2V9H A; 4WAA A; 4MGK E; 4FAD A; 3DVN V; 5CTR C; 5GMV A; 1WSP A; 4BKG A; 3EA6 A; 2ZJD A; 2WXQ A; 2M0A A; 1ZP0 B; 2LHD A; 1C4C A; 1IGC A; 1EU4 A; 4K3C A; 2NBW B; 2K9X A; 1PDX A; 3VH4 B; 2YLM A; 3H9D A; 4WWN A; 2BWF A; 1V5O A; 3BY4 B; 2JX5 A; 2W3S A; 3RN9 C; 3Q3F A; 3FIL A; 3QCA A; 3PO0 A; 1HEZ E; 2DZI A; 1IBX A; 2Z0D B; 2FCN A; 3NY5 A; 1XF5 L; 1EM7 A; 2H89 B; 4RCO A; 2D5G A; 3MC9 A; 4H2A A; 1ENF A; 1D4B A; 3L13 A; 2KWD A; 4XC2 A; 3L4P A; 1TKE A; 3EHV A; 2EKE C; 4EZJ A; 1RM6 C; 2KHW B; 3LDZ E; 1WM3 A; 1F52 A; 3SU8 X; 5KHO A; 3W1S A; 1ROE A; 4KX6 B; 4OZC A; 3VAW A; 2JZP A; 2Q5W D; 3V6E B; 2DNF A; 3BVZ A; 3VTU A; 3AB5 A; 1C77 A; 1E0Z A; 1YX5 B; 2LEK A; 2DYB A; 1OQY A; 4R3D A; 3GP7 A; 2WLB A; 1YN3 A; 4HPP A; 5BYS A; 5DPS A; 3WAL A; 1DOI A; 4HRO A; 1SGH A; 3VFK A; 2K6D B; 1Q0W B; 1UF0 A; 3V3X A; 3T9L A; 2KN5 A; 1SE3 A; 4ZYS A; 3QWZ B; 4BBN C; 2FUG 1; 5IAA C; 2KAJ A; 3KVF B; 1LQB A; 1FEH A; 3AE4 B; 1CMX B; 2QHO A; 3AEF B; 1NEK B; 3APC A; 3VVW B; 1FXI A; 2KDE B; 1KLU D; 2RR9 A; 1R4N I; 3SEB A; 2KT7 A; 4MDK E; 1TKG A; 4EOY A; 5L95 C; 3PRM B; 2KQ4 X; 1WXQ A; 2M1M A; 1VZ7 A; 1V1O A; 2MSE D; 3RYT A; 1XLN A; 2KTR A; 2JWZ A; 2I1K A; 4QAY A; 1WGY A; 1K51 A; 2FCS A; 3U52 E; 4FUL A; 1FM0 D; 2NR2 A; 1D5Z C; 3GE8 C; 1YQB A; 2LAS A; 2C60 A; 1D5M C; 3DHG C; 2WXR A; 1U4A A; 2JXX A; 2ZNV B; 2YVC A; 1OFF A; 2VH2 A; 3D32 A; 4IUM B; 3Q2A C; 1L6U A; 3IT6 B; 1N61 A; 4MGI E; 1C4A A; 1TS4 A; 3NG0 A; 4IM3 A; 4W9C A; 2M17 A; 2LI5 A; 1FRD A; 4FLH A; 2QDF A; 3AU5 A; 3NVY A; 3BYY B; 3NUH B; 4GXB A; 4MJS B; 3R7R A; 4LJO B; 5LLI A; 5IOI A; 4KGT A; 2IJ0 A; 1WE7 A; 2V3P A; 1C3T A; 3Q8C A; 1RWS A; 3T3O A; 3FKY A; 3JYU A; 2CU3 A; 2DLB A; 1JWM D; 2WXM A; 1QZE A; 3DVG Y; 4RGN A; 5J17 A; 3ZNH B; 3L16 A; 4KIK A; 2PTL A; 5J2R A; 3IXS A; 3BVM A; 2REX A; 3JW0 X; 1SIJ A; 1HTO A; 2KWU B; 2W3R A; 2LUE A; 1FFU A; 1C78 A; 4P7I A; 3FAH A; 1P98 A; 4CO7 A; 2IBI B; 3M63 B; 2FUH B; 2R2Q A; 1V2Y A; 1QIL A; 3AMZ A; 2X38 A; 2KJR A; 1GC6 A; 1WXS A; 4S0R A; 3CMM B; 4OZB A; 3W1Y A; 4B6W A; 2WDR B; 2K39 A; 2BTE A; 2BT6 A; 3KWV A; 2Y5C A; 2AQ2 B; 4KZ0 A; 2W9N A; 1UH6 A; 3HM3 A; 3R7Q A; 5HFY A; 2GBR A; 1I4X A; 2KXJ A; 2WDQ B; 2L7R A; 4ANX A; 1WJ6 A; 4E74 A; 1IYF A; 3IG3 A; 1PYW D; 3W9C B; 1WGR A; 2HTM E; 2BS3 B; 3LB8 C; 2DYM A; 4W9I A; 1WXM A; 3ZO5 B; 3U7D A; 2DZM A; 1KLG D; 2JWU A; 3OWE B; 3RMK C; 4C80 A; 2KAN A; 3RNA C; 2ZNV C; 3PV1 A; 1FPY A; 5JZE B; 4LNI A; 2Z0E B; 1VZ8 A; 3PT2 B; 3I5J C; 4IM2 A; 1AYF A; 4GDK B; 4B0E A; 4BKT A; 2ZVN A; 2H88 B; 3QK0 A; 1E7V A; 3A33 B; 4HJK A; 3OLM D; 2G3Q B; 1JRU A; 3CF6 E; 1TY2 A; 3KUC B; 3B2G A; 3X23 A; 5HI1 A; 5FR6 A; 4FA6 A; 1ZGU B; 2BKR B; 2DZK A; 2RD0 A; 2L83 A; 3DVN U; 3TEY A; 1TJE A; 1K8R B; 1RYJ A; 2ZCB A; 4YXD B; 3SR6 A; 3AN1 A; 1WY8 A; 3WIM A; 1VRA B; 3RFZ B; 1L6V A; 4US9 A; 3AE3 B; 2QC8 A; 4DXA B; 1DGJ A; 2LZ6 A; 1JWA D; 4FBJ B; 3E9S A; 2O2V B; 2KFJ A; 3L0W B; 1E9M A; 3AE7 B; 3ZNI D; 2EMS A; 1I4H A; 4GLS C; 2RDB C; 1RRB A; 1UNS A; 2KDF B; 2CU1 A; 2G1E A; 3A4S C; 2HTH A; 2J4X A; 2KC2 A; 2FID A; 2ZPN A; 5FKA C; 1WMH A; 3OJ4 B; 5LXH A; 4ITK A; 1CK1 A; 3BK2 A; 3HK0 A; 1C4P A; 4C7Y A; 5C3J B; 2XNA C; 4TQ1 A; 3U4E G; 1RAX A; 2V4L A; 1I4G A; 2KMA A; 2Z59 B; 2M56 B; 2WXF A; 1OQQ A; 1NEN B; 2NPT B; 1MPE A; 3PLU A; 5D3D A; 5DPT A; 3SDL C; 3QIJ A; 5DPR A; 4ZRI A; 3KUD B; 4YSY B; 2LGI A; 1KH0 A; 1XLP A; 1KTK A; 1FO4 A; 3ZLZ A; 1MG4 A; 1WH3 A; 2KAC A; 2O6V B; 4WJP A; 1TY0 A; 2BYF A; 1WX8 A; 2K8C A; 2K22 A; 1OEY J; 2JUO A; 3VTV A; 4N58 A; 2EMT A; 3H7S A; 3HVZ A; 3BIN A; 3PGE A; 4ZHO A; 2RDG A; 2O6V D; 1A70 A; 5DPW A; 1CJE A; 2ONQ A; 3UI3 A; 1WX9 A; 1TBE A; 2V1Y A; 1JCK B; 3PLV A; 2L0F A; 4NNJ B; 2KO3 A; 1HXY D; 1CQV A; 3VR8 B; 5EDS A; 2ZW1 A; 2G9H D; 5H8Y E; 5EE0 A; 1UZX B; 2KWC A; 3RNB C; 4MT5 A; 3VR9 B; 3MJ5 A; 4HLE A; 3UIN B; 3DBL I; 4M0W B; 4PYZ A; 3RUI B; 3MFG A; 2ZPY A; 2GOW A; 3RNE C; 1PGA A; 1STE A; 1UWX A; 1F2R I; 1QT9 A; 1L0Y B; 3ML9 A; 4JWU C; 3GOE A; 4ANW A; 3TUO A; 1E8Z A; 1P0R A; 1ZDX A; 3S2A A; 1RLF A; 3DBR I; 2LJI A; 1FNU A; 2GB1 A; 3C0R B; 1F9J A; 3JSV B; 3DDC B; 4AP4 C; 3RCZ A; 3Q8A A; 5D3I B; 4K7U A; 4IWO A; 5CHV C; 3FC4 A; 4JIO U; 4TUU A; 1OEY A; 1V81 A; 4ICV A; 1LO5 D; 2JRH A; 3V60 A; 3WAN A; 2KDI A; 4JQW C; 1SIF A; 2NTS A; 4OHJ A; 5HHD G; 4WWM A; 3ZUN A; 2IO3 B; 4KSK C; 4II2 B; 3Q8E A; 1Q10 A; 3AV8 A; 4JPS A; 5I4D A; 3NVZ A; 3AE2 B; 1VDV A; 1XCQ L; 4WJQ A; 1WGG A; 4E71 A; 4NPN A; 2M4N A; 3SHQ A; 5IKC M; 1UEL A; 2PIA A; 3ZXR A; 1T5X D; 4O1N A; 4G3X B; 2KZR A; 4RF0 A; 4MH0 E; 3HVD A; 2MP2 B; 2XK5 A; 3TL5 A; 1OTR B; 2RGF A; 3DCG A; 4WWP A; 4A8X C; 2GRI A; 2WXP A; 4GGQ A; 1YJI A; 3UIO B; 3UGB B; 3HRD D; 3IFW B; 1MHX A; 5E6P A; 2NBU A; 4TSS A; 2OED A; 1TS2 A; 3ZIM A; 3RNF C; 2X8X X; 3PVL A; 2INC C; 2HJ1 A; 3RD2 A; 4PS7 A; 4YTN B; 2JU6 X; 4OW0 A; 3IVF A; 4KGS A; 1FCC C; 1FCL A; 1LXD A; 2D3A A; 3TIX A; 3TMP B; 2ON8 A; 2YEP B; 4EE2 A; 1GB4 A; 1TIF A; 4MSM B; 2RMM A; 5EE9 A; 3KQ4 A; 1YNT E; 2ZEQ A; 1WM2 A; 4MJS A; 3C19 A; 4ZDV A; 4WWO A; 1P9D U; 3I63 C; 1YQ3 B; 4ANV A; 2GBJ A; 1QOF A; 1M94 A; 1TZ1 A; 3U2S C; 4YSX B; 2ZCC A; 2JRI B; 3P2B A; 4K7S A; 1F2R C; 2JXT A; 1WR6 E; 1EF5 A; 4A9A A; 3RT3 B; 1PFD A; 1R7S A; 1OQR A; 4A90 A; 4IDI A; 4A55 A; 3V6C B; 2MX2 A; 1ZOY B; 2WP9 B; 1EWY C; 1WJ4 A; 2PW9 A; 1NYR A; 1V8C A; 3R2T A; 1DYQ A; 1J7B A; 2WS3 B; 4N59 A; 3R2I A; 2OJW A; 3DBS A; 4RFB A; 2BBC A; 1QLB B; 2HE7 A; 3U30 A; 3KYC D; 3GB1 A; 5CX3 A; 2K0P A; 3ZYY X; 2ASQ A; 1D5X C; 1TKY A; 1P7F A; 1JWS D; 4M8M A; 4NAW B; 3N1Y C; 4S17 A; 1N63 A; 3OJ3 A; 2CHW A; 2PVG C; 5E6J A; 1Y8R C; 2Y3A A; 3P4Q B; 3Q3N C; 2KNB A; 2BS2 B; 1ZKH A; 2ZZP B; 2AYO B; 5L83 A; 2AL3 A; 2JT4 B; 4HCN B; 5IA7 A; 4W9F A; 3ZJU A; 2INN E; 3HUI A; 1ZDV A; 3N1Z C; 3IAM 1; 2HDE A; 3CST A; 3A9K A; 1PQS A; 2UWQ A; 4N9F 4; 2MJE A; 1WRD B; 2IGG A; 1Q5W B; 3ZTC A; 1BXT A; 4LLG M; 2LGD A; 4NJ6 A; 4G11 A; 4GDK A; 4P6V F; 1XLO A; 3P42 A; 2BWE S; 4USA A; 2IY0 B; 4WJN A; 1I7H A; 4IW0 A; 2IND C; 3PSE B; 2J42 A; 2DBY A; 1WF9 A; 1UWM A; 2L76 A; 2K25 A; 2MEK A; 5IP4 D; 4IM0 A; 1KLV A; 2K3U A; 1Z5S B; 2KMM A; 1GPX A; 5E6O A; 3RZW C; 2BGF A; 3NOB A; 4DWF A; 2DAF A; 3PHX B; 2KK8 A; 4P16 A; 4AS1 A; 2CHZ A; 4RGM A; 3I9V 1; 1FRR A; 3OAW A; 1N62 A; 1JRO A; 4HK2 A; 2V3N A; 4BKS D; 3AE8 B; 3L08 A; 2LGX A; 4MEM A; 4W9L A; 3WAM A; 4DK5 A; 2LMC A; 2CKH B; 4YTM B; 1H8C A; 1BML C; 4RM9 A; 4WUR A; 4B0M A; 3NHE B; 2C9W B; 3MC8 A; 4LDT B; 4KKJ A; 2M8S A; 1A5R A; 1WYG A; 3TSS A; 3GE3 C; 3WA0 A; 1TTN A; 2CS4 A; 3FIL B; 4WAF A; 4C00 A; 2XN9 C; 3ZRC A; 4LDT D; 5D2M B; 5D6J B; 3AE9 B; 1IBX B; 1UGM A; 4WIP A; 2L0T A; 2WXK A; 2A5U A; 1WE6 A; 5BMH A; 3PZ8 A; 4HXD A; 2CHX A; 2GBN A; 2KVR A; 3ZJV A; 2WXG A; 1HE8 A; 3KH0 A; 1T0R C; 4G0N B; 5H92 C; 1XCT L; 4GN1 A; 3ZNZ B; 4MM3 A; 2O6V A; 4IWP A; 1E5W A; 1T0S C; 3PRP B; 3LJ3 A; 4TV3 A; 3NS1 A; 1WZ0 A; 1FNV A; 3W5V B; 3JVZ X; 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2MJ3 A; 3PHW B; 3Q3M C; 3GZN B; 4MH8 A; 2BB5 A; 4ZRK A; 2MP2 A; 1HTQ A; 4G50 A; 2UU7 A; 2EKI A; 1UUP A; 2LVQ A; 2ZW0 A; 2LRW A; 2JZ3 B; 2IYD B; 1YJ1 A; 1WFY A; 2BF8 B; 3IHP C; 4M02 A; 1SE4 A; 3NRZ A; 2N9K A; 4TMA B; 4B95 A; 3TEW A; 3NZU A; 1J19 A; 1AWD A; 3O65 B; 3UIP B; 4F1S A; 1EWC A; 3P4R B; 2N9L A; 1SE9 A; 1L0X B; 3A9J B; 3V05 A; 1KF6 B; 2HJ8 A; 1MFW A; 4OZA A; 2L52 A; 2BYV E; 2JSV X; 2KC1 A; 3Q6B A; 3DWM A; 1T0Q C; 4WQO B; 3NVV A; 2D11 A; 3AXC A; 3EC8 A; 1IUE A; 3VHT C; 4GMV A; 4OVV A; 2WDT B; 3J9C A; 1AN8 A; 3AUL A; 4XYC A; 1PUT A; 2BB6 A; 3VUW A; 1JWU D; 2KWV B; 1YMH E; 1L7Y A; 2NMQ A; 1E6E B; 1MJD A; 1FXA A; 3HIZ A; 3ZQ4 A; 5TSS A; 2JY6 A; 2L3Z A; 1I42 A; 1M4V A; 1L4D B; 1OGW A; 4HDO A; 2PJH A; 1FFV A; 1V80 A; 4REZ A; 4KDI C; 4DBG A; 1ET9 A; 3DHI C; 5IO9 A; 3L17 A; 4NQK E; 1L0V B; 3EFC A; 5AZH A; 4NAW A; 4RM8 A; 3V62 A; 3W2D A; 1B1Z A; 2MBB B; 3ENE A; 5E6N A; 1YX6 B; 1TS3 A; 3EUB 2; 2I1J A; 2WX1 A; 5BMG A; 2LFI A; 1JQ4 A; 1EF1 A; 1XQQ A; 2MBQ A; 2I2Y A; 1LM8 B; 4ARC A; 3U7Z A; 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