The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADGGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| molecule keywords |
Protein L
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GI9 A; 1HZ5 A; 1MHX A; 2GB1 A; 2PW9 A; 1P7E A; 5HI1 A; 4KGR A; 1UWX A; 2PTL A; 2J53 A; 5JXV A; 4IKG A; 2RPV A; 1PGA A; 2QMT A; 4D2K A; 1GB1 A; 1EM7 A; 1FCC C; 2ZW1 A; 2KDM A; 1PGX A; 5HFY A; 2EEL A; 5BMI A; 1XCQ L; 1P7F A; 2LGI A; 3FIL B; 1XCT L; 1MHH E; 2LUM A; 2JSV X; 1HEZ E; 2N9L A; 2KQ4 X; 1GB4 A; 2JZP A; 2LHE A; 1MVK A; 2JU6 X; 2KAC A; 4MAC A; 4IOI E; 2LHD A; 1PGB A; 1IGC A; 2J52 A; 4OZC A; 2K0P A; 4KGS A; 1IBX B; 1FCL A; 4KGT A; 4HKZ E; 3V3X A; 5HHD G; 4WH4 A; 2PLP A; 2N9K A; 1MPE A; 2RMM A; 2KWD A; 3MP9 A; 1YMH E; 1ZXH A; 2I2Y A; 2ON8 A; 1K50 A; 1QKZ A; 2IGD A; 4HJG E; 2ONQ A; 1Q10 A; 1C9F A; 2IGG A; 1IBX A; 4OZA A; 2NMQ A; 2OED A; 1D4B A; 2ZW0 A; 1FD6 A; 5BMH A; 1K52 A; 2JXT A; 1KH0 A; 1JML A; 1IGD A; 1MI0 A; 2JWU A; 2KN4 A; 3FIL A; 1XF5 L; 3GB1 A; 5BMG A; 1YNT E; 2IGH A; 1K53 A; 2QSD A; 1K51 A; 1F2R I; 4GLS C; 1F2R C; 3UI3 A; 1HZ6 A; 2I38 A; 2N7J A; 5HG2 A; 4OZB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3N3K B; 4P7I A; 3PRP B; 4ACF A; 2WLB A; 3P63 A; 2WXI A; 3PT2 B; 3RPF C; 1P3Q U; 1YX6 B; 2BS3 B; 3KUC B; 4ZDV A; 4M0W B; 5HFY A; 5BMI A; 2L8J A; 1SE9 A; 3NRZ A; 5E6N A; 1ZDV A; 2M0A A; 2JZP A; 3ZNH B; 4ANU A; 5LLI A; 2VH1 A; 1UGM A; 2LFI A; 3QWZ B; 3U30 A; 5LXH A; 1XQQ A; 1N62 A; 2K8B A; 3QCA A; 2LVQ A; 2V1Y A; 1XLN A; 4M0W A; 3HM6 X; 2FCN A; 2BT6 A; 4JE3 B; 1C4C A; 1NYR A; 2KQS A; 1SJE D; 1C77 A; 3GOE A; 1RFA A; 3NS1 A; 3A4R A; 1QKZ A; 1WJU A; 2MBB B; 2MBE A; 2QIL A; 5AUK A; 1ZKH A; 4JGH B; 2BKF A; 4M02 A; 1WGR A; 3P4Q B; 1IGD A; 2IY1 B; 3VTV A; 1I42 A; 5C3J B; 1WMH A; 3I57 A; 2WXF A; 3W1S C; 1UEL A; 5EE0 A; 2QJL A; 3NHE B; 4HEA 1; 3Q14 C; 2JYT A; 2L32 A; 4BVU C; 3ZRC A; 4ASW C; 4W9J A; 1IYF A; 4A90 A; 2W9N A; 1KM7 A; 4DXG A; 4RCO A; 4YTP B; 3A9K B; 2KMC A; 3PPA A; 1E90 A; 1YOV B; 2N1W A; 2ZNV C; 3N9Y C; 2KFK B; 1FFU A; 3M63 B; 2I1K A; 1WGH A; 3CWI A; 2K9X A; 3LXF A; 1PQS A; 4YSX B; 2LGX A; 3BYY B; 1VRA B; 4LNF A; 1P9D U; 5MPO A; 3A9K A; 4KGT A; 3SFE B; 2KAN A; 4NZL B; 1KLU D; 2INN E; 2AQ1 B; 2RDG A; 2J42 A; 2OJR A; 3VRA B; 2NCN A; 3ZTD A; 4KZC A; 2PPH A; 1S1Q B; 2KFK A; 1WJ4 A; 4YT0 B; 4ZHO A; 3DQV A; 2AQ3 B; 5G5G A; 3B0A A; 2WXL A; 3AH7 A; 2NS5 A; 1YN3 A; 3VR9 B; 2PMV A; 4GDK B; 3W1S A; 2MP2 A; 2WU5 B; 2WXK A; 2MH7 A; 2Z0E B; 4LNI A; 3ZNG C; 2CHW A; 2QIE B; 5BMG A; 4E3C A; 2ZNV B; 2LEK A; 3ZYY X; 2MWS B; 1WX7 A; 2WXQ A; 3M95 A; 4RM8 A; 1MG4 A; 3NVW A; 3WAP A; 3MC8 A; 4JX1 C; 4HXD A; 2YEP F; 2ZJD A; 4GMV A; 1WYG A; 3WIM A; 2O2V A; 1WXM A; 4CYE A; 4GDK A; 3AE4 B; 3V60 A; 4N58 A; 1G6J A; 3AM9 A; 3ZQ4 A; 1FM0 D; 3MC0 B; 3BWU D; 1WRI A; 1C3T A; 3MHZ A; 3W2D A; 2IY0 B; 3L13 A; 4D2K A; 5BYQ A; 5J18 A; 3DBH B; 1KOT A; 2ZCB A; 2DWQ A; 4F1S A; 4M01 A; 1OQQ A; 3W5U B; 3IT6 B; 3CSF A; 3H7P B; 1JWS D; 4HCP B; 3I9V 1; 3Q3F A; 2ZPN A; 3AEC B; 1TIF A; 4KKJ A; 2AWT A; 1RLF A; 2D07 B; 1ISN A; 3JVZ X; 3N20 C; 5FKA C; 2OJW A; 2BYF A; 4NJC A; 4ICU A; 4LNO A; 3L10 B; 2KWV B; 1J7B A; 3IHP C; 2BPS A; 1XLP A; 1TKE A; 4US9 A; 3H7P A; 2WXR A; 1GC6 A; 5D6J B; 1I4H A; 5BO4 B; 5J17 A; 3HRD D; 1K50 A; 2DNF A; 4I6L B; 1YX5 B; 3TMP B; 4A3P A; 3HVD A; 2DYO A; 5BMH A; 4BBN F; 3RNF C; 2L1A A; 2WWZ A; 4G0N B; 2KN4 A; 1L4D B; 4KV2 A; 2B3A A; 2LZ6 A; 2XBB C; 1I35 A; 4LJP B; 2KX3 A; 4RGN A; 4EZL A; 4MSM B; 1UGJ A; 4N9F 4; 1I7H A; 1WXQ A; 1TYG B; 2L00 B; 3NJT A; 3I3T B; 2KC2 A; 1WZ0 A; 1SGH A; 4XYC A; 5HI1 A; 2BVC A; 4OW0 A; 1GG3 A; 4HLE A; 1ESF A; 1NEK B; 4C56 C; 4EFO A; 2KNB A; 2KJH B; 4HDO A; 2V3P A; 1EM7 A; 1QF6 A; 2IDY A; 2ZW1 A; 4LNK A; 4KDI C; 4KDL B; 3RNG C; 2X38 A; 1NI2 A; 3VRB B; 4GSW A; 2PJH A; 5IA7 A; 4WQO B; 4J6I A; 2M56 B; 4FA6 A; 2XK5 B; 1ZPS A; 3VAW A; 1WFY A; 4MGI E; 4S17 A; 1SSN A; 1L0X B; 3ONS A; 4ZRI A; 3AE8 B; 2AL6 A; 5IAA C; 1WXV A; 4W9E A; 1ET6 A; 1YQ3 B; 2BGF A; 2MCN B; 1F0Z A; 3VR8 B; 2LGS A; 1C76 A; 1L5P A; 2PKO A; 1WXA A; 4XDC A; 2WX1 A; 4HRS A; 1QOB A; 1WI0 A; 3RNE C; 2BQQ A; 3P4S B; 4CHK A; 1WGG A; 3QIJ A; 4RNA A; 4F8C B; 1WM3 A; 4HWI B; 2KD0 A; 4IM3 A; 5I4D A; 4LTU A; 1N63 A; 1FNW A; 2PE9 A; 1HTQ A; 4B95 A; 4GN1 A; 1Y56 A; 1I4P A; 1KH0 A; 1L2N A; 1C1Y B; 4WJP A; 2R61 A; 3KUZ A; 1HXY D; 4RH6 A; 1I4X A; 1V49 A; 3MTN B; 2RSU A; 4ZRP A; 1R4M B; 1HZ6 A; 2C7N B; 2DYM A; 3Q8A A; 3ZW3 A; 1ZDX A; 5EE1 A; 1VLB A; 5JH5 C; 4MM3 B; 2K6D B; 2JWZ A; 1WY8 A; 3RZW C; 1WR1 A; 4GB9 A; 4AJY B; 2V0G A; 2RPV A; 1I4G A; 2YEP B; 1XEE A; 2QCZ A; 3CF6 E; 3JW0 X; 1UH6 A; 4EZK A; 1TS5 A; 3KWV A; 2KYW A; 3HVZ A; 1P7F A; 3P42 A; 2KTR B; 1ZP0 B; 5H8Y E; 2WXM A; 4KVG B; 3W5V B; 2V9H A; 1UBI A; 4NAW B; 4MAC A; 1LXD A; 1WGD A; 4TSS A; 4MM3 A; 4OZC A; 2MBO A; 1LO5 D; 1OGW A; 4W9I A; 3L0W B; 3AV8 A; 4RFB A; 4HRO A; 1SB3 C; 1ZW7 A; 3PO0 A; 3QA8 A; 5EDS A; 2PVG C; 5G55 A; 2KTR A; 1NEN B; 3AEB B; 3W1Y A; 3S2A A; 4HJG E; 2MQJ A; 1OQR A; 1C78 A; 1V5T A; 3DBL B; 4IC7 B; 3AE3 B; 4PS8 A; 2B76 B; 1RAX A; 1XLQ A; 2JYE A; 3DHH C; 3ABV B; 2V3N A; 3AEE B; 3U8Z A; 1GAQ B; 3ML9 A; 4A3O A; 3N32 A; 1KLV A; 4IWO A; 1YNT E; 3EEC A; 3UGB B; 3ALB A; 2WX0 A; 3WAO A; 2K5P A; 2W3S A; 2Y5P A; 4US8 A; 2HE7 A; 2C60 A; 2FBW B; 1M4V A; 1PFD A; 1GOZ A; 1L0V B; 2EKE C; 1WYW B; 4MJS A; 1FMA D; 4XE0 A; 2BWF A; 4IKG A; 1FNV A; 2L0T A; 4W9K A; 1AN8 A; 2VH2 A; 3JYU A; 3AE6 B; 3HIZ A; 2KJ6 A; 3M3J A; 3ZTC A; 2CJO A; 2MA9 B; 4WJO A; 4BKG A; 1NI3 A; 2DHZ A; 3KH0 A; 2D3G A; 3B1L X; 3KWL A; 4IUM B; 1NVI D; 2KQ4 X; 3VTU A; 2KKC A; 3DBH I; 1U4A A; 3JSV B; 5DPR A; 4DXF A; 3T9L A; 3P4P B; 2DX5 B; 2FCQ A; 2H88 B; 2KK8 A; 3TEY A; 4L2Y A; 3IAS 1; 3VH3 B; 4LDT B; 4TQ0 A; 1SBB B; 4MDK E; 4ZYN A; 1WH3 A; 2LGD A; 2N9E B; 3MP9 A; 4A20 A; 1V5O A; 1MJD A; 1N6Z A; 2I2Y A; 1T0Y A; 3B2F A; 2UWQ A; 3JSV A; 1RYJ A; 3PRZ A; 2BW2 A; 4YWG G; 4LDT D; 4RGO S; 4MEM A; 3I5J C; 4XC2 A; 3FC4 A; 4PK1 A; 3U52 E; 1FD6 A; 2W55 A; 1TBE A; 3RUL A; 2JXT A; 4RF1 A; 2FCS A; 2VRR B; 3GB1 A; 4KSK C; 4CO7 A; 1VJK A; 5C2T B; 3R7R A; 5H92 C; 2ASQ A; 4IW0 A; 1A5R A; 1L4Z B; 4GLS C; 4RF0 A; 1WE7 A; 3LB8 C; 3PVL A; 2DAF A; 3NZS A; 1J7C A; 3TCA A; 4HVB A; 3LYY A; 1WE6 A; 2KAJ A; 1T0Q C; 1FIQ A; 5FK9 C; 4PS7 A; 3GP7 A; 2RD0 A; 1UWX A; 2FAZ A; 4DHJ B; 1VDV A; 4K1R B; 2K6Q A; 4ICV A; 3P2B A; 1Y8R C; 5E6O A; 2FUH B; 1T6B X; 5LNK 1; 3EFC A; 4XWW A; 2ZVO A; 1NYQ A; 2DBY A; 3Q6B A; 4XZ4 A; 3RFZ B; 3WA0 A; 3J9C A; 2DZI A; 2M8S A; 3FIL B; 4R3D A; 4DHJ D; 4URK A; 2A5U A; 1AWD A; 1QOA A; 1MVK A; 1F52 A; 2KAC A; 1SJH D; 1XLO A; 3Q3N C; 4TQ1 A; 4MGK E; 3V61 A; 1QOG A; 1LGR A; 3AUL A; 2L05 A; 1LQB A; 2Z8L A; 5IKC M; 1UF0 A; 3ZKJ C; 4ZOH C; 1VCB A; 2WGS A; 2KQ7 A; 5KHQ A; 1QIL A; 3C19 A; 2KOX A; 2N4F A; 2ONQ A; 3VVW B; 3SEB A; 1HTO A; 2EMS A; 2FE8 A; 3B08 A; 4DHZ E; 1E8Z A; 5GMV A; 4H2A A; 2INP E; 1D5M C; 1TS2 A; 2JZ3 B; 1BT0 A; 3BIN A; 2MJ3 A; 2V4I B; 2KWU B; 5D3D A; 2AX5 A; 4A9A A; 4FBJ B; 5HG2 A; 1YQB A; 2NTS A; 4HJK A; 1H4R A; 2IJ0 A; 1E7U A; 3PZD A; 2IYD B; 3AEF B; 1HZ5 A; 4AUQ C; 4A6Q A; 2WQY B; 4II2 B; 4C4V B; 1R4M I; 4B0E A; 1FO4 A; 2PEA A; 1ZGU B; 2JT4 B; 3IFW B; 4AQ7 A; 2JXX A; 2PTL A; 5FR6 A; 3Q69 A; 2GBM A; 3EUB 2; 4HPP A; 1IP9 A; 3DCG A; 3TEW A; 1WZ3 A; 4PS3 A; 1TJE A; 1E10 A; 1PGX A; 1V81 A; 2KO3 A; 2N1V A; 4K3B A; 1QQR A; 1V9J A; 4WWN A; 1Q0W B; 3GE3 C; 3PSE B; 4FUL A; 4W9F A; 2W54 A; 3V05 A; 1WGY A; 3I63 C; 1IUE A; 3IXS A; 4BKT A; 2KWC A; 5G5H A; 2YVC A; 1CJE A; 2WXO A; 5CX3 A; 4HKQ A; 3AE2 B; 2HTM E; 2K22 A; 4C7Y A; 2G4D B; 3EGR A; 2DZM A; 2LMC A; 2N9K A; 2NBV B; 3E9S A; 4YXD B; 4J3O D; 1FXA A; 4DWF A; 1ZXH A; 3Q2A C; 1R7S A; 5G2N A; 1XO3 A; 1Q5W B; 4PYU A; 2V4L A; 2TSS A; 3MJW A; 2IGG A; 3OWE B; 4EUT A; 3WAN A; 2JVC A; 4OZA A; 5D94 A; 2BKR B; 4GGQ A; 1YN5 A; 3APC A; 3HHM A; 2IBI B; 3KVF B; 2Y5B B; 3VUY A; 2W82 A; 4ANV A; 3DWM A; 3WAL A; 2DLB A; 3W9C B; 4OHJ A; 4ZRK A; 1SE3 A; 3OAW A; 2JWU A; 4XDD A; 1N61 A; 2EMT A; 3DBL I; 1OQY A; 5TSS A; 1WX9 A; 1JWA D; 2FUG 1; 1F2R I; 1FNU A; 4FHJ A; 2HDE A; 1N5X A; 4HDQ A; 4K7U A; 3PRE A; 3BII D; 4BZA A; 2KT7 A; 3H7S A; 1SEB D; 1VZ6 A; 3A9J B; 1YJ1 A; 1KTK A; 2WHI A; 2KTF A; 5GXG B; 5EE3 A; 2HJ1 A; 5LXI B; 4A55 A; 1H8C A; 1V80 A; 4AOF A; 1JRP A; 3RN9 C; 5AZH A; 1GB1 A; 2MLB A; 2HD5 B; 4G11 A; 4II3 B; 4BOZ B; 3ML8 A; 5JHB A; 4G3X B; 1VZ8 A; 1E8X A; 2JQR B; 2PVO D; 1DOX A; 1J19 A; 1ZOY B; 4C7Z A; 2N9L A; 2ICI A; 1LFD A; 3PRM B; 3A9J A; 2XNA C; 3VTW A; 2BS2 B; 3BY4 B; 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1E6E B; 3E56 A; 2R2O A; 1WJN A; 3Q3J A; 3A1Q B; 1HQR D; 1YQ4 B; 4E71 A; 2G45 B; 1P0R A; 2KX0 A; 1B1Z A; 2BBC A; 2IO2 B; 4WIP A; 2JX5 A; 1WJ6 A; 1Q10 A; 1YJJ A; 4WWP A; 2SAK A; 4NPN A; 4WJQ A; 1RWS A; 2D3A A; 3KW5 B; 1Z2M A; 2BYE A; 4WAF A; 3VUW A; 2FID A; 4PT5 A; 2Y5C A; 2EKI A; 2GMI C; 5L95 C; 1VD2 A; 3R3M A; 1OEY J; 1AYF A; 3AU4 A; 4KSL C; 4W9D A; 1JML A; 1MFW A; 3MFG A; 1WR6 E; 3A1Q A; 3KYD D; 4L23 A; 2KFJ A; 1RFK A; 4GOC A; 4NAW A; 4KIK B; 2N7J A; 2BYT A; 2YLM A; 1ZE3 D; 1OTR B; 1JRO A; 5IOI A; 1D6E C; 4MGZ E; 2J7Q B; 4WUR A; 1EO6 A; 2BB6 A; 2LJ5 A; 2JUO A; 4KZ0 A; 2KLC A; 1RM6 C; 3RNA C; 4S0R A; 2WDR B; 1GC7 A; 4DHZ B; 4P1C C; 2J53 A; 3ECI A; 5HKH A; 2MX2 A; 3H1U A; 1PGA A; 2Z0D B; 2AYO B; 3AB5 A; 1NBF C; 3Q3M C; 1FRD A; 1WWT A; 2J4X A; 2M19 A; 1QLB B; 2D11 A; 3DWG C; 4KIK A; 1VZ7 A; 2QEJ C; 3SDL C; 2PIA A; 5DPS A; 4W9H A; 4FAD A; 5DPW A; 5J2R A; 3U4E G; 2D5G A; 4B0M A; 2MBH A; 1WIA A; 2JU6 X; 1PUT A; 4RGT A; 4JWS C; 4BFR A; 4EEW A; 2O6V B; 1YJI A; 1FPY A; 1TS3 A; 2GBK A; 3RMK C; 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