The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADGGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K50 A; 2KWD A; 1IGD A; 2IGG A; 1F2R C; 2KAC A; 4D2K A; 1HEZ E; 5JXV A; 5HFY A; 2KN4 A; 1ZXH A; 1PGX A; 1KH0 A; 2QMT A; 1UWX A; 1IGC A; 4KGS A; 2NMQ A; 2PLP A; 3FIL B; 3V3X A; 1PGA A; 2IGH A; 1K52 A; 1C9F A; 1QKZ A; 1YMH E; 4IKG A; 1JML A; 2J52 A; 2JSV X; 1FCL A; 1MPE A; 1P7F A; 1XCT L; 4HKZ E; 4OZA A; 1HZ6 A; 5HI1 A; 2PTL A; 1K53 A; 2K0P A; 2LUM A; 2GB1 A; 4KGR A; 2PW9 A; 4OZC A; 2RMM A; 4MAC A; 2QSD A; 3MP9 A; 2LHD A; 1GB1 A; 1YNT E; 5BMG A; 1MI0 A; 4WH4 A; 1MHH E; 1MHX A; 2OED A; 2JXT A; 2GI9 A; 1K51 A; 1FCC C; 1F2R I; 2KQ4 X; 2ON8 A; 1XF5 L; 2RPV A; 2IGD A; 2JWU A; 4OZB A; 4GLS C; 1D4B A; 2JZP A; 1P7E A; 4KGT A; 4HJG E; 1GB4 A; 2JU6 X; 2ZW1 A; 5BMI A; 1HZ5 A; 3UI3 A; 1XCQ L; 1EM7 A; 2ZW0 A; 5BMH A; 1PGB A; 2N7J A; 2N9K A; 3GB1 A; 1MVK A; 4IOI E; 2I38 A; 2J53 A; 2LGI A; 2EEL A; 3FIL A; 2KDM A; 1IBX A; 2ONQ A; 2LHE A; 1FD6 A; 5HG2 A; 1IBX B; 2N9L A; 5HHD G; 2I2Y A; 1Q10 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YJJ A; 3RNG C; 4NJC A; 3L54 A; 1VLB A; 2ZPN A; 2RDH A; 3DHG C; 1UGM A; 1P3Q U; 3PRP B; 3O65 B; 3R66 C; 2J7Q B; 3PZ8 A; 5DPT A; 5AUK A; 4JWS C; 4US9 A; 3A33 B; 3NUH B; 2DYM A; 2VH2 A; 2PVG C; 4AS1 A; 2Z0E B; 2DAJ A; 1DOI A; 2CJN A; 1QZE A; 1L0Y B; 2OOB B; 1C4A A; 3JYU A; 1OQR A; 2LJI A; 3P63 A; 4MEM A; 1K53 A; 3BVM A; 3SDL C; 1PFD A; 2QC8 A; 4BKS A; 2C60 A; 5IN7 A; 1I4X A; 2KWC A; 5IP4 D; 3IHP C; 5CTR C; 2GBM A; 2LGX A; 1NEN B; 1N60 A; 1FRD A; 5J17 A; 1WJU A; 1E6E B; 2OED A; 4REZ A; 2G1E A; 3NVW A; 3WAO A; 3NVV A; 2BWF A; 3RNC C; 2K22 A; 2M1M A; 2J0M A; 1H8C A; 1DYQ A; 3ZJU A; 4OVU A; 1N62 A; 3KWV A; 4X57 B; 5BMI A; 2LRW A; 3TEX A; 5J18 A; 1E8X A; 2MSE D; 2ZZP B; 2KMC A; 4PS7 A; 4B6W A; 2KAJ A; 4WWP A; 3LB8 C; 5KHQ A; 4XYC A; 1J7B A; 2ONQ A; 3Q14 C; 2KWV B; 5HG2 A; 3M62 B; 3AEG B; 2YLM A; 4JL9 A; 3B1L X; 4BOZ B; 1BXT A; 4A20 A; 3ZNZ B; 3EUB 2; 2W9N A; 4G3X B; 4RF0 A; 3U52 E; 1E8Y A; 1CZP A; 4RH6 A; 5DPS A; 2CHZ A; 1EU3 A; 2RGF A; 3R7Q A; 3KWL A; 3DBS A; 5JZE B; 3FC4 A; 2QEJ C; 2K25 A; 2IY1 B; 2ZEQ A; 2BQQ A; 4OZA A; 3UQB A; 2NBU A; 3IAS 1; 1G6J A; 2X38 A; 3VH4 B; 4P16 A; 1J7A A; 4C56 C; 1UGJ A; 2YEP F; 4FHJ A; 1L0X B; 2D3G A; 2KQ7 A; 2R2Q A; 2KLG A; 4GGQ A; 2DAF A; 2O6V A; 4LCD E; 3LXF A; 2AX5 A; 2CKH B; 1N63 A; 1JRO A; 3U30 A; 3ZTC A; 3RPF C; 4LDT B; 3MTN B; 4UDU C; 2KHW B; 1MHX A; 4IM2 A; 4W9H A; 3Q6B A; 4W9F A; 1UH6 A; 4TQ0 A; 3A1Q B; 1V6E A; 2KLC A; 1QIL A; 4M0W B; 1WYW B; 2FCN A; 3QK0 A; 2LGS A; 4ARI A; 4BAX A; 1YN4 A; 3JVZ X; 2MWS B; 4EKU A; 5BMH A; 4MM3 A; 4RGT A; 1RYJ A; 3GB1 A; 3ZYY X; 1VJK A; 4NNJ B; 4HVB A; 4WJQ A; 2CJO A; 2PEA A; 1QQR A; 1I4P A; 2M8S A; 2FE8 A; 3LJ3 A; 4HPM B; 2LGD A; 4C4V A; 3T3O A; 2JT4 B; 2LFI A; 2IJ0 A; 1AN8 A; 3E9S A; 2BTE A; 3VUW A; 5EE1 A; 1DOX A; 3H7P A; 2WDR B; 3U4E G; 3W1S C; 4KGS A; 1L6U A; 3IVF A; 3V3X A; 1IUE A; 4RFB A; 4IM0 A; 1PYW D; 2C7M B; 1HXY D; 1X1M A; 1L7Y A; 1RFK A; 2N1V A; 1E0Z A; 1PQS A; 1Q5W B; 1MG4 A; 3APC A; 1KF6 B; 4HWI B; 2JSV X; 1MPE A; 1WWT A; 3APF A; 2M0A A; 3Q3F A; 2JUO A; 1RWS A; 4QAY A; 3KYD D; 2L32 A; 4NAW B; 2V3P A; 1VZ7 A; 3S2A A; 3I9V 1; 4DK5 A; 2LJ5 A; 2D2Q A; 4FHK A; 3RUL A; 4WWO A; 1WGG A; 3OWE B; 4OZC A; 3A4S C; 1WGR A; 1L5P A; 3M3J A; 4DBG A; 4HXD A; 1HTO A; 2CU1 A; 3HK0 A; 2EKE C; 3ETR A; 1WE7 A; 3PPA A; 4A3O A; 1ZDX A; 3OJ3 A; 3QJZ A; 2KZR A; 1GNU A; 1Y56 A; 5E6O A; 3KUD B; 2FIF A; 1F2R I; 4J6I A; 1OEY J; 1WF9 A; 3DVN U; 4MSM B; 3C19 A; 4YL8 A; 4A55 A; 2IO0 B; 2WXQ A; 4MGZ E; 3HIZ A; 3VFK A; 4PS8 A; 1A70 A; 2JXX A; 1MG8 A; 4KV2 A; 3VTU A; 1EF5 A; 2DX5 B; 1I35 A; 1I4H A; 2J42 A; 2A5U A; 1TJE A; 5G2N A; 3HRD D; 3K9P B; 3A4R A; 3V61 A; 5H8Y E; 3SD5 A; 3P1M A; 2N1W A; 3NZ3 A; 3PRM B; 1XD3 B; 3GP7 A; 2DYB A; 3P4Q B; 2PPH A; 1WRI A; 1TKE A; 2LMC A; 1NBF C; 4IC7 B; 5HFY A; 2QIL A; 4BKS D; 1TKY A; 4KZ0 A; 3VR9 B; 1QF6 A; 4I6N B; 3ZNG C; 3EEC A; 3DDC B; 3OLM D; 2WX0 A; 2AWT A; 4K7S A; 1VZ8 A; 3FIL B; 4E3C A; 2OJW A; 2WXP A; 3I57 A; 4AJW A; 3ZO5 B; 3ECI A; 2JYT A; 3ZJT A; 3KH0 A; 1I42 A; 3WIM A; 1JML A; 2L76 A; 4N58 A; 2DHZ A; 2MJ3 A; 2GMI C; 1WX8 A; 2VZK D; 1P9D U; 1WYG A; 4MJS B; 3PRE A; 2GB1 A; 4GU2 A; 1WZ3 A; 2WU5 B; 2AQ3 B; 4P1B C; 1M94 A; 2MEK A; 3PTF C; 2GOW A; 1UZX B; 3ZW3 A; 3QIJ A; 1BT0 A; 1GB1 A; 5HKH A; 1V49 A; 4I6L B; 2R61 A; 2DZJ A; 3AU4 A; 4BZA A; 5J2R A; 4MSQ B; 4RM9 A; 4G50 A; 1FNW A; 1TKG A; 2V0G A; 2GI9 A; 4MH8 A; 3Q8F A; 3NRZ A; 2KQ4 X; 1FXT B; 1TZ1 A; 1UNS A; 4GSW A; 1YX5 B; 2JZP A; 2NCN A; 5JHB A; 4ZHO A; 4ZRK A; 4BKG A; 1SJE D; 4JGH B; 2HJ8 A; 2MX2 A; 2CU3 A; 2KX3 A; 2WLB A; 3AEC B; 2NTS A; 2LUE A; 1UBI A; 4MEL A; 4NAM A; 5LNK 1; 2J0K A; 2XBB C; 2FUH B; 2N7D A; 2EKI A; 1R4N I; 1BML C; 4GDL B; 5MPO A; 1WJ4 A; 1KJT A; 2IO1 B; 2V3N A; 1V80 A; 4L23 A; 5BYR A; 4HPP A; 1K8R B; 5I4D A; 1LFD A; 2KMA A; 1PGX A; 4NJ6 A; 3H7S A; 5D7G A; 3TBL D; 1NI3 A; 2KKC A; 4XWW A; 1LM8 B; 3DVG X; 2KYW A; 4K3B A; 2O6V D; 2TSS A; 5G5G A; 2N0S B; 4S17 A; 1YIW A; 1R7S A; 3H1U A; 2UU7 A; 2H89 B; 2J52 A; 2FID A; 1FCL A; 4B9K A; 2V3S A; 1D5Z C; 5D6J B; 1HZ6 A; 1YN5 A; 3QX1 A; 3X23 A; 4W9E A; 3CMM B; 4ZRP A; 2BYV E; 3UIP B; 1WX9 A; 3C8Y A; 1JWS D; 2V4I B; 2W3R A; 1R4N B; 2IO3 B; 2FCS A; 3TCA A; 1FMA D; 1VZ6 A; 4K1R B; 3Q8B A; 2ON8 A; 1N5X A; 3TMP B; 1QOG A; 2WXM A; 1B9R A; 1DOY A; 1CK1 A; 1JW9 D; 4USA A; 1GB4 A; 4EE2 A; 1V5O A; 3PV1 A; 1EM7 A; 1V86 A; 2SAK A; 5C3J B; 2B76 B; 1XLQ A; 4PS3 A; 1OTR B; 2N9K A; 3KW5 B; 4P1C C; 3Q8A A; 2R2O A; 4ANV A; 1JWM D; 1SF0 A; 3ALB A; 2KDM A; 2YVC A; 1E10 A; 3B08 A; 2LHE A; 3L08 A; 4ANW A; 2QHO A; 1FD6 A; 4GIV A; 1WXS A; 1J7C A; 2N9L A; 3Q69 A; 5BO4 B; 1V81 A; 1ESF A; 1WGY A; 1FFU A; 4M00 A; 2AEH A; 3ABV B; 1UUP A; 2ZCC A; 4D2K A; 4XX5 A; 3RNF C; 1JQ4 A; 2ZVO A; 2D3A A; 3NS1 A; 1SBB B; 1WX7 A; 3DHH C; 2BW2 A; 2C7N B; 3VTV A; 1WGK A; 2KDB A; 1N61 A; 1SIF A; 1XLO A; 4C00 A; 4E71 A; 3ZNI D; 5FKA C; 1EU4 A; 1XCT L; 1C77 A; 2DEN B; 3CST A; 2KDF B; 3V62 A; 3U7D A; 4EZJ A; 1E7U A; 3FAH A; 3H8H A; 2LUM A; 1RFA A; 1T0Y A; 2C7H A; 2WXR A; 2X8X X; 2MW5 A; 1C3T A; 4ZYS A; 1RRB A; 1P0R A; 3JW0 X; 3O13 A; 2SEB D; 5EE3 A; 1YNT E; 4WJN A; 4HPL B; 2BB5 A; 1UWM A; 3SEB A; 1MHH E; 3GS2 A; 3NG0 A; 2JXT A; 2LZ6 A; 1V97 A; 4JE3 B; 2K6Q A; 4ZDV A; 1HE8 A; 3URY A; 4HDO A; 1I4Q A; 4K81 A; 1XLN A; 1F0Z A; 5IAA C; 1OEY A; 4LNK A; 2PE9 A; 2KOX A; 2EMT A; 1L2N A; 3DQV A; 4FAD A; 2H88 B; 3GE3 C; 4II2 B; 1IBX A; 4YWG G; 1UF0 A; 2WGS A; 4O1N A; 3U7Z A; 3D32 A; 4TSS A; 5AZH A; 1IBX B; 2WNM A; 2KWU B; 1JWU D; 2L3Z A; 3PZD A; 4MT5 A; 3SR6 A; 1FNU A; 4M01 A; 3AE7 B; 4YT0 B; 1WY8 A; 3RUI B; 2KWD A; 2VZK B; 2KAC A; 4ASW C; 5E6P A; 4F8C B; 1T0S C; 5FK9 C; 3L0W B; 3W2D A; 3M63 B; 2FNJ B; 3VUX A; 5EDS A; 3BVG A; 4WWN A; 1ACC A; 1KH0 A; 1VR9 A; 4KDL B; 2INN E; 4LK0 M; 3SU8 X; 2JY6 A; 3N20 C; 3RCZ A; 1K52 A; 2BF8 B; 2ASQ A; 3K9O B; 4DDG D; 1KTK A; 5D3D A; 2KD0 A; 1T0Q C; 5CHW A; 4FXC A; 3IT4 B; 3BK1 A; 3RZW C; 1CJE A; 2BVC A; 3TL5 A; 2BPS A; 4PK1 A; 2Z8L A; 1J0G A; 2KO3 A; 3BYT B; 4N9F 4; 3DCG A; 5G55 A; 3GZN I; 3X0W A; 1F1H A; 1GOZ A; 2RPQ A; 3IT6 B; 4KVG B; 1C76 A; 2KJH B; 4FLH A; 4TMA B; 4XZ4 A; 4RGO S; 3VXW A; 3ZIM A; 3DVG Y; 4B0M A; 1VD2 A; 1N6Z A; 4K7U A; 5DPW A; 1IYF A; 2E3T A; 3R8B A; 3RZF A; 1I7H A; 3TEZ A; 3AEF B; 3PVL A; 1OQQ A; 4ZHP A; 3AUL A; 1TS4 A; 3N3K B; 2O6V B; 3NZS A; 4GN1 A; 3UQA A; 2I38 A; 2MBO A; 3GOE A; 2RR9 A; 1NYQ A; 3ZQ4 A; 3RYT A; 3R2I A; 3AM9 A; 1LXD A; 2E6X A; 1GUA B; 1VRA B; 2D11 A; 2WS3 B; 1GC7 A; 4K7W A; 1F2R C; 4HDQ A; 2N9X A; 2DNF A; 2KAN A; 2ZNV B; 2BKF A; 1SIJ A; 4F1S A; 3W9C B; 4AOF A; 1VDV A; 4MM3 B; 3AEE B; 4EEW A; 4CQN A; 1GPX A; 2FBW B; 1ENF A; 2NR2 A; 5IA7 A; 3MJ5 A; 2BYT A; 2Q5W D; 1ISN A; 4W9L A; 4C4V B; 4JWU C; 4NZL B; 3ZDM C; 1D3Z A; 4BKT A; 3A9J A; 1WXA A; 2PTL A; 3AE9 B; 4MGI E; 3A9J B; 4BBN F; 2MBE A; 2VH1 A; 4KSL C; 3H7P B; 4KGR A; 5LXH A; 1WJN A; 1H4R A; 1XT9 B; 1D5X C; 1T0R C; 4ACF A; 1ZP0 B; 1CMX B; 1L0V B; 2WXI A; 1XXG A; 3ZTD A; 3CSF A; 3UF8 A; 1KLV A; 1C4P A; 2DZI A; 5E6N A; 3Q2A C; 2KTR A; 2Y5P A; 2BYF A; 1KM7 A; 3MC8 A; 3N1Y C; 3LDZ E; 5GMV A; 1FXI A; 2HJ1 A; 2WX1 A; 1F9J A; 1KLU D; 1ZGU B; 2N7E A; 4GLS C; 3MFG A; 1KRH A; 2BGF A; 1P7E A; 1V2Y A; 4BBN C; 1TY0 A; 3AI5 A; 2ZW0 A; 1WIA A; 4ZRI A; 4TQ1 A; 4IOI E; 1E5W A; 4JQW C; 3DBH I; 4R3D A; 3SFD B; 3BZD B; 2RDB C; 2KFJ A; 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3RNA C; 4IW0 A; 2K5P A; 1TT5 B; 2ZPY A; 1WM3 A; 3BIN A; 2G3Q B; 2W82 A; 3VVW B; 2K8H A; 3AE3 B; 5BYQ A; 4W9D A; 2WDQ B; 3TEW A; 1C9F A; 4JLC A; 3SFE B; 4AWJ A; 1QKZ A; 2KT7 A; 4DHJ D; 2DLB A; 2DBY A; 3N1Z C; 3DBL B; 1WR1 A; 2MA9 B; 3PO0 A; 4YXD B; 2BYE A; 1LQB A; 3TUO A; 3DBR B; 4LNO A; 4WJO A; 1YD8 U; 2MBH A; 3CIR B; 1L4D B; 3T8M A; 2G45 B; 2PJH A; 1Z2M A; 3VQI A; 5DPR A; 3ZLZ A; 4EUT A; 2BS3 B; 2L7R A; 1EWC A; 1D5M C; 4FN2 A; 3ZJV A; 5C23 A; 4FJZ A; 3WA0 A; 3BVZ A; 3PZ7 A; 3HM3 A; 2IYD B; 3QAR A; 2JWU A; 3I3T B; 2KC2 A; 3PS6 A; 3P4R B; 4WJP A; 3IAM 1; 2M19 A; 3VAW A; 4P6V F; 3P4P B; 3JSV A; 3KUZ A; 1PGB A; 3VR8 B; 3DWM A; 1UEL A; 2D10 A; 1JRP A; 2MHJ A; 2NBV B; 3BY4 B; 3A9K A; 3JSV B; 2UYZ B; 3RFZ B; 1V8C A; 1P98 A; 2LRU A; 5L95 C; 1HA5 A; 4W9G A; 2KTF A; 4A8X C; 1QOF A; 2BB6 A; 2DZM A; 3HUI A; 3V05 A; 2IDY A; 2PVO D; 3DHI C; 1QLB B; 2RSU A; 3WAN A; 3ZNH B; 3APD A; 1K50 A; 2MP2 A; 2I1K A; 2KC1 A; 4C7Y A; 2IGG A; 3VDZ A; 1XLP A; 1TTN A; 1YQ3 B; 4HCN B; 2N9P C; 4MGY E; 3TEY A; 3QQ8 B; 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