1KFWA

Structure of catalytic domain of psychrophilic chitinase b from arthrobacter tad20
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
435
structure length
435
Chain Sequence
PLTSTVNGYRNVGYFAQWGVYGRAFQAKQLDVSGTAKNLTHINYSFGNINNQTLTCFMANKAQGTGPNGSDGAGDAWADFGMGYAADKSVSGKADTWDQPLAGSFNQLKQLKAKNPKLKVMISLGGWTWSKNFSKAAATEASRQKLVSSCIDLYIKGNLPNFEGRGGAGAAAGIFDGIDIDWEWPGTNSGLAGNGVDTVNDRANFKALLAEFRKQLDAYGSTNNKKYVLSAFLPANPADIDAGGWDDPANFKSLDFGSIQGYDLHGAWNPTLTGHQANLYDDPADPRAPSKKFSADKAVKKYLAAGIDPKQLGLGLAAYGRGWTGAKNVSPWGPATDGAPGTYETANEDYDKLKTLGTDHYDAATGSAWRYDGTQWWSYDNIATTKQKTDYIVSKGLGGGMWWELSGDRNGELVGAMSDKFRAAAPGPVTEAAPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of catalytical domain of psychrophilic chitinase from Arthobacter, with and without allosamidine
rcsb
molecule keywords chitinase B
molecule tags Hydrolase
source organism Arthrobacter sp.
total genus 168
structure length 435
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2001-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1kfwA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1kfwA01
1JYXA 1LL6A 1KXTA 2CHOA 3VILA 4HA4A 1H1NA 3WL0A 1EDGA 3QHOA 4P8XA 1HIZA 3I3BA 3WEZA 1C7SA 4PEEA 2Y24A 1XH1A 1XYZA 4B3KA 4LXFA 4W86A 2DSKA 4DM1A 1NWUA 3G6MA 3CZEA 4CCEA 5BWFA 2CXGA 1OIFA 1BTCA 1BG9A 4WK9A 4H7VA 3MUAA 1KWKA 4NRRA 3ARUA 3S6TA 4HOZA 2WMGA 8CGTA 3MV11 3ZR6A 1TCMA 4YPJA 5AC5A 2C7FA 2GFTA 1V3LA 1Q6CA 1E3ZA 1TA3B 3VX0A 3MMDA 2IXUA 3KEHA 5DT7A 4Z2KA 2WPGA 1XYFA 2XSAA 4Q22A 1R8LA 3WUBA 4UQ9A 4AD3A 4QCFA 4D72A 1LWHA 1W3KA 3CUFA 3WDQA 1DWGM 3VD4A 1JXKA 4JFVA 4N42A 3IJ9A 5I77A 2ZUWA 3EMQA 1UKQA 3MANA 3AJ7A 5CSYA 3RDKA 2G41A 4OBSA 5A3HA 1NQ6A 3N12A 2FGZA 3WIJA 2QF8A 4ACZA 1WAWA 2WAGA 2GVYA 3ALFA 2XFRA 4W7VA 1H0IA 1GJWA 3NSMA 4LYPA 5HDRA 2ZUUA 3AHTA 4BQ2A 4IISA 3N18A 2EO7A 5CLWA 4MNKA 4OOUA 3T0AA 4D6CA 4HMDA 1LG2A 2A3HA 3DC0A 2DH2A 2WCSA 4AZCA 5A2BA 3W4RA 2XWEA 4PMXA 1PZ3A 1CDGA 1GPFA 2VX5A 3GYCA 1M03A 3WNOA 1X6NA 3UG3A 4M82A 2CESA 3G6LA 1MW1A 1SMDA 3W37A 2VCAA 3AMGA 4UZUA 2EPKX 2YA2A 3UR8A 2BVDA 1MWOA 2VO5A 4W84A 1GW1A 1CXHA 1KGWA 1JZ5A 1J12A 4UFIA 2WSPA 3WMCA 4J3VA 3PZNA 1UKOA 4D6JA 1YHTA 4MB3A 4ATDA 3GNOA 1WPCA 2J78A 4AD5A 2WVTA 2ZX8A 2AOSA 1K9TA 2Z1SA 2W61A 4XUYA 5E6YA 3T0DA 1B90A 1HL9A 1JI2A 3KL3A 1QI2A 1UKSA 1HKMA 4A3YA 3WNKA 4AIUA 5M17A 1EXPA 1UWIA 5IHSA 1HVQA 1XCXA 4QLJA 4MPKA 3TP4A 3VIOA 3FAWA 1XV8A 2VX7A 3M7SA 3CUGA 8A3HA 3EBVA 2VZSA 3CBWA 3EDJA 1ZL1A 1JNDA 1J9YA 4PMOA 5CQ1A 2ZXDA 1KGXA 3F5JA 1JXJA 5A8QA 2OSXA 2Z1KA 2VQUA 1IV8A 4R5EA 4MDPA 4UQBA 4GQRA 5DFAA 5GNYA 1VEOA 3ZSSA 1UWSA 3VIJA 1F4HA 1EHNA 1OWQA 3AIEA 4AZGA 3AICA 3WBEA 3VX1A 3B8SA 1UKPA 1EDTA 1I75A 2O9TA 2VJXA 1B3ZA 2XIBA 2XVGA 1I1XA 3VDHA 3VNYA 4LGXA 3MO4A 2VZVA 1J0IA 4B9ZA 3SUSA 3GDBA 3DYOA 3LPFA 3WL1A 1KR1A 1VJZA 2VCBA 3FAXA 4U2YA 3W82A 4CGTA 2NT1A 1E6PA 5IXEA 1OD8A 5A6AA 1HF6A 2VUYA 1G01A 1NP2A 3ARVA 1QPKA 3ZT5A 3MS8A 2J8GA 2WMHA 4UTFA 1ISYA 4WJXA 1UUQA 3WH9A 3LPGA 3N9KA 4UFMA 3WQ5A 2QPUA 3M6DA 5IDIA 2WLZA 3PZVA 3BC9A 4HPGA 2DEPA 3PZ9A 1HP4A 2UY2A 3GBEA 3N17A 2YIHA 1PJ9A 2DSVA 1J10A 3RPMA 3WNMA 2WC3A 4XX6A 4CU8A 2PWEA 4P8VA 1K9DA 3WF3A 4URIA 2VCCA 3UESA 1BFNA 1WDPA 3SUWA 5HXMA 4HZ6A 3IAPA 3WEMA 3AIRA 4F9JA 4TXEA 3L4ZA 1QBAA 1GONA 3T2OA 1JI1A 4JFTA 2JALA 2CHNA 4BQ4A 1VFMA 3WDHA 2VMFA 1DHKA 2XWDA 4F9DA 3SUUA 1XH2A 3WFLA 1HX0A 4JIEA 5A6BD 1F4AA 3WSUA 3OA5A 1GOKA 3OGRA 1EIBA 2EPLX 3ZJ8A 3QHNA 2J8FA 1W3HA 1NWSA 1Q6FA 3E1F1 1VRXA 2WVVA 4YHEA 1TMQA 3A6OA 2W66A 5I23A 1J18A 3PBGA 3KE0A 3VPLA 4OJYA 1JZ4A 3LPOA 4P7QA 1X1NA 5BXRA 1IZJA 2CKSA 3ALGA 2QLYA 5KZ6A 3K8LA 3UETA 2PC8A 4ZXLA 1B3XA 1UZ4A 1JFXA 4M1RA 4FLRA 1EOMA 2E3ZA 3WDJA 4LQ1A 4IPLA 2X05A 4W5UA 1EQCA 1GVIA 3WENA 2CBUA 3ZMRA 3U57A 1CWYA 1UD8A 5M03A 2BS9A 2BY3A 3AZSA 1MVYA 1V03A 1E3XA 3DYPA 3WF2A 3BAYA 3FY1A 4MNLA 1US3A 5D9OA 3B9AA 4AD4A 2VX6A 2F2HA 1E73M 2BXZA 3BLPX 1MXGA 2EBNA 3SEPA 2ZUTA 3VD3A 5E6ZA 2ZUMA 3NUKA 4MJ4A 1CYGA 1QBBA 3F4VA 1W3JA 5E9AA 1E6QM 5GQBA 1HJVA 2EEXA 3O6AA 3WD2A 4ZFMA 1DWHM 2O9RA 2XJ7A 1VFFA 1D2KA 1C7TA 2C8NA 2GUYA 3BMWA 3WQWA 3I3DA 2WWCA 4EKJA 4AD0A 3AROA 2J7BA 3AXXA 3THCA 4DWSA 1JYWA 4W8AA 1J0KA 4M29A 4B15A 1GQKA 3ARPA 1XCWA 4EAMA 5AC4A 1VBUA 3BAJA 1HJWA 4JKKA 5CXPA 4P7LA 3MSDA 1RP9A 3QHMA 3VDBA 5CPQA 5ABGA 3N1AA 2WVUA 1KQZA 1CLXA 3AMLA 4TTUA 3AFBA 1LWJA 2DGAA 5A69A 2XVNA 3W29A 1J01A 1NWTA 3TTOA 2NT0A 4XB3A 4ZE5A 5D9MA 3VM7A 3ZT7A 4W85A 4UFKA 4EANA 1VFOA 3WUEA 5KEZA 2ZX5A 1W1VA 5TD4A 1HP5A 1ISZA 3K4AA 3NSXA 4OBRA 1SYTA 1ZJAA 4NF7A 1HT6A 1H49A 4AY1A 3A47A 1GOQA 3TTQA 4UFJA 7CGTA 2X0HA 3KWXA 1H5VA 1OSEA 2CITA 3O2LA 1OGSA 1WDSA 1VFUA 1ITXA 4H04A 1W9UA 1E0XA 3AMKA 1WB0A 1M53A 3J7HA 9CGTA 3A4XA 1K9EA 4FMVA 3ZQ9A 4HU8A 1WDRA 1Q6EA 1VIWA 2E4TA 4W7UA 3B9EA 3RMEA 3WELA 1EH9A 5CGMA 1GOIA 2FGLA 1FHDA 1G9HA 4PMUA 4D6HA 1UD5A 2WZEA 3PZGA 3GXDA 4UFHA 2WHJA 2D24A 4AIEA 4PTXA 2BY2A 1PX3A 3ZM8A 1HJQA 4D6DA 1VJSA 5LA1A 4PTVA 3T08A 2VTFA 2CETA 2MANA 4AMCA 4J7RA 1Y7VA 3DYMA 3W26A 4DUVA 5E0CA 1HKJA 3MMUA 1U30A 2RGLA 3OLEA 3SCNA 2QPSA 2VVSA 2XTKA 3NYDA 2FH8A 1SMAA 1HVXA 3GZAA 3BSGA 2J7GA 1TA3A 2BY1A 1QW9A 5HNNA 3VDCA 1B0IA 2BVTA 4BS0A 1XRVA 2J7HA 1NOUA 2OSYA 5FOOA 2FH6A 2XM1A 1UQZA 3K8MA 4L4PA 3N15A 4PRWA 1PZ2A 1UOKA 1WO2A 4JFUA 4GI6A 1JDAA 1EA9C 3L4VA 1R87A 2GK1B 1XD0A 4FLQA 2J7EA 4GO9A 4E8DA 1CXLA 1CGTA 5C71A 1PEZA 2AAAA 4PUEA 3MV01 1E6XM 2CBIA 1MW3A 3WH5A 3WNLA 4E4PA 2X8RA 2YLAA 1CGWA 3QOMA 4OUEA 1W2VA 2O9PA 4Z2HA 1V0MA 3VGFA 1U2YA 5A8PA 5A6BA 5AYIA 3CHCA 2D2OA 3D3AA 1GOWA 4FLSA 5A6LA 4AZIA 4QP0A 1YQ2A 2J79A 4PTWA 1LJYA 1GORA 3NDZA 4GQQA 3VVGA 4DUXA 3VGBA 2W92A 4AC1X 1CXKA 2ZWYA 3CTTA 2BHYA 1HKKA 1QW8A 2WMIA 5I2UA 1W9XA 3AHXA 2WC7A 2JIWA 1UR4A 3HJEA 3UG5A 5A94A 1CLVA 1HL8A 2BFGA 2E0PA 1FHLA 4A4AA 2X09A 1V3HA 4F8XA 1W9PA 1KB3A 2J7CA 3F5KA 3T09A 3DHUA 1UWRA 2ZX6A 5CG0A 2ZUSA 1XGZA 1KXHA 1D7FA 4U33A 5DO8A 5E70A 1E40A 1H2JA 2BNJA 2PWGA 1KXQA 2J4GA 1BSIA 3ZT6A 2VOTA 2RGMA 2YA1A 4P7NA 1JZ6A 3KL5A 3WQVA 2ZIDA 3OG2A 3TONA 1QI0A 1UG6A 2JEPA 3O9NA 4HZ8A 3WD1A 1H09A 1L8NA 1OD0A 4B16A 2PB1A 1O6IA 1CENA 2QMKA 5FL1A 3CIVA 2WBGA 3PHAA 2J25A 4JHZA 2BVYA 1US2A 1V0LA 1GOOA 2EPNA 4E2OA 1ZBWA 3M46A 4TVCA 1UR2A 4KGJA 3SCWA 1E6NA 1E6ZA 1E0WA 3MKKA 5JBDA 3M07A 4DWSD 1IT0A 1V08A 2ESCA 3VKKA 2D0FA 1BGGA 2YL5A 3FN9A 3TA9A 3W81A 4MAZA 5JIPA 2YL6A 4KWUA 2HISA 4KH2A 1DP0A 3MMWA 2VL4A 3L4TA 4DM2A 2XVPA 1HXJA 1OT1A 1X6LA 4PMDA 4JFWA 2YKKA 3EDFA 4QLLA 5EB8A 3BAKA 3ZO9A 4PMVA 3OLIA 1G5AA 2AMGA 3AQUA 1JDDA 4YN5A 1V02E 4GZEA 3WH6A 3MUY1 4D6EA 1HJSA 3WH7A 1C91A 1V02A 1ESWA 4MNMA 3WUGA 2ZOXA 3RM4A 4LX4A 4TX8A 4ACZB 3GTNA 4UQAA 1LL4A 4N0RA 1MQPA 5JIWA 4WKFA 1Z32X 4PBGA 3WF4A 2B31A 3VMOA 4MB4A 1W9DM 1B3YA 2JEQA 2YL8A 3N13A 3K46A 1E4IA 2O9OA 1V3JA 4D6IA 4ATWA 2V38A 4KGLA 4AZCB 2WKLA 2FHBA 4U5IA 2PF0A 4D6GA 3VIMA 3UERA 2EPOA 3GM8A 1MW2A 1R85A 1HJXA 1FP8A 1W91A 1B3WA 4TTGA 3FXYA 2DT2A 1OINA 3BH4A 3VOCA 4AWEA 2WWDA 3AIQA 1CGYA 2GJXB 4W93A 2VZTA 5DMYA 4D71A 1BAGA 1C93A 3NSNA 5LYRA 4AEEA 2OYKA 1WZLA 2VQTA 1UH2A 3CHEA 3WQ4A 4YHGA 3PZTA 1MFVA 5LA2A 2JIEA 3ZOAA 1PPIA 1W1YA 2CIPA 4AD1A 4U5KA 1E4LA 4Y7EA 3CZJA 4OOZA 3RJYA 4B3LA 4Z2IA 1V6UA 4HA3A 4JHOA 3ARXA 3CPUA 4UOQA 1M01A 4TUFA 2OYLA 1ZU8A 1U33A 2WANA 4C7GA 1FP9A 3BMVA 5FD0A 5A8MA 2BXYA 2C0HA 3WEOA 5IFPA 3AIVA 1VENA 3AIWA 1TR1A 3EMZA 1OGBA 3B9DA 3CO4A 3VU2A 1V0KA 1OIMA 4TVDA 4CU6A 4MNJA 1J0JA 4IUGA 1HKIA 2J7DA 2D0HA 1GJUA 1TUXA 4PMNA 4W5ZA 2WMKA 4QDMA 3OLDA 1JZ2A 1BQCA 4NRSA 1JZ7A 2OSWA 3WBAA 2OYMA 2G3MA 3BGAA 3UCQA 4H8UA 3WD0A 2ZXQA 1NM9A 4UQCA 4XZWA 1LG1A 3CUJA 2VNCA 1E9LA 2ZUVA 2QV4A 1EOKA 4P8UA 2VVNA 1PIFA 4GPNA 1KR0A 3ZJ6A 4PSPA 3QGVA 3SCRA 5ABFA 4PMQA 3A4AA 5D9PA 1OT2A 5FKYA 3WMSA 3WF0A 1ISXA 4BQ5A 3EDEA 3ZJ7A 1SFSA 3D5HA 3IANA 2W67A 2ZUNA 2CKRA 1E1EA 1E71M 5CLTA 1E6SM 3VIPA 3VNZA 3GH7A 1JDCA 2OLHA 4W89A 4MDOA 4U3CA 4CCDA 4KMQA 1V3MA 2W63A 1DWIM 4CKQA 2E9MA 3AYRA 2WNWA 4WSJA 3FHQA 3AXHA 4H8VA 3U5YA 4AZBA 2QHAA 1XSJA 4HOWA 2OWWA 2HVMA 1MW0A 1BG4A 2ZE0A 2D23A 2CPUA 2VZUA 3RO8A 5HPOA 1RPKA 2ZICA 3GXIA 3W0KA 2DDXA 2YLLA 1VB9A 2NW0A 1VEPA 5BRPA 3AS1A 4U3AA 3TTYA 1V3KA 2VI0A 4J3XA 4JKMA 5I3DA 1DWJM 1G0CA 3WNNA 2BY0A 3BSHA 3NJ3A 3PZMA 3AS0A 4H8HA 6A3HA 1XC6A 1G94A 1MQQA 4UR9A 4CD5A 3T0BA 1JF5A 5DT5A 4GZIA 4A3HA 1NWRA 1UH4A 2XVKA 3WH8A 2V3FA 4QCEA 2VRKA 1R7OA 3ZSTA 1E1FA 3KZSA 4S3KA 1B9ZA 2CBVA 1KBBA 5CGTA 1MQRA 1CGXA 5BYWA 2Y2WA 1CZ1A 5D4YA 4M56A 3VD9A 2Y5EA 1GQJA 1K9FA 3VMNA 1BHGA 3POHA 1ZBVA 1C3FA 1FOBA 1E43A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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