1KW5A

Methionine core mutant of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1kw5A00
4EKRA 1WTHA 1QTDA 1G0QA 1G07A 1XJTA 4W54A 156LA 1P3NA 3C7WA 4YX7C 109LA 1C6GA 1T97A 4EKPA 180LA 1L84A 1C6KA 3C8SA 3PBLA 3C7YA 2RBSA 1DYCA 2B72A 3HUKA 164LA 1L55A 2RBRA 188LA 1C6QA 234LA 1C6BA 161LA 197LA 3OE6A 3CDQA 157LA 1QUGA 1L68A 4DKLA 4ARQA 152LA 3HTFA 1L04A 4W57A 140LA 1T8GA 1JTMA 4I7PA 3DMVA 3C83A 1G0KA 4W59A 182LA 1G0GA 1LPYA 1CU6A 233LA 102LA 1L51A 1OVKA 125LA 1C6DA 2CUUA 1L02A 262LA 2F47A 2RBQA 1L52A 212LA 1CU2A 175LA 210LA 2OE7X 1QSQA 1G06A 4EJ4A 1L90A 4W53A 1OV5A 3RZEA 1CV6A 241LA 2F32A 3DN0A 1P7SA 3FA0A 1LGUA 1LLHA 1DYEA 3HTBA 1EPYA 245LA 2OTZX 1L39A 1ZYTA 1DYGA 1G0PA 3DN4A 1LYHA 4I7KA 1L08A 2B6ZA 1L0KA 198LA 1L48A 174LA 1P2LA 2B6YA 4S0WA 253LA 247LA 3DMZA 131LA 1K28A 150LA 1L38A 1LYFA 221LA 244LA 2OEAX 1P56A 3PDSA 1L44A 3F8VA 3HDEA 3K2RA 144LA 255LA 3L2XA 1T8FA 1L80A 1C66A 1L61A 261LA 3HT6A 2F2QA 1LI3A 200LA 252LA 1LYDA 2Q9DA 1LYGA 1C6FA 148LE 1L32A 3L64A 1L43A 1L89A 1SWZA 1L00A 1L86A 4ARMA 1QUOA 1C6TA 1D2YA 201LA 4EPFA 4EKQA 4I7NA 215LA 1QT4A 251LA 248LA 4I7JA 169LA 1L62A 3D4SA 1CV4A 222LA 230LA 1G1WA 1D3MA 1L05A 7LZMA 1C65A 2LZMA 3GUOA 149LA 1D3NA 173LA 1L72A 1L82A 257LA 4YXAC 1P2RA 185LA 211LA 240LA 1LWGA 2A4TA 1QT5A 3GUKA 3JR6A 4I7OA 151LA 2IGCA 218LA 1L45A 3HU9A 115LA 1L56A 4I7SA 3SBAA 1DYBA 2LC9A 111LA 3F9LA 142LA 1L01A 242LA 1L03A 3HWLA 4EPIA 1L79A 1C6LA 228LA 3NY8A 1G0JA 1L30A 4W56A 1C6IA 3SB8A 118LA 1QSBA 2RB0X 1QTZA 137LA 2LCBA 2RAZX 1C6MA 1L34A 3OE9A 3DKEX 2O7AA 1C6PA 243LA 3OE8A 146LA 2B75A 3G3WA 2HUMA 3RUNA 1DYFA 4W51A 129LA 3FI5A 4EKSA 190LA 138LA 171LA 3DN3A 4ARLA 1L26A 249LA 4IAPA 1ZURA 1TLAA 3HUQA 172LA 206LA 1CV5A 4GBRB 1L50A 110LA 127LA 2RBPA 1D2WA 2RAYX 246LA 2B73A 3GUMA 1C6AA 1L83A 1QTBA 2QB0B 1L58A 2HUKA 1CUQA 1L29A 1P37A 1PQKA 4ZPUA 3FADA 187LA 2L78A 1L95A 1L41A 3SN6R 1L07A 1LYEA 103LA 128LA 1L28A 4OO9A 1C61A 1C69A 1CV3A 217LA 1L71A 213LA 139LA 166LA 1D9WA 1L46A 3SB6A 223LA 196LA 2HULA 3OE0A 1OYUA 2RB1X 250LA 235LA 162LA 1G1VA 3DN2A 1PQMA 3HH3A 3HTDA 1L47A 1T6HA 3SB5A 1L12A 3ODUA 1D3JA 1L99A 1DYAA 1LI6A 4EXMA 104LA 2B6TA 1C62A 2OU8A 1KNIA 1CX6A 1L98A 2Z6BA 1LGWA 191LA 119LA 231LA 186LA 1L67A 3DNAA 3V2YA 126LA 1L92A 226LA 2NTHA 1C6JA 2QARC 1CV1A 3LZMA 3GULA 199LA 1CV0A 1L65A 1XEPA 1QT6A 1PQOA 3SB9A 1L40A 4ARJA 1LGXA 225LA 3G3VA 4PJZA 1L77A 1L59A 2B70A 4K5YA 1LW9A 216LA 4LDOA 1L20A 1L96A 1QUDA 3GUJA 1JTNA 1PQIA 1QUHA 238LA 4ARPA 259LA 1P46A 143LA 1L0JA 2ANVA 1KY0A 1L13A 1L42A 2B74A 3HDFA 4I7LA 1C6HA 2OTYX 1L36A 1LWKA 232LA 3HTGA 256LA 1L54A 1L53A 1CTWA 4ARQB 1L97A 219LA 4W58A 1P64A 4AQNA 184LA 1L09A 1LYIA 2O79A 1SWYA 195LA 112LA 1L10A 1L37A 165LA 214LA 1QT7A 1P5CA 1L33A 3HH6A 2OU0X 2RBNA 1OWZA 3NY9A 1L16A 1L76A 3HUAA 1C60A 4YXCA 1L14A 1CX7A 1L81A 1G0LA 3CDVA 3HU8A 3GUNA 168LA 3HT9A 1CVKA 1L15A 1L18A 3HH4A 177LA 1L85A 1L87A 254LA 4I7MA 209LA 1C68A 1L31A 3V2WA 120LA 4W55A 1DYDA 1QT8A 1PQDA 1C67A 178LA 1C6CA 1P36A 227LA 3UONA 4PK0A 113LA 2O4WA 1C6NA 239LA 224LA 3HT7A 141LA 1KY1A 3C82A 5LZMA 2NTGA 114LA 176LA 1L60A 1L35A 4LDLA 1ZWNA 1XJUA 1P6YA 1L21A 1C6EA 3C7ZA 1C63A 260LA 1PQJA 1L19A 3HT8A 3C8RA 1QT3A 3VW7A 1L22A 3EMLA 1QS5A 159LA 1L73A 1L75A 1QTVA 2OU9A 4ARMB 163LA 122LA 3CDTA 4W52A 181LA 4I7QA 3DN1A 1L23A 1L74A 3DMXA 3DN6A 1I6SA 236LA 1KW5A 123LA 3CDOA 2Q9EA 3QAKA 1CUPA 229LA 1L57A 1SX7A 3GUPA 4LZMA 147LA 1LYJA 4GRVA 220LA 108LA 4LDEA 3CDRA 3GUIA 167LA 183LA 1L25A 2B6WA 1OVJA 1SX2A 2RH1A 1KS3A 4DAJA 1QTHA 1L66A 1L11A 2RB2X 205LA 4DJHA 1L27A 1L93A 130LA 1B6IA 1JQUA 4I7RA 1L88A 160LA 3G3XA 4I7TA 3C8QA 1SSYA 258LA 3C80A 1NHBA 6LZMA 1OWYA 3C81A 1OVHA 2OE4X 1SSWA 2RBOA 3HH5A 1L17A 1L94A 1CU0A 3SBBC 5I14A 1L06A 1L69A 1L63A 1G0MA 1L24A 1T8AA 170LA 1QTCA 1D3FA 107LA 3DN8A 1L64A 1QS9A 158LA 2B7XA 1CU5A 2OE9X 145LA 1CU3A 1L49A 189LA 155LA 1LI2A 237LA 192LA 1L70A 3SB7A 4E97A 1KW7A 1C64A 2B6XA 2ANXA 1OV7A 3NYAA 1L91A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EL1A 4HTQA 1QTDA 1LZ9A 2BQNA 4W54A 156LA 1P3NA 1QQYA 1C6GA 1T97A 4EKPA 180LA 5LVHA 1B7QA 1IOTA 4OOTA 1LJFA 4RW2A 4UWUA 5ILCA 1DYCA 1QUTA 4PGJB 164LA 4DD7A 4H9AA 1GPQC 1OUJA 1GFUA 4LYTA 1GBOA 3HBEX 1DKKA 1DI4A 3QE8A 4RLNA 3TXKA 4W57A 1JTMA 1YAOA 3C83A 1G0KA 1LPYA 4IATA 1A4VA 2Z39A 1NMMA 2BPUA 2DQHY 2Z38A 1NHEA 1B7OA 2F47A 2Y8PA 212LA 2DQCY 1G06A 1CJ7A 4LYZA 1FLYA 4W53A 3WUAA 4HV2A 1CV6A 1JJ1A 2F32A 1LGUA 3WPJA 1EPYA 2LZ2A 2MEAA 1G0PA 4I7KA 1LSCA 198LA 174LA 1AM7A 1IP5A 150LA 1IOCA 1L38A 1LYFA 3PDSA 3HDEA 4RLMA 1QDTA 1KXYA 1BVKC 144LA 3L2XA 1TDYA 1C66A 1L61A 3WPKA 261LA 1TAYA 3HT6A 2F2QA 4QY9A 2Q9DA 3IWRA 1VDPA 1L86A 4NEBA 4ARMA 1IX0A 201LA 4DC4A 4CFPA 4DWXA 4DDCA 2EIZC 5DN5A 251LA 3B0KA 4GN4A 1BVXA 3A3QA 169LA 3AYQA 3G3AB 4NG8A 5B1FA 4ANRA 4H92A 4XJIA 1C65A 2LZMA 5LVKA 1D3NA 1L82A 1DZBX 2YBJA 2A4TA 3GUKA 4C3WA 151LA 3P68A 3HU9A 1IP2A 3SBAA 1DYBA 1JEFA 3F9LA 5F14A 1L01A 242LA 1A2YC 1L03A 4CJ2A 2YDGA 1L79A 1C6LA 4HPIA 1G0JA 3CSQA 4NFVA 5LVGA 2DQDY 4W56A 1QSBA 2LCBA 5IELA 1C6MA 3LN2A 2LYOA 1BWIA 146LA 4WMGA 5I4WA 1GFKA 2EPEA 4W51A 1IOSA 190LA 5D5CA 4G49A 1KIPC 3CSRA 1GEVA 4HJYA 1ZURA 1TLAA 3HUQA 206LA 4GBRB 2G4NA 4WO6A 134LA 5C6LA 1H6MA 3LYTA 3W6AA 4BAFA 1ALCA 3GUMA 1OQMA 1QTBA 1LZSA 2FBBA 4ZPUA 3FADA 1BB7A 1J1PY 1FN5A 2B5ZA 4N1CC 128LA 4OO9A 1HSXA 1C61A 1C69A 1CV3A 4NWEA 139LA 3HBHA 1E8LA 5FELA 4CFOA 2BQLA 4QGZA 223LA 1H87A 196LA 4WOAA 1AT5A 4DT3A 3W6FA 1BQLY 4GCBA 1IP7A 1UIFA 1PQMA 4FDYA 2XJWA 4NHPA 3HTDA 3TXIA 5B07A 5KJ9A 4C5FA 1L99A 2B6TA 1GXV2 4R0FA 1GE4A 1IY4A 1L98A 4XJHA 1REMA 2BQKA 3E3DA 186LA 4H9CA 2HU1A 3N9CA 1LSZA 1L65A 1QT6A 5APFA 1L40A 4ARJA 3G3VA 1Z55A 1GE0A 1IWVA 1LW9A 216LA 1GFEA 1JUGA 1KXWA 3GUJA 1JTNA 2G4QA 1F10A 1P46A 3AGGG 143LA 1L0JA 1B5ZA 2Z12A 3HDFA 1C6HA 2OTYX 4NSIA 1LWKA 5D5FA 232LA 1LZ8A 3AZ4A 3WU9A 1XFPL 3N9AA 1L97A 1P64A 4AQNA 2BQMA 3A92A 1LYIA 195LA 1LSAA 1QT7A 1LZYA 1CKFA 1L33A 1IWXA 2F30A 1OWZA 4G4HA 4E3UA 1UIGA 4GLVA 1LYYA 3GUNA 1RFPA 4RW1A 1L15A 5F9UA 1L18A 1IR7A 254LA 4BAPA 5II3A 1B5WA 1L31A 120LA 1D9UA 1P36A 1V7TA 3UONA 4PK0A 1NDMC 4UWNA 2O4WA 1C6NA 239LA 4B0DA 5LA8A 1NWGA 2A7FA 4H9IA 1L60A 4H90A 4GCDA 1XEKA 5FCPA 1XJUA 1OUIA 4OWBA 1LZ6A 1RJCB 1UUZC 4H1PA 1C63A 2W1XA 1VEDA 5HMVA 1L22A 3EMLA 3A67Y 159LA 1L73A 1L75A 1IR8A 4ARMB 1GDXA 122LA 4HP0A 4NIJA 4W52A 3DN1A 1L23A 2YSSC 3DN6A 1I6SA 123LA 1GEZA 1GAZA 1SX7A 3TXDA 3CT5A 3GUPA 4LZMA 1GB6A 3P66A 108LA 1GFTA 1B7LA 5L9JA 1C08C 2B6WA 1IWUA 1KS3A 1L66A 1GFVA 4J7VA 1I56A 130LA 1I1ZA 3TXBA 1L88A 5KXLA 2F2NA 1HC0A 3WL2A 258LA 4FJRA 1JTTL 1B5XA 4HSFA 1IC4Y 4IASA 4ETBA 5KXZA 4NGIA 1LSDA 3WW6A 4NGVA 1L63A 1L24A 2FBDA 4PJ2C 1QTCA 3TXEA 1L64A 1OUGA 2BQGA 1QS9A 2B7XA 3A8ZA 2OE9X 1L49A 1WQNA 3WYHA 1W08A 4E97A 4ETEA 2B6XA 1YAPA 1LOZA 4EKRA 4DQ7A 1XJTA 3C7WA 1XGUC 1L84A 2DQIY 1IR9A 1C6KA 4MCKA 5LYTA 3PBLA 1WVVA 2B72A 1MLCE 4DD2A 1D6QA 188LA 5B05A 4NHQA 234LA 4Z3MA 161LA 4KPMA 157LA 1VDTA 4ZEEA 4H8XA 1T8GA 4NWHA 4W59A 5F9XA 1JPOA 1B0DA 1GF9A 4XADA 5KXTA 3EO5A 1QSWA 3A93A 102LA 1JJ0A 1IY3A 2WARA 4J1BA 2D4JA 1KXXA 125LA 3G3BB 1L02A 4TWSA 3QNGA 1VFBC 4EJ4A 2DKVA 1QIOA 3AGHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1EL1 A;  4HTQ A;  1QTD A;  1LZ9 A;  2BQN A;  4W54 A;  156L A;  1P3N A;  1QQY A;  1C6G A;  1T97 A;  4EKP A;  180L A;  5LVH A;  1B7Q A;  1IOT A;  4OOT A;  1LJF A;  4RW2 A;  4UWU A;  5ILC A;  1DYC A;  1QUT A;  4PGJ B;  164L A;  4DD7 A;  4H9A A;  1GPQ C;  1OUJ A;  1GFU A;  4LYT A;  1GBO A;  3HBE X;  1DKK A;  1DI4 A;  3QE8 A;  4RLN A;  3TXK A;  4W57 A;  1JTM A;  1YAO A;  3C83 A;  1G0K A;  1LPY A;  4IAT A;  1A4V A;  2Z39 A;  1NMM A;  2BPU A;  2DQH Y;  2Z38 A;  1NHE A;  1B7O A;  2F47 A;  2Y8P A;  212L A;  2DQC Y;  1G06 A;  1CJ7 A;  4LYZ A;  1FLY A;  4W53 A;  3WUA A;  4HV2 A;  1CV6 A;  1JJ1 A;  2F32 A;  1LGU A;  3WPJ A;  1EPY A;  2LZ2 A;  2MEA A;  1G0P A;  4I7K A;  1LSC A;  198L A;  174L A;  1AM7 A;  1IP5 A;  150L A;  1IOC A;  1L38 A;  1LYF A;  3PDS A;  3HDE A;  4RLM A;  1QDT A;  1KXY A;  1BVK C;  144L A;  3L2X A;  1TDY A;  1C66 A;  1L61 A;  3WPK A;  261L A;  1TAY A;  3HT6 A;  2F2Q A;  4QY9 A;  2Q9D A;  3IWR A;  1VDP A;  1L86 A;  4NEB A;  4ARM A;  1IX0 A;  201L A;  4DC4 A;  4CFP A;  4DWX A;  4DDC A; 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