1KY1A

Methionine core mutant of t4 lysozyme
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ky1A00
1L07A 1LGWA 200LA 229LA 243LA 1L81A 3G3VA 1OV5A 1L83A 205LA 3HTGA 1G0JA 2B6XA 4I7LA 1L39A 3GUMA 104LA 4YXAC 1TLAA 167LA 1C6LA 3HTDA 1L20A 4EPFA 115LA 1D2WA 146LA 3C7ZA 4EKSA 1CTWA 1L91A 1P2RA 4YXCA 5LZMA 1P46A 184LA 1L11A 1L94A 129LA 258LA 2QARC 1G0GA 1DYGA 1P36A 239LA 2RAZX 3C8QA 1L41A 144LA 1L57A 253LA 1QT8A 3HH3A 4ARPA 4OO9A 235LA 1OWYA 1OWZA 212LA 140LA 1D3JA 2O79A 2NTHA 4I7RA 1D3FA 1L55A 1ZYTA 210LA 2RBPA 199LA 173LA 1P37A 1L32A 3GUOA 1P2LA 4ZPUA 1CV1A 4W58A 1SSYA 1QT5A 255LA 1C6EA 1C6GA 3C82A 1CU5A 4GRVA 187LA 1L49A 1L38A 1L15A 2O7AA 1CV4A 241LA 3G3WA 2F47A 3PDSA 1L28A 1L99A 175LA 142LA 1L09A 4I7KA 3D4SA 1L31A 1QS9A 1CU2A 3DN6A 2RB1X 1DYEA 1L43A 1L03A 1SWZA 257LA 2B70A 3UONA 242LA 259LA 152LA 158LA 1C6QA 1L29A 1L25A 1QTZA 1L98A 1L44A 1XEPA 244LA 159LA 1LYEA 2RB0X 1XJUA 102LA 1QTDA 1L96A 1L05A 224LA 1L34A 1QUDA 1SWYA 4EKPA 108LA 3SB9A 262LA 3FA0A 151LA 174LA 6LZMA 1CV5A 4LZMA 3SBAA 163LA 4W55A 2OE9X 1G1VA 2F2QA 126LA 1PQKA 160LA 216LA 1LI6A 107LA 112LA 171LA 223LA 219LA 1G0MA 206LA 1L08A 3CDVA 4W57A 1LLHA 1L0JA 1L19A 1L73A 1JTMA 185LA 201LA 3C8RA 166LA 4I7SA 1L12A 1L84A 1L46A 1C6FA 1L47A 1LYIA 1C67A 3C7WA 147LA 1D3MA 1T8GA 1D3NA 1C64A 1L69A 1LYGA 1QSQA 222LA 3F8VA 1CVKA 1L66A 1G06A 3SB6A 1L33A 2Z6BA 1CX6A 1NHBA 1LGUA 4S0WA 186LA 3HT6A 1L68A 4PJZA 1QT6A 120LA 1OV7A 189LA 3OE9A 1KW5A 250LA 1QS5A 1PQOA 168LA 3DN2A 1L60A 1L76A 150LA 3HT7A 3G3XA 256LA 1T8FA 3RUNA 254LA 3HH4A 247LA 1KNIA 2RBNA 3GULA 196LA 4W59A 157LA 1SX7A 3K2RA 1C65A 111LA 4I7TA 2QB0B 240LA 1DYAA 1PQIA 3GUKA 3HT8A 123LA 4ARJA 4EPIA 251LA 1CX7A 3CDTA 1C6NA 110LA 1L37A 3DKEX 109LA 1C6AA 1KY0A 2Q9EA 170LA 1JTNA 1L53A 1K28A 1P3NA 1LYDA 225LA 1L70A 1QTCA 3DMVA 3OE6A 1L71A 125LA 118LA 145LA 1D9WA 1L0KA 1L56A 4ARMA 1C6TA 1L87A 1LI2A 119LA 155LA 1DYCA 130LA 4EXMA 220LA 2OEAX 3PBLA 1L10A 3SB8A 183LA 1L95A 2OE7X 1L80A 1G1WA 149LA 177LA 1D2YA 1L02A 4ARQA 4K5YA 1L35A 1L67A 248LA 215LA 3C7YA 4I7QA 138LA 181LA 1P7SA 1P56A 4W51A 1LPYA 2LC9A 1LWKA 1C6BA 3C83A 233LA 180LA 238LA 226LA 1L13A 3HU8A 1C6MA 2A4TA 3HH5A 3ODUA 2OE4X 3L64A 1C6HA 1CV0A 230LA 172LA 1L18A 2HUKA 1L06A 1PQDA 4EJ4A 1OVJA 3QAKA 4IAPA 3RZEA 2B7XA 1OYUA 1L85A 1DYBA 2B6TA 4LDEA 3DN0A 2B74A 156LA 3L2XA 1T6HA 178LA 4EKRA 3OE8A 1QT7A 198LA 2HUMA 2O4WA 1L92A 1L88A 236LA 1XJTA 1L27A 234LA 7LZMA 4ARLA 1CU0A 3DNAA 1DYFA 246LA 1L82A 1LI3A 1C62A 164LA 1P6YA 228LA 1L54A 148LE 218LA 3EMLA 1QUGA 1L61A 1C69A 2RB2X 162LA 1T8AA 2Q9DA 3VW7A 2RBSA 1L23A 1L59A 2L78A 188LA 231LA 2B75A 1QT3A 3HT9A 1QUHA 3CDRA 1ZWNA 1C66A 1KY1A 3HDEA 1L51A 1L72A 4I7PA 2RH1A 214LA 1L97A 2CUUA 3NY8A 122LA 3C80A 3SB5A 3FI5A 3SB7A 1C6IA 1B6IA 2B72A 2OU9A 3CDQA 4W52A 4AQNA 211LA 3C8SA 3JR6A 1C6DA 3HWLA 192LA 1G0PA 1L21A 1SX2A 161LA 1WTHA 191LA 4DJHA 3DN3A 2OU0X 1L30A 3OE0A 1QTHA 1L64A 2LCBA 1L48A 2B73A 190LA 1L45A 4DKLA 245LA 3HH6A 182LA 4W54A 2OTYX 3V2YA 227LA 3SN6R 169LA 128LA 237LA 1LWGA 2HULA 3NY9A 1L04A 1L22A 3HUKA 114LA 1P64A 1L65A 1L26A 113LA 5I14A 3GUNA 3HUAA 1PQJA 1LW9A 1LYHA 4PK0A 1L86A 3C81A 1DYDA 1L74A 139LA 1C6JA 213LA 1CU3A 1C6CA 1L01A 232LA 3GUJA 1T97A 1C6KA 1L62A 1L00A 217LA 1G07A 1QTBA 1L50A 1G0LA 2RBRA 137LA 1L93A 1LGXA 3HUQA 4GBRB 3LZMA 3DN4A 1L75A 2NTGA 3HTBA 2B6YA 4ARMB 1CUPA 2LZMA 1QTVA 2OTZX 3F9LA 4EKQA 1CUQA 1L89A 1ZURA 2B6ZA 1L42A 1C60A 4I7MA 4I7JA 2IGCA 1EPYA 4ARQB 1PQMA 3DMXA 3HTFA 1SSWA 2ANVA 127LA 1C63A 1CV6A 3V2WA 1C6PA 1I6SA 1OVHA 4LDOA 3DN1A 165LA 1L16A 1CV3A 3DN8A 3DMZA 4W53A 1L24A 3CDOA 195LA 131LA 4I7OA 3FADA 1QUOA 176LA 1LYFA 1P5CA 252LA 260LA 1JQUA 1KW7A 2RAYX 1CU6A 4YX7C 1L14A 2B6WA 1L77A 1OVKA 141LA 1LYJA 3GUPA 4LDLA 1L40A 3HU9A 1KS3A 2OU8A 103LA 2RBOA 1G0KA 209LA 4W56A 1C61A 1L58A 1L63A 1C68A 1L36A 3GUIA 2RBQA 3NYAA 2ANXA 1L90A 249LA 2F32A 221LA 1G0QA 1L17A 261LA 197LA 1L79A 4I7NA 3SBBC 4E97A 1QSBA 1L52A 1QT4A 3HDFA 4DAJA 143LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHXA 1DZBX 1HSWA 1NQIA 200LA 2YDGA 1IP1A 1LKRA 2BQBA 2ZYPA 4YXAC 1TLAA 167LA 1C6LA 3HTDA 1L20A 4EPFA 3D3DA 146LA 1Z55A 1IP4A 2W1MA 4YXCA 1IOSA 1P46A 184LA 1TCYA 1HFXA 3TXIA 2W1XA 1LSAA 4Z98A 1P36A 1JKAA 4OO9A 4ETCA 1OWYA 1OWZA 1D3JA 1LJFA 2NTHA 4DD0A 4YEOA 1L55A 1HEOA 210LA 2ZILA 1LYSA 4UWNA 5KJ9A 5HLLA 1P37A 3GUOA 4PRUA 1P2LA 1LZEA 5KXPA 4KT3A 1UIFA 3B6LA 2F30A 1CU5A 4GRVA 4BADA 3CSZA 1BWJA 3GXKA 1BB7A 1CV4A 3G3WA 5LAFA 142LA 1LZAA 5M1YA 1GE3A 1N4FA 1JTPL 1LOZA 1DYEA 3ZEKA 4BAFA 4AXTA 2RSCA 1GB6A 1LHJA 1L43A 257LA 5A3EA 242LA 1GAZA 1L25A 3WYHA 3N9CA 4G4CA 4Z3MA 224LA 4RW1A 1SWYA 4GN5C 4XJGA 4N1EI 3SB9A 1OUAA 3TMXA 4WL7A 2BQFA 5FHWA 5KXNA 1DKKA 1PQKA 4M4OA 1QSWA 1IWWA 1HEPA 1GB5A 206LA 4W57A 1DXJA 1INUA 1L0JA 1ZVHL 4I7SA 1CKFA 1LZCA 1L12A 1L84A 1L46A 1LSFA 3C7WA 3RT5X 5AMYA 1YIKA 4OOTA 2VB1A 1L69A 2BLYA 3EXDA 1L33A 4HJVA 1REZA 1HELA 2Z6BA 1LGUA 1GB2A 4S0WA 3HT6A 4B4EA 120LA 5FCPA 2YSSC 1KW5A 250LA 1WTMA 1QS5A 1PQOA 168LA 256LA 3RUNA 254LA 5II3A 1GFEA 3GULA 4LT0A 4UWVA 3WUNA 196LA 1SX7A 1XSFA 4WM6A 4N8ZA 2DQJY 2HEFA 240LA 1QDTA 1IX0A 4L41A 4PHIA 123LA 5EBHA 4EPIA 251LA 1H6MA 3P65A 4MR1A 5F14A 2Z38A 1LSMA 4TSBA 1BGIA 1CKDA 1C6AA 170LA 1JTOL 1L53A 1F0WA 1XGUC 2F4GA 1L70A 125LA 3N9AA 4WLYA 3TXEA 133LA 145LA 1D9WA 5FEKA 1NHEA 1VDQA 1DYCA 4EXMA 220LA 2YBHA 1O23A 2OE7X 1G1WA 149LA 4G49A 3LYZA 5LVJA 1L35A 3C7YA 248LA 5APEA 1LZ9A 1XGRC 2LC9A 1GBSA 3C83A 1UBZA 180LA 238LA 1BQLY 226LA 1C6MA 1OUIA 3CSQA 1C6HA 1B7QA 1JEFA 2HUKA 3B0IA 4EJ4A 2ZWBA 3W6EA 3W6AA 1NDMC 3ATOA 1HMLA 3RNXA 4H93A 4H8ZA 1DPXA 1DYBA 2B6TA 3DN0A 1IY3A 1LJKA 2MEDA 1H87A 2O4WA 1AM7A 4H94A 3P4ZA 3DNAA 1LMAA 3CT0A 2BQLA 164LA 228LA 2MEFA 1IVMA 218LA 3EMLA 1OUJA 3WPLA 1DPWA 4HTKA 3TXGA 2Q9DA 1GBZA 4DD3A 6LYTA 1KY1A 1IR8A 1L72A 4I7PA 4NSJA 122LA 3W6FA 1UACY 4HV1A 3CDQA 4AQNA 3TXKA 3C8SA 1LMOA 1GF8A 1B7OA 1L21A 1G0PA 1SX2A 4FJRA 1VFBC 3CT1A 4OWEA 2OU0X 1LJNA 3CB7A 1QTHA 1L64A 5IDDA 2LCBA 3A67Y 1C7PA 4WO9A 1NBYC 227LA 2Z39A 4XYYA 1LWGA 1D0LA 1L04A 4NHQA 3WVYA 1P64A 3EO5A 113LA 5I14A 4ML7A 4GCBA 2Z2FA 4GCCA 4C5FA 4DQ7A 4H9IA 139LA 1C6JA 1EQ5A 3QE8A 1BB6A 4NY5A 4H9HA 1L01A 3ULRA 1L62A 4NGYA 137LA 4NGZA 2FYCA 5LA8A 3HTBA 2YBJA 1CUPA 2LZMA 1LZ1A 1GXXA 4I7MA 4RW2A 3AYQA 1HF4A 2BQDA 1UA6Y 2I6ZA 5F16A 4ETAA 1HENA 1LZBA 4DD1A 1C6PA 1UCOA 1XEJA 3DN1A 3A8ZA 4NGOA 1CV3A 5KXOA 3QY4A 4W53A 5KXKA 1GE4A 4I7OA 1QUOA 4D9ZA 176LA 252LA 2XJWA 3TMUA 1D6QA 4EOFA 2RAYX 5B1FA 4YX7C 1KXWA 1L14A 2B6WA 2FYDA 1OVKA 1L40A 103LA 2RBOA 1JJ3A 1LMCA 1LJ3A 1G0KA 209LA 2HECA 194LA 4GCFA 1C61A 1L58A 4M6DA 5LVGA 3NYAA 3WUAA 1L90A 249LA 6LYZA 1IP5A 1G0QA 221LA 1L17A 1IWVA 261LA 1G7LC 4I7NA 4E97A 1L52A 4DAJA 3HDFA 4B49A 143LA 4H9AA 4IJ4A 1GFJA 2G4NA 4NGVA 3TXJA 5D5CA 5KKIA 1OV5A 205LA 4Z46A 1G0JA 2B6XA 3D9AC 3GUMA 1YAQA 4YM8A 3C7ZA 3AW7A 5A3ZA 1L91A 5LZMA 1L11A 3KAMA 258LA 1AT6A 2LYOA 1RFPA 2A7FA 3G3AB 1LMQA 3TMVA 4H1PA 1L41A 2C8OA 1QT8A 1QUTA 1DI4A 5LA5A 212LA 140LA 3M18B 1REYA 1UIEA 1B7NA 199LA 4LT3A 1LHIA 3TMWA 173LA 1L32A 4R0FA 1CV1A 1SSYA 1QT5A 1IWUA 1C6GA 3WU7A 2ZIKA 3IJVA 3B0OA 1L49A 1L38A 1LSPA 5E4PA 2O7AA 241LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CHX A;  1DZB X;  1HSW A;  1NQI A;  200L A;  2YDG A;  1IP1 A;  1LKR A;  2BQB A;  2ZYP A;  4YXA C;  1TLA A;  167L A;  1C6L A;  3HTD A;  1L20 A;  4EPF A;  3D3D A;  146L A;  1Z55 A;  1IP4 A;  2W1M A;  4YXC A;  1IOS A;  1P46 A;  184L A;  1TCY A;  1HFX A;  3TXI A;  2W1X A;  1LSA A;  4Z98 A;  1P36 A;  1JKA A;  4OO9 A;  4ETC A;  1OWY A;  1OWZ A;  1D3J A;  1LJF A;  2NTH A;  4DD0 A;  4YEO A;  1L55 A;  1HEO A;  210L A;  2ZIL A;  1LYS A;  4UWN A;  5KJ9 A;  5HLL A;  1P37 A;  3GUO A;  4PRU A;  1P2L A;  1LZE A;  5KXP A;  4KT3 A;  1UIF A;  3B6L A;  2F30 A;  1CU5 A;  4GRV A;  4BAD A;  3CSZ A;  1BWJ A;  3GXK A;  1BB7 A;  1CV4 A;  3G3W A;  5LAF A;  142L A;  1LZA A;  5M1Y A;  1GE3 A;  1N4F A;  1JTP L;  1LOZ A;  1DYE A;  3ZEK A;  4BAF A;  4AXT A;  2RSC A;  1GB6 A;  1LHJ A;  1L43 A;  257L A;  5A3E A;  242L A;  1GAZ A;  1L25 A;  3WYH A;  3N9C A;  4G4C A;  4Z3M A;  224L A;  4RW1 A;  1SWY A;  4GN5 C;  4XJG A;  4N1E I;  3SB9 A;  1OUA A;  3TMX A;  4WL7 A;  2BQF A;  5FHW A;  5KXN A;  1DKK A;  1PQK A;  4M4O A;  1QSW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4CHX A;  1DZB X;  1HSW A;  1NQI A;  200L A;  2YDG A;  1IP1 A;  1LKR A;  2BQB A;  2ZYP A;  4YXA C;  1TLA A;  167L A;  1C6L A;  3HTD A;  1L20 A;  4EPF A;  3D3D A;  146L A;  1Z55 A;  1IP4 A;  2W1M A;  4YXC A;  1IOS A;  1P46 A;  184L A;  1TCY A;  1HFX A;  3TXI A;  2W1X A;  1LSA A;  4Z98 A;  1P36 A;  1JKA A;  4OO9 A;  4ETC A;  1OWY A;  1OWZ A;  1D3J A;  1LJF A;  2NTH A;  4DD0 A;  4YEO A;  1L55 A;  1HEO A;  210L A;  2ZIL A;  1LYS A;  4UWN A;  5KJ9 A;  5HLL A;  1P37 A;  3GUO A;  4PRU A;  1P2L A;  1LZE A;  5KXP A;  4KT3 A;  1UIF A;  3B6L A;  2F30 A;  1CU5 A;  4GRV A;  4BAD A;  3CSZ A;  1BWJ A;  3GXK A;  1BB7 A;  1CV4 A;  3G3W A;  5LAF A;  142L A;  1LZA A;  5M1Y A;  1GE3 A;  1N4F A;  1JTP L;  1LOZ A;  1DYE A;  3ZEK A;  4BAF A;  4AXT A;  2RSC A;  1GB6 A;  1LHJ A;  1L43 A;  257L A;  5A3E A;  242L A;  1GAZ A;  1L25 A;  3WYH A;  3N9C A;  4G4C A;  4Z3M A;  224L A;  4RW1 A;  1SWY A;  4GN5 C;  4XJG A;  4N1E I;  3SB9 A;  1OUA A;  3TMX A;  4WL7 A;  2BQF A;  5FHW A;  5KXN A;  1DKK A;  1PQK A;  4M4O A;  1QSW A; 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