1L01A

Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage t4. the temperature-sensitive mutant protein thr157 (right arrow) ile
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRAGIWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage T4. The temperature-sensitive mutant protein Thr157----Ile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l01A00
233LA 3C81A 221LA 3SB6A 220LA 217LA 260LA 128LA 4I7KA 2LC9A 1DYCA 1QT8A 1C6PA 1L10A 112LA 2NTHA 2RB0X 1L38A 1L35A 2B75A 247LA 123LA 110LA 1L32A 1DYFA 1JTNA 3HTFA 126LA 185LA 1OVHA 2QB0B 1L24A 242LA 1T8AA 4PJZA 1C62A 1L94A 4ARPA 3L2XA 213LA 4YXCA 3HT6A 1P56A 1L65A 1L92A 1L33A 1DYDA 3SN6R 1L98A 1LI3A 1CX7A 2RBQA 4I7QA 4ARLA 1QTBA 1L03A 1L08A 1OWYA 1LLHA 1L72A 3C82A 3GUKA 3UONA 1C6QA 230LA 1L75A 1NHBA 2RBOA 1C69A 189LA 4EPIA 107LA 1SSYA 2B6XA 3HTBA 1L68A 2RBSA 3K2RA 142LA 1P6YA 6LZMA 1CVKA 1KNIA 1LWGA 1PQDA 2Q9EA 4W58A 2LCBA 2L78A 3HDFA 232LA 3GUOA 201LA 1C6JA 1C6NA 129LA 1SWYA 2HUKA 1L09A 1KY0A 1LI2A 1P2LA 1JQUA 3CDTA 250LA 1LYFA 3FA0A 1QUOA 3HH3A 4I7SA 1L05A 1L23A 212LA 1G1VA 215LA 1QTDA 2B6YA 3RZEA 257LA 1XJTA 2IGCA 3DN4A 4ARJA 3DN6A 1L22A 1PQJA 1C64A 1D2YA 139LA 4E97A 1QTCA 152LA 1P37A 3CDVA 3HWLA 3HTDA 1C6EA 2OU0X 235LA 1DYAA 1L11A 4PK0A 122LA 231LA 1C67A 1L61A 1LYHA 1L31A 3PBLA 1CV6A 3C8RA 1L42A 1L41A 227LA 1OYUA 3DKEX 3DN1A 4EKRA 3OE0A 1C6BA 3PDSA 167LA 1L84A 186LA 3G3XA 1C6AA 1G0JA 1L93A 1B6IA 239LA 2RB1X 4W51A 2B74A 1CUPA 1CU3A 2B73A 1L07A 3DMVA 198LA 1D9WA 219LA 4W52A 3GUMA 1T8GA 224LA 1G0QA 119LA 1L28A 1L81A 1T97A 131LA 3C7ZA 1L00A 3HUKA 1XEPA 2B6WA 165LA 3HT9A 1L21A 1OV5A 1PQOA 3C83A 1G0LA 1LYGA 191LA 3G3VA 1L49A 2RBNA 7LZMA 1CTWA 199LA 1CV5A 3C80A 261LA 3G3WA 1L30A 1L25A 2OE9X 4AQNA 174LA 2RBRA 245LA 1L50A 1P46A 1L73A 1L34A 256LA 2RB2X 4I7PA 4ZPUA 1L17A 3F8VA 2Z6BA 3GUIA 125LA 3HTGA 1QTZA 1L90A 157LA 1L64A 1LYJA 3V2YA 4W54A 2NTGA 3SB7A 1CU0A 1OVJA 159LA 1LGUA 3CDOA 1CV4A 210LA 3OE6A 243LA 225LA 1L12A 1L37A 147LA 4I7MA 1QS9A 2HUMA 1CV0A 1L70A 1P3NA 222LA 3DMXA 188LA 3EMLA 1CUQA 1QUDA 1C6FA 197LA 1L29A 3NY8A 1QT6A 3HU8A 3RUNA 4I7NA 234LA 4K5YA 4ARQA 137LA 141LA 3HDEA 3C7YA 109LA 146LA 1L86A 1DYBA 4LDOA 2RH1A 4ARQB 1L54A 3HUAA 209LA 3F9LA 108LA 249LA 4I7LA 1C61A 223LA 111LA 1L66A 1L48A 104LA 1C6CA 1LGXA 2B70A 2RBPA 4LDEA 4DKLA 1L87A 5I14A 1L06A 143LA 1PQMA 1I6SA 4YXAC 1L80A 1L01A 2O4WA 1SWZA 3VW7A 1LYIA 1L53A 182LA 1L0KA 3QAKA 1L58A 1QSQA 2F2QA 1C6KA 1K28A 3SB9A 1C6IA 2RAYX 2QARC 2OE4X 1D3MA 114LA 255LA 236LA 4EPFA 187LA 2F32A 4S0WA 178LA 1L39A 1L85A 1C66A 1LWKA 3SBAA 252LA 163LA 1L02A 1L36A 4I7TA 115LA 2B6TA 2O7AA 1L13A 1L96A 171LA 1L83A 3DN8A 1D3NA 246LA 240LA 1L45A 3DN0A 1P64A 3C8SA 1L20A 1ZWNA 4IAPA 241LA 1QT4A 1C65A 1L77A 1L69A 1KS3A 173LA 1QTHA 151LA 1L19A 1G0PA 1C6LA 1ZYTA 3HU9A 4GRVA 175LA 2HULA 218LA 1L51A 1P36A 3OE8A 3OE9A 1CU6A 1SX2A 5LZMA 1L27A 1L59A 4W53A 4EKSA 4EKQA 1L97A 1L60A 1L74A 211LA 3L64A 1G06A 1SSWA 2CUUA 140LA 3CDRA 3DN2A 1L76A 4EKPA 148LE 1G0MA 244LA 1L62A 1D3JA 2B72A 1QUGA 130LA 1DYGA 4W59A 161LA 237LA 3NYAA 4W57A 2OTYX 1QT5A 1DYEA 3LZMA 3C8QA 1TLAA 2A4TA 2ANXA 180LA 2B6ZA 254LA 184LA 3D4SA 150LA 238LA 2Q9DA 1L15A 2OTZX 113LA 1CV3A 1QSBA 1L40A 138LA 4I7RA 1L44A 1L57A 1KW5A 1LW9A 1QUHA 164LA 1EPYA 4I7OA 1C6DA 4EJ4A 262LA 168LA 3SBBC 1L0JA 205LA 2ANVA 1P2RA 4OO9A 1L71A 4DAJA 248LA 3GUJA 1JTMA 1L89A 1OV7A 172LA 102LA 1QT7A 1G07A 1L82A 3ODUA 3V2WA 228LA 195LA 1WTHA 3FI5A 1L18A 4LDLA 1LYEA 4YX7C 156LA 1L52A 259LA 1C63A 1G1WA 1L79A 1L63A 226LA 4EXMA 2F47A 2OU8A 253LA 1CU5A 3DMZA 1C6GA 176LA 3GUPA 1D3FA 3HH5A 1CX6A 3HT8A 162LA 1KY1A 4W55A 4ARMA 103LA 1XJUA 4W56A 2OU9A 1C6MA 183LA 1T6HA 1C6HA 4ARMB 1P7SA 1L16A 3SB5A 2OEAX 190LA 160LA 155LA 1CU2A 1L04A 1QS5A 120LA 1C60A 169LA 181LA 196LA 1QTVA 1OVKA 145LA 1G0GA 1L26A 3NY9A 118LA 3DNAA 2OE7X 1LPYA 127LA 1C6TA 1L46A 1ZURA 3JR6A 2RAZX 4DJHA 258LA 1L55A 166LA 3GULA 4GBRB 1KW7A 4LZMA 1PQKA 1D2WA 3HH4A 1LGWA 1C68A 1QT3A 1L88A 1T8FA 1L43A 1G0KA 1L95A 3SB8A 1LYDA 1L47A 1SX7A 1L14A 251LA 170LA 206LA 2B7XA 1PQIA 200LA 229LA 2O79A 1P5CA 3CDQA 158LA 1L67A 149LA 1OWZA 3C7WA 4I7JA 192LA 3HH6A 177LA 3GUNA 1CV1A 144LA 1L56A 1L99A 216LA 1LI6A 3FADA 3HT7A 3HUQA 214LA 2LZMA 1L91A 3DN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VATA 3C81A 2BQNA 2YBJA 217LA 4I7KA 2H5ZA 2G4PA 1LZYA 2RB0X 1IC5Y 1REYA 2ZYPA 247LA 1XSFA 1DYFA 1JTNA 3AGHA 1LZDA 1J1PY 3CSQA 5FSTA 1L94A 1L65A 4OWBA 4N0JA 1CJ8A 3EO5A 2YBHA 1IWYA 1B7SA 3WPKA 2W1MA 5K7OA 4LYTA 2XJWA 4XADA 1LSYA 230LA 189LA 4WMGA 107LA 1DXJA 5HQ1A 2RBSA 2ZWBA 1GWDA 6LZMA 1CVKA 2BPUA 2EQLA 4NY5A 1GD6A 2BAAA 5F81A 1P2LA 3LYOA 1GF4A 1LZRA 1DPXA 1QUSA 1BB5A 1L23A 2Z38A 5LA5A 1QTDA 5KXPA 1UCOA 3RZEA 4GLVA 3WL2A 1GF9A 4HJYA 3DN4A 2CWIA 4M6DA 4QGZA 139LA 1MELL 4E97A 1OUJA 1LYYA 3WU7A 1GEVA 1GHLA 4PK0A 122LA 4H1PA 1L61A 1LYHA 1L31A 3P64A 3C8RA 4ETDA 1LAAA 227LA 5FELA 3RW8A 2MEAA 3OE0A 1C6BA 3PDSA 167LA 3G3XA 1L93A 207LA 1VDQA 3QNGA 4B4IA 2D91A 3DMVA 3TXGA 1D9WA 224LA 1L28A 4GN3A 1T97A 4DDAA 3TMWA 1QDRA 1PQOA 1HNLA 1LYGA 1L49A 2RBNA 3A90A 3A67Y 199LA 5KY1A 261LA 3G3WA 1WQPA 4OWHA 6LYTA 2DQGY 1IR9A 1KIQC 4DD0A 174LA 1CJ7A 245LA 1L50A 4MCKA 1P46A 1UICA 2RB2X 4DWXA 4TTDA 2Z39A 3F8VA 2Z6BA 1BB4A 1HELA 1QTZA 1TAYA 157LA 2AUBA 2F30A 4EOFA 1OVJA 1LGUA 1CV4A 1AT6A 243LA 1L37A 1GBWA 1FLQA 4I7MA 4WO6A 1AZFA 1P3NA 1LZAA 2EKSC 188LA 2MEDA 1B7LA 1LZGA 3EMLA 5EBHA 4P2EA 2MEIA 3B0IA 1JKAA 4LYOA 1FLWA 137LA 1OUGA 2MEEA 3HDEA 4NIJA 1L86A 4H9AA 4ARQB 1INUA 1L54A 3HUAA 4WOAA 1IP2A 1IY4A 3A34A 1C6CA 3IWRA 1B5UA 1GF3A 2ZILA 1LSZA 1JISA 4LDEA 4DKLA 2HEAA 1L06A 4KL7A 2EPEA 2Z2EA 1BHZA 2ZNXY 3AGIA 3VW7A 1LYIA 1L53A 182LA 4G49A 1HSWA 1L58A 4ML7A 1JTTL 1C6KA 3HBDA 5HLLA 2YBNA 1C6IA 3TXJA 1DI3A 3B72A 236LA 1D6PA 5DL9A 4I0CA 2I6ZA 2F32A 4NHQA 1LWKA 3SBAA 1YL1X 2Z2FA 115LA 1WTNA 2B6TA 2O7AA 1P64A 1LSEA 2LYOA 1BQLY 5L3HA 1L77A 3ATOA 1GFVA 1UIBA 1GBXA 4Z46A 4XENA 1I56A 1EQ4A 1LHKA 218LA 4NGZA 3OE8A 1LJNA 2ZIKA 4J1BA 1CU6A 1L97A 1GB0A 1L60A 1L74A 1NHEA 4B4JA 5IHGA 148LE 1G0MA 1GB6A 1GFRA 244LA 1QUGA 3B6LA 4W57A 2MECA 1LSMA 4NHTA 1DYEA 3W6AA 3SP3A 4I8SA 180LA 5F9UA 1LZ5A 254LA 184LA 3FE0A 1CV3A 3ULRA 3AJNA 1QSBA 1GB2A 1L40A 1B5WA 3W6EA 1LW9A 1EPYA 4WM1A 262LA 4NWEA 4B1AA 2ANVA 3W6FA 3GUJA 1LZSA 1QT7A 4NFVA 5I5QA 1G07A 2FBBA 228LA 2DQDY 1GB5A 1WTHA 1NDMC 5F9XA 3M18B 1JHLA 1WQMA 153LA 1HMKA 3WU8A 1LJIA 4NGIA 1JUGA 3CT1A 1CU5A 5E9RA 2YVBA 1LSAA 4DD9A 3HT8A 3A3RX 162LA 1QTKA 4W55A 3WMKA 5KXYA 2A7DA 2OU9A 1C6MA 1F0WA 1UUZC 183LA 1T6HA 1C6HA 4ARMB 1L16A 2OEAX 190LA 1DI4A 1LYZA 2ZNWY 3WVYA 4B0DA 1HENA 160LA 4WLYA 1QS5A 1C60A 169LA 1QTVA 1GXV2 4NGJA 5LYTA 5KXSA 118LA 1CKGA 4TWSA 4AGAA 4WL7A 1YAPA 3B0KA 4CGEA 3AW6A 3LYMA 4GBRB 1KW7A 1PQKA 3HH4A 1OQMA 1LHJA 1G0KA 5C6LA 4NSIA 1WQOA 4YF2A 4LFXA 4HTQA 1QSWA 1KIRC 206LA 1OUDA 1P5CA 158LA 1FKVA 3CB7A 1F6SA 4TSCA 192LA 1L91A 3SB6A 1NBYC 1QT8A 1C6PA 4H93A 112LA 4H94A 2NTHA 1HEOA 1L38A 1IP5A 4LFPA 1LCNA 1LMPA 1BVKC 185LA 1OVHA 4Z41A 5B59A 242LA 4W94A 1C62A 4ARPA 3L2XA 3E3DA 1IWXA 4YXCA 3LYZA 3SN6R 1L98A 1IP6A 3A96A 4NHSA 4I7QA 4ARLA 1GFAA 4PRUA 4YOPA 1GF7A 4XJIA 1L08A 1OWYA 1LLHA 1HEPA 4DC4A 2YSSC 1C69A 2ZYCA 5L3IA 4QDNA 3TXFA 4DDBA 2DQCY 1V7TA 1JIYA 1GFHA 1P6YA 1G7MC 1KNIA 4H92A 2Q9EA 4PGJB 4DQ7A 1UBZA 3HDFA 201LA 1JJ1A 1JKBA 1KY0A 4WLDA 1LMOA 1TBYA 1YKXX 1QUOA 1G1VA 3EMSA 3KAMA 2B6YA 4HJZA 1G7LC 1WVVA 4C3WA 1SQ2L 1D2YA 1RE2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VAT A;  3C81 A;  2BQN A;  2YBJ A;  217L A;  4I7K A;  2H5Z A;  2G4P A;  1LZY A;  2RB0 X;  1IC5 Y;  1REY A;  2ZYP A;  247L A;  1XSF A;  1DYF A;  1JTN A;  3AGH A;  1LZD A;  1J1P Y;  3CSQ A;  5FST A;  1L94 A;  1L65 A;  4OWB A;  4N0J A;  1CJ8 A;  3EO5 A;  2YBH A;  1IWY A;  1B7S A;  3WPK A;  2W1M A;  5K7O A;  4LYT A;  2XJW A;  4XAD A;  1LSY A;  230L A;  189L A;  4WMG A;  107L A;  1DXJ A;  5HQ1 A;  2RBS A;  2ZWB A;  1GWD A;  6LZM A;  1CVK A;  2BPU A;  2EQL A;  4NY5 A;  1GD6 A;  2BAA A;  5F81 A;  1P2L A;  3LYO A;  1GF4 A;  1LZR A;  1DPX A;  1QUS A;  1BB5 A;  1L23 A;  2Z38 A;  5LA5 A;  1QTD A;  5KXP A;  1UCO A;  3RZE A;  4GLV A;  3WL2 A;  1GF9 A;  4HJY A;  3DN4 A;  2CWI A;  4M6D A;  4QGZ A;  139L A;  1MEL L;  4E97 A;  1OUJ A;  1LYY A;  3WU7 A;  1GEV A;  1GHL A;  4PK0 A;  122L A;  4H1P A;  1L61 A;  1LYH A;  1L31 A;  3P64 A;  3C8R A;  4ETD A;  1LAA A;  227L A;  5FEL A;  3RW8 A;  2MEA A;  3OE0 A;  1C6B A;  3PDS A;  167L A;  3G3X A;  1L93 A;  207L A;  1VDQ A;  3QNG A;  4B4I A;  2D91 A;  3DMV A;  3TXG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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