1L0JA

Methionine core mutant of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l0jA00
252LA 1L21A 3SB8A 177LA 2RH1A 142LA 4OO9A 1LW9A 4ARLA 3F9LA 4EXMA 146LA 1JTNA 4I7RA 1L97A 1PQMA 2O7AA 1G0MA 1ZYTA 172LA 3CDTA 242LA 4IAPA 2F2QA 1OVKA 2RBRA 1D9WA 3HUAA 1L74A 3HTBA 1C6KA 1C63A 4EKRA 1LLHA 1SWZA 148LE 4EPFA 1LYIA 1DYDA 4DKLA 128LA 150LA 1QT5A 224LA 3HU9A 1OWYA 244LA 237LA 2OU9A 174LA 1LGXA 1P7SA 170LA 1CV5A 131LA 1L56A 4ARPA 3D4SA 223LA 166LA 1P5CA 3CDQA 2OTZX 3UONA 4I7KA 1LYEA 1L35A 3HT7A 4EPIA 1C6TA 1C60A 4E97A 1C69A 248LA 4ARJA 149LA 1D3JA 254LA 1L32A 3FADA 4EJ4A 1P6YA 1L05A 3RZEA 1C6DA 3HT8A 2OE9X 3HTFA 1L93A 4AQNA 220LA 1L14A 1L99A 1OVHA 2B7XA 1L68A 260LA 1L69A 1OYUA 1P2RA 2RAZX 192LA 1L43A 3DN3A 1P37A 1C64A 151LA 2NTGA 4W53A 1L92A 2NTHA 144LA 3VW7A 1CTWA 1L77A 1QTVA 4EKPA 3NY8A 139LA 1L55A 258LA 3PDSA 140LA 1P46A 235LA 1T8AA 184LA 1L85A 125LA 251LA 2RBNA 1DYBA 3DN8A 3QAKA 1L50A 1CU0A 1JTMA 1L63A 2B6WA 197LA 104LA 1KNIA 1L29A 1L73A 1SSYA 2Z6BA 1L46A 1CV3A 110LA 1L36A 183LA 1L91A 2OTYX 4YX7C 1G0LA 1LI6A 3GUJA 1D3MA 1L72A 1OV5A 4ARMA 1L01A 3DN1A 3HH4A 1LI3A 1C65A 3L2XA 2B74A 2B6YA 3DMVA 4LDEA 1NHBA 1L51A 118LA 3HWLA 159LA 214LA 256LA 198LA 3GUKA 4PJZA 1P56A 1L86A 218LA 1L08A 1L13A 1SWYA 1G0PA 1QTCA 259LA 1L10A 3NYAA 2LC9A 1LYGA 230LA 2RAYX 3C7WA 3HUQA 1G1WA 215LA 167LA 2RB2X 246LA 164LA 3G3XA 1I6SA 1KW5A 2RBPA 2IGCA 113LA 156LA 4S0WA 3GUMA 6LZMA 255LA 1L19A 4W59A 155LA 2HUKA 4EKQA 3OE6A 3F8VA 1PQJA 122LA 3GUPA 249LA 3SBAA 2B70A 1C6FA 3OE9A 3L64A 245LA 4PK0A 1L65A 4YXCA 1CV4A 1L60A 4W57A 3DKEX 143LA 3CDOA 3C83A 4W58A 1L25A 4YXAC 1L23A 109LA 1B6IA 1L26A 2LCBA 1ZURA 3SB6A 114LA 1C6AA 1L24A 176LA 1L79A 2F47A 1L98A 138LA 4W56A 3PBLA 160LA 1LGWA 4I7TA 232LA 1SX7A 4I7QA 1L47A 147LA 1P2LA 4GRVA 4I7NA 1OV7A 1L90A 1LYDA 2RB0X 4I7JA 4LDOA 3C82A 3RUNA 1L06A 1G0QA 1KW7A 180LA 201LA 127LA 210LA 4ZPUA 1L53A 112LA 1CV1A 257LA 165LA 1L31A 5I14A 1L18A 3OE8A 238LA 225LA 1L58A 1L38A 3V2WA 239LA 3ODUA 1L61A 1C6IA 1L15A 1L54A 2OE7X 1WTHA 2ANVA 187LA 1L67A 1OWZA 3FI5A 3SB5A 1L42A 1QUOA 1L30A 2CUUA 158LA 1L83A 1QS9A 4GBRB 1C6GA 3DMXA 222LA 103LA 190LA 2B6ZA 1L62A 3C8RA 119LA 1L40A 1XJUA 4I7LA 4LDLA 1LWGA 2L78A 2B6XA 1G0JA 1L39A 1CU6A 2LZMA 120LA 2QB0B 1QSQA 3C8SA 4DJHA 213LA 3DN2A 205LA 1C67A 173LA 115LA 1L37A 161LA 1C6PA 1QTDA 206LA 2Q9EA 3HU8A 236LA 3DN0A 108LA 3C81A 212LA 191LA 1L70A 1L20A 1CUPA 1P64A 1QT3A 1T6HA 4W51A 1T8GA 1CU2A 1L80A 4ARQB 2B72A 2RBOA 3C80A 4W52A 2F32A 5LZMA 141LA 1C6JA 1QTHA 2B6TA 182LA 1L28A 1C6MA 1QUDA 3HT6A 186LA 1K28A 102LA 175LA 168LA 229LA 1L64A 1QT6A 1KY0A 3HTDA 1L16A 163LA 1LGUA 3K2RA 3DNAA 1L33A 1PQOA 1SX2A 3GUOA 3DN6A 1LI2A 1C6CA 1L0JA 1XEPA 3SN6R 1QTZA 4W55A 1CUQA 227LA 1L88A 4K5YA 233LA 1L34A 209LA 3C7YA 3C8QA 1L76A 219LA 3HDEA 145LA 195LA 2ANXA 1PQDA 2RB1X 1CX6A 2RBQA 2OU8A 4I7SA 3HDFA 253LA 1DYFA 1L41A 3GULA 3V2YA 1C6HA 1P36A 171LA 1L03A 1QT4A 1ZWNA 107LA 1L66A 1L27A 1L11A 247LA 1C6BA 3HH3A 2OU0X 2B73A 1CX7A 1XJTA 1T8FA 1PQKA 1L81A 1G1VA 1L96A 1C66A 1KY1A 1G0GA 2O79A 3NY9A 1DYEA 2RBSA 4I7PA 1L22A 189LA 3HH5A 4I7OA 126LA 1G0KA 162LA 1G07A 111LA 1QT7A 3DN4A 1L94A 1L71A 1KS3A 1G06A 3GUIA 1QS5A 196LA 1LWKA 1L49A 1L89A 1L82A 1QSBA 241LA 188LA 1DYAA 1PQIA 4I7MA 1SSWA 1L84A 1QTBA 129LA 1LYJA 1L04A 1C6EA 3JR6A 3OE0A 217LA 7LZMA 1L59A 221LA 3FA0A 181LA 3HUKA 1L48A 216LA 185LA 4DAJA 261LA 1T97A 4LZMA 1L12A 4ARMB 2OEAX 3SB7A 243LA 3CDVA 1DYGA 130LA 231LA 226LA 169LA 2OE4X 2HULA 3DMZA 1CVKA 1C6QA 1JQUA 3GUNA 234LA 3SB9A 240LA 1L0KA 3CDRA 157LA 1QUHA 1C6LA 1L75A 211LA 1D3FA 1EPYA 1L02A 1OVJA 2HUMA 1QT8A 1C6NA 3HTGA 1LYHA 1L09A 1QUGA 2O4WA 1TLAA 1C61A 1C68A 1D2YA 152LA 2A4TA 4W54A 2Q9DA 200LA 1L87A 137LA 1L52A 1P3NA 1D2WA 262LA 1LYFA 1L44A 1L00A 2QARC 3EMLA 1C62A 2B75A 1L45A 3LZMA 123LA 1DYCA 1L95A 250LA 4EKSA 1CV0A 1CU3A 1D3NA 4ARQA 1CU5A 3HH6A 199LA 1L07A 1CV6A 3C7ZA 178LA 228LA 1L57A 3HT9A 1L17A 3G3VA 3G3WA 1LPYA 3SBBC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NDGC 252LA 1NMMA 2EIZC 142LA 3WU9A 3TXIA 4OO9A 4ARLA 2A7FA 3CSZA 3F9LA 4NG8A 1LYOA 4EXMA 5M1YA 3LZTA 1L97A 4WLDA 1G0MA 172LA 3CDTA 1REYA 2D4IA 3EO5A 4GN4A 4HPEA 5D5CA 1D9WA 1LLHA 2I26L 1GE0A 2LYMA 2HUBA 1DZBX 1XGUC 1O23A 224LA 5DL9A 244LA 237LA 1L56A 2YBNA 1LZCA 4ARPA 4NSGA 1NDMC 166LA 1P5CA 3UONA 4EPIA 2DKVA 1BWHA 3AZ5A 3EMSA 1C69A 4ARJA 1D3JA 1GF6A 1HFZA 3FADA 1L05A 3RZEA 1ZVHL 3HTFA 4DDCA 1FKVA 1B2KA 4G4CA 3TMUA 220LA 260LA 5ILFA 1GB0A 4DQ7A 2NTGA 3WUMA 1B7MA 3VW7A 4EKPA 3NY8A 139LA 4PJ2C 3WVYA 184LA 2BQHA 2PC2A 3WU8A 1YILA 1GB3A 251LA 3DN8A 1KNIA 1IORA 2ZYCA 1SSYA 3HBHA 1CV3A 1L36A 1OUDA 1CJ8A 1G0LA 3P64A 1LSBA 4ZIXA 4WLTA 1L01A 1XFPL 1CKGA 2D91A 1C65A 3L2XA 2B74A 3IJUA 4LDEA 1LZ8A 1C10A 1RJCB 2MEHA 5DN4A 3A91A 218LA 4R6CA 2MEBA 4XJIA 1L13A 4N5RA 1QTCA 3NYAA 1LHLA 1LYGA 1UIBA 1OUFA 2RAYX 3HUQA 4N1EI 4TWSA 5I4YA 1LZYA 1BHZA 1KW5A 4S0WA 1LPIA 1FLWA 4W59A 1L19A 4H9IA 2BQEA 4NIJA 1H87A 3KAMA 3SBAA 1HERA 2B70A 2ZNXY 3L64A 1ZV5L 1UACY 5LVKA 1CV4A 1L60A 1XSFA 143LA 4W58A 3C83A 1L26A 1ZURA 1L24A 1RE2A 1L79A 1LZAA 4W56A 1J1XY 2BLYA 232LA 3LN2A 4WMGA 5LINA 2DQFC 5C6LA 1GE3A 1SX7A 4I7QA 5B06A 1P2LA 4I7NA 1FLQA 1OV7A 2CDSA 5LVJA 2RB0X 1HMKA 4LDOA 3A3RX 3C82A 3ZVQB 5L9JA 4NEBA 1BGIA 1LYZA 3RUNA 1LKRA 2MEFA 1L06A 1KW7A 127LA 1QUTA 2HECA 4ZPUA 1GB2A 1HSWA 5FEKA 5I14A 1L18A 3OE8A 3A8ZA 4N9RA 5B07A 3V2WA 1JJ3A 4PRQA 3WW5A 3EBAB 1L61A 1L54A 1LZGA 1GBZA 1WTHA 1OWZA 5KXZA 4GCEA 1F6SA 1LSPA 1CJ7A 4G4HA 1TBYA 4AXTA 4LYTA 1CJ6A 4J0LA 1GE4A 1FKQA 103LA 1MELL 190LA 4J1AA 2B6ZA 1GFKA 1L62A 1REZA 119LA 4GCCA 3WPJA 4I7LA 1LWGA 1L39A 2WARA 1NKHA 4HTKA 3C8SA 1QSQA 1YL0X 4UWNA 1C43A 3CT1A 2RSCA 2Z38A 1IWWA 1B5ZA 1VDQA 3C81A 1LZDA 5I5QA 1L70A 3ULRA 1T8GA 5KXWA 1LZTA 2F32A 3P4ZA 1NBYC 1QTHA 2ZIKA 1C08C 1YAMA 3RU5A 1L28A 1C6MA 4CJ2A 4GCBA 1ZMYL 4QY9A 1IWVA 5LAGA 1GEZA 1KY0A 1RI8B 1IOTA 163LA 1LGUA 3DNAA 2Z18A 2MEEA 207LA 3DN6A 4A7DA 1AT5A 1GF0A 1QTZA 1G7MC 3B72A 4W55A 1IC7Y 1L88A 209LA 145LA 195LA 2RB1X 1WQNA 2OU8A 4I7SA 1QTKA 3A6CY 107LA 1L27A 247LA 3G3AB 1AZFA 1LJNA 1CX7A 1WTMA 4HPIA 1CNSA 4BAPA 4NGJA 1IP3A 1L81A 4PPOA 1AKIA 1G0GA 4WM4A 4NGIA 2RBSA 1QDRA 5LAFA 3AZ4A 2A7DA 5KXRA 1LJIA 1LZ5A 1BVKC 126LA 1G0KA 1QSWA 5APFA 5LA5A 1UIDA 1KS3A 3CSRA 196LA 1LWKA 1L82A 1IWUA 1DYAA 4I7MA 1B5YA 1UUZC 4ETDA 1LYJA 4UWUA 1C6EA 3ZVQA 1L59A 2FYCA 1L12A 1GF8A 4NHTA 2OEAX 1PS5A 1W6ZA 243LA 1DYGA 130LA 1IC4Y 4OOOA 4NFVA 1C6QA 5FCPA 1LZ9A 2HEAA 1DPWA 1CKDA 4TSBA 1L75A 5LYZA 5IHGA 3WW6A 5F81A 1WQMA 5AMYA 1L02A 2HUMA 4LGKA 2YDGA 3FI7A 4OWEA 1QQYA 1GBSA 1QUGA 1L09A 1DXJA 4H8YA 2Q9DA 3GXRA 5T3FA 1D2WA 2DQJY 1LYFA 5KKIA 1L00A 3EMLA 123LA 1L95A 1REXA 4EKSA 1HC0A 3A6BY 1CU5A 2C8PA 4H94A 4EMNA 4H9CA 1LYYA 3SB8A 5F16A 5B1FA 4LZTA 1LOZA 5D5FA 146LA 1JTNA 1QDTA 5IELA 4ETCA 1PQMA 1ZYTA 2F2QA 1CJ9A 1C6KA 4NGKA 4EKRA 1SWZA 148LE 4EPFA 4WLXA 1VDTA 4DKLA 1DYDA 1F10A 1QT5A 5IDDA 1REMA 5ILCA 1GB7A 1LZEA 135LA 2OU9A 3AZ7A 2MEGA 1B5WA 3E3DA 1B7NA 2OTZX 3TMXA 1LYEA 1L35A 4IATA 1BB4A 1C6TA 1NQIA 3TXJA 1YKXX 5FSTA 149LA 1YL1X 1C7PA 1GF9A 3HT8A 2OE9X 2DBTA 4QDNA 2B7XA 4LYZA 1L68A 4XJBA 1P2RA 2RAZX 5I54A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NDG C;  252L A;  1NMM A;  2EIZ C;  142L A;  3WU9 A;  3TXI A;  4OO9 A;  4ARL A;  2A7F A;  3CSZ A;  3F9L A;  4NG8 A;  1LYO A;  4EXM A;  5M1Y A;  3LZT A;  1L97 A;  4WLD A;  1G0M A;  172L A;  3CDT A;  1REY A;  2D4I A;  3EO5 A;  4GN4 A;  4HPE A;  5D5C A;  1D9W A;  1LLH A;  2I26 L;  1GE0 A;  2LYM A;  2HUB A;  1DZB X;  1XGU C;  1O23 A;  224L A;  5DL9 A;  244L A;  237L A;  1L56 A;  2YBN A;  1LZC A;  4ARP A;  4NSG A;  1NDM C;  166L A;  1P5C A;  3UON A;  4EPI A;  2DKV A;  1BWH A;  3AZ5 A;  3EMS A;  1C69 A;  4ARJ A;  1D3J A;  1GF6 A;  1HFZ A;  3FAD A;  1L05 A;  3RZE A;  1ZVH L;  3HTF A;  4DDC A;  1FKV A;  1B2K A;  4G4C A;  3TMU A;  220L A;  260L A;  5ILF A;  1GB0 A;  4DQ7 A;  2NTG A;  3WUM A;  1B7M A;  3VW7 A;  4EKP A;  3NY8 A;  139L A;  4PJ2 C;  3WVY A;  184L A;  2BQH A;  2PC2 A;  3WU8 A;  1YIL A;  1GB3 A;  251L A;  3DN8 A;  1KNI A;  1IOR A;  2ZYC A;  1SSY A;  3HBH A;  1CV3 A;  1L36 A;  1OUD A;  1CJ8 A;  1G0L A;  3P64 A;  1LSB A;  4ZIX A;  4WLT A;  1L01 A;  1XFP L;  1CKG A;  2D91 A;  1C65 A;  3L2X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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