1L10A

Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage t4. the temperature-sensitive mutant protein thr157 (right arrow) ile
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGIWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage T4. The temperature-sensitive mutant protein Thr157----Ile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l10A00
245LA 227LA 3G3VA 1KY0A 231LA 3DN3A 3OE9A 1KS3A 251LA 109LA 1L99A 3HT8A 1CTWA 3DMVA 1XJTA 1PQMA 2OE7X 3C7YA 3HT9A 1T6HA 4GRVA 233LA 1LYIA 3C81A 1L59A 2B70A 1DYDA 1C60A 261LA 4YX7C 219LA 241LA 1QSQA 1K28A 118LA 1L13A 1L05A 1L21A 2OTZX 2Z6BA 3JR6A 4I7OA 3CDVA 1L88A 2OE4X 1L29A 262LA 108LA 1SWYA 1PQJA 146LA 176LA 228LA 1L75A 3OE6A 2B72A 4EKQA 1L39A 237LA 1L93A 1DYBA 120LA 1L11A 1L31A 1G0MA 1CU6A 126LA 1C6EA 1P56A 4W52A 1L85A 1LPYA 1P2LA 1CV4A 3HTBA 4PJZA 257LA 1L67A 1CV0A 1C6IA 198LA 1QT3A 1JTMA 4ARPA 1CU0A 1CX7A 1C6TA 1G0JA 1L14A 3GUOA 3SB8A 3SB5A 2LC9A 3SB6A 164LA 1L96A 239LA 1L55A 4I7QA 1L25A 1PQKA 1L83A 3C80A 1C6NA 3HTGA 1L82A 3SBBC 1L06A 1LYEA 2RH1A 115LA 1C6HA 170LA 191LA 1QS9A 1L97A 3DN1A 2B75A 4EKSA 1D9WA 1P64A 1JTNA 158LA 252LA 4EJ4A 1T97A 2LCBA 4ARLA 1T8GA 102LA 229LA 183LA 195LA 1L16A 1C69A 2OU8A 3DN4A 3QAKA 139LA 2OE9X 4LZMA 1KW5A 260LA 2QB0B 1XEPA 3GUJA 3HWLA 1CV1A 152LA 3HH4A 1L35A 250LA 3HDEA 1L36A 4OO9A 224LA 162LA 2RBRA 2B6WA 3F8VA 1L76A 1LW9A 1C63A 259LA 215LA 2CUUA 4ARQA 4ZPUA 3DN6A 1CU5A 1L08A 1L86A 3HU9A 1L02A 1C6GA 150LA 1P2RA 3ODUA 4IAPA 122LA 1LI2A 147LA 1QTCA 1P46A 1G0KA 1OV7A 1C6CA 1OVKA 223LA 211LA 175LA 4K5YA 1I6SA 3C7ZA 1L30A 3GULA 1DYGA 1DYCA 1NHBA 1KNIA 1L57A 165LA 1QT7A 169LA 1G0LA 1G1VA 1LYJA 3C8SA 1CUPA 3RUNA 4I7SA 1OVJA 180LA 1L23A 2OTYX 1KY1A 242LA 3CDOA 149LA 1D3FA 1T8AA 5I14A 1L46A 3DMZA 3PDSA 3HUAA 1OYUA 217LA 1D3MA 1L66A 235LA 3EMLA 3D4SA 1L94A 1LGXA 1SSWA 1L65A 205LA 3L64A 2F2QA 3CDTA 220LA 3RZEA 161LA 4W57A 2B6XA 4DJHA 190LA 1P6YA 246LA 196LA 1PQOA 2QARC 1LWGA 232LA 123LA 2F32A 1DYAA 4ARQB 1L24A 221LA 3CDQA 1L49A 1L0JA 168LA 3SB9A 234LA 1L10A 1OWYA 1L50A 1PQDA 3DNAA 3C7WA 1L70A 2Q9EA 213LA 1L47A 2A4TA 3NY8A 4W51A 230LA 3FI5A 107LA 2B6TA 3V2WA 2RBQA 1L20A 214LA 2HUMA 1QS5A 1LGWA 1L18A 1LYFA 3G3WA 210LA 1L00A 188LA 2RAYX 143LA 3DKEX 1QTBA 1CU2A 3K2RA 1LYHA 4ARMA 212LA 3SN6R 1QTDA 1L43A 1L71A 4YXAC 3F9LA 182LA 148LE 1C6BA 1L91A 2RB0X 1L84A 178LA 3GUMA 1PQIA 1C6KA 1G1WA 2B7XA 1WTHA 4EKPA 4LDLA 1L54A 114LA 3LZMA 3C82A 1LI6A 2RBPA 1L68A 130LA 1L0KA 2B6ZA 1QT8A 1SX2A 186LA 137LA 4I7KA 4W55A 1P3NA 247LA 2B6YA 1L27A 1L92A 127LA 3HH3A 4AQNA 3OE0A 1L77A 1C6AA 1QT5A 3GUNA 197LA 1D2YA 3HH6A 1C6MA 2OEAX 1LLHA 3VW7A 4I7MA 1C6DA 1L51A 112LA 1OWZA 243LA 3FA0A 3NY9A 4E97A 1D2WA 4I7LA 4ARJA 1L26A 3GUKA 199LA 256LA 3OE8A 244LA 258LA 1LYDA 1P37A 4PK0A 2NTHA 131LA 1LYGA 249LA 1SWZA 4LDOA 222LA 1L90A 1L62A 3C8QA 128LA 3HUQA 1L53A 3SBAA 3HUKA 248LA 1EPYA 2RBNA 144LA 1L79A 2HULA 200LA 6LZMA 4EPFA 110LA 166LA 1C66A 1P7SA 2OU9A 238LA 104LA 1TLAA 3GUIA 4ARMB 4W58A 1QT4A 2OU0X 1L40A 255LA 4W56A 1QTZA 3NYAA 2RAZX 1L63A 4W54A 181LA 174LA 1ZWNA 1QUHA 2RB1X 160LA 1L03A 159LA 2RB2X 3DN0A 4S0WA 1CVKA 2IGCA 3HH5A 3FADA 4I7TA 1L33A 3UONA 1L87A 2NTGA 140LA 1QTVA 1CV5A 2O79A 4EPIA 1L34A 1L61A 253LA 1L95A 1C6JA 3SB7A 2B74A 3PBLA 226LA 1XJUA 7LZMA 3GUPA 111LA 1C62A 206LA 2RBSA 187LA 1ZYTA 192LA 218LA 2O4WA 2B73A 1G07A 1G0GA 1C67A 1L98A 1G06A 142LA 3HTFA 1L19A 167LA 4W53A 1QT6A 163LA 1DYEA 3HT6A 4I7NA 1D3NA 1L37A 1L48A 1L81A 2ANVA 4I7RA 1LGUA 4LDEA 2RBOA 1DYFA 1L09A 240LA 254LA 1P36A 1OV5A 1C6LA 1G0QA 1KW7A 1SX7A 125LA 1C68A 2LZMA 156LA 1CV6A 201LA 1OVHA 225LA 1QUDA 1L12A 1QUOA 1L73A 1L01A 4GBRB 2HUKA 1L56A 4EXMA 1JQUA 3C83A 3V2YA 2L78A 1L17A 1C6FA 3CDRA 145LA 3HDFA 3DN8A 1L45A 1L74A 1LI3A 3L2XA 4EKRA 1G0PA 113LA 151LA 1SSYA 4W59A 1CU3A 1L52A 119LA 1L80A 177LA 129LA 185LA 3HTDA 3HT7A 138LA 3DN2A 1D3JA 4YXCA 1P5CA 1CUQA 2Q9DA 1L60A 1B6IA 1ZURA 5LZMA 157LA 3C8RA 1C64A 184LA 4DAJA 1L38A 1T8FA 172LA 1C6QA 141LA 1L42A 1C61A 1L64A 1L58A 3G3XA 1L44A 1CV3A 3HU8A 103LA 1L15A 2ANXA 2F47A 1L07A 4I7PA 155LA 1L41A 1L72A 1C6PA 1L22A 1L32A 171LA 1QTHA 1C65A 1L04A 1LWKA 173LA 4DKLA 236LA 216LA 1L69A 1QUGA 3DMXA 1CX6A 1QSBA 4I7JA 1L89A 1L28A 2O7AA 209LA 189LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D6BA 4WM6A 2MEIA 3DMVA 3M3UA 1ZVYB 4NGLA 1T6HA 233LA 1L59A 2B70A 1LJEA 1IOSA 261LA 1NMMA 1K28A 1YAQA 2C8OA 3A34A 4H90A 2Z6BA 262LA 108LA 1SWYA 1PQJA 146LA 176LA 1C08C 1LMPA 1B9OA 5M1YA 5F81A 3W6CA 1G0MA 1JJ1A 126LA 3T36A 1C6EA 1P56A 4GCFA 4W52A 5E4PA 4PJZA 2W1XA 1CV0A 2XQOA 5L3IA 1QT3A 1JTMA 1B5XA 1YROA 1CU0A 1DQJC 1L14A 3GUOA 3A90A 1YANA 2BQAA 2LC9A 2B5ZA 164LA 1L96A 3W6EA 4R0FA 1L25A 5F14A 1IP7A 1L83A 2HECA 3C80A 1A4VA 1C6NA 2LZTA 3SBBC 1C6HA 170LA 3CB7A 5F9UA 3TMUA 1BVKC 5LYTA 1L97A 4WL6A 4LT1A 4ML7A 2DKVA 3B0IA 1JTNA 1LZ9A 252LA 4N5RA 1T8GA 102LA 183LA 1UBZA 2OU8A 3DN4A 3QAKA 4NGJA 1LZ8A 1KW5A 2QB0B 4ANRA 3WXTA 4DQ5A 1L35A 3HDEA 3A67Y 5LVKA 1JHLA 1KXXA 5FDJA 1L76A 1C63A 4QY9A 5I53A 1WQQA 4ARQA 1LZ5A 3AZ4A 3AGIA 1L02A 1C6GA 4IAPA 1W08A 1JSFA 5KXYA 1QTCA 1G0KA 4TWSA 4OOTA 1JKDA 3KAMA 1PZYA 1JWRA 3A3QA 2D4JA 4DDAA 1DYGA 1L57A 2BQDA 1CNSA 1LJ3A 4M6DA 1J1OY 1WQRA 3F6ZA 1CUPA 4DYGA 1KY1A 1N4FA 1LSAA 5B07A 1T8AA 4ETDA 1L46A 3PDSA 3HUAA 5LA5A 1NBYC 2Z37A 235LA 2BQFA 4I8SA 4PPOA 1NF5A 1QDTA 1GFEA 1LGXA 5KXKA 1IX0A 2B6XA 2Z19A 3CT1A 5B05A 1L24A 1LMOA 4XJGA 1BVXA 2ZWBA 1BWIA 5KXSA 1D6PA 1FLWA 3WU9A 1OWYA 3AJNA 3DNAA 1L70A 2F2NA 1L47A 2A4TA 3NY8A 230LA 107LA 3LYZA 3V2WA 1L20A 153LA 2HUMA 1QS5A 1TBYA 143LA 1LZNA 1P2CC 1W6ZA 2ZYPA 4LYMA 4DD2A 2Z38A 3OK0A 3D9AC 1C6BA 5B1GA 4WL7A 4TSBA 1IOTA 4H9IA 1G1WA 3C82A 1L68A 130LA 2LYOA 2B6ZA 1SX2A 1D0LA 4H8XA 186LA 4I7KA 4W55A 1XGPC 4XJFA 2CWIA 4HJVA 1L77A 4NY5A 1D2YA 1GF4A 1G7HC 193LA 243LA 1V7TA 3LHMA 3NY9A 4E97A 4ARJA 3GUKA 256LA 4II8A 3OE8A 3P68A 1LJIA 2EPEA 4PK0A 2NTHA 131LA 1TAYA 4TX7A 4LDOA 3WUAA 128LA 2Z2EA 3HUQA 1AKIA 1L53A 1H87A 3SBAA 3HUKA 1IP2A 2RBNA 4H91A 1XGQC 1L79A 4LYZA 1GF5A 238LA 1F6SA 1YAOA 1LSEA 3NYAA 4BS7A 4W54A 3LYMA 4GN4A 1ZWNA 1FDLY 1OUGA 2DQFC 4XJBA 1QUHA 3ZVQA 2HEEA 4OOOA 1YIKA 2RB2X 1GE1A 3UONA 2DQGY 140LA 1CV5A 1L61A 4H9BA 3SB7A 4GCEA 3FI7A 4A7DA 1LAAA 206LA 2RBSA 187LA 218LA 1QTKA 2Y8PA 2B73A 1OUEA 1L98A 1L19A 3WUMA 3HT6A 5DM9A 2ANVA 1TCYA 1C7PA 1IY3A 2RBOA 3AW6A 5D5FA 4GLAA 1LMNA 1P36A 3CSQA 1BWJA 1C6LA 4B1AA 1JUGA 1GB9A 5LVHA 1LJ4A 4MCKA 2HUKA 4EXMA 2L78A 1LZSA 2G4PA 145LA 1JTOL 4EKRA 2MEBA 1G0PA 3TXBA 1SSYA 1GFAA 4W59A 1L52A 1C46A 1LMAA 1GB0A 4DQJA 4Z3MA 3B6LA 1LSGA 2HU3A 4BAPA 1YQVY 2BQKA 4NHQA 1D6QA 1B6IA 4ETCA 3C8RA 1UIGA 7LYZA 3TXKA 4DD1A 3A6BY 4GCCA 2ZNWY 3HBEX 1T3PA 4N1EI 1L64A 3HFMY 4NGZA 1F10A 4H9EA 1LZBA 5I4WA 1B7PA 1LYOA 2YDGA 1L41A 1GF6A 1C6PA 1A2YC 171LA 1QTHA 4YEMA 4RW2A 1LHMA 216LA 1QUGA 1GEZA 3DMXA 4TUNA 2Q0MX 3F9LA 1HSXA 227LA 5FCPA 4WO6A 251LA 109LA 3HT8A 3WPLA 133LA 1XJTA 4WG7A 2OE7X 3C7YA 2ZNXY 1DYDA 5L3HA 2DQAA 4D9ZA 118LA 1L13A 4Z98A 1L21A 2ZQ3A 3CDVA 2F4GA 2OE4X 1L29A 1GAZA 3CT0A 2YBJA 2IFFY 3OE6A 4NG8A 1LKRA 1HEMA 1OP9B 1CU6A 2DBTA 4DWXA 2PC2A 1HMLA 4QEQA 1P2LA 1CV4A 4NSGA 3ZEKA 1L67A 1GDXA 207LA 1AM7A 4WLYA 1CX7A 5ILFA 3WW5A 4QDNA 1B7SA 4I7QA 4XENA 1CKFA 1JTTL 4H8ZA 1YKXX 1DKKA 115LA 1T6VL 1QS9A 5B1FA 4XJIA 4EKSA 2B75A 3G3BB 1IIZA 1P64A 3AW7A 158LA 4EJ4A 2LCBA 1GB7A 4WM5A 195LA 1BB6A 139LA 1QDRA 260LA 5KXLA 4OWCA 1VDTA 152LA 1GE0A 250LA 1L36A 4YF2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2D6B A;  4WM6 A;  2MEI A;  3DMV A;  3M3U A;  1ZVY B;  4NGL A;  1T6H A;  233L A;  1L59 A;  2B70 A;  1LJE A;  1IOS A;  261L A;  1NMM A;  1K28 A;  1YAQ A;  2C8O A;  3A34 A;  4H90 A;  2Z6B A;  262L A;  108L A;  1SWY A;  1PQJ A;  146L A;  176L A;  1C08 C;  1LMP A;  1B9O A;  5M1Y A;  5F81 A;  3W6C A;  1G0M A;  1JJ1 A;  126L A;  3T36 A;  1C6E A;  1P56 A;  4GCF A;  4W52 A;  5E4P A;  4PJZ A;  2W1X A;  1CV0 A;  2XQO A;  5L3I A;  1QT3 A;  1JTM A;  1B5X A;  1YRO A;  1CU0 A;  1DQJ C;  1L14 A;  3GUO A;  3A90 A;  1YAN A;  2BQA A;  2LC9 A;  2B5Z A;  164L A;  1L96 A;  3W6E A;  4R0F A;  1L25 A;  5F14 A;  1IP7 A;  1L83 A;  2HEC A;  3C80 A;  1A4V A;  1C6N A;  2LZT A;  3SBB C;  1C6H A;  170L A;  3CB7 A;  5F9U A;  3TMU A;  1BVK C;  5LYT A;  1L97 A;  4WL6 A;  4LT1 A;  4ML7 A;  2DKV A;  3B0I A;  1JTN A;  1LZ9 A;  252L A;  4N5R A;  1T8G A;  102L A;  183L A;  1UBZ A;  2OU8 A;  3DN4 A;  3QAK A;  4NGJ A;  1LZ8 A;  1KW5 A;  2QB0 B;  4ANR A;  3WXT A;  4DQ5 A;  1L35 A;  3HDE A;  3A67 Y;  5LVK A;  1JHL A;  1KXX A;  5FDJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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