1L10A

Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage t4. the temperature-sensitive mutant protein thr157 (right arrow) ile
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGIWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage T4. The temperature-sensitive mutant protein Thr157----Ile.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l10A00
3G3XA 1L59A 1XJTA 1NHBA 5I14A 1G0LA 1D3JA 1C6AA 155LA 1WTHA 1K28A 4ARQA 4YXAC 3HUQA 3DN8A 144LA 223LA 139LA 1L52A 1L03A 3HUAA 1L11A 1L53A 1C67A 1CU2A 3HH5A 1JTNA 1L96A 1QTVA 148LE 3HT8A 2QB0B 3SB6A 1CX6A 1L46A 3LZMA 3JR6A 1L22A 1LYGA 2RB0X 1KNIA 1L24A 1D2WA 4EKPA 123LA 3DNAA 1LWGA 125LA 180LA 1L66A 174LA 1L00A 147LA 1PQKA 3CDRA 149LA 1L08A 1C6TA 1P36A 163LA 1L16A 1LYHA 260LA 158LA 1P3NA 143LA 1KS3A 104LA 1DYBA 1LW9A 2RBRA 1CV5A 1PQDA 164LA 1L14A 1L83A 3EMLA 1L80A 130LA 1L77A 1L05A 3V2YA 220LA 2Q9EA 1L71A 1C6FA 156LA 1LYJA 1SX7A 177LA 1JQUA 113LA 3CDTA 1L57A 108LA 2O79A 4I7MA 7LZMA 3RZEA 1L30A 4OO9A 3GUMA 4PK0A 160LA 184LA 4K5YA 235LA 1SX2A 1C6HA 3HT6A 1QT3A 1L50A 1L70A 1LYFA 1L17A 1LI2A 1KW5A 2NTHA 4W51A 3UONA 1L61A 3G3VA 1C69A 161LA 1L98A 1OV7A 2B6ZA 1L42A 2Q9DA 1QS9A 3GUIA 159LA 138LA 3DMZA 4I7QA 3HH3A 1G1WA 212LA 1L48A 258LA 2F2QA 3GULA 4EKRA 3HT7A 1DYDA 1D9WA 2OU8A 1L28A 1P64A 1L88A 240LA 1CX7A 1QTBA 1QT7A 1L15A 1B6IA 1L13A 1ZWNA 4ARLA 4I7TA 2B6XA 232LA 2HULA 1P5CA 4EPFA 213LA 3C8SA 217LA 151LA 1C6CA 1P2RA 3NYAA 1L65A 231LA 197LA 111LA 173LA 1QSBA 3C7ZA 1L54A 1L67A 4DKLA 1L68A 4EKQA 211LA 3SBAA 189LA 110LA 1SSWA 3QAKA 1P37A 3DN3A 1QUOA 165LA 1L38A 219LA 261LA 1QSQA 4I7PA 1L91A 127LA 1DYGA 4YXCA 206LA 3GUJA 2F47A 236LA 222LA 1QT5A 2O4WA 3OE0A 248LA 4YX7C 1L92A 1LWKA 112LA 4I7LA 1L20A 4W58A 1L64A 1QUDA 247LA 115LA 3ODUA 4I7JA 1P56A 4W53A 2B74A 4I7RA 181LA 1L86A 1D3NA 3CDQA 1QUHA 1CV0A 2B70A 118LA 1LI6A 1DYCA 1C6JA 227LA 1G0GA 1L63A 4ARMB 4W55A 169LA 238LA 1T8FA 198LA 1L19A 1LYIA 3NY9A 1C6LA 2HUKA 3C81A 4I7SA 182LA 2RBNA 3L64A 1L01A 3PBLA 1L02A 3DMVA 1LYDA 1L55A 192LA 1L90A 259LA 3GUOA 4DAJA 251LA 2B6YA 1EPYA 1L82A 1KY0A 1L18A 3D4SA 6LZMA 1LPYA 1C6NA 4I7NA 1KW7A 157LA 2RH1A 141LA 1L44A 1C6DA 1CU3A 1C6MA 4EPIA 1C6IA 1SWYA 239LA 1QS5A 1SWZA 1OVJA 1C65A 246LA 171LA 5LZMA 4I7OA 1C6PA 1CV1A 218LA 4S0WA 1T97A 1L95A 2O7AA 200LA 249LA 1L07A 2RBPA 2RAYX 3K2RA 3HTDA 226LA 1L99A 1L21A 3SB5A 3DN1A 3HDFA 4ARMA 1QT6A 199LA 1P7SA 190LA 2ANVA 129LA 3HWLA 1C6GA 107LA 4GRVA 1C62A 1L31A 2B73A 1L87A 1G0MA 3OE8A 1L84A 4W57A 1DYAA 1SSYA 4W54A 3C83A 1L35A 3OE6A 1L12A 1QTCA 178LA 3HDEA 3DN4A 2HUMA 215LA 209LA 102LA 3GUNA 140LA 1L94A 1CV3A 3CDOA 2L78A 4ARJA 3SB7A 3HH6A 3RUNA 1L79A 1CUQA 250LA 1L47A 142LA 1L0KA 1L81A 1LGWA 2OU9A 2B6WA 1L89A 4IAPA 1LYEA 1L39A 241LA 172LA 1L25A 1C61A 1P2LA 1L60A 1L56A 1L43A 1P6YA 1C6KA 228LA 4LZMA 119LA 170LA 196LA 4E97A 2CUUA 3DMXA 1L04A 3HTBA 1C68A 1QT4A 176LA 185LA 3C7YA 1CUPA 3CDVA 257LA 1C60A 4PJZA 146LA 4LDEA 1QTZA 3HTGA 4ARPA 4LDLA 1L41A 2IGCA 3SB9A 183LA 3DN2A 1PQMA 1PQOA 2B72A 4W56A 1OWYA 4W52A 1LI3A 2OE4X 201LA 3DN0A 1DYEA 1L75A 3PDSA 3SBBC 4EJ4A 3GUKA 1OYUA 1L23A 1OVHA 1G0PA 1L27A 1L51A 1L58A 1L69A 2RB1X 1OV5A 3HU9A 2RAZX 245LA 1C6QA 1L34A 1ZYTA 1L37A 210LA 1QTHA 3OE9A 2LZMA 167LA 2Z6BA 168LA 4GBRB 191LA 3DN6A 3C8RA 3L2XA 1L62A 4I7KA 234LA 188LA 1CV4A 1CU6A 3SB8A 128LA 3HT9A 166LA 224LA 1LLHA 3C80A 195LA 1L76A 3G3WA 1QUGA 1L06A 152LA 2OU0X 3HTFA 1G07A 175LA 1L32A 2OEAX 1L0JA 2OE9X 2RB2X 3F9LA 1CTWA 2LCBA 1L73A 4LDOA 1G0KA 122LA 1L40A 1LGUA 1D2YA 262LA 1ZURA 3C7WA 2RBOA 1PQIA 205LA 2ANXA 3FADA 1XEPA 3C82A 221LA 216LA 256LA 1L49A 187LA 225LA 1L85A 2QARC 1L26A 2A4TA 1OVKA 126LA 1L10A 2RBSA 1L36A 1T8AA 1L29A 237LA 145LA 1KY1A 1PQJA 2NTGA 4DJHA 1C63A 4EKSA 1C66A 2B6TA 1L45A 4ARQB 1L33A 1T8GA 1LGXA 1L93A 3DKEX 230LA 3FA0A 1D3FA 4EXMA 3F8VA 1TLAA 2OTZX 114LA 131LA 253LA 3HH4A 2OE7X 3HUKA 1P46A 3HU8A 3NY8A 103LA 1G0JA 3VW7A 1L74A 255LA 1QT8A 1G06A 4W59A 3V2WA 2OTYX 1XJUA 242LA 1I6SA 4AQNA 3C8QA 162LA 1D3MA 109LA 3FI5A 3SN6R 1G1VA 243LA 2LC9A 229LA 1C6BA 1L09A 244LA 254LA 2B7XA 1C6EA 1CU0A 3GUPA 252LA 214LA 137LA 120LA 1C64A 1G0QA 1QTDA 1L72A 1CU5A 1JTMA 1OWZA 1CV6A 186LA 233LA 1DYFA 150LA 1T6HA 2F32A 2B75A 1L97A 4ZPUA 2RBQA 1CVKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L59A 1NHBA 4H9AA 1GF3A 1JIYA 4YXAC 3HUQA 1GFAA 1GAZA 1XGTC 3P66A 4H94A 3WXUA 1L11A 1LMOA 1C67A 1GF4A 3A8ZA 4KT3A 1IORA 6LYTA 1D0LA 2WARA 2BQGA 1GHLA 3SB6A 1CX6A 5C6LA 4NSJA 1DKJA 1D0KA 2RB0X 1KNIA 1EQEA 1L24A 1LHMA 4EKPA 123LA 180LA 1H87A 3CDRA 2DQAA 4GCDA 4NG1A 1L08A 1C6TA 163LA 1L16A 1IC7Y 260LA 5E9RA 3QY4A 1DYBA 3M3UA 4QY9A 1PQDA 1L14A 1L83A 4X3BA 5LYMA 3A3RX 1L77A 2Q9EA 4BADA 2BQBA 2Z18A 5F81A 3CDTA 4LGKA 1L57A 4WMGA 2O79A 3RZEA 3WUMA 1JPOA 4AXTA 3GUMA 4PK0A 4DD9A 1DPWA 1BGIA 3AZ7A 1LZBA 235LA 4ETEA 1C45A 2CWIA 5A3ZA 1GF0A 1L50A 1L70A 4J1AA 1KW5A 3G3VA 1OV7A 1L98A 1WTNA 3EO5A 2B6ZA 3WVXA 4DQJA 159LA 258LA 3W6AA 1DYDA 4Z41A 1P64A 3CT5A 3CQLA 3T36A 1LZTA 1P5CA 4WLTA 4EPFA 1GEZA 3CSRA 217LA 4GLAA 1P2RA 1IC5Y 4HP0A 1L67A 1GF5A 2FBBA 3SBAA 3WW5A 1SSWA 4XADA 4HTNA 1C7PA 1QSQA 1QSAA 2FBDA 4AGAA 1KIQC 4YXCA 2N5ZA 5B1FA 248LA 4WO6A 1QQYA 1L64A 2EIZC 1IWXA 4W53A 1YAOA 2B74A 5ILFA 2D6BA 181LA 1I56A 1JHLA 2B70A 118LA 1DYCA 1G0GA 4ARMB 2HEDA 4W55A 4PRUA 5DN4A 4BAPA 1LYIA 4I7SA 1LYDA 4DAJA 2B6YA 1B2KA 3D4SA 1LPYA 1VAUA 2G4NA 4I7NA 5J7CA 1BB3A 1BB6A 4NGIA 5I4YA 1SWYA 4GCEA 1OVJA 5HMJA 1C65A 1TAYA 246LA 5HNLA 2BQDA 218LA 4S0WA 1C46A 1L95A 200LA 2RBPA 1LCNA 2MEGA 4PPOA 3D3DA 3P65A 3P4ZA 1D0MA 1QT6A 199LA 190LA 4HV2A 2B73A 3OE8A 2MEDA 3FI7A 1OUBA 1SQ2L 2W1LA 1WQNA 1LJGA 1REMA 215LA 3TXGA 3FE0A 102LA 1IP6A 1L94A 1JJ3A 3LYTA 4M6DA 3A92A 3RUNA 142LA 1L81A 4YM8A 4DYGA 5FCPA 3W6CA 1GB8A 4EOFA 4DQ5A 4DDCA 1HHLA 4NHQA 5DLAA 4GCFA 3DMXA 3HTBA 1HEPA 1GFKA 2MEBA 3C7YA 3F6ZA 4TX7A 1C60A 1D6QA 1B5VA 3HTGA 5L3IA 1XEJA 1LZ9A 3SB9A 3DN2A 2CDSA 1LPIA 5B07A 1B7QA 1LJNA 201LA 3DN0A 1DYEA 1B5ZA 1W6ZA 3A93A 2BQKA 3GUKA 5LYTA 1OVHA 1JTOL 4N0JA 4DDAA 1L58A 3WYHA 2RB1X 1OV5A 1WTMA 3HU9A 4NG8A 1L37A 210LA 2LZMA 1OUDA 1B7LA 2BQEA 1HEQA 4HV1A 128LA 1C08C 3HT9A 1N4FA 4ETCA 1LYSA 4WG1A 1LJ3A 3RT5X 3WULA 1REZA 3TXFA 1RE2A 1GE4A 1QUGA 152LA 2OU0X 1KXWA 4Z98A 1IOTA 1L32A 1DXJA 5DL9A 4LDOA 1LGUA 1D2YA 1ZURA 1NF5A 2LYMA 216LA 256LA 2A4TA 5LVHA 1OVKA 126LA 2MEAA 4GLVA 1LJ4A 1EL1A 1DI4A 237LA 2F4AA 4EKSA 1C66A 2B6TA 4ARQB 5B06A 1L33A 3WPJA 208LA 4GCBA 4IJ4A 4NGWA 3DKEX 1HC0A 4ML7A 3FA0A 4TUNA 4EXMA 1TLAA 253LA 2OE7X 3WH1A 4N1EI 1P46A 4OWAA 4LT0A 103LA 1L74A 1WVVA 4OW1A 1B7PA 4W94A 5JENB 1KIPC 1RI8B 2BPUA 1V7SA 3AYQA 3C8QA 133LA 162LA 1LZ8A 4WOAA 1G1VA 2D4KA 1NHEA 1L09A 4HJVA 4C5FA 1LZ1A 2Q0MX 2B7XA 1C6EA 4LYTA 3GUPA 1QTDA 1IX0A 1JTMA 3B0OA 2HEFA 186LA 1GFHA 4H93A 3G3XA 3WXTA 1LYYA 2MEEA 1G0LA 4LZTA 155LA 1B5UA 1HEMA 2FYCA 1Z55A 3DN8A 2Z12A 4DWXA 223LA 1L03A 3EBAB 4ZFPA 2ZYPA 4NSGA 4MCKA 2X0AA 1LSNA 1L22A 4KXIA 4NWHA 1GF6A 3DNAA 4J7VA 1L66A 1GE0A 1L00A 3AGGG 1PQKA 4LFXA 4TSCA 3W6DA 2DKVA 4WM4A 2G4QA 1LZYA 1KS3A 1LW9A 2Y8PA 2RBRA 2MECA 2F30A 3EMLA 2DQGY 4LYBA 1L05A 220LA 1L71A 3LYZA 1QSWA 3RNXA 1HENA 1LMTA 1JQUA 4OWEA 1B9OA 1L30A 3G3BB 2YBNA 1SX2A 1C6HA 3HT6A 1IY3A 4W51A 3GXKA 1V7TA 1C69A 5D5CA 3A96A 138LA 4CGEA 1C10A 1CJ6A 1L28A 3TMVA 1L88A 240LA 1OUAA 1IP4A 1LMAA 1QTBA 4OOTA 4HJYA 1L13A 4I7TA 2B6XA 4DD7A 232LA 1LSPA 1LSYA 1UIDA 4H90A 3C8SA 4WM5A 3CSZA 151LA 231LA 2HU1A 173LA 1BWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L59 A;  1NHB A;  4H9A A;  1GF3 A;  1JIY A;  4YXA C;  3HUQ A;  1GFA A;  1GAZ A;  1XGT C;  3P66 A;  4H94 A;  3WXU A;  1L11 A;  1LMO A;  1C67 A;  1GF4 A;  3A8Z A;  4KT3 A;  1IOR A;  6LYT A;  1D0L A;  2WAR A;  2BQG A;  1GHL A;  3SB6 A;  1CX6 A;  5C6L A;  4NSJ A;  1DKJ A;  1D0K A;  2RB0 X;  1KNI A;  1EQE A;  1L24 A;  1LHM A;  4EKP A;  123L A;  180L A;  1H87 A;  3CDR A;  2DQA A;  4GCD A;  4NG1 A;  1L08 A;  1C6T A;  163L A;  1L16 A;  1IC7 Y;  260L A;  5E9R A;  3QY4 A;  1DYB A;  3M3U A;  4QY9 A;  1PQD A;  1L14 A;  1L83 A;  4X3B A;  5LYM A;  3A3R X;  1L77 A;  2Q9E A;  4BAD A;  2BQB A;  2Z18 A;  5F81 A;  3CDT A;  4LGK A;  1L57 A;  4WMG A;  2O79 A;  3RZE A;  3WUM A;  1JPO A;  4AXT A;  3GUM A;  4PK0 A;  4DD9 A;  1DPW A;  1BGI A;  3AZ7 A;  1LZB A;  235L A;  4ETE A;  1C45 A;  2CWI A;  5A3Z A;  1GF0 A;  1L50 A;  1L70 A;  4J1A A;  1KW5 A;  3G3V A;  1OV7 A;  1L98 A;  1WTN A;  3EO5 A;  2B6Z A;  3WVX A;  4DQJ A;  159L A;  258L A;  3W6A A;  1DYD A;  4Z41 A;  1P64 A;  3CT5 A;  3CQL A;  3T36 A;  1LZT A;  1P5C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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