1L16A

Structural analysis of the temperature-sensitive mutant of bacteriophage t4 lysozyme, glycine 156 (right arrow) aspartic acid
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTDTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structural analysis of the temperature-sensitive mutant of bacteriophage T4 lysozyme, glycine 156----aspartic acid.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l16A00
186LA 3HT8A 138LA 2F32A 158LA 206LA 1C6HA 1PQIA 4W55A 1OVKA 3CDRA 215LA 200LA 2B6ZA 3GULA 1L56A 1L13A 3EMLA 2B6WA 3C8RA 1OWYA 170LA 165LA 3G3WA 1L04A 4I7KA 123LA 1D2WA 126LA 183LA 1CV3A 1PQDA 3QAKA 1QTBA 1G0LA 1L94A 1SWYA 103LA 1KY0A 3C7YA 1L48A 4I7JA 189LA 1L77A 2RB1X 3JR6A 4I7TA 226LA 2O7AA 1PQOA 2RH1A 2RB0X 1L19A 3L64A 1LGWA 1CU5A 4ARQB 4ARMA 1G0MA 110LA 167LA 1L03A 239LA 1LYFA 1LPYA 4PJZA 3C80A 3G3XA 1JTNA 1DYDA 1SSYA 3HDEA 1ZYTA 1LI2A 1L96A 185LA 199LA 1D3NA 3DMVA 1L74A 240LA 2B73A 1TLAA 3HDFA 3HUKA 1L11A 1L22A 3HT7A 127LA 2OU9A 1L65A 2RBRA 3DNAA 107LA 1QUHA 2OU0X 4I7SA 1L30A 2OE9X 220LA 1QT8A 1SWZA 2O4WA 1LI3A 3HH5A 2Q9DA 4W56A 1G0KA 5LZMA 1L21A 255LA 1QUOA 1G0JA 1L81A 1C64A 1G0QA 1DYGA 3FI5A 4GBRB 1LGXA 1C6QA 3C8SA 3HUQA 1CTWA 2OTYX 245LA 3V2WA 142LA 108LA 1C66A 1QT7A 141LA 1L17A 1T97A 190LA 1CU6A 1LYIA 2LCBA 3C81A 254LA 1L01A 122LA 1P56A 3CDOA 1C63A 2OEAX 1P2RA 1L02A 3SN6R 1OVHA 2CUUA 4EKQA 1L71A 1C6BA 1LYEA 1L06A 1L12A 2A4TA 1OV5A 1QS5A 175LA 1L42A 2B75A 1L31A 4I7NA 1C6NA 261LA 1EPYA 1DYBA 181LA 3PDSA 4LDLA 222LA 4ARMB 3C7ZA 1P6YA 147LA 2HULA 184LA 3GUNA 1QT4A 151LA 1L08A 1L59A 1CU0A 1L35A 1LI6A 4ZPUA 1L62A 4OO9A 1L46A 1L52A 1QTZA 2Z6BA 1XEPA 1ZWNA 1L84A 1L83A 1L58A 1C6LA 1KW7A 2L78A 1L73A 3HH3A 3OE6A 161LA 3DN4A 1QS9A 4ARJA 120LA 1C6MA 1QUDA 4I7MA 160LA 118LA 197LA 4EPIA 1D3JA 1L93A 3NYAA 1CVKA 1G0PA 1L92A 155LA 1ZURA 3DMXA 3NY9A 3DN1A 3HTDA 196LA 5I14A 148LE 130LA 1OWZA 1CV5A 1L05A 115LA 4W57A 4EXMA 3GUKA 137LA 112LA 3G3VA 3HT6A 143LA 3HH4A 219LA 1C61A 192LA 1G06A 238LA 1L85A 1L70A 4S0WA 249LA 3SBAA 2RAZX 1L39A 1C6IA 4W52A 1P2LA 1C65A 1G1VA 3GUOA 1L33A 1L40A 1C60A 3L2XA 252LA 3PBLA 3SB6A 2RBOA 1L37A 1L98A 2LZMA 1B6IA 1L27A 237LA 1L66A 149LA 4YX7C 3GUPA 1L82A 3HU8A 1C6PA 3HWLA 1L68A 1L60A 1L79A 3F9LA 3DKEX 1D9WA 168LA 1DYAA 225LA 1CUQA 227LA 140LA 242LA 1JQUA 4EJ4A 1L86A 152LA 1P3NA 3ODUA 1LGUA 178LA 251LA 1DYFA 172LA 3C8QA 2B72A 1PQKA 1L97A 3DN8A 171LA 3OE9A 1C6CA 145LA 1QT3A 104LA 111LA 1CX7A 1SX2A 260LA 131LA 212LA 4LDOA 1G1WA 4I7LA 159LA 1QUGA 218LA 1CU2A 180LA 3V2YA 2LC9A 4E97A 1P46A 1KNIA 1CX6A 1L29A 4W53A 1T8AA 233LA 125LA 1WTHA 1QTHA 2ANXA 1L25A 1SX7A 1C69A 1L09A 1L43A 1T6HA 3HUAA 4GRVA 4K5YA 4PK0A 3SBBC 4I7QA 1CV4A 166LA 3GUMA 3CDQA 232LA 231LA 2RB2X 1L00A 2RBSA 2QB0B 1L90A 1L34A 1SSWA 1XJUA 2B7XA 1C6KA 2ANVA 198LA 177LA 2IGCA 228LA 1P5CA 213LA 241LA 3FA0A 1C6GA 235LA 1L51A 2RAYX 1L75A 4EKRA 1L28A 1LYJA 1L76A 1L67A 129LA 4W51A 1D2YA 1LW9A 4ARLA 3UONA 214LA 256LA 217LA 1D3MA 1KS3A 1NHBA 1C6DA 210LA 1L50A 144LA 4EKPA 1L07A 2HUKA 109LA 1L24A 262LA 2QARC 201LA 4EPFA 1L23A 1KW5A 1L47A 3GUIA 244LA 2OU8A 188LA 1C67A 221LA 4ARPA 1OVJA 1CU3A 1QSBA 4I7RA 2RBPA 150LA 1K28A 2B6YA 1KY1A 3SB9A 1CV0A 2NTGA 1L20A 216LA 182LA 164LA 1LWKA 195LA 258LA 1L26A 247LA 253LA 1C62A 1L99A 234LA 1LWGA 3FADA 114LA 3HH6A 246LA 1CV1A 1L10A 1C6FA 1C6AA 139LA 3OE0A 1CV6A 2F47A 3RUNA 223LA 1PQMA 3OE8A 2B6XA 102LA 3RZEA 119LA 1L61A 1C6TA 1LLHA 3C82A 2HUMA 1OV7A 163LA 4W58A 1L36A 1QT6A 2OE4X 1LYGA 243LA 4DJHA 1L0JA 209LA 4I7OA 1L53A 1L88A 1L15A 248LA 4AQNA 1DYEA 1L18A 1QTCA 1T8GA 3SB5A 187LA 1I6SA 1LYHA 1P37A 4LDEA 1JTMA 146LA 3C83A 236LA 3HTFA 3SB7A 3NY8A 1P7SA 1G0GA 4W54A 3CDTA 7LZMA 2B70A 3LZMA 113LA 1D3FA 3D4SA 1L45A 1P36A 3GUJA 3DMZA 1L44A 1L41A 1CUPA 1L63A 156LA 1L32A 176LA 2Q9EA 3DN6A 1QTVA 4YXAC 1L57A 1L72A 1L87A 1L14A 1C6EA 3DN3A 4IAPA 3HU9A 224LA 1L54A 1L64A 1P64A 1C6JA 3C7WA 1L49A 1L80A 1LYDA 3HT9A 1T8FA 229LA 211LA 174LA 1PQJA 2OE7X 1C68A 2RBNA 230LA 2B6TA 3K2RA 3SB8A 250LA 4ARQA 4DAJA 1OYUA 3DN2A 2RBQA 169LA 3HTBA 205LA 1G07A 1QT5A 2F2QA 2NTHA 4YXCA 1XJTA 3HTGA 173LA 1L0KA 191LA 3F8VA 128LA 3CDVA 1L89A 1L91A 1QTDA 259LA 4I7PA 4LZMA 1L69A 1L55A 3VW7A 2O79A 1DYCA 2B74A 4W59A 4EKSA 1L16A 257LA 2OTZX 1QSQA 3DN0A 162LA 1L38A 4DKLA 6LZMA 1L95A 157LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BPUA 186LA 4GCDA 1OVKA 5E9RA 215LA 4N0JA 3CSQA 4YOPA 2LYOA 170LA 4ETAA 2XBRA 4OOTA 4I7KA 3AYQA 183LA 3WL2A 3QAKA 1QTBA 3B0IA 1OUEA 1L94A 4NWEA 3AGIA 3FE0A 3LYOA 1PS5A 189LA 1L77A 2RB1X 4ET9A 4PPOA 4I7TA 226LA 2O7AA 1IR8A 1DXJA 1CU5A 4IASA 4ARQB 4ARMA 1G0MA 110LA 1GFTA 1L03A 1LPYA 3G3XA 3HDEA 3P65A 1NQIA 3A96A 199LA 153LA 4HJVA 1B5YA 2A7DA 1TLAA 1EQEA 2AUBA 4FJRA 1IC5Y 4PRQA 4GCEA 1B7QA 1L65A 5FEKA 3DNAA 107LA 2I25L 5F9UA 2OE9X 1QT8A 3IWRA 3HH5A 5LZMA 1NBZC 1L21A 255LA 3ZVQA 1IP3A 4GBRB 1GXXA 142LA 1T97A 1KXWA 1RE2A 3C81A 4WG7A 1YIKA 1J1OY 4WLDA 1QDTA 3CDOA 2YDGA 2OEAX 1B7SA 1L02A 3SN6R 4GCBA 2CUUA 4EKQA 1C6BA 1UICA 4LFPA 1L31A 4I7NA 261LA 181LA 3PDSA 2A7FA 1A4VA 1OUGA 1GF8A 1F0WA 2YBIA 147LA 1LZGA 4H8ZA 2GV0A 1BQLY 3GUNA 4NHSA 1GFAA 1L59A 3W6DA 1C08C 2BQBA 4GCFA 1HSWA 1L46A 1L52A 1GWDA 1LMPA 1LJGA 1QTZA 2HUBA 1G7HC 1XEPA 1ZWNA 2D6BA 4WL7A 1VDQA 3J4GA 1GB7A 1L73A 4Z41A 4ARJA 1NF5A 5I4YA 1LSEA 1QUDA 5DN5A 5LVKA 3RNXA 4Z46A 1UIGA 5KXOA 1G0PA 1QDRA 1GPQC 1C43A 5LIOA 1BB3A 4DD7A 2BLXA 3QY4A 4PRUA 3G3VA 3HT6A 3A3RX 1DKJA 5HNCA 1L85A 2RAZX 1NKHA 2MEIA 1C6IA 1P2LA 1G1VA 3GUOA 252LA 4CHXA 2CGIA 2W1LA 4LT1A 5C6JA 2C8OA 1REYA 3WYHA 5KKIA 3F9LA 1JPOA 3AW6A 4G49A 1HEMA 4OOOA 5L3IA 1CUQA 227LA 140LA 3A3QA 4HPEA 4DDAA 251LA 1WTMA 5FCPA 4H1PA 2B72A 3J6KA 3OE9A 4XYYA 4LGKA 260LA 131LA 4NGKA 1QUGA 2ZIJA 1CU2A 1UBZA 2I26L 3V2YA 1LSBA 4E97A 1P46A 1KNIA 5I4WA 1LOZA 2G4NA 233LA 3K3TA 4BAPA 1LSNA 1SX7A 1L43A 1T6HA 4N5RA 5B1FA 2DQGY 1L00A 2Z2EA 2QB0B 1XJUA 5IELA 1QSAA 1NDGC 228LA 1DI3A 1P5CA 1B5VA 1IVMA 3FA0A 4EKRA 1L75A 2BQFA 2DQCY 1LYJA 1FKVA 2MEFA 1LW9A 4LYMA 4ARLA 1KS3A 5A3ZA 3G3BB 109LA 2FYCA 2QARC 201LA 4HPIA 1UIAA 3TXIA 4WLTA 2OU8A 188LA 1C67A 1LAAA 3AZ5A 4I7RA 2RBPA 1K28A 1GB8A 1GBXA 2NTGA 164LA 1L26A 247LA 5LA5A 2BQKA 1L99A 1CV1A 1L10A 2ZQ4A 1C6FA 1IC4Y 1LZAA 5HMVA 1AM7A 4NY5A 3TMWA 1CV6A 1CJ6A 1B7MA 1G7MC 1GAZA 1EQ5A 4BAFA 1HEWA 2H5ZA 3RZEA 5B1GA 1UIBA 4NSIA 1C6TA 1HENA 1OV7A 4OWCA 4W58A 2YBLA 4DWXA 2OE4X 1J1XY 2F4GA 2G4PA 4DJHA 4I7OA 3T6UA 1OUDA 1L88A 1L15A 248LA 4GN4A 1L18A 5LAGA 4QGZA 3W6BA 1JJ3A 1LYHA 1IOSA 1JHLA 3AZ7A 4LDEA 1JTMA 1D0LA 4NG8A 1YANA 2DBTA 2W1XA 3OK0A 113LA 1D3FA 5D5CA 5B05A 1IP7A 1P36A 1IP1A 1FLQA 4HV2A 4HTKA 3CQLA 1L41A 1L32A 176LA 2Q9EA 5HNLA 1QTVA 5ILFA 1C6EA 5FELA 1P64A 1C6JA 3D9AC 1LYDA 2BQJA 174LA 2XTHA 3CT5A 2B6TA 1IORA 1GF3A 1C46A 1W6ZA 1OYUA 1ZV5L 5KXKA 208LA 3HTBA 4WLXA 3HTGA 1OUAA 173LA 191LA 4YM8A 1YAMA 3CDVA 1GBSA 3WU8A 1DYCA 1MELL 1XGUC 2OTZX 1LZSA 1QSQA 2D4IA 4NGIA 4XJIA 3EXDA 4LYCA 1QUSA 1L38A 1UC0A 1L95A 158LA 4W55A 4HTQA 4QEQA 3W6CA 1REZA 1LMOA 5KXLA 3C8RA 207LA 4ZFPA 2BQHA 2Z19A 1GBZA 1SLYA 2W1MA 3P64A 1DI5A 154LA 1LSMA 1LZDA 3WXTA 3JR6A 1OP9B 1JISA 4AXTA 1F6SA 193LA 1YAQA 2EQLA 2RB0X 4W94A 1L19A 1UUZC 4KPMA 1C7PA 1IP4A 1JKDA 1LZ5A 167LA 3AZ6A 4OWEA 3A92A 1LYFA 1CKDA 1SSYA 4H92A 1D6PA 1ZYTA 4WMGA 4CFPA 3A93A 185LA 2LZ2A 4YENA 1D3NA 5KY1A 3TXDA 3WUMA 4WO6A 1L74A 5KXZA 1L11A 1GFEA 1L22A 1EL1A 3IJVA 1UA6Y 3TMVA 3HT7A 4CFOA 127LA 1QUHA 3TXHA 4GLVA 4I7SA 1L30A 220LA 5T3FA 5LYMA 2Q9DA 132LA 1G0QA 1VDTA 5I4XA 5J7CA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BPU A;  186L A;  4GCD A;  1OVK A;  5E9R A;  215L A;  4N0J A;  3CSQ A;  4YOP A;  2LYO A;  170L A;  4ETA A;  2XBR A;  4OOT A;  4I7K A;  3AYQ A;  183L A;  3WL2 A;  3QAK A;  1QTB A;  3B0I A;  1OUE A;  1L94 A;  4NWE A;  3AGI A;  3FE0 A;  3LYO A;  1PS5 A;  189L A;  1L77 A;  2RB1 X;  4ET9 A;  4PPO A;  4I7T A;  226L A;  2O7A A;  1IR8 A;  1DXJ A;  1CU5 A;  4IAS A;  4ARQ B;  4ARM A;  1G0M A;  110L A;  1GFT A;  1L03 A;  1LPY A;  3G3X A;  3HDE A;  3P65 A;  1NQI A;  3A96 A;  199L A;  153L A;  4HJV A;  1B5Y A;  2A7D A;  1TLA A;  1EQE A;  2AUB A;  4FJR A;  1IC5 Y;  4PRQ A;  4GCE A;  1B7Q A;  1L65 A;  5FEK A;  3DNA A;  107L A;  2I25 L;  5F9U A;  2OE9 X;  1QT8 A;  3IWR A;  3HH5 A;  5LZM A;  1NBZ C;  1L21 A;  255L A;  3ZVQ A;  1IP3 A;  4GBR B;  1GXX A;  142L A;  1T97 A;  1KXW A;  1RE2 A;  3C81 A;  4WG7 A;  1YIK A;  1J1O Y;  4WLD A;  1QDT A;  3CDO A;  2YDG A;  2OEA X;  1B7S A;  1L02 A;  3SN6 R;  4GCB A;  2CUU A;  4EKQ A;  1C6B A;  1UIC A;  4LFP A;  1L31 A;  4I7N A;  261L A;  181L A;  3PDS A;  2A7F A;  1A4V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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