1L19A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l19A00
1CV4A 1L23A 1JQUA 231LA 1G06A 1T8AA 4I7QA 222LA 199LA 1LYHA 1K28A 1D2YA 1L88A 3GULA 125LA 1JTNA 137LA 3HT7A 250LA 3C8QA 1LYEA 3DN2A 1OWYA 2OE7X 1OVJA 249LA 3VW7A 126LA 239LA 115LA 1CX7A 1C6LA 1G0QA 1T8GA 3HT8A 166LA 6LZMA 1C62A 107LA 3V2YA 1L60A 1P36A 3NY9A 4EKPA 141LA 3DN4A 1L81A 1LYDA 3CDTA 2Q9EA 1L70A 1L12A 209LA 1L80A 4GBRB 4I7TA 1L79A 3RUNA 3SB8A 1XEPA 1OV5A 3DN8A 4I7PA 114LA 1L37A 3NY8A 1CU3A 4EJ4A 1L91A 1C6MA 1L50A 2B72A 1L34A 1LI2A 1L45A 182LA 186LA 3GUIA 160LA 130LA 149LA 2L78A 1CV1A 1L90A 201LA 228LA 3SBAA 2QARC 4EXMA 216LA 211LA 145LA 3FA0A 236LA 3L64A 1C6BA 1LWKA 1QT7A 229LA 1G07A 165LA 3LZMA 1D3JA 1T97A 4PJZA 138LA 1C64A 3JR6A 4PK0A 1QTHA 259LA 1EPYA 4ARJA 218LA 258LA 2RBRA 1L75A 2ANXA 2OTZX 155LA 3HH6A 1ZURA 3FADA 196LA 148LE 1L52A 2Z6BA 1L07A 123LA 1LI6A 4LDEA 1D2WA 1L74A 4E97A 1L11A 1OVKA 3FI5A 3EMLA 1C67A 1L05A 2F32A 1C6QA 1C6CA 2B6TA 4W52A 3SB5A 2OEAX 1C6IA 1LI3A 1QSQA 3QAKA 1SSYA 1L72A 2OE9X 4K5YA 1L76A 1DYGA 1T8FA 1LYGA 260LA 2HUKA 2O4WA 200LA 241LA 122LA 2RAYX 4I7NA 1OV7A 4IAPA 1PQMA 246LA 3HTDA 3SN6R 4W51A 210LA 1L25A 206LA 1SWZA 257LA 1L30A 2RB0X 1WTHA 1CV0A 227LA 3HDFA 3GUPA 1L92A 213LA 1L09A 171LA 1D3FA 1QT8A 4ARQA 1LWGA 4ARQB 212LA 3OE6A 1L10A 3HT9A 1G0LA 1QUDA 1LLHA 189LA 3C80A 221LA 1LGUA 3K2RA 2Q9DA 1G0KA 1SSWA 2B74A 4EKQA 1L84A 167LA 235LA 1L47A 1PQIA 188LA 2RBOA 215LA 1C6HA 1L31A 2F47A 2B70A 1QT6A 1L40A 1G0JA 1L98A 1L28A 2HUMA 1P7SA 1L42A 219LA 2ANVA 1L95A 1SWYA 181LA 1ZYTA 1CV3A 1C6GA 1DYCA 152LA 1G0GA 3L2XA 253LA 174LA 1CX6A 1LYJA 1L17A 4ZPUA 1KS3A 1CVKA 1KW5A 1KY0A 1PQJA 159LA 1L26A 237LA 1L86A 4YXCA 1CV5A 1KW7A 1LGXA 1QUGA 3CDOA 2OE4X 1L22A 1L51A 2O7AA 4S0WA 1P3NA 110LA 113LA 4W59A 3HU9A 163LA 3DNAA 256LA 3ODUA 3PDSA 1L63A 1L94A 1XJUA 1CTWA 4YXAC 1LGWA 1QTZA 175LA 3OE8A 1L56A 1C65A 7LZMA 151LA 2LZMA 1QTBA 1L19A 2RBPA 4I7JA 4EKSA 3NYAA 3CDQA 2RBQA 3C7ZA 1C66A 1L27A 1QUOA 3UONA 169LA 1C61A 1L44A 1PQDA 3G3XA 156LA 1P64A 1TLAA 3HTBA 198LA 161LA 2B73A 4OO9A 2OU8A 144LA 2B6YA 1L38A 1L68A 1L04A 3G3VA 1P37A 2LCBA 1KNIA 191LA 233LA 2RBNA 2RH1A 1L24A 158LA 1LYFA 3DN3A 1ZWNA 248LA 1C6DA 4ARLA 1I6SA 1OYUA 1L02A 4LZMA 1L00A 1L32A 3C8RA 1L64A 251LA 1CU6A 3DN6A 4DKLA 119LA 220LA 162LA 3CDRA 1L54A 2B6WA 1QTDA 3SB6A 4ARPA 111LA 1L20A 4W57A 183LA 3GUNA 150LA 1OWZA 1P56A 4AQNA 1G1VA 252LA 1L43A 1SX2A 1L89A 4GRVA 1DYFA 3C81A 1L53A 1CUQA 243LA 234LA 1C6NA 240LA 1DYDA 3C83A 1L39A 3HH3A 1C6EA 2CUUA 4YX7C 2OU0X 1DYBA 3HH4A 1C6TA 1C6FA 103LA 1L41A 214LA 146LA 1L62A 1QTCA 2LC9A 1L65A 1L97A 1P2LA 4W58A 1QT3A 3F9LA 3GUKA 1C6PA 224LA 1DYAA 4W53A 1L59A 1L71A 2O79A 3DN0A 4I7MA 3C82A 1L46A 1P46A 4LDOA 1L15A 2QB0B 1D3MA 172LA 1G0PA 1L77A 1OVHA 1QT5A 109LA 1LYIA 245LA 3HU8A 1B6IA 4I7OA 180LA 1P5CA 2RBSA 3DKEX 1LPYA 1XJTA 129LA 5I14A 2RAZX 1L48A 1P2RA 1CU2A 226LA 1CV6A 3HWLA 1C60A 1G1WA 1SX7A 1L61A 3CDVA 1NHBA 1JTMA 1L14A 4ARMA 4ARMB 3GUOA 140LA 2B6XA 178LA 1P6YA 164LA 244LA 102LA 1C69A 2B6ZA 255LA 1L73A 3HH5A 147LA 262LA 1C6AA 1L58A 3HUKA 3HUAA 1L67A 1L66A 1L16A 3OE9A 4I7LA 2RB1X 112LA 3HUQA 1L36A 2NTGA 1L01A 3PBLA 2OU9A 1D9WA 143LA 1L21A 3GUMA 173LA 225LA 4W55A 127LA 128LA 1L85A 1CU5A 1QSBA 242LA 3HDEA 3RZEA 184LA 120LA 187LA 1L35A 3G3WA 4I7RA 1G0MA 3GUJA 2RB2X 4EKRA 230LA 1L03A 118LA 4W56A 4I7KA 3DMXA 1L99A 3SB7A 1L49A 2IGCA 1C68A 2NTHA 247LA 3HTGA 1L08A 1L83A 170LA 1L69A 1PQOA 1KY1A 3D4SA 1DYEA 1L57A 1L18A 1CUPA 1C6JA 3DMVA 1LW9A 3DN1A 157LA 4DJHA 232LA 190LA 3V2WA 1L13A 1L33A 1L0JA 205LA 2HULA 1L87A 4EPFA 1T6HA 185LA 1L93A 217LA 4I7SA 1L06A 1QS9A 3OE0A 4LDLA 1QUHA 5LZMA 131LA 168LA 177LA 1C6KA 3HTFA 1D3NA 261LA 176LA 1C63A 192LA 3DMZA 2A4TA 1QS5A 1L0KA 2B7XA 3SBBC 1PQKA 4DAJA 254LA 108LA 3C7YA 195LA 3HT6A 2F2QA 197LA 1L55A 142LA 4EPIA 1CU0A 2OTYX 3F8VA 223LA 2B75A 1L96A 1QT4A 139LA 3C7WA 3SB9A 1QTVA 1L82A 238LA 1L29A 4W54A 3C8SA 104LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXXA 1C10A 1G06A 1T8AA 1BGIA 1LYHA 1K28A 1D2YA 1LSEA 4HJYA 1JTNA 4M4OA 137LA 250LA 1YAOA 126LA 1C6LA 1G0QA 2Z2EA 3HT8A 4EMNA 2ZILA 6LZMA 107LA 1GB8A 4B0DA 3NY9A 1JJ3A 3DN4A 4LYZA 2YBMA 3CDTA 5FEKA 1UUZC 5KXNA 3TXIA 1WQQA 3NY8A 1CU3A 5LIOA 4GCFA 4GCBA 5B59A 1GF4A 2B72A 1CJ9A 1LJHA 1IWTA 4NGKA 1LI2A 1LSFA 4Z98A 3GUIA 1GPQC 1GFVA 1G7JC 2N5ZA 4WG1A 1P2CC 4EXMA 216LA 1B5ZA 1D3JA 5DN5A 3JR6A 1IWVA 3AGIA 2Y8PA 4PHIA 4EOFA 1G7LC 2OTZX 4QGZA 1UIEA 1LJJA 1N4FA 1L07A 1LI6A 1L74A 4E97A 1LTMA 1IWZA 1BWHA 5D5FA 4R6CA 1TAYA 4LYCA 1L05A 2F32A 4U3XB 2OEAX 1HEOA 3A6BY 2W1LA 4C5FA 2LZTA 2BQLA 200LA 2RAYX 3OK0A 1LJFA 2BQDA 3QE8A 1HNLA 4TX7A 1PQMA 3HTDA 1YANA 3QNGA 4W51A 4B4EA 1SWZA 3WUNA 134LA 1LZGA 3WXTA 1CV0A 2LYOA 1B9OA 4OWHA 5L3IA 5I4XA 3M18B 5APCA 1L09A 1LHIA 2MEGA 1IR8A 212LA 1GBZA 3OE6A 1L10A 1BB3A 3AZ6A 4H9CA 5E9RA 1LLHA 1LZ5A 3ULRA 3WW5A 2X0AA 1HMLA 1LGUA 1TBYA 2BQBA 2CGIA 4XJDA 1L84A 167LA 1L47A 2BQAA 1PQIA 5HMJA 188LA 1GE2A 4WM4A 3LYZA 1YAMA 3WW6A 3TXEA 2HUMA 4OWCA 1L95A 4GCEA 1REYA 1OUDA 1YQVY 1ZYTA 4QY9A 1C6GA 3L2XA 3G3AB 1LJKA 1OQMA 4GLAA 1KS3A 1UIFA 1KY0A 1L26A 237LA 1DKJA 1LMTA 2OE4X 5F9XA 1LZSA 3WULA 110LA 113LA 4W59A 3HU9A 1XGTC 1XEIA 1B7OA 1B2KA 1L63A 1L94A 3WU9A 1FLYA 5KXMA 1GF7A 4OWEA 1L56A 2XTHA 1B7PA 4XYYA 5IDDA 2LZMA 4WM5A 4EKSA 132LA 3CDQA 3NYAA 5APFA 1C7PA 1CKHA 5HNCA 2F30A 3G3XA 1P64A 4WM2A 4UWUA 3EBAB 4LT0A 1IP5A 198LA 2B73A 2IHLA 1IC5Y 2OU8A 1LJGA 1L68A 1P37A 233LA 2RH1A 1ZWNA 248LA 1C6DA 4ARLA 1I6SA 3T36A 1AKIA 3A94A 3C8RA 1IR7A 1L64A 251LA 1CU6A 5LVIA 1B7LA 3WU7A 111LA 1L20A 4ARPA 4W57A 207LA 1O23A 4HV2A 5KJ9A 252LA 1SX2A 1L89A 3C81A 1UIDA 234LA 1C6NA 1XEKA 1DYDA 2CUUA 4YX7C 2DQCY 2OU0X 103LA 1NDGC 146LA 1AT6A 1QTCA 2I25L 1P2LA 1CJ8A 2DQHY 1JJ1A 2HU1A 5HLLA 1QT3A 2D4IA 1I1ZA 5KXPA 4NFVA 1LYSA 1GB6A 1W6ZA 3DN0A 4CGEA 3A3RX 4LDOA 2XQOA 3W6CA 172LA 1OVHA 1IIZA 1QT5A 3M3UA 4LYOA 1LYZA 3HU8A 4I7OA 4R0FA 3A90A 129LA 1LYOA 1RI8B 1CU2A 1PZYA 1Z55A 1C60A 5KXRA 5LA5A 3CDVA 4WG7A 4H1PA 1JTMA 1L14A 4KT3A 3GUOA 244LA 3AZ7A 262LA 2LHMA 1L58A 2MEAA 4G4HA 1L67A 5KXZA 4H9IA 1L66A 1L16A 3OE9A 4B1AA 1OUIA 1UA6Y 1FLUA 1D9WA 3TMXA 1DI4A 1B5XA 5APDA 4H9AA 2G4NA 3AJNA 1L85A 4BADA 1CU5A 2BLYA 1IOSA 4DD9A 4DD0A 1CKCA 2XBRA 1GFAA 2EQLA 3CSQA 4LFXA 230LA 1L03A 118LA 4I7KA 2YBHA 4WL7A 4LT2A 2FBBA 1HSXA 2YBIA 4NHSA 1PQOA 3J4GA 3D4SA 1DYEA 1L18A 4GLVA 1LW9A 157LA 232LA 1L13A 4OW1A 205LA 1LSBA 2HULA 3CQLA 4WLDA 1T6HA 1UACY 1G7IC 5JENB 2ZQ3A 1QUHA 1C6KA 2ZWBA 1F6SA 1D3NA 5LAGA 1C63A 5E4PA 4NHQA 3WUMA 2B7XA 4RW1A 4DAJA 254LA 1JSFA 1GF3A 1CU0A 2W1XA 4G49A 3F8VA 1T3PA 1QTVA 4PJ2C 2ZIKA 5LVKA 153LA 4W54A 1YROA 5LYTA 2Z38A 4I7QA 4IATA 1IC4Y 4OOOA 222LA 1IR9A 1NKHA 3ZEKA 3AZ4A 2ZYCA 4NHPA 1OWYA 2OE7X 1GF5A 1OVJA 1QDTA 3VW7A 5LXWA 1J1XY 4NGIA 1F6RA 4DC4A 166LA 4CHXA 1IOQA 1C46A 1XGUC 3B72A 141LA 1YILA 1LYDA 1GHLA 1LMAA 4KL7A 1IP4A 1VDPA 2Q9EA 1L70A 1L12A 1LSCA 209LA 1UIGA 1XEPA 4I7PA 114LA 1ZMYL 5KY1A 1F10A 4N1EI 4QDNA 3TXBA 1C6MA 4NHTA 1OUJA 1LHMA 3A34A 1C08C 4X3BA 182LA 130LA 2DQFC 4TWSA 4ET8A 1LJ4A 3WUAA 1CNSA 1UICA 228LA 3VWOA 3FA0A 1LSZA 1REMA 1EQ5A 1B7NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5KXX A;  1C10 A;  1G06 A;  1T8A A;  1BGI A;  1LYH A;  1K28 A;  1D2Y A;  1LSE A;  4HJY A;  1JTN A;  4M4O A;  137L A;  250L A;  1YAO A;  126L A;  1C6L A;  1G0Q A;  2Z2E A;  3HT8 A;  4EMN A;  2ZIL A;  6LZM A;  107L A;  1GB8 A;  4B0D A;  3NY9 A;  1JJ3 A;  3DN4 A;  4LYZ A;  2YBM A;  3CDT A;  5FEK A;  1UUZ C;  5KXN A;  3TXI A;  1WQQ A;  3NY8 A;  1CU3 A;  5LIO A;  4GCF A;  4GCB A;  5B59 A;  1GF4 A;  2B72 A;  1CJ9 A;  1LJH A;  1IWT A;  4NGK A;  1LI2 A;  1LSF A;  4Z98 A;  3GUI A;  1GPQ C;  1GFV A;  1G7J C;  2N5Z A;  4WG1 A;  1P2C C;  4EXM A;  216L A;  1B5Z A;  1D3J A;  5DN5 A;  3JR6 A;  1IWV A;  3AGI A;  2Y8P A;  4PHI A;  4EOF A;  1G7L C;  2OTZ X;  4QGZ A;  1UIE A;  1LJJ A;  1N4F A;  1L07 A;  1LI6 A;  1L74 A;  4E97 A;  1LTM A;  1IWZ A;  1BWH A;  5D5F A;  4R6C A;  1TAY A;  4LYC A;  1L05 A;  2F32 A;  4U3X B;  2OEA X;  1HEO A;  3A6B Y;  2W1L A;  4C5F A;  2LZT A;  2BQL A;  200L A;  2RAY X;  3OK0 A;  1LJF A;  2BQD A;  3QE8 A;  1HNL A;  4TX7 A;  1PQM A;  3HTD A;  1YAN A;  3QNG A;  4W51 A;  4B4E A;  1SWZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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