1L19A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l19A00
3CDOA 255LA 4EKSA 1D3MA 1LYJA 1QTBA 1L0KA 229LA 168LA 4ZPUA 2LCBA 158LA 1L26A 1L91A 174LA 262LA 171LA 114LA 111LA 225LA 195LA 217LA 3HTBA 169LA 3HT7A 1L96A 4EKRA 2O79A 165LA 1L48A 2CUUA 3C8QA 4EPFA 2B70A 1L01A 1L32A 2HUMA 1CUPA 261LA 1C68A 1DYBA 1DYFA 1C60A 1C6EA 2OEAX 1ZURA 1T97A 4DAJA 1L54A 1L11A 4ARJA 4EKQA 3DN8A 142LA 1L57A 1L15A 1QT5A 1KW5A 1L30A 247LA 4ARMB 198LA 1L28A 1L47A 149LA 1L58A 122LA 190LA 1L79A 1CU5A 1L90A 1DYCA 216LA 1XEPA 176LA 1C6FA 3DN4A 1C6GA 2O7AA 157LA 2IGCA 1L84A 1L27A 3V2YA 1ZYTA 4W57A 104LA 1CU0A 4EPIA 199LA 4W54A 3L64A 131LA 1QS9A 1XJTA 2ANVA 1KW7A 1C6JA 242LA 4W52A 1DYAA 1L05A 1SX7A 1CV0A 1P2LA 2ANXA 3NYAA 3DN6A 1G0PA 3SB7A 103LA 1L07A 254LA 241LA 2RBSA 1LGUA 1L20A 1L74A 2QB0B 1LLHA 1L53A 3GUOA 4LZMA 3V2WA 1QT4A 1T8GA 1L99A 1L95A 1L87A 1D9WA 1QTDA 1LYGA 1L46A 1CU2A 2OTYX 192LA 1T8FA 107LA 1L66A 1C61A 128LA 253LA 2Q9DA 4I7MA 1LPYA 4W55A 3HT9A 1L04A 3C7ZA 3QAKA 3DN0A 4E97A 3DKEX 1PQKA 3C80A 1L00A 2RBOA 3NY8A 1OWZA 1TLAA 7LZMA 127LA 1P5CA 1QUOA 3HTFA 1L70A 2B7XA 2Q9EA 1L10A 155LA 1G1WA 181LA 3EMLA 167LA 3C8RA 1LGWA 1DYEA 1QTHA 1L97A 1L88A 1CV4A 3JR6A 4W59A 2B74A 2RB2X 3OE6A 3F8VA 1LWKA 3DN1A 4DJHA 126LA 184LA 148LE 3DMZA 1L52A 2LZMA 1L39A 1P37A 3UONA 4EJ4A 213LA 189LA 1QTZA 1LYFA 1L38A 1L81A 1KY0A 3DN2A 3K2RA 1C6IA 1LWGA 1G0MA 2OTZX 1C64A 3HDEA 1CV6A 147LA 3G3WA 4W51A 187LA 1L61A 4ARQB 173LA 243LA 1QSBA 3SB5A 1G0JA 1L92A 201LA 1L77A 3HH4A 3F9LA 1QSQA 4EXMA 110LA 1OWYA 119LA 1L06A 1SSYA 1PQIA 228LA 1L73A 3GUIA 1L60A 2HULA 2RB1X 1LW9A 3L2XA 2RB0X 3C81A 3HU8A 4I7SA 140LA 1G1VA 1L31A 3GULA 1QS5A 1C6MA 3PBLA 145LA 3HTGA 1D2YA 4S0WA 3OE9A 258LA 1C62A 4GRVA 1G0GA 3HUKA 1L98A 1C67A 1P36A 3FI5A 2B6TA 4I7TA 4LDLA 1L59A 226LA 1QT8A 186LA 4LDOA 139LA 1G0KA 1D3NA 218LA 2NTGA 236LA 185LA 4I7RA 1QT3A 4I7LA 4YXAC 1CV1A 1L51A 1QTVA 230LA 2RBPA 1PQMA 1G07A 180LA 1L65A 1P6YA 1LGXA 1L0JA 1JQUA 1L09A 1JTNA 1CX7A 1T8AA 1CUQA 3C7YA 210LA 3C83A 1QT6A 240LA 1L44A 3SN6R 215LA 1L71A 1PQDA 1ZWNA 4GBRB 233LA 256LA 3HUQA 2RBQA 2B73A 3C7WA 1C6BA 156LA 4PK0A 1L37A 2B75A 3SB8A 1SSWA 3G3XA 3GUMA 1WTHA 1L22A 1B6IA 1I6SA 1L42A 2RH1A 4W53A 1KS3A 4K5YA 1L02A 1L34A 231LA 2OE7X 3FADA 3GUJA 3HU9A 4YX7C 1L17A 1L69A 3RUNA 1L29A 2O4WA 1L83A 1LI6A 1OVKA 2B6YA 1K28A 1L55A 3CDRA 232LA 4I7PA 3HDFA 3HH3A 175LA 206LA 3HH6A 4I7JA 1LI2A 1L85A 1C6QA 1L86A 3GUPA 235LA 1C69A 1G0QA 3CDVA 197LA 161LA 1C6NA 196LA 1D3FA 1L49A 1CV5A 1SWZA 1L94A 3PDSA 1LYDA 1L40A 4W56A 4I7KA 1L03A 1KY1A 1L45A 151LA 3G3VA 1C65A 1L16A 3FA0A 1L82A 146LA 1D3JA 1G06A 1L21A 2B6WA 130LA 4PJZA 120LA 1C6TA 1L23A 4ARPA 129LA 1CV3A 3ODUA 1L24A 1L62A 1D2WA 3RZEA 170LA 2F2QA 1L89A 2L78A 2B6ZA 115LA 183LA 152LA 1C6AA 1L63A 1OV5A 159LA 1SWYA 4OO9A 188LA 1PQJA 1CTWA 2OU0X 219LA 160LA 3C8SA 1P64A 1L67A 259LA 1C6DA 137LA 3CDTA 3NY9A 1C6LA 2F32A 1LYEA 2QARC 2Z6BA 3HTDA 222LA 191LA 1L35A 1L08A 2OE4X 3SBAA 250LA 150LA 4I7QA 4I7OA 138LA 2NTHA 6LZMA 239LA 125LA 1C6PA 1QUDA 4AQNA 2OU8A 205LA 1L33A 4W58A 1QTCA 245LA 1C6CA 1DYDA 2A4TA 3CDQA 1C6HA 1OYUA 1QUGA 1L76A 246LA 2F47A 2RAZX 3GUKA 123LA 108LA 220LA 144LA 182LA 1OV7A 3HT6A 2RBNA 178LA 212LA 1C63A 1CU3A 3D4SA 1L64A 4I7NA 237LA 221LA 2OE9X 251LA 3HT8A 4LDEA 141LA 214LA 209LA 2OU9A 1L93A 113LA 4YXCA 1KNIA 1XJUA 223LA 4ARLA 4ARQA 1NHBA 1L25A 1L72A 3SBBC 5I14A 2RAYX 3OE8A 1CU6A 3C82A 2LC9A 163LA 1P7SA 211LA 1CX6A 2B6XA 1CVKA 244LA 3OE0A 172LA 1P46A 1G0LA 1L19A 227LA 1L41A 1L50A 1JTMA 1C66A 1L75A 1L80A 1LYIA 1L12A 3GUNA 1QUHA 3HWLA 1L36A 4ARMA 1EPYA 1L14A 3VW7A 200LA 5LZMA 1OVJA 164LA 3DN3A 4EKPA 1L43A 3SB9A 162LA 238LA 177LA 1T6HA 234LA 102LA 1P2RA 1LI3A 2B72A 3DNAA 112LA 1C6KA 1L56A 1PQOA 224LA 249LA 2HUKA 1L68A 2RBRA 1L13A 3LZMA 260LA 1LYHA 4IAPA 3HH5A 1DYGA 166LA 118LA 1QT7A 143LA 3HUAA 3SB6A 3DMXA 1SX2A 252LA 1L18A 3DMVA 1OVHA 109LA 1P56A 248LA 257LA 1P3NA 4DKLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NBZC 2C8OA 1D3MA 1B0DA 1QTBA 4DT3A 4ET8A 1IX0A 4ZFPA 158LA 2Z18A 3AZ4A 1GFKA 2ZIKA 1L26A 217LA 2Z2EA 165LA 4BAFA 1AT5A 2HUMA 5KXTA 1UIEA 2OEAX 1T97A 1CNSA 3DN8A 3W6FA 142LA 1L15A 3WU9A 1UA6Y 5LYTA 1BHZA 2BLXA 1OUIA 1B7MA 3AGIA 216LA 1L90A 1XEPA 3A6CY 1YAQA 5LAGA 3DN4A 5FDJA 2O7AA 1V7SA 4EPIA 5F16A 4LT1A 1KW7A 4W52A 154LA 1DKJA 1YAPA 1LPIA 1CV0A 3DN6A 1L07A 1TBYA 5I5QA 1CKDA 4LZMA 3GUOA 3EBAB 4N8ZA 1QT4A 3AB6A 1JSFA 1NDMC 1LZBA 2OTYX 192LA 4XJFA 2Z19A 128LA 1H6MA 4W55A 3HBHA 3C7ZA 4H9HA 3SP3A 4OOOA 3QAKA 4WOAA 1PQKA 1UACY 2ZYCA 1P5CA 1L70A 1GE1A 155LA 1G1WA 1IC7Y 3J6KA 1AM7A 4IATA 2DQEY 2RB2X 1IO5A 3OE6A 3F8VA 3TXEA 1L39A 2MEBA 3CB7A 3K2RA 3DN2A 4TUNA 1CV6A 3HBDA 4GN4A 187LA 173LA 4MCKA 1QSBA 1L92A 1UIHA 1YAMA 1LTMA 4EXMA 1L06A 1PQIA 1IWWA 1L73A 1HEOA 2HEDA 4LYZA 1B7LA 1OUHA 2RB0X 3C81A 4I7SA 1AKIA 5KJ9A 134LA 2HU1A 1GBSA 5E4PA 5I4WA 258LA 1C62A 3W6CA 1G0GA 4Z41A 1BVXA 1IR7A 1JJ3A 1OP9B 186LA 1LKRA 4WO9A 4NFVA 4HTKA 3LHMA 1D3NA 1IP5A 2HEFA 236LA 1XEJA 1QT3A 4I7LA 4YXAC 8LYZA 1YKZX 1XGPC 4RLMA 4NSJA 2RBPA 4WM3A 2F30A 1L65A 3AZ6A 4GN3A 1FBIX 1CX7A 1HEMA 1IC4Y 4PGJB 1LZNA 2BQOA 4ETAA 4W96A 1QT6A 1VDSA 240LA 1BB3A 5LVKA 4UWNA 4H94A 256LA 1YKXX 3AJNA 1L37A 2B75A 3TMVA 1SSWA 3G3XA 1L22A 2LZ2A 1IWZA 1KS3A 4K5YA 231LA 3HU9A 4YX7C 4WL6A 1L69A 132LA 2HECA 4CJ2A 4WM5A 4DQJA 2O4WA 1YIKA 1QTKA 1OQMA 1IOQA 2B6YA 1JISA 1L55A 5F81A 175LA 4ET9A 206LA 3WUAA 5KXOA 1C6QA 235LA 1H87A 4G9SA 4MSTA 3A67Y 161LA 1RJCB 196LA 1D3FA 3B6LA 4N1CC 1CV5A 3WL2A 3WVYA 4J0LA 1L45A 3WU8A 4M4OA 1C65A 2D4JA 2LZTA 3A92A 3P66A 146LA 1D3JA 1G06A 3B72A 4HTNA 4XJGA 4LYCA 4ARPA 5A3EA 4BADA 1CV3A 3WW6A 3ODUA 4WLYA 4NGJA 2F2QA 4HJZA 4RDSA 1GFGA 1OV5A 2EKSC 1SWYA 1I20A 1CTWA 3RNXA 1D0LA 160LA 4I8SA 4G49A 1F6SA 259LA 4ETBA 1GFVA 3EMSA 3AW6A 1IY4A 4EOFA 1L35A 1L08A 3AGHA 3ZEKA 1LYZA 138LA 4B0DA 6LZMA 1LJGA 1GFRA 1CJ8A 125LA 2HEEA 1IOCA 1GB2A 3P64A 1L33A 1QTCA 1QQYA 4NGYA 1J1OY 1IOTA 1D0MA 4PRUA 1OYUA 5A3ZA 2F47A 1BQLY 3A93A 3GUKA 3TXDA 1GBWA 4LT3A 3LZTA 4G4BA 1JIYA 3HT6A 2MEFA 1LYOA 1J1XY 1ALCA 1L64A 4I7NA 1XEIA 251LA 4NGVA 1DI5A 214LA 1G7MC 2Q0MX 4YXCA 5B1FA 4RLNA 1KIPC 1NHBA 1NQIA 2CWIA 3AZ5A 4KL7A 1DI3A 4I0CA 4E3UA 3WUMA 1ZV5L 1VAUA 2ZILA 1FDLY 4PPOA 1UIFA 211LA 1CX6A 2BQBA 3OE0A 1G0LA 1LZ9A 1L41A 1C66A 1L12A 1UCOA 4H8YA 3ULRA 5II3A 1EPYA 200LA 5LZMA 5APCA 5KKIA 1L43A 3SB9A 4TSBA 3W6BA 1DI4A 3A96A 102LA 1HSWA 1P2RA 5LXWA 3OK0A 112LA 1XSFA 2HUKA 4ETEA 1E8LA 4KPMA 4IAPA 3HH5A 1DYGA 1NWGA 118LA 1QT7A 5E9RA 1LZ5A 252LA 3DMVA 1P56A 4MR1A 248LA 1GF3A 257LA 1QUSA 3A8ZA 4GCDA 2DQJY 4YF2A 1LYJA 1VATA 4ZPUA 2LCBA 4BAPA 3BKVA 171LA 114LA 3HT7A 2W1LA 2LYMA 4EKRA 4H92A 3J4GA 1GF8A 1LZGA 1L01A 1JHLA 5FHWA 5C6JA 1GFEA 4LFXA 3VWOA 1IR9A 1HERA 2FYCA 1L54A 1L11A 1L57A 2PC2A 198LA 1L28A 4II8A 2I25L 4LGKA 1HC0A 3B0OA 1L47A 122LA 1L79A 1CU5A 5J7CA 3HFMY 5K7OA 5KXKA 3AW7A 1C6GA 2HTXA 1G7JC 1CKHA 1L84A 1L27A 4W57A 4DC4A 2Y8PA 4XN6A 1B5VA 2EIZC 1XJTA 1C6JA 2WARA 1L05A 3WULA 1G0PA 4GN5C 3SB7A 2F4AA 254LA 1HFYA 241LA 2RBSA 1LGUA 1TDYA 1L20A 1O23A 1BWIA 3QE8A 4XADA 1L87A 1D9WA 1LYGA 2XBSA 1CU2A 1L66A 4WM2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NBZ C;  2C8O A;  1D3M A;  1B0D A;  1QTB A;  4DT3 A;  4ET8 A;  1IX0 A;  4ZFP A;  158L A;  2Z18 A;  3AZ4 A;  1GFK A;  2ZIK A;  1L26 A;  217L A;  2Z2E A;  165L A;  4BAF A;  1AT5 A;  2HUM A;  5KXT A;  1UIE A;  2OEA X;  1T97 A;  1CNS A;  3DN8 A;  3W6F A;  142L A;  1L15 A;  3WU9 A;  1UA6 Y;  5LYT A;  1BHZ A;  2BLX A;  1OUI A;  1B7M A;  3AGI A;  216L A;  1L90 A;  1XEP A;  3A6C Y;  1YAQ A;  5LAG A;  3DN4 A;  5FDJ A;  2O7A A;  1V7S A;  4EPI A;  5F16 A;  4LT1 A;  1KW7 A;  4W52 A;  154L A;  1DKJ A;  1YAP A;  1LPI A;  1CV0 A;  3DN6 A;  1L07 A;  1TBY A;  5I5Q A;  1CKD A;  4LZM A;  3GUO A;  3EBA B;  4N8Z A;  1QT4 A;  3AB6 A;  1JSF A;  1NDM C;  1LZB A;  2OTY X;  192L A;  4XJF A;  2Z19 A;  128L A;  1H6M A;  4W55 A;  3HBH A;  3C7Z A;  4H9H A;  3SP3 A;  4OOO A;  3QAK A;  4WOA A;  1PQK A;  1UAC Y;  2ZYC A;  1P5C A;  1L70 A;  1GE1 A;  155L A;  1G1W A;  1IC7 Y;  3J6K A;  1AM7 A;  4IAT A;  2DQE Y;  2RB2 X;  1IO5 A;  3OE6 A;  3F8V A;  3TXE A;  1L39 A;  2MEB A;  3CB7 A;  3K2R A;  3DN2 A;  4TUN A;  1CV6 A;  3HBD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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