1L23A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRAILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l23A00
1L15A 1L13A 3G3VA 186LA 2OTZX 1LPYA 130LA 1LGUA 1LI3A 222LA 3FI5A 1C6TA 4I7SA 4I7TA 1C69A 1L90A 192LA 161LA 1XJTA 3C7ZA 227LA 4I7MA 1QUHA 3C8RA 4EKRA 3GUJA 1PQDA 1P7SA 1C6JA 1KY0A 103LA 3HDFA 1L52A 3HU9A 151LA 1L30A 1C62A 2RBSA 2OTYX 104LA 5I14A 1PQOA 205LA 2RBQA 1P56A 2F47A 226LA 4DAJA 253LA 1QTHA 1QT8A 141LA 140LA 3HT6A 1T8AA 1G1VA 1L86A 1QSQA 1L71A 2NTGA 1LYJA 1L89A 158LA 155LA 172LA 258LA 1L17A 1LYGA 182LA 4LDEA 1DYEA 3DMZA 1XEPA 2OU8A 245LA 3SBAA 4I7QA 1L0JA 3HTGA 3OE8A 4IAPA 1L40A 1G0GA 210LA 1L01A 1KNIA 2B6YA 1OWZA 2RAYX 223LA 4PJZA 1LYEA 1C6IA 249LA 3F8VA 2B75A 1L80A 1QTBA 2B6ZA 1JQUA 122LA 1D3MA 2Z6BA 1L16A 238LA 1L12A 1OVHA 1QTCA 1G07A 1L53A 191LA 1ZYTA 2Q9DA 183LA 1L75A 1L56A 159LA 1QT4A 2ANVA 4W57A 1L59A 3K2RA 4I7KA 1D2YA 1L87A 200LA 2HUMA 1KW7A 213LA 1L33A 1CX7A 152LA 1L48A 1SSYA 1L22A 3HH4A 4EKSA 1L10A 1CV5A 1CV3A 241LA 157LA 1QT5A 1C6EA 2CUUA 102LA 3HH3A 1C6DA 1P64A 1C6FA 1PQIA 3C81A 1KS3A 4W53A 4YX7C 1LI2A 4EKPA 3FA0A 1L45A 199LA 1L58A 255LA 233LA 4W55A 2RB1X 1L05A 1ZWNA 2RH1A 257LA 1L85A 164LA 1CV0A 1L73A 1L92A 1OWYA 3CDTA 2L78A 201LA 4I7OA 4ARMB 139LA 125LA 110LA 1OVKA 123LA 212LA 260LA 3NY9A 244LA 1EPYA 3HH5A 1CU6A 1L26A 3V2YA 261LA 2B6TA 3HH6A 1C63A 4W59A 166LA 1P3NA 3HU8A 4OO9A 1CV4A 1L76A 142LA 4ARJA 1D2WA 1L54A 1CU3A 3SBBC 3C83A 1C6CA 1L93A 1DYBA 1CV6A 2OEAX 187LA 2OU0X 242LA 4I7LA 1CU5A 220LA 180LA 3HUQA 1I6SA 1C6KA 147LA 240LA 4EXMA 1JTNA 1WTHA 1ZURA 1C61A 1D3NA 3VW7A 146LA 4S0WA 1L82A 1LWGA 1L18A 3JR6A 4AQNA 1DYDA 108LA 3DN0A 3OE9A 4E97A 252LA 2RB2X 1L49A 4I7PA 1LYDA 3CDRA 1LYHA 1L41A 1G0KA 209LA 3EMLA 2RBRA 188LA 2B7XA 1OVJA 256LA 1L23A 1LGXA 1L57A 1L61A 1C64A 1L97A 1L74A 1PQMA 156LA 1L51A 1QT6A 178LA 1L84A 3CDVA 1LI6A 169LA 1C67A 1L27A 2NTHA 1G0QA 1TLAA 1C6AA 2O79A 171LA 3SN6R 1C68A 1KY1A 2Q9EA 118LA 3DMXA 1QS9A 1L37A 1QUDA 3HUAA 2OU9A 1C6BA 1L42A 1L0KA 1LLHA 3NYAA 3DN4A 1G0LA 1L72A 1OYUA 2O7AA 185LA 1G0JA 160LA 1P37A 150LA 195LA 4YXAC 1XJUA 1P46A 2HULA 2HUKA 214LA 1L06A 2OE4X 2RBNA 3G3WA 1PQJA 3SB6A 4W54A 1L02A 1QS5A 2RB0X 2QARC 3DN2A 1C6MA 3FADA 129LA 1QTZA 1L98A 1L94A 1L68A 3NY8A 206LA 217LA 173LA 119LA 4I7NA 4ARQA 1L95A 145LA 1CX6A 1P36A 1L44A 144LA 2LC9A 4GRVA 4LZMA 1KW5A 1L96A 1L69A 3HUKA 4I7RA 126LA 2B6WA 243LA 4W56A 148LE 1P5CA 3ODUA 2QB0B 1K28A 1L91A 1L29A 196LA 1DYCA 1B6IA 3SB7A 3G3XA 1P6YA 1G1WA 3SB8A 1C6NA 2F32A 1L21A 1L66A 3C82A 5LZMA 131LA 174LA 3DN3A 1LGWA 1CVKA 262LA 3HTDA 4ARLA 3V2WA 128LA 3C8QA 1L31A 2OE9X 137LA 3PBLA 3GUPA 1L46A 2A4TA 1D9WA 3UONA 1C6PA 3PDSA 2O4WA 211LA 1CTWA 177LA 120LA 1L08A 1L39A 2LCBA 149LA 3DNAA 1NHBA 1L14A 239LA 2RBOA 3D4SA 4W58A 259LA 1SX7A 189LA 230LA 246LA 229LA 3GUIA 3C8SA 250LA 1D3JA 3HT9A 3RZEA 1L60A 3HTFA 143LA 1LYFA 1LWKA 1DYGA 4DJHA 4I7JA 3DN1A 4W51A 1C66A 198LA 1CU0A 1D3FA 115LA 3DN6A 1QT3A 234LA 248LA 1L55A 1G0MA 1OV7A 1T6HA 1C6LA 1L11A 1L28A 3DMVA 1L03A 3GULA 1L35A 1G06A 184LA 1L77A 1C6HA 3F9LA 4EJ4A 1L00A 2OE7X 2F2QA 162LA 165LA 170LA 1L67A 163LA 216LA 3C7WA 4EKQA 7LZMA 2RBPA 4K5YA 3HDEA 2RAZX 1P2RA 1SSWA 215LA 109LA 3DKEX 111LA 3HTBA 4ARPA 1T8FA 1C65A 1L04A 225LA 3GUOA 1L99A 1L20A 1L63A 3GUKA 1L25A 1L70A 4LDOA 3HWLA 1L09A 3DN8A 181LA 218LA 1C60A 2B73A 2B74A 1T8GA 235LA 3C80A 1T97A 112LA 1DYFA 3C7YA 4W52A 4YXCA 4GBRB 1QSBA 4PK0A 4LDLA 3QAKA 2LZMA 1SX2A 1L81A 4ZPUA 221LA 3CDOA 251LA 2B72A 1PQKA 2B70A 1L50A 1CU2A 1L43A 1QUOA 1CUPA 1DYAA 1L38A 254LA 1QTVA 1QTDA 1G0PA 237LA 1OV5A 1L88A 4ARMA 2IGCA 1QT7A 1L47A 1L79A 4EPIA 1SWZA 4EPFA 127LA 113LA 190LA 1SWYA 1L65A 3L64A 236LA 1L24A 4DKLA 1L64A 175LA 1L19A 1L83A 3L2XA 1L32A 1JTMA 219LA 3GUNA 1QUGA 197LA 4ARQB 1CUQA 3HT7A 107LA 3CDQA 168LA 3LZMA 3OE0A 1CV1A 1C6QA 1LW9A 3RUNA 228LA 3HT8A 6LZMA 1P2LA 224LA 232LA 1LYIA 167LA 1L07A 3SB5A 138LA 1C6GA 3OE6A 2ANXA 3SB9A 1L36A 247LA 176LA 114LA 1L62A 1L34A 3GUMA 2B6XA 231LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LSZA 3G3VA 4NGLA 2BPUA 3WPKA 3TXGA 1HFXA 4IJ4A 2HTXA 1JJ0A 2BLYA 1LGUA 1GBWA 1LI3A 4I7SA 5KXRA 161LA 133LA 227LA 3C7ZA 4I7MA 1GBZA 1PQDA 1C6JA 103LA 3HU9A 1NDGC 1LCNA 1YIKA 2OTYX 4MCKA 104LA 1BB4A 3WW6A 1QIOA 4GN3A 2DQEY 4I0CA 4HPIA 2BQKA 2BQHA 253LA 4W96A 141LA 1J1PY 5KY1A 4ETDA 1L86A 5APDA 1H87A 2D4IA 4LT2A 158LA 1O23A 1LZDA 4LDEA 2OU8A 3SBAA 3HTGA 2EIZC 4WM1A 4OWBA 3EMSA 1L01A 1KNIA 1B5VA 2B6YA 1YKZX 5II3A 2DQJY 4PJZA 1LYEA 1C6IA 2B75A 1L80A 1QTBA 2MEAA 5KXPA 1IWYA 3FE0A 122LA 1IOCA 2Z6BA 3TMWA 238LA 1L12A 4H92A 1QSAA 1UIAA 1G07A 1UIEA 4IASA 1L59A 1KW7A 213LA 1L33A 1GB8A 3LHMA 1LZRA 4EKSA 4H90A 4DD9A 1CV5A 3A3QA 157LA 4CHXA 4Z41A 1JHLA 4W53A 4MR1A 1F6RA 2YBHA 1LSNA 1UCOA 257LA 3HBHA 1LZAA 164LA 4H9BA 1L73A 1L92A 1TAYA 2L78A 201LA 4ARMB 1I1ZA 2BQDA 1IP2A 212LA 5KXWA 2HEAA 4NGIA 4TWSA 4H9AA 3HH5A 1CU6A 1KXWA 3WU8A 5APCA 1UIFA 4HJYA 142LA 1IR9A 1D2WA 2G4QA 4ARJA 1UBZA 3A6CY 1C6CA 2HEBA 1XGPC 8LYZA 2HEDA 147LA 1GFEA 4ANRA 1QDTA 1LSFA 194LA 1B7OA 4N8ZA 1JISA 4NG8A 4LYOA 3JR6A 1GEZA 1SQ2L 4HSFA 3OE9A 2X0AA 4EMNA 1LYDA 1RI8B 4NG1A 1GB5A 1L41A 2ZILA 1G0KA 1LMTA 3AGGG 2RBRA 1QTEA 1LZ4A 1L57A 1DKKA 1C64A 5EBHA 1L51A 4DYGA 4HTKA 1B9OA 1L84A 4NHIA 1HERA 1G7MC 1L27A 3AJNA 5LYZA 2Z12A 3ZEKA 1GBYA 1LYZA 2BQCA 3AW6A 1JSEA 3HUAA 2FBDA 1L0KA 2MEDA 1OUGA 2I26L 3DN4A 1GE2A 1OYUA 2IHLA 160LA 5APFA 150LA 195LA 3RW8A 3RZ4A 4ETAA 5FHWA 4QDNA 1UA6Y 1HEQA 1WQOA 3WUAA 1JKBA 3DN2A 3AGHA 3FADA 4TTDA 1OUEA 4BS7A 4N1EI 4KXIA 1HELA 4C5FA 217LA 119LA 5B1FA 1LZCA 1A2YC 1FKQA 2BQEA 1HEOA 3LYMA 3MGWA 1L96A 1L69A 3HUKA 4I7RA 2DQDY 3AZ6A 1GFUA 4B49A 1SLYA 1K28A 1JJ1A 1ZVHL 1L29A 4LYTA 4RW2A 1P6YA 1G1WA 1LPIA 3SB8A 5J7CA 2Z2EA 1L66A 5LZMA 1GB9A 3DN3A 174LA 1CVKA 1GXXA 137LA 1IWXA 1BWHA 1GF4A 4GN4A 1GFVA 3PDSA 5B59A 1LKSA 1CTWA 2D6BA 2BQBA 177LA 5E4PA 2LCBA 4QGZA 149LA 1FLYA 4NGOA 3D4SA 1LZSA 3AYQA 189LA 5I53A 2GV0A 250LA 3W6DA 1D3JA 3HTFA 1LZNA 1LYFA 4DJHA 1NBZC 2D4KA 4ZIXA 115LA 3DN6A 1C43A 1L55A 1G0MA 1OV7A 1GXV2 1C6LA 1L11A 1L28A 3T36A 1LHMA 1CKGA 4NWHA 3D3DA 4WLXA 3VWOA 1LMAA 1LZBA 4H9CA 1RE2A 2W1LA 1L77A 3F9LA 1LYYA 3E3DA 1HEPA 3HDEA 4DQ7A 1LSCA 2FYCA 3TXEA 1IP1A 1B5WA 3DKEX 3HTBA 1L04A 225LA 4IATA 5F9UA 3W3EA 4WLTA 1L09A 2DQFC 2LYOA 4WO9A 1DI4A 1OUBA 4RDSA 2DBTA 2BQOA 5LVGA 1LMQA 4W52A 5KKIA 4GBRB 5IELA 5I5QA 4LDLA 1L81A 3WPLA 3CDOA 251LA 1LZ8A 1VDTA 4LZTA 5B1GA 1PQKA 1CUPA 1DYAA 1QTVA 3M3UA 1QTDA 1EL1A 1QT7A 1WVVA 2XQOA 3WL2A 1L79A 4EPIA 2DKVA 4EPFA 236LA 1L24A 2F4GA 3EBAB 5KXMA 4XJHA 1CNSA 1G7LC 1DPXA 1REZA 4DQJA 2Z37A 1XSFA 4XADA 1GB7A 4WM6A 3HT7A 4NHQA 4HP0A 1YL1X 3IJUA 1W6ZA 3A91A 1IC7Y 2F2NA 3ATNA 232LA 5I4WA 3SB5A 4UWNA 1L36A 247LA 2ZNXY 1LSYA 4AXTA 2Z38A 5KXOA 2ZIKA 4UWUA 4WM5A 1LZGA 1XEKA 130LA 2MEEA 5ILFA 5I54A 207LA 2A7DA 2Q0MX 4GCFA 1C6TA 2ZIJA 3ULRA 2ZWBA 1V7TA 1GFHA 1XJTA 1QUHA 3GUJA 1KY0A 2BQJA 3HDFA 1L52A 3EXDA 151LA 5LVKA 3A94A 1XGQC 2RBSA 1D9UA 5DN4A 1WQMA 3HBEX 5I14A 205LA 1BHZA 4H9HA 2F47A 5IHGA 5LVHA 1QT8A 3HT6A 1BWJA 1T8AA 1G1VA 3A93A 2NTGA 4GCBA 4DC4A 1L17A 1LZ1A 1DYEA 1YQVY 1L0JA 1B7LA 4PPOA 210LA 1LJJA 1OWZA 2RAYX 3F8VA 1KXXA 3J4GA 3TMVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LSZ A;  3G3V A;  4NGL A;  2BPU A;  3WPK A;  3TXG A;  1HFX A;  4IJ4 A;  2HTX A;  1JJ0 A;  2BLY A;  1LGU A;  1GBW A;  1LI3 A;  4I7S A;  5KXR A;  161L A;  133L A;  227L A;  3C7Z A;  4I7M A;  1GBZ A;  1PQD A;  1C6J A;  103L A;  3HU9 A;  1NDG C;  1LCN A;  1YIK A;  2OTY X;  4MCK A;  104L A;  1BB4 A;  3WW6 A;  1QIO A;  4GN3 A;  2DQE Y;  4I0C A;  4HPI A;  2BQK A;  2BQH A;  253L A;  4W96 A;  141L A;  1J1P Y;  5KY1 A;  4ETD A;  1L86 A;  5APD A;  1H87 A;  2D4I A;  4LT2 A;  158L A;  1O23 A;  1LZD A;  4LDE A;  2OU8 A;  3SBA A;  3HTG A;  2EIZ C;  4WM1 A;  4OWB A;  3EMS A;  1L01 A;  1KNI A;  1B5V A;  2B6Y A;  1YKZ X;  5II3 A;  2DQJ Y;  4PJZ A;  1LYE A;  1C6I A;  2B75 A;  1L80 A;  1QTB A;  2MEA A;  5KXP A;  1IWY A;  3FE0 A;  122L A;  1IOC A;  2Z6B A;  3TMW A;  238L A;  1L12 A;  4H92 A;  1QSA A;  1UIA A;  1G07 A;  1UIE A;  4IAS A;  1L59 A;  1KW7 A;  213L A;  1L33 A;  1GB8 A;  3LHM A;  1LZR A;  4EKS A;  4H90 A;  4DD9 A;  1CV5 A;  3A3Q A;  157L A;  4CHX A;  4Z41 A;  1JHL A;  4W53 A;  4MR1 A;  1F6R A;  2YBH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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