1L24A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l24A00
1L24A 236LA 2B74A 2CUUA 163LA 118LA 248LA 205LA 1L31A 1L65A 3DN4A 222LA 2OE7X 2RB2X 3DN8A 122LA 220LA 262LA 3C82A 2B7XA 1C65A 1QSQA 2RB1X 1L36A 3HH4A 1L61A 148LE 107LA 3HT6A 1L50A 3V2YA 1QTBA 3K2RA 143LA 1PQOA 4YX7C 3PBLA 3CDOA 1L95A 1LI3A 3HUAA 1JTMA 1L49A 3OE6A 2LZMA 3C7YA 4AQNA 1QT8A 1D2WA 3GULA 216LA 3DMVA 1C6FA 4EKSA 229LA 1QS9A 1L30A 2LC9A 1L75A 1G07A 241LA 1LYJA 167LA 1CU6A 1KNIA 145LA 2B75A 3G3XA 224LA 1L64A 3EMLA 3C7WA 1D3MA 2HULA 1JQUA 1L27A 1L59A 3SB6A 4EPIA 2OU9A 1L03A 254LA 3HT9A 2OE9X 1L77A 3FI5A 3GUKA 1LYGA 2B70A 1DYDA 3DN2A 3SB7A 1L10A 1G0LA 1LYIA 4YXCA 3SB5A 1L74A 138LA 3SBBC 218LA 1L20A 4I7PA 230LA 165LA 1DYBA 1L71A 1L99A 1L86A 3DKEX 2QB0B 1TLAA 1L0JA 1L0KA 1QTZA 1L09A 162LA 3FA0A 4OO9A 1L12A 125LA 169LA 217LA 3HTGA 197LA 4EKPA 4LDOA 214LA 149LA 3F9LA 2A4TA 127LA 1LYFA 1CV3A 1L70A 4PJZA 221LA 1C6KA 192LA 2Q9EA 2ANXA 4EJ4A 4EPFA 3NY8A 1P46A 1QTCA 4IAPA 3V2WA 233LA 1C6MA 3DN6A 1C67A 1L80A 1L46A 1WTHA 1L87A 1L43A 1C69A 156LA 212LA 109LA 246LA 2B6WA 1L28A 4LZMA 1LYEA 1L17A 3D4SA 1L88A 1L89A 239LA 1QUGA 146LA 119LA 1PQKA 190LA 1L56A 1QT5A 1LGUA 1D9WA 1P64A 2RBRA 3DNAA 1CU3A 1PQIA 1K28A 3C7ZA 4I7KA 4W53A 4YXAC 1L37A 1LYHA 2OTYX 2Z6BA 1L54A 174LA 232LA 1C6LA 2RB0X 2F2QA 1C6PA 1L00A 228LA 3GUOA 161LA 4EXMA 3CDTA 1QUOA 2L78A 1L42A 252LA 3HDEA 1C62A 1L92A 170LA 4ARQA 4I7LA 4DJHA 1T8AA 1L19A 260LA 4W51A 1L34A 2OU8A 2Q9DA 1P7SA 184LA 250LA 1L51A 142LA 7LZMA 1L58A 1L90A 1CU5A 1G0PA 1T8FA 1L01A 152LA 1KW7A 3HDFA 1CTWA 1G06A 3GUIA 1L40A 3C8SA 3C83A 1L35A 1CUPA 3HWLA 1L57A 1P2LA 251LA 1P6YA 1QTVA 213LA 1I6SA 247LA 3HT7A 1C6GA 2B73A 225LA 1L83A 131LA 1OWZA 2F32A 2B6XA 253LA 1KY0A 196LA 1C61A 4ZPUA 1CU2A 3HTDA 1L08A 160LA 1QUHA 1JTNA 4LDEA 4W58A 130LA 189LA 3GUMA 4W55A 137LA 1KS3A 2RAZX 147LA 2O4WA 3RUNA 159LA 195LA 3CDRA 3DN0A 3HT8A 1C6IA 1LYDA 1L62A 3SN6R 3CDQA 140LA 185LA 144LA 1PQJA 178LA 102LA 1LGXA 155LA 164LA 1C6EA 4I7RA 3RZEA 1LGWA 238LA 1ZWNA 1C6AA 4ARLA 1D3JA 3OE8A 3G3VA 1LW9A 110LA 175LA 123LA 2RBNA 1QSBA 237LA 1L73A 1DYFA 1C6HA 3SB9A 3F8VA 3FADA 3G3WA 3L2XA 1LLHA 1DYCA 176LA 240LA 1OWYA 223LA 1QT7A 1L52A 1C60A 1P5CA 3SB8A 1OVJA 139LA 1B6IA 1L14A 4GRVA 3DMZA 1C6BA 1ZYTA 3L64A 128LA 1CX6A 1SX2A 258LA 4W59A 2HUKA 4K5YA 2OTZX 3PDSA 3UONA 3VW7A 1L91A 4I7MA 104LA 3DN3A 1C6DA 6LZMA 2HUMA 172LA 1L41A 1L05A 1KW5A 1QS5A 1LI6A 158LA 3ODUA 2O79A 1CV5A 235LA 1L23A 1C6JA 1OV7A 2NTGA 255LA 1L94A 1L32A 2F47A 211LA 256LA 1C6TA 183LA 150LA 2RAYX 1G0GA 1QT4A 1T8GA 1CV1A 1SSYA 1LPYA 1C6NA 244LA 1CX7A 243LA 1L96A 1G1VA 2NTHA 3QAKA 3HTBA 2O7AA 1L16A 103LA 1L68A 206LA 1OVKA 4W57A 226LA 120LA 1L13A 4I7SA 257LA 3NY9A 200LA 199LA 4E97A 1L25A 1QTDA 4LDLA 249LA 3OE9A 1XJUA 1C68A 1L48A 3OE0A 1D2YA 2B6ZA 1DYAA 1L82A 1CV6A 2QARC 227LA 3HU8A 1SWYA 4DAJA 261LA 168LA 2ANVA 1P37A 1XEPA 3HUKA 1T6HA 1L85A 1PQDA 245LA 215LA 1L69A 1DYGA 1NHBA 4ARMB 1L79A 1L60A 1L84A 2OU0X 4EKQA 3SBAA 1C6QA 1SWZA 234LA 1L33A 1L11A 201LA 2IGCA 4W52A 1G0QA 4ARJA 1D3FA 3C8QA 2OEAX 188LA 1QTHA 242LA 1DYEA 1L06A 3CDVA 1C6CA 1XJTA 1EPYA 1G0JA 2RBSA 3DN1A 4I7OA 3GUNA 1C64A 3HU9A 3HUQA 171LA 1L67A 1CV4A 3NYAA 1L53A 191LA 4GBRB 115LA 1L98A 1L55A 1L63A 126LA 1SSWA 166LA 1L38A 186LA 1L07A 1QT6A 1T97A 1D3NA 1L72A 1LWGA 2B6TA 1OYUA 1G0KA 2LCBA 2RBPA 3C8RA 1L76A 1P56A 3HH5A 3LZMA 1L21A 4W54A 5I14A 113LA 111LA 1OV5A 3C81A 1LI2A 1L26A 259LA 3HH6A 3JR6A 1P3NA 157LA 210LA 3C80A 1P36A 4ARQB 1L02A 1KY1A 1L47A 1CUQA 173LA 3GUJA 209LA 4EKRA 2RH1A 2B72A 4ARPA 4ARMA 1PQMA 1G1WA 4I7JA 1L18A 1CVKA 108LA 114LA 3HTFA 1SX7A 1QUDA 1L93A 231LA 1C66A 4I7NA 181LA 4W56A 1CV0A 4S0WA 1L66A 1L81A 4I7TA 1C63A 141LA 3GUPA 219LA 4I7QA 1QT3A 180LA 5LZMA 1L15A 4PK0A 1L44A 1L29A 1L97A 1LWKA 1L22A 4DKLA 2RBOA 112LA 1G0MA 151LA 1L39A 3DMXA 1OVHA 2RBQA 177LA 198LA 1L45A 1ZURA 3HH3A 182LA 187LA 1CU0A 1P2RA 1L04A 2B6YA 2OE4X 129LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
194LA 248LA 2RB2X 3DN8A 2BQHA 4DT3A 1QSQA 4LZTA 1L36A 4YOPA 1L61A 1LMAA 4NSGA 148LE 1IWUA 1JIYA 1DI4A 1NQIA 4HJVA 5M1YA 1PQOA 1NBZC 1FKVA 1GB8A 1JEFA 1IOSA 1GB6A 4NWHA 1CJ9A 1L75A 241LA 3B0IA 2I26L 1FLQA 145LA 2B75A 224LA 3C7WA 3AGHA 1D3MA 4RLNA 1A4VA 254LA 4C3WA 1LZYA 1XEIA 1JTTL 2HU3A 3FI5A 3GUKA 2B70A 2YBMA 1DYDA 1NHEA 2HECA 3AW7A 3SB5A 4GN4A 2VB1A 138LA 4LYBA 1L86A 2LYOA 2Z12A 4HTKA 3WULA 1LHLA 3A92A 1L09A 1B7OA 169LA 3TMXA 4EKPA 214LA 3RT5X 1GEVA 127LA 1LYFA 1LJGA 221LA 4ZIXA 3RU5A 1C6KA 4EPFA 2ANXA 1OUGA 5LVIA 5KY1A 1QTCA 3P65A 1C6MA 3DN6A 1B5XA 1VEDA 1WTHA 1L43A 2W1XA 2Y8PA 156LA 1LHKA 4H8XA 4DD3A 109LA 1L17A 4GCFA 4HP0A 2LYMA 3D4SA 1JJ1A 1J1PY 4LYOA 5HNCA 3E3DA 1LYSA 1GFVA 1CU3A 1PQIA 1K28A 3C7ZA 3LN2A 4YXAC 1LYHA 1LMNA 228LA 4QDNA 3CDTA 1IP5A 1QUOA 1L42A 2DQCY 1C62A 4Z3MA 1TBYA 1P2CC 4XN6A 1UA6Y 1YROA 1LYOA 1FKQA 2OU8A 4ZFPA 2MEGA 1C08C 2FBDA 4N8ZA 142LA 4NGZA 4H9FA 2CWIA 4J1AA 1CU5A 1T8FA 1YQVY 1JJ3A 3HDFA 1LYYA 1B7MA 4XJBA 1L35A 2DQEY 1LZTA 213LA 1GFRA 1C6GA 3FE0A 2B73A 225LA 3LYTA 3WW6A 4NGIA 196LA 1LJJA 1UUZC 1FLUA 1GAZA 2D4IA 4W96A 1UIDA 1L08A 4DYGA 4H9HA 1A2YC 5F14A 130LA 189LA 3WU9A 2N5ZA 1KS3A 3RW8A 147LA 4LYZA 159LA 5DL9A 3CDRA 3WL2A 3SN6R 2Z19A 102LA 5HLLA 155LA 4I7RA 3RZEA 2W1LA 5F81A 238LA 4H9IA 1C6AA 2AUBA 2ZQ3A 2G4PA 3G3VA 1LW9A 5E9RA 2BQEA 2D4KA 1IOTA 1I1ZA 1QSBA 3SB9A 4H91A 3L2XA 1EQ4A 1UC0A 1OWYA 1HF4A 1GXV2 5IDDA 1C60A 1LMOA 1P5CA 1ZMYL 139LA 1QDTA 1IWTA 3DMZA 5LYTA 1GE1A 1CX6A 4H9BA 9LYZA 3UONA 1NF5A 1QIOA 2C8OA 3DN3A 1IP6A 1C6DA 2HUMA 1L41A 2DQAA 4O34A 4RLMA 5B1GA 158LA 3WXUA 2MEBA 5L3HA 4DD1A 1C6TA 4IATA 1VDPA 1B7NA 1VDQA 1YILA 4NWEA 1WVVA 1GWDA 4NEBA 4ETDA 1LZBA 2O7AA 1L16A 4DDCA 5KXTA 1LKSA 1OVKA 3P66A 226LA 4MSTA 5LVKA 4I7SA 3NY9A 4E97A 1GFEA 1L25A 3OE9A 2WARA 1C68A 5C6JA 2B6ZA 3ULRA 1CKDA 4MR1A 3HU8A 4DAJA 261LA 2MECA 1DKJA 1KIRC 1B5VA 5LYMA 1JSEA 4RW1A 5FCPA 1DYGA 4ARMB 1BWJA 1L60A 1L84A 2OU0X 4EKQA 2MEIA 1GE4A 1SWZA 1L11A 2IGCA 1DZBX 4R6CA 5EBHA 5KXZA 4NGJA 1UIHA 1WQOA 3FI7A 1QTHA 4TUNA 3M18B 1C6CA 4KL7A 1XEJA 1IWWA 1LZ5A 1L67A 1CV4A 1L53A 191LA 1ZVYB 1JPOA 115LA 2XBSA 1AT6A 1SSWA 1AT5A 1GF4A 1LWGA 2Z38A 1GBZA 1OYUA 1LZGA 3C8RA 3HH5A 1BB3A 5I14A 1UACY 1NMMA 113LA 4IASA 3TMUA 1OV5A 1LSPA 1UCOA 1IWXA 3GXKA 4B4EA 5APDA 5LINA 1F6RA 3HH6A 3JR6A 1C43A 1P36A 1L02A 1KY1A 2ZIJA 3GUJA 2YDGA 4ARMA 1CKGA 3B0OA 1CVKA 5C6IA 2A7DA 1SX7A 1QUDA 5KXWA 1GFTA 3N9EA 1EQ5A 1L66A 4H8ZA 1H6MA 154LA 2BQJA 1BHZA 4I7QA 3WUAA 4B1AA 1XGRC 3P68A 1CNSA 3AGGG 1LMCA 3LZ2A 1LHHA 4AGAA 4NIJA 112LA 1G0MA 2FYDA 4DQ5A 1CKHA 3IJUA 3HH3A 1P2RA 3P4ZA 1YIKA 1XFPL 163LA 5I4XA 1LZNA 220LA 3C82A 2B7XA 1CJ8A 1RCMA 3HT6A 3V2YA 143LA 4YX7C 1FDLY 1JTPL 3CDOA 2DQJY 1L95A 1L49A 1BB5A 4AQNA 1QT8A 1D2WA 1JHLA 216LA 3WW5A 1KXXA 4EKSA 3T6UA 135LA 4UWUA 2LC9A 1LYJA 1QSWA 1CU6A 3G3XA 4GCDA 1L64A 3EMLA 5L3IA 1YAOA 3P64A 2HULA 4EPIA 1JQUA 1B5ZA 2OU9A 4DQ7A 4HSFA 4DD9A 3AZ4A 2YSSC 1DPXA 1L77A 3EO5A 1L10A 1JWRA 4YXCA 5A3ZA 1L74A 5T3FA 4CHXA 5DLAA 1IWVA 165LA 1DYBA 1L71A 1L99A 1F10A 4HV1A 1HMLA 1SQ2L 4OWHA 3LZTA 1L0KA 1DPWA 3FA0A 1BVKC 3W6AA 1L12A 1N4FA 3HTGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 194L A;  248L A;  2RB2 X;  3DN8 A;  2BQH A;  4DT3 A;  1QSQ A;  4LZT A;  1L36 A;  4YOP A;  1L61 A;  1LMA A;  4NSG A;  148L E;  1IWU A;  1JIY A;  1DI4 A;  1NQI A;  4HJV A;  5M1Y A;  1PQO A;  1NBZ C;  1FKV A;  1GB8 A;  1JEF A;  1IOS A;  1GB6 A;  4NWH A;  1CJ9 A;  1L75 A;  241L A;  3B0I A;  2I26 L;  1FLQ A;  145L A;  2B75 A;  224L A;  3C7W A;  3AGH A;  1D3M A;  4RLN A;  1A4V A;  254L A;  4C3W A;  1LZY A;  1XEI A;  1JTT L;  2HU3 A;  3FI5 A;  3GUK A;  2B70 A;  2YBM A;  1DYD A;  1NHE A;  2HEC A;  3AW7 A;  3SB5 A;  4GN4 A;  2VB1 A;  138L A;  4LYB A;  1L86 A;  2LYO A;  2Z12 A;  4HTK A;  3WUL A;  1LHL A;  3A92 A;  1L09 A;  1B7O A;  169L A;  3TMX A;  4EKP A;  214L A;  3RT5 X;  1GEV A;  127L A;  1LYF A;  1LJG A;  221L A;  4ZIX A;  3RU5 A;  1C6K A;  4EPF A;  2ANX A;  1OUG A;  5LVI A;  5KY1 A;  1QTC A;  3P65 A;  1C6M A;  3DN6 A;  1B5X A;  1VED A;  1WTH A;  1L43 A;  2W1X A;  2Y8P A;  156L A;  1LHK A;  4H8X A;  4DD3 A;  109L A;  1L17 A;  4GCF A;  4HP0 A;  2LYM A;  3D4S A;  1JJ1 A;  1J1P Y;  4LYO A;  5HNC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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