1L24A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l24A00
147LA 1ZYTA 1LYDA 3HTBA 3EMLA 1C6LA 232LA 2QB0B 3C83A 1QTZA 262LA 220LA 3OE8A 1KW5A 1C6TA 4LZMA 1C6FA 2B6WA 1EPYA 2HUKA 1LPYA 1OV5A 2LC9A 2OE7X 3SB7A 3SB6A 3F9LA 3K2RA 142LA 1QT4A 1DYCA 1QUDA 1P5CA 151LA 1P37A 2OTYX 1C6NA 1L75A 1L31A 104LA 249LA 155LA 1L59A 4W58A 2OTZX 1D9WA 1L48A 1C65A 2O4WA 4I7OA 1L34A 1C6GA 3QAKA 1L65A 1L92A 3F8VA 188LA 3HTGA 180LA 2RB2X 1L29A 1LYJA 158LA 1L87A 236LA 3CDVA 3HDFA 4EKQA 2RBOA 2B7XA 4LDLA 1CU2A 115LA 1C6MA 3CDQA 112LA 1CUQA 3GUJA 226LA 1QSBA 1QS9A 152LA 1L61A 162LA 161LA 243LA 1L12A 3JR6A 182LA 1L88A 123LA 139LA 1C66A 3HUKA 1CU5A 1L09A 4S0WA 1L43A 3GUIA 1DYGA 1L94A 1XEPA 172LA 107LA 1CU6A 1KY0A 1OVKA 2QARC 1G0JA 4DKLA 1L01A 246LA 1L60A 254LA 225LA 1L38A 217LA 1L13A 4ARJA 3DN8A 2OEAX 257LA 1P2LA 233LA 1DYAA 1L33A 4GBRB 1QT5A 1T97A 128LA 169LA 3HTFA 2LCBA 163LA 1SX2A 1CUPA 1C6IA 4I7LA 1LI6A 3OE0A 1L23A 223LA 148LE 2OU9A 4W54A 1LGWA 1LW9A 1K28A 171LA 4LDOA 228LA 259LA 3CDRA 1L10A 1LI3A 3HTDA 4ARPA 1L72A 1QUOA 114LA 3FI5A 3HT8A 1LLHA 1PQIA 3L64A 4IAPA 1L04A 2ANXA 1L44A 1QUHA 144LA 2IGCA 1L80A 1L64A 3OE9A 1L77A 1L95A 1QT6A 1PQMA 258LA 165LA 1JTNA 1L66A 216LA 2RB0X 4EKRA 2HULA 4W57A 2B70A 4I7PA 2CUUA 1T8AA 222LA 4EKSA 109LA 1L91A 3SB8A 1L07A 3GUMA 1C6JA 3HH5A 2B72A 3DMVA 3ODUA 1QT8A 3C8SA 1JQUA 4LDEA 4YX7C 1L28A 1L02A 185LA 1C6QA 3HT9A 3DKEX 4I7JA 1L36A 1CV4A 244LA 3GUNA 1L85A 1L0JA 1SX7A 1G0QA 1D2YA 1C6AA 131LA 196LA 189LA 1I6SA 234LA 1KY1A 143LA 1QSQA 219LA 4EXMA 1T8GA 166LA 110LA 1L46A 1L74A 209LA 241LA 3G3WA 3NY8A 1OWZA 1G07A 4I7MA 1L97A 1L03A 2O7AA 1OWYA 1QTBA 4DJHA 198LA 3RUNA 1OVHA 3SB5A 1C6EA 1CV1A 1L69A 126LA 1D3FA 1L37A 224LA 1L14A 1DYDA 2F32A 160LA 213LA 1CU3A 229LA 1L52A 2RAZX 1P46A 1C64A 253LA 146LA 137LA 1LYGA 4E97A 3C80A 1L30A 1L18A 1L25A 2B6TA 2B74A 3NYAA 1L98A 1CV3A 1B6IA 237LA 3HUQA 1LGXA 129LA 1D3JA 2O79A 3DMZA 252LA 175LA 1L56A 3DN2A 149LA 5LZMA 1ZWNA 145LA 1L42A 1L89A 150LA 183LA 4I7KA 119LA 3CDTA 1L0KA 1C63A 1L35A 261LA 3C82A 1JTMA 2OU0X 1OVJA 3DNAA 1CX7A 170LA 173LA 206LA 140LA 1L93A 3C81A 1L55A 1C6KA 4GRVA 205LA 2RBPA 231LA 3SB9A 4PK0A 108LA 2RBNA 3L2XA 1LYHA 1L58A 1G0PA 1ZURA 1QTDA 4EJ4A 1SSYA 157LA 1L41A 3HWLA 1G0LA 2NTGA 1C6DA 2B6ZA 1T6HA 125LA 214LA 4DAJA 1P6YA 2A4TA 3CDOA 4AQNA 1L39A 1QTCA 1KS3A 195LA 3DN4A 3HUAA 3HDEA 4I7QA 1OYUA 1C61A 3PDSA 2OE9X 212LA 242LA 4ARQA 1TLAA 1L96A 3LZMA 4K5YA 1QTHA 218LA 1CVKA 190LA 1L00A 2OU8A 3HH6A 1D3MA 200LA 1PQDA 2LZMA 1C6HA 3SBBC 1C6CA 1C60A 3V2YA 3G3XA 199LA 1L21A 248LA 1LYIA 1L08A 118LA 1KNIA 1LYFA 4ARQB 177LA 3C7WA 1L90A 2RH1A 1CV6A 3DN6A 1C62A 1L99A 1L63A 1DYEA 4EPIA 1C67A 1CV0A 3HT6A 3GUOA 1OV7A 1QT7A 1QTVA 1L06A 1L82A 3NY9A 2B6YA 178LA 1L11A 1SWZA 4ZPUA 1LWKA 2Q9EA 159LA 4EKPA 3RZEA 4I7TA 3SBAA 4EPFA 235LA 1L17A 1C6BA 1LWGA 1C69A 1PQKA 1L15A 102LA 2Q9DA 1PQOA 221LA 130LA 3SN6R 1L68A 4ARLA 1P64A 211LA 1D2WA 167LA 1CV5A 3VW7A 1G1VA 250LA 141LA 1L57A 1L76A 1G0KA 1L40A 201LA 1L19A 1CU0A 1L50A 1G0MA 1LGUA 1LYEA 215LA 1G0GA 1L67A 4YXAC 1SSWA 1C6PA 1LI2A 251LA 1QS5A 4W59A 4YXCA 1L45A 1KW7A 3V2WA 4I7RA 3C8QA 3HH3A 2RBRA 3GUPA 3DN0A 197LA 3OE6A 1L73A 181LA 2Z6BA 1L32A 227LA 3HH4A 239LA 120LA 1L84A 255LA 6LZMA 1PQJA 3FA0A 1L05A 2B6XA 3C7ZA 4OO9A 4ARMA 4I7SA 1CX6A 1L51A 1L16A 1L86A 2F47A 1DYFA 4W52A 3DN1A 1G06A 111LA 1CTWA 1QUGA 127LA 1L71A 3DMXA 245LA 2NTHA 4W51A 3DN3A 1L62A 1P3NA 187LA 191LA 192LA 138LA 210LA 3G3VA 2RBQA 7LZMA 1L22A 4ARMB 176LA 230LA 3HT7A 2HUMA 2ANVA 1XJTA 1L26A 113LA 3FADA 4W55A 3C7YA 1P56A 5I14A 184LA 1L83A 1DYBA 3D4SA 1L70A 2F2QA 3UONA 1L81A 1WTHA 4PJZA 3C8RA 156LA 1XJUA 247LA 1P7SA 174LA 4W56A 164LA 2RB1X 1D3NA 1L79A 1QT3A 1L49A 1C68A 260LA 103LA 1T8FA 3PBLA 240LA 3GULA 4I7NA 1SWYA 1NHBA 1L47A 186LA 256LA 3HU8A 2RAYX 3GUKA 1P2RA 1L53A 122LA 1L20A 1P36A 2B75A 2RBSA 4W53A 168LA 1L24A 2B73A 238LA 2L78A 2OE4X 3HU9A 1L27A 1L54A 1G1WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
147LA 4H9FA 1JJ1A 4WO6A 3HBHA 3LYOA 262LA 1LMTA 4NHTA 5LVGA 2YBHA 1GE3A 2MEAA 2I26L 1LJFA 1LPYA 4PGJB 1GHLA 2EQLA 3K2RA 1QUDA 151LA 2OTYX 4DD9A 2BAAA 1WQRA 4NGIA 1GF6A 1C65A 4I7OA 4IATA 1L34A 1C6GA 4NGLA 1UIEA 1L92A 5KXNA 1LYJA 3CDVA 2RBOA 207LA 1TCYA 2G4PA 115LA 112LA 1CUQA 4LYTA 5F9UA 3TMXA 1QS9A 1YKYX 5B1FA 1GDWA 123LA 4H93A 3WMKA 1GF0A 3HUKA 4IASA 3CB7A 1CU5A 3AZ5A 5HMJA 1L43A 1LSPA 3A3QA 1GBWA 1L94A 1XEPA 1HHLA 1LCNA 107LA 1KY0A 3A3RX 1KIQC 225LA 4OWHA 1L38A 217LA 2HEEA 1OUJA 3DN8A 1DYAA 2BQBA 4WLDA 4GBRB 1T97A 169LA 1GFHA 1YL0X 1LZDA 2LCBA 4D9ZA 163LA 1CUPA 1LMPA 223LA 148LE 2XBRA 4OWEA 6LYTA 4H9EA 4N0JA 171LA 4LDOA 2AUBA 5KXWA 1LZYA 1JTOL 3CDRA 1L10A 4YF2A 5ILFA 5C6LA 1ZVYB 4IAPA 1L04A 3ZVQB 4I8SA 4W94A 4KT3A 3A34A 1FLWA 1L80A 3EO5A 3WUAA 4HTQA 4FJRA 1FN5A 1LZ4A 2HULA 4W57A 1GF5A 1J1XY 1T8AA 222LA 1LMNA 1RE2A 1UIHA 4H91A 3SB8A 4LFXA 3HH5A 3WUNA 1XFPL 5FHWA 4WMGA 1LSDA 1IP5A 1L02A 185LA 2HECA 5APCA 3DKEX 1JPOA 1L85A 4AXTA 1LKSA 4DYGA 1B0DA 1HEMA 1I6SA 1UACY 5KXXA 4DDBA 1QSQA 2HU3A 4GCDA 1IOCA 5L3HA 4PPOA 3WXTA 166LA 1L74A 1WTMA 193LA 5IHGA 4RW2A 1OWZA 4DQ7A 1LHMA 4I7MA 3WU8A 2O7AA 3CQLA 4DJHA 198LA 2YBIA 4W96A 4LYZA 1D3FA 224LA 1L14A 1LJNA 2F32A 1LZ8A 160LA 2F2NA 229LA 4ML7A 1P46A 2LZ2A 1DXJA 1GPQC 4E97A 1CKCA 4DT3A 1LHIA 1CV3A 1L98A 237LA 3HUQA 3AGHA 129LA 1FDLY 3P68A 1CKFA 1VFBC 4WM5A 1L56A 1L89A 3SP3A 4I7KA 7LYZA 1IO5A 2YBLA 4TUNA 2DQFC 2LZTA 4HPIA 5KXSA 3C82A 2OU0X 4RW1A 1CX7A 2BQHA 5IDDA 4XJIA 5ILCA 3EMSA 2VB1A 3A90A 2RBPA 231LA 8LYZA 1HERA 5L9JA 1GB2A 3WPLA 4TWSA 1G0LA 2B6ZA 1T6HA 4MCKA 4DAJA 1P6YA 2BQEA 1L39A 3TXEA 195LA 3HDEA 5FSTA 1A2YC 2W1LA 4I7QA 2W1MA 1OYUA 3PDSA 212LA 4ARQA 4HTKA 3A92A 218LA 1CVKA 1L00A 4WL7A 133LA 200LA 1LYSA 1DI4A 3SBBC 1GB3A 1QUSA 1UCOA 3K3TA 3V2YA 5DN5A 199LA 1LYIA 5B06A 1L08A 118LA 1WVUA 4H92A 2RH1A 1CV6A 3DN6A 1C43A 1C62A 1NWGA 1DYEA 4XADA 2XTHA 1IC5Y 3HT6A 5KXPA 1OV7A 2F4AA 1QT7A 1L06A 4MR1A 2B6YA 2BQKA 2Q9EA 2ZQ4A 159LA 3P66A 4I7TA 5C6JA 1L17A 1C69A 1OUGA 2H9JA 2Q9DA 211LA 3WW6A 2BLXA 167LA 1HMKA 2MEBA 1BWIA 1OUHA 5KXYA 1L57A 1DKJA 4NGOA 201LA 4WM1A 1GAYA 4O34A 4CGEA 1QS5A 1UIBA 4H1PA 1KW7A 4HV2A 3V2WA 5KXMA 197LA 1LJIA 1B5WA 1IOTA 181LA 1EL1A 1YL1X 5C6IA 3TXKA 3FA0A 4EMNA 1SQ2L 2LHMA 1JHLA 4OO9A 4UWVA 4N9RA 4CHXA 1CX6A 1KXWA 5KJ9A 4BAFA 4LFPA 2FYCA 1L51A 1L16A 1L86A 1DYFA 1CKDA 4W52A 3DN1A 1WQNA 1VATA 4GCCA 3DMXA 2NTHA 3DN3A 1L62A 1GB0A 191LA 1Z55A 3G3VA 2RBQA 5A3EA 1GD6A 230LA 1IR8A 3CSZA 1AM7A 3C7YA 4GLAA 2D4JA 1DYBA 2CDSA 1GFRA 2F2QA 4N1EI 3TMVA 3C8RA 5J7CA 5I5QA 174LA 1BWJA 1HEOA 164LA 1L79A 4N5RA 260LA 3GULA 4XENA 1L47A 1XEJA 1OQMA 5KKJA 1GFJA 4G49A 1P2RA 3P4ZA 1L53A 1L20A 1P36A 2RBSA 2B73A 2L78A 4DQJA 5M1YA 1E8LA 1LZ6A 1L27A 3W6AA 1GB8A 1L54A 4YOPA 232LA 2QB0B 4I0CA 1UIDA 5APEA 1EPYA 2OE7X 3SB6A 2GV0A 142LA 1RJCB 2BLYA 1IR9A 1DQJC 1P37A 5DLAA 1DI3A 2MECA 104LA 249LA 5HQ1A 1OUDA 1D9WA 5LVIA 2RSCA 1IWWA 4NGYA 1LZ1A 2RB2X 3J4GA 1GFAA 1LHKA 3HDFA 5HMVA 4EKQA 1LHHA 1JKAA 2IHLA 1ZMYL 3GUJA 226LA 4H8YA 3RU5A 1QSBA 152LA 1INUA 161LA 4XJBA 4QGZA 1NQIA 1QUTA 3JR6A 4HPEA 1CNSA 139LA 1BB6A 1C66A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 147L A;  4H9F A;  1JJ1 A;  4WO6 A;  3HBH A;  3LYO A;  262L A;  1LMT A;  4NHT A;  5LVG A;  2YBH A;  1GE3 A;  2MEA A;  2I26 L;  1LJF A;  1LPY A;  4PGJ B;  1GHL A;  2EQL A;  3K2R A;  1QUD A;  151L A;  2OTY X;  4DD9 A;  2BAA A;  1WQR A;  4NGI A;  1GF6 A;  1C65 A;  4I7O A;  4IAT A;  1L34 A;  1C6G A;  4NGL A;  1UIE A;  1L92 A;  5KXN A;  1LYJ A;  3CDV A;  2RBO A;  207L A;  1TCY A;  2G4P A;  115L A;  112L A;  1CUQ A;  4LYT A;  5F9U A;  3TMX A;  1QS9 A;  1YKY X;  5B1F A;  1GDW A;  123L A;  4H93 A;  3WMK A;  1GF0 A;  3HUK A;  4IAS A;  3CB7 A;  1CU5 A;  3AZ5 A;  5HMJ A;  1L43 A;  1LSP A;  3A3Q A;  1GBW A;  1L94 A;  1XEP A;  1HHL A;  1LCN A;  107L A;  1KY0 A;  3A3R X;  1KIQ C;  225L A;  4OWH A;  1L38 A;  217L A;  2HEE A;  1OUJ A;  3DN8 A;  1DYA A;  2BQB A;  4WLD A;  4GBR B;  1T97 A;  169L A;  1GFH A;  1YL0 X;  1LZD A;  2LCB A;  4D9Z A;  163L A;  1CUP A;  1LMP A;  223L A;  148L E;  2XBR A;  4OWE A;  6LYT A;  4H9E A;  4N0J A;  171L A;  4LDO A;  2AUB A;  5KXW A;  1LZY A;  1JTO L;  3CDR A;  1L10 A;  4YF2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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