1L34A

High-resolution structure of the temperature-sensitive mutant of phage lysozyme, arg 96 (right arrow) his
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title High-resolution structure of the temperature-sensitive mutant of phage lysozyme, Arg 96----His.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l34A00
4ARMA 1L51A 4I7PA 170LA 4GRVA 233LA 3PDSA 224LA 1L06A 1LGWA 155LA 1L30A 104LA 225LA 3SBBC 3HDFA 1PQOA 4LDLA 185LA 4OO9A 1L73A 1L39A 1LW9A 3VW7A 147LA 1L21A 1C67A 221LA 120LA 162LA 1L59A 1P56A 1G0JA 228LA 3HU8A 1L41A 3JR6A 3NY9A 1L02A 2OTZX 146LA 4W57A 1C6QA 2RAZX 1L46A 6LZMA 1L63A 1L52A 1L92A 3HH6A 1KY1A 1L60A 1L19A 1C69A 4AQNA 1DYCA 2OE4X 3QAKA 192LA 1D9WA 4LDOA 1L11A 1LI3A 1G1WA 1L95A 1PQDA 2LCBA 4ARQB 2B73A 1G0MA 1L89A 213LA 166LA 3HU9A 172LA 4EKPA 1OWYA 115LA 2O7AA 1DYEA 205LA 1KY0A 1L01A 1L72A 1CU5A 184LA 1L77A 2F2QA 1JTMA 4W54A 1L0KA 1QT8A 1L71A 1P36A 3SB5A 173LA 1L76A 3GULA 1CU0A 1L57A 3EMLA 215LA 3DN8A 1CV5A 3RZEA 1G07A 2OU9A 1PQMA 1DYDA 1L35A 1L38A 245LA 2LZMA 3G3WA 5LZMA 3SN6R 3DN0A 3C83A 2QARC 1QT4A 4DKLA 1C6KA 2RBSA 1CUPA 2B70A 1L33A 1L27A 2B6ZA 2B72A 145LA 4PK0A 1L81A 212LA 1P2RA 3HH5A 1P3NA 1L67A 1L96A 191LA 4I7OA 4I7RA 1L87A 252LA 1DYFA 4ARLA 2F47A 3C8SA 1L66A 1LI2A 1C6FA 241LA 3HUAA 165LA 196LA 2B6WA 1C6LA 1C6DA 1L82A 1CU3A 3FI5A 1L79A 3CDOA 2RBQA 1LPYA 4EKRA 1L65A 257LA 4GBRB 4W56A 2RBPA 1L17A 151LA 1T97A 2HULA 1D3MA 1LYFA 2RAYX 1T8FA 1C6JA 1L29A 235LA 4DJHA 1L62A 1P6YA 4YX7C 3DNAA 1CX7A 1LI6A 1QT5A 2OEAX 119LA 1L16A 149LA 1L08A 1L99A 1OYUA 1OV7A 1QT3A 2B74A 4ARPA 7LZMA 2B75A 159LA 1L74A 256LA 3L64A 1QT7A 211LA 177LA 3C7YA 249LA 3HTGA 1L31A 3C7ZA 3HUQA 3ODUA 1C60A 1PQKA 1ZYTA 3DN2A 3F8VA 3V2YA 4EKQA 1L56A 142LA 200LA 1QUGA 220LA 2IGCA 219LA 2Q9EA 4ARMB 242LA 1DYGA 4YXAC 195LA 2Q9DA 148LE 1CU6A 1QUHA 223LA 3SB9A 3SB6A 3GUNA 1C62A 1L75A 152LA 3HT6A 1G0QA 4I7MA 244LA 3GUJA 160LA 1OWZA 227LA 1L98A 1TLAA 253LA 3OE6A 1KNIA 3HDEA 2F32A 3HUKA 234LA 1L26A 229LA 3DKEX 1G0LA 122LA 1C6AA 1L04A 210LA 254LA 2CUUA 4W52A 2O4WA 150LA 1C6MA 1OV5A 3HT7A 1L25A 3C8RA 1OVKA 1QTVA 1LWKA 246LA 4I7SA 2RBOA 197LA 238LA 1CX6A 1L69A 1L14A 3C81A 255LA 1L61A 1L50A 107LA 1L88A 1L54A 258LA 3RUNA 1QT6A 2RH1A 129LA 1P46A 3CDRA 3DMZA 3DN6A 260LA 1L97A 175LA 3GUKA 1C6PA 1QUOA 114LA 1QTZA 141LA 190LA 237LA 1KS3A 3FA0A 1LYGA 1QS9A 1P64A 1L23A 138LA 1CV3A 112LA 161LA 1L43A 1SX7A 2A4TA 1L84A 2ANXA 3DMXA 3DN3A 218LA 1CV4A 3C80A 1JQUA 4I7LA 131LA 1DYAA 125LA 158LA 2NTGA 1L49A 1C6HA 2L78A 4ARJA 1LYIA 1L20A 3UONA 1L00A 1P5CA 182LA 1C61A 262LA 3C8QA 3OE8A 1I6SA 4ZPUA 3PBLA 4I7NA 3HTFA 1WTHA 4EPFA 3C82A 4YXCA 1P7SA 2RB0X 1L48A 1C6EA 2OE7X 1G0GA 1D2WA 4I7JA 198LA 1L93A 1CTWA 1L10A 108LA 2HUMA 4I7KA 1C64A 1L0JA 3CDTA 1OVJA 1T8AA 3HWLA 3OE9A 1NHBA 1LWGA 4LDEA 3DN4A 1C6BA 2HUKA 2OU8A 140LA 168LA 2B6YA 1LYEA 1OVHA 1L22A 232LA 1CU2A 3C7WA 1QTBA 178LA 3LZMA 1L24A 209LA 1L42A 1L86A 1CVKA 1L15A 2RBNA 189LA 1LYJA 3CDVA 216LA 186LA 1L12A 214LA 261LA 1PQIA 143LA 4W59A 1QSBA 4E97A 1XJTA 248LA 4EKSA 1L64A 144LA 3K2RA 1C6IA 2ANVA 247LA 1L18A 1JTNA 1L90A 130LA 180LA 1L83A 110LA 1LGXA 1EPYA 226LA 250LA 3GUIA 1C68A 1CUQA 1L44A 1C6CA 3D4SA 2B6TA 2OTYX 1B6IA 3NY8A 1C63A 1G1VA 1C6NA 1DYBA 1L32A 251LA 2OE9X 1XEPA 240LA 4PJZA 222LA 3HT9A 2NTHA 1QSQA 3GUPA 1CV0A 1T6HA 1KW7A 3L2XA 1L03A 1L68A 1D3FA 1L47A 118LA 1KW5A 1L94A 3V2WA 1LLHA 1G0KA 1LGUA 123LA 1SSWA 4ARQA 1QTDA 1L13A 1P37A 1SX2A 4IAPA 1SWZA 206LA 171LA 1ZWNA 4LZMA 187LA 3G3VA 4EXMA 1PQJA 163LA 127LA 1C66A 4W55A 2QB0B 111LA 164LA 3HH3A 230LA 4I7TA 1L34A 1LYDA 236LA 199LA 1L58A 3GUMA 2B6XA 1L07A 174LA 231LA 2O79A 3DN1A 128LA 3HT8A 243LA 4EPIA 1XJUA 1LYHA 1CV1A 139LA 1L37A 239LA 1C65A 1T8GA 3SBAA 113LA 169LA 4I7QA 259LA 4W51A 1L85A 1G0PA 1C6GA 3HTBA 3G3XA 201LA 1L91A 3NYAA 2RBRA 4W58A 188LA 1L70A 156LA 1L05A 1L80A 4EJ4A 4K5YA 109LA 3DMVA 1QS5A 176LA 5I14A 2RB2X 1CV6A 102LA 1L28A 1L36A 1C6TA 103LA 4DAJA 3GUOA 4W53A 137LA 1D3JA 3OE0A 1L45A 157LA 2LC9A 2RB1X 1QUDA 1L55A 1K28A 3HTDA 217LA 1P2LA 2Z6BA 183LA 1L53A 1SWYA 1G06A 2OU0X 3CDQA 1L09A 1D2YA 1ZURA 3SB8A 126LA 3SB7A 2B7XA 167LA 1D3NA 181LA 3F9LA 3FADA 3HH4A 1SSYA 1L40A 1QTHA 4S0WA 1QTCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L51A 4GRVA 233LA 3A6BY 4NGOA 224LA 1L06A 2H9KA 4N9RA 1L39A 1LZ8A 4OWBA 4G49A 1LSNA 5I4XA 3JR6A 2OTZX 5F9UA 1LZ6A 1LSEA 4WO9A 1AT6A 5APDA 2BQGA 2RAZX 1L46A 4NSJA 1L92A 5LVKA 1HSWA 2YBLA 1HNLA 3QAKA 1NBYC 1AZFA 2BLXA 4NG1A 2G4PA 4DD3A 1QDRA 4WG1A 1DYEA 4WM6A 3A3QA 4A7DA 2YBIA 2F2QA 1JTMA 1GFJA 4W54A 1VFBC 2CJLA 1KIQC 1GB0A 1WQMA 1P36A 3A6CY 3SB5A 3GULA 4RLMA 2XJWA 215LA 4LYTA 1IP4A 1O23A 1GE4A 1G07A 2OU9A 1L35A 1UIDA 1YQVY 2ZIJA 1LZGA 4OOOA 1EQ4A 5HMJA 5L3HA 1LSYA 5KXYA 1IC5Y 212LA 4I7OA 1GB8A 2H5ZA 4ARLA 2YSSC 3HUAA 165LA 1RJCB 4Z41A 2B6WA 1ZVHL 4BADA 1CU3A 2W1LA 5APEA 1L65A 5HLLA 257LA 1BB6A 5D5FA 3B0KA 5IDDA 4M4OA 151LA 1T97A 2HULA 1DKJA 1LZYA 1L62A 4YEMA 3DNAA 1NQIA 4QGZA 2D4JA 1HEPA 1VDPA 1YL1X 4ARPA 1NDGC 4DQ5A 1IP3A 1L74A 1LZTA 1QT7A 5LVJA 1LHKA 3HTGA 3WVYA 3ODUA 3A93A 4II8A 3DN2A 1GBXA 1GFRA 1VEDA 1EQ5A 142LA 1QUGA 1XGRC 2IGCA 219LA 1GEZA 3LYZA 1LZAA 5KXPA 5FCPA 2BLYA 2Q9DA 1FLUA 1C62A 1B2KA 5I54A 1GF9A 1I1ZA 1VAUA 1GF8A 3WULA 5LVGA 3OE6A 2Z38A 4XJIA 1KNIA 1UC0A 2YBNA 3DKEX 1IO5A 1G0LA 4BS7A 4W52A 150LA 2CDSA 1NDMC 4WL7A 3T36A 1IY4A 246LA 2RBOA 238LA 3AZ4A 1F10A 1L14A 4GCFA 1XGQC 1L61A 4ANRA 107LA 4Z46A 4GLVA 175LA 3P68A 5L3IA 1IR8A 5HMVA 1QTZA 3W6AA 4G4BA 141LA 237LA 1LSCA 1LJNA 1GDWA 1QS9A 1P64A 2Z2EA 4FJRA 4HPEA 161LA 3ZVQB 1YL0X 2W1YA 1B7QA 1NMMA 208LA 1BWJA 4OWAA 3LYOA 134LA 5KXWA 1JTTL 4ARJA 3UONA 4TSBA 1YKYX 1GHLA 1F6RA 4N0JA 1V7SA 1LKRA 4I7NA 3HTFA 4YXCA 1P7SA 4H9HA 198LA 4FDYA 4I7JA 1JJ0A 1L93A 4GCBA 2BQIA 1CTWA 1LJKA 4I7KA 2I25L 3HWLA 4LDEA 3DN4A 1C6BA 3OJPA 132LA 1LYOA 2Z39A 3QNGA 1JSEA 1IP6A 168LA 2HEEA 1CU2A 1HFYA 3C7WA 1QTBA 1L42A 4CGEA 4IASA 216LA 186LA 1L12A 4QDNA 1QSBA 4H9BA 3AW6A 5I5QA 4X3BA 5T3FA 1OP9B 1L18A 1JTNA 1L83A 1LYYA 3LZ2A 4H9EA 1C6CA 3D3DA 1B0DA 1GE1A 1G1VA 1C6NA 1BB3A 4HPIA 1L32A 251LA 2OE9X 1XEPA 3WYHA 4NGVA 4ET8A 1FLWA 1QSQA 5KXOA 3WPJA 1T6HA 4NGYA 3V2WA 1SSWA 1BHZA 3F6ZA 4CFPA 1OUEA 1C45A 206LA 4LZMA 187LA 3G3VA 163LA 2QB0B 111LA 1YAPA 3M18B 5F14A 164LA 4I7TA 1QTKA 2XBSA 2B6XA 3GXKA 174LA 4AGAA 3DN1A 4LYZA 1NBZC 1QSWA 1GF0A 1CV1A 3SBAA 2HEFA 1LMQA 4RLNA 1GAYA 1D0LA 1UUZC 3ATNA 3B0OA 1GDXA 4DDBA 1LSBA 4CHXA 4J0LA 1B7NA 1YAOA 3HTBA 3W6FA 1L91A 2C8OA 4LYOA 1J1OY 2H9JA 156LA 1L05A 2LYOA 1HENA 4DT3A 4K5YA 1EL1A 109LA 1VATA 3DMVA 1BB5A 4TUNA 1IC7Y 1LZ5A 102LA 1LSFA 4WM3A 103LA 1MLCE 1D0MA 1QTEA 4H8YA 3CT5A 1V7TA 1D3JA 3OE0A 1L45A 1HEOA 3HTDA 4WOAA 4G4CA 1DKKA 217LA 1GFTA 2Z6BA 1MELL 1G06A 5B06A 3CDQA 1FDLY 3AW7A 2FYCA 167LA 3FADA 3HH4A 3WW5A 4H9FA 1QTCA 4LGKA 4ARMA 4WM2A 3N9CA 2MECA 104LA 3A67Y 3HDFA 4LDLA 185LA 3G3BB 9LYZA 221LA 1UACY 162LA 1VDTA 1L59A 4LFPA 1P56A 228LA 4DDCA 4J1AA 1CKGA 2N5ZA 4N1CC 5LA8A 2XBRA 4I8SA 4GN5C 5FHWA 2Z18A 1L63A 1L52A 3TXDA 1B5WA 2CWIA 2ZILA 1GEVA 4CJ2A 1D9WA 1L11A 1G1WA 1LHMA 1L95A 1PQDA 2MEBA 2B73A 1DZBX 213LA 1BB4A 3TXKA 1IOQA 172LA 3HU9A 4DD1A 4KT3A 2O7AA 1D9UA 4HJZA 5LAGA 1JJ1A 4DC4A 1JIYA 1QT8A 1LJJA 1L71A 3EMSA 1ZV5L 1UCOA 1L76A 1UICA 2C8PA 1CU0A 4DQJA 2I26L 3AZ7A 1DYDA 1L38A 4XJGA 3G3WA 4LT2A 4UWUA 3A94A 1IOCA 2QARC 1GB3A 2EKSC 4GLAA 1CUPA 1OUFA 1L33A 2B6ZA 2B72A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L51 A;  4GRV A;  233L A;  3A6B Y;  4NGO A;  224L A;  1L06 A;  2H9K A;  4N9R A;  1L39 A;  1LZ8 A;  4OWB A;  4G49 A;  1LSN A;  5I4X A;  3JR6 A;  2OTZ X;  5F9U A;  1LZ6 A;  1LSE A;  4WO9 A;  1AT6 A;  5APD A;  2BQG A;  2RAZ X;  1L46 A;  4NSJ A;  1L92 A;  5LVK A;  1HSW A;  2YBL A;  1HNL A;  3QAK A;  1NBY C;  1AZF A;  2BLX A;  4NG1 A;  2G4P A;  4DD3 A;  1QDR A;  4WG1 A;  1DYE A;  4WM6 A;  3A3Q A;  4A7D A;  2YBI A;  2F2Q A;  1JTM A;  1GFJ A;  4W54 A;  1VFB C;  2CJL A;  1KIQ C;  1GB0 A;  1WQM A;  1P36 A;  3A6C Y;  3SB5 A;  3GUL A;  4RLM A;  2XJW A;  215L A;  4LYT A;  1IP4 A;  1O23 A;  1GE4 A;  1G07 A;  2OU9 A;  1L35 A;  1UID A;  1YQV Y;  2ZIJ A;  1LZG A;  4OOO A;  1EQ4 A;  5HMJ A;  5L3H A;  1LSY A;  5KXY A;  1IC5 Y;  212L A;  4I7O A;  1GB8 A;  2H5Z A;  4ARL A;  2YSS C;  3HUA A;  165L A;  1RJC B;  4Z41 A;  2B6W A;  1ZVH L;  4BAD A;  1CU3 A;  2W1L A;  5APE A;  1L65 A;  5HLL A;  257L A;  1BB6 A;  5D5F A;  3B0K A;  5IDD A;  4M4O A;  151L A;  1T97 A;  2HUL A;  1DKJ A;  1LZY A;  1L62 A;  4YEM A;  3DNA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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