The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
122
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structure length |
112
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Chain Sequence |
NNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PLASMINOGEN
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase activator
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
112
|
| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1C4P A; 1BML C; 1L4D B; 1QQR A; 1L4Z B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GMI C; 2W82 A; 4HK2 A; 3ZRF A; 4E74 A; 1IUE A; 1I4H A; 1WWT A; 3HM6 X; 4FAD A; 3MHZ A; 2CJO A; 3DCG A; 2PVG C; 4M02 A; 1YQ4 B; 3I57 A; 2BF8 B; 5H8Y E; 3QA8 A; 2J52 A; 1AYF A; 1RWS A; 1JCK B; 4IM2 A; 3BVG A; 4BFR A; 1ZP0 B; 1YX6 B; 2IDY A; 4HEA 1; 2WS3 B; 1HTO A; 1WXA A; 5I4D A; 2WXL A; 1E10 A; 3IVF A; 2J0M A; 1SBB B; 2JRH A; 2FIF A; 4JLC A; 1FM0 D; 3AE4 B; 5CX3 A; 4FN2 A; 1HEZ E; 2MJD A; 5HFY A; 5BMG A; 3K9P B; 3VR9 B; 4AQ7 A; 4WWN A; 5DPR A; 3RNE C; 4C7Y A; 3CSF A; 5JHB A; 1BML C; 1L5P A; 2INN E; 3RZW C; 2MH7 A; 2M19 A; 5E6O A; 4C4V A; 2RMM A; 1C4A A; 4KKI A; 2CS4 A; 1FNW A; 1WY8 A; 1EF5 A; 2N9P C; 3R7Q A; 3PZD A; 1B9R A; 1JQ4 A; 4RGM A; 1V5T A; 1STE A; 2KXJ A; 1QOA A; 2O6V A; 3T8M A; 3P2B A; 4G3X B; 1CK1 A; 4YTN B; 4L1B A; 3PS6 A; 1K50 A; 3SFE B; 4GB9 A; 3R3M A; 2KQ4 X; 3PO0 A; 2KK8 A; 4WJP A; 2QIE B; 2KFK A; 1SSN A; 1NI2 A; 3PRE A; 3KUZ A; 3WAM A; 2KVZ A; 1A5R A; 4FJV B; 1JRU A; 3N9Y C; 3ENE A; 4LNK A; 5LXH A; 2N0S B; 1J7A A; 3S2A A; 2AQ1 B; 2D3C A; 1VCB A; 1IPG A; 1L0Y B; 2MWS B; 3V05 A; 4ANU A; 2MJ3 A; 4BZA A; 5EE0 A; 2PKO A; 1E6E B; 1T3Q A; 2KDF B; 3EFU A; 2W55 A; 2LVP A; 1K8R B; 2R2O A; 3BK2 A; 3DBL B; 2UU7 A; 2B3A A; 3VUW A; 1FO4 A; 3TEZ A; 4GMV A; 3W1S A; 2GLS A; 5D2M B; 3UIN B; 2DAF A; 2VZK D; 1MPE A; 2Y3A A; 2FCQ A; 2CR5 A; 2DAJ A; 4DXG A; 1ZDX A; 3Q3J A; 3DVG Y; 4HKZ E; 4OVZ A; 2GRI A; 1S1Q B; 2CHZ A; 2WU5 B; 3PSE B; 4LLG M; 4P16 A; 4KZ0 A; 4YTP B; 1F0Z A; 4LCD E; 2JZZ A; 2IY1 B; 1ZGU B; 3DBR I; 1DYQ A; 1EF1 A; 2MQJ A; 1MJD A; 2L83 A; 2VZK B; 3NUH B; 2QJL A; 4MDK E; 3Q8B A; 3A9K A; 1E8X A; 2BS3 B; 1R7S A; 1P98 A; 2WX1 A; 1TJE A; 5HG2 A; 3QIJ A; 5DPT A; 1DOY A; 4GLS C; 4IM3 A; 4XWT A; 2LUE A; 1F2R I; 2BWF A; 3L16 A; 2LGS A; 1UBQ A; 4YSZ B; 5C1Z A; 3QAR A; 2J0K A; 3TEX A; 1I4G A; 2DZJ A; 4DXA B; 1XO3 A; 2LJ5 A; 3VXW A; 3PZ7 A; 1PYW D; 1F77 A; 1V6E A; 2KMC A; 3KW5 B; 4ICV A; 2LGD A; 2K6D B; 1WSP A; 3VTW A; 1XEE A; 2PEA A; 3UIO B; 3DQV A; 2BT6 A; 1ZPS A; 4A8X C; 2DYO A; 4LNI A; 2IO1 B; 3KYC D; 3ZXR A; 3APC A; 1SJH D; 2JZP A; 4AJY B; 2GBM A; 4DK5 A; 2WLB A; 3EA6 A; 2CU1 A; 4XDD A; 2G4S A; 3A1Q B; 4URK A; 4M8N A; 4FLH A; 2IND C; 1J8C A; 2MEK A; 1F52 A; 1C4C A; 1YJJ A; 4BOS C; 1WGK A; 1WYG A; 2J7Q B; 1HZ6 A; 1RAX A; 3VH4 B; 1H4R A; 4KKJ A; 5J2R A; 1V81 A; 4M01 A; 2CJN A; 5G5H A; 1WR6 E; 1CZP A; 1Q1O A; 2X8X X; 1KLV A; 2GBN A; 4ZOH C; 3W5U B; 1WJN A; 1ZXH A; 2PTL A; 3UI3 A; 5IKC M; 2V9H A; 4RCO A; 2BVC A; 2D10 A; 1UF0 A; 2K8B A; 2XN9 C; 5L83 A; 3ECI A; 4FHJ A; 1IGC A; 2D5G A; 1V5O A; 3AV8 A; 2N7D A; 3Q8E A; 2L3Z A; 3QHT A; 4N58 A; 3IHP C; 3Q14 C; 3W2D A; 5TR5 A; 2ZVN A; 2O2V B; 2IGG A; 4GOC A; 3U4E G; 3NZ3 A; 3NS1 A; 1L0X B; 4GXB A; 2MA9 B; 1AWD A; 2LVQ A; 1NBF C; 2WYQ A; 4II3 B; 4GDL B; 4I6L B; 1I35 A; 1GOZ A; 1WGD A; 2XEW A; 4AP4 C; 4RGN A; 4ZRK A; 4AUQ C; 4DDI D; 1SF0 A; 1WX9 A; 4HPM B; 1XD3 B; 5MPO A; 2M0A A; 2PIA A; 1J19 A; 4W9K A; 3ZUN A; 4KGR A; 1ZKH A; 2IJ0 A; 5FR3 A; 1WJ4 A; 2SEB D; 1KJT A; 2WGS A; 4EZL A; 2KHW B; 1J0G A; 1V49 A; 1FXI A; 5GMV A; 5AZH A; 1JAL A; 4YSY B; 3IG3 A; 2FCS A; 1EO6 A; 4ARI A; 3P63 A; 2MX2 A; 1V86 A; 3BWU D; 3EGR A; 1FRR A; 3TBL D; 2DZI A; 1QF6 A; 4OVU A; 2D3G A; 1GC6 A; 4MGI E; 2M4N A; 1KF6 B; 3RNB C; 1SXT A; 2YEP F; 1FNU A; 2CU3 A; 3R7R A; 3A4R A; 1YN3 A; 3EEC A; 2XK5 B; 3EUB 2; 3ZDM C; 5DCN A; 4I6N B; 3MJW A; 3QC8 B; 4OZC A; 4B6W A; 3H1U A; 3OWE B; 1R4M I; 3MHS D; 3Q8A A; 3T3O A; 3SU8 X; 2JX5 A; 4IKG A; 3L17 A; 4ZDV A; 2PPH A; 5KHQ A; 3TCA A; 3D32 A; 3H9D A; 2L1A A; 3NY5 A; 4IC7 B; 2D2Q A; 1MFW A; 2XNA C; 5EE9 A; 2GBK A; 2INC C; 1I4R A; 4S17 A; 2EMT A; 1T0R C; 3FIL A; 1DOX A; 1SB3 C; 2KAC A; 3O65 B; 2DBY A; 2N9E B; 4G0N B; 4TKN A; 3ZKJ C; 3DVN U; 4YSX B; 3ML9 A; 2ICI A; 2OJW A; 1UGM A; 1AW7 A; 2H88 B; 2MJE A; 4EUT A; 2BBC A; 1SIJ A; 3R8B A; 2NBU A; 4OZA A; 1P7F A; 2DZK A; 1GNU A; 1FIQ A; 3RPF C; 2MRP A; 4YWG G; 2VH1 A; 4KSL C; 1IBX A; 2WXF A; 4GDK B; 4NQL B; 1YOV B; 4JIO U; 3LXF A; 1J7B A; 2BYE A; 3I5J C; 1UEL A; 2Z8L A; 2QEJ C; 4PK1 A; 3MFG A; 4ZRQ A; 1I7H A; 2NBW B; 1GAQ B; 3QAQ A; 4JWS C; 4IDI A; 2HJ1 A; 2MBE A; 1L0V B; 1T0S C; 3ZNI D; 3R66 C; 2ZZP B; 3MC0 B; 2UWQ A; 4MEM A; 2KJH B; 4ANX A; 1WFY A; 1YIW A; 3EFC A; 1ENF A; 3OG5 A; 2GOW A; 3TEW A; 2X38 A; 1TY0 A; 1RYJ A; 4P1B C; 3PLU A; 2Z0E B; 5D6J B; 2YVC A; 3VUY A; 3WAO A; 1KLU D; 3ZLZ A; 4KGT A; 2BS2 B; 1FXA A; 3ALB A; 4F1S A; 2V3N A; 4HPP A; 3AE2 B; 3ZDT A; 2KD0 A; 5DPW A; 1D3Z A; 4PS8 A; 3U7D A; 1WGG A; 1L6V A; 2JVC A; 1ZOY B; 4PS7 A; 3Q6B A; 3IFW B; 2REX A; 2K39 A; 3N1Z C; 2KTR B; 2ZEQ A; 1V1P B; 1DGJ A; 2CHW A; 1HZ5 A; 4US9 A; 4JL9 A; 4M0W B; 1HA5 A; 2DYB A; 1E8Y A; 3TMP B; 2N9L A; 1FEH A; 4HKQ A; 1SE3 A; 4XDC A; 1WMH B; 1MG4 A; 2LHD A; 1OQR A; 3NVV A; 4K3B A; 4DXF A; 4K3C A; 1F2R C; 2C7N B; 3DBR B; 4XE0 A; 3RNF C; 1WXM A; 2HTM E; 2DNF A; 2ZNV C; 4EE2 A; 3DDC B; 5LLI A; 4KVG B; 2G1E A; 4LJO B; 1XT9 B; 3KLS X; 1XXG A; 1PUT A; 4YTM B; 2MBO A; 3P4P B; 1IGD A; 4WH4 A; 2LWP A; 1N5W A; 3Q2A C; 2PLP A; 4IWP A; 4CHK A; 4YXD B; 2ZVO A; 3B08 A; 2ZNV B; 2LMC A; 2FID A; 5D7G A; 2L00 B; 3UIP B; 3I9V 1; 4ASW C; 4ZRI A; 4B0E A; 4HJG E; 1EWC A; 4PYU A; 1T0Y A; 1WRI A; 4JPS A; 2D3B A; 4XYC A; 3U30 A; 4EEW A; 2BPS A; 4G50 A; 4IM0 A; 1AAR A; 1JWM D; 5C2T B; 2O6V D; 1C9F A; 4N9F 4; 4ICU A; 3PHW B; 3UQB A; 3VRB B; 4ZHO A; 4CQN A; 1N62 A; 3RNC C; 2H89 B; 1YN4 A; 1VR9 A; 2IYD B; 4NJ7 A; 3RD2 A; 2G9H D; 1C3T A; 3ETR A; 4C4V B; 2A4Z A; 2EMS A; 2WDQ B; 3DHI C; 2GBJ A; 1EU4 A; 4R3D A; 1L7Y A; 4GGQ A; 2L76 A; 1FMA D; 2BWE S; 2KMM A; 2WX0 A; 1TZO A; 2A5U A; 2EEL A; 1AN8 A; 5C3J B; 3AE7 B; 3CF6 E; 4BOZ B; 3PVL A; 1TT5 B; 2WXJ A; 2LVO A; 1QLB B; 1E8W A; 1Q10 A; 3ZNG C; 1MG8 A; 2LEK A; 1Y56 A; 1I4X A; 2KFK B; 3P1M A; 2KWD A; 1K53 A; 2OED A; 3APD A; 3W9C B; 1E90 A; 2BYV E; 4AS1 A; 3N1X C; 5JHA A; 4XX5 A; 1MVK A; 4GU2 A; 2KDI A; 4W9C A; 3ABV B; 3DBH B; 1OQQ A; 4AJW A; 2QHO A; 3W1S C; 1WM3 A; 3QJZ A; 2NTS A; 2HDE A; 3ZVV A; 3NJT A; 2IO3 B; 4W9J A; 3VHT C; 1RFK A; 3NVZ A; 3DOW A; 1UWX A; 2YEP B; 3IAM 1; 4NJ6 A; 3DPD A; 1V80 A; 3ZIM A; 3AM9 A; 1QOB A; 2BW2 A; 4FBJ B; 1J7C A; 1V2Y A; 3L08 A; 2WXG A; 3MTN B; 4MM3 A; 1C4P A; 3PT2 B; 2JZ3 B; 3AED B; 3HM3 A; 2QIL A; 4IOI E; 2ZJD A; 1E7V A; 2K1F A; 2ASQ A; 1ET6 A; 4WQM A; 1QKZ A; 2WXK A; 3OLM D; 2TSS A; 2JRI B; 3BIN A; 4WQO B; 4YT0 B; 4RNA A; 3PHX B; 2KYW A; 3DBS A; 1VDV A; 3ZQ4 A; 2DWQ A; 4MGZ E; 1GG3 A; 2FCN A; 2RD0 A; 2MSE D; 1WX7 A; 1XLN A; 3GZN I; 4M00 A; 4LNF A; 2N9X A; 3RNG C; 1WR1 A; 4XWW A; 4HDO A; 3RNA C; 3A9K B; 2JWZ A; 3I3T B; 2ACZ B; 2KVR A; 3NVY A; 3RI7 C; 5FKA C; 1TS5 A; 5AZG A; 4LNN A; 3B9J A; 1WZ0 A; 4CO7 A; 4XC2 A; 2KT7 A; 2LHE A; 5LNK 1; 1D6E C; 2GB1 A; 3L4P A; 1GB4 A; 1F1H A; 4GSW A; 1R4M B; 4K1R B; 4RM9 A; 2M8S A; 2JQR B; 2WHI A; 3Q69 A; 2BQQ A; 4HVB A; 2K8H A; 4A90 A; 4MSM B; 3PPA A; 2N4F A; 2AQ2 B; 4BKS A; 2DZM A; 2CKH B; 4P6V F; 2L32 A; 3N32 A; 3P4S B; 5IOI A; 1E7P B; 3PTF C; 1OTR B; 1FCC C; 4MJS B; 2BYT A; 1TBE A; 3RFZ B; 2CHX A; 3SEB A; 1PFD A; 1V1O A; 2LGY A; 3Q8C A; 3ZJU A; 3QCA A; 1QQR A; 4OZB A; 3GE8 C; 1RFA A; 2LFI A; 2V4I B; 3PRM B; 2HJ8 A; 4ARC A; 2WXI A; 1DOI A; 3CIR B; 3KYD D; 4TMA B; 1WH3 A; 2K22 A; 2WNM A; 1UD7 A; 3VTV A; 1NVI D; 4C7Z A; 4WJQ A; 4W9D A; 1KH0 A; 2RPQ A; 1V97 A; 1UGJ A; 3AE5 B; 2WDV B; 3RCZ A; 5BO4 B; 2AL3 A; 2K25 A; 1MHX A; 3WCQ A; 1WJ6 A; 3A1Q A; 2IGH A; 3PGE A; 2WXN A; 1VZ7 A; 4DHZ E; 3KWL A; 1C77 A; 4L23 A; 4HLE A; 4US8 A; 1XCQ L; 3TSS A; 1C79 A; 3BVM A; 2ZCB A; 3Q3N C; 1IYF A; 3DHG C; 1R4N B; 1VRA B; 3MJ5 A; 3Q8F A; 4H2A A; 4HRS A; 3HHM A; 4DBG A; 3ZGZ A; 4WAA A; 1E5W A; 4ZYN A; 2NCN A; 3DBH I; 1KOT A; 4LTU A; 5JZE B; 1HE8 A; 4KIK B; 1D5X C; 2IBI B; 5EDS A; 4DDG D; 1SIF A; 1ET9 A; 3AEE B; 2NS5 A; 3O13 A; 1SEB D; 2NPT B; 4W9I A; 3BY4 B; 2WU2 B; 4BVU C; 3WA0 A; 3EC8 A; 1TS2 A; 2YLM A; 2IY0 B; 2PW9 A; 2ZPY A; 4NAW B; 2OHF A; 4RM8 A; 2KLC A; 4J6I A; 3PZ8 A; 4LNO A; 1ROE A; 3IT4 B; 3AUL A; 4TQ1 A; 1TGZ B; 3RYT A; 1TKY A; 2JT4 B; 2N9K A; 4LK0 M; 2LUM A; 4P1C C; 4IW0 A; 4D2K A; 4J3O D; 1UUP A; 2L7R A; 3ZRC A; 2RDG A; 2JXT A; 1YQB A; 2N1W A; 3SHQ A; 1WXS A; 1WF9 A; 1FRD A; 1QZE A; 2JYE A; 3LDZ E; 4A3O A; 4GDL A; 1JWA D; 1V8C A; 2WP9 B; 3JSV A; 1NDD A; 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4WJO A; 2INP E; 1UZX B; 3ZJV A; 3ZNZ B; 1YJ1 A; 4OHJ A; 1WE6 A; 1YQ3 B; 1WGY A; 1EWY C; 2LAS A; 5HI1 A; 3ZXV A; 4KX6 B; 2QSD A; 2M1M A; 1A70 A; 3B2G A; 4GDK A; 2G3Q B; 5TSS A; 4IWQ A; 5IN7 A; 3ZTD A; 4F8C B; 2RDH A; 4PS3 A; 3OAW A; 4NZL B; 3ML8 A; 3Q3F A; 3AH7 A; 4DHJ D; 3E56 A; 4FJZ A; 3H7P B; 2ZW1 A; 1KLG D; 1JWS D; 3QWZ B; 2L0T A; 4RF0 A; 4BBN F; 3AU4 A; 3WAN A; 3AN1 A; 3IT6 B; 2PE9 A; 1MI0 A; 3X23 A; 4HXD A; 2K9X A; 3L54 A; 5HKH A; 2RGF A; 5CHW A; 3AE9 B; 4YL8 A; 1XF5 L; 3A4S C; 2JXX A; 3URY A; 1SGH A; 1N5X A; 4DHZ B; 4L2Y A; 2PJH A; 3FKY A; 1CJE A; 2KMA A; 2MBH A; 3RMK C; 2V0G A; 1LO5 D; 1N63 A; 4KDI C; 4RGO S; 4C56 C; 4N6E B; 4FJY A; 3PLV A; 4DHJ B; 1IP9 A; 4I6P A; 2HD5 B; 3C8Y A; 3W1Y A; 2ONQ A; 3GZN B; 1HTQ A; 2DX5 B; 1TYG B; 3RT3 B; 1KM7 A; 2KLG A; 2C5L C; 2KNB A; 3KUC B; 2AEH A; 2KTR A; 1FNV A; 4E71 A; 5BYR A; 1VZ8 A; 1V1P A; 1NYR A; 4OW0 A; 3TJP A; 4M0W A; 4RGT A; 2RSU A; 1Q0W B; 2JY6 A; 4A9A A; 1WMH A; 1G6J A; 1JML A; 2C9W B; 4W9G A; 2FAZ A; 4JQW C; 4RMA A; 1PGX A; 3AEB B; 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