1L5TA

Crystal structure of a domain-opened mutant (r121d) of the human lactoferrin n-lobe refined from a merohedrally-twinned crystal form.
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRDTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of a domain-opened mutant (R121D) of the human lactoferrin N-lobe refined from a merohedrally twinned crystal form.
pubmed doi rcsb
molecule keywords lactoferrin
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.16.1.2: Diferric-transferrin reductase.
pdb deposition date 2002-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1l5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1l5tA02
2PVUA 4U4SA 5H8QB 3PGFA 1H76A 5BUUA 3K6UA 3KZGA 3WAFA 2HEUA 3HV1A 3EHSA 3SETA 4THIA 4OWDA 4BDLA 4LQ5A 1T0KA 2HCAA 5AA4A 2XXHA 3KOSA 4KPTA 1S50A 3HO7A 4UA8A 4RYAA 3E4RA 5TP9B 1RYOA 5DVFA 2UXAA 3V8XB 1ZLQA 3C34A 3EHUA 5H8HA 2CZLA 3FGSA 4RJZA 4RXLA 5CMMA 4OEVA 1URGA 3H6TA 2UVHA 1QUIA 4JWOA 2REJA 4RA1A 4O3AA 4OXVA 1A54A 2VOZA 1LFHA 3O29A 4BDQA 1NNKA 3MPKA 2DP8A 3KJ7A 4YKPA 3KFMA 2XD2A 3OMBA 4I62A 4ZZEA 2I4CA 3LUYA 2ZYKA 3H6UA 1M5EA 2I58A 3K02A 3TAJA 3AXFA 3OO9A 3PPPA 3MWBA 1NMUA 1FQBA 2V84A 1H44A 1SDXA 1MQGA 1S9TA 3FJ7A 5I2KA 4X48A 1ZTYA 4GXAA 1PEBA 3RTFB 5M2VA 3SEWA 5KCJA 4IY6A 5TPAB 3MP8A 3O28A 3FV2A 3SDFA 4DXCA 4I9DA 2XHDA 4H5FA 1URSA 2Z8EA 3IK6B 3QUFA 1B3EA 1OQGA 1XOCA 5JTYB 3DP4A 3OSRA 3RGYA 1QULA 2XXYA 3ZKKA 2V3UA 3U93A 1JW4A 4P0IA 2QS3A 1J1NA 1SYIA 1B3GA 1DPEA 1HSJA 4QFPA 3S4UA 1FQDA 4O3BA 4C1UA 2DWHA 1GR2A 1MQHA 4KCCA 4MF3A 4RNSA 1MG1A 4U22A 1TFAA 2I0BA 2X7QA 4G8HA 3MP6A 4FIMA 4X1BA 4QFOA 1B51A 1BKAA 3RLFE 4ZEDA 1M5FA 3MW0A 3FVGA 4GD5A 2NUVA 5CRYA 4QF9A 1M5BA 2AL4A 3UP9A 4HS7A 1SQYA 4TLLB 1HSEA 5AA3A 2HFBA 5L9SA 3K6XA 3GBBA 1RYXA 2Y7PA 4LQ2A 1LAHE 1PBPA 1AL3A 3CR9A 3QK6A 3H4ZA 3MQ9A 2XX8A 3JV9A 3C4MA 2H25A 5AA2B 2VP1A 1Y9UA 3O6IA 1II5A 2ZNUA 4AB5A 3V5AA 3Q29A 3UGWA 3FVOA 5ICQA 1B46A 2H99A 4GRKA 5F1QA 3QYTA 3VFJA 4YAHX 3RPWA 1AOVA 1NH8A 1IZ1A 5AE4A 1ZIUA 3VVDA 2VD3A 4AQ4A 4C0RA 1MQDA 2O68A 5FHOA 4WEPA 3VVFA 5KDTB 5KZTA 2AL5A 2E1SA 1MM6A 1Y3PA 5DEXA 3DP6A 1PB9A 3UIFA 2UVIA 4FEDA 1IXGA 4P11A 5I2NB 3BKIB 2Z8DA 2Z23A 5TU0A 1UQWA 1MRPA 4KYEA 3OXNA 2YPNA 4F3SA 1PB7A 1NFTA 3FD3A 5CMCA 4JSDA 3FV1A 5I56A 1URDA 1H43A 1P1WA 3PV0E 4YKKA 4ZZAA 1LB8A 3IO6A 4ONYA 1MQIA 4U4XA 2I49A 3A3CA 3USDA 3IR1A 2I6EA 5L8DA 1B7ZA 1B3HA 1IXHA 5ITOA 4QFKA 4XXUA 2PBWA 3FJGA 1MPBA 5L9OA 3PUZE 1PDAA 1TXFA 3FXUA 3HSTA 2P0SA 1B6HA 3KSXA 1JEVA 2GFEA 3G3KA 4MFIA 5I57A 4KFQA 3MC2A 2DOJA 1ZU0A 4MBPA 3RQTA 1MY1A 2F97A 3ILTB 4F3BA 4NF6B 4XIGQ 4KD5A 3GBAA 2NOOA 4QFNA 3W9WA 5IKBA 3S2VA 3M8UA 2QSXA 1NNFA 3O2AA 2F7AA 4Z0IA 1WODA 3LSLA 4X1DA 4OZ9A 3MZBA 2F36A 1AMFA 3TCGA 4PFUA 2H9BA 4TOZA 2DE3A 2H98A 3KG2A 2ONKE 4F19A 3UA8A 3GLBA 3ODBA 1QJMA 3GZGA 4POXA 2DQVA 3FXQA 2B3FA 1D9YA 2OK2A 4DXBA 3TYHA 3RN8A 4I1DA 5JEIA 3VXBA 3IB0A 3L6HA 2HZLA 1UIVA 3IJOB 5A5XB 4EXKA 2ABHA 2I4BA 3H6WA 1LCTA 3OO6A 1DTGA 3LBSA 4NF4A 5CMBA 2HZKA 3SEYA 2NXOA 4DDDA 4YMAA 5DT6A 1EH3A 1B3LA 4N13A 2XX7A 4QSDA 1ZMGA 1WDNA 1JEUA 1BLFA 3TDJA 1B7UA 4EQBA 3OELA 4LONB 4DCXA 3K6VA 1S7YA 2WKYA 4YB5A 3QAXA 3V83A 2ZYMA 4FAJA 4U1ZA 2ESNA 3CFXA 4RPNA 2O1MA 1B05A 4BDOA 4FATA 5ELVA 5H8NA 3IOTA 1N84A 2XXXA 2F7BA 2H4IA 3EHTA 2D5WA 4OVJA 1N0TA 3V89B 1DOTA 1OLCA 2Q9TA 3H7MA 4IGRA 2DWIA 1JW5A 3LSXA 2YJPA 1QUJA 4H0WA 3DLNA 2PYYA 4Q30B 4OENA 1DTZA 4R2FA 3BBRA 3EPEA 1OVBA 3G7WA 3PPOA 3G3HA 3P7IA 5I58A 2ZNSA 1IQ7A 3PMXA 3PUXE 2X26A 4PP0A 5I56B 2QL3A 3M3FA 4EF1A 4PE5B 3IO4A 3N94A 1SI0A 1UTHA 1R6ZA 4G8NA 3IB1A 1OQHA 1Y4TA 4DIGA 1D9VA 2KLFA 2DVCA 2OBGA 2G93A 3GXAA 2XXQA 4IGTA 3K1PA 5H8SA 2DSFA 2NVUB 4NF5B 2NWJA 1Z7ME 4ZEBA 4G68B 2RCBA 4YICA 4F2OA 1B4ZA 3OEKA 3CFZA 2O84X 3QUJA 2F78A 3TEPA 5FTIA 3SEXA 1P1OA 4FJPA 4EF2A 5JK4A 2XXTA 3TQLA 4DE8A 2ZXTA 3CFLA 2QJEA 1Y20A 4PETA 4IO6A 3SESA 5HBCA 1YCJA 5K2XA 1A40A 4F1VA 3S9MC 1US5A 5H8FB 4F1YA 2OWTA 3RY3A 4ZE9A 2THIA 3VXCA 1B4HA 3HN0A 3JYRA 1KWHA 4UACA 3Q25A 3T96B 4ECFA 2HAUA 2XXVA 3TELA 5BWJA 4OFOA 3ILUB 1FTMA 1TWYA 5ISUA 1IITA 2E0SA 3KBRA 2F34A 3D4CA 3OEMA 4LVQA 1PB8A 2I3WA 1I6BA 4NTLA 3CRBA 4KI0E 2RKMA 3E13X 1LLSA 3OSQA 4PFYA 2QS4A 3B7DA 4WKMA 2ANJA 5DYHA 2OLBA 3KEIA 3KJTA 1XC1A 3F11A 2XXUA 1HSLA 1MY0A 1QW0A 3KGCA 4N07A 1FTLA 2O7UA 1VFDA 2OJTA 4NF8B 5HPQA 1MXYA 3HCQA 2O51A 2QRYA 1Z7NE 1XVXA 1JW1A 4R72A 1LAXA 4GLIA 4R9FA 3MJNA 3CI8A 2FA7A 3W9VA 4DZ1A 1IEJA 1USYE 4IY5A 3TZAA 1YTVA 3TKDA 3PUVE 4DLDA 1Q35A 1FTJA 2OWSA 5IAIA 1I6QA 3TTRA 2AIXA 2Y7WA 2FYIA 3K1MA 2ZYNA 1QUKA 4NMYA 5I58B 4YKIA 4F31B 5AA4B 1YAEA 2F35A 1O63A 1PBQA 4R2BA 4OEUA 5ITPA 4LATA 1M5DA 3FIRA 2Z8FA 4Q5TA 3MZ9A 4IO7A 1BP5A 5H8HB 2DXYA 1MXZA 2XXWA 3TQWA 2IEEA 3Q28A 2DE4A 3E9XA 4FEBA 2PMSA 4OMBA 3RUMA 4BLAA 2A5TA 4GQOA 3O97A 3C33A 4KR5A 4LA9A 3O66A 5DTBA 1SW4A 4F29A 2BJJX 1OMPA 2D3IA 3RNNA 1P1NA 2P1SA 4KHZE 3O6HA 1FQCA 3RTWB 3T9VA 3K00A 4HCYA 3CSGA 5I84A 2O7IA 3DP8A 4KYSA 3IX1A 2QS1A 5I2KB 1ZBMA 1WVJA 3IL1B 4HW8A 3SEVA 5H8QA 5KCJB 3MP1A 3DM0A 4R6KA 4U1OA 5K2YA 4GF8A 2XD3A 4XKQA 1ZKBA 3Q27A 2RC9A 2G29A 4POWA 2VD2A 3FVNA 1LFIA 3T22A 4QFLA 3SKPA 4QRZA 4ELPA 1N76A 1N3WA 2B65A 1JNFA 2GRVA 2QPQA 3TTKA 1FW0A 4OETA 3ZS6A 5HM4B 1O7TA 3HPIA 3HHFA 3FVKA 1SI1A 2M8CA 5TP9A 1EZOA 3U92A 5CM6A 3A3UA 3K1NA 4H67A 1VE4A 2P2AA 1MY2A 2Y7RA 1F9BA 2O6AA 2F5XA 1MXVA 1FQFA 3RT8A 4FORA 3S9LC 1DSNA 3B6TA 4F1UA 4M4GA 4JBZA 4EQ9A 4RK2A 3IOVA 3MUQA 3A09A 4U2RA 3VVEA 3R26A 2O1LA 3THIA 4L17A 3E3KA 3C31A 3O9PA 4R6YA 3I3VA 1B7HA 1Y1ZA 1LBBA 1L5TA 4ZE8A 4KCDA 3T93B 2VGQA 4WEDA 3K2DA 2DS9A 2I3VA 2UVJA 5B70A 1A7LA 3PU5A 4JDFA 3G3FA 5FHMA 5TPAA 4XKNA 4EXLA 3TUSA 4U21A 3OO8A 3IJXB 3OO7A 4DXUA 4ESWA 2CMOA 5JTYA 1TFDA 4AB6A 4OQOA 4X9TA 5I59A 1VFEA 3PMVA 2DVZA 1A8EA 5LOMA 1FTKA 3CSBA 3PPRA 3C32A 1N7XA 2LAOA 1SVXB 2OZZA 1BTJA 4GVOA 4LUBA 1TT1A 3EF7A 3C9HA 3FUZA 5B7DA 4OHNA 3CVGA 1A55A 2H5YA 1RKMA 3T9HB 2OCUA 4EDPA 3C36A 4NWCA 3O6GA 4FECA 1ATGA 2I48A 1MPCA 1EU8A 1B0HA 2DE2A 5AA2D 4MLQA 4QSCA 1D4NA 4G4PA 5DEXB 1NH7A 1QKAA 3MZ1A 4G8MA 4YB6A 2F7CA 2ZYOA 4RK9A 3I6VA 3C35A 4FE8A 3VE1B 3IB2A 4WXJA 3PD8A 4YMBA 5ICTA 3MBPA 4JSOA 1LSTA 3KN7A 4ZS9A 3SERA 3TPAA 2V25A 3MPLA 4YB7A 4C1TA 1US4A 1B5JA 4OESA 3PUWE 4TLMB 1IIWA 1CE2A 3N5LA 4G77A 4ELOA 4F3GA 3MAMA 5AA2A 4M1VA 3R6UA 1Y4CA 1Y1MA 1B2HA 2QS2A 3FJMA 4R6HA 3TCHA 3U94A 3G3JA 3U72A 1LGBC 1GV8A 4ZDMA 3W15C 4KQPA 2ZMBA 4QSEA 4GIZA 2F6GA 1XHYA 1I6AA 1N3XA 1YPNA 4E0XA 4RY1A 3T66A 3KN3A 3CG1A 3M3KA 1DMBA 1QKBA 2PT1A 4EUOA 3TFLA 2V93A 5FHNA 2GHAA 1XT8A 2UVGA 5DVJA 4JXIA 1B58A 5I57B 3ECRA 1B1XA 1EZ9A 1B52A 3BFTA 4TQUQ 4JWYA 3N26A 1JQFA 4O3CA 1SW1A 1UTBA 2GHBA 4ESXA 5KDTA 4JB7A 2Q8JA 2UYEA 3TCFA 5EHSA 3VLWA 1EZPA 2DWAA 2QMXA 1Q1KA 3LSFB 1R9LA 2XX9A 1JVXA 5I2NA 3IORA 2HQ0A 3ZSFA 1Y3QA 4NEDA 2R9JA 4H1XA 5AA1A 4Q8RA 3H06B 3OOAA 3FASA 5CBSA 1MDQA 4NWDA 3IAZA 3T9XB 2RINA 3S9EA 3K0VA 4IO5A 4ZEIA 1LAFE 4H6DA 3PPNA 1P1QA 4F22A 4ZEKA 1H45A 4R75A 3M3LA 3EN3A 5EHMA 1XS5A 2RC7A 2D21A 3OD7A 4NF4B 2DWJA 1R9QA 5I59B 3K4UA 1M5CA 4LZ7A 2X7PA 3MVXA 1SBPA 3KOTA 4G2ZA 4XKPA 4HTGA 3RT6B 4IO2A 2XXPA 1MY4A 3CG3A 2V3QA 4NE4A 4F3PA 1DPPA 3ONMA 3MVYA 3H03A 3T9UA 2ONRA 1N04A 5CBRA 4MLVA 1OIBA 4GFRA 2HAVA 2DYXA 5H8NB 1VSOA 2V3TA 4N6PA 2PT2A 2PX1A 4HCWA 4ND9A 4NF6A 3H3GA 4PQJA 1A99A 2Z22A 1SW5A 1ELJA 1D3KA 4GWOA 3L6GA 1NKXA 4GOTA 4GL0A 1BIYA 1XVYA 4XTCQ 1MH4A 1JVYA 1CB6A 1AIVA 3SEUA 4YKJA 1ANFA 5EYFA 1B0LA 2HXWA 3PPQA 2B3BA 4P0GA 1UTHB 3QSLA 4F2QA 3U1OA 3TMGA 2I0CA 3WAEA 2YLNA 1MXUA 4H8JA 3UK4A 3G3GA 5A5XA 4K3FA 1P99A 1OLAA 4F39A 4OTEA 4LP2B 4Q0CA 2Q89A 2VHAA 1LB9A 2ZNTA 1LAGE 3LR1A 1MQJA 1ZJLA 1B9JA 4ISUA 3I5OA 1LFGA 3VLVA 1P1UA 1NNTA 2AYSA 3B6WA 4EQ7A 1B32A 3QXMA 4QHQA 4BDRA 1SD3A 1UTBB 1SYHA 1MS7A 2XXIA 4XKRA 2R6GE 1USYH 4G68C 3PUYE 1OVTA 3KN8A 3VLUA 2FNCA 2IA4A 4YU0A 3Q26A 3BFUA 1JETA 1I69A 1GGGA 3TODA 4IO4A 1IXIA 1FQEA 3FXRA 4OFJA 5L9MA 3UORA 4I8CA 1FTOA 1MM7A 1B3FA 3MVWA 1MXWA 4YZZA 1MDP1 3TTNA 2R71A 3IOWA 5DVIA 3N6TA 3MVZA 4H5GA 1LBCA 3D4GA 5FTHA 1B1HA 1NNPA 4LZ5A 4JWXA 3U8QA 2GH9A 3UN6A 2O69A 4BDNA 1QVSA 4GXSB 1MH3A 4NF5A 3PMWA 4G68A 1B40A 2Y7KA 3H6VA 4PFWA 1O64A 5F7VA 3R7XA 3K01A 3KSJA 2F8DA 2Y7IA 2Q2AA 1R1NA 3PD9A 4ELRA 4DCYA 1SW2A 1N7WA 3S9NC 3OENA 4IO3A 4KYDA 4RPOA 4U23A 5J1DA 2RC8A 1FCKA 4BDMA 4LZ8A 5H8FA 1LCFA 3HHGA 1MY3A 2A5SA 3TTMA 4OFLA 4ZEFA 4F18A 1A8FA 2QMWA 1GVCA 1IXCA 3ZKLA 4PFTA 2F6PA 4H8IA 1VR5A 4ELQA 3B6QA 2UYFA 4ZECA 2RF1A 3IOUA 3FZVA 2DXRA 5CMKA 1PC3A 4OERA 3CIJA 4OYVA 1Y3NA 3VDFA 2RCAA 4IB2A 2Q2CA 1AH5A 3DELB 3TTLA 2ALUA 1POY1 2A5TB 1FQAA 1H3DA 4MH5A 4GL8A 1MXXA 2Q88A 2XXRA 3EQ1A 4Z7EA 4H65A 1NL5A 1POTA 2REGA 5CC2A 4NF8A 1IUDA 4R73A 2ONSA 3LC8A 1UIUA 3N6UA 3JZJA 4R9GA 1B5IA 4R74A 5CI5A 4E0WA 1MPDA 3VV5A 3K6WA 1B5HA 2W7YA 3G3IA 3LSWA 3QIMA 2Y84A 3FATA 1GTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KBZA 2PVUA 4U4SA 5H8QB 5IZZA 3PGFA 4GWXA 1H76A 5BUUA 3K6UA 3KZGA 2OX3A 3WAFA 2HEUA 3HV1A 4XF5A 3EHSA 3SETA 4THIA 4OWDA 4BDLA 4X04A 4LQ5A 1T0KA 2HCAA 5AA4A 2XXHA 2VT5A 3KOSA 5ET8A 4KPTA 1S50A 3HO7A 4UA8A 4RYAA 3E4RA 5TP9B 1RYOA 5DVFA 2UXAA 3V8XB 1ZLQA 3C34A 3EHUA 5H8HA 2CZLA 3FGSA 4RJZA 4RXLA 5CMMA 3T0JA 4OEVA 1URGA 3H6TA 2UVHA 2DDKA 1QUIA 4JWOA 2REJA 4X8RA 4RA1A 4O3AA 4OXVA 1A54A 5EQ9A 2VOZA 1LFHA 3O29A 4BDQA 4QBAA 1NNKA 3MPKA 2DP8A 3KJ7A 4YKPA 3KFMA 2XD2A 3OMBA 4I62A 4ZZEA 4P9KA 4XEQA 2I4CA 3LUYA 2ZYKA 3H6UA 1M5EA 2I58A 4IR8A 3K02A 3TAJA 3AXFA 3OO9A 3PPPA 3MWBA 1NMUA 1FQBA 2V84A 1H44A 1SDXA 1MQGA 1S9TA 3FJ7A 5I2KA 4X48A 1ZTYA 3RYDA 4GXAA 4PDDA 2F3BA 1PEBA 3RTFB 5M2VA 5J16A 3SEWA 5KCJA 4IY6A 5TPAB 3MP8A 3O28A 3FV2A 3SDFA 4DXCA 2GQ1A 1KA1A 4I9DA 2XHDA 4H5FA 1URSA 2Z8EA 3IK6B 3QUFA 1B3EA 1OQGA 1XOCA 5JTYB 3DP4A 3OSRA 3RGYA 3E79A 1QULA 2XXYA 3ZKKA 5F24A 2V3UA 3U93A 1JW4A 4P0IA 2QS3A 2QVUA 1J1NA 1SYIA 1B3GA 2P3VA 1DPEA 1HSJA 4QFPA 3S4UA 1FQDA 4O3BA 4C1UA 2DWHA 1GR2A 3FBPA 1FTAA 1MQHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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