1L5TA

Crystal structure of a domain-opened mutant (r121d) of the human lactoferrin n-lobe refined from a merohedrally-twinned crystal form.
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
b'RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRDTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of a domain-opened mutant (R121D) of the human lactoferrin N-lobe refined from a merohedrally twinned crystal form.
pubmed doi rcsb
molecule keywords lactoferrin
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 90
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.16.1.2: Diferric-transferrin reductase.
pdb deposition date 2002-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1l5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1l5tA02
3MZBA 4NWCA 3RQTA 4R6KA 3MBPA 1XOCA 1Y1MA 4QFOA 1MPCA 1A54A 5TP9A 2DE4A 5JK4A 3TFLA 3C34A 1F9BA 4EXKA 1TXFA 3KGCA 1IXGA 3H4ZA 3FD3A 3QSLA 4FE8A 4YB5A 1QULA 3HPIA 4QFKA 3MUQA 2G29A 2RC8A 3TCGA 2DWAA 5I59A 2ANJA 2QS2A 4BDOA 3UN6A 3HHFA 3PMWA 1FQBA 1SW5A 2AL4A 1JW1A 2ZXTA 1MDQA 1QKAA 5CI5A 5H8HB 2VGQA 4LZ5A 4F22A 4YZZA 3PUZE 2V25A 4YAHX 1YTVA 2PX1A 1UTBB 2AYSA 1VFEA 2O84X 4F29A 5KCJA 4MH5A 5BUUA 2NVUB 1DPEA 2LAOA 2CZLA 1PC3A 3TELA 3KBRA 3CFZA 1IIWA 4POWA 4BDMA 3MZ9A 4Z0IA 3OMBA 2RC9A 4DLDA 4F1YA 2OCUA 4JWYA 3K6VA 3CSBA 3ZKKA 1JW4A 4IY6A 2H98A 4R72A 2ZYMA 5HM4B 1P99A 4NF8A 2Y7PA 1ZMGA 4IY5A 3GBAA 2Y7RA 1POY1 3C33A 3OO8A 3SERA 1PB7A 4YKJA 2VOZA 4R73A 3QXMA 1RYXA 2Q88A 4FEBA 3ODBA 1OLCA 3RNNA 4ZEBA 3UORA 5AA4A 1MXWA 1YAEA 1B58A 3I5OA 1M5EA 3K0VA 3K6XA 4LP2B 4ZE8A 1H43A 4WEDA 3M8UA 4IO5A 3TEPA 3OO6A 4C1UA 1A40A 1ZU0A 5L9MA 1B1HA 4QRZA 4EF1A 1JEUA 4O3BA 5I57B 3W9WA 3C32A 1M5CA 2XX7A 3LUYA 3CRBA 4G77A 2HFBA 1EZ9A 3VVFA 5H8QA 5L9SA 1B1XA 1L5TA 2NOOA 3FJMA 1Q35A 1RKMA 2OJTA 1SQYA 1WVJA 5TPAA 1SVXB 1QUKA 2ZNTA 4RPNA 4IO7A 3W9VA 1USYE 4HCYA 4PFYA 4N07A 1I6AA 4ZEKA 1P1QA 1H45A 4UACA 4GFRA 3UP9A 3IOUA 3G3HA 1AOVA 2V93A 3G3IA 5J1DA 5JTYB 5DVJA 3EHUA 1PBQA 2P1SA 3RUMA 3TTKA 4LATA 4HTGA 1N7WA 4G2ZA 4IGTA 2OZZA 5B70A 4U4SA 2QJEA 1XHYA 3OD7A 4OFJA 3O2AA 2F6PA 4Q8RA 1NNFA 4BDRA 2F78A 2F7BA 4JDFA 2I3VA 4YKKA 5BWJA 5EYFA 4FAJA 1B3FA 3MVZA 5DEXA 3DELB 2UYEA 4H65A 5H8NA 3PPRA 1LAHE 1FQCA 5AA3A 3TPAA 3MW0A 1I6QA 2A5SA 2REJA 5KDTA 2G93A 3H6VA 3E9XA 2Y7KA 3QUJA 5KCJB 3SEUA 3RTWB 1ZTYA 3OOAA 2GH9A 1MY3A 3E3KA 3IO6A 4G68C 3HO7A 4YKIA 3O97A 1O7TA 2PMSA 3MZ1A 3T9HB 3H6WA 3LR1A 3Q28A 3VLVA 1HSLA 4MFIA 3WAEA 3JZJA 4NF8B 1IXIA 1Y3QA 3N94A 2F97A 3DP8A 1CE2A 4RYAA 3K2DA 3AXFA 4KYEA 1OMPA 5IKBA 4IO4A 4LONB 1Y1ZA 4KHZE 4KYSA 2XXIA 5AA4B 3MP6A 1GVCA 2I4CA 3VDFA 3O6HA 3IJXB 3OSRA 4EF2A 1LFGA 4F31B 1B3LA 3RN8A 2V3QA 4FATA 1TWYA 3ILUB 5CBSA 4RA1A 3OO9A 1US4A 1OIBA 2B3FA 1QUIA 1DOTA 4XTCQ 3N6UA 5H8QB 1XT8A 2XXYA 3GXAA 2DE2A 3Q29A 3MVXA 3MP1A 1PB8A 4I1DA 4YMAA 3K6UA 3IAZA 2FA7A 4F1UA 1URDA 3MQ9A 3E4RA 3IX1A 5TPAB 4JB7A 1MRPA 2FYIA 2XX8A 3TKDA 4F19A 4YICA 1AIVA 3PD9A 1B0LA 4PFUA 4N6PA 4QSCA 4ELOA 2VP1A 5CRYA 3KFMA 1BIYA 3CG1A 2QS3A 4NF6A 2I48A 2NXOA 5K2YA 4H6DA 4M4GA 3MAMA 3QK6A 5AE4A 3Q27A 1GR2A 2ONRA 4KI0E 3IR1A 3PUXE 4PFTA 1M5DA 3P7IA 1LCTA 4KCDA 5FTHA 3IOWA 4NMYA 3PU5A 3KN3A 4G68A 3MPKA 2YJPA 1B3GA 3F11A 1SI1A 5DEXB 4ZEDA 1JETA 2O69A 1ZJLA 4FORA 3LSXA 4OWDA 3A3UA 1MQHA 2DXYA 3G3KA 1LBCA 3VLUA 2OWSA 4DE8A 2V3UA 4R6YA 2XXTA 3TYHA 2DWIA 3GLBA 1OQHA 1IQ7A 1VFDA 1AMFA 3C31A 4WXJA 2NWJA 2DWHA 1JEVA 2OK2A 4DCYA 1P1OA 3QYTA 1EZPA 3IORA 2H9BA 1TFAA 3K4UA 3TODA 5DT6A 4Q0CA 3HHGA 3C36A 3FXRA 2H4IA 1ATGA 1OVBA 1SW2A 3PV0E 2GHAA 3T9XB 3C35A 2H99A 3FIRA 2QPQA 4F1VA 2DWJA 4U23A 4RK9A 1MPBA 4OEVA 2Q2AA 4BLAA 4XIGQ 4LQ2A 2F8DA 2F35A 5FHMA 5AA2B 5CMKA 1MXVA 4THIA 2XXRA 5L9OA 3LSFB 4QSEA 2R9JA 2HZKA 1H76A 2QL3A 1MQIA 4LQ5A 3T9UA 5B7DA 4OETA 4E0WA 4LA9A 4NF5A 2DQVA 3KJTA 1B3EA 1US5A 2PT2A 2VD2A 1NL5A 1D9YA 4QFLA 3BKIB 4K3FA 4TLMB 1B4ZA 1A55A 1A7LA 3PPNA 1MXXA 2Y7WA 2E1SA 3HSTA 3KZGA 4U2RA 2V3TA 1B52A 2Q89A 5CC2A 2REGA 4GXAA 4OENA 1B5HA 1B40A 3RTFB 3FXQA 2Z8DA 2A5TA 4H5FA 5FTIA 3S9MC 1PB9A 4F2OA 1XVYA 4OEUA 1LAGE 1QKBA 3PMVA 3FVKA 4PQJA 1Y3NA 3H3GA 2HZLA 5I2NB 3DLNA 2PVUA 1DPPA 4NE4A 3OXNA 1LLSA 4KCCA 4NF6B 4EDPA 4TQUQ 3TUSA 1WODA 1ZIUA 4XKPA 2Z8FA 1NKXA 2I3WA 3KN7A 3I6VA 2YLNA 5CM6A 2XD3A 3V5AA 1SDXA 3H03A 1Z7ME 4P11A 2X26A 3RLFE 3O9PA 2RCBA 2DVZA 2DE3A 1R1NA 1S7YA 4JSDA 1D9VA 4YMBA 1B5IA 4G68B 4I9DA 3EN3A 4FIMA 2AL5A 3PUYE 2Z23A 3FUZA 3EPEA 4DXCA 4FJPA 3U92A 3TCFA 3PPQA 4QFPA 1SW1A 4ZEFA 4E0XA 1EH3A 4KD5A 2UVGA 1FCKA 4KYDA 2HXWA 5CMCA 4PP0A 3H7MA 3FV1A 3UIFA 2HEUA 3KSXA 2QSXA 3USDA 4PE5B 3ILTB 4GOTA 4TLLB 4H8IA 5TP9B 5TU0A 3K1MA 3IJOB 1URSA 2UVHA 1MXZA 3RT8A 4I8CA 2ABHA 2DXRA 5I59B 3KOSA 4XXUA 1VE4A 1IXHA 4I62A 2F6GA 1JVXA 4AB6A 1IITA 4F39A 2X7PA 2FNCA 3B6QA 1LFIA 4GQOA 2ZNSA 1NMUA 3KEIA 1DSNA 4OXVA 4KR5A 1BKAA 3PGFA 4HW8A 3LBSA 4JWOA 3PPOA 2R71A 3ZKLA 5ICQA 4MF3A 3Q25A 3D4CA 4OTEA 2ESNA 2PT1A 3IOVA 1MQDA 1XVXA 2ZNUA 4G4PA 4DDDA 3M3FA 4R74A 4C1TA 5DTBA 2Q9TA 1FQDA 2F7CA 1UIVA 4ZZEA 4H5GA 1IXCA 3RPWA 3QUFA 1DTGA 2P2AA 3THIA 2XXVA 3T96B 4ZE9A 4R2FA 3VXCA 4H67A 3SKPA 2OBGA 2I4BA 3HCQA 3PUVE 1SBPA 4IO3A 4KPTA 3KN8A 5I58A 4X48A 1NNPA 3UK4A 4JWXA 4JSOA 3EF7A 2I6EA 2IEEA 4GIZA 4OZ9A 4F2QA 4KFQA 4DZ1A 3N5LA 1H44A 2O51A 3V89B 1POTA 4X1DA 3SEYA 4EQBA 2PBWA 1URGA 3K6WA 2F36A 4EQ7A 1IEJA 3ZS6A 3JV9A 3S9NC 3FJGA 1HSJA 4L17A 1LSTA 2I49A 2AIXA 3OENA 1IUDA 2YPNA 3CFXA 5AA1A 3G3FA 1QJMA 3TTRA 1ANFA 3TQLA 2VD3A 1YPNA 1BTJA 2O7UA 1MXYA 1JVYA 3FXUA 2Y7IA 3IB0A 3CSGA 3UGWA 5KZTA 3PUWE 3KOTA 3DP4A 2RINA 1OQGA 3HV1A 1XS5A 3E13X 3VFJA 1SD3A 3GZGA 3L6GA 4OFLA 4DXUA 4RK2A 4BDNA 3FVOA 3OSQA 4LZ7A 5I57A 3TZAA 2OLBA 2HAUA 4U1ZA 4GXSB 4R6HA 1NFTA 1B7ZA 4RXLA 3SEXA 1NNKA 1R9QA 4HS7A 4G8NA 1QW0A 1B0HA 2ZYKA 1OLAA 5H8NB 1MG1A 1MY2A 4NTLA 2ONKE 1FQAA 2UYFA 1Z7NE 1R6ZA 1MQGA 1LAXA 3T93B 1LGBC 2RKMA 5LOMA 2Y84A 5ELVA 1O63A 5KDTB 4F18A 3K01A 2KLFA 3C9HA 1P1NA 1Y20A 5ITOA 1B6HA 5CMMA 2O7IA 3FGSA 2HAVA 4RPOA 1B4HA 4G8HA 1MM6A 3KJ7A 1R9LA 2Z22A 3FZVA 1SYIA 3VVDA 1N0TA 3O66A 3T66A 4Q30B 1BLFA 4NF4A 4GRKA 4EQ9A 4ND9A 3VXBA 3CI8A 1ZBMA 4MLQA 3ZSFA 4R2BA 4ELQA 3MC2A 4GF8A 3I3VA 4NEDA 2IA4A 3U1OA 3TCHA 1LAFE 1JW5A 4RNSA 1MY1A 5CMBA 3OO7A 1M5BA 2QRYA 3T9VA 1N04A 3KG2A 2DYXA 3VVEA 2QMXA 4NWDA 1UQWA 5ISUA 3FASA 1ZKBA 5I58B 3OEMA 1DTZA 1MXUA 2E0SA 3TTLA 3ECRA 4GL8A 1QUJA 3U72A 4OHNA 3R26A 2WKYA 2HCAA 4LUBA 1B5JA 2O6AA 3LSWA 4H0WA 3A09A 3RT6B 3CG3A 1B46A 2HQ0A 1JNFA 3K02A 1FTLA 1BP5A 3TDJA 4YU0A 2F5XA 2XXHA 3U8QA 3CFLA 5CBRA 1FTJA 1EU8A 1A8EA 4YB7A 4U1OA 5A5XA 2I58A 4ISUA 3O6IA 3GBBA 2D21A 4RY1A 3PMXA 2QMWA 1AH5A 2DVCA 5AA2D 4C0RA 4Q5TA 4IGRA 3O28A 4H1XA 1MY4A 3EHTA 3O6GA 3IK6B 1Q1KA 2RC7A 1MH4A 1MY0A 1A99A 4IB2A 1N84A 2ALUA 2XXUA 3TQWA 4OMBA 3TAJA 1TT1A 4ELPA 1SYHA 1B2HA 1FTMA 1S50A 3C4MA 1VR5A 5ITPA 1YCJA 3U93A 2GHBA 2M8CA 4MBPA 4MLVA 4O3CA 4JBZA 1MH3A 2I0CA 1B7UA 1HSEA 2DSFA 4IO6A 1N7XA 4PFWA 1MQJA 3ONMA 4F3BA 2XX9A 4LZ8A 3K1NA 1N3XA 2QS1A 1UTHA 4LVQA 3FV2A 1B3HA 1USYH 1PBPA 3BFTA 1LFHA 3MWBA 1S9TA 4KQPA 1MPDA 2B65A 1NH7A 1N76A 2PYYA 3KSJA 2DP8A 3CR9A 4ZDMA 4AQ4A 2DS9A 5I56A 4YB6A 1XC1A 5HBCA 3H06B 2BJJX 2O1MA 2THIA 5H8FA 2XXQA 2DOJA 3IB2A 4GL0A 1LB8A 4N13A 1IZ1A 5IAIA 1PDAA 3H6TA 1ZLQA 4OQOA 5DYHA 2RF1A 3B6TA 1TFDA 3M3LA 5L8DA 1FQEA 2RCAA 4XKNA 1B05A 3SEVA 2X7QA 2XD2A 3V8XB 5I2KA 2ZMBA 4WEPA 4NF4B 2XXXA 4R75A 3SEWA 1NH8A 3RGYA 2R6GE 5EHMA 1NNTA 2F7AA 1MDP1 4AB5A 3U94A 2D5WA 4UA8A 1FTKA 3TMGA 3S4UA 5F1QA 3S2VA 1I69A 4DCXA 1B32A 3FVGA 4P0GA 3T22A 4OERA 4ESWA 3EHSA 3SETA 1A8FA 4U4XA 2F34A 3W15C 2CMOA 5FHNA 3TTNA 1KWHA 5FHOA 2XXPA 3FVNA 1N3WA 4POXA 3JYRA 4JXIA 2P0SA 4Z7EA 3UA8A 3LSLA 1J1NA 5EHSA 4NF5B 2GFEA 3Q26A 3MP8A 1CB6A 2OWTA 4ELRA 4ONYA 2Z8EA 4OFOA 4ZZAA 2D3IA 2ZYOA 3D4GA 3VLWA 4DIGA 5ICTA 4PETA 4GVOA 3N26A 3K00A 4QSDA 3OELA 5A5XB 1Y4CA 3PPPA 4R9GA 4HCWA 1GGGA 1O64A 1MS7A 3SESA 3SDFA 1OVTA 2A5TB 3DM0A 1AL3A 5H8HA 1GV8A 1H3DA 1PEBA 3H6UA 4G8MA 1LB9A 3FATA 1ELJA 2NUVA 3G3JA 1LBBA 4R9FA 1UTBA 2UVIA 4ESXA 3MVYA 4U21A 3CIJA 4FECA 2QS4A 1EZOA 1SW4A 4DXBA 1Y9UA 1UIUA 1WDNA 5AA2A 3QIMA 4P0IA 3M3KA 1QVSA 2O1LA 4OESA 4XKRA 5JEIA 3IO4A 1VSOA 3CVGA 4U22A 3FJ7A 3RY3A 4QF9A 1LCFA 1UTHB 1JQFA 5I84A 3IOTA 1P1UA 3A3CA 4O3AA 2B3BA 3B7DA 2XHDA 3MPLA 4F3GA 2I0BA 3TTMA 1M5FA 2ZYNA 4RJZA 2W7YA 4OYVA 2UXAA 1FTOA 3OEKA 3G3GA 4H8JA 5DVIA 1Y4TA 2H5YA 2V84A 5I56B 4WKMA 3VV5A 2VHAA 1FW0A 1D4NA 4X1BA 3PD8A 4YKPA 2ONSA 5H8FB 4BDQA 1FQFA 1B7HA 5I2NA 3LC8A 5K2XA 3B6WA 1MM7A 1P1WA 3MJNA 3S9EA 1B9JA 4QHQA 3HN0A 4TOZA 4F3PA 4OVJA 4M1VA 4ZEIA 3R7XA 4ZS9A 4FEDA 2GRVA 5HPQA 2XXWA 5H8SA 3L6HA 3V83A 3K1PA 2Q2CA 4IO2A 3N6TA 3EQ1A 5I2KB 3BFUA 3BBRA 1II5A 1D3KA 3MVWA 1GTKA 4ECFA 4EUOA 3VE1B 4BDLA 2H25A 1RYOA 4QFNA 3DP6A 1SI0A 2UVJA 4GWOA 3O29A 3IB1A 3S9LC 3R6UA 1Y3PA 4GD5A 4EXLA 4GLIA 1T0KA 4X9TA 3G7WA 4ZECA 5JTYA 5M2VA 3WAFA 1DMBA 2Q8JA 4XKQA 2O68A 3QAXA 1B51A 5F7VA 4F3SA 1I6BA 3IL1B 5DVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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