1L5TA

Crystal structure of a domain-opened mutant (r121d) of the human lactoferrin n-lobe refined from a merohedrally-twinned crystal form.
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRDTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords lactoferrin
publication title Structure of a domain-opened mutant (R121D) of the human lactoferrin N-lobe refined from a merohedrally twinned crystal form.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 90
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.16.1.2: Diferric-transferrin reductase.
pdb deposition date 2002-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1l5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1l5tA02
5I59B 1MQHA 3KN3A 2UVJA 4WEPA 2R6GE 2XXYA 5DVIA 3KN8A 1VFEA 3ZSFA 2RCAA 3H6TA 5CMCA 3QUJA 4YMAA 2GHBA 5AA3A 1ZTYA 1FW0A 3F11A 3N5LA 3E13X 5KCJB 2DE3A 5F1QA 3RT6B 1MY4A 1ZU0A 2RC8A 4F2OA 2O7UA 4OTEA 4X1BA 1S9TA 1TFDA 4WEDA 3WAEA 3U8QA 4BDOA 1PC3A 4OHNA 4DLDA 3OSQA 3MPKA 4H65A 4HCYA 3Q25A 3LR1A 4LONB 4BDLA 5DTBA 3Q29A 5DT6A 1POTA 5I84A 3H6WA 3H4ZA 4FATA 2D3IA 1HSLA 1B58A 3PPQA 2ZNUA 3S9LC 3OENA 3T9HB 4F1UA 5CC2A 1Y3NA 1AIVA 5EHMA 5AA4A 4ND9A 4N13A 1Z7NE 3S2VA 1IITA 5I59A 1D3KA 4PFYA 2UXAA 1FQEA 4FEDA 4U4SA 2Q89A 4MLVA 4PFUA 5KCJA 2P0SA 3H06B 2DYXA 5H8HA 2YJPA 2QRYA 4HW8A 5EHSA 2DXYA 2F78A 2PMSA 4GRKA 3GXAA 3FV1A 2Y84A 4Q30B 3E9XA 2ONKE 3S4UA 4I8CA 1B5HA 4MH5A 1PB8A 4YZZA 3O6IA 4KFQA 2ALUA 4G8MA 1EZ9A 3KZGA 1B3LA 2H4IA 2O6AA 3SEXA 2RF1A 4U21A 1B3GA 1BKAA 3ECRA 5TP9B 4GD5A 2GH9A 3SETA 4R2BA 3SDFA 3K00A 3PGFA 4HCWA 1LAGE 2XXPA 3EHSA 4GXSB 3EN3A 3HV1A 1BIYA 4ZE9A 2OZZA 2ANJA 4YB7A 4JWYA 4P0GA 3H7MA 1B46A 4EDPA 3U92A 2I3WA 3MVXA 3LSWA 4QSDA 4GOTA 4H6DA 1FQAA 3CG3A 2XXTA 3O9PA 1LBBA 2ZYOA 1MS7A 4C0RA 4YU0A 3H6UA 4EUOA 2XXXA 4QSEA 4H8JA 3TPAA 2H5YA 1MXVA 5H8QB 5I2NA 4MLQA 2HCAA 3UA8A 2RKMA 5DVFA 1N84A 1B7HA 1JW1A 5AA2B 2H99A 3CI8A 2XXQA 4FEBA 3FXUA 4EF2A 1M5FA 2BJJX 3PPOA 3JYRA 1MY3A 4XXUA 3OO8A 1OLAA 1B7UA 3C31A 5TP9A 3SEUA 3UK4A 2P1SA 1XHYA 3MZ1A 3Q28A 3USDA 5I56B 1RYXA 5AE4A 5HM4B 1US4A 5L8DA 1ZLQA 3DLNA 1SDXA 4F1YA 4H1XA 3PD9A 3OXNA 2Z8DA 1PBQA 2HAVA 2NVUB 2O1LA 3T9VA 2E1SA 5H8FB 3KG2A 4ZEBA 3M3KA 3MWBA 3VE1B 5K2YA 3VLVA 2ZMBA 4EXKA 3PMWA 1NKXA 4OEVA 3QXMA 1DOTA 4H67A 5H8QA 5ITOA 1B0LA 3LSFB 4H5GA 1DTZA 1SD3A 1VR5A 2X26A 3K0VA 1B2HA 1FCKA 3DP6A 2DQVA 3FJ7A 4JXIA 4RK9A 3SKPA 2AIXA 3IJOB 4KYEA 3TCGA 1B51A 3MVWA 3OELA 4FECA 3C9HA 1N7XA 1PB7A 3VDFA 3MBPA 3SEYA 2AYSA 3E3KA 4ZZAA 3TELA 5I56A 1QVSA 2V3TA 4ESXA 3IORA 4OVJA 4C1TA 3CR9A 1T0KA 1GVCA 1MH4A 3TEPA 4Z7EA 3MQ9A 1Y20A 1FTLA 3ILTB 4DZ1A 4AB6A 1JQFA 4YKIA 1B3FA 2YPNA 1P1UA 3OOAA 3BFTA 4GQOA 1H45A 5H8FA 2OWSA 1LCTA 2RC9A 5IAIA 1A55A 1H43A 3CFZA 1ANFA 2QSXA 1YPNA 2FNCA 2QS2A 2NOOA 2NXOA 1B5IA 4QHQA 2OBGA 3W9WA 5ICQA 5H8SA 5BWJA 3HPIA 1LB9A 3RLFE 3FVKA 3HN0A 5KZTA 3TUSA 1IEJA 2VP1A 4OENA 1Z7ME 3IO6A 4JBZA 1A7LA 1Y4CA 3G3JA 4ZEFA 3U94A 4ISUA 2VGQA 1UTBB 1I6QA 1B5JA 1RYOA 2ABHA 4XKPA 3R7XA 3PMVA 3I5OA 4FJPA 1AMFA 4DIGA 5JTYB 3FJMA 5H8NB 2R71A 1QUIA 1N0TA 3N6UA 4LA9A 1EU8A 2H9BA 3TYHA 3K02A 2QMXA 4R72A 4P11A 1B9JA 2F6GA 2DXRA 1WVJA 5KDTA 2ONRA 2DE4A 3BFUA 3PPPA 3PV0E 5TPAA 3BKIB 4NEDA 4QFPA 5L9SA 2QPQA 2V25A 1R9LA 3O6GA 3V5AA 2THIA 5F7VA 1FQDA 1B4ZA 1Y9UA 1FTMA 4U4XA 4H0WA 2HZLA 1OQGA 1LSTA 3RTWB 1SYIA 2I4BA 4BDMA 4HS7A 3TKDA 1Y1MA 4HTGA 1USYE 1LAFE 2D5WA 2F35A 2XXUA 3IOWA 1B4HA 5A5XB 5JK4A 3GBAA 2REGA 4G4PA 1MQJA 1Y1ZA 1UTBA 3O66A 4Z0IA 5H8HB 4RPOA 3PMXA 4NF4A 1SVXB 2R9JA 3MAMA 2UYFA 2F7AA 5JTYA 4OFOA 5H8NA 4LQ2A 2HAUA 1MXXA 4YICA 4U1ZA 4IY6A 3OEKA 4QFNA 4OEUA 1LLSA 3K1NA 5HBCA 1TT1A 1NH8A 1YAEA 2DVCA 3MZBA 1N3XA 3CFXA 3QIMA 1S50A 4PFTA 4OWDA 3W9VA 1D9VA 3FVGA 1LB8A 3IB2A 4ELRA 4OZ9A 4ZEKA 3T22A 3VVFA 4GLIA 5CMBA 4KHZE 1MDP1 2LAOA 3K01A 3TTRA 5AA2D 4ZEDA 1QW0A 1L5TA 4R6KA 3IB1A 3PUWE 5ISUA 1DSNA 4G8NA 4NE4A 2F8DA 1LGBC 2PX1A 5TU0A 1CE2A 3GZGA 1SW1A 2O68A 4N6PA 4R73A 2FYIA 1IXGA 4KPTA 3FXQA 5A5XA 4F18A 4YKJA 5BUUA 2O51A 4TLLB 1A99A 2ZYMA 4Q0CA 3KEIA 2Q2CA 3I3VA 1FTOA 4OETA 4QFLA 1IZ1A 4G8HA 1POY1 3TCFA 3N26A 3O6HA 4YKKA 3D4CA 1DTGA 5I2NB 2DVZA 2NUVA 3LC8A 1EH3A 2DOJA 3R26A 2ZNSA 3QUFA 1QKAA 1TXFA 5M2VA 3RT8A 4MBPA 1HSEA 4PQJA 3RPWA 3MVZA 3TAJA 3LSLA 1MQIA 3DP8A 2AL4A 1YCJA 3PUZE 3I6VA 4AB5A 3C4MA 2QS1A 2QS3A 3S9MC 2Y7WA 3L6HA 1NFTA 3HHFA 3TODA 2A5TB 4LVQA 3VLWA 3TDJA 1AOVA 1ATGA 3KFMA 3EPEA 5CM6A 4NWCA 3IOTA 3SESA 3FIRA 1N3WA 2CZLA 4JSDA 1MDQA 5DEXB 4O3CA 1FQFA 2GFEA 4LQ5A 4F3SA 4M4GA 3A3UA 4O3BA 4XKNA 3EF7A 3S9EA 5DYHA 1UQWA 4F3GA 3PUYE 1VE4A 3QK6A 3MW0A 1QUKA 4TQUQ 2F6PA 3SEVA 1NMUA 4IO6A 1N76A 2XX7A 2IEEA 2OJTA 3DELB 2ESNA 2XXIA 3T9UA 3H3GA 3IL1B 1Y3PA 3MUQA 4BDRA 3UGWA 5I58B 2PYYA 3SERA 3Q27A 3VLUA 3MC2A 4KD5A 4ELQA 4R75A 1JETA 3K6UA 3SEWA 1QULA 5B7DA 4RNSA 4QF9A 4POXA 4UA8A 3E4RA 2RC7A 4RXLA 1JEVA 1Y4TA 4YKPA 3HSTA 3G7WA 1R1NA 4RJZA 2VD3A 3KOTA 1FQBA 2Q88A 5L9OA 1NNKA 2A5TA 1MM7A 3FVNA 4LZ5A 4XTCQ 1MPDA 4U23A 2F34A 4YB5A 1H44A 3MJNA 1BP5A 2WKYA 2XXHA 4U1OA 4I9DA 1EZOA 3V8XB 3FD3A 3K1MA 5DEXA 3Q26A 4ONYA 5IKBA 4JWXA 4RK2A 4KR5A 4NF5B 2KLFA 1D4NA 4OYVA 2UYEA 1XOCA 3IO4A 2H98A 3M8UA 3PUVE 2QS4A 3KN7A 3PU5A 4F2QA 1LCFA 1TFAA 1MQDA 3VXBA 1GTKA 3UP9A 3OEMA 1JW5A 4GL8A 3TZAA 3C33A 1LBCA 2DWAA 4E0XA 1IIWA 1XC1A 4GIZA 4ZDMA 4LZ7A 5I2KB 5I58A 4UACA 4AQ4A 4ECFA 4GWOA 5CRYA 2I3VA 3ILUB 1QJMA 1GV8A 4BLAA 1XT8A 1MY2A 1MH3A 1VFDA 3V83A 4QFOA 4NF6B 2PT2A 1ZJLA 2ZNTA 4LZ8A 2HEUA 4F19A 2RINA 4OERA 2V93A 3KJTA 2I6EA 1MY0A 4G68B 3O28A 2PBWA 3DM0A 3GLBA 4EQ9A 1M5CA 1TWYA 5CBSA 2G93A 3VFJA 3IAZA 4NF5A 4BDNA 4LATA 1SYHA 2XXVA 4KCDA 2I58A 1US5A 3CFLA 1B6HA 1ZKBA 3CG1A 1XS5A 3U72A 5KDTB 4E0WA 2OWTA 4RY1A 3MP8A 1LFGA 4EF1A 1FQCA 5ELVA 3G3IA 3IK6B 5TPAB 1S7YA 4WKMA 4GL0A 3R6UA 2M8CA 3HO7A 5I2KA 4GVOA 2HFBA 4QFKA 1LFIA 4OMBA 1ZBMA 3VXCA 2X7QA 3K6XA 1UIVA 3TQLA 3HHGA 2F5XA 4OFLA 1UTHB 3OD7A 3CIJA 3IOVA 2A5SA 4NF6A 4PE5B 3KBRA 2XXRA 3H03A 1M5BA 4NF8A 3VVEA 4NF4B 4R2FA 4G68A 3D4GA 4IY5A 4H8IA 4U22A 2I0CA 4ZECA 1SW4A 5ITPA 1MRPA 3TCHA 4OQOA 4OXVA 2FA7A 1O63A 4Q8RA 2F97A 3JV9A 1URSA 3KSJA 3RN8A 1MXYA 1IXCA 3W15C 4F3PA 1NNPA 1Q35A 5FTHA 3B6TA 3G3FA 4R6HA 4LUBA 4C1UA 3T93B 5EYFA 2DWJA 4R74A 2G29A 4H5FA 3OO6A 4G2ZA 2I48A 4FIMA 2Z23A 4EQBA 2I49A 1UIUA 1B52A 1B0HA 3FV2A 3O29A 1UTHA 1JVYA 4GFRA 3C34A 3ODBA 1PEBA 2XD3A 1P1WA 1P99A 1URDA 4ZS9A 2NWJA 5J1DA 4ELOA 3B6QA 4LP2B 3G3KA 3FUZA 3TTNA 3IX1A 3KOSA 1WODA 2Z8FA 3TTLA 2DE2A 2I0BA 1ELJA 3UN6A 1N7WA 4KYDA 2QL3A 1CB6A 3PUXE 3CSGA 4JSOA 1IUDA 4EXLA 3P7IA 2VHAA 4RPNA 5L9MA 3TFLA 2Z8EA 4YAHX 5FHOA 4IGTA 2UVIA 4OFJA 3MPLA 3T96B 1MXZA 1B32A 4F3BA 5JEIA 3THIA 1IQ7A 2F7CA 1A8FA 3B6WA 2XX8A 4IO3A 2OLBA 3OMBA 1GGGA 1BTJA 3A09A 1PDAA 3K4UA 3ZS6A 2H25A 1ZIUA 1R6ZA 2QMWA 2XHDA 1P1NA 4IO2A 1PBPA 1A54A 3DP4A 1B05A 4FORA 4IO5A 2GRVA 2XXWA 4KYSA 2F7BA 3MP6A 2ZYNA 4ZE8A 3O2AA 1RKMA 2REJA 1MG1A 2I4CA 2Q8JA 3CRBA 1MXUA 3M3LA 1GR2A 3GBBA 4DCXA 5B70A 1IXIA 3EHUA 1XVYA 4ZEIA 1F9BA 3G3HA 1DPEA 2PT1A 2VD2A 2AL5A 2HZKA 1OQHA 3KGCA 1B1HA 4TOZA 2DSFA 4MF3A 4XKQA 1B3EA 1H76A 5LOMA 3FVOA 3KSXA 4THIA 3MZ9A 3PPNA 2B3FA 2VOZA 3LSXA 1NNTA 3HCQA 4R9GA 2B65A 1I69A 4F39A 4Q5TA 2DWIA 1ZMGA 2RCBA 4N07A 1MY1A 1URGA 3N94A 2ZXTA 1B7ZA 4U2RA 1B3HA 2D21A 4X9TA 2O69A 2E0SA 3H6VA 3K6WA 1FTJA 2OCUA 1A8EA 1Q1KA 1FTKA 3QAXA 3FGSA 4RYAA 1MPCA 1DPPA 3G3GA 1PB9A 1N04A 2QJEA 4KI0E 2O7IA 1WDNA 5ICTA 2Y7KA 5CMMA 3T66A 1AL3A 4PP0A 4GXAA 1USYH 3RUMA 1P1QA 1H3DA 3RGYA 1XVXA 2Y7RA 1B1XA 5FTIA 3L6GA 3IB0A 1OMPA 3PD8A 2W7YA 3UORA 2F36A 1JVXA 3KJ7A 4P0IA 1J1NA 4R9FA 1MPBA 1D9YA 4I1DA 2Y7IA 2ZYKA 3OSRA 4G77A 4F22A 1QKBA 3ZKKA 3VVDA 1JW4A 2UVHA 3UIFA 4GF8A 2PVUA 3QYTA 1OVTA 4F29A 2GHAA 3M3FA 4ELPA 4DXBA 4TLMB 5I57B 3K2DA 1OVBA 3B7DA 3C32A 3C36A 1VSOA 1LAXA 2V84A 5K2XA 3U1OA 1SBPA 1BLFA 3K6VA 2CMOA 4MFIA 1SW2A 1OLCA 4IO4A 4XKRA 3FASA 1LAHE 1A40A 2O1MA 3U93A 3T9XB 3EQ1A 5AA2A 5FHMA 2OK2A 2V3QA 4ZZEA 2DS9A 4ESWA 3IR1A 1OIBA 4NF8B 1P1OA 3A3CA 4O3AA 4L17A 4JB7A 3FZVA 4DDDA 4JWOA 4DXCA 4I62A 3S9NC 3FATA 1MXWA 4NMYA 3IJXB 3PPRA 3O97A 3LBSA 3MVYA 2Q9TA 4G68C 3OO7A 3FXRA 4XIGQ 1DMBA 2X7PA 4RA1A 3RQTA 3ZKLA 5I57A 4DXUA 2YLNA 1JNFA 4YMBA 3K1PA 1HSJA 3AXFA 4DE8A 4NTLA 1NNFA 4X48A 2IA4A 3MP1A 1YTVA 4IB2A 3C35A 4QSCA 1O7TA 5AA1A 1SI1A 3ONMA 1QUJA 1LFHA 3VV5A 3EHTA 4QRZA 1B40A 2HXWA 1SW5A 4F1VA 2XD2A 4PFWA 1NH7A 4WXJA 3RY3A 4R6YA 3CVGA 3RNNA 4X1DA 1SI0A 3TTKA 1MQGA 4JDFA 3TTMA 1O64A 4KQPA 5CMKA 2UVGA 3IOUA 1SQYA 4IO7A 3TMGA 5DVJA 4K3FA 4EQ7A 2V3UA 3BBRA 4OESA 1IXHA 1I6AA 5CBRA 1M5EA 2ONSA 2O84X 2DP8A 5FHNA 4YB6A 4F31B 1II5A 4M1VA 4IGRA 4FE8A 3TQWA 3N6TA 3RTFB 1KWHA 3FJGA 4KCCA 5CI5A 4DCYA 1JEUA 3QSLA 2XX9A 4NWDA 3V89B 3CSBA 1R9QA 1EZPA 4POWA 3JZJA 1MM6A 2DWHA 5HPQA 4FAJA 2Q2AA 3LUYA 1NL5A 1M5DA 1Y3QA 1AH5A 2P2AA 4PETA 2Y7PA 2Z22A 3OO9A 1I6BA 2B3BA 5AA4B 2HQ0A 4BDQA 3WAFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I59B 1MQHA 3KN3A 2UVJA 4WEPA 2R6GE 2XXYA 5I5PA 5DVIA 5FBPA 3KN8A 1VFEA 3ZSFA 2RCAA 5I3SA 3H6TA 4O7IA 5CMCA 3QUJA 4YMAA 2GHBA 1K9ZA 5AA3A 2FVZA 1ZTYA 1FW0A 4PF8A 3ROJA 3F11A 3N5LA 3E13X 5KCJB 2DE3A 5ET5A 5F1QA 3RT6B 1MY4A 1ZU0A 2RC8A 4F2OA 4IR8A 4PC9A 2O7UA 4OTEA 4X1BA 1S9TA 1TFDA 4WEDA 3WAEA 1NV1A 3U8QA 4BDOA 1PC3A 4OHNA 4DLDA 3OSQA 1FPLA 3MPKA 4H65A 4HCYA 3Q25A 3LR1A 4PFIA 4LONB 4BDLA 2FIXA 5DTBA 3Q29A 5DT6A 1POTA 5I84A 3H6WA 3H4ZA 4FATA 2D3IA 1HSLA 1B58A 1FPFA 3PPQA 2ZNUA 3S9LC 3OENA 1NUZA 3T9HB 4F1UA 5CC2A 1Y3NA 1AIVA 5EHMA 5AA4A 4ND9A 4N13A 1Z7NE 3S2VA 5EQ8A 1IITA 5I59A 1D3KA 4PFYA 2UXAA 1FQEA 4FEDA 4U4SA 2FHYA 2ZZXA 2QVUA 2Q89A 4MLVA 4PFUA 1LBZA 4GWSA 5KCJA 2P0SA 5DW8A 3H06B 2DYXA 5H8HA 2YJPA 1SPIA 3U65A 2QRYA 4HW8A 1KA1A 1EYJA 5EHSA 2DXYA 2F78A 2PMSA 4NX1A 2VPOA 4GRKA 3GXAA 3FV1A 2Y84A 4JVDA 4Q30B 3E9XA 2ONKE 1NV3A 3S4UA 4I8CA 1B5HA 4MH5A 1PB8A 1G0HA 4YZZA 1FBFA 3O6IA 4KFQA 3D1RA 2ALUA 4G8MA 1EZ9A 4QBAA 3KZGA 1B3LA 2H4IA 2O6AA 3IFAA 3SEXA 2RF1A 4U21A 1B3GA 1BKAA 1EYIA 3ECRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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