1L66A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAASELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l66A00
1L10A 129LA 1L0KA 1L55A 1CV4A 1L89A 1L98A 3HTFA 4I7TA 182LA 1L86A 1CUQA 2B6TA 1C6HA 1P2LA 2OEAX 1L97A 1D3FA 2B75A 1QTHA 2OU9A 1QS5A 4ARPA 172LA 4GBRB 237LA 1XEPA 2OTZX 1L52A 2RBQA 1L0JA 1D3JA 3VW7A 3NY9A 4W57A 3RUNA 1L21A 1L64A 1T97A 234LA 2CUUA 1SWYA 1C6KA 1L20A 1L80A 2RAZX 3HU8A 2B7XA 1LI2A 1C6QA 1OVKA 158LA 3GUPA 3SB8A 1DYBA 1KY0A 1P6YA 4W53A 1TLAA 1L04A 4EJ4A 3OE9A 1D2YA 1LGUA 107LA 1LI3A 3K2RA 2RBOA 3DN8A 128LA 1JQUA 1P3NA 1L47A 4LZMA 4EKQA 1L41A 2O7AA 1L96A 1LWKA 2LC9A 3L64A 1CV6A 1SX2A 2B6WA 3DN6A 4DJHA 3HT9A 260LA 187LA 257LA 1C6PA 1CU2A 248LA 1C6IA 1L22A 137LA 155LA 1D9WA 1L84A 3FA0A 1LGXA 1QT6A 1L94A 225LA 2OU0X 3FI5A 4LDLA 1L51A 1C6AA 3D4SA 1L50A 1L62A 1L48A 1L18A 3G3WA 3GUJA 1QT3A 1C6DA 258LA 1P7SA 252LA 160LA 177LA 1OYUA 191LA 3HTGA 1OWZA 1PQMA 221LA 2F47A 1L05A 3C82A 1G0QA 1L44A 1L36A 3SB9A 1P2RA 1QT7A 3HWLA 3DN1A 1C69A 1L95A 3QAKA 1LYGA 1LYDA 102LA 119LA 3HU9A 120LA 164LA 151LA 5I14A 217LA 180LA 223LA 3HT6A 4EPIA 110LA 1L79A 3HH5A 4IAPA 1JTNA 250LA 126LA 161LA 2OE4X 1C6BA 1L82A 249LA 1L02A 3SB7A 4W52A 1G0KA 1CX6A 1L33A 1SWZA 251LA 2A4TA 1ZYTA 103LA 2HULA 168LA 2LZMA 255LA 3SN6R 143LA 3HH4A 1L13A 4GRVA 1C6MA 213LA 242LA 4I7PA 1D3MA 2NTGA 3HUKA 2Q9DA 3V2YA 219LA 3DKEX 1I6SA 4AQNA 184LA 2Z6BA 3OE0A 4I7RA 1L53A 2B74A 1LYJA 1CV0A 1QTBA 3V2WA 1L31A 1G0PA 1L63A 1XJUA 1CV5A 1L85A 2B70A 1P64A 4DAJA 1C6GA 4YXCA 131LA 1CUPA 1PQKA 2HUKA 1L14A 236LA 1QSQA 1C63A 1L42A 186LA 3DMVA 3PBLA 1L26A 1L30A 2QB0B 228LA 4W54A 3C81A 2QARC 2OU8A 157LA 1L73A 3NYAA 4I7OA 1L29A 125LA 1C6CA 1L61A 1G1WA 2O79A 3GUOA 162LA 3CDRA 1L91A 147LA 2ANXA 1DYAA 3HDFA 195LA 2F32A 2NTHA 112LA 3CDVA 4W59A 224LA 239LA 1L00A 1L57A 1P5CA 3HTBA 3JR6A 216LA 1L54A 2B6ZA 4EKRA 1P46A 156LA 2B6YA 2F2QA 1QTCA 1L93A 122LA 3GUKA 1C61A 1L23A 1QTZA 226LA 1L49A 3ODUA 1L76A 4ARQA 3CDOA 1LYIA 198LA 3NY8A 229LA 1L27A 1QSBA 3HUAA 1L92A 1L75A 1L46A 222LA 3F8VA 1L24A 6LZMA 2B6XA 1CTWA 1DYDA 2ANVA 114LA 1L90A 235LA 2RBPA 146LA 1L01A 3CDTA 3DN3A 4EKSA 4ARJA 1L81A 1QUGA 1C67A 1L17A 1CV3A 2RBRA 4S0WA 4EPFA 1L69A 1L45A 1L59A 2IGCA 1L60A 227LA 3RZEA 3OE8A 108LA 189LA 3SBAA 123LA 2RBSA 1PQIA 4I7NA 1L38A 4I7KA 1DYFA 1C68A 1L25A 1QTDA 4K5YA 3G3VA 1QUOA 3GUMA 238LA 3HTDA 1P37A 1OVJA 173LA 1DYGA 176LA 2RAYX 1KW5A 144LA 183LA 3DN4A 4W55A 1LYHA 1PQJA 1LWGA 1ZWNA 3F9LA 218LA 3SBBC 1K28A 1T8FA 1L66A 2B73A 3FADA 3HT8A 140LA 1L77A 150LA 2RB2X 1CU5A 1L35A 4ARMA 215LA 1QT8A 1KS3A 1L65A 1PQDA 3SB6A 1L06A 206LA 163LA 3DN2A 3HDEA 1L40A 4I7MA 1L03A 3GUIA 138LA 1CU0A 1OV7A 1L11A 243LA 2B72A 3C8RA 4YX7C 115LA 1CU6A 109LA 197LA 232LA 1L07A 2RBNA 1L99A 240LA 3C7ZA 4ARLA 246LA 190LA 3DNAA 1ZURA 142LA 130LA 262LA 2OE9X 1T8AA 7LZMA 1B6IA 261LA 205LA 1L39A 1QS9A 1D2WA 1L68A 1L19A 4YXAC 4EKPA 3L2XA 196LA 1QT5A 1NHBA 211LA 199LA 166LA 3GULA 2LCBA 2RH1A 165LA 3G3XA 1G06A 192LA 259LA 3C8QA 1L87A 4W51A 5LZMA 1L15A 169LA 4PK0A 145LA 4ARQB 210LA 1LI6A 4ZPUA 1QUHA 1C6TA 3C7YA 3LZMA 1D3NA 1KW7A 1SSWA 1L43A 1OWYA 1L34A 1CV1A 178LA 1L28A 3HH3A 1SX7A 241LA 2L78A 175LA 1LYFA 174LA 3EMLA 1P56A 1CU3A 220LA 1PQOA 4I7SA 1G1VA 1QTVA 2RB0X 188LA 214LA 1L32A 1L67A 247LA 3HUQA 4E97A 4I7LA 3GUNA 104LA 170LA 149LA 1L37A 254LA 1KNIA 2RB1X 1L12A 127LA 3DMXA 3SB5A 245LA 4DKLA 159LA 201LA 1C65A 3C80A 152LA 4LDOA 4EXMA 1C6NA 4OO9A 1LW9A 1LLHA 1L58A 1LPYA 1JTMA 171LA 209LA 1L70A 1XJTA 2Q9EA 3CDQA 4W56A 2HUMA 111LA 1L08A 1P36A 1DYCA 1L71A 1CX7A 231LA 1L56A 233LA 148LE 1G0LA 185LA 1C6LA 1C62A 1C6JA 139LA 3C7WA 1KY1A 113LA 200LA 4W58A 4ARMB 1T6HA 118LA 3C8SA 1QUDA 3OE6A 1L83A 244LA 3DMZA 1OVHA 1L16A 3PDSA 230LA 2OE7X 4LDEA 2O4WA 1QT4A 256LA 1CVKA 1DYEA 1WTHA 141LA 3DN0A 167LA 4PJZA 3UONA 1SSYA 1G0MA 1T8GA 1C60A 3C83A 4I7JA 1L74A 1L88A 253LA 1C66A 1G0GA 1C6EA 181LA 3HT7A 1C64A 1G0JA 1LGWA 2OTYX 1EPYA 1LYEA 1G07A 1L72A 1C6FA 1L09A 212LA 4I7QA 1OV5A 3HH6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HEEA 1L89A 4I7TA 182LA 2G4NA 1L86A 2B6TA 1JKBA 4LYTA 4XADA 1L97A 1QTHA 1LZ6A 4ARPA 1GF4A 2BQLA 2MEBA 3VW7A 5APCA 3NY9A 4W57A 2BQIA 1SWYA 1C6KA 1WQOA 1B7NA 1BGIA 3GUPA 3SB8A 2BQCA 4H9IA 4W53A 2ZYPA 4LGKA 2FBDA 1JSFA 107LA 1LYZA 1LTMA 1QIOA 4EKQA 4LZMA 4OWCA 4ET8A 4OWAA 1B5UA 5FDJA 5C6LA 1CV6A 2XBSA 2B6WA 4H94A 5J7CA 3DN6A 1C45A 154LA 4PRUA 5HNLA 2HEBA 4H8XA 4AXTA 4Z41A 2D4KA 5DN5A 4DDCA 4NHQA 1B7OA 4NFVA 1GB3A 5I4YA 225LA 3W6AA 4G4BA 1IP5A 1HSWA 2BPUA 1IIZA 1LZRA 3D4SA 3GUJA 2HEAA 4RDSA 1P7SA 4B4EA 4NGJA 160LA 1LSBA 2Z39A 3CT5A 1PQMA 221LA 4N1EI 3WU8A 4N8ZA 1L05A 1GBZA 5II3A 2ZIKA 1G0QA 2F30A 4W96A 3ZVQB 4CFOA 4DWXA 3DN1A 4NG1A 102LA 119LA 2BQBA 4DDAA 1CKFA 3WW5A 3HT6A 4EPIA 110LA 1L79A 2FBBA 4TSBA 4IAPA 5HQ1A 1N4FA 3RNXA 3TXFA 1LHLA 2OE4X 3SB7A 1G0KA 2LZTA 4WMGA 4XJDA 2LZ2A 2F2NA 3WUAA 1B0DA 4WM3A 1L33A 2A4TA 3W3EA 103LA 2HULA 4PRQA 4HSFA 2Z2EA 143LA 4I7PA 3HUKA 2Q9DA 1EQEA 2ZYCA 4FDYA 3OE0A 1QQYA 2EPEA 4IJ4A 2B74A 2BQJA 3TXIA 1L31A 1J1XY 1CV5A 2VB1A 1OUEA 3WULA 1NBYC 1LSGA 2DQIY 2N5ZA 5KXOA 1L26A 228LA 5E4PA 1C6CA 2Y8PA 162LA 3HDFA 3WPLA 4WLXA 4DD3A 3WUMA 1UUZC 1RE2A 1GF7A 1L57A 1LMAA 1P5CA 1LMPA 3JR6A 1GE3A 5FCPA 1QTCA 4R0FA 4NIJA 122LA 4YEOA 1D6PA 1C61A 1QTZA 4PPOA 1IWZA 2W1LA 2CWIA 222LA 1REZA 5KXLA 1REMA 1LZBA 1L24A 4KT3A 6LZMA 1WQRA 1B7RA 1FKVA 2ANVA 3ULRA 2RBPA 2HECA 4OWHA 2XBRA 1CV3A 1QTKA 3N9AA 4DD7A 4WLDA 3RZEA 4GN4A 3OE8A 1B7QA 3KAMA 1LMOA 3A91A 4G4HA 4I7KA 1B5ZA 4K5YA 1QUOA 1P37A 1GEVA 1DPWA 1OVJA 1W08A 3RW8A 176LA 1KW5A 4C3WA 3DN4A 4W55A 1PQJA 1YL0X 4M4OA 1DI3A 1FLYA 1CU5A 1L35A 4ARMA 215LA 1GFJA 1QT8A 4YENA 2YBIA 1L40A 4I7MA 1IY3A 5KJ9A 138LA 1CU0A 1OV7A 1VFBC 243LA 2IHLA 4YX7C 115LA 1LMCA 4GN3A 197LA 3C7ZA 5LAFA 190LA 1OUIA 2AUBA 3DNAA 4RLMA 4QGZA 2DQCY 2BQGA 2MEAA 2Z2FA 4J1BA 1B6IA 1L39A 3D3DA 1WQNA 2DQFC 4EKPA 196LA 211LA 1IR9A 3RU5A 3WUNA 3HFMY 3WVXA 1FLUA 4NG8A 1JKCA 2BQHA 3J6KA 3EO5A 1LI6A 1UACY 1C6TA 1LZ1A 4H91A 1WQQA 1JISA 1YAMA 1OWYA 1L34A 5KXZA 1IR8A 1CV1A 4H9BA 1VATA 4LT1A 1GFUA 4NHSA 5APEA 3B0KA 4GCCA 1LYFA 4TX7A 3WVYA 5L9JA 174LA 3EMLA 1DI5A 1PQOA 4WM6A 1L32A 4I7LA 170LA 1GBOA 4N5RA 1L37A 254LA 1KNIA 1AKIA 3LYZA 4NGIA 245LA 135LA 1LJEA 3TXBA 1LZ9A 201LA 1REYA 152LA 4LDOA 1GB5A 4H93A 1LAAA 1WQPA 3HBDA 4W56A 1HEOA 4HP0A 1C08C 1CX7A 3IWRA 1L56A 4NHIA 1G7IC 1J1OY 3F6ZA 5I54A 139LA 4WLYA 113LA 1LSCA 1T6HA 1IP6A 118LA 3C8SA 2YBHA 1QUDA 3OE6A 1GFKA 244LA 1UCOA 3FE0A 4GN5C 2OE7X 1LJHA 2DQJY 167LA 1IOQA 1GB8A 4UWUA 4XJGA 5KY1A 1SSYA 4LYCA 3D9AC 1CKCA 3HT7A 6LYTA 1C6FA 1L09A 4EOFA 212LA 5B59A 5F81A 1L0KA 1V7SA 5D5CA 1QUTA 2Q0MX 1C6HA 2OU9A 172LA 2C8PA 1YROA 3W6DA 237LA 1GBXA 2OTZX 1L21A 1LCNA 5LA5A 2ZNWY 1GF5A 1LI2A 4UWNA 1DYBA 4WO9A 1KY0A 1GBSA 3IJVA 1VDPA 1BB4A 1ZMYL 1GB6A 4LFXA 3P65A 1ZVHL 1UIDA 2RBOA 2GV0A 1P2CC 1YQVY 1NDMC 2XTHA 1LSNA 1B7PA 5B1GA 1KIPC 1IX0A 1JITA 1UICA 4DJHA 257LA 3A96A 3B6LA 3LYMA 1LJ3A 1QTEA 4GCBA 1JIYA 155LA 1IC4Y 5LVKA 1WTMA 3FA0A 4OWEA 1L94A 2OU0X 2G4PA 4LDLA 1LJGA 3G3WA 5HMVA 1QT3A 1C6DA 1LZNA 1E8LA 177LA 3HTGA 2C8OA 1EQ5A 3TXDA 2F47A 3TMXA 3C82A 2A7DA 4NGVA 1C69A 1UBZA 1LYDA 3HU9A 1LZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HEE A;  1L89 A;  4I7T A;  182L A;  2G4N A;  1L86 A;  2B6T A;  1JKB A;  4LYT A;  4XAD A;  1L97 A;  1QTH A;  1LZ6 A;  4ARP A;  1GF4 A;  2BQL A;  2MEB A;  3VW7 A;  5APC A;  3NY9 A;  4W57 A;  2BQI A;  1SWY A;  1C6K A;  1WQO A;  1B7N A;  1BGI A;  3GUP A;  3SB8 A;  2BQC A;  4H9I A;  4W53 A;  2ZYP A;  4LGK A;  2FBD A;  1JSF A;  107L A;  1LYZ A;  1LTM A;  1QIO A;  4EKQ A;  4LZM A;  4OWC A;  4ET8 A;  4OWA A;  1B5U A;  5FDJ A;  5C6L A;  1CV6 A;  2XBS A;  2B6W A;  4H94 A;  5J7C A;  3DN6 A;  1C45 A;  154L A;  4PRU A;  5HNL A;  2HEB A;  4H8X A;  4AXT A;  4Z41 A;  2D4K A;  5DN5 A;  4DDC A;  4NHQ A;  1B7O A;  4NFV A;  1GB3 A;  5I4Y A;  225L A;  3W6A A;  4G4B A;  1IP5 A;  1HSW A;  2BPU A;  1IIZ A;  1LZR A;  3D4S A;  3GUJ A;  2HEA A;  4RDS A;  1P7S A;  4B4E A;  4NGJ A;  160L A;  1LSB A;  2Z39 A;  3CT5 A;  1PQM A;  221L A;  4N1E I;  3WU8 A;  4N8Z A;  1L05 A;  1GBZ A;  5II3 A;  2ZIK A;  1G0Q A;  2F30 A;  4W96 A;  3ZVQ B;  4CFO A;  4DWX A;  3DN1 A;  4NG1 A;  102L A;  119L A;  2BQB A;  4DDA A;  1CKF A;  3WW5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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