1L73A

Multiple stabilizing alanine replacements within alpha-helix 126-134 of t4 lysozyme have independent, additive effects on both structure and stability
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWAAAAAALAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Multiple alanine replacements within alpha-helix 126-134 of T4 lysozyme have independent, additive effects on both structure and stability.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l73A00
1P7SA 1PQOA 192LA 4W52A 197LA 1L56A 4EPFA 1L49A 109LA 1CV6A 1L86A 4ARJA 219LA 1L98A 1G06A 1T8AA 1OYUA 152LA 155LA 182LA 1G0PA 1OVHA 3F8VA 2B70A 1L90A 4I7KA 3HUAA 3SB7A 201LA 1C6JA 3GUMA 1L13A 1CX6A 4I7JA 172LA 2RBQA 102LA 1LGUA 3D4SA 1L40A 191LA 3JR6A 251LA 1T6HA 125LA 2NTGA 3DKEX 163LA 170LA 4I7RA 1OWYA 3DN6A 4EPIA 144LA 2O7AA 162LA 1C6BA 1C6GA 4ARMA 188LA 1G1VA 1QT5A 3HTDA 2RBNA 3ODUA 4ARLA 131LA 3OE6A 3GUNA 2QARC 3CDOA 1C6HA 159LA 1KW7A 190LA 1CV3A 1QS5A 3FI5A 1G1WA 234LA 4ARQB 1L70A 243LA 1QTVA 1KY0A 4W51A 137LA 4EKSA 1L02A 1L91A 3HU8A 4EJ4A 1T8FA 226LA 205LA 165LA 1QTHA 2OU8A 3C8RA 4LDOA 1QT8A 1DYDA 4LZMA 214LA 1L94A 1L11A 4GBRB 1L57A 3G3XA 142LA 186LA 3DN0A 250LA 1XEPA 1L15A 2B6WA 1PQIA 1LYFA 1C6NA 1G0LA 1OV7A 1L50A 2OEAX 173LA 238LA 3NYAA 3C8QA 1L84A 4LDEA 2O79A 1C6CA 176LA 3DMZA 161LA 3DMXA 248LA 2O4WA 1C60A 1LW9A 3HH4A 1L00A 1QUDA 1LYEA 241LA 4W58A 1L35A 1P2RA 229LA 1L32A 1L58A 1CU3A 4EKPA 2QB0B 1C62A 4PK0A 1L71A 1C6MA 3DN2A 120LA 1NHBA 1QT4A 4DAJA 256LA 181LA 1L61A 222LA 2OE4X 146LA 1C67A 1QSQA 1D3FA 1L28A 3SN6R 1LGWA 130LA 3HH3A 1LYHA 3GUPA 1L43A 1JTMA 213LA 6LZMA 1L64A 3SB5A 1KW5A 3QAKA 1DYAA 3HUKA 1QT6A 2Z6BA 160LA 3HT8A 1QUHA 4EKQA 196LA 1WTHA 1KY1A 2F2QA 2Q9EA 1LYJA 3HT7A 199LA 1L88A 4OO9A 1L08A 2B72A 2LC9A 3SB9A 1CX7A 1L74A 1G0GA 1L59A 231LA 112LA 2LCBA 5LZMA 1L20A 1L83A 1L65A 3LZMA 4I7QA 4YXCA 1L24A 1OVKA 1L42A 128LA 141LA 1LYDA 1SWYA 4I7OA 3C83A 139LA 2B73A 3NY8A 1L51A 1KS3A 3SBAA 4I7NA 1L81A 1L89A 3GUIA 1LGXA 1D3MA 2RBOA 1L82A 1DYBA 216LA 1L75A 3HH5A 1C66A 166LA 1C6DA 1L68A 2RAYX 3C7YA 1TLAA 1L93A 3OE9A 1L39A 4W56A 3SB6A 1L29A 1JQUA 4W54A 1L17A 262LA 2RAZX 4I7PA 209LA 2B74A 1L07A 223LA 2OE9X 1C69A 1P37A 1L0JA 1JTNA 1L12A 1L48A 253LA 255LA 4W55A 4DKLA 4I7MA 1L52A 1QTDA 3HDFA 246LA 1L21A 1LWGA 149LA 2B6TA 3K2RA 3NY9A 1P64A 1LI3A 147LA 1P56A 1PQKA 1LI6A 215LA 108LA 212LA 1G0KA 1OV5A 1L0KA 3V2YA 240LA 236LA 254LA 1CU6A 151LA 122LA 2RB0X 3GULA 158LA 1SX2A 148LE 3OE0A 4K5YA 119LA 1ZURA 127LA 1L38A 1D3JA 1L44A 113LA 1C6IA 224LA 3HTFA 3PDSA 2F47A 4W53A 3OE8A 3PBLA 3FADA 1P6YA 143LA 1CTWA 1SWZA 3C80A 195LA 2HUMA 3HUQA 1L34A 3G3WA 1PQJA 1SX7A 1L79A 1DYGA 3DN1A 1QTZA 1C6LA 1L46A 2CUUA 3F9LA 4ARQA 2ANXA 3C7WA 3HWLA 1CU0A 1L53A 167LA 4ZPUA 1L10A 1C68A 1QTCA 177LA 1C64A 1D3NA 1CU5A 1L33A 4EXMA 1L55A 1P3NA 3L2XA 237LA 3C7ZA 4I7TA 4PJZA 129LA 1QT7A 118LA 3FA0A 3SB8A 123LA 2OTZX 1D2WA 4GRVA 1L25A 1L69A 1L95A 2OU9A 2OU0X 115LA 1L47A 1CV0A 1L54A 200LA 2OE7X 1L72A 218LA 206LA 3HTBA 150LA 1LPYA 1ZYTA 1L41A 211LA 2B6ZA 261LA 2OTYX 1L77A 1C6QA 227LA 178LA 4I7SA 4ARMB 3DMVA 2LZMA 2B6YA 4YXAC 225LA 3DN8A 2A4TA 1PQDA 174LA 2B6XA 4W57A 107LA 4ARPA 168LA 3DN4A 2IGCA 1KNIA 3GUKA 1CV1A 3UONA 1ZWNA 1L73A 1L05A 1L36A 1L09A 2F32A 3CDQA 4S0WA 1LYIA 1I6SA 221LA 103LA 169LA 1C6TA 1L16A 3HDEA 156LA 187LA 1L14A 252LA 1L26A 1L99A 233LA 1P5CA 2RBPA 3DN3A 1L97A 1CUQA 1C6AA 1L80A 247LA 3HU9A 1G07A 1D2YA 1OWZA 2ANVA 1DYCA 2RBSA 3V2WA 2RB2X 1C63A 1LI2A 1PQMA 1G0MA 1L76A 1L85A 1L04A 3SBBC 1L37A 1QT3A 1C6EA 3RUNA 114LA 217LA 1QSBA 1L45A 164LA 230LA 3C82A 183LA 1XJTA 1L31A 1G0JA 3HT6A 1G0QA 1L01A 1L06A 1L92A 3CDTA 1CV5A 1SSWA 140LA 2NTHA 1C6PA 3DNAA 1B6IA 260LA 3GUOA 3VW7A 1P36A 3RZEA 1QS9A 3C81A 180LA 210LA 2Q9DA 3HTGA 2HULA 1DYFA 242LA 3HT9A 126LA 157LA 228LA 235LA 4W59A 1P46A 4IAPA 1L23A 3L64A 1L30A 3GUJA 1OVJA 1L60A 1QUOA 3EMLA 2B75A 1CU2A 244LA 1QUGA 1L66A 3G3VA 1L19A 145LA 1L63A 104LA 1L96A 1L03A 1DYEA 257LA 1L27A 171LA 2L78A 5I14A 110LA 1C65A 1P2LA 1L62A 259LA 4DJHA 1T97A 258LA 4YX7C 1K28A 249LA 2RBRA 1SSYA 4AQNA 1C61A 245LA 184LA 1LLHA 1LYGA 1QTBA 1C6FA 2RB1X 232LA 4I7LA 1D9WA 1CVKA 138LA 4LDLA 2B7XA 1CUPA 7LZMA 2HUKA 175LA 1LWKA 1EPYA 3CDVA 189LA 4E97A 1XJUA 111LA 220LA 1L18A 1L22A 4EKRA 239LA 3CDRA 185LA 1L67A 3C8SA 198LA 2RH1A 1CV4A 1L87A 1C6KA 1T8GA 3HH6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M6DA 1LZNA 4AXTA 4YOPA 4W52A 4EPFA 1L49A 1L86A 1IO5A 3W6AA 4ARJA 1REMA 1G06A 1T8AA 3F8VA 1CJ6A 1UCOA 1OUAA 4H91A 1GF0A 4NGJA 172LA 1B7NA 1IY4A 4ET9A 1BB6A 1T6HA 4IATA 3DKEX 163LA 170LA 1IWWA 2C8OA 162LA 1CKCA 3TXHA 1JWRA 1LZ9A 3ODUA 3GUNA 3B0OA 3WULA 1EQ4A 1UBZA 1UIEA 1HSWA 234LA 1L70A 4B49A 3WVYA 4GCEA 4EKSA 3QE8A 5D5CA 3EMSA 1HC0A 3HU8A 205LA 4WLTA 2BQFA 1NKHA 1DYDA 214LA 2BQKA 1GAYA 5KXYA 1L94A 1L11A 2NWDX 1GWDA 1LZCA 142LA 186LA 3AGGG 1XEPA 1GB8A 2LYMA 1B7OA 2B6WA 1OV7A 1LSMA 2MEAA 3J4GA 1A4VA 1HEMA 173LA 2D4IA 1LSYA 2DQAA 4LT0A 248LA 2BQEA 3OJPA 1C60A 4FDYA 1GF6A 2LHMA 1RFPA 1B7QA 241LA 4W58A 1P2CC 3P68A 1L35A 5HQ1A 3LYZA 5I53A 3D3DA 1LMCA 3D9AC 120LA 1UIFA 5LVIA 222LA 2H5ZA 146LA 1D3FA 1JHLA 5C6IA 2EIZC 1LGWA 2PC2A 1L43A 1HERA 3QAKA 1QT6A 4MCKA 1QSWA 4YENA 1KY1A 2Z18A 3P64A 5L3IA 2F2QA 4LFXA 1IOSA 1RI8B 4D9ZA 2B72A 1CX7A 1L59A 3TXKA 4HV2A 2FYDA 1NDMC 4I7QA 4LFPA 1UUZC 1OVKA 1L42A 3MGWA 4OWCA 4NGYA 4WM5A 4XYYA 5KXOA 4WLDA 4I7OA 4WO6A 1CNSA 1KS3A 3SBAA 5B06A 1QUSA 4PHIA 2RBOA 1L82A 2XBSA 3HH5A 1GB9A 1L68A 1EL1A 1GE1A 1OUHA 1LJJA 1DI5A 1QQYA 1OUFA 2ZILA 5LVHA 209LA 2B74A 4OOOA 1LZYA 223LA 1L48A 3CSQA 4DT3A 253LA 4W55A 4DKLA 5M1YA 3A3RX 3HBEX 4TSBA 5LYMA 4H93A 3K2RA 3NY9A 1JUGA 1LI6A 215LA 1G0KA 3WPLA 1LYYA 254LA 1CU6A 1YAQA 1JJ0A 151LA 158LA 2BQGA 4XJHA 1JTPL 1C10A 2BPUA 1ZURA 127LA 4TUNA 1BB7A 4N5RA 2HEBA 1B5VA 3HTFA 3WXUA 3W6CA 1F10A 4W53A 1IWUA 5LVJA 3PBLA 1FN5A 5KKIA 3FADA 1P6YA 143LA 4C5FA 4G49A 5DLAA 3G3WA 3AGIA 1SX7A 1GPQC 5B05A 2N5ZA 1PZYA 1DQJC 3C7WA 1B2KA 4W94A 1LZTA 167LA 2XBRA 2W1YA 3WMKA 1HFZA 1TAYA 5LA5A 4HJVA 3L2XA 4H9CA 3C7ZA 3RT5X 4NSHA 4LYOA 3FA0A 1WTNA 2OTZX 4CJ2A 1L95A 2DQHY 1QDTA 1DZBX 4H9FA 3WU7A 1D9UA 1LKSA 4WG7A 4DDAA 206LA 1HNLA 207LA 2Q0MX 4ML7A 2YBMA 194LA 261LA 1C6QA 1FKVA 4N9RA 1XGQC 4ARMB 3DMVA 3N9AA 1PQDA 1GDXA 107LA 1IP2A 1DI3A 168LA 3GUKA 1CV1A 3UONA 2D4JA 2BAAA 1IP3A 1L36A 1OUIA 1LHLA 4S0WA 3AZ7A 2BQJA 4GCBA 187LA 252LA 1P5CA 1CKGA 3K3TA 5LA8A 247LA 3HU9A 2ANVA 1DYCA 2RB2X 1PQMA 1G0MA 2HEEA 3SBBC 1L37A 5F16A 1VDTA 217LA 4N0JA 1HMLA 1O23A 2MEHA 4UWNA 2LYZA 1LYSA 1G0JA 3HT6A 2MEDA 3CDTA 1CV5A 4OWEA 3B6LA 2NTHA 1IP6A 5EBHA 1GBXA 1KIPC 4DQJA 3RZEA 4LT3A 210LA 1LJFA 3ATNA 2Q9DA 2HULA 3WVXA 1QTEA 242LA 228LA 4W59A 1L23A 4HPEA 1UIBA 3CT0A 1GF5A 2W1LA 244LA 4ET8A 1LSAA 5B59A 1REYA 2F2NA 2IFFY 1LZEA 1IR7A 5A3EA 3A6CY 1GEZA 1ZMYL 3HBHA 5I14A 1C65A 1P2LA 1L62A 259LA 1WQNA 4YF2A 1K28A 2RBRA 1SSYA 3W3EA 4LT1A 1G7JC 1E8LA 1CVKA 1CUPA 2HUKA 2MEIA 1EPYA 3CDVA 189LA 4X3BA 1XGPC 5IELA 1L18A 4EKRA 239LA 208LA 1GE3A 1REXA 4CGEA 1C6KA 1HHLA 1T8GA 1D6PA 1REZA 1PQOA 2BQAA 1LJEA 1L56A 219LA 1OYUA 2B70A 2Z38A 3J6KA 1B5WA 1TCYA 1GBSA 1LAAA 4I7KA 3HUAA 1V7SA 3TXFA 3W6BA 3GUMA 1LHHA 5DL9A 4I7JA 1LGUA 1KIRC 191LA 5DM9A 4HTQA 4J1BA 2BQMA 125LA 2BQLA 1YIKA 1FLQA 1HEWA 1XSFA 2YBLA 2MECA 3DN6A 4DWXA 1VDQA 5KJ9A 4NY5A 1C6GA 4RW2A 188LA 1QSAA 3F6ZA 1YKZX 3OE6A 2QARC 1GEVA 1C6HA 2ZQ3A 159LA 4N1CC 4CHXA 3FI5A 4NGIA 133LA 1G1WA 3OK0A 5L3HA 4PRQA 5DN5A 243LA 2G4PA 1QTVA 4PJ2C 1DKJA 5FCPA 5KKJA 137LA 5KXZA 4EJ4A 3TXDA 5KXWA 165LA 3C8RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M6D A;  1LZN A;  4AXT A;  4YOP A;  4W52 A;  4EPF A;  1L49 A;  1L86 A;  1IO5 A;  3W6A A;  4ARJ A;  1REM A;  1G06 A;  1T8A A;  3F8V A;  1CJ6 A;  1UCO A;  1OUA A;  4H91 A;  1GF0 A;  4NGJ A;  172L A;  1B7N A;  1IY4 A;  4ET9 A;  1BB6 A;  1T6H A;  4IAT A;  3DKE X;  163L A;  170L A;  1IWW A;  2C8O A;  162L A;  1CKC A;  3TXH A;  1JWR A;  1LZ9 A;  3ODU A;  3GUN A;  3B0O A;  3WUL A;  1EQ4 A;  1UBZ A;  1UIE A;  1HSW A;  234L A;  1L70 A;  4B49 A;  3WVY A;  4GCE A;  4EKS A;  3QE8 A;  5D5C A;  3EMS A;  1HC0 A;  3HU8 A;  205L A;  4WLT A;  2BQF A;  1NKH A;  1DYD A;  214L A;  2BQK A;  1GAY A;  5KXY A;  1L94 A;  1L11 A;  2NWD X;  1GWD A;  1LZC A;  142L A;  186L A;  3AGG G;  1XEP A;  1GB8 A;  2LYM A;  1B7O A;  2B6W A;  1OV7 A;  1LSM A;  2MEA A;  3J4G A;  1A4V A;  1HEM A;  173L A;  2D4I A;  1LSY A;  2DQA A;  4LT0 A;  248L A;  2BQE A;  3OJP A;  1C60 A;  4FDY A;  1GF6 A;  2LHM A;  1RFP A;  1B7Q A;  241L A;  4W58 A;  1P2C C;  3P68 A;  1L35 A;  5HQ1 A;  3LYZ A;  5I53 A;  3D3D A;  1LMC A;  3D9A C;  120L A;  1UIF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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