1L75A

Multiple stabilizing alanine replacements within alpha-helix 126-134 of t4 lysozyme have independent, additive effects on both structure and stability
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWAAAAAAAAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Multiple alanine replacements within alpha-helix 126-134 of T4 lysozyme have independent, additive effects on both structure and stability.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l75A00
1QT7A 2HUMA 1CV6A 1L77A 1L73A 4EXMA 118LA 1LYIA 2RAZX 3G3XA 3HU9A 3F9LA 1C6MA 1NHBA 221LA 1QTHA 1PQJA 1C65A 131LA 1L76A 223LA 3L64A 3K2RA 1QTVA 3GUIA 3SBAA 4GBRB 4YX7C 1DYGA 168LA 4W53A 1L27A 1LWGA 161LA 3DKEX 201LA 1G0PA 4EKSA 1C6TA 1QSQA 1OWYA 1QT4A 1L88A 1OV7A 261LA 108LA 187LA 1SWZA 3C7ZA 1DYDA 4EPIA 4ARJA 1L45A 3DN0A 144LA 3CDTA 112LA 1L36A 4EKPA 3HTFA 169LA 1L10A 1LYEA 1L87A 2HULA 1C6DA 1L24A 3NYAA 4W57A 1D3FA 2Q9EA 2OTYX 1L16A 1LI2A 4I7JA 1L63A 1C6NA 1D3MA 2RBRA 3C82A 3C81A 1C6JA 1L19A 185LA 1OVHA 2RB0X 152LA 2RBOA 114LA 1CVKA 182LA 1QTBA 4AQNA 2Q9DA 236LA 2RBSA 1CU2A 1PQIA 177LA 1LGUA 235LA 3HT6A 3FI5A 1C6GA 1EPYA 1L55A 1G06A 1QT6A 1C6AA 1QSBA 220LA 1LGXA 175LA 1QTZA 4E97A 1L29A 2OE9X 126LA 2B6TA 4DJHA 3SB7A 1G1VA 1DYCA 147LA 150LA 4YXAC 241LA 2RBNA 3HH6A 219LA 1L12A 1XEPA 4DKLA 1L51A 1SX7A 257LA 1L25A 254LA 1G0GA 3DN3A 3HT9A 1L42A 1L32A 1L59A 3FA0A 4I7NA 3HUQA 3HU8A 1CU0A 206LA 3OE0A 226LA 1L86A 2OE7X 1L74A 3G3VA 260LA 1B6IA 4ARMA 1C61A 1L22A 125LA 1L15A 2OU9A 1L03A 1L65A 1CU3A 1L79A 173LA 4EKQA 3HH4A 1L48A 1L14A 1PQDA 1L61A 3OE9A 1C6BA 222LA 189LA 1LYFA 4I7MA 139LA 4S0WA 1L57A 3RZEA 249LA 4EPFA 214LA 107LA 1L71A 4ARLA 1L92A 199LA 151LA 166LA 1C66A 1CU5A 2B6ZA 1P7SA 1L94A 262LA 1L07A 1WTHA 109LA 218LA 1OWZA 2RBQA 163LA 195LA 1CTWA 3HUKA 155LA 4ZPUA 4W59A 239LA 1T8AA 138LA 1L85A 1ZURA 2OEAX 1QS5A 1C60A 1L50A 209LA 1L38A 238LA 4W58A 3JR6A 110LA 162LA 171LA 142LA 197LA 1XJTA 3NY8A 1L33A 232LA 158LA 1L26A 3SN6R 2ANXA 1I6SA 224LA 3HWLA 1L96A 4EKRA 1C6QA 1KW7A 210LA 1KNIA 1L60A 1L21A 188LA 190LA 230LA 3LZMA 4ARMB 4GRVA 1D9WA 237LA 216LA 172LA 1L34A 1L67A 1T6HA 3CDQA 1QUOA 1L64A 2OU0X 3FADA 1L70A 2O4WA 1PQKA 1L68A 1CV5A 157LA 2OTZX 3HTBA 1PQMA 192LA 1L82A 2RB2X 6LZMA 259LA 3HH5A 3SB8A 1L0KA 2B7XA 2F47A 2HUKA 4OO9A 3C83A 191LA 2IGCA 3GUPA 1L30A 3SBBC 1C6IA 3DMZA 213LA 3NY9A 3DMVA 2F2QA 3DN1A 1SSWA 4W54A 1JTMA 217LA 3DN4A 148LE 2O7AA 1CV1A 256LA 196LA 3SB5A 1L69A 3G3WA 178LA 1L49A 1LI3A 3C80A 1QS9A 1C68A 2RB1X 4I7OA 3C7WA 1L80A 1JTNA 3DMXA 1L04A 3C7YA 1T8GA 3GUKA 115LA 1C64A 1L08A 3HTGA 1P2RA 1L52A 1L06A 1L05A 1SX2A 1L89A 1G07A 3L2XA 1OVJA 129LA 1L75A 1L40A 3GUMA 229LA 4PJZA 181LA 1L35A 1C6FA 1KS3A 3GUNA 1L54A 1L83A 3CDOA 1LYDA 4I7PA 258LA 2B6WA 1CUQA 1DYBA 228LA 3DN2A 3HDFA 1C6KA 2B74A 1LLHA 113LA 130LA 1LYGA 165LA 1QT5A 1SSYA 3HDEA 1L28A 3V2YA 1P5CA 227LA 211LA 137LA 1L95A 3DN8A 1KY1A 1L93A 1SWYA 4W52A 174LA 2CUUA 4W56A 127LA 246LA 1L20A 1C63A 2B72A 2Z6BA 244LA 2RAYX 1P36A 245LA 251LA 186LA 1L72A 123LA 2B70A 1L84A 212LA 1QUDA 1G1WA 1L00A 1LPYA 120LA 2B75A 1P56A 4I7RA 2RH1A 3C8SA 1C67A 1QT8A 1C6PA 215LA 143LA 247LA 234LA 2NTHA 1DYAA 104LA 2B6XA 183LA 3PDSA 3CDRA 170LA 1G0MA 1G0QA 1L41A 1T97A 1L98A 3SB9A 160LA 252LA 3OE6A 198LA 243LA 231LA 176LA 1CV0A 1JQUA 4LDEA 103LA 3C8RA 1P2LA 3HTDA 1XJUA 1KY0A 1D3NA 248LA 1L46A 2QB0B 4PK0A 141LA 4DAJA 3HT8A 225LA 3HUAA 3V2WA 1QT3A 1P64A 2LZMA 1C6HA 184LA 3ODUA 1KW5A 156LA 3UONA 253LA 4YXCA 146LA 1CU6A 1C69A 1P46A 2OU8A 1L56A 1L31A 4I7LA 4K5YA 4LDOA 1L23A 4W55A 3CDVA 1L17A 2RBPA 1CUPA 3C8QA 1C6EA 240LA 159LA 1QUHA 1C6LA 1OVKA 1L13A 2NTGA 1L11A 1QUGA 2OE4X 1K28A 1L47A 1OV5A 4EJ4A 145LA 1L91A 1L09A 1L43A 2QARC 4ARQA 1G0LA 4W51A 4LZMA 1C62A 1CV4A 128LA 167LA 2O79A 1L0JA 2A4TA 3RUNA 2B73A 1TLAA 3SB6A 140LA 1PQOA 3OE8A 4IAPA 1L44A 1L02A 2LCBA 3D4SA 1QTCA 1LWKA 5I14A 1P6YA 4ARPA 255LA 3DN6A 3F8VA 1L53A 1L18A 1L58A 2B6YA 1D2WA 119LA 3HH3A 4I7KA 1DYEA 1L37A 1L99A 1OYUA 3EMLA 1L62A 1LGWA 4I7QA 1ZWNA 242LA 149LA 1LYHA 3HT7A 1DYFA 1G0KA 1L66A 3GULA 111LA 1G0JA 180LA 1P37A 3PBLA 4I7SA 1L90A 1T8FA 122LA 2F32A 1L01A 250LA 3VW7A 1CX7A 200LA 1C6CA 1P3NA 1LW9A 3DNAA 1CX6A 4I7TA 1LYJA 1QTDA 3GUJA 233LA 3GUOA 2ANVA 3QAKA 1LI6A 4LDLA 1ZYTA 1L81A 102LA 164LA 7LZMA 1D3JA 2L78A 4ARQB 1CV3A 1D2YA 205LA 5LZMA 1L97A 1L39A 2LC9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZQ4A 1CV6A 1L77A 2ZNWY 3TXKA 4ZEEA 2D4JA 4LGKA 4KXIA 1XGTC 2Z2FA 1C65A 131LA 5FEKA 1ZVYB 4HV2A 2LZ2A 5E4PA 2G4NA 4NGYA 1QTVA 3WPLA 3SBAA 1B9OA 4AXTA 201LA 1B5XA 5F14A 4OWCA 1C6TA 1UIAA 5B05A 1QT4A 1L88A 4XJIA 1LJEA 1SWZA 4XN6A 4YEMA 1G7MC 1LZEA 2BQFA 1J1XY 4LT3A 4DDBA 112LA 3HTFA 1IP3A 1L10A 4GCBA 1D6QA 1BGIA 1L24A 3NYAA 3B72A 2OTYX 1RJCB 3A6CY 1GBZA 1IP2A 2Z37A 3C82A 1DQJC 1LKSA 1OVHA 3A92A 182LA 1GFGA 208LA 4KPMA 4NSJA 3A6BY 1RI8B 2RBSA 1PQIA 2HEFA 2A7DA 3HT6A 3P64A 5L3HA 4NHIA 4H1PA 1QDTA 1REZA 2XBRA 4NG1A 1L29A 2F4GA 3WVYA 4IATA 1RCMA 1UIDA 3EMSA 1LJFA 1HMLA 4YXAC 1LYZA 241LA 4DKLA 1L12A 3D9AC 4PGJB 1C43A 254LA 1G0GA 3B0KA 3DN3A 1LJ4A 1L32A 4W94A 3FA0A 226LA 1CJ6A 1YKYX 4Z98A 2HECA 4H91A 1LMQA 260LA 4NGKA 1L15A 1C10A 3RZ4A 1L65A 1B7OA 5II3A 173LA 1L48A 4U3XB 3OE9A 1C6BA 1BWJA 4I7MA 4NFVA 249LA 3WUNA 4EOFA 2EQLA 1V7SA 2HTXA 5IDDA 2EKSC 4DDAA 1CU5A 4WM1A 2BLXA 5A3EA 4LYBA 4ML7A 4WOAA 1AM7A 4WO9A 1VDQA 1OWZA 195LA 3HUKA 4B4EA 239LA 1UACY 4NGOA 1LZ4A 4H9HA 3HBHA 1LYSA 1QS5A 5D5FA 5C6JA 1C46A 1UIGA 3ZVQB 4DC4A 1JJ0A 1LHMA 4OWAA 1IR7A 4J7VA 4ETEA 1L96A 1SLYA 6LYZA 1LAAA 3QE8A 3AGHA 4WLDA 133LA 4NHSA 1L60A 1L21A 190LA 5DL9A 3CDQA 1L34A 4AGAA 1T6HA 1QUOA 2OU0X 5I4XA 3AGGG 4IJ4A 4GLAA 2DQDY 1L82A 1GB3A 2RB2X 4H8XA 4FDYA 3SB8A 2B7XA 1LPIA 4H8YA 4LT2A 4CFPA 4ET8A 2ZQ3A 191LA 2IGCA 1L30A 3DMZA 5B07A 213LA 4CGEA 1LZAA 2H9JA 3A3QA 217LA 148LE 196LA 2ZIJA 2BQOA 1BWIA 3HFMY 1OUIA 1L80A 3C7YA 4GCEA 1L52A 1L06A 4H9AA 2BQHA 3L2XA 4OWEA 129LA 1GF7A 2DKVA 3BKVA 4B49A 1C6FA 3GUNA 3TXHA 4LFPA 4HTKA 4I7PA 1LZ9A 5E9RA 1KXWA 1LZBA 113LA 130LA 1LYGA 3HDEA 2ZILA 3V2YA 3D3DA 3WYHA 3DN8A 1SWYA 4PHIA 1JKAA 5KXKA 1LMOA 4W56A 1CKHA 127LA 246LA 2I25L 3TXEA 1IOSA 1RE2A 1BB4A 244LA 1WTMA 2XJWA 1IO5A 5F9UA 4UWVA 1A4VA 1L00A 1LPYA 1UC0A 3C8SA 1C6PA 1IC7Y 2XTHA 3A93A 1IY3A 143LA 2NTHA 1LJHA 1WQPA 4NG8A 3A3RX 183LA 2XBSA 3TMXA 1HFYA 2HEDA 1LHKA 3CDRA 1G0MA 1CJ9A 1FBIX 1LZYA 3QNGA 243LA 176LA 2ZIKA 1P2LA 3HTDA 1XJUA 248LA 2FBDA 1L46A 4G4CA 3CSRA 4DAJA 4GCCA 1LZ5A 1KW5A 3W3EA 1LZRA 2ZYCA 4XJFA 5FHWA 1GXV2 1UIBA 4LDOA 3CQLA 1KIRC 4LYCA 4HJVA 4QEQA 1TCYA 1C6LA 1QSAA 1GB5A 1QTKA 1CKFA 145LA 1IX0A 1OUAA 1GBWA 1LJIA 4I0CA 1UIEA 1LMCA 1LJJA 4M4OA 4RDSA 1L0JA 1F10A 4BAFA 4DDCA 140LA 1PQOA 1L44A 2HEEA 2LCBA 3D4SA 1VEDA 1PS5A 4NY5A 1P2CC 3MGWA 1WQMA 3F8VA 1L18A 3ATNA 4DWXA 1D2WA 4I7KA 1LSNA 1DYEA 3EMLA 4B4JA 4DD2A 1EL1A 4TUNA 2GV0A 4J1BA 1BVKC 3HT7A 2Z38A 3GULA 3PBLA 4NWHA 1JJ1A 3A34A 4WM5A 1IY4A 200LA 3BKHA 3RT5X 1NDMC 4I7TA 1CX6A 4WM6A 1VAUA 2ANVA 1PZYA 2BQBA 1B0DA 1DKKA 1B5WA 4ARQB 9LYZA 1D2YA 3LZ2A 1IWWA 3WH1A 1YIKA 1L73A 5FDJA 118LA 2YVBA 1LSDA 2DQIY 3F9LA 1TBYA 1L76A 223LA 1VDTA 3CT1A 1B7SA 3VWOA 2IFFY 4GBRB 4YX7C 5KXSA 4H8ZA 1IIZA 3FE0A 3TXBA 1QSQA 1OWYA 1OUFA 3ATOA 3WXUA 1OV7A 4OOOA 261LA 1IC4Y 4NSIA 4GN3A 3C7ZA 1B7LA 1DYDA 4EPIA 1L45A 2I6ZA 3CDTA 4EKPA 4XADA 4HV1A 1C6DA 1JITA 2Q9EA 1B5UA 4I7JA 4N1EI 1D3MA 1DI5A 5FCPA 3KAMA 1LHLA 4NWEA 1C6JA 1L19A 114LA 1GPQC 2Z19A 1EQ4A 1QTBA 4E3UA 177LA 1LGUA 4YOPA 2Z39A 1LSYA 3AW7A 1HMKA 1QT6A 5I4YA 3AZ6A 175LA 1I56A 2OE9X 4H93A 1JISA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZQ4 A;  1CV6 A;  1L77 A;  2ZNW Y;  3TXK A;  4ZEE A;  2D4J A;  4LGK A;  4KXI A;  1XGT C;  2Z2F A;  1C65 A;  131L A;  5FEK A;  1ZVY B;  4HV2 A;  2LZ2 A;  5E4P A;  2G4N A;  4NGY A;  1QTV A;  3WPL A;  3SBA A;  1B9O A;  4AXT A;  201L A;  1B5X A;  5F14 A;  4OWC A;  1C6T A;  1UIA A;  5B05 A;  1QT4 A;  1L88 A;  4XJI A;  1LJE A;  1SWZ A;  4XN6 A;  4YEM A;  1G7M C;  1LZE A;  2BQF A;  1J1X Y;  4LT3 A;  4DDB A;  112L A;  3HTF A;  1IP3 A;  1L10 A;  4GCB A;  1D6Q A;  1BGI A;  1L24 A;  3NYA A;  3B72 A;  2OTY X;  1RJC B;  3A6C Y;  1GBZ A;  1IP2 A;  2Z37 A;  3C82 A;  1DQJ C;  1LKS A;  1OVH A;  3A92 A;  182L A;  1GFG A;  208L A;  4KPM A;  4NSJ A;  3A6B Y;  1RI8 B;  2RBS A;  1PQI A;  2HEF A;  2A7D A;  3HT6 A;  3P64 A;  5L3H A;  4NHI A;  4H1P A;  1QDT A;  1REZ A;  2XBR A;  4NG1 A;  1L29 A;  2F4G A;  3WVY A;  4IAT A;  1RCM A;  1UID A;  3EMS A;  1LJF A;  1HML A;  4YXA C;  1LYZ A;  241L A;  4DKL A;  1L12 A;  3D9A C;  4PGJ B;  1C43 A;  254L A;  1G0G A;  3B0K A;  3DN3 A;  1LJ4 A;  1L32 A;  4W94 A;  3FA0 A;  226L A; 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