1L75A

Multiple stabilizing alanine replacements within alpha-helix 126-134 of t4 lysozyme have independent, additive effects on both structure and stability
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWAAAAAAAAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Multiple alanine replacements within alpha-helix 126-134 of T4 lysozyme have independent, additive effects on both structure and stability.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l75A00
1L57A 3L64A 4ARMB 1L80A 2RH1A 1DYCA 3SBAA 259LA 185LA 2NTGA 3OE8A 1P5CA 108LA 1G0PA 1P3NA 1L55A 1L25A 1C61A 1L26A 1QT7A 2RB2X 4K5YA 4EXMA 3CDRA 1KY0A 1G0GA 1L10A 4E97A 3DN8A 1SSWA 155LA 262LA 1C65A 4YX7C 1QT8A 3SB6A 2F2QA 1B6IA 3HU8A 4W58A 1L60A 1KNIA 1QT4A 1PQDA 4PJZA 1L53A 1T8AA 2F32A 2OTYX 1L74A 2B6ZA 1L18A 1KS3A 1C6QA 2B73A 229LA 220LA 1G0LA 1L93A 114LA 4ARLA 138LA 1CV6A 1QS9A 1XEPA 2OE4X 4I7OA 198LA 222LA 1L94A 3HT9A 1T8GA 1C60A 1L76A 1L23A 2A4TA 148LE 149LA 1L99A 4W57A 1L22A 224LA 2RAYX 1C68A 213LA 5LZMA 197LA 3F8VA 4I7JA 1L42A 112LA 1QUHA 123LA 1L61A 1L12A 1PQJA 1L79A 2OTZX 3HUKA 1L54A 240LA 3HTFA 129LA 1C6JA 1LYDA 237LA 3SBBC 1L47A 2OU0X 1G0QA 1C6PA 254LA 2RBNA 1DYFA 1LLHA 1L41A 3DN0A 1TLAA 1L11A 180LA 1P37A 184LA 1SSYA 2O4WA 3HH6A 1L03A 3JR6A 3GUKA 1QTCA 1CUPA 1SWZA 1XJUA 145LA 1OVJA 128LA 1CU6A 233LA 161LA 152LA 2B74A 1P2LA 1P56A 2B6XA 4I7NA 2Z6BA 3V2YA 1CU3A 3HUAA 1CTWA 3NY9A 173LA 113LA 4PK0A 1L92A 1SWYA 1G07A 2RBQA 3V2WA 4GRVA 1QUGA 4I7KA 1C62A 1P64A 249LA 1QUOA 218LA 4I7QA 4W53A 166LA 1L50A 1DYDA 188LA 1L01A 1L0JA 3G3WA 214LA 1L46A 1QTHA 3D4SA 1D3JA 3DN2A 1L08A 1L75A 1C6NA 3G3VA 1L07A 4W55A 1CU5A 253LA 2NTHA 223LA 1DYBA 163LA 3HDFA 1G06A 1LYIA 2OU9A 1C6IA 1K28A 1D3NA 251LA 181LA 1L31A 1L70A 3GUOA 1EPYA 4EKPA 1L28A 3C80A 120LA 1G1WA 151LA 1L86A 1DYAA 230LA 1QT6A 4LDOA 2B72A 165LA 1L24A 1L0KA 3FA0A 3FADA 4I7SA 3SB5A 3C83A 247LA 4I7TA 261LA 1C66A 1L02A 3PBLA 1QTDA 3HTBA 1DYGA 1L35A 3C7YA 1LYFA 1L36A 4W56A 1L06A 186LA 1JTMA 1L87A 1L38A 1LPYA 1L97A 1L68A 3CDVA 3DN4A 221LA 1LI3A 1LW9A 219LA 260LA 3C8RA 3HTGA 176LA 4DJHA 3SB9A 211LA 7LZMA 3DKEX 3DMZA 236LA 2RB0X 192LA 3HTDA 2B6YA 215LA 1C67A 1L98A 2L78A 189LA 3HH3A 3PDSA 226LA 1C6FA 1LI2A 159LA 234LA 1CUQA 1L65A 3HUQA 169LA 1L45A 1C63A 3GUNA 1P46A 3CDQA 1LYEA 2O7AA 200LA 4YXCA 1LI6A 1QTBA 195LA 4W51A 1C6HA 102LA 1L20A 1L56A 4YXAC 241LA 1KY1A 255LA 131LA 1P7SA 1C6GA 104LA 3GUMA 2HUMA 3K2RA 3HH4A 4ARQA 1KW5A 2OU8A 3RZEA 4I7MA 3OE0A 2OE9X 1C6AA 1QTZA 245LA 1T6HA 3SB7A 242LA 227LA 210LA 1LGWA 178LA 2RAZX 201LA 196LA 246LA 2B70A 1G0JA 4IAPA 257LA 1LWGA 4DAJA 1L32A 1CV1A 1L34A 1OYUA 3ODUA 4DKLA 4ZPUA 1L95A 1QSBA 3DN6A 2B6TA 139LA 4GBRB 1L82A 4EJ4A 156LA 252LA 4LDEA 1L39A 1PQMA 3SB8A 1C6CA 1L84A 2B7XA 168LA 2Q9EA 1ZYTA 4AQNA 160LA 1I6SA 3CDTA 107LA 4EKQA 1L04A 143LA 3G3XA 1L89A 1CX6A 2LCBA 238LA 1L00A 109LA 1SX7A 4OO9A 137LA 2Q9DA 3DNAA 4EPFA 183LA 1L73A 1XJTA 3FI5A 1CV5A 170LA 1C6TA 1JTNA 1JQUA 3VW7A 1KW7A 239LA 127LA 3DN3A 1CU2A 3HH5A 3C81A 1P6YA 206LA 2ANVA 3L2XA 1L37A 1L05A 1L63A 4W59A 187LA 1L19A 1QT3A 150LA 3C82A 3CDOA 1C6MA 4I7LA 3GUPA 122LA 2RBPA 199LA 244LA 1L90A 1L40A 2RB1X 1L16A 1C6BA 1ZURA 1PQKA 111LA 1D2WA 1L64A 3C8QA 1CX7A 1PQOA 6LZMA 2CUUA 103LA 2QB0B 3NYAA 2O79A 1QS5A 5I14A 3HT7A 250LA 2B6WA 1D2YA 1P36A 110LA 1LWKA 2OEAX 3OE9A 1OV5A 1OVHA 1L44A 1OVKA 1L59A 3DN1A 1ZWNA 1DYEA 4S0WA 4ARMA 164LA 1L17A 2HUKA 3C7ZA 1CV3A 1QUDA 216LA 1L13A 1OWYA 1L43A 3C7WA 1WTHA 2F47A 1D3FA 1L15A 182LA 3DMXA 1L72A 1LGUA 231LA 4ARQB 130LA 162LA 1C6DA 4EKRA 1LYJA 1L62A 1QTVA 142LA 3SN6R 228LA 3HT6A 4I7RA 3DMVA 256LA 3GULA 2RBRA 3HU9A 2B75A 146LA 1LYGA 157LA 1NHBA 217LA 2RBOA 3GUJA 3C8SA 4LDLA 1QT5A 158LA 235LA 1L77A 1CU0A 1C64A 2QARC 3F9LA 144LA 175LA 141LA 3HT8A 1C6KA 1L58A 1P2RA 1L67A 209LA 126LA 1C6EA 4EKSA 3GUIA 3OE6A 1L14A 2HULA 1L71A 258LA 1L96A 212LA 2IGCA 191LA 140LA 177LA 205LA 147LA 1OWZA 4I7PA 1SX2A 2ANXA 3UONA 3LZMA 1T97A 1L21A 3QAKA 3NY8A 1L83A 1L81A 190LA 1L69A 1D9WA 4EPIA 1PQIA 1CV0A 1L49A 1C69A 115LA 1LYHA 2LZMA 2OE7X 118LA 1L09A 243LA 1G0MA 1L48A 4LZMA 1L52A 4ARJA 1G0KA 174LA 172LA 4W52A 3HWLA 3HDEA 1L88A 225LA 1CV4A 1G1VA 1L29A 1CVKA 1L85A 1D3MA 1L33A 1OV7A 1QSQA 3EMLA 125LA 119LA 248LA 1L66A 3RUNA 1L27A 2RBSA 1T8FA 171LA 1L51A 4ARPA 167LA 1C6LA 1L91A 2LC9A 1LGXA 1L30A 232LA 4W54A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GXRA 3TXBA 1BB4A 3TMXA 2NTGA 1QQYA 2DQIY 4PJ2C 3P68A 1L26A 4EXMA 3IWRA 1A2YC 2YBJA 3SB6A 4NGVA 4W58A 1L60A 1KNIA 2CWIA 5DN5A 5APFA 4CFPA 3AGHA 4NSJA 1L18A 1GE0A 4DYGA 2CDSA 229LA 1G0LA 1L93A 138LA 4UWUA 2OE4X 1CKCA 1GFHA 222LA 1L94A 3HT9A 3A92A 1NWGA 4NSHA 1YL0X 5KXKA 1LZTA 2RAYX 4NGJA 1C68A 4KXIA 4OW1A 4I7JA 2Y8PA 1LZAA 112LA 3TXGA 1A4VA 1PQJA 1IP3A 1L12A 2OTZX 1B7NA 1L54A 1LSZA 129LA 1LYDA 237LA 1OUBA 1C6PA 254LA 5II3A 2YDGA 4LYBA 1DYFA 1L41A 1IP2A 1L11A 4DDCA 1EL1A 3CQLA 2HEBA 1PS5A 2O4WA 5LA5A 1UIEA 1DI3A 1GB6A 1REMA 1QTCA 1CUPA 1I56A 1XJUA 145LA 1OVJA 1VDSA 3A94A 1CU6A 1IP7A 4ETAA 1P2LA 4TTDA 1RI8B 1CJ6A 2W1MA 5APDA 2FBBA 5APCA 1GF9A 3NY9A 173LA 113LA 2CJLA 2RBQA 3V2WA 2DQDY 2H9JA 4GRVA 2Z2FA 1AZFA 1P64A 1IIZA 249LA 218LA 1LZYA 5LVKA 166LA 132LA 188LA 4CFOA 5KJ9A 2BLXA 2DQHY 208LA 1LZ6A 253LA 5APEA 1DYBA 1GF6A 3AJNA 1LYIA 1K28A 2RSCA 2F4GA 4MCKA 4X3BA 120LA 1L86A 1DYAA 1VEDA 4RW2A 3FA0A 4WLTA 3SB5A 4DT3A 4HPEA 3C83A 1BVXA 4I7TA 1IO5A 1WTNA 3ATNA 1JTOL 4B4IA 1GBOA 2DKVA 3AW7A 1L35A 1CKDA 3WL2A 186LA 1KXXA 1KIQC 1GE3A 1VAUA 5LA8A 1GF5A 3CSZA 1L97A 3DN4A 4KT3A 4NHTA 1LPIA 1YKXX 2W1LA 5KXTA 3C8RA 3B6LA 3CB7A 2EKSC 1H87A 2A7DA 3DKEX 1FLUA 1D0KA 4WO9A 2LYOA 1LJGA 1DXJA 2L78A 4CJ2A 189LA 2HEAA 1FLQA 3LYOA 4H93A 1C6FA 1OUJA 2D91A 1CUQA 4LFXA 1NDMC 2XJWA 5L3IA 3D3DA 1I20A 4ZFPA 1G7LC 2O7AA 5LYTA 1JKDA 1C6HA 135LA 5HMVA 2BQFA 1RFPA 3K2RA 1LAAA 1YKZX 1KW5A 2OU8A 1JEFA 3TXFA 2OE9X 1IR8A 1C6AA 1QTZA 245LA 3SB7A 242LA 1GFRA 178LA 5KXRA 5HMJA 4WM1A 246LA 1G0JA 257LA 1LWGA 2N5ZA 1L34A 4DKLA 1J1XY 1L95A 3DN6A 1QDRA 3J6KA 1I1ZA 1L84A 2B7XA 1B7QA 2Q9EA 1ZV5L 3ULRA 1JITA 1AT6A 160LA 1I6SA 3G3BB 1LJFA 4NGWA 3CDTA 3TMWA 1GB5A 4G4HA 1XGRC 1DKJA 1L89A 1CX6A 4OWBA 1SX7A 1GB2A 3HBEX 2Q9DA 4EPFA 4B4EA 1LSEA 2YBIA 1L73A 1EQEA 5LINA 3DN3A 4WMGA 3C81A 2ANVA 3L2XA 1L05A 1L19A 122LA 1WVUA 2RBPA 5F9UA 1LMTA 2D4KA 5KY1A 1ZVHL 1C6BA 2C8PA 1GD6A 1PQKA 1L64A 1CX7A 5C6IA 3WXTA 2QB0B 3NYAA 153LA 2O79A 3AB6A 4OWCA 2B6WA 5J7CA 1D2YA 1JTTL 1L44A 1L59A 2Z37A 5F9XA 3B0IA 1DYEA 1YAOA 4N8ZA 1CV3A 5E4PA 1QUDA 216LA 1LHKA 1L13A 4OOOA 1QIOA 1L15A 3DMXA 4ARQB 1LZCA 162LA 3TXKA 1B5VA 1C6DA 3TXEA 1LYJA 2H5ZA 142LA 1UICA 2C8OA 4I7RA 3B72A 4IATA 3DMVA 1BWJA 1LZSA 3QE8A 2RBRA 5KKIA 3HU9A 2B75A 1GWDA 146LA 2I26L 6LYZA 5LAFA 2X0AA 3GUJA 5I5QA 1GF4A 1GFJA 5F81A 1CJ9A 1LZEA 1L77A 1CU0A 1C64A 175LA 4LT0A 1NF5A 1L58A 3WMKA 1L67A 1C6EA 1HERA 3OE6A 2BQEA 1L14A 1L96A 212LA 1KIPC 191LA 140LA 2BQAA 4G4BA 3WYHA 147LA 1OWZA 1NBZC 1SX2A 4LGKA 4BADA 3LZMA 1L81A 1L69A 1REZA 4EPIA 1PQIA 4NEBA 1L49A 2LZMA 5HLLA 4N1EI 4WLXA 1LHJA 1L52A 1LJ4A 4W52A 3HDEA 2ZILA 3IJUA 3J4GA 5B1FA 3EMLA 3RUNA 3T36A 1WQOA 4A7DA 1L27A 4NGKA 3CT1A 3W3EA 1OP9B 2IHLA 1HNLA 1REYA 4HJZA 1LHIA 1LZ4A 3WVXA 232LA 2LZTA 4QGZA 4ARMB 1L80A 2ZIKA 1VDTA 1DYCA 3OE8A 1C61A 1XEIA 1CJ7A 1QT7A 3TMVA 4YF2A 1BQLY 1KY0A 1G0GA 4H9EA 4E97A 5FDJA 1AKIA 1RJCB 4H9IA 4PHIA 2XBRA 3AZ5A 3HU8A 1HFXA 2LZ2A 1HEPA 1PQDA 2DQJY 2ZWBA 1T8AA 2F32A 1XGPC 3HBDA 4U3XB 2B6ZA 4GN4A 3BKHA 4XADA 8LYZA 1HC0A 1CV6A 5K7OA 1JJ3A 1QS9A 1XEPA 198LA 6LYTA 1ZMYL 1YKYX 2A4TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GXR A;  3TXB A;  1BB4 A;  3TMX A;  2NTG A;  1QQY A;  2DQI Y;  4PJ2 C;  3P68 A;  1L26 A;  4EXM A;  3IWR A;  1A2Y C;  2YBJ A;  3SB6 A;  4NGV A;  4W58 A;  1L60 A;  1KNI A;  2CWI A;  5DN5 A;  5APF A;  4CFP A;  3AGH A;  4NSJ A;  1L18 A;  1GE0 A;  4DYG A;  2CDS A;  229L A;  1G0L A;  1L93 A;  138L A;  4UWU A;  2OE4 X;  1CKC A;  1GFH A;  222L A;  1L94 A;  3HT9 A;  3A92 A;  1NWG A;  4NSH A;  1YL0 X;  5KXK A;  1LZT A;  2RAY X;  4NGJ A;  1C68 A;  4KXI A;  4OW1 A;  4I7J A;  2Y8P A;  1LZA A;  112L A;  3TXG A;  1A4V A;  1PQJ A;  1IP3 A;  1L12 A;  2OTZ X;  1B7N A;  1L54 A;  1LSZ A;  129L A;  1LYD A;  237L A;  1OUB A;  1C6P A;  254L A;  5II3 A;  2YDG A;  4LYB A;  1DYF A;  1L41 A;  1IP2 A;  1L11 A;  4DDC A;  1EL1 A;  3CQL A;  2HEB A;  1PS5 A;  2O4W A;  5LA5 A;  1UIE A;  1DI3 A;  1GB6 A;  1REM A;  1QTC A;  1CUP A;  1I56 A;  1XJU A;  145L A;  1OVJ A;  1VDS A;  3A94 A;  1CU6 A;  1IP7 A;  4ETA A;  1P2L A;  4TTD A;  1RI8 B;  1CJ6 A;  2W1M A;  5APD A;  2FBB A;  5APC A;  1GF9 A;  3NY9 A;  173L A;  113L A;  2CJL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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