1L91A

Similar hydrophobic replacements of leu 99 and phe 153 within the core of t4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAFINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Similar hydrophobic replacements of Leu99 and Phe153 within the core of T4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l91A00
1L65A 198LA 1CV5A 4W59A 1C67A 187LA 222LA 3C83A 1L70A 190LA 1L87A 1C6LA 3VW7A 4I7OA 4I7RA 1L41A 214LA 1L37A 1L55A 145LA 2RAZX 2F47A 3G3VA 4E97A 1LGUA 1L30A 1T8FA 1C6AA 1PQMA 2HUMA 1G0PA 1OYUA 3EMLA 2Z6BA 218LA 1P37A 1L36A 3DN2A 151LA 1DYDA 2B6XA 1L34A 3CDRA 1G0KA 1L95A 120LA 1LWKA 3HTFA 249LA 3V2YA 1LGWA 1T8AA 4ARQB 1QT5A 1G06A 2B7XA 1L17A 143LA 2LZMA 3G3XA 2OU9A 3HUKA 1L43A 242LA 1DYFA 1D2WA 1G07A 150LA 3GULA 3HTBA 1L48A 1WTHA 3G3WA 1QT7A 246LA 4YX7C 243LA 1L66A 122LA 1ZYTA 1L88A 4PK0A 236LA 1DYBA 1L89A 1G0GA 3C8QA 1C6EA 192LA 183LA 4LDEA 4S0WA 3JR6A 159LA 196LA 1C6HA 3NY9A 200LA 1L71A 251LA 4EKSA 1QUOA 1D3MA 1L19A 1PQDA 1ZWNA 1L92A 2ANVA 2A4TA 180LA 1C68A 1L57A 221LA 232LA 1DYCA 1L77A 1SSYA 3HU9A 4DJHA 253LA 1KW5A 3SB5A 4YXCA 102LA 250LA 1QTZA 219LA 3QAKA 3SB8A 3GUKA 205LA 1CV4A 125LA 1OVKA 3GUOA 1L01A 1L03A 1L35A 2OE4X 1L74A 1CTWA 3GUIA 1XJTA 1B6IA 226LA 1L05A 1LYEA 1C61A 1QTVA 3PDSA 3OE8A 181LA 1L56A 4DAJA 1LWGA 4ARJA 1L09A 3OE9A 166LA 1L39A 2LC9A 1KY1A 2F32A 1PQKA 3V2WA 261LA 4ARQA 189LA 1L31A 1QS9A 1KNIA 2HUKA 140LA 175LA 201LA 1L96A 3C7ZA 1L62A 254LA 1C6CA 3DMVA 3DN3A 1L25A 2CUUA 1SWZA 119LA 1C6FA 3L64A 1DYEA 147LA 1LW9A 2RBOA 1XEPA 206LA 1CV1A 210LA 258LA 2RBRA 260LA 4W57A 2OE9X 7LZMA 3CDTA 255LA 4ZPUA 177LA 1QTCA 3GUNA 2RBNA 1L45A 4IAPA 1L0JA 1CU3A 1L32A 3GUMA 248LA 2QB0B 131LA 1C6BA 1PQIA 1L08A 1T97A 5LZMA 1L49A 1L0KA 1G0QA 160LA 1L84A 3FADA 3HT8A 1QSQA 1L51A 220LA 3SBBC 3OE0A 1C6MA 3C80A 240LA 217LA 1L58A 3RUNA 1C62A 128LA 3DN4A 1P5CA 126LA 3UONA 3RZEA 3FI5A 1OVJA 238LA 3CDOA 1CU5A 4W53A 118LA 1SX2A 1KW7A 4I7LA 2RB0X 2ANXA 1P7SA 3SBAA 3NYAA 4W51A 115LA 161LA 152LA 1DYAA 1L22A 4W54A 1L33A 1L44A 3GUPA 1SSWA 3F9LA 3HH5A 4OO9A 1G1WA 3C8RA 199LA 230LA 247LA 2B75A 1L60A 123LA 1CV3A 1K28A 1C6QA 1G0MA 4EPFA 1L11A 1L79A 144LA 1C6TA 1KS3A 1L83A 1L26A 1G1VA 1JTNA 1L80A 235LA 3HH3A 1L14A 3HTGA 2RBQA 215LA 141LA 165LA 1L69A 4W55A 173LA 1D9WA 110LA 1L99A 1L18A 3SB7A 3DN8A 1L86A 191LA 1C69A 3SB6A 2RH1A 3CDQA 4AQNA 1L54A 252LA 1QS5A 109LA 4I7NA 4I7JA 225LA 2O79A 3C82A 1L20A 212LA 2OTZX 6LZMA 2QARC 3C7YA 4LDOA 4EKQA 1CX7A 3OE6A 2OU0X 1D3JA 2L78A 129LA 1L52A 4ARPA 1EPYA 1QT8A 4GRVA 127LA 244LA 1QUDA 1P2LA 3HU8A 171LA 2B6TA 3SB9A 138LA 233LA 2B70A 2Q9DA 170LA 1L68A 1C6JA 1OV5A 146LA 1L24A 1L16A 1L59A 2OTYX 1OV7A 4GBRB 1L04A 1C65A 1L12A 234LA 2RBSA 1LPYA 1CX6A 2O4WA 1C6KA 1C6PA 237LA 1G0JA 4EKPA 104LA 2OEAX 1C6GA 3DN1A 1QT6A 1L93A 113LA 169LA 4I7SA 3F8VA 3HDFA 3CDVA 3HH6A 3NY8A 1L61A 224LA 4ARMB 167LA 1P64A 1P6YA 176LA 1LGXA 157LA 1LI6A 1QTDA 1C60A 142LA 3GUJA 1CU0A 1L15A 4ARLA 1L81A 1L02A 1QTBA 4LZMA 3SN6R 1L07A 2B74A 197LA 1JTMA 3C81A 1NHBA 1L94A 1L63A 2B6WA 211LA 103LA 3HUQA 239LA 107LA 3PBLA 1L85A 1L72A 4I7TA 2RBPA 228LA 1L98A 1QUGA 241LA 1P3NA 2OE7X 172LA 1OVHA 3HT9A 231LA 3HWLA 1T6HA 209LA 3ODUA 2B73A 1QTHA 4K5YA 259LA 149LA 1D2YA 1L91A 1C6IA 1L06A 4DKLA 1C63A 139LA 1CUQA 4I7QA 4EKRA 137LA 2RB2X 1L50A 4W58A 1XJUA 262LA 2F2QA 1L21A 1L38A 2RB1X 2B6YA 1I6SA 1D3FA 1C64A 1L46A 1JQUA 178LA 148LE 229LA 158LA 1G0LA 1CU2A 1C6DA 1LYGA 2IGCA 1LYIA 1L40A 213LA 3DKEX 1L75A 2OU8A 1SX7A 188LA 3HH4A 1L73A 3D4SA 1LI2A 108LA 1CV0A 114LA 1P2RA 3DNAA 4EXMA 3DN0A 3K2RA 1L82A 168LA 2O7AA 111LA 1L47A 3HTDA 184LA 3DMXA 3HT7A 1QT4A 2B6ZA 1C6NA 1D3NA 1OWZA 1TLAA 1L10A 1L13A 1L27A 2LCBA 4EPIA 1CUPA 1QSBA 2NTGA 1PQOA 5I14A 4W56A 1L97A 1L28A 4LDLA 1OWYA 4EJ4A 2Q9EA 3HT6A 3HDEA 4W52A 1CV6A 1C66A 2NTHA 3C7WA 1L42A 1LI3A 1L67A 1SWYA 4ARMA 1L29A 162LA 1L90A 130LA 4I7KA 1CVKA 185LA 1LYJA 182LA 1LYDA 3DN6A 4YXAC 163LA 4PJZA 1PQJA 2HULA 3L2XA 1KY0A 1CU6A 3LZMA 195LA 1LLHA 2RAYX 164LA 256LA 156LA 155LA 174LA 2B72A 112LA 1L23A 216LA 245LA 3FA0A 1L53A 227LA 1P36A 1L64A 186LA 1P46A 223LA 1LYFA 3HUAA 3C8SA 1QT3A 1QUHA 257LA 4I7PA 1ZURA 1DYGA 1L76A 3DMZA 1T8GA 1P56A 1LYHA 4I7MA 1L00A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEEA 198LA 1QDTA 3LYOA 3C83A 1L70A 4M4OA 5AMYA 5JENB 4WOAA 214LA 145LA 2F47A 1JJ3A 1GAYA 3B6LA 4OWAA 4YF2A 1T8FA 1OYUA 5L3HA 2Z6BA 218LA 3LYZA 4UWUA 3E3DA 1JJ1A 3GXKA 3HFMY 2Y8PA 1LWKA 1GB0A 1LJIA 4YEOA 3V2YA 3LYTA 4ARQB 4RLMA 1L17A 2PC2A 3G3BB 4G9SA 242LA 5KXKA 150LA 3HTBA 1KXWA 4DQJA 1WTHA 2XBSA 3G3WA 246LA 2B5ZA 243LA 1DPWA 2BQEA 1L66A 4WLTA 3WUAA 1ZYTA 3RW8A 1F6SA 3WXTA 2C8PA 3B0IA 1G0GA 4DYGA 1C6EA 1GFVA 5KXYA 1FKQA 1HFZA 1V7SA 4MR1A 2IFFY 251LA 4PPOA 1LHIA 1NDMC 3KAMA 4NIJA 1AZFA 1ZWNA 4WO9A 134LA 3WYHA 2GV0A 1LZRA 180LA 1C68A 1L57A 1B7PA 4ETBA 5KKIA 1LZAA 1DYCA 1SSYA 253LA 1LSEA 5L9JA 1KW5A 1GDWA 1ZVHL 4YXCA 102LA 2MEFA 4LGKA 1JUGA 3N9EA 4NGKA 1LYZA 5F16A 1JEFA 3GUKA 3GUOA 1GFGA 1L03A 1LZ4A 1L74A 2YDGA 3GUIA 1XJTA 1B6IA 1L05A 1QTVA 3OE8A 181LA 1L56A 1LMPA 4ARJA 2HEDA 1KY1A 1F0WA 1FLQA 1LZYA 3A34A 3A92A 1KXXA 1L31A 3A95A 1B5ZA 1B2KA 1RJCB 2DQCY 4YENA 3AGGG 1XGQC 5DM9A 254LA 1QUSA 4TX7A 2CUUA 3EXDA 1DYEA 1F10A 1LZGA 1P2CC 4QY9A 1LMOA 3M3UA 4H8ZA 2FBBA 1YAMA 5KXSA 7LZMA 177LA 2ZQ3A 1L45A 4DQ7A 1LZ9A 1HEMA 131LA 1YKZX 1H6MA 5LZMA 1WQMA 1L84A 1GBSA 3HT8A 1IWXA 220LA 4TSBA 3SBBC 2ZIKA 2Z39A 1C6MA 3OE0A 3C80A 217LA 1AKIA 1LSBA 1PZYA 126LA 3W3EA 1IWTA 3WPKA 2CJLA 4Z46A 1LTMA 4KXIA 1B5WA 2RB0X 2ANXA 3BKVA 1WQPA 3LHMA 3NYAA 115LA 3IJUA 1JKDA 1LSAA 1DYAA 1L33A 1GB7A 1YKXX 3HH5A 4OO9A 1G1WA 199LA 230LA 1LSPA 2B75A 1MLCE 1CV3A 1K28A 1NBYC 1IORA 4EPFA 1L79A 1C6TA 1FDLY 1L83A 2F4AA 1G1VA 1JTNA 3HTGA 1L14A 4DWXA 2RBQA 4HPEA 173LA 1N4FA 1GFTA 5KXZA 3SB7A 191LA 4WM1A 4H9HA 5HMVA 1L54A 3B0OA 252LA 4LYBA 3N9AA 3FE0A 2BQAA 2OTZX 207LA 1W6ZA 2OU0X 1D0MA 129LA 4LYTA 4TSCA 4ARPA 1B9OA 4H92A 4NGOA 3HU8A 1GF7A 171LA 1B5YA 2B6TA 1GF8A 4NSGA 2B70A 2DQFC 1L24A 1L16A 4NGJA 4GBRB 1L04A 5F81A 3RU5A 4HV1A 1LPYA 2AUBA 2O4WA 4DD0A 2DQJY 3TMUA 1GB6A 4G4HA 3P68A 1LSGA 1GBXA 5C6IA 3CDVA 3HH6A 2NWDX 4CFPA 1P64A 4WG7A 4H94A 4B4JA 1LGXA 1OP9B 4CFOA 3HBHA 4RLNA 4GN5C 4LZMA 1UIBA 2H9JA 4Z3MA 1NHBA 1L94A 4N9RA 2BQIA 211LA 2HEFA 107LA 1I1ZA 1L85A 4H9BA 3QNGA 1IWYA 4H9EA 1QUTA 241LA 2OE7X 1DKKA 3WL2A 1YAPA 172LA 1LJKA 3TMXA 4K5YA 1VDPA 1L91A 2LYZA 1JTTL 4I7QA 1XJUA 2BQBA 1BHZA 1HC0A 4IATA 1AT6A 3CSZA 1WVUA 2BQCA 4OWHA 4HTQA 4WM5A 148LE 229LA 1G0LA 2ZNWY 1LYIA 1JISA 2OU8A 1SX7A 3HH4A 1LI2A 108LA 114LA 3DNAA 4EXMA 5LVIA 3DN0A 1NHEA 2BLXA 1LAAA 1QTKA 3DMXA 3HT7A 1QT4A 2B6ZA 3CT0A 1IC7Y 5B59A 1TLAA 1L10A 1L27A 4EPIA 1TBYA 2NTGA 5I14A 2BQDA 5B05A 1L28A 4LDLA 1OWYA 5E9RA 2Q9EA 1C43A 3HT6A 2BPUA 1JKBA 3C7WA 1LI3A 1SWYA 4ARMA 3A94A 130LA 2I26L 4YXAC 2BQKA 1B7MA 2BLYA 1CKHA 2ZWBA 4LYMA 2Z12A 1JSFA 2B72A 1L23A 4XJGA 4ETEA 1P46A 223LA 3HUAA 1QT3A 1DYGA 1L76A 3DMZA 1LZCA 1AT5A 4HP0A 3A3QA 1P56A 1LYHA 4WM4A 4A7DA 4W59A 1LZSA 5KXRA 4UWVA 1C6LA 3VW7A 4I7OA 1L41A 1BVKC 2MEGA 2RAZX 4G4CA 1UACY 2MEAA 4E97A 1C6AA 2HUMA 1G0PA 1GE2A 1GBYA 1YAOA 1P37A 1LSDA 1LZ6A 2B6XA 4LFPA 3CDRA 1L95A 120LA 1LSZA 249LA 2YBJA 1OUAA 5FEKA 1QT5A 5I54A 4GCCA 4XJFA 4DQ5A 2OU9A 1D2WA 3FI7A 2HUBA 1L48A 5KXPA 4NHIA 1G7IC 1GF0A 4DD2A 4YX7C 4EOFA 2XJWA 4BAPA 122LA 5LAFA 4PK0A 4OOTA 236LA 1BB4A 3K3TA 3C8QA 5LVKA 1XGUC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ZEE A;  198L A;  1QDT A;  3LYO A;  3C83 A;  1L70 A;  4M4O A;  5AMY A;  5JEN B;  4WOA A;  214L A;  145L A;  2F47 A;  1JJ3 A;  1GAY A;  3B6L A;  4OWA A;  4YF2 A;  1T8F A;  1OYU A;  5L3H A;  2Z6B A;  218L A;  3LYZ A;  4UWU A;  3E3D A;  1JJ1 A;  3GXK A;  3HFM Y;  2Y8P A;  1LWK A;  1GB0 A;  1LJI A;  4YEO A;  3V2Y A;  3LYT A;  4ARQ B;  4RLM A;  1L17 A;  2PC2 A;  3G3B B;  4G9S A;  242L A;  5KXK A;  150L A;  3HTB A;  1KXW A;  4DQJ A;  1WTH A;  2XBS A;  3G3W A;  246L A;  2B5Z A;  243L A;  1DPW A;  2BQE A;  1L66 A;  4WLT A;  3WUA A;  1ZYT A;  3RW8 A;  1F6S A;  3WXT A;  2C8P A;  3B0I A;  1G0G A;  4DYG A;  1C6E A;  1GFV A;  5KXY A;  1FKQ A;  1HFZ A;  1V7S A;  4MR1 A;  2IFF Y;  251L A;  4PPO A;  1LHI A;  1NDM C;  3KAM A;  4NIJ A;  1AZF A;  1ZWN A;  4WO9 A;  134L A;  3WYH A;  2GV0 A;  1LZR A;  180L A;  1C68 A;  1L57 A;  1B7P A;  4ETB A;  5KKI A;  1LZA A;  1DYC A;  1SSY A;  253L A;  1LSE A;  5L9J A;  1KW5 A;  1GDW A;  1ZVH L;  4YXC A;  102L A;  2MEF A;  4LGK A;  1JUG A;  3N9E A;  4NGK A;  1LYZ A;  5F16 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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