1L92A

Similar hydrophobic replacements of leu 99 and phe 153 within the core of t4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAIINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Similar hydrophobic replacements of Leu99 and Phe153 within the core of T4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l92A00
1QSBA 3OE0A 3JR6A 110LA 1CU2A 1QT6A 4EJ4A 3HTFA 144LA 1L01A 257LA 3C83A 1OV5A 3GUJA 1C6GA 188LA 1CV6A 4W56A 3HWLA 1L47A 4I7NA 190LA 2B6ZA 128LA 199LA 1LGXA 218LA 239LA 6LZMA 1ZURA 1L76A 1PQIA 1L73A 4AQNA 2OTYX 1L27A 3SB9A 174LA 2F2QA 1OWYA 169LA 159LA 1SWYA 4EXMA 3C8SA 4I7LA 3SB6A 102LA 1L70A 4ARQA 2NTGA 184LA 3HUAA 3C7WA 3HDFA 1KY1A 1L88A 259LA 3OE9A 1L0KA 1SSYA 1LI2A 1L57A 1L63A 1L21A 1CV5A 1JTMA 1L48A 181LA 1L29A 1C6PA 1QUDA 1L46A 3NY9A 1SWZA 3GUPA 250LA 211LA 5LZMA 1QTBA 1LYEA 1L90A 1T6HA 172LA 1QTVA 1EPYA 198LA 3ODUA 157LA 229LA 3HUQA 115LA 1L07A 122LA 4YXAC 2RBOA 2A4TA 2O4WA 4I7SA 4K5YA 4ARPA 1KW5A 109LA 1L79A 1LGUA 3FA0A 3C8QA 3OE8A 1DYFA 228LA 2B73A 1C6BA 4DAJA 141LA 137LA 1QT3A 166LA 3RUNA 2B6YA 2RBQA 3HT8A 1L09A 163LA 4S0WA 3G3WA 1L91A 1C6MA 1K28A 1KS3A 1JTNA 1L03A 1QTZA 2HUMA 1L0JA 1CUPA 1D3FA 1L00A 1P46A 162LA 1CU0A 230LA 4EPIA 2F32A 3DKEX 4ARQB 3OE6A 1XEPA 1B6IA 1L08A 3D4SA 1P6YA 3GUNA 237LA 120LA 1L69A 3SB5A 234LA 1PQOA 1QUGA 216LA 150LA 1T8FA 4DJHA 2B70A 1L44A 3GUKA 118LA 3C8RA 2OE7X 1L94A 1L61A 1L53A 1L22A 1C6AA 3HDEA 1G07A 1L24A 140LA 1L95A 3LZMA 130LA 4W59A 1L37A 2IGCA 165LA 4DKLA 1OV7A 1C63A 4W57A 1G1VA 3HT7A 1DYGA 1LYGA 1LYJA 1C68A 1CX7A 1L85A 249LA 196LA 1T8GA 1CV3A 231LA 180LA 189LA 1PQDA 1L04A 1L52A 1L14A 1LGWA 1LYIA 1L98A 238LA 1L49A 232LA 182LA 219LA 3C81A 210LA 2CUUA 1P3NA 1L23A 1L92A 1G1WA 2RB1X 1L15A 1L58A 3VW7A 1OVKA 3F9LA 1L66A 248LA 221LA 4W58A 127LA 1QUHA 1G06A 1XJUA 1L65A 1C60A 3K2RA 197LA 255LA 1L05A 145LA 260LA 3FADA 3QAKA 4W54A 1L72A 1CU6A 1D3NA 4I7RA 244LA 3DMXA 1L75A 3CDOA 1C6TA 3DN2A 1L59A 1LLHA 205LA 168LA 1L54A 1PQKA 4W52A 1P7SA 1QT8A 201LA 2O7AA 1L82A 131LA 1CV4A 1L80A 1L74A 3C7ZA 1ZWNA 167LA 2F47A 176LA 1L33A 3PBLA 3CDVA 2RBPA 1L25A 4I7QA 1G0LA 1L84A 1L83A 252LA 2B75A 2B7XA 236LA 2LZMA 2RAZX 3GUIA 1QTHA 151LA 1L77A 4E97A 1OWZA 246LA 147LA 114LA 1CU3A 1LYDA 2OU9A 1KY0A 4ZPUA 177LA 2Q9EA 1P36A 4ARLA 1PQJA 195LA 119LA 2HULA 4LDLA 3DN6A 1D2YA 4I7PA 1L71A 1C67A 4I7OA 4EKRA 3DMVA 1C62A 171LA 2OU0X 3FI5A 1SX2A 111LA 227LA 4I7KA 3DMZA 108LA 240LA 3PDSA 2RAYX 4ARMA 125LA 1CVKA 1L51A 1QTDA 3L64A 183LA 2QB0B 1L38A 1QUOA 1L93A 206LA 123LA 1LI6A 3HH4A 1L18A 192LA 3GULA 1KW7A 2NTHA 3HH5A 4YXCA 1CUQA 225LA 1L32A 2ANXA 1L96A 1G0QA 2B6WA 242LA 243LA 164LA 1CX6A 1C6FA 200LA 235LA 1C6KA 1LYHA 1L16A 4EKSA 1L99A 3CDRA 4LDOA 3V2YA 1L50A 1QS9A 1QT5A 149LA 2OU8A 1L43A 2L78A 3DN4A 113LA 1L26A 2RH1A 1L67A 262LA 3DNAA 3HTBA 253LA 1L45A 4W51A 1L41A 1C6IA 3G3VA 1L31A 1ZYTA 1L62A 3DN1A 187LA 3HUKA 258LA 3DN0A 1L42A 1C6HA 1C6QA 3NY8A 1L55A 1L10A 251LA 155LA 4PK0A 3EMLA 146LA 1LI3A 3HH6A 1QT4A 1G0JA 158LA 4ARMB 1G0PA 2HUKA 1JQUA 3RZEA 241LA 2RBNA 1D2WA 1C6CA 1L19A 1SX7A 1P37A 1L30A 170LA 4W55A 1C64A 215LA 4GRVA 1D9WA 1DYBA 2QARC 4IAPA 1L60A 1C65A 1G0GA 1D3JA 1L86A 4PJZA 160LA 2LCBA 1CU5A 3HH3A 175LA 3HU8A 173LA 3CDTA 7LZMA 1DYCA 1L68A 2OE4X 2OTZX 256LA 3HU9A 1LW9A 1P2RA 3NYAA 233LA 1L64A 3HT9A 1QSQA 1L36A 3F8VA 1C69A 1L34A 1L02A 3UONA 3GUOA 4ARJA 1CV1A 1OVHA 1P56A 2B6TA 220LA 1DYEA 1DYDA 5I14A 107LA 2OE9X 1L12A 4EPFA 1LWGA 1DYAA 4I7MA 247LA 1C6DA 1LYFA 156LA 4I7JA 212LA 4YX7C 2B72A 1CTWA 261LA 1NHBA 1P2LA 1C66A 4LZMA 1XJTA 1L89A 1QS5A 1L06A 1L40A 4LDEA 1L20A 1L56A 1P64A 1OYUA 1L35A 1L28A 4OO9A 1T8AA 186LA 1L97A 213LA 1PQMA 3HTGA 4I7TA 2Z6BA 2LC9A 1L17A 161LA 1L81A 2RB2X 1G0MA 104LA 3SB8A 1C6NA 222LA 1SSWA 1LWKA 3HT6A 1WTHA 1TLAA 2RBSA 4W53A 185LA 3C7YA 1D3MA 223LA 3DN8A 2B6XA 226LA 1CV0A 2OEAX 254LA 3C80A 1OVJA 139LA 1L11A 3CDQA 138LA 1L39A 1C6LA 2RB0X 3GUMA 1C61A 143LA 4EKQA 1QTCA 126LA 1G0KA 142LA 4EKPA 103LA 1LPYA 2Q9DA 217LA 1L87A 3SBAA 1C6EA 3SBBC 4GBRB 2ANVA 129LA 1T97A 3SB7A 3V2WA 2B74A 3G3XA 1P5CA 2O79A 214LA 3L2XA 1C6JA 1L13A 224LA 3C82A 209LA 2RBRA 191LA 1I6SA 3SN6R 245LA 152LA 1QT7A 178LA 1KNIA 112LA 3DN3A 3HTDA 148LE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QSBA 4DDAA 1LHMA 3GUJA 4ZEEA 1CV6A 3HWLA 2DBTA 4NSGA 5KXMA 1LGXA 218LA 1YILA 3E3DA 1L76A 1PQIA 4AQNA 5C6JA 1L27A 4C3WA 1OWYA 4UWUA 1JSFA 3C8SA 3B6LA 3W6EA 4XJFA 1FN5A 3OK0A 1GFAA 1F0WA 2MEBA 1KY1A 4DD3A 1LI2A 1IP7A 2MEGA 1L21A 2DQAA 1CV5A 1TAYA 1HEOA 1AM7A 1L46A 1SWZA 3GUPA 3EXDA 3TXHA 1L90A 2BQAA 1EPYA 5HQ1A 5HMVA 157LA 115LA 1OUDA 2BQDA 2G4PA 2A4TA 2O4WA 3G3BB 4HTQA 5IDDA 3WU8A 1OQMA 4XJHA 3ATNA 1XEJA 3K3TA 3FA0A 1H6MA 2HU1A 5KXPA 4B1AA 1C6BA 4H9CA 4BAPA 137LA 1OUJA 1QT3A 2HEBA 1BVKC 3G3WA 1L03A 5FDJA 1OUGA 2DQDY 3WW5A 1L0JA 1CUPA 1B7PA 230LA 1GF6A 2F32A 1WQPA 1B6IA 4NGVA 120LA 1QUGA 4NGLA 150LA 2B70A 2MEAA 1GF7A 1LJEA 1L44A 4H92A 4CHXA 5F16A 3C8RA 2OE7X 5B06A 1P2CC 3OJPA 5E9RA 1L61A 5D5FA 4LYCA 1AT5A 1CKHA 1DKJA 1LJIA 1BWHA 5KXXA 1OUBA 130LA 5KXOA 1A4VA 5HNCA 1OV7A 4L41A 4HP0A 5APCA 1O23A 1LYJA 1F6SA 1T8GA 4ETEA 2DQEY 189LA 4EMNA 1L98A 1AZFA 2YBMA 2CGIA 1ZV5L 1CKDA 4B0DA 1P3NA 1L23A 2MEHA 4LT2A 1L15A 1G7HC 3VW7A 1GDWA 1YROA 1LKRA 4XENA 1QUHA 1G06A 2HU3A 7LYZA 1BWJA 5FHWA 3CQLA 3J6KA 3QAKA 4UWVA 1LSMA 1CU6A 4KXIA 1D3NA 4I7RA 244LA 1L75A 205LA 168LA 1PQKA 4HPIA 4HSFA 1P7SA 4W52A 1EQ5A 4NSJA 1ZWNA 167LA 1YKYX 1NQIA 3PBLA 1IC7Y 4Z46A 2ZIJA 3A93A 2YSSC 1L25A 4I7QA 1L84A 1H87A 4FJRA 2H9KA 3GUIA 1CU3A 1LYDA 1GF8A 3T6UA 177LA 4ZPUA 4Z98A 1CJ8A 1B7OA 1QUSA 4ARLA 3W6FA 3TXBA 3WUNA 4I7PA 4QGZA 3TXKA 5LINA 1QIOA 1C67A 4EKRA 3DMVA 3FI5A 1QSWA 3FE0A 108LA 3PDSA 2BQMA 1CVKA 1QTDA 3L64A 1L38A 1LJGA 1F6RA 3TXJA 4ETDA 2Z2FA 1GBZA 4DD1A 4OWCA 3AZ4A 3HBDA 123LA 1JHLA 1LI6A 3HH4A 5AMYA 193LA 1L18A 4NG8A 1KW7A 5APDA 1L32A 2FBBA 4TSCA 2B6WA 2MECA 4LFPA 1AT6A 243LA 1LTMA 3QY4A 1CX6A 3GXRA 1C6FA 1FDLY 200LA 4EKSA 1B7QA 4NEBA 1LOZA 3V2YA 1QS9A 4DDBA 5II3A 2G4NA 4MCKA 2BLXA 1LJNA 1QQYA 3DNAA 253LA 2BQIA 1LSEA 1L41A 4G4CA 1C6IA 1ZYTA 258LA 1C6HA 1L55A 2Z39A 1LZ1A 1W6ZA 1VDPA 1JQUA 4E3UA 1C7PA 1MELL 4RDSA 4H91A 1NF5A 1C64A 4XYYA 1PZYA 4X3BA 2BQGA 4IASA 4PJZA 2LCBA 1UIAA 3HU8A 5J7CA 2OE4X 4WMGA 4LYZA 3NYAA 233LA 4NGJA 1QSQA 3F8VA 2DQIY 1GBXA 1OVHA 4BAFA 2B6TA 1NMMA 2ZIKA 1DYDA 5I14A 5A3EA 107LA 2OE9X 5B1FA 5KXLA 8LYZA 4I7MA 247LA 1BB5A 4N1EI 5HNLA 1LYOA 1LMOA 3D3DA 1CTWA 1NHBA 1EQEA 1L40A 1L56A 1OYUA 1QUTA 1TCYA 3AB6A 3HTGA 4I7TA 4N5RA 2LC9A 1L17A 1IC4Y 1NKHA 4WM4A 4LYBA 1RFPA 1LSZA 1WTHA 1TLAA 4NGYA 3C7YA 1B5WA 1IR8A 1SLYA 1CV0A 1J1PY 2XBRA 1V7TA 1L11A 3CDQA 3GUMA 143LA 1QTCA 126LA 1LPYA 2BQBA 1ZMYL 1L87A 1YL0X 1I1ZA 4U3XB 3SB7A 4XJGA 1YKXX 214LA 2BQOA 4GLAA 2RBRA 1LZ4A 1I6SA 1HFZA 2I26L 1KXWA 3DN3A 2BLYA 3A92A 1HFYA 3J4GA 1LMCA 1RE2A 208LA 1HERA 2LHMA 4WL7A 188LA 4HJVA 1NHEA 1FLYA 1L47A 4I7NA 4XJBA 128LA 3RW8A 5KXTA 239LA 1ALCA 2RSCA 1ZURA 2OTYX 207LA 174LA 1GEZA 1JIYA 4I7LA 3SB6A 1UUZC 184LA 1HFXA 3C7WA 1GBOA 2YBNA 259LA 1L0KA 3A6BY 1SSYA 2BAAA 1GB6A 1YIKA 3WU7A 181LA 1LSCA 3B0OA 1T3PA 4WG1A 5LZMA 4NIJA 1QTBA 1LYEA 4DD0A 2CDSA 1IWUA 1XEKA 1LZYA 2ZNXY 4LZTA 1LZNA 1QTEA 4HPEA 1LJJA 4B4EA 4ARPA 4XJIA 2H5ZA 1C08C 1IP6A 228LA 4G9SA 2B73A 5L3HA 1YANA 3CT1A 5APFA 4LYMA 5L9JA 4DAJA 2B6YA 4DQ5A 1LYYA 1LSNA 4RLNA 1L09A 1BQLY 1L91A 1GFGA 3P64A 1QTZA 3TMUA 2IHLA 1P46A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QSB A;  4DDA A;  1LHM A;  3GUJ A;  4ZEE A;  1CV6 A;  3HWL A;  2DBT A;  4NSG A;  5KXM A;  1LGX A;  218L A;  1YIL A;  3E3D A;  1L76 A;  1PQI A;  4AQN A;  5C6J A;  1L27 A;  4C3W A;  1OWY A;  4UWU A;  1JSF A;  3C8S A;  3B6L A;  3W6E A;  4XJF A;  1FN5 A;  3OK0 A;  1GFA A;  1F0W A;  2MEB A;  1KY1 A;  4DD3 A;  1LI2 A;  1IP7 A;  2MEG A;  1L21 A;  2DQA A;  1CV5 A;  1TAY A;  1HEO A;  1AM7 A;  1L46 A;  1SWZ A;  3GUP A;  3EXD A;  3TXH A;  1L90 A;  2BQA A;  1EPY A;  5HQ1 A;  5HMV A;  157L A;  115L A;  1OUD A;  2BQD A;  2G4P A;  2A4T A;  2O4W A;  3G3B B;  4HTQ A;  5IDD A;  3WU8 A;  1OQM A;  4XJH A;  3ATN A;  1XEJ A;  3K3T A;  3FA0 A;  1H6M A;  2HU1 A;  5KXP A;  4B1A A;  1C6B A;  4H9C A;  4BAP A;  137L A;  1OUJ A;  1QT3 A;  2HEB A;  1BVK C;  3G3W A;  1L03 A;  5FDJ A;  1OUG A;  2DQD Y;  3WW5 A;  1L0J A;  1CUP A;  1B7P A;  230L A;  1GF6 A;  2F32 A;  1WQP A;  1B6I A;  4NGV A;  120L A;  1QUG A;  4NGL A;  150L A;  2B70 A;  2MEA A;  1GF7 A;  1LJE A;  1L44 A;  4H92 A;  4CHX A;  5F16 A;  3C8R A;  2OE7 X;  5B06 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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