1L95A

Similar hydrophobic replacements of leu 99 and phe 153 within the core of t4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTVRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Similar hydrophobic replacements of Leu99 and Phe153 within the core of T4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l95A00
3C83A 1QSBA 2B6TA 1D9WA 1L06A 142LA 175LA 4S0WA 1DYFA 102LA 1L96A 1PQDA 3DN8A 1G0JA 1SWYA 3ODUA 1L46A 2B6WA 4I7RA 1SWZA 178LA 1L05A 1D2YA 3QAKA 3HTBA 2F32A 4W53A 125LA 2RB0X 1LYGA 2LCBA 3HT8A 3G3WA 1CU3A 2OU8A 1NHBA 2O79A 4I7JA 1L01A 3HH4A 3PBLA 1L72A 3CDOA 187LA 1L92A 1QTDA 4EKQA 3SB8A 2OTYX 4ARPA 1C6JA 1OV7A 195LA 1C6LA 1L19A 170LA 1SSWA 2HUMA 1OYUA 2OU9A 3HUAA 111LA 1LGUA 4DAJA 1C6BA 1CV0A 1L90A 2RB1X 4DJHA 1P5CA 2B6ZA 1C6EA 1L64A 1T6HA 211LA 1KY1A 1PQMA 4I7LA 1C6TA 114LA 4YX7C 1L30A 141LA 2OE4X 1L48A 189LA 1L81A 210LA 128LA 1OVHA 1L57A 3NYAA 6LZMA 3OE9A 169LA 1L23A 1QUGA 2NTGA 3HT7A 1G0QA 2RBOA 1G0GA 2RBNA 4I7NA 2O7AA 4W59A 229LA 1QS9A 2OEAX 4OO9A 227LA 139LA 1LLHA 1L91A 174LA 1L62A 4GBRB 113LA 1P3NA 3C8SA 1P7SA 2CUUA 3CDTA 3GUJA 4E97A 3CDQA 3C8RA 1G06A 3FADA 2RBPA 155LA 1LPYA 1DYGA 5LZMA 1XEPA 1D3JA 218LA 1L73A 177LA 1L98A 1G1WA 3C8QA 161LA 1L32A 1C66A 3HDFA 3OE0A 4ARQB 3GUKA 3RZEA 1QT5A 143LA 1L11A 1L20A 1K28A 1CTWA 1ZWNA 3V2YA 1LYIA 2Q9EA 122LA 112LA 138LA 1L71A 213LA 166LA 1JTNA 1L56A 140LA 190LA 1L76A 1C6AA 1L39A 3NY9A 4ARMA 3C82A 2RH1A 1CV4A 1P56A 3SB6A 1QTVA 1L0KA 184LA 261LA 1L45A 199LA 214LA 4ARJA 1CVKA 1WTHA 2RBQA 4I7PA 4K5YA 167LA 104LA 1L74A 2NTHA 1L12A 1C60A 1CU6A 1LI3A 1T8GA 4AQNA 3HUQA 3HWLA 3SB9A 3D4SA 120LA 4LDOA 4LDEA 149LA 129LA 3C7ZA 1OWYA 2Z6BA 1L34A 1QSQA 173LA 1LYEA 1L60A 1PQIA 4I7KA 145LA 2RAZX 5I14A 1L79A 1TLAA 2RAYX 3SB7A 3DN3A 1L04A 4EXMA 1CU5A 1KW5A 4IAPA 4EKRA 1B6IA 115LA 1LYDA 157LA 176LA 1L18A 4DKLA 1LYJA 1QTZA 219LA 4W58A 4W56A 1L22A 2OE7X 1P2LA 3DN1A 1DYEA 147LA 254LA 1L68A 1CX7A 2B74A 1C63A 228LA 156LA 2L78A 1L08A 222LA 196LA 2F47A 1L27A 1C6MA 1C65A 2ANVA 3HUKA 4LDLA 215LA 1L86A 246LA 1CUQA 162LA 172LA 3CDRA 192LA 1CU0A 232LA 2OE9X 1C67A 4YXCA 3UONA 1G0PA 1DYAA 126LA 188LA 209LA 4EKPA 107LA 2B6XA 182LA 191LA 2LC9A 244LA 1L14A 4I7TA 1L59A 1JQUA 110LA 1LYHA 1L65A 1C6CA 1QUHA 165LA 1D2WA 1L37A 1L02A 1L94A 3HT6A 262LA 1L66A 1SX7A 1L29A 1C6IA 4W57A 4EPIA 3HH6A 1QT4A 231LA 1G1VA 1C6PA 1EPYA 1PQJA 243LA 224LA 130LA 1LI2A 3C80A 158LA 127LA 1P2RA 103LA 2ANXA 159LA 160LA 1T8AA 1KNIA 3FA0A 3FI5A 1L43A 163LA 1QUDA 1CX6A 3SBBC 1P37A 2HUKA 1L42A 1L93A 3RUNA 221LA 1L69A 1L13A 2RB2X 3DN6A 1L33A 1C6KA 2HULA 257LA 233LA 1C6QA 1QT6A 1C68A 1QTCA 3C81A 2A4TA 1JTMA 255LA 1KY0A 3HH5A 226LA 2F2QA 1KS3A 186LA 3F8VA 1L00A 150LA 1L0JA 1L75A 1CUPA 1QUOA 164LA 1L51A 2B70A 4ARMB 1L41A 206LA 3EMLA 1D3MA 1L82A 4W55A 1L47A 1G0KA 1D3FA 1C61A 1L50A 1SSYA 146LA 3GUPA 3L2XA 1LWKA 1LW9A 1QT7A 212LA 152LA 2QARC 1L35A 247LA 3DKEX 1XJTA 230LA 3C7YA 1L88A 1LYFA 4ARLA 1P36A 4EJ4A 4GRVA 234LA 3DMXA 3C7WA 1L24A 1C6HA 1L97A 260LA 3DNAA 1L03A 3HTDA 3HDEA 1L63A 1C69A 3DMVA 3LZMA 1L80A 4ZPUA 3V2WA 1LWGA 3HT9A 1D3NA 1OWZA 1L95A 2OU0X 3OE8A 123LA 1L67A 1L77A 1QTBA 201LA 1QT3A 1L84A 185LA 2LZMA 251LA 1L61A 3G3XA 4PK0A 131LA 2B75A 248LA 1OVJA 3SBAA 3HU8A 1XJUA 3SN6R 1DYCA 3F9LA 2B72A 109LA 3DN0A 144LA 3GUNA 4I7MA 3SB5A 118LA 1L36A 1T8FA 1L25A 1L07A 1CV5A 258LA 1L17A 2B6YA 2B7XA 245LA 3HH3A 220LA 237LA 4W52A 7LZMA 1P6YA 1CU2A 151LA 3GUIA 1DYBA 1L58A 183LA 3PDSA 3GUOA 1ZURA 252LA 1OVKA 4LZMA 1G0LA 4EKSA 1L15A 1L85A 168LA 239LA 238LA 1SX2A 1C62A 1L21A 1I6SA 236LA 198LA 250LA 249LA 1L52A 3HTGA 1CV1A 148LE 1L10A 1L28A 1L55A 241LA 3DN2A 1L31A 1L53A 1QS5A 217LA 205LA 4I7SA 1L83A 1L09A 1CV6A 2O4WA 2IGCA 1L87A 253LA 223LA 1C6NA 4W54A 3DN4A 171LA 1L54A 242LA 3NY8A 4ARQA 1CV3A 3G3VA 4PJZA 3VW7A 4EPFA 1KW7A 1P46A 1C64A 1QTHA 1L16A 3CDVA 4YXAC 1L70A 1LI6A 1L49A 3L64A 1L26A 3K2RA 4W51A 200LA 216LA 119LA 256LA 3DMZA 235LA 1P64A 4I7OA 225LA 1G0MA 1L38A 2RBRA 259LA 2OTZX 1DYDA 3HTFA 197LA 1PQKA 181LA 240LA 1LGWA 3GULA 1L40A 4I7QA 1T97A 1L44A 1LGXA 2B73A 3HU9A 3GUMA 180LA 1C6GA 1OV5A 1L99A 108LA 1C6DA 2Q9DA 3OE6A 137LA 1G07A 3JR6A 1C6FA 1ZYTA 1L89A 1QT8A 2QB0B 2RBSA 1PQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QSBA 2B6TA 3AB6A 4AXTA 1C43A 4W94A 1PQDA 1L96A 1UIFA 4ETCA 3ODUA 1LSNA 2B6WA 2W1LA 4I7RA 4AGAA 1F6RA 1SWZA 2ZYPA 3AGIA 178LA 3HTBA 1HELA 125LA 1B5VA 4LT0A 4DD1A 2LCBA 1CU3A 4KT3A 1NHBA 2O79A 4NGKA 2W1YA 4H90A 3SB8A 3AW6A 1OV7A 1GB0A 1HEOA 4LFPA 4DD0A 4KL7A 1B0DA 1P5CA 1GBWA 2B6ZA 211LA 1KY1A 3WVXA 5KXKA 5LAFA 2C8OA 3TXKA 1C6TA 4NSGA 114LA 141LA 2OE4X 210LA 6LZMA 1OVHA 1IP7A 1L57A 1LHMA 2YBNA 1LZBA 1QUGA 1REXA 3IWRA 3HT7A 4XJFA 4CJ2A 4I7NA 1V7SA 229LA 4TSBA 1QS9A 1JJ0A 4B1AA 227LA 1LLHA 1FN5A 1IWWA 1YQVY 1L62A 4GBRB 1YANA 1JTOL 4Z3MA 1NMMA 2GV0A 4G4BA 3TXHA 1OUEA 1G06A 2RBPA 1LPYA 1QSWA 5LZMA 5IHGA 1D3JA 1L73A 1VAUA 2D4JA 3A96A 4TUNA 3P66A 1WQMA 5LAGA 3EMSA 5APDA 1G1WA 1CKFA 1GF9A 1C66A 3HDFA 3OE0A 3WU9A 4DWXA 1IORA 3GUKA 2Q9EA 112LA 138LA 1L71A 3VWOA 1FDLY 190LA 1L76A 4NGOA 4ETAA 5ILFA 1XGTC 1GB5A 1L45A 1LHHA 1XGQC 4DD3A 4DDBA 4K5YA 1GBOA 1UIAA 1T8GA 3HUQA 1D6QA 4WO6A 4DYGA 3EBAB 120LA 1LZ5A 1GB3A 4HTNA 149LA 3C7ZA 2Z6BA 1G7IC 1QUTA 2A7FA 4M6DA 4XJIA 2RAYX 5DLAA 4EXMA 1CU5A 4EKRA 1B6IA 4PJ2C 115LA 5K7OA 3OK0A 1LYJA 1QTZA 3ULRA 1LJIA 219LA 1N4FA 1L22A 1JTPL 3DN1A 1CX7A 1BWJA 1JKDA 196LA 1UIHA 1DI4A 1C6MA 1G7HC 4LDLA 1L86A 1UICA 232LA 1IWVA 3UONA 188LA 3AYQA 209LA 1GF8A 2MECA 4NG8A 1NQIA 5APEA 1F0WA 2LC9A 244LA 1GB6A 1L14A 1L65A 3G3BB 1D0LA 2MEIA 3WULA 165LA 2WARA 1L02A 1UC0A 4WG1A 1HEWA 2RSCA 6LYZA 1L94A 3HT6A 262LA 1LJHA 1SX7A 1C6IA 4W57A 207LA 231LA 4DD2A 2H5ZA 1OUGA 224LA 4CFOA 3IJVA 1LI2A 3C80A 1IX0A 1CJ6A 4H9EA 2ANXA 159LA 1T8AA 1IO5A 1NWGA 4H9BA 1VDQA 4QEQA 1CKHA 4N1CC 3GXRA 3DN6A 1L33A 3W6DA 1C6QA 1HENA 1QIOA 1QT6A 4LT3A 1PZYA 1C68A 2A4TA 1JTMA 2BQIA 194LA 5FSTA 4HJVA 3F8VA 1WQQA 1VFBC 1QUOA 4B4IA 2H9KA 4G4CA 2DBTA 1HFYA 4I8SA 4B4JA 1B5WA 1G0KA 1A2YC 4HV1A 1SSYA 3GUPA 146LA 3A90A 4NGYA 1LWKA 4WM3A 212LA 152LA 1LSPA 1L35A 247LA 4OW1A 1OP9B 1E8LA 1LYFA 4G9SA 2XJWA 1P36A 1LKRA 4LT2A 3BKVA 234LA 2A7DA 4B49A 1GWDA 1AT5A 2FBDA 1L63A 3DMVA 1LWGA 7LYZA 1LHJA 1CKGA 1D3NA 1L67A 5LVHA 2F2NA 3HBEX 1L61A 153LA 3QY4A 3HU8A 1XJUA 3SN6R 1DYCA 2BPUA 3F9LA 2B72A 4LZTA 4MSTA 144LA 3GUNA 4I7MA 5F9XA 1JKBA 1JITA 1BHZA 1OUIA 4HV2A 1L25A 1L07A 1CV5A 2B6YA 3AZ4A 220LA 237LA 4RW2A 7LZMA 3CT0A 3GUIA 1L58A 183LA 4H8ZA 4GN5C 4HTKA 5KXXA 1DQJC 239LA 1SX2A 1DKJA 5LVKA 198LA 3FI7A 1SLYA 249LA 3WYHA 1L52A 4D9ZA 1L28A 1KXXA 1RE2A 3LYMA 205LA 1GXV2 1L83A 3RNXA 4II8A 3F6ZA 1L87A 4W54A 4ZFPA 171LA 1L54A 242LA 2HTXA 4C5FA 4H94A 5F14A 4ARQA 4YF2A 2CJLA 4PJZA 1YIKA 2W1MA 1CKDA 1HF4A 200LA 3DMZA 225LA 1L38A 2YBJA 1GF6A 1I1ZA 1V7TA 1FLYA 197LA 4IATA 181LA 240LA 3GXKA 4I7QA 3HU9A 2B73A 1ZVYB 1C6DA 2Q9DA 3T36A 4G49A 137LA 5KXYA 2RBSA 1PQOA 1D9WA 142LA 2I25L 1DYFA 1C45A 1LHIA 3WUMA 4OWEA 1GB9A 2YBLA 3W6AA 1D2YA 1LZYA 2F32A 2G4NA 1IWXA 4NGVA 2OU8A 3TMUA 4I7JA 4DC4A 1GFAA 3HH4A 3PBLA 2ZIKA 4GCBA 4HTQA 3CDOA 2BQMA 187LA 1BVXA 1B5ZA 1CJ8A 2PC2A 1C6JA 4NEBA 1C6LA 3AJNA 4XJDA 4M4OA 3B72A 4PRQA 1SSWA 1LGUA 4DAJA 1C6BA 1CV0A 1REYA 1L90A 4DJHA 3ATNA 1C6EA 3WPKA 5LYZA 1GFKA 1BWHA 1FLUA 3G3AB 1LYSA 4R0FA 2BQLA 1L30A 1G0QA 2RBOA 2RBNA 5C6IA 2O7AA 4OO9A 1NHEA 5A3EA 113LA 3WU7A 1P7SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QSB A;  2B6T A;  3AB6 A;  4AXT A;  1C43 A;  4W94 A;  1PQD A;  1L96 A;  1UIF A;  4ETC A;  3ODU A;  1LSN A;  2B6W A;  2W1L A;  4I7R A;  4AGA A;  1F6R A;  1SWZ A;  2ZYP A;  3AGI A;  178L A;  3HTB A;  1HEL A;  125L A;  1B5V A;  4LT0 A;  4DD1 A;  2LCB A;  1CU3 A;  4KT3 A;  1NHB A;  2O79 A;  4NGK A;  2W1Y A;  4H90 A;  3SB8 A;  3AW6 A;  1OV7 A;  1GB0 A;  1HEO A;  4LFP A;  4DD0 A;  4KL7 A;  1B0D A;  1P5C A;  1GBW A;  2B6Z A;  211L A;  1KY1 A;  3WVX A;  5KXK A;  5LAF A;  2C8O A;  3TXK A;  1C6T A;  4NSG A;  114L A;  141L A;  2OE4 X;  210L A;  6LZM A;  1OVH A;  1IP7 A;  1L57 A;  1LHM A;  2YBN A;  1LZB A;  1QUG A;  1REX A;  3IWR A;  3HT7 A;  4XJF A;  4CJ2 A;  4I7N A;  1V7S A;  229L A;  4TSB A;  1QS9 A;  1JJ0 A;  4B1A A;  227L A;  1LLH A;  1FN5 A;  1IWW A;  1YQV Y;  1L62 A;  4GBR B;  1YAN A;  1JTO L;  4Z3M A;  1NMM A;  2GV0 A;  4G4B A;  3TXH A;  1OUE A;  1G06 A;  2RBP A;  1LPY A;  1QSW A;  5LZM A;  5IHG A;  1D3J A;  1L73 A;  1VAU A;  2D4J A;  3A96 A;  4TUN A;  3P66 A;  1WQM A;  5LAG A;  3EMS A;  5APD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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