1L96A

Structure of a hinge-bending bacteriophage t4 lysozyme mutant, ile3-> pro
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNPFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structure of a hinge-bending bacteriophage T4 lysozyme mutant, Ile3-->Pro.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l96A00
1T6HA 3PDSA 211LA 1CU3A 1L22A 1LI6A 2QARC 4K5YA 1T8FA 1L35A 1L0JA 1L75A 1SWZA 1C64A 1L86A 235LA 183LA 2B72A 2RBOA 1LPYA 2OU8A 1C6KA 152LA 139LA 2RBPA 1P7SA 1LW9A 2IGCA 239LA 158LA 3DN0A 1KW5A 1EPYA 1L29A 1C66A 1L99A 4PJZA 1L64A 1LI3A 1L18A 1L47A 1JQUA 2L78A 1G1WA 1ZURA 1D3JA 3HU8A 112LA 254LA 3C7ZA 4I7MA 4W51A 1L42A 2A4TA 244LA 1C6AA 1L02A 1L51A 2O7AA 159LA 118LA 3HUQA 3SB5A 1JTNA 1L62A 184LA 2B6XA 1DYBA 1C6IA 1C6BA 2B75A 1KY1A 214LA 1L57A 1L11A 1L46A 251LA 4I7JA 144LA 1QS5A 205LA 4LDEA 3HT6A 222LA 171LA 142LA 2RBNA 4ARPA 3HUAA 1NHBA 1QTDA 1L40A 161LA 1QT4A 1G07A 1C6EA 1LWKA 257LA 1PQIA 3G3WA 1L72A 1XJTA 1L20A 1G0QA 1OV7A 1QUOA 3CDTA 2B6TA 1L53A 3GUIA 3HH4A 1TLAA 1OYUA 258LA 3CDVA 197LA 3QAKA 189LA 1D3MA 1P36A 3UONA 1KNIA 1L82A 1QT8A 2RBSA 3DMZA 217LA 1L54A 1C6PA 3SBBC 1PQJA 232LA 1CV4A 3HDFA 186LA 2NTGA 1T8GA 1C6JA 1CV3A 3V2YA 1L81A 4I7QA 167LA 1L25A 3HH5A 1L91A 213LA 1L07A 185LA 1LGUA 1OVKA 1L01A 5I14A 3V2WA 1SWYA 3HWLA 1DYGA 3CDRA 1L10A 150LA 1L43A 1L27A 3DMXA 166LA 7LZMA 234LA 2Q9EA 1CU0A 4EKSA 3HUKA 1L63A 187LA 3OE6A 1CU5A 176LA 2F32A 1L85A 4I7SA 1L90A 4I7KA 255LA 1C61A 170LA 1L04A 148LE 1CX6A 3HH6A 231LA 4W58A 3DN6A 1LYFA 1G0LA 261LA 3RUNA 104LA 174LA 1L23A 1L68A 1L58A 1G1VA 188LA 1L56A 1L08A 247LA 1G0KA 1K28A 1LYJA 3SBAA 1L00A 1L59A 1P2LA 1QUHA 1L92A 1P46A 1B6IA 4I7RA 1L31A 1ZWNA 1LYEA 3GULA 1SSYA 2O79A 1LYHA 1QUGA 4DKLA 4DJHA 198LA 110LA 1DYAA 224LA 200LA 1KY0A 1L17A 4EJ4A 227LA 113LA 210LA 1D9WA 1DYEA 2RBQA 3ODUA 1CV1A 3HTBA 236LA 3HTFA 129LA 2OTYX 1L15A 3C81A 1C6TA 4YX7C 4ARQA 238LA 177LA 165LA 4W53A 4W57A 237LA 3SN6R 1L13A 3SB8A 175LA 228LA 1G0GA 2OE4X 3HT9A 3FADA 4S0WA 1L80A 1LGWA 1QT5A 3DN4A 1QTZA 1L97A 1QS9A 147LA 1D3NA 262LA 120LA 178LA 130LA 1CUPA 3HH3A 1LWGA 1XEPA 4EPFA 1L71A 1C6DA 1L0KA 1L39A 3L2XA 119LA 3GUJA 6LZMA 1DYFA 220LA 2CUUA 1PQOA 1QTHA 201LA 1LLHA 1L05A 4I7OA 3OE9A 3C7WA 241LA 4EXMA 4PK0A 4ARMB 3HU9A 1C6CA 3PBLA 1C65A 1L48A 3F9LA 4ZPUA 127LA 1LYDA 2OU9A 1D2WA 1L84A 1C67A 196LA 1C69A 1L70A 1SX2A 1WTHA 225LA 143LA 156LA 151LA 1L03A 2F2QA 114LA 4E97A 1L89A 3OE0A 229LA 1ZYTA 1L96A 3C8RA 4DAJA 149LA 3DN1A 1L69A 3DNAA 125LA 1G0JA 1I6SA 4I7PA 138LA 111LA 1L88A 1CV6A 1DYCA 155LA 260LA 4LZMA 1QT6A 1C62A 3VW7A 1CVKA 1L28A 3GUOA 195LA 2OTZX 1C6NA 1CX7A 3C8SA 4W59A 1XJUA 1CU2A 1CUQA 131LA 2ANXA 3L64A 3SB7A 1LGXA 1G0MA 4I7LA 226LA 1L93A 1QTBA 3SB6A 252LA 1C68A 1C6HA 1L87A 1T97A 181LA 1OVHA 4OO9A 4LDLA 206LA 107LA 3G3XA 1CU6A 1JTMA 1L09A 2B6YA 1SX7A 2OEAX 4LDOA 4ARMA 3RZEA 109LA 4YXAC 199LA 3HT8A 4EKQA 1LYIA 4I7TA 245LA 3CDQA 240LA 3DN8A 1QT3A 1L44A 2B70A 1SSWA 1OV5A 243LA 145LA 4IAPA 1L37A 242LA 1CTWA 1C6GA 1P5CA 3GUKA 1L32A 221LA 1L41A 2LC9A 3G3VA 1P64A 115LA 2RB2X 1CV5A 1L60A 2RBRA 250LA 1QSQA 1CV0A 1L30A 1L21A 2B6WA 140LA 4GBRB 2B6ZA 4W52A 1C6QA 3C80A 1C6FA 218LA 1L16A 2B74A 3C7YA 3FI5A 146LA 1L26A 1L76A 108LA 2HUMA 2HUKA 4EKRA 1L66A 169LA 2RH1A 1C6LA 190LA 223LA 1L67A 168LA 1L50A 1PQKA 3LZMA 141LA 3OE8A 1L77A 4ARLA 180LA 1P6YA 1G0PA 1L95A 1L49A 259LA 1L94A 122LA 1L73A 216LA 1OVJA 3C82A 248LA 1L52A 123LA 256LA 2ANVA 3SB9A 1QT7A 249LA 3HT7A 1OWYA 1L45A 102LA 4W56A 1L34A 3K2RA 1D3FA 1L79A 172LA 1D2YA 1QSBA 3DMVA 1KS3A 3GUPA 2OU0X 1P37A 2RB0X 3C8QA 4AQNA 3D4SA 3EMLA 3HDEA 1P2RA 2O4WA 3DKEX 1L19A 1C60A 173LA 157LA 1L12A 2LZMA 3JR6A 4ARJA 3CDOA 1L65A 1DYDA 2QB0B 2HULA 3NY9A 230LA 137LA 3DN2A 4EPIA 1C63A 1QTCA 4W54A 2LCBA 1L83A 1L74A 1KW7A 1P3NA 128LA 1L61A 1L33A 246LA 2RAZX 3GUNA 4EKPA 1L06A 253LA 2RAYX 3F8VA 3NY8A 209LA 126LA 233LA 163LA 1P56A 212LA 1L36A 3DN3A 5LZMA 1OWZA 164LA 3NYAA 1QTVA 219LA 1LYGA 160LA 1L14A 1PQDA 191LA 2OE7X 1L98A 162LA 1L38A 4I7NA 3HTDA 4ARQB 4W55A 2B73A 1L24A 1T8AA 2NTHA 1LI2A 3C83A 192LA 1QUDA 3FA0A 3HTGA 215LA 4YXCA 2F47A 2RB1X 2Z6BA 4GRVA 1G06A 103LA 1L55A 2Q9DA 1C6MA 1PQMA 2OE9X 2B7XA 182LA 3GUMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NKHA 3PDSA 1CU3A 4DD3A 5LIOA 4NGIA 1GE0A 1T8FA 1L35A 1L75A 1HHLA 1SWZA 4NSJA 3TXDA 2RBOA 1GEVA 1LPYA 2OU8A 1C6KA 4H91A 1P7SA 2IGCA 4PHIA 1L99A 1YKYX 4PJZA 2BQLA 5JENB 1GFEA 3GXRA 2YVBA 1G1WA 3C7ZA 4YENA 1LHMA 1L42A 4N5RA 2O7AA 159LA 118LA 1BQLY 1HELA 3SB5A 4DD2A 1GB5A 4XN6A 2B6XA 1YKZX 4L41A 3W6DA 1C6BA 4WM6A 1L11A 3WYHA 251LA 4I7JA 205LA 2ZQ3A 4LT1A 5D5CA 222LA 1HSWA 3HUAA 3RT5X 2HU1A 1QT4A 1LAAA 5DM9A 1G0QA 1OV7A 3CDTA 1HEPA 1LJ3A 3GUIA 5F9UA 5B06A 1OUEA 3DMZA 2DQHY 4N0JA 1L54A 3SBBC 1A2YC 1CV4A 1MELL 2IFFY 1L81A 4HJYA 1L25A 4DDCA 4AXTA 1FKQA 1LMNA 1G7MC 2BQFA 1GFKA 1IP4A 2HUBA 2YBHA 1ALCA 2LYZA 1L07A 1QSAA 1OVKA 1JPOA 3WXUA 3HWLA 4HV1A 1L10A 1O23A 3DMXA 3HUKA 1KIPC 1OUHA 1UACY 4NIJA 4HP0A 4I7KA 4CGEA 3AGHA 1LJGA 4NHQA 2HEDA 5APDA 3HH6A 231LA 1JTPL 3EO5A 2EIZC 1C7PA 261LA 1GB2A 1JJ3A 1L68A 1L58A 1L56A 1QUTA 3CT1A 1XFPL 1K28A 1YAPA 2W1MA 1L59A 1A4VA 2MEBA 1HFXA 1GBZA 3CQLA 1ZVHL 1GF3A 1LZ5A 2O79A 208LA 4DKLA 1T3PA 1C10A 1B5XA 224LA 1IC5Y 2DQIY 1LZ9A 1VDSA 1IWXA 113LA 2EPEA 210LA 4GCCA 3KAMA 1DYEA 2IHLA 3A6CY 4KPMA 1IWUA 236LA 1JWRA 4WO6A 2Z18A 4H94A 2H9JA 238LA 177LA 2HEBA 4NSGA 3TXEA 228LA 3HT9A 4B49A 1E8LA 1UIDA 3QY4A 4WM1A 1QS9A 1LMOA 1QQYA 1D3NA 178LA 3LYOA 1CUPA 2Y8PA 1LWGA 4EPFA 1L71A 1L0KA 3EBAB 2DQJY 4II8A 4WG1A 1OUBA 3GUJA 1XGUC 1OUAA 1QTHA 3W6EA 5K7OA 1UIGA 201LA 1L05A 4CJ2A 5L3IA 241LA 4EXMA 4PK0A 1BWJA 1XGRC 5B59A 1WQQA 1B5VA 2Q0MX 2OU9A 1B7QA 1L84A 2BLYA 196LA 1SX2A 1L70A 4UWNA 1IR7A 156LA 1L03A 3F6ZA 4OWBA 1LZ8A 229LA 1YROA 3TMXA 3N9EA 4DAJA 1QSWA 2LYOA 125LA 1G0JA 5HMJA 138LA 111LA 1L88A 1B7OA 5APCA 1GF8A 2FBDA 2MEAA 4DC4A 1QT6A 1C62A 3T6UA 1C6NA 3C8SA 1LZBA 1JIYA 2ZNWY 1JTOL 1CUQA 1IC7Y 1G0MA 4G4CA 226LA 1QTBA 1C68A 1GB9A 4NFVA 2BQOA 4Z41A 1C6HA 5I4WA 3WL2A 1L87A 1OVHA 4EMNA 4LDLA 1QIOA 1CJ7A 1OUGA 4ARMA 3A6BY 4YXAC 199LA 1UIEA 1LYIA 245LA 1GFHA 5DLAA 2B70A 1B7PA 1HFYA 2HEFA 5I54A 242LA 1P5CA 1IY3A 4H93A 5EBHA 5DL9A 5KXRA 5KXSA 1P64A 1WQOA 4IJ4A 4WL7A 1IWVA 1L30A 1LJEA 3ZVQB 4W52A 3WU7A 1GHLA 2ZQ4A 1OUJA 1B5ZA 1RI8B 146LA 2F30A 169LA 4R0FA 1W08A 190LA 1PQKA 3LZMA 3B0IA 3WU8A 1L49A 122LA 1JSFA 1OVJA 2W1YA 1L52A 123LA 4DD7A 2ANVA 1V7TA 4DD1A 4TX7A 1L45A 2Z39A 4NG1A 1VDQA 1F0WA 3A3RX 4LYTA 1P37A 1LJ4A 3D4SA 2G4PA 1P2RA 2O4WA 1XGPC 3P66A 2BQDA 2LZMA 4LYZA 3EMSA 1L65A 1DYDA 1HNLA 5F14A 2HULA 4YEMA 4EPIA 2BQKA 1KW7A 1AKIA 3GUNA 3N9AA 1HEMA 4UWVA 4NGLA 163LA 212LA 1L36A 1CJ8A 1IC4Y 4DWXA 160LA 6LYZA 4RW2A 2B5ZA 3LZTA 4I7NA 2ZILA 4ARQB 1LSEA 1L24A 1T8AA 2DKVA 1YL0X 4YXCA 4XJDA 2Z6BA 2I25L 1G06A 2BQNA 2OE9X 1GFVA 4FJRA 1TDYA 4MCKA 2QARC 1LKSA 2HTXA 1L0JA 3LZ2A 1LZYA 2FYDA 152LA 139LA 239LA 3DN0A 1LZSA 3IWRA 3WPJA 1CKGA 1LI3A 1L18A 1KXXA 1L47A 5HQ1A 4LYBA 1ZURA 1RJCB 112LA 254LA 1WQPA 4I7MA 3B0KA 4W51A 2A4TA 4XENA 1AZFA 3CT5A 1YAOA 1L51A 1B7NA 3HUQA 3CB7A 3A90A 2H9KA 1JTNA 1LMTA 5D5FA 1DYBA 1LMCA 5FHWA 1YAMA 4NHTA 214LA 1L57A 1EL1A 1AT6A 4UWUA 1GF0A 3A95A 1LSMA 4HPEA 2XTHA 4B1AA 3LYMA 1LPIA 1REYA 5T3FA 1C6EA 257LA 1LJJA 4DQ7A 3B72A 4RW1A 1LZNA 1LJKA 1QUOA 2B6TA 3WW5A 258LA 197LA 1RE2A 1D3MA 3UONA 1INUA 1VDTA 1KNIA 1DI4A 3TXHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NKH A;  3PDS A;  1CU3 A;  4DD3 A;  5LIO A;  4NGI A;  1GE0 A;  1T8F A;  1L35 A;  1L75 A;  1HHL A;  1SWZ A;  4NSJ A;  3TXD A;  2RBO A;  1GEV A;  1LPY A;  2OU8 A;  1C6K A;  4H91 A;  1P7S A;  2IGC A;  4PHI A;  1L99 A;  1YKY X;  4PJZ A;  2BQL A;  5JEN B;  1GFE A;  3GXR A;  2YVB A;  1G1W A;  3C7Z A;  4YEN A;  1LHM A;  1L42 A;  4N5R A;  2O7A A;  159L A;  118L A;  1BQL Y;  1HEL A;  3SB5 A;  4DD2 A;  1GB5 A;  4XN6 A;  2B6X A;  1YKZ X;  4L41 A;  3W6D A;  1C6B A;  4WM6 A;  1L11 A;  3WYH A;  251L A;  4I7J A;  205L A;  2ZQ3 A;  4LT1 A;  5D5C A;  222L A;  1HSW A;  3HUA A;  3RT5 X;  2HU1 A;  1QT4 A;  1LAA A;  5DM9 A;  1G0Q A;  1OV7 A;  3CDT A;  1HEP A;  1LJ3 A;  3GUI A;  5F9U A;  5B06 A;  1OUE A;  3DMZ A;  2DQH Y;  4N0J A;  1L54 A;  3SBB C;  1A2Y C;  1CV4 A;  1MEL L;  2IFF Y;  1L81 A;  4HJY A;  1L25 A;  4DDC A;  4AXT A;  1FKQ A;  1LMN A;  1G7M C;  2BQF A;  1GFK A;  1IP4 A;  2HUB A;  2YBH A;  1ALC A;  2LYZ A;  1L07 A;  1QSA A;  1OVK A;  1JPO A;  3WXU A;  3HWL A;  4HV1 A;  1L10 A;  1O23 A;  3DMX A;  3HUK A; 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