1L97A

Structure of a hinge-bending bacteriophage t4 lysozyme mutant, ile3-> pro
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNPFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structure of a hinge-bending bacteriophage T4 lysozyme mutant, Ile3-->Pro.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 53
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l97A00
235LA 1LYHA 4I7MA 209LA 245LA 1L28A 4W57A 4E97A 3RZEA 103LA 4IAPA 1L00A 2QARC 1L01A 2OE9X 1D3FA 3HH3A 242LA 3CDTA 104LA 1L99A 1DYGA 111LA 1L52A 1LI6A 1QUHA 4EKRA 3HH5A 152LA 3F8VA 1L25A 3HTFA 1SSWA 1P56A 2RBNA 3C8QA 3GULA 1QT3A 3SB5A 1G0MA 1L85A 1PQDA 2OU0X 4K5YA 4YXAC 1C65A 2IGCA 3HWLA 1P7SA 1JTMA 4EPFA 1D2WA 2OEAX 1C6AA 3SBBC 3GUMA 257LA 4PK0A 1JTNA 262LA 3V2WA 2NTHA 1CV5A 1PQMA 1L53A 3DMZA 3ODUA 181LA 1L84A 2LZMA 3C8RA 1L45A 4LZMA 1T8GA 1CV6A 219LA 170LA 1KW5A 109LA 1L95A 102LA 1L17A 2A4TA 1I6SA 1C6LA 2RBOA 3CDQA 1L24A 246LA 4I7JA 4ARLA 178LA 205LA 162LA 1L39A 4I7NA 1KS3A 260LA 3G3WA 130LA 2RBRA 1CU6A 144LA 237LA 1L46A 1L82A 1L44A 1C63A 2L78A 4W51A 4EJ4A 1C6HA 160LA 1SX7A 123LA 1D3JA 1QTBA 1CV1A 1QTCA 2RBSA 236LA 3HTBA 166LA 156LA 187LA 1DYFA 1L59A 1QS9A 1C6GA 3HUQA 3CDVA 1DYBA 3PDSA 3C7ZA 1L51A 3GUOA 1C69A 258LA 1LI2A 1L0JA 4S0WA 131LA 168LA 3G3XA 3OE6A 3HUKA 1C6CA 2RB1X 1CX7A 1D9WA 1L0KA 3L64A 3HU9A 1L63A 3OE9A 1D3NA 1D2YA 182LA 254LA 1CV4A 122LA 247LA 1L03A 3DMVA 1LYJA 199LA 3SBAA 1C61A 248LA 1G06A 3HT7A 4ARMB 3QAKA 1OYUA 143LA 4LDEA 2Z6BA 3L2XA 1KY0A 1LWKA 5I14A 239LA 129LA 220LA 1C67A 1CX6A 3PBLA 4W59A 3HDFA 107LA 146LA 4I7SA 1CU5A 190LA 244LA 2OU8A 2RAZX 212LA 4GRVA 223LA 1L67A 1L36A 2O79A 1LW9A 4I7PA 3SB8A 1L56A 2O4WA 198LA 1B6IA 1LLHA 4LDOA 232LA 1L14A 256LA 3DKEX 1L86A 1L42A 164LA 230LA 169LA 147LA 1L09A 3C82A 3SN6R 4I7KA 4PJZA 1L61A 2OE7X 3NYAA 4W54A 1C60A 4W53A 1L76A 3DN3A 1L04A 1G0LA 206LA 163LA 3JR6A 1L48A 1L43A 1L70A 1LYIA 1C6BA 2RB0X 1P2RA 222LA 184LA 3C7WA 2B6TA 210LA 261LA 1L64A 1P64A 2F2QA 1L55A 1SWYA 4I7TA 1G1WA 2RBPA 1L68A 2HUMA 1L16A 4EKPA 1PQJA 2B7XA 3C83A 1LGUA 1PQOA 3OE0A 4ARQB 1C6TA 215LA 196LA 3FADA 3GUKA 5LZMA 185LA 3DN4A 1LYEA 2RBQA 1LPYA 1L19A 1L23A 1L20A 1L81A 191LA 234LA 1L38A 2B74A 4I7RA 3HT8A 1C6QA 2B70A 1QUDA 4EXMA 1C6JA 1L35A 252LA 3V2YA 1C68A 241LA 1LYDA 3D4SA 183LA 233LA 243LA 231LA 1L87A 1LYFA 126LA 1G0QA 216LA 1KNIA 1LWGA 6LZMA 1P46A 114LA 3DN1A 1C6KA 175LA 1L07A 1L65A 3GUNA 4W55A 137LA 150LA 1T8AA 3HTGA 4DAJA 3NY8A 2RB2X 1C6MA 1OVHA 1L94A 1P5CA 1P3NA 3DMXA 176LA 2O7AA 195LA 1WTHA 3UONA 1L33A 1LGXA 1L60A 255LA 2NTGA 3C8SA 4YXCA 2QB0B 1QT6A 1C6DA 4ZPUA 113LA 2B6YA 250LA 1KY1A 1L37A 1L83A 1OWZA 1P6YA 1QT8A 1T8FA 1SWZA 2B73A 1L32A 1G0GA 2F32A 157LA 1L62A 1L92A 1L40A 172LA 1L12A 1L74A 224LA 1ZYTA 1L34A 2RH1A 1XEPA 2B6WA 1JQUA 4DJHA 112LA 1L06A 1T6HA 221LA 225LA 1L71A 4W58A 217LA 1L96A 1SX2A 1LI3A 1CV3A 1L15A 1QUOA 1L27A 2OTYX 3C7YA 1C6EA 1C62A 2HUKA 1TLAA 1CTWA 1CV0A 3SB9A 1QS5A 171LA 180LA 4AQNA 1L69A 1LYGA 3HUAA 155LA 1G0JA 3VW7A 1L26A 139LA 238LA 2OE4X 3F9LA 4LDLA 1LGWA 4W52A 1CU3A 2B75A 165LA 3GUPA 2HULA 1L75A 1C6NA 1L98A 141LA 4W56A 161LA 2RAYX 1L31A 1L77A 4I7QA 1P37A 1CUQA 1DYDA 177LA 3DNAA 149LA 1C6PA 226LA 1QUGA 1QSQA 1L91A 1D3MA 253LA 1P36A 229LA 2ANXA 1C66A 1CU2A 4ARJA 1L73A 125LA 115LA 140LA 213LA 1PQKA 1L50A 1SSYA 108LA 3HH4A 214LA 1C6IA 3OE8A 1L05A 3DN0A 2OU9A 3DN2A 1L11A 4YX7C 3CDOA 1ZWNA 1XJTA 1QT7A 1L22A 138LA 174LA 3DN6A 1L88A 1L90A 4ARQA 1PQIA 218LA 3GUIA 197LA 142LA 2Q9DA 3HTDA 173LA 201LA 2LCBA 3C80A 1G0KA 3FA0A 158LA 3HU8A 3HT6A 1OWYA 151LA 1P2LA 1L79A 2OTZX 1L47A 3FI5A 3HDEA 2Q9EA 7LZMA 188LA 1L93A 3RUNA 3K2RA 3SB6A 4GBRB 3C81A 1QTZA 1G07A 3DN8A 3GUJA 3HH6A 3SB7A 1L97A 148LE 189LA 4OO9A 128LA 1L02A 2B72A 3HT9A 1L54A 167LA 1L72A 4EPIA 1L66A 1L80A 2B6XA 4EKQA 1L08A 249LA 259LA 1CU0A 1NHBA 1DYAA 200LA 1OVKA 159LA 1OV5A 1L18A 1G0PA 1DYEA 227LA 3G3VA 1L21A 1XJUA 110LA 251LA 127LA 3LZMA 1L57A 1K28A 1CUPA 1DYCA 1L13A 1EPYA 1ZURA 4I7OA 228LA 3NY9A 4ARMA 1L58A 2B6ZA 192LA 2LC9A 1CVKA 1QSBA 1QT5A 1L49A 2F47A 1QTDA 1OV7A 1KW7A 1L30A 1L41A 1L89A 1OVJA 1QTHA 186LA 2CUUA 1C64A 4DKLA 1C6FA 240LA 211LA 1QT4A 1T97A 3EMLA 4EKSA 118LA 145LA 119LA 4ARPA 1G1VA 1QTVA 4I7LA 120LA 1L29A 1L10A 3CDRA 2ANVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A94A 235LA 245LA 1GFHA 135LA 1RI8B 4E97A 103LA 1L00A 1L01A 1OUAA 1LZSA 1LHLA 1B7RA 1DYGA 3J6KA 2YBJA 1LI6A 1QUHA 1D0LA 3RNXA 3P65A 2A7DA 3F8VA 3A90A 1A4VA 4B1AA 1L25A 3OJPA 3HTFA 3A6BY 2OU0X 2IGCA 4NWEA 1P7SA 1WQOA 1JTNA 2BQGA 1JPOA 3ODUA 2YSSC 4FJRA 3CB7A 2I26L 3C8RA 2BPUA 2G4PA 1L45A 1UBZA 3ATNA 1LSFA 4M4OA 2RBOA 1I6SA 1C6LA 4ARLA 2GV0A 4HTKA 5B07A 1WQPA 162LA 1QDTA 1UIGA 1VDPA 4I7NA 1KS3A 3B0IA 3HBEX 3W6DA 1JEFA 237LA 2WARA 1L82A 1BB5A 5KKIA 2DQEY 5M1YA 2BQAA 4NIJA 4W51A 3BKVA 1C6HA 160LA 2W1LA 4DDCA 2RBSA 3HTBA 166LA 156LA 2DQCY 2HEEA 1LMNA 3CDVA 5II3A 2RSCA 4GLVA 4XJFA 2CJLA 1C69A 3G3XA 4NHTA 1B5VA 2LYZA 2DKVA 3OE9A 182LA 254LA 1CV4A 247LA 1WQRA 1LYJA 133LA 3A3RX 248LA 1LZGA 2BQBA 4LDEA 2Z6BA 1MLCE 2DQAA 1HHLA 1LSZA 1UIFA 1KY0A 5C6IA 4M6DA 3WPLA 5I14A 220LA 1C67A 5DN5A 1CX6A 3W3EA 1GFVA 4W59A 107LA 3OK0A 1HEOA 4MR1A 4WLTA 2RAZX 4NGZA 4NGKA 134LA 3W6BA 3RU5A 1L67A 2O79A 1LW9A 3SB8A 3AJNA 4MCKA 5KY1A 1L86A 3ULRA 4HSFA 1C08C 164LA 1INUA 169LA 4QDNA 147LA 1L09A 4II8A 4I7KA 4PJZA 4Z3MA 1L61A 3NYAA 1C60A 3ZEKA 4OWHA 1JTOL 4J1AA 2D6BA 206LA 3JR6A 1L43A 4H8YA 1TDYA 4U3XB 1C6BA 222LA 184LA 4H93A 2B6TA 3CT1A 1CJ6A 1BWHA 2BQKA 1P64A 4NGOA 1LJGA 1OUBA 1LJ4A 1LSCA 4UWUA 2RBPA 1CJ7A 1L68A 1GB7A 1NBYC 2HUMA 1LHIA 2D4IA 1EQ5A 1I1ZA 1DZBX 1FKVA 1BVXA 7LYZA 5LZMA 1LPYA 1L20A 1L38A 2MEGA 3TXEA 1BWIA 1F0WA 2BAAA 3M18B 1E8LA 1GFEA 1NDMC 4R0FA 126LA 4LT1A 5FELA 216LA 1LWGA 6LZMA 1LZEA 1C6KA 1L07A 1LHKA 2YBMA 2YBNA 3A95A 3NY8A 1OVHA 3VWOA 4LYCA 1WTHA 3UONA 1YAPA 1LGXA 1IO5A 2C8PA 5HNLA 2NTGA 1DI3A 2QB0B 113LA 250LA 1L83A 1L37A 1OWZA 5B05A 4TTDA 1OUGA 1UACY 2F32A 1G0GA 3AW7A 1PZYA 1L92A 2D4JA 172LA 1IORA 1L12A 4NGJA 2H9KA 1LZDA 1WTMA 1L06A 1T6HA 4PJ2C 5B06A 1XGRC 4RLMA 1SX2A 5I4XA 1CV3A 5I4WA 1L15A 1QUOA 2OTYX 3P66A 1CTWA 1QS5A 180LA 1LMAA 3ATOA 4Z98A 3EBAB 1IWVA 5I4YA 1LZ9A 3CSQA 4HTQA 4H1PA 1NMMA 3E3DA 2DBTA 4OWAA 3T6UA 1CU3A 2B75A 4LZTA 1OUFA 1L31A 4I7QA 1BWJA 2CGIA 1UIDA 3B0KA 1C6PA 1EQEA 2C8OA 4ETEA 2Z18A 3N9AA 1AT5A 1GB6A 3QE8A 2MEEA 3J4GA 5LVGA 125LA 115LA 213LA 1PQKA 2BQMA 1LSGA 1PS5A 108LA 1LMTA 3HH4A 4XENA 1L05A 3LZTA 3DN0A 5HLLA 138LA 174LA 4H9FA 1L88A 4ARQA 3GUIA 1IIZA 1LHJA 3HTDA 173LA 2LCBA 4GCDA 1OWYA 4B49A 1JKCA 4YEMA 1LSBA 3HDEA 188LA 1GBXA 3K2RA 208LA 3P68A 1FKQA 4CJ2A 4DQ7A 1L97A 148LE 1GFKA 1IVMA 1L02A 1JIYA 2B72A 3WUMA 4WM1A 1L54A 4EPIA 4H94A 3TMWA 2BQCA 4TX7A 4EKQA 4HJZA 2BQFA 5FSTA 4GLAA 1OVKA 1HEPA 1FLQA 1FLWA 1G7LC 1K28A 1LJFA 1UIAA 1UIBA 2Z2EA 4A7DA 1YILA 3NY9A 4ARMA 1BB3A 1HENA 4DD2A 2B6ZA 5KXOA 1QT5A 4WOAA 1L30A 4G49A 1OVJA 1QSWA 1HNLA 3EMLA 1T97A 145LA 119LA 1J1XY 4I7LA 1L29A 3CSZA 1NF5A 1IC7Y 4IAPA 1IEEA 3TXFA 1D3FA 2AUBA 242LA 1L99A 1LYSA 1L52A 152LA 4CFPA 4PRQA 2BQNA 3GULA 1L85A 4K5YA 4L41A 2Z38A 4YXAC 3W6FA 5LA5A 5FCPA 1IP5A 3CT5A 3RT5X 262LA 3V2WA 4YOPA 1YKYX 2NTHA 1CV5A 1PQMA 3DMZA 1L84A 1CKHA 2BQHA 4NGYA 1CV6A 1L95A 1KW5A 1TAYA 3IJUA 2Z39A 4GCEA 246LA 4I7JA 178LA 1B5YA 1YIKA 1L39A 4EOFA 4G4CA 144LA 1L46A 1XEKA 1IWYA 1C63A 4EJ4A 1VDTA 1P2CC 153LA 1D3JA 1QTBA 2ZNWY 1CV1A 187LA 3LZ2A 2BQEA 4NSGA 3HUQA 3PDSA 3C7ZA 1L51A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A94 A;  235L A;  245L A;  1GFH A;  135L A;  1RI8 B;  4E97 A;  103L A;  1L00 A;  1L01 A;  1OUA A;  1LZS A;  1LHL A;  1B7R A;  1DYG A;  3J6K A;  2YBJ A;  1LI6 A;  1QUH A;  1D0L A;  3RNX A;  3P65 A;  2A7D A;  3F8V A;  3A90 A;  1A4V A;  4B1A A;  1L25 A;  3OJP A;  3HTF A;  3A6B Y;  2OU0 X;  2IGC A;  4NWE A;  1P7S A;  1WQO A;  1JTN A;  2BQG A;  1JPO A;  3ODU A;  2YSS C;  4FJR A;  3CB7 A;  2I26 L;  3C8R A;  2BPU A;  2G4P A;  1L45 A;  1UBZ A;  3ATN A;  1LSF A;  4M4O A;  2RBO A;  1I6S A;  1C6L A;  4ARL A;  2GV0 A;  4HTK A;  5B07 A;  1WQP A;  162L A;  1QDT A;  1UIG A;  1VDP A;  4I7N A;  1KS3 A;  3B0I A;  3HBE X;  3W6D A;  1JEF A;  237L A;  2WAR A;  1L82 A;  1BB5 A;  5KKI A;  2DQE Y;  5M1Y A;  2BQA A;  4NIJ A;  4W51 A;  3BKV A;  1C6H A;  160L A;  2W1L A;  4DDC A;  2RBS A;  3HTB A;  166L A;  156L A;  2DQC Y;  2HEE A;  1LMN A;  3CDV A;  5II3 A;  2RSC A;  4GLV A;  4XJF A;  2CJL A;  1C69 A;  3G3X A;  4NHT A;  1B5V A;  2LYZ A;  2DKV A;  3OE9 A;  182L A;  254L A;  1CV4 A;  247L A;  1WQR A;  1LYJ A;  133L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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