1LB9A

Crystal structure of the non-desensitizing glur2 ligand binding core mutant (s1s2j-l483y) in complex with antagonist dnqx at 2.3 a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb9A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb9A01
5TP9A 2DE2A 2F7AA 3TZAA 4QHQA 4R2FA 3C32A 4GXSB 1A40A 4KQPA 1FQEA 1NFTA 2I0CA 3N5LA 2H9BA 4U2RA 1O7TA 1VR5A 2O7UA 3VE1B 1RKMA 1YTVA 1B3FA 4IGTA 1QUJA 3W15C 1USYE 3TDJA 1XVXA 2P0SA 3C33A 5I84A 4DE8A 1H76A 2RC8A 1FTLA 1MH4A 1B4HA 1Q35A 4JXIA 4OHNA 3PPPA 3R6UA 4ZS9A 4L17A 2HEUA 2PX1A 3FXQA 3U93A 4EF2A 3R7XA 1B7UA 2D21A 5H8NA 1EZ9A 1QKBA 4YU0A 2UYFA 5ICQA 3IJOB 4R6YA 1IXCA 4TLMB 1A55A 1S50A 1OLCA 2Q9TA 4IY6A 3TODA 4NF8A 2ZYKA 3MC2A 1B9JA 2GH9A 3UN6A 3TTMA 4U21A 1VSOA 4NF5B 4GL0A 2QJEA 1D9YA 4Q30B 3QUFA 3OO7A 1MY4A 1A99A 3UK4A 1AIVA 4ZEIA 1I6QA 4RNSA 3M3LA 3Q29A 4IO7A 3HV1A 3E3KA 4HCYA 1AL3A 3TTNA 4G68C 3S9MC 3PPOA 3M3FA 4JSDA 5AA2B 1L5TA 1QULA 4R9GA 5BWJA 3PUYE 1MY3A 1S9TA 1FTMA 2I58A 4LONB 1P99A 3O6IA 3EHSA 4G68B 1MPDA 4XTCQ 3M3KA 4GQOA 4KYSA 4OYVA 2DE3A 4G8MA 1MY0A 3VLWA 1IUDA 4ESWA 5M2VA 1LFGA 3OENA 3K6XA 2AIXA 3K02A 3KN8A 3LSFB 4UACA 4FATA 4GOTA 3THIA 3CSBA 2I4CA 1MPCA 3CFLA 2I4BA 3S2VA 1IXHA 1B0HA 1D3KA 2DWHA 2ZNUA 1MDQA 3G3JA 3H6WA 5FHNA 1XVYA 5K2XA 5I2NB 4G8HA 3SESA 1B2HA 3TTLA 2KLFA 3SETA 4F3PA 4OWDA 4P11A 3TTKA 5I57B 1QVSA 3O66A 3QIMA 3WAFA 4EQ9A 1MRPA 1EZOA 1US5A 4QFNA 3WAEA 1LB8A 1OMPA 4ZEBA 4BDQA 3Q26A 3UORA 1MS7A 4ZECA 3FVNA 1MXYA 1GV8A 2O1LA 3W9VA 2VD3A 2XXUA 3L6GA 4WKMA 4O3CA 1SW5A 5L9OA 4R72A 3C9HA 1FQAA 3OSRA 4FJPA 1IQ7A 2RF1A 3LBSA 4GLIA 4EDPA 4KCDA 1MXZA 4FE8A 2Y7IA 2WKYA 4F2QA 4F18A 5A5XB 5AA4B 2F8DA 1O63A 4GWOA 4R6HA 3EF7A 3FJMA 3VFJA 5ISUA 5FTIA 3P7IA 4OZ9A 1SBPA 4ND9A 4ISUA 3H6TA 1ZKBA 3LR1A 5ELVA 3RGYA 2VOZA 1JEVA 4R73A 4Q5TA 3CI8A 1R9QA 1GR2A 4YKKA 3OSQA 3PV0E 4IO5A 2UVIA 3FXUA 3FV1A 1B3LA 4U1ZA 1JVXA 4PFUA 3I6VA 4ZE8A 2I3VA 1I69A 1I6AA 3GLBA 4R9FA 1J1NA 4IO2A 2H25A 4G8NA 3PU5A 3O6GA 3O97A 2YLNA 5I2NA 5TPAA 1JNFA 4N13A 3KG2A 3HO7A 3TELA 1VFEA 1NH8A 3OMBA 4EXLA 3ONMA 2AYSA 3SDFA 3S9EA 3HHFA 3G3HA 2NXOA 5L9MA 3S9NC 4KYEA 5I2KA 4WXJA 2AL5A 3H6UA 3HCQA 1Y9UA 2RINA 3DELB 4KCCA 4NF4B 1XC1A 5H8FB 4PQJA 2NUVA 3SEWA 2QS4A 2D3IA 4KFQA 4NF6B 2O84X 4PE5B 4U4XA 4F3BA 3IJXB 1FQDA 3H3GA 3IOVA 3CRBA 1IXGA 4QSEA 5DTBA 4IO6A 4XKNA 3TTRA 4IY5A 1LFIA 4H5FA 1MQJA 4EF1A 1LLSA 4Z0IA 1B5HA 3C34A 2M8CA 3BFTA 4OEUA 1LBBA 2OLBA 3DLNA 5A5XA 3PD8A 2F7CA 2Q88A 3KGCA 1D4NA 2QS3A 4EXKA 3KFMA 4DXUA 2D5WA 2XX7A 3O9PA 5H8QA 2F6PA 2O51A 2XXXA 4F3GA 1S7YA 1B46A 2UYEA 3ILUB 4P0IA 3E4RA 2Q2CA 4XIGQ 2H4IA 2A5TB 1B5JA 2XXIA 5CM6A 4WEDA 2VP1A 3B6QA 4LATA 1PB7A 1JW5A 3MP1A 3IB1A 4JSOA 2X7QA 1N7WA 4BDOA 5I59B 1EZPA 4LVQA 3CFZA 3RY3A 3KN7A 3LSXA 1LB9A 2PT1A 1MQGA 3PPNA 1MQIA 2I6EA 4RXLA 2F7BA 3SEXA 2RKMA 4GVOA 5AE4A 2XXHA 1MM6A 3JV9A 3KOSA 1PBQA 3V89B 1FQFA 3TEPA 3FZVA 4R2BA 1GGGA 3C4MA 2H98A 3OEKA 4RPOA 1NNKA 3U92A 2YJPA 3GBBA 4X48A 1WODA 4OFOA 3A3UA 2ZYNA 1DTGA 5EHMA 2V93A 1M5EA 3RLFE 4AB6A 4G4PA 3MP8A 3K6VA 4FIMA 2DVZA 1ZJLA 3G3FA 3IO6A 2V3TA 4YMBA 1GTKA 3SEVA 1ZBMA 1O64A 1UTBA 5KCJA 4QFKA 3IOTA 3C36A 2DWJA 2FA7A 4NWCA 1LAXA 3RNNA 2I3WA 2R71A 1OVBA 4OTEA 4H8IA 3QSLA 3RQTA 4RY1A 1MQDA 2OK2A 1CE2A 3H06B 4GL8A 2THIA 1XOCA 3OO6A 1B7ZA 2X26A 2X7PA 2Z8FA 1VE4A 4G2ZA 4GFRA 3KSJA 5I56B 4YICA 5CBSA 2A5TA 3K6WA 4NTLA 5BUUA 4X1DA 3OELA 1LAGE 2XD2A 4G77A 1NH7A 3FASA 3ECRA 3QAXA 4POWA 1QUKA 1B4ZA 4FEBA 5CI5A 1SDXA 1B6HA 4GIZA 4HTGA 2QL3A 4KPTA 2CMOA 5I58B 4DZ1A 3ZKLA 1ZU0A 1PB8A 4LP2B 3T96B 3QXMA 1IXIA 2B65A 3KEIA 1FQCA 1DMBA 5B7DA 1AOVA 3O6HA 2E1SA 3N6UA 4XKPA 5CRYA 1SW2A 3PPQA 3EQ1A 4GF8A 3SEUA 3CIJA 3I5OA 4H67A 2QPQA 3BKIB 2F34A 3PGFA 1FTJA 2UVGA 2HXWA 3RT8A 3UGWA 3MW0A 3VLVA 2ESNA 2ONSA 1KWHA 3DP4A 4YZZA 5KDTB 1UTHB 3PUZE 5J1DA 4H65A 1WVJA 4KHZE 5ITPA 2NWJA 3EN3A 4Q8RA 1P1OA 3E9XA 3V83A 2REGA 2R9JA 2GRVA 4THIA 2HZLA 3N6TA 4BDLA 1N7XA 4FECA 1MXXA 2NVUB 2RCBA 4QFPA 1ZIUA 2V3QA 5DEXB 3MP6A 3TYHA 5AA2D 3TAJA 1XT8A 1MM7A 4NMYA 2DWIA 1US4A 4F1UA 2QMXA 5CMKA 4LQ5A 4PETA 2VGQA 3I3VA 5CMBA 2Y7KA 1DSNA 1MXUA 2B3BA 3K00A 3RN8A 3UP9A 1QUIA 3TCGA 3IR1A 2HCAA 2DXYA 5EYFA 4WEPA 3M8UA 1B3HA 4IO4A 1MDP1 1HSLA 1M5FA 1SQYA 3FD3A 2PYYA 2B3FA 3V5AA 3T9XB 5I58A 2DSFA 3MAMA 4GXAA 3K2DA 3FVGA 4ELQA 3BFUA 2XXQA 3GBAA 3TQLA 2HQ0A 3FV2A 2OBGA 3G7WA 4NF5A 4XXUA 1SD3A 1XHYA 1Y3PA 4LUBA 5DYHA 1AMFA 2ANJA 1NNFA 1B3GA 1A7LA 1R1NA 1WDNA 3DP6A 1BKAA 3QUJA 5JTYB 1N3XA 2ZYMA 3OEMA 5KDTA 4RA1A 1PC3A 4YB6A 5AA2A 4R74A 3S4UA 3H7MA 1MH3A 5H8HB 5DVIA 3KOTA 1F9BA 3IB0A 4QFOA 3K0VA 3FVOA 2QS2A 1B1HA 4G68A 1SI1A 2ZYOA 3A3CA 2XXYA 4NE4A 5DVJA 3B6TA 2ZMBA 1FTKA 3S9LC 4TQUQ 3UA8A 2O7IA 4ZEDA 5DEXA 2O68A 3KJTA 4POXA 4ZZAA 2Z23A 4FEDA 3CG3A 2XXPA 4P0GA 1IITA 1Z7NE 4YB7A 4F31B 5DT6A 1TXFA 2ZNTA 4C1UA 3PD9A 4ZEFA 1LFHA 3H03A 4OEVA 4YMAA 2HAUA 3LSLA 3E13X 2Q8JA 3G3KA 1H45A 1B58A 3TKDA 1LAFE 5I57A 4DIGA 3F11A 1NMUA 3K1NA 4TLLB 1JVYA 3K01A 3QK6A 4XKRA 1UIVA 3V8XB 3PUWE 3O28A 3G3GA 2Y84A 1PDAA 3SKPA 1MY1A 1Y1MA 4PP0A 4YKJA 1GVCA 5JTYA 2O6AA 5K2YA 1ELJA 4I8CA 2ZXTA 1B51A 1B1XA 2DVCA 1T0KA 2V84A 4RJZA 4OETA 1LAHE 1UQWA 4KI0E 4DLDA 5AA4A 4QSDA 3B6WA 3BBRA 3O2AA 1RYXA 1JQFA 2HAVA 1DOTA 4RPNA 4JWYA 1CB6A 1H43A 1EU8A 2RC9A 3D4GA 4N6PA 4RYAA 4AQ4A 5ICTA 3QYTA 4EQBA 3IOUA 5IKBA 4F3SA 3MVZA 3IX1A 4OENA 4E0XA 3VXBA 3KJ7A 1FW0A 3ZKKA 1M5BA 3W9WA 1YAEA 1MQHA 3K1PA 1AH5A 3VVDA 4YKPA 3B7DA 1SVXB 2CZLA 3MVYA 5H8NB 1Y4TA 3RTFB 1YCJA 2E0SA 4YB5A 1PEBA 3OD7A 2UXAA 4H5GA 4XKQA 1B40A 2I0BA 3TPAA 3K4UA 2Q2AA 3DM0A 4NF8B 1FCKA 4C0RA 4F39A 3FUZA 4I62A 1H3DA 3A09A 3JZJA 4ELRA 4K3FA 1Y1ZA 5IAIA 3O29A 4MLQA 4AB5A 4NF4A 2QMWA 5H8FA 2XX8A 1SW1A 4OQOA 2XX9A 3TUSA 1SYIA 2HZKA 4NF6A 5JEIA 1A54A 3DP8A 4ESXA 3HSTA 3FJGA 4RK9A 2DOJA 2Z8DA 4UA8A 3CVGA 4N07A 5FHOA 3RPWA 1Q1KA 2AL4A 1ZMGA 4U22A 2QRYA 2XXTA 2Z22A 3VVFA 4I9DA 5CMMA 3T93B 4JDFA 4X9TA 3IAZA 2PT2A 4ZZEA 4Q0CA 2DP8A 5F1QA 5I59A 2F6GA 4GD5A 3H6VA 2Y7PA 4OMBA 1OLAA 4RK2A 3OOAA 4H1XA 3CR9A 3VDFA 5CC2A 2FNCA 1A8EA 1ANFA 5AA3A 4JWOA 4R6KA 2FYIA 4LQ2A 3D4CA 2OWSA 4OESA 1JW4A 1PBPA 1N3WA 1MXWA 3T66A 4QRZA 1POTA 1OQGA 5CMCA 4DXCA 2RC7A 1TFAA 3JYRA 3U72A 3IB2A 1N76A 2PVUA 1MXVA 3SERA 4DCXA 4BDMA 3MWBA 1BP5A 3TFLA 4M4GA 3G3IA 4DDDA 3TCHA 3OO8A 2GFEA 1B3EA 4HW8A 2YPNA 3FIRA 4YKIA 1P1QA 4U4SA 1P1WA 3MBPA 3C35A 3IO4A 1LGBC 1JETA 3RTWB 4LA9A 5FHMA 4F2OA 5I56A 3Q25A 3KZGA 1TFDA 4DXBA 2ONKE 2DQVA 3U8QA 1HSEA 1LBCA 4LZ5A 3U94A 1LCTA 4IO3A 4PFYA 3TMGA 1H44A 3VV5A 4ONYA 3HPIA 3CSGA 4MFIA 1DPPA 1OQHA 3HN0A 1ZTYA 2VHAA 3TCFA 3C31A 4U23A 3R26A 2UVJA 2A5SA 4I1DA 3MVXA 5TPAB 4JB7A 2DXRA 3FATA 4R75A 4LZ8A 3HHGA 3PPRA 2Q89A 1URSA 2UVHA 2Z8EA 1Y20A 1OIBA 4EQ7A 2DYXA 3AXFA 1MPBA 5I2KB 2R6GE 3OXNA 3KN3A 3LC8A 1DTZA 1NL5A 2PBWA 1FQBA 2Y7RA 5HBCA 2V3UA 5L8DA 3GZGA 1JW1A 4JWXA 3TQWA 1UTHA 4F1VA 1N0TA 3ZSFA 4PFTA 4OFLA 5HM4B 1USYH 3T9HB 2OCUA 2VD2A 4QSCA 4ZE9A 1DPEA 2G93A 2V25A 5LOMA 5JK4A 1B05A 2XXWA 5HPQA 2GHBA 3T9VA 1M5DA 1NKXA 4NWDA 3RT6B 2QSXA 3IORA 2H99A 3EHUA 4E0WA 3MPLA 2OZZA 1MG1A 1B5IA 5DVFA 1TT1A 1I6BA 5H8QB 4OXVA 4F22A 4MF3A 4U1OA 4IB2A 5KZTA 2PMSA 1RYOA 2O1MA 4H0WA 3LSWA 5ITOA 1EH3A 4H8JA 4TOZA 1OVTA 4ZDMA 2DE4A 5AA1A 2Y7WA 1D9VA 1HSJA 3EHTA 1NNPA 3GXAA 3VXCA 3MZBA 1Y3QA 1TWYA 3CG1A 3LUYA 4DCYA 2DWAA 4PFWA 3N94A 4ECFA 3MQ9A 4HS7A 4X1BA 2IEEA 5FTHA 4BDNA 3EPEA 4F29A 3T9UA 3KBRA 1QKAA 2F36A 1P1UA 2IA4A 2F78A 4IGRA 1NNTA 3USDA 4FAJA 4YAHX 1PB9A 3ZS6A 2ONRA 4LZ7A 3MJNA 3RUMA 4ELOA 1XS5A 1IEJA 3IOWA 2P2AA 5TP9B 2F97A 1B0LA 1IZ1A 2HFBA 2XHDA 4QFLA 2BJJX 2GHAA 3PUVE 1UTBB 2XXVA 5KCJB 3PMXA 3PMWA 2XXRA 1ATGA 4KYDA 5H8HA 1IIWA 3MPKA 1A8FA 1SW4A 4H6DA 2NOOA 1N04A 2F35A 3FGSA 4Z7EA 2H5YA 3ILTB 3FVKA 2XD3A 1R6ZA 1BIYA 1FTOA 4KR5A 1B7HA 4HCWA 2O69A 3VVEA 4MH5A 1M5CA 3H4ZA 2LAOA 4ZEKA 1VFDA 1ZLQA 3CFXA 4BDRA 2OJTA 2G29A 4O3BA 1JEUA 5TU0A 1B32A 1Y3NA 1Z7ME 3PMVA 1QW0A 3N26A 2ALUA 1N84A 1P1NA 3K1MA 4MBPA 3Q28A 3Q27A 1LCFA 1II5A 3KSXA 4JBZA 5L9SA 1B52A 4BLAA 5F7VA 1URDA 3K6UA 4ELPA 3FJ7A 3MVWA 3UIFA 3MUQA 3ODBA 1BTJA 4OFJA 4O3AA 3IL1B 3VLUA 4OVJA 4NEDA 3U1OA 3L6HA 1YPNA 2ZNSA 1Y4CA 2I49A 3FXRA 5EHSA 4M1VA 1URGA 3OO9A 2OWTA 1R9LA 2W7YA 3MZ1A 3MZ9A 5B70A 3T22A 3IK6B 1SI0A 2DS9A 4OERA 1QJMA 5H8SA 1MY2A 2REJA 4MLVA 4F1YA 2F5XA 1POY1 2I48A 2QS1A 1BLFA 4C1TA 1LSTA 2ABHA 5CBRA 2RCAA 4FORA 4F19A 4GRKA 1UIUA 2P1SA 4QF9A 1SYHA 4EUOA 3SEYA 3PUXE 4KD5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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