1LB9A

Crystal structure of the non-desensitizing glur2 ligand binding core mutant (s1s2j-l483y) in complex with antagonist dnqx at 2.3 a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb9A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb9A01
4YB7A 3CSBA 5EYFA 4F31B 3KZGA 1MPCA 4JSOA 2HCAA 3ECRA 2OWTA 2DOJA 2Z8EA 3FD3A 1WVJA 3U8QA 4OETA 4EF2A 4EQBA 3M3LA 1DPPA 4MFIA 3A09A 1B2HA 1IUDA 2X7QA 5ELVA 3DP4A 4KD5A 4U4SA 5A5XA 3FVNA 1QUKA 4KYEA 4F1YA 2DWJA 1J1NA 4G2ZA 5HBCA 5DVFA 3C33A 3IB0A 4AQ4A 4ISUA 1ZMGA 2DP8A 2OBGA 3OEKA 2DVZA 4NF5A 4F3PA 3OSQA 1LAGE 4F2OA 2PMSA 3C31A 4GFRA 3LSFB 2A5TA 4LQ5A 3VVDA 1EZOA 4BDOA 1DTGA 3HHFA 4YMBA 1US4A 4OMBA 2BJJX 4ZZAA 3TTNA 2W7YA 1B52A 4R74A 3OO7A 5DEXB 4R2FA 4F3SA 4YB6A 1I69A 2HFBA 3OO8A 3TCHA 1OLCA 1OMPA 3TUSA 4X9TA 4DCYA 4BDMA 2GHBA 2Y7KA 3PUVE 2ZXTA 5ISUA 2V84A 4XKNA 3RT6B 3MVYA 3JV9A 5J1DA 3TTMA 1P1OA 2HQ0A 4OZ9A 2KLFA 4KCCA 4ZE9A 3RPWA 1MXYA 3VXCA 2XXPA 2DQVA 4JWYA 2X26A 3IJXB 3MZBA 3K01A 3K1PA 1BLFA 1MY1A 1LBBA 3H6VA 4ZEKA 4EXKA 3DLNA 1BP5A 3V89B 1B0HA 3PV0E 5M2VA 5H8QB 4RY1A 2Q88A 1Y3PA 1VE4A 3IB2A 3FV2A 2DE4A 2ESNA 1NNPA 1NH7A 4H8IA 2AL5A 1JVYA 1TFAA 4G68A 1II5A 3C32A 3CFXA 2H4IA 1H45A 1HSJA 3N26A 1B51A 1NNFA 4R9GA 3IR1A 4YKKA 1LCTA 5I59A 3IORA 4H5FA 2NXOA 1LFIA 2Y7IA 4IGRA 5I2NB 3G3KA 4RK2A 1VR5A 1UTHA 4GL0A 4HW8A 3Q28A 5BWJA 3RTFB 2ONKE 1YTVA 3T9VA 2F5XA 5TPAA 1B6HA 5IKBA 4OEVA 2I3VA 4GWOA 1YCJA 2DWIA 4YKJA 3FVKA 1HSEA 3OO6A 5ITPA 3JZJA 2DS9A 1IXIA 3BFUA 2ABHA 2O1MA 4YU0A 5DVJA 1ZU0A 1DOTA 1DMBA 3O2AA 2VOZA 3KG2A 4G77A 1ZTYA 2O69A 2QMWA 5DVIA 4YB5A 4YAHX 3MUQA 4R75A 4LZ5A 3MW0A 1Y3NA 4RJZA 3BFTA 2QS3A 2RINA 4KI0E 2O7IA 2XXIA 1FQFA 2XXRA 3G3JA 4X48A 2LAOA 4POWA 1MQDA 1AMFA 1QUIA 4IY6A 2E0SA 2Q9TA 4NF4B 5I56B 5AA4A 3PMXA 3C9HA 2OK2A 3MVZA 2UVIA 1MXXA 1USYE 4FE8A 1WODA 5H8NA 1B5HA 3SETA 1N3WA 1UQWA 3N6UA 3N6TA 2NUVA 4U4XA 1FTLA 2QS2A 3FXRA 4ELRA 3IK6B 3U1OA 2ZYMA 3T66A 5TP9B 5L9OA 1BIYA 2UVGA 2H99A 3K00A 5JTYB 5H8FB 3C35A 1B58A 2ZYOA 4F3BA 1VFEA 4UACA 4RPOA 4ELOA 3LUYA 2Z22A 5I2KA 1IQ7A 1N04A 2O84X 3T93B 4KHZE 1PDAA 2I0BA 1LAXA 3K0VA 2HAVA 3SEWA 1D9VA 4KYDA 5CC2A 4X1DA 1DPEA 4I1DA 5DYHA 1SD3A 2E1SA 3C4MA 5FTHA 3T96B 3GXAA 1JEUA 3MPLA 3FIRA 4JDFA 4C1TA 1SW5A 4NF8A 4IGTA 2RF1A 1AL3A 1BKAA 4R72A 4XXUA 1MH3A 4R6HA 4E0XA 1N7XA 2I3WA 3QAXA 3QUFA 5F1QA 3PD8A 3Q27A 5KDTA 1FTMA 4N07A 1MM6A 3K1NA 4Z0IA 4PFYA 2QSXA 1R9LA 3L6GA 2XHDA 3HPIA 3H3GA 4ECFA 4LVQA 2AYSA 4RXLA 1QKBA 2M8CA 3IL1B 4P0IA 3CI8A 3W9VA 3CG1A 5EHMA 2DWHA 4YKIA 3E3KA 2DSFA 3PPQA 4H1XA 1POTA 2I49A 1NNKA 2F6GA 4NWDA 2REGA 2F7AA 4TQUQ 4YKPA 3K6VA 4NF5B 2Q2CA 1OVBA 1UIUA 3H7MA 3KJTA 1B1HA 2Q8JA 5K2XA 3UIFA 1MQGA 4IB2A 3HN0A 3OSRA 1HSLA 5H8HB 2NWJA 4MBPA 1B3HA 2V25A 3TZAA 2HEUA 3IB1A 1P1QA 4P11A 3MZ1A 1Y20A 1TXFA 3KOSA 2H98A 5FHOA 3ODBA 4Q0CA 4UA8A 3UGWA 5I57B 4I9DA 2DE2A 5FHNA 5B70A 3RLFE 3MP1A 1SW2A 2ZMBA 1JETA 1WDNA 3E13X 3K6WA 1IXGA 2DYXA 2OZZA 3H4ZA 4FATA 4QFPA 1I6QA 3RTWB 5K2YA 2PX1A 4JSDA 3FXQA 1SYIA 3T9HB 3VDFA 4F39A 5AA3A 3S9NC 3ILUB 1XT8A 2NOOA 1IIWA 3UORA 1MRPA 3MP6A 3FJMA 3SDFA 1MY3A 4IO3A 4KYSA 4NMYA 1GTKA 1B7UA 3N5LA 4IO4A 5IAIA 2CMOA 4X1BA 1A54A 4MF3A 4NF6A 2D21A 1JEVA 1B0LA 3FJ7A 3PD9A 4WEPA 3ILTB 3K2DA 3R26A 4I8CA 5KZTA 1YPNA 4XTCQ 4ZZEA 4HCWA 4M1VA 4F1UA 2F36A 3AXFA 3UN6A 3O66A 3MWBA 4Q30B 1UIVA 1DTZA 4L17A 2RC7A 4H65A 2NVUB 2XD2A 2XXXA 4G68B 3KBRA 2ONRA 2B3FA 4WKMA 2XXQA 4GLIA 1B40A 5I59B 4LQ2A 3THIA 4G4PA 1UTHB 4C1UA 1N3XA 3FASA 3IOVA 1NNTA 2Z23A 4H0WA 2FA7A 4R73A 3MPKA 3DP8A 4FJPA 5KCJA 3CG3A 3O6GA 1LBCA 3SEUA 2REJA 3MAMA 1M5EA 2P2AA 3OXNA 4OFOA 1NFTA 1EH3A 2WKYA 3KN3A 3QXMA 2GHAA 2QPQA 4OVJA 4G8MA 4JB7A 4BDRA 1M5CA 3TQWA 5I58A 3S4UA 1LFHA 3KN7A 1B3GA 4GXSB 4IO2A 1IXCA 1H43A 1XVYA 3W9WA 1OQHA 4U1OA 1H76A 5H8SA 4GOTA 2ZNTA 2G29A 1FQEA 3O6HA 3KSJA 1Q35A 5H8NB 1XS5A 2R71A 4GF8A 1F9BA 3IJOB 2VD2A 4KCDA 3G3HA 3EHTA 4RA1A 4U1ZA 3K1MA 1GV8A 4DXUA 1Z7ME 3VXBA 4ESXA 5AA2A 3QIMA 2I0CA 2HZLA 3I3VA 2PT1A 1P1WA 1Q1KA 3E4RA 1Y9UA 4BDLA 1GR2A 4QF9A 2DVCA 1Y4CA 1CE2A 4QSEA 3G7WA 2F7BA 2OLBA 3EHUA 2XXWA 2GFEA 5DEXA 2OJTA 4WEDA 1MS7A 1US5A 3EN3A 1I6BA 4NF8B 4DE8A 1QVSA 4RPNA 4P0GA 4RNSA 3CFLA 3O97A 3BKIB 4YZZA 4C0RA 3HHGA 1LB8A 4Z7EA 4OHNA 3U72A 1IITA 4H5GA 2Q2AA 4U22A 4BDNA 4XKPA 1B7ZA 4R6KA 1FTOA 2Y7PA 4M4GA 5KDTB 2Y7WA 2OWSA 4PFTA 3MC2A 2HZKA 4ESWA 2B3BA 3BBRA 1LB9A 5L9SA 4TOZA 3RUMA 1ATGA 2RKMA 3V8XB 2X7PA 5F7VA 1P99A 4PQJA 1XVXA 3GLBA 2QMXA 1H44A 2VHAA 1ELJA 1SBPA 2ZYNA 3TTRA 1O64A 3FATA 1Z7NE 2ANJA 1FQDA 4OFJA 2XX9A 3PPPA 5DTBA 2IA4A 4DXCA 3IX1A 4JBZA 4PETA 3QYTA 4JWOA 1MQIA 1RYXA 2XX7A 1B5JA 5H8QA 3TFLA 4GRKA 4LZ7A 4POXA 2GH9A 1Y3QA 1BTJA 2I48A 1URDA 1IXHA 3QK6A 2ALUA 3EPEA 1LCFA 1XHYA 2R9JA 3PPRA 2XXVA 3CR9A 4LZ8A 1B32A 2I4BA 2FNCA 3ZS6A 2QS4A 3B6WA 1SI0A 5I2NA 2ZNSA 1RKMA 2H25A 1JNFA 3LR1A 3TDJA 2O68A 1A7LA 3UA8A 2QS1A 4PFUA 4PFWA 4QFNA 1LAHE 2THIA 3OMBA 2H9BA 4BDQA 3CIJA 1R6ZA 3K4UA 4NTLA 2UVJA 4YICA 3OENA 1KWHA 3IOWA 4F22A 4QHQA 4F1VA 2RCBA 2D3IA 4ELQA 3N94A 1IEJA 3WAFA 5BUUA 3PUYE 1USYH 4ND9A 3S2VA 1SW1A 1EU8A 3H6UA 4ONYA 1T0KA 4GD5A 5A5XB 4WXJA 3VFJA 2Y7RA 3UP9A 3V5AA 2ZNUA 4FEDA 3S9LC 3TMGA 3FVGA 1S7YA 1MPBA 3O28A 3IAZA 2RC9A 4HCYA 2YPNA 1N84A 3TEPA 2UYEA 3LSWA 3TELA 3RT8A 3MJNA 2VP1A 4KFQA 3VVFA 2A5TB 3MBPA 4ZS9A 3B6QA 3LBSA 4AB5A 4QSCA 5CBSA 5H8FA 1OQGA 3GBAA 4OYVA 3ZKKA 1OLAA 1URGA 1EZPA 1MXVA 4QRZA 3RY3A 2DE3A 1JW1A 2V3TA 2I6EA 3CSGA 1PBPA 4GVOA 2AIXA 3G3IA 3IO6A 3FV1A 1DSNA 5KCJB 1MH4A 4QFOA 3I6VA 4DDDA 3RQTA 3MQ9A 3MVXA 4DXBA 2QRYA 1QJMA 2VGQA 3R6UA 5CMKA 5CMBA 3TTLA 1PC3A 1LLSA 3HCQA 1R9QA 3B7DA 4MLQA 3IOTA 4ZEFA 4OTEA 1ZIUA 1AH5A 3I5OA 1N76A 1A99A 1B5IA 1SI1A 3PU5A 1B3FA 3LSLA 3DP6A 4H6DA 2OCUA 4F3GA 1MXWA 3JYRA 3D4GA 4Q5TA 3TQLA 3HSTA 3ZKLA 1QKAA 2F35A 1ZLQA 3MVWA 1MDQA 1LSTA 2RCAA 4N6PA 4IO5A 1UTBA 1OIBA 2QJEA 4OESA 1VSOA 1FCKA 4YMAA 5AA2B 1MDP1 1PBQA 2ZYKA 1JQFA 3KN8A 1URSA 3SESA 5I84A 3H6TA 3U92A 5AA2D 3F11A 3TODA 4K3FA 4TLMB 5ICTA 4ZEDA 1SVXB 5EHSA 3A3CA 4EF1A 3TAJA 1TFDA 5H8HA 3HV1A 4QSDA 5TPAB 4JWXA 3OELA 5HPQA 3VLWA 3KJ7A 3H03A 1XC1A 2XX8A 3W15C 1PB8A 4RK9A 1B1XA 3CFZA 3G3GA 2CZLA 4ZEBA 3R7XA 3CVGA 2P0SA 3RNNA 1FTJA 2QL3A 3TCFA 4FORA 3SEYA 3KSXA 3OD7A 4HTGA 5I57A 1LFGA 2DXYA 2UVHA 4G68C 4FECA 3Q25A 4LUBA 2O7UA 2F8DA 4F19A 4F18A 4EQ7A 4AB6A 3TPAA 1O7TA 5JEIA 1D9YA 2Y84A 1N7WA 1FQCA 4IY5A 3MP8A 3TKDA 4QFKA 5DT6A 4E0WA 1IZ1A 3G3FA 2IEEA 2XXUA 4H67A 3O6IA 1MY2A 2UXAA 1D4NA 3K6XA 1D3KA 4HS7A 3CRBA 1P1UA 5AA4B 2I58A 5FHMA 3KFMA 3C34A 1LAFE 4NEDA 4KPTA 1QUJA 5CMCA 1S50A 3O9PA 1QW0A 4BLAA 3RGYA 4LP2B 3KGCA 2GRVA 4G8HA 1ZBMA 3A3UA 1JW5A 3PGFA 1A8FA 4XKQA 1SDXA 3PMVA 3SKPA 3SEVA 1P1NA 1R1NA 1AIVA 3T22A 3OEMA 1PB9A 1ZKBA 5HM4B 5I2KB 4U23A 5AE4A 2VD3A 3USDA 4FIMA 2XD3A 5B7DA 1Y4TA 1B05A 2F7CA 1MXUA 4RYAA 3MZ9A 4EQ9A 1H3DA 4H8JA 3PPNA 1A40A 3P7IA 2O6AA 5ITOA 3M3FA 3SERA 4Q8RA 1JVXA 1SW4A 1B7HA 1B3LA 2XXTA 4O3AA 4F29A 4ZECA 2UYFA 3GZGA 2P1SA 3H06B 4EDPA 2O1LA 3HO7A 1LGBC 3DELB 4THIA 3B6TA 1JW4A 2F78A 1MXZA 3OOAA 3C36A 3FZVA 5LOMA 1NL5A 4GIZA 5CI5A 2V3QA 4PP0A 4DCXA 4NE4A 2PYYA 1MQHA 1MPDA 5CM6A 4OXVA 3PPOA 4FEBA 1AOVA 3LC8A 1B4ZA 3EQ1A 3EF7A 5CRYA 1B4HA 3WAEA 2HXWA 4OWDA 3M8UA 2RC8A 5L8DA 1MY4A 1I6AA 3FUZA 5ICQA 1NH8A 3VE1B 1GGGA 3KEIA 1RYOA 3RN8A 1B9JA 1FTKA 2HAUA 3LSXA 1FQAA 4LONB 2FYIA 1ANFA 1A8EA 2AL4A 4DZ1A 1TT1A 3FVOA 3VV5A 1XOCA 3SEXA 4KQPA 5TU0A 3L6HA 3FJGA 2XXYA 2ONSA 4LA9A 4R9FA 3TYHA 2F34A 1EZ9A 2F6PA 4XKRA 2PVUA 4EXLA 4F2QA 4NWCA 5JK4A 3Q26A 2D5WA 1M5DA 4JXIA 1PB7A 1ZJLA 2V93A 2B65A 3QSLA 1FW0A 4OQOA 4KR5A 1TWYA 3E9XA 3KOTA 5L9MA 3DM0A 4XIGQ 2XXHA 4I62A 1NMUA 1MY0A 1B46A 2F97A 3VLUA 4EUOA 3T9XB 2Z8DA 4ZDMA 3ONMA 1L5TA 4G8NA 3PMWA 2DWAA 4QFLA 3D4CA 5CBRA 1QULA 3EHSA 2PBWA 3VVEA 3ZSFA 2DXRA 3PUXE 4ELPA 4R2BA 4TLLB 1N0TA 1FQBA 4OENA 4OERA 3VLVA 1MQJA 2O51A 4NF6B 2Q89A 3S9MC 4N13A 2G93A 1M5BA 4GQOA 4IO6A 3M3KA 3K6UA 1Y1MA 2Z8FA 4O3CA 1NKXA 1UTBB 4NF4A 5I56A 5AA1A 1O63A 1MM7A 3O29A 4FAJA 2YJPA 4OFLA 3K02A 1VFDA 1YAEA 4GL8A 3TCGA 3S9EA 1PEBA 4GXAA 4DIGA 3IO4A 3H6WA 4U2RA 5TP9A 3U94A 3FXUA 1CB6A 5JTYA 3OO9A 3GBBA 5FTIA 4U21A 1SYHA 5CMMA 4ZEIA 2YLNA 2H5YA 4DLDA 2I4CA 4R6YA 3V83A 2R6GE 1Y1ZA 4MLVA 4ZE8A 3IOUA 1M5FA 1B3EA 4O3BA 3UK4A 3T9UA 2A5SA 4MH5A 3TTKA 1POY1 1A55A 1OVTA 3PUZE 2V3UA 1SQYA 4LATA 3FGSA 1GVCA 2PT2A 4IO7A 4PE5B 5I58B 1MG1A 3PUWE 3QUJA 3Q29A 1S9TA 3U93A 4OEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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