1LBCA

Crystal structure of glur2 ligand binding core (s1s2j-n775s) in complex with cyclothiazide (ctz) as well as glutamate at 1.8 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamine Receptor 2
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lbcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lbcA01
3Q29A 4PFWA 2AL5A 2G29A 3S4UA 4YB7A 3TTNA 1FTLA 3FXUA 4FECA 5AE4A 4F22A 3DP8A 3GXAA 5KZTA 3OOAA 4G68B 3LR1A 4DXBA 5I56A 3MJNA 3FV2A 3RLFE 3IORA 4F39A 2XXVA 1GTKA 3C9HA 4U4XA 5F7VA 2D3IA 4ELRA 3RGYA 4F31B 3PU5A 3LSLA 5CMMA 3T9HB 2QRYA 5FHOA 2QS1A 3USDA 1USYE 3IB1A 3E13X 3IJXB 2NVUB 1MPDA 3PUXE 2I0CA 5A5XA 3KZGA 1LAXA 3FXQA 5H8HB 1BIYA 5TPAB 4HS7A 1P1WA 1MY2A 3LSXA 1B40A 2Z8DA 5F1QA 4NF8A 4XKPA 2REGA 4XKNA 5H8QB 1MQDA 1B51A 1IXGA 1PB8A 3D4CA 2IA4A 4BDQA 3FVNA 5CI5A 2V93A 3B6WA 4RPOA 4KI0E 2REJA 3K4UA 4NF5B 4ONYA 4QHQA 4F19A 3U1OA 1MY3A 2W7YA 2ALUA 3N94A 4R74A 5DVFA 4OWDA 3Q26A 5B7DA 1D9YA 4F3BA 2Y7WA 4IO7A 3S9EA 1OQGA 4ISUA 1Y3NA 3IB2A 3OO7A 3KN3A 4F1VA 5ICTA 1LB8A 3K1PA 1F9BA 4H8IA 1XC1A 1MRPA 3K2DA 1R9QA 3PUYE 1I6AA 4FORA 3PGFA 1SW5A 4N13A 2VGQA 5I2KB 3K0VA 4RYAA 2ZYKA 1ATGA 1DOTA 2Q2AA 2DS9A 1OVBA 1QJMA 2Q8JA 1N7WA 3SESA 1MQGA 4X1DA 4MFIA 1LGBC 4YICA 1I6QA 1PB9A 3ZKKA 3O6HA 2Z22A 4DCYA 2XHDA 3MZ1A 5AA3A 3TCFA 4YKKA 3Q25A 1PBPA 1XVXA 3H6UA 1ELJA 4DXUA 3C31A 1LBBA 4ZEBA 1WVJA 4OXVA 5JK4A 1O64A 3DP6A 2H98A 1URSA 1MPCA 2ZYOA 3O66A 4IGTA 3FIRA 2NUVA 2DWHA 3T9VA 4JDFA 4HTGA 2YPNA 2ONKE 3MQ9A 4F3GA 1BTJA 2DYXA 4MLQA 5L9MA 4K3FA 1N7XA 3A3UA 1I6BA 1SW1A 4UACA 3SEXA 2NOOA 1VR5A 1QKBA 4R6HA 4IO2A 3O28A 3EPEA 3TZAA 3CRBA 4U21A 5HPQA 2DVCA 4U23A 4EDPA 3MW0A 1D3KA 1UQWA 2XX9A 4R2BA 3JV9A 2V3TA 3IO4A 3FJMA 3QUFA 2QS3A 3UGWA 3TUSA 1B46A 1NH8A 2UYFA 2AL4A 1MQIA 4AB5A 1Y1ZA 1PDAA 3PPNA 4EQ9A 3TQWA 3MVZA 1JW1A 3K6XA 1NNFA 2PX1A 5BUUA 2BJJX 2GHBA 3V83A 3UIFA 1URDA 3KJTA 3CG3A 3FASA 2RC9A 1Y20A 3MP8A 5L8DA 2H99A 3DP4A 5FHNA 4NMYA 2HZKA 2O84X 1Z7ME 1CE2A 3S9NC 3M3FA 5A5XB 3G7WA 3QSLA 4NTLA 4C1TA 1A40A 4O3CA 4ECFA 1MXZA 2O1LA 5DTBA 3LC8A 1MS7A 4HCYA 2OWTA 3RPWA 3S9MC 1Z7NE 3OEMA 3RT8A 3QYTA 3G3JA 4KPTA 4DE8A 3QXMA 1A99A 1MM6A 2UVJA 3VVDA 4DZ1A 3EN3A 3CFXA 5AA2B 2YLNA 3O9PA 4Q0CA 3HN0A 2F36A 3V5AA 1MDQA 4MH5A 4ZZEA 4QRZA 4IY5A 1Q35A 4ZEIA 3SDFA 3FXRA 4IO3A 2Y7IA 1XS5A 2R6GE 3VLWA 1ZBMA 2H25A 1JQFA 3EHUA 3I6VA 1R6ZA 2A5TB 4C0RA 1FQCA 4Q5TA 2DE3A 4XXUA 3O2AA 4FAJA 1P99A 4U1OA 4O3BA 3IAZA 5DVIA 4AB6A 3C34A 3SEYA 3UN6A 5H8FA 4GQOA 1UTHB 4E0WA 1XHYA 1MXWA 2PYYA 3KSJA 2LAOA 1P1OA 4KQPA 5JTYA 4UA8A 1EH3A 1Q1KA 5KDTA 4PFTA 3MVWA 2NWJA 1Y1MA 2CMOA 2XXHA 3FV1A 1UTBB 1B4ZA 3B7DA 4RK9A 1JW5A 1SI1A 4H6DA 1S9TA 3IOTA 4ZE8A 1VFEA 1ZJLA 1YTVA 4BLAA 1ZMGA 3K01A 3P7IA 3V8XB 4QFLA 5H8SA 4RY1A 3GLBA 5H8NB 2DE4A 4NWDA 3E9XA 3H6WA 4JWOA 3K6WA 2B3FA 5HM4B 3VFJA 3CI8A 3QAXA 3KBRA 4JBZA 4MF3A 4XTCQ 1B0LA 4NEDA 1OMPA 4R72A 4LZ5A 3C36A 4G2ZA 2I58A 2VP1A 5I84A 5J1DA 3KOTA 4U1ZA 4L17A 3WAFA 3IB0A 3CVGA 4ELQA 3R26A 4OVJA 1B3GA 1JVXA 4YKJA 1PC3A 2I4BA 4F29A 1N0TA 3H03A 3K02A 2F7AA 1EU8A 3SEWA 4M1VA 4LZ8A 3FVOA 4IGRA 2OK2A 4YKIA 2ZNTA 2P0SA 3L6HA 5TP9A 4GL8A 1N3XA 2DVZA 1EZOA 1ANFA 4GL0A 4WEPA 1FQBA 3PUVE 2PMSA 3I5OA 2F8DA 2GFEA 3MUQA 3VVFA 1LFGA 2QPQA 5CBSA 4FE8A 3TCHA 1USYH 1OVTA 2XXTA 3CG1A 3TYHA 1N3WA 3LSWA 1IITA 3UORA 1B05A 3TKDA 3JZJA 4NE4A 3V89B 3O6GA 4AQ4A 1FTMA 2OJTA 2Y7PA 4POXA 1DMBA 3U93A 1QKAA 4THIA 1SDXA 4YB5A 3UA8A 5I59B 1ZLQA 5I57B 3K6VA 5K2XA 3I3VA 4ZS9A 2VOZA 3AXFA 2OLBA 5IAIA 4LATA 1IXIA 3WAEA 5CMBA 3CFLA 2RC7A 2XX8A 4NF4A 3PMWA 5KCJA 2PVUA 2HCAA 1MH3A 5EYFA 5L9OA 4H67A 3U8QA 3T96B 4QSDA 3IR1A 4GXAA 1IQ7A 5CBRA 4R9FA 1MPBA 1LCFA 2PT1A 1R1NA 3C32A 2OCUA 3FATA 3T93B 1N76A 1TT1A 1B5HA 1BLFA 1MY1A 4QFOA 3M3KA 1T0KA 4RPNA 4WEDA 3TTRA 1QW0A 2OZZA 2DXYA 3U94A 4IO5A 5B70A 1FTOA 4KYSA 4EXKA 4Q8RA 4KCCA 2O6AA 4EF1A 3OELA 2Q89A 3E4RA 4H0WA 3HSTA 2F6GA 2O7IA 4OTEA 1A54A 2XXXA 3VLUA 1SD3A 3RTFB 4LQ5A 3FVGA 5M2VA 1RKMA 2E1SA 3TODA 1NL5A 3PUWE 1CB6A 1TFDA 3W9VA 5I2NA 1II5A 2ABHA 1FQFA 2XX7A 3VV5A 5FHMA 4PFUA 3TTMA 5DT6A 1Y9UA 2R9JA 1WDNA 2Y84A 4I9DA 4IO6A 4NF6A 1H76A 2RF1A 2I4CA 4JXIA 4ZE9A 4YKPA 1SBPA 4OEUA 4BDRA 3B6QA 4TLMB 1H45A 3PUZE 4RNSA 4YMAA 4EXLA 1MXXA 3FJ7A 3QUJA 4EQ7A 1H43A 3G3IA 2VHAA 4FEBA 2QSXA 1MXUA 5AA4A 1OLCA 4P11A 5DEXA 1HSEA 3C33A 1LAGE 4TOZA 3QK6A 4U4SA 5I56B 5CM6A 4RXLA 1OIBA 4C1UA 5ITOA 2ONSA 2O51A 1OLAA 1SQYA 2VD2A 1A55A 1S7YA 2B65A 4PP0A 4G68A 1H44A 4PETA 1XOCA 2UVGA 3EHSA 4MBPA 5FTHA 4QF9A 1EZPA 4IB2A 4OERA 5CMKA 3N26A 4ZEDA 2E0SA 2XXUA 2OBGA 3LBSA 4U2RA 2V84A 2ZNSA 2V3UA 4GXSB 2HAVA 3T22A 1MQJA 3TQLA 4DXCA 3RUMA 1GR2A 1QUJA 1JETA 4NF8B 3KGCA 5H8HA 5TPAA 5ICQA 1EZ9A 2PBWA 2P1SA 1M5CA 4YAHX 5TU0A 4RJZA 4G8NA 2UVIA 4GF8A 1LFIA 5H8QA 4JWXA 2D21A 1POTA 2I6EA 5K2YA 3RN8A 3IJOB 3OSRA 1MH4A 1AIVA 2ZYNA 1B1HA 1N04A 2VD3A 4EF2A 2Q88A 2QMWA 3PMVA 3VLVA 2DWAA 4NF5A 1JEVA 1JVYA 4G68C 3VE1B 3HHGA 1FTKA 1UIUA 2UVHA 4F2OA 1H3DA 1DPEA 1BKAA 2Z8FA 3D4GA 5EHMA 1IXHA 1B4HA 3KSXA 1SYHA 4R73A 4PQJA 2F35A 2I48A 1SW2A 2ONRA 2HQ0A 4NWCA 1A8FA 2DWJA 1LLSA 2O7UA 3LSFB 1TFAA 4OEVA 3BFUA 4ZZAA 2RCAA 3DLNA 3N6UA 2F5XA 1HSJA 5I2KA 2Y7KA 1DTZA 3ZSFA 3F11A 1JEUA 1NMUA 4R6KA 4HW8A 1POY1 4GRKA 4KFQA 1B6HA 1Y4CA 4MLVA 3OSQA 1LFHA 4KHZE 3K1MA 3MWBA 1B3HA 4YZZA 3O6IA 1LBCA 3TCGA 4KD5A 1B0HA 4OFOA 2HFBA 4POWA 3RY3A 4FEDA 4ZECA 4F18A 3KN7A 3IOVA 3IO6A 2RINA 3CSBA 5EHSA 3PPRA 4RK2A 1D9VA 5IKBA 3FJGA 1NH7A 4OETA 4TLLB 1UIVA 3JYRA 4QSEA 3G3FA 4R9GA 4JSOA 3ILUB 1B5IA 4YMBA 3GBAA 2DP8A 1L5TA 2AIXA 3SEVA 4EQBA 4FIMA 3RNNA 2D5WA 2IEEA 1NKXA 1RYXA 3OENA 3OO8A 2DWIA 4G8MA 4H8JA 3SERA 4LA9A 1NNTA 2RCBA 4IY6A 4RA1A 1B7UA 1HSLA 3KN8A 1PBQA 3H6TA 1JW4A 3TELA 2F7CA 3MPKA 4X1BA 2DE2A 3FVKA 3IOWA 4DDDA 3BKIB 1VSOA 3ZS6A 4GFRA 3IX1A 2O1MA 3M3LA 2ZNUA 2GHAA 5DYHA 3HV1A 2DSFA 2GH9A 4OMBA 4F2QA 2H5YA 3OXNA 2WKYA 4JB7A 3PV0E 2Q2CA 1FTJA 4JWYA 3TPAA 1DPPA 2DOJA 2M8CA 3S9LC 1SI0A 2ZYMA 1DSNA 2I49A 3KOSA 1US5A 3HO7A 4BDOA 1GVCA 3OD7A 1IZ1A 5JEIA 3QIMA 1QVSA 4LVQA 1NFTA 1AL3A 2F97A 1M5DA 2B3BA 4R6YA 3K00A 3VXBA 3MVYA 4N07A 3R7XA 3ILTB 2XXIA 3T66A 1PEBA 4LP2B 1B58A 2XXPA 1IXCA 1GV8A 4F1YA 3C4MA 1B52A 1B7ZA 4OFLA 1YCJA 2GRVA 4PE5B 3H6VA 1LCTA 3U92A 3PD8A 4QFKA 1J1NA 4H65A 5CC2A 1LB9A 1MY0A 3K6UA 5AA2A 2ZXTA 3FZVA 3DM0A 3KEIA 4GWOA 3HHFA 1B7HA 2X26A 2ESNA 2RKMA 3EQ1A 3CFZA 2HZLA 2AYSA 4H5GA 3B6TA 1B2HA 5FTIA 4XIGQ 3G3KA 2UYEA 4I8CA 2FYIA 3MZ9A 3RTWB 1IEJA 1LAFE 5H8FB 3TMGA 1MDP1 1IIWA 2A5TA 2DXRA 4G8HA 3BBRA 5JTYB 3IOUA 4YB6A 5KDTB 1UTHA 5L9SA 3FD3A 3FGSA 1KWHA 1MQHA 2XXQA 3G3GA 4N6PA 4FJPA 4GD5A 2XXWA 1WODA 1P1NA 2PT2A 4ESWA 1Y3PA 5ISUA 1B5JA 1R9LA 1US4A 3N5LA 4WXJA 4DLDA 3OEKA 1UTBA 3H3GA 2F6PA 1GGGA 1B3LA 2QS4A 1URGA 3CIJA 1ZTYA 1LSTA 1MG1A 4G77A 2O68A 1FQEA 5I58A 4FATA 3O29A 3GBBA 2F78A 4LUBA 2QMXA 2I3WA 1JNFA 4X48A 3TEPA 3K1NA 4F3PA 1A7LA 1VE4A 3GZGA 3OMBA 5H8NA 3KG2A 2X7PA 1D4NA 2OWSA 4P0GA 2XXYA 4I62A 4XKRA 2THIA 1N84A 2XD2A 4TQUQ 1B9JA 2FNCA 3W15C 5ELVA 3SETA 1M5FA 4BDMA 1NNKA 3S2VA 1B1XA 3KFMA 4P0IA 2P2AA 5CRYA 1SW4A 3MP6A 3HPIA 1ZKBA 4QFNA 4ZEFA 2Y7RA 4ELOA 2FA7A 1B3EA 3PPPA 1OQHA 1M5BA 2H9BA 4F1UA 3RQTA 3E3KA 3PPOA 4OQOA 4ND9A 1RYOA 5TP9B 3CR9A 4OYVA 2Q9TA 4O3AA 3H7MA 2H4IA 1TXFA 3TTKA 1QUIA 4KCDA 1O63A 2A5SA 3EF7A 3SKPA 4JSDA 1Y3QA 3W9WA 4F3SA 3PPQA 2ZMBA 2RC8A 3ZKLA 1S50A 4ZDMA 3CSGA 2F34A 3MAMA 4GOTA 4H1XA 4EUOA 2CZLA 3IL1B 3Q27A 1PB7A 2HXWA 4OENA 3VXCA 3MVXA 1P1UA 2XXRA 1XT8A 4X9TA 3MP1A 1SVXB 4Z7EA 3BFTA 2R71A 5AA2D 1B3FA 4ZEKA 2O69A 4M4GA 1SYIA 3OO6A 3KJ7A 1IUDA 3RT6B 2V25A 4OFJA 3MPLA 3PD9A 2YJPA 3DELB 2KLFA 5I59A 4HCWA 1ZIUA 5DVJA 2XD3A 2HEUA 4Q30B 1P1QA 5I57A 4NF4B 5KCJB 2HAUA 3LUYA 4Z0IA 1DTGA 3N6TA 3UK4A 1O7TA 2Z23A 4DCXA 4LONB 5AA1A 4XKQA 4H5FA 4KYDA 1YPNA 1TWYA 3L6GA 3HCQA 3TAJA 2NXOA 1NNPA 2F7BA 4R2FA 1FQDA 4OZ9A 2QJEA 3Q28A 4KYEA 3ODBA 4BDNA 3EHTA 3O97A 1VFDA 3H4ZA 3MC2A 3M8UA 4QSCA 3MBPA 5ITPA 4BDLA 2QS2A 4KR5A 1AH5A 4U22A 3G3HA 3T9XB 1B32A 1LAHE 2V3QA 1YAEA 3MZBA 4DIGA 1Y4TA 3T9UA 1AOVA 4YU0A 3FUZA 4LQ2A 4ESXA 4GVOA 1FCKA 4G4PA 2QL3A 4QFPA 4WKMA 3A09A 2X7QA 3ECRA 5I2NB 5I58B 2I3VA 3TTLA 4LZ7A 3PMXA 1XVYA 2Z8EA 3C35A 1MXYA 4OHNA 1AMFA 3U72A 3VDFA 2I0BA 3R6UA 1BP5A 1M5EA 3TDJA 4NF6B 1QULA 1MY4A 2G93A 3UP9A 1FW0A 2DQVA 1MM7A 4R75A 1I69A 5BWJA 3ONMA 4OESA 5LOMA 4PFYA 2UXAA 1ZU0A 3A3CA 4E0XA 3OO9A 4I1DA 3TFLA 4ELPA 2ANJA 3IK6B 1QUKA 3THIA 3H06B 4IO4A 3VVEA 5AA4B 1A8EA 3SEUA 5CMCA 1FQAA 4GLIA 5HBCA 1MXVA 4GIZA 5DEXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q29A 4PFWA 2AL5A 2G29A 3S4UA 1KA0A 4YB7A 3TTNA 1FTLA 3FXUA 4FECA 4XEQA 5AE4A 4F22A 3DP8A 3GXAA 5KZTA 3OOAA 4G68B 3LR1A 4DXBA 5I56A 1JP4A 3MJNA 2P3VA 3FV2A 3RLFE 1FPGA 3IORA 4F39A 2XXVA 1GTKA 3C9HA 4U4XA 5F7VA 2D3IA 4ELRA 3RGYA 4F31B 3PU5A 3LSLA 5CMMA 3T9HB 2QRYA 5FHOA 2QS1A 3USDA 1USYE 3IB1A 3E13X 3IJXB 2NVUB 4MNCA 1MPDA 3PUXE 2I0CA 5A5XA 3KZGA 4I40A 1LAXA 3FXQA 5H8HB 1BIYA 5TPAB 4HS7A 4JVCA 1P1WA 1MY2A 3LSXA 1B40A 2Z8DA 5F1QA 2WBBA 4NF8A 4XKPA 2REGA 4XKNA 5H8QB 1MQDA 1B51A 1IXGA 1PB8A 4PGPA 5ET8A 3D4CA 2IA4A 4BDQA 3FVNA 5CI5A 5EYHA 2V93A 3B6WA 4RPOA 4PF8A 1NV6A 4KI0E 2REJA 3K4UA 4NF5B 1FBPA 4ONYA 4QHQA 4F19A 3U1OA 1MY3A 2W7YA 1FBEA 2ALUA 3N94A 4R74A 5DVFA 4OWDA 3Q26A 5B7DA 1D9YA 1KZ8A 4F3BA 4HXVA 2QVRA 2Y7WA 4IO7A 4OANA 3S9EA 1OQGA 4ISUA 1Y3NA 3IB2A 3OO7A 3KN3A 4F1VA 5ICTA 1LB8A 2ZZWA 3K1PA 1F9BA 4H8IA 1XC1A 1MRPA 2XWVA 3K2DA 1R9QA 3PUYE 1I6AA 4FORA 3PGFA 1SW5A 4N13A 2VGQA 4NHBA 5I2KB 3K0VA 4RYAA 2ZYKA 1ATGA 4N8GA 1DOTA 2Q2AA 1NV0A 2DS9A 1OVBA 1QJMA 2Q8JA 1N7WA 3SESA 1MQGA 4X1DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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