1LBCA

Crystal structure of glur2 ligand binding core (s1s2j-n775s) in complex with cyclothiazide (ctz) as well as glutamate at 1.8 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
b'NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamine Receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lbcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lbcA01
5TPAB 3HV1A 3OSRA 1A8FA 3HCQA 5ICTA 1DTGA 1MDP1 4C1TA 3H3GA 5ITPA 3OSQA 1OIBA 4DCXA 1TT1A 4H67A 4U1ZA 1B2HA 2CZLA 4DCYA 4AB6A 1LAGE 4YKIA 2UVJA 2AL5A 3Q27A 3N6TA 1UTBB 5DVFA 4ZEFA 4NF5B 4PFUA 3TELA 4WXJA 2O1MA 2REJA 2XXRA 3FIRA 2I0BA 1MXZA 3MP8A 4YKJA 1MQIA 3G3GA 1A40A 2ONSA 2X7QA 3PPNA 5TP9A 1US5A 3IB2A 3IO6A 3SERA 2B65A 4KYEA 4OFOA 2RC9A 5I2NA 4KR5A 3SEXA 3KJ7A 2FYIA 1B3HA 4DIGA 3U8QA 4KHZE 1PBPA 5B7DA 5AE4A 3W9WA 4FEBA 2F7CA 1QKAA 1A8EA 2XXWA 1MXWA 1URGA 1MRPA 1XHYA 2Z8DA 4F3GA 3FV1A 3KN7A 3FATA 4ZS9A 3VXCA 3SETA 3MQ9A 2XHDA 3O6GA 3HSTA 3MJNA 1ZU0A 3FGSA 4H5GA 2R6GE 1MQHA 3Q29A 1AH5A 4TLLB 3TODA 1WVJA 1MXUA 2QS4A 3MWBA 1MXXA 1IXIA 4F1VA 4R2BA 3DLNA 5LOMA 4ELRA 5ELVA 4I62A 1MDQA 3BKIB 2VHAA 3GBAA 4RNSA 1N7WA 2IA4A 3IX1A 3T9VA 3G3HA 3UN6A 2ZNSA 3PMVA 2OJTA 4PETA 3G3FA 2D5WA 1UIVA 2F78A 4KQPA 4KPTA 3VXBA 5FTHA 3E4RA 4BDRA 3CRBA 4XKNA 2XXUA 1FCKA 2Q89A 2RC7A 3RPWA 4RK9A 2I49A 4G68A 2RCAA 5DTBA 2GRVA 3CFLA 4OTEA 3EF7A 4XTCQ 3VE1B 3TYHA 2XXVA 1IZ1A 1MPCA 2IEEA 1H45A 3KJTA 4IGRA 4Z7EA 1B1XA 3U93A 3ONMA 1GTKA 1SD3A 1B0LA 3OELA 1SYIA 2QS1A 1QULA 4GF8A 1D9YA 3QSLA 1Y3NA 1TFAA 1UTHB 2DSFA 1Q35A 1P99A 4N07A 4R73A 4G77A 3S9MC 1N0TA 2V3QA 3TTLA 5AA4A 4QSEA 3DP8A 1JW1A 1POY1 1RYOA 3OOAA 3V8XB 2DXYA 3GBBA 1IIWA 3TQLA 1BLFA 3A3UA 2DVCA 2RC8A 3P7IA 1MH3A 4DXBA 4GRKA 4FATA 1QVSA 3CI8A 1H76A 3PV0E 4NF6B 2UYFA 4R2FA 1BKAA 3C34A 4GL0A 3K6XA 5ISUA 1MXVA 3D4CA 3C35A 3LSFB 2B3FA 3R26A 1MQDA 2O7UA 3QIMA 3TPAA 2O6AA 3FD3A 3K01A 4QFNA 4NTLA 3N6UA 1IXGA 5L8DA 4XKQA 1I6QA 1NKXA 1N76A 4JWYA 4HCWA 3ILTB 3T9HB 4O3BA 5H8HA 1MPDA 1LAHE 3DM0A 2Z8EA 2I58A 5FTIA 1A54A 1R9LA 5I58A 3N5LA 3MBPA 4EQ9A 4QF9A 1IEJA 2F34A 1S9TA 4IGTA 4ELOA 2B3BA 4OZ9A 1A99A 1B32A 3N26A 3LSLA 3RGYA 3PGFA 4E0WA 1Y9UA 4NWDA 4G68C 2OWSA 3FVNA 3TDJA 3E13X 2F7BA 2RKMA 3KSXA 1D4NA 3SEWA 1FQEA 4TQUQ 3B6TA 3TAJA 3B7DA 3K6VA 3TMGA 3CFXA 1JVYA 2G29A 4MLVA 4U4XA 5I57A 4YB5A 3F11A 4RYAA 1O64A 3MP1A 1USYE 5H8NA 3PUWE 5ICQA 3VV5A 1DOTA 2R9JA 3VVDA 3W9VA 1CB6A 1XT8A 4ELQA 3FJMA 3IL1B 2DP8A 4EXLA 1UQWA 3Q26A 5CI5A 4DE8A 3OO7A 5BUUA 1MY3A 1NNTA 3O28A 4UACA 3B6QA 5EYFA 1ANFA 2VD2A 1D9VA 1JEUA 4JSDA 1VSOA 2PT1A 1Y1ZA 5FHNA 5KCJB 4U2RA 4OMBA 2H25A 3O6HA 2ZXTA 4FJPA 3U92A 4N6PA 3Q25A 1B0HA 5I84A 4IY6A 5DVJA 5FHOA 2QL3A 4PE5B 2V84A 2XX9A 1R9QA 5DYHA 1ZJLA 3Q28A 4YKKA 2DE4A 3RTWB 3MC2A 4F2QA 4YKPA 4H0WA 3WAFA 3H6TA 1YPNA 3OXNA 3FVOA 4P11A 1ZKBA 2F35A 4R9GA 1IQ7A 3KG2A 3KSJA 4ZEKA 1MS7A 1LB8A 1FTJA 5H8FB 4QRZA 3MAMA 5A5XA 1B3FA 5CM6A 3MVXA 1QKBA 2OWTA 2XD3A 4IO4A 4KFQA 4G8MA 3MVZA 1JW4A 4X9TA 2OCUA 2H5YA 4F2OA 1T0KA 1ZLQA 4G68B 5I2KB 1I69A 3THIA 1MY1A 5TU0A 2NXOA 4ZZEA 3O2AA 1VFDA 4H8IA 4R9FA 4F18A 4Q5TA 4MBPA 4GIZA 3PUZE 1D3KA 4YICA 1MY2A 4RXLA 3FJ7A 3CSGA 2Y7WA 3BFUA 3K6WA 4MFIA 4QFPA 3I3VA 3C36A 1ELJA 5DEXA 3PUVE 3U1OA 2QS2A 2Z22A 3MPKA 1I6BA 5CMBA 2YLNA 1Y4CA 1H3DA 4LQ5A 2RF1A 1XC1A 5K2YA 3JV9A 2HEUA 3W15C 3MW0A 1AL3A 2ZYNA 1B05A 1VR5A 1P1NA 3MVYA 3FVKA 1XVXA 4KYDA 4ZECA 1SW1A 4C0RA 2XXYA 1URDA 3RY3A 4F29A 3PMXA 3KOTA 4F22A 4LA9A 4ZEBA 4R6KA 1LB9A 5H8QA 2QMXA 1GV8A 3ZS6A 2H9BA 4H1XA 2Q88A 1XVYA 3KN3A 1PDAA 4R75A 4G4PA 2O84X 2Q2CA 3IJOB 1B9JA 1BTJA 4WEDA 4FIMA 5H8SA 2Y7RA 3ODBA 2AYSA 1DPPA 2OZZA 2I48A 1B7ZA 1R1NA 4UA8A 4RK2A 2XX8A 4LVQA 1N7XA 3GZGA 4O3AA 2ANJA 3RQTA 1OVTA 1EZOA 5I59B 1ZMGA 4LUBA 1LCTA 4GD5A 1FQAA 2D3IA 2Q9TA 3IB0A 3JZJA 2DYXA 4PFWA 3B6WA 5CMKA 3MZ1A 3UK4A 2VP1A 3C32A 3OO9A 4R6YA 5EHSA 3EHUA 3K0VA 3EHTA 3T93B 2PVUA 4PQJA 3FVGA 3GLBA 4NMYA 1AMFA 2RINA 3LUYA 2XXQA 1NNFA 5TPAA 3OD7A 2GFEA 5KDTA 2PBWA 4BDOA 2ZYOA 1NNPA 1DMBA 3K1PA 4EXKA 4IO6A 3UORA 2P0SA 4ZE8A 2Z8FA 4DDDA 2QS3A 3PPRA 4IO2A 3V89B 1LFHA 2PT2A 5HPQA 3TTKA 1VE4A 4Q8RA 1JEVA 5IAIA 5M2VA 3TEPA 1N3WA 3OMBA 2O51A 4LONB 2GHAA 4NF5A 4DZ1A 1SI1A 2P1SA 4LZ8A 2CMOA 4KCCA 3PD8A 1LGBC 3K6UA 2HCAA 2H99A 3G7WA 3BBRA 3TUSA 2ESNA 4LZ7A 4PP0A 3LBSA 2Y7KA 4ZDMA 3L6HA 3JYRA 5JTYB 5AA3A 2REGA 3ILUB 3T66A 3H6WA 3AXFA 3GXAA 1A55A 3TZAA 4YU0A 1TXFA 1LFGA 3SEVA 3T22A 4H8JA 3RNNA 2GH9A 3TQWA 2HXWA 4KI0E 2NOOA 3PMWA 3O29A 3LC8A 1Z7NE 4NF4B 3S2VA 2DE2A 1OQGA 3R7XA 5CRYA 1OQHA 2I0CA 2G93A 3V5AA 4MH5A 3VLUA 3ZKKA 3UP9A 4WKMA 3IORA 3K02A 1H43A 4OVJA 1B6HA 2O7IA 3IOVA 4ND9A 1UIUA 4O3CA 1NNKA 1JW5A 4NF8B 2F8DA 3SEUA 3VLWA 4IO7A 1EZPA 1XS5A 2BJJX 4MF3A 5I56B 2NWJA 5KZTA 1FTMA 4I9DA 1SW4A 2F6GA 1BP5A 5FHMA 1FTKA 3EN3A 3PPOA 4OEVA 2QSXA 4IO5A 2WKYA 4GVOA 1YAEA 5CC2A 3E9XA 3KBRA 4X1BA 1QUIA 2YJPA 4F3BA 3S9LC 2DOJA 4QFOA 3RT8A 3IO4A 1LSTA 1JVXA 1TFDA 2ZYMA 2ONRA 2DQVA 3A3CA 1WODA 1F9BA 1EH3A 4PFTA 1A7LA 2HFBA 1QW0A 4YB7A 2ALUA 1FTLA 1UTHA 4N13A 3KEIA 4G2ZA 1B4ZA 5TP9B 4AB5A 5B70A 3OEKA 1WDNA 2XXXA 4OEUA 3O66A 2X7PA 3CG1A 3TTNA 4OESA 5ITOA 5I2NB 1FQDA 4YAHX 1B40A 4I1DA 2X26A 1CE2A 1XOCA 4OENA 4F3SA 1SW5A 3I5OA 3CR9A 2E0SA 1LAXA 1NH7A 4YZZA 2VGQA 4ECFA 2V93A 4M4GA 1P1WA 2A5TA 2V3TA 2FNCA 4H5FA 2Y84A 3O97A 4C1UA 2I4CA 2DWIA 4EQBA 3CVGA 3UIFA 4NF6A 4THIA 1B7UA 2H4IA 1B7HA 2DVZA 2DWHA 2P2AA 3LSXA 2Q2AA 1M5CA 3FXUA 1JNFA 5K2XA 3RN8A 3PUYE 3IOTA 5BWJA 4QHQA 1OMPA 3HHGA 2LAOA 4JWXA 2UYEA 1B5HA 1TWYA 1URSA 4JWOA 3FV2A 3BFTA 1MQGA 1YCJA 3VVEA 1PBQA 5AA2A 1N84A 2I3WA 3S4UA 3FXRA 3QK6A 3PUXE 4YB6A 5HM4B 4OFJA 3KFMA 3FJGA 1SDXA 4QFKA 4R72A 3WAEA 5CBSA 1L5TA 4KD5A 2F36A 2PMSA 2I3VA 1O7TA 1S7YA 4GWOA 3MZBA 4RJZA 5KDTB 1MY4A 1GGGA 3G3JA 3C33A 1PB7A 3H7MA 1QUKA 3U72A 2I4BA 2PX1A 3LSWA 4JDFA 2ZYKA 4RPOA 2YPNA 3M8UA 2QJEA 3U94A 4ELPA 5L9SA 1II5A 2XXPA 3KGCA 3K2DA 2F5XA 4GXSB 3K1MA 4Q0CA 1O63A 2QPQA 2KLFA 4FORA 3VLVA 2HQ0A 2XX7A 1HSEA 4U22A 5AA4B 3PPQA 3CSBA 2QMWA 4OETA 4M1VA 4BDQA 1KWHA 3DP4A 2Q8JA 4OYVA 2O68A 2DS9A 1J1NA 1MH4A 4IO3A 4FE8A 3H06B 3O6IA 4I8CA 4F19A 1LBBA 1FW0A 4K3FA 4KCDA 2E1SA 1SYHA 5CMCA 2ABHA 3PPPA 3FXQA 3CFZA 4R6HA 1HSLA 1QUJA 3QUFA 1B51A 2HAVA 3ZSFA 2ZNTA 5KCJA 3TCHA 5F7VA 2THIA 5JK4A 3N94A 3H03A 3MPLA 4HCYA 4POXA 4L17A 3H4ZA 5L9OA 1MPBA 4AQ4A 1RYXA 1PC3A 4EF1A 2OK2A 1IXCA 5H8HB 1EU8A 1SQYA 1S50A 4RY1A 4EUOA 5I58B 1NL5A 2XXIA 2QRYA 1M5BA 3M3FA 3H6UA 1MG1A 1N3XA 1B5IA 4JB7A 2HAUA 1Y3PA 4OWDA 4OERA 5HBCA 3OENA 2ONKE 4ESXA 1B4HA 3K1NA 2Z23A 4RPNA 4G8HA 5H8FA 1OLCA 2OLBA 4PFYA 4QFLA 1OLAA 3FZVA 1USYH 4YMBA 1B58A 4TOZA 2AL4A 1BIYA 3QXMA 3TFLA 4P0GA 3R6UA 3TTRA 4GXAA 3TCGA 1M5EA 3FASA 3I6VA 4H65A 3MZ9A 4JBZA 1P1QA 5I2KA 1Y4TA 3TTMA 3M3KA 3IB1A 4DXCA 1LFIA 3D4GA 3ZKLA 5I57B 3T9UA 3QYTA 4GLIA 1UTBA 4FEDA 1PB9A 1LCFA 1QJMA 3K4UA 1MM6A 5H8NB 4EDPA 3USDA 3M3LA 3S9EA 1GR2A 2DWJA 4DXUA 3SESA 3TKDA 1M5FA 5DT6A 2GHBA 4MLQA 3TCFA 1POTA 2F7AA 1B46A 2AIXA 2H98A 3IR1A 2UXAA 2O69A 5L9MA 4JXIA 3RT6B 3QUJA 1JQFA 3MVWA 2HZLA 4ISUA 4POWA 1B5JA 3MUQA 3HN0A 3L6GA 1AIVA 1ZIUA 2XD2A 2W7YA 3KOSA 4LZ5A 4TLMB 1SW2A 4QSCA 1IXHA 3IOWA 2A5TB 1NH8A 4F1YA 3DELB 1SBPA 2R71A 4GOTA 4R74A 1IUDA 4GL8A 1ATGA 3KN8A 2RCBA 4NWCA 1I6AA 3EHSA 3SDFA 4FECA 4ZEDA 4H6DA 2ZNUA 4XXUA 3LR1A 2VOZA 3IAZA 1OVBA 3K00A 4OHNA 1DTZA 4X1DA 2HZKA 3RTFB 1SI0A 4LQ2A 3C31A 2UVGA 2DE3A 3IOUA 4G8NA 3SEYA 2DXRA 2PYYA 5JEIA 2M8CA 1ZTYA 5I59A 4U4SA 4NE4A 4LATA 4XKRA 3SKPA 5AA2B 1YTVA 5J1DA 4Z0IA 2XXTA 3G3KA 3O9PA 3CIJA 1LAFE 3OEMA 3T9XB 2UVHA 5A5XB 1P1OA 3EQ1A 1IITA 3UA8A 4E0XA 4EQ7A 4ZE9A 4JSOA 2XXHA 1HSJA 3IK6B 3S9NC 3V83A 4X48A 1PEBA 3QAXA 4Q30B 1FTOA 3E3KA 2O1LA 4KYSA 4DLDA 4BDNA 3VDFA 3G3IA 1AOVA 4XIGQ 1JETA 1B52A 1RKMA 2UVIA 5DEXB 3HPIA 3EPEA 3KZGA 2V3UA 4GFRA 2OBGA 4LP2B 4BDLA 1NFTA 4GQOA 5IKBA 1N04A 4BDMA 1B3LA 4HTGA 2V25A 5AA1A 3T96B 1MM7A 3CG3A 3HO7A 2I6EA 3ECRA 3UGWA 4OQOA 1GVCA 2ZMBA 5F1QA 2F97A 4P0IA 3MP6A 3PD9A 4RA1A 1B3EA 1Y20A 4BLAA 2VD3A 5JTYA 5H8QB 4YMAA 4F31B 3OO6A 4OXVA 4FAJA 4IB2A 3PU5A 1B3GA 1DSNA 1H44A 1FQBA 3VVFA 4WEPA 5EHMA 4U23A 1R6ZA 1Q1KA 1LBCA 3IJXB 4ZEIA 1MQJA 1B1HA 3FUZA 4U21A 4QSDA 2D21A 4U1OA 4F39A 3RLFE 3A09A 3H6VA 1Y3QA 4NF4A 1VFEA 4XKPA 3VFJA 1LLSA 5AA2D 4NEDA 2F6PA 3C9HA 1FQFA 3HHFA 4ESWA 2FA7A 2NVUB 2Y7PA 1P1UA 3OO8A 5DVIA 1DPEA 1Y1MA 4HS7A 2A5SA 1SVXB 4HW8A 1Z7ME 1NMUA 4OFLA 3RUMA 2Y7IA 4ZZAA 4NF8A 1FQCA 5CMMA 1MXYA 4EF2A 4F3PA 5CBRA 2NUVA 1MY0A 4F1UA 4IY5A 3DP6A 1ZBMA 1EZ9A 2DWAA 1M5DA 5I56A 1US4A 1PB8A 3C4MA 4ONYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O94A 5TPAB 3HV1A 3OSRA 2F3BA 1A8FA 3HCQA 5ICTA 1DTGA 1MDP1 4C1TA 3H3GA 5ITPA 3OSQA 1G0HA 1LBYA 1OIBA 3B8BA 4DCXA 4X04A 1TT1A 4H67A 4U1ZA 2WYPA 1B2HA 2CZLA 4DCYA 4AB6A 1LAGE 2BJIA 4YKIA 2UVJA 2AL5A 3Q27A 3N6TA 1UTBB 5DVFA 4ZEFA 5IZZA 3D1RA 4NF5B 4PFUA 3TELA 2L5VA 4WXJA 2O1MA 2REJA 2XXRA 3FIRA 2I0BA 4QXDA 1MXZA 3KC1A 3MP8A 4YKJA 1MQIA 3G3GA 4PF6A 1A40A 2ONSA 2X7QA 3PPNA 5TP9A 2R8TA 1US5A 3FBPA 3IB2A 3IO6A 3SERA 2B65A 4KYEA 4OFOA 2RC9A 5I2NA 2WBBA 4KR5A 3SEXA 3KJ7A 2FYIA 1B3HA 4DIGA 3U8QA 4KHZE 1PBPA 5B7DA 5AE4A 2Q8MA 3W9WA 4FEBA 2F7CA 1QKAA 1A8EA 2XXWA 1MXWA 4JVCA 1URGA 1MRPA 1XHYA 2Z8DA 4F3GA 3FV1A 3KN7A 3FATA 4ZS9A 3VXCA 3SETA 3MQ9A 1IMEA 2XHDA 4GX4A 3O6GA 3HSTA 3MJNA 1G0IA 1ZU0A 3FGSA 1FTAA 4H5GA 2R6GE 4O7MA 1MQHA 3Q29A 1AH5A 4TLLB 3TODA 1WVJA 1MXUA 2QS4A 3MWBA 1MXXA 1IXIA 4F1VA 4R2BA 3DLNA 5LOMA 4ELRA 5ELVA 4O7IA 4I62A 1MDQA 3BKIB 2VHAA 3GBAA 4RNSA 1KA0A 1N7WA 2B4MA 1IMAA 1KZ8A 2IA4A 3IX1A 3T9VA 3G3HA 3UN6A 2ZNSA 3FXBA 2XA5A 3PMVA 2OJTA 4PETA 3G3FA 2D5WA 2QVRA 1UIVA 2F78A 4PFBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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