1LBCA

Crystal structure of glur2 ligand binding core (s1s2j-n775s) in complex with cyclothiazide (ctz) as well as glutamate at 1.8 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamine Receptor 2
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lbcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lbcA01
1F9BA 2QS2A 4UACA 1ANFA 2NXOA 2RKMA 5CC2A 2Z8EA 2HXWA 4BLAA 5H8SA 2Q89A 3FV1A 4EF2A 1II5A 5H8HB 1XC1A 3MBPA 1SYHA 2XXYA 2UVIA 1MXVA 3H3GA 2X26A 3T66A 4KI0E 5DVJA 3N94A 3RN8A 3F11A 4KYSA 1ATGA 5I57B 4LZ8A 2I49A 1NNFA 3KSXA 1VFDA 2ABHA 2RC8A 3T22A 3V8XB 2FNCA 2B3BA 3OMBA 3KZGA 1LAHE 4R2BA 4Z7EA 4R72A 3VVFA 4FE8A 3MQ9A 4XKQA 3K02A 4Q0CA 1Y20A 4QSDA 3U92A 3E4RA 3E9XA 1TT1A 2B3FA 1UIUA 1D9VA 4Q5TA 1FW0A 2YLNA 3PUWE 2V25A 4BDMA 3MVYA 4UA8A 4G8NA 5M2VA 2XHDA 1B7UA 1P1QA 3FUZA 1P1OA 3SEVA 4GVOA 2ONSA 3V89B 1N7XA 1ZIUA 1LFGA 2D3IA 3K01A 3LC8A 1M5BA 3T9UA 3CI8A 4H5GA 1N04A 1UTBB 2QL3A 1YCJA 1JW5A 4IO5A 3BBRA 5TP9B 1ZTYA 3SKPA 1DPEA 4G4PA 1MY1A 4U23A 4R2FA 4R6KA 2OCUA 1LB9A 2V93A 1QUIA 2ONRA 3RT6B 3VVDA 4R9GA 2XX7A 4OERA 3RTWB 4EQBA 4IGRA 4JWOA 4LZ7A 4MFIA 3WAEA 4F2QA 3PPNA 3V83A 4FORA 1TFDA 2I0CA 3MP8A 1KWHA 1Y3NA 4DLDA 3SEXA 2Y7PA 2V3UA 4LUBA 4PE5B 5ELVA 3FJMA 2F7AA 3TELA 5I56B 1O64A 2WKYA 3EQ1A 2F97A 4HCWA 5CBSA 4RNSA 1LBCA 3KOSA 1D4NA 3I3VA 4YKIA 1Y3PA 1OQHA 1USYH 5FTHA 4WXJA 2AL4A 4M4GA 1FTOA 1YPNA 3VLVA 3WAFA 4KD5A 2RINA 2DQVA 3K2DA 2F6GA 3CSBA 1WVJA 4DZ1A 4G2ZA 3RUMA 1B0HA 4NE4A 5K2YA 4H0WA 2PT2A 2XXTA 4GLIA 1PDAA 4OYVA 3FXQA 3O66A 1M5CA 3KN7A 4YB6A 1AL3A 1N0TA 3TCHA 3C9HA 2AL5A 4ZECA 1FQCA 3U72A 1UTHA 1MQHA 3CVGA 1AMFA 4RA1A 1B32A 3KJTA 3IAZA 5H8HA 4G77A 1N76A 5F7VA 2ZYOA 1JVXA 3H7MA 4N07A 2DE3A 4BDNA 3FGSA 3TYHA 4KCDA 3U94A 3PU5A 3C33A 5FHOA 3IORA 5I57A 1EZOA 4DIGA 4BDQA 3TFLA 2UVJA 3QAXA 4JSDA 1A40A 3UK4A 1A7LA 2BJJX 5AA2A 3TAJA 4RK9A 3B6QA 3FVNA 3THIA 2I4BA 4OEVA 1D3KA 1DTZA 1B3EA 3K6WA 2DS9A 2DVCA 2F34A 3IOUA 3Q29A 1R1NA 1RKMA 2DXRA 1HSJA 5CM6A 4OENA 4QFPA 3L6GA 4ZEKA 1MG1A 1IITA 4GWOA 3AXFA 2X7PA 5KCJB 3Q26A 3GBBA 5DVFA 4GIZA 4YZZA 2HFBA 3QUFA 2PVUA 2HCAA 4F29A 3O2AA 3QK6A 4IY6A 2V3TA 4GFRA 2XXHA 5H8FB 3MZBA 4GRKA 3H03A 3TQWA 5I59A 4DXBA 2OJTA 3E3KA 4ZS9A 1EZPA 4ECFA 4G8HA 3C34A 1VSOA 3C35A 3O6HA 4F1YA 3PPPA 3OO6A 4KHZE 1MM7A 4NF8B 3I5OA 2HZLA 4HTGA 1B3HA 2RC7A 2I3WA 1JEVA 2O84X 5CMCA 4F3SA 3TUSA 3FXRA 4KR5A 1XHYA 1B6HA 3UGWA 3IO6A 4NF5B 2GHBA 3QIMA 2X7QA 2VP1A 4H67A 3EHSA 4C1UA 4XXUA 3T9VA 3T9XB 3ILTB 2AYSA 2GRVA 4C1TA 2DE2A 2GHAA 1H44A 5I56A 1B4HA 3C4MA 1SDXA 1FQBA 5DEXB 4LP2B 1ELJA 2XXRA 4ZEBA 4OFLA 4H6DA 4YICA 5TU0A 4DXUA 3FD3A 1FCKA 4ZEFA 2V84A 4OETA 1NNTA 4OMBA 5DVIA 2DSFA 4H1XA 4TQUQ 3K1MA 3MZ1A 3K1NA 1B1HA 5AA2D 1R9LA 3IX1A 1B46A 4OWDA 4QFNA 5H8QA 5JEIA 5AA3A 1P1WA 5BUUA 2F8DA 3KFMA 3CRBA 2QSXA 5CI5A 1J1NA 3UA8A 4NF4B 3SETA 1OMPA 3N6TA 3KG2A 3USDA 3VLWA 3M3FA 3U1OA 3OEKA 1FTJA 3K0VA 4QSCA 1UTHB 3FVOA 2DVZA 4HCYA 4XTCQ 3M3LA 1SD3A 1B7HA 2ZMBA 3TTLA 2M8CA 4R75A 4WEDA 1WDNA 5HPQA 4N13A 1EH3A 3MZ9A 3FVGA 2UYFA 1OIBA 3PUYE 3H6VA 2PX1A 4FJPA 2I6EA 3HHFA 1SYIA 4LQ2A 3U8QA 1Q1KA 3I6VA 4LONB 4ELOA 4NWCA 1R6ZA 4RPOA 5I2KB 4F39A 4O3AA 2REGA 2DWHA 3MWBA 3TKDA 2NVUB 1XT8A 3H4ZA 5AA2B 2QPQA 1AH5A 2QRYA 3IOVA 5L9MA 5HBCA 1ZMGA 3ILUB 4U1OA 4U1ZA 1B5IA 1UQWA 3FATA 1LB8A 1Y4CA 4THIA 2NWJA 4QFLA 2Q88A 2H98A 4JDFA 3MC2A 4X1BA 1B9JA 3OEMA 2NOOA 3T9HB 2O1MA 1GTKA 2F7CA 2R6GE 1VR5A 2O51A 4G68C 4WEPA 5KCJA 1DMBA 3K6UA 3IO4A 1NFTA 3T93B 4I8CA 2ZYNA 3OELA 3SEWA 5I59B 2I0BA 5H8FA 3G3GA 2ALUA 1LFHA 3B7DA 5F1QA 2HZKA 1PC3A 4FECA 3MVWA 3C32A 3MUQA 2A5TB 1R9QA 4EQ7A 1N3XA 3IB1A 2PMSA 4NF8A 1UIVA 4U22A 4HW8A 4N6PA 1M5EA 3H6WA 1H3DA 3PV0E 4OZ9A 3PMWA 2IA4A 2UYEA 1SI1A 4X1DA 1LAXA 2PBWA 1ZKBA 1B51A 3K00A 5I58B 1HSLA 5I2NB 3H06B 1A8EA 5IKBA 4QRZA 1T0KA 4NF5A 1B4ZA 1MXZA 1Y4TA 3DLNA 3MJNA 4GF8A 1P1UA 3M3KA 3ZS6A 3N26A 4ND9A 2VD2A 1OQGA 3IOWA 4ONYA 4F18A 3BFTA 3G3IA 3M8UA 3OSQA 4DCYA 4PQJA 3TZAA 2HEUA 1DSNA 5DEXA 3K6XA 4Z0IA 3UORA 1M5FA 4F31B 2XXIA 1MQIA 4PETA 3CFXA 2RCBA 4Q8RA 3HV1A 2UVHA 5ICQA 2RCAA 5FHNA 2F6PA 4IO3A 1XS5A 3IOTA 5H8QB 5IAIA 2R71A 1URSA 3V5AA 1RYOA 2DE4A 4F19A 1MH3A 2ANJA 4GQOA 1BTJA 1I6QA 1SW5A 4BDOA 4GD5A 4R74A 4O3CA 2DYXA 4NF4A 1JEUA 1JW4A 1I6AA 4POWA 3IB2A 2O6AA 5EYFA 2O7UA 3ZKLA 1NKXA 1M5DA 2ZXTA 5KZTA 4FEDA 3OENA 3KN3A 3OO9A 2XXXA 5I84A 2OWTA 3S9MC 4KCCA 1MXWA 2P0SA 4L17A 3TTMA 3PPRA 2Q9TA 3IJXB 4POXA 3TCGA 1L5TA 3OSRA 3CSGA 4PFYA 4JWYA 5CMBA 1B3LA 2QS4A 1B52A 1IEJA 3CR9A 4IO6A 2XXVA 1US4A 3PMXA 1JNFA 4IO2A 1MY4A 1QKAA 4X48A 2I58A 1MXXA 3DELB 3GLBA 3LBSA 1MPCA 3O28A 1QW0A 4NF6B 4H65A 1B58A 5I2KA 1NH7A 1MPDA 3D4CA 2XXWA 3R6UA 3QSLA 1QUJA 3A3UA 2E0SA 4ELRA 4RYAA 1SVXB 3FVKA 3RLFE 3W15C 1IIWA 4GOTA 4H8JA 4IB2A 3K1PA 4RXLA 3CFZA 1DOTA 1PBPA 1AOVA 2GFEA 1OLCA 3S2VA 2D21A 1PB9A 3L6HA 4LATA 1FTLA 4YKJA 1BIYA 4GL0A 3R7XA 2NUVA 4XKRA 3OD7A 4G68B 3O97A 1LAGE 4GXAA 2RC9A 1POTA 3HPIA 5B7DA 1XVYA 4M1VA 1RYXA 4H5FA 3Q27A 4JWXA 3B6TA 3O6GA 2A5TA 2OBGA 5J1DA 4FIMA 4X9TA 1MDP1 4IGTA 4KQPA 1URDA 2THIA 5A5XB 3B6WA 3G7WA 1VE4A 2ZYKA 2R9JA 4MBPA 4PFWA 3DP8A 2AIXA 4E0XA 5I58A 4ZZAA 4PFUA 4BDRA 3A09A 5I2NA 2F78A 3K4UA 3S9LC 3GXAA 4QFOA 3Q25A 3A3CA 3MPKA 1LCFA 1Y3QA 2Z22A 5FTIA 3UIFA 1SW2A 5JTYB 3CFLA 3RY3A 3TPAA 2G29A 3S9NC 1US5A 2Z8DA 4Q30B 5ITPA 1SI0A 1QVSA 3VDFA 3VXBA 2FYIA 3IB0A 4QHQA 4OEUA 1LLSA 2DWIA 2QMWA 3PGFA 4FAJA 2OLBA 4EF1A 3MW0A 4EDPA 4PFTA 1N7WA 2IEEA 4ZZEA 4IO7A 4XKNA 1MQJA 2VHAA 1GGGA 3PD9A 1LFIA 4MH5A 1MY2A 4R6YA 1HSEA 1XOCA 3N5LA 1B2HA 1TXFA 3IK6B 1EZ9A 3IR1A 3IL1B 4F3GA 2REJA 4JB7A 4I1DA 3H6UA 2UXAA 1MDQA 1A8FA 1NNKA 3TCFA 1OLAA 1O7TA 4FATA 4O3BA 1TWYA 5HM4B 4QSEA 2YJPA 1N3WA 4XKPA 4XIGQ 4P0GA 1A99A 2QMXA 1QJMA 1SBPA 1LSTA 3PPOA 1FQDA 4AB6A 1IUDA 2UVGA 4NF6A 5CMKA 5EHMA 4E0WA 4OQOA 3FJ7A 3CIJA 3TQLA 1LAFE 1QUKA 3RGYA 3VVEA 2YPNA 1JVYA 3VXCA 1H45A 3JYRA 3JZJA 3BKIB 1I69A 2DWJA 5TPAB 3MVZA 1MPBA 2Y7RA 4R73A 2I4CA 4EXLA 5CRYA 2OZZA 3EF7A 3FXUA 4FEBA 2HAVA 1NNPA 1ZJLA 1ZLQA 2H99A 5ITOA 1B3GA 3G3FA 3HCQA 4KYEA 3VV5A 1B0LA 4ELQA 4EUOA 1SW1A 1IXIA 3VLUA 1PEBA 4OXVA 3LSFB 3LSXA 5CMMA 5JK4A 4G68A 3EN3A 4F3PA 3SEYA 2P2AA 4JXIA 1YTVA 2O69A 3G3JA 3E13X 4IY5A 2GH9A 4P11A 3R26A 3EHUA 1XVXA 5AA4B 1H76A 4QF9A 2H25A 3HSTA 1PB8A 2XD3A 1JQFA 2XXPA 3MPLA 1D9YA 3MAMA 1DPPA 4OFJA 5KDTB 3ONMA 3MP6A 3KSJA 1QULA 4R6HA 2HAUA 2H5YA 2ZNTA 1LGBC 5A5XA 2PT1A 2Y7KA 3KJ7A 1VFEA 3FIRA 2F35A 1IZ1A 2QS3A 1GV8A 4EXKA 4OVJA 2O68A 4RPNA 3OOAA 4F1UA 5H8NB 1MS7A 3HN0A 4RK2A 4KFQA 2G93A 1GR2A 1NMUA 2DOJA 1IXGA 1ZBMA 1NH8A 4YB7A 5L9OA 4DCXA 1S7YA 4JSOA 4F1VA 4OFOA 3HO7A 5LOMA 2ESNA 1EU8A 5JTYA 4BDLA 4LVQA 2DXYA 4ZEIA 1Y1ZA 4YU0A 4K3FA 2XD2A 5L9SA 1NL5A 4HS7A 4RJZA 4WKMA 1DTGA 3W9VA 4DDDA 5ICTA 4OESA 2ZYMA 4NMYA 1JW1A 3MP1A 2CZLA 2P1SA 4LA9A 1IQ7A 4MF3A 3PUXE 3PPQA 5L8DA 3GZGA 3TDJA 4AQ4A 4U2RA 2Z8FA 2E1SA 4YB5A 4P0IA 1POY1 3JV9A 3N6UA 3QXMA 4G8MA 1MRPA 2VD3A 3FASA 1LBBA 3DP4A 2F5XA 4NTLA 1IXHA 1S9TA 2VGQA 1OVBA 3LR1A 1PB7A 3DP6A 3SEUA 1FTMA 3O29A 3D4GA 2DP8A 3H6TA 3RPWA 1H43A 5ISUA 2ZNSA 2B65A 1USYE 2FA7A 3P7IA 1FQFA 3W9WA 1MM6A 3G3HA 3U93A 2XXUA 3TTRA 2XX9A 5B70A 4ESWA 1FTKA 3RNNA 3ECRA 1Y9UA 4OHNA 3MVXA 2O1LA 1Q35A 3PD8A 4KPTA 3SESA 4IO4A 1SQYA 3TODA 1TFAA 1BKAA 4ELPA 4ESXA 5DT6A 5AE4A 4U21A 3QUJA 1IXCA 5K2XA 4ZEDA 5BWJA 2HQ0A 4AB5A 3SDFA 4ZE9A 4R9FA 3BFUA 1A55A 3LUYA 4C0RA 2RF1A 2V3QA 3TMGA 2H4IA 5TPAA 4U4SA 4YAHX 3RQTA 4I62A 3KBRA 3ODBA 2KLFA 1AIVA 2ONKE 4MLVA 1B5HA 3DM0A 5DTBA 3FJGA 4RY1A 1BP5A 4DXCA 2Y7IA 1MQDA 4ZDMA 2OWSA 1QKBA 4LQ5A 1P1NA 3S4UA 3C31A 4YMAA 4ZE8A 4KYDA 3K6VA 2I48A 1Y1MA 1YAEA 1LCTA 2Q2AA 3TTNA 4TOZA 3ZKKA 4F3BA 2Q8JA 1B7ZA 5AA1A 1UTBA 3C36A 4EQ9A 4YKPA 1CE2A 1MY0A 2D5WA 5EHSA 3EPEA 5AA4A 5TP9A 3IJOB 3UP9A 2F7BA 3VE1B 3O6IA 3T96B 1FQEA 5DYHA 5CBRA 3KGCA 2O7IA 4YKKA 5KDTA 1B5JA 3TEPA 4F2OA 3OO7A 2Q2CA 2ZNUA 4LZ5A 3SERA 4YMBA 2CMOA 4H8IA 2Y7WA 3ZSFA 1OVTA 3S9EA 1N84A 2OK2A 1URGA 2F36A 4GL8A 2Y84A 3CG3A 5H8NA 3GBAA 2W7YA 3FZVA 4OTEA 3TTKA 1A54A 4U4XA 5FHMA 2DWAA 3G3KA 3EHTA 4NEDA 4TLLB 3LSWA 4GXSB 4I9DA 1PBQA 3HHGA 4JBZA 1BLFA 4NWDA 3PUVE 2VOZA 1ZU0A 3KN8A 1B3FA 3CG1A 3Q28A 2H9BA 3PUZE 2LAOA 2QS1A 3OO8A 2XX8A 2A5SA 1MXYA 2I3VA 1SW4A 1I6BA 1MY3A 1B1XA 3KOTA 3RTFB 1P99A 1MXUA 3PMVA 1Z7NE 1B40A 1MQGA 3VFJA 1Z7ME 2XXQA 1FQAA 3OXNA 1WODA 1O63A 4QFKA 1JETA 2Z23A 1MH4A 4DE8A 3UN6A 3RT8A 3O9PA 3KEIA 4MLQA 2PYYA 4PP0A 1CB6A 3LSLA 3FV2A 4TLMB 4ISUA 2QJEA 4F22A 1GVCA 1S50A 3QYTA 1B05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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