1LCTA

Structure of the recombinant n-terminal lobe of human lactoferrin at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
RSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the recombinant N-terminal lobe of human lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 97
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lctA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lctA02
4LP2B 2HCAA 3U93A 1B05A 3V89B 3DP6A 1UTHA 2F7CA 2V84A 3V8XB 4KFQA 1UTBA 4M1VA 3SESA 4GRKA 2ONSA 3LSFB 3U72A 4E0XA 2BJJX 4OFLA 1MDP1 3IJOB 3RNNA 1RYXA 3TKDA 3TQLA 3G3IA 1ZU0A 3CSBA 3LBSA 1M5CA 1Y20A 2P0SA 3CSGA 1OQHA 3MWBA 4NF8B 1PDAA 1MQDA 4GVOA 1B6HA 1SBPA 3GZGA 1SVXB 3OENA 3T96B 1GTKA 1QKAA 3H06B 3M3FA 2DS9A 3IORA 3MVXA 1L5TA 4BDRA 5H8FB 5JTYB 1A7LA 5L9SA 5AA1A 2HXWA 4LZ5A 2OJTA 4NF5A 3GLBA 3LC8A 3WAEA 3T93B 1B7UA 3VE1B 2RC8A 2DXYA 4DXCA 1US5A 4R72A 1IZ1A 3L6HA 1P1WA 4EQ7A 3GBBA 2H99A 2A5TB 4RPNA 4YKIA 3HHGA 1NNKA 2UYFA 1LFHA 1USYE 4KYDA 3C32A 1I6QA 4LATA 2ONKE 5LOMA 2I48A 3O97A 4N07A 3T9VA 4GIZA 5H8QB 3SERA 4NF5B 1B2HA 5I56B 1VE4A 1D4NA 5H8FA 5H8QA 1JEUA 4F2QA 1LFIA 3MC2A 1BP5A 4OFOA 4QSEA 2UYEA 2Y7IA 3K00A 4ESWA 2DWHA 5FHNA 4NEDA 3KJTA 3O6IA 1B5JA 3VVFA 3EHUA 4H5FA 1FQBA 1O7TA 2QMXA 2UVHA 2ZXTA 5KCJB 1XOCA 2F36A 2I0CA 5AA2B 2B65A 3C36A 3C35A 3RTWB 3S4UA 1IUDA 2XXIA 4PETA 2OBGA 2PVUA 5DEXA 1FQFA 1B4HA 2NUVA 4X48A 1NH7A 1UTHB 3PUXE 4ONYA 3VDFA 5CBSA 3TTRA 3E4RA 3U92A 1OVTA 3PPOA 2VGQA 4XKQA 4K3FA 2F35A 1MY3A 3EN3A 3QXMA 3RLFE 4GXAA 1JVYA 2DOJA 3OMBA 3RN8A 3IJXB 4HTGA 1AIVA 3CVGA 2OLBA 1MY1A 4IGTA 1OQGA 3ONMA 4ZEBA 3V5AA 4H6DA 1A54A 3E9XA 4DXBA 3T9UA 4LA9A 3TAJA 3QSLA 1UTBB 2AIXA 4F3BA 3MZ1A 1JNFA 3KSJA 1FW0A 1I6AA 2DWAA 4U23A 5FHOA 3A3CA 4ZEKA 3TTLA 4F3PA 2D21A 4H5GA 4RNSA 2QJEA 4XTCQ 2Q89A 5B70A 1SYIA 1O64A 5BWJA 4G68B 2Q2AA 3FIRA 3FVOA 4IO2A 3TODA 3TPAA 4PFYA 2Q8JA 4PE5B 5TPAB 3O29A 3S9EA 3H7MA 3K6UA 3Q28A 5I2NB 2RINA 2B3FA 3ZS6A 4JDFA 4UA8A 2F78A 5H8HA 2PBWA 2UXAA 4FIMA 3MPLA 4OVJA 3U1OA 2X26A 3ZSFA 1DPPA 1LAFE 2O7IA 3FV1A 1NNTA 4GXSB 3HSTA 4NMYA 4F18A 1ZIUA 4YKJA 3Q25A 1NFTA 1N76A 3TTNA 4AB5A 2YLNA 4F22A 3QYTA 2QPQA 4N6PA 4EQ9A 1B5HA 1Y3QA 1B51A 2D5WA 4XIGQ 3C9HA 3VV5A 2ZNUA 3QAXA 4LZ7A 4F1VA 1RYOA 2DYXA 3L6GA 3O28A 1Z7NE 1NL5A 2RCBA 2I58A 3PD8A 3JV9A 4FAJA 4GOTA 5I84A 1ZKBA 5H8HB 4ELQA 1O63A 1Y1MA 4KQPA 3CR9A 3GBAA 1SD3A 1SW1A 4RYAA 3DELB 2QSXA 2A5SA 3PPPA 5CMBA 2GFEA 3LSLA 3N5LA 5I2KB 4WEDA 2DQVA 2XXHA 3HN0A 3IO6A 3CIJA 2AYSA 3TTKA 1LGBC 1N84A 2DP8A 1M5DA 1Q35A 1XVXA 1QUKA 1Y3PA 5CMCA 2XX9A 3VLVA 4H67A 5A5XA 4G77A 3PUVE 1I69A 2ZYNA 4GWOA 3FXUA 2XHDA 3ZKLA 1LB8A 2UVJA 4YMBA 3IX1A 1JW4A 1OMPA 1SW2A 3CG1A 3OO7A 1XS5A 2ALUA 3DP4A 1DTZA 4RA1A 3BFTA 4GQOA 4OEUA 1NNFA 3IL1B 3OO9A 2X7PA 3SEVA 4C1UA 4F1UA 3OD7A 4FORA 1BTJA 4LUBA 3FGSA 2O1MA 3MP8A 4NWDA 4QFNA 1EZ9A 2XXRA 1MH3A 4EXLA 1B3HA 2I49A 1N3XA 3HCQA 4X9TA 2HZLA 3TFLA 5H8NB 3QUFA 4MLQA 5K2XA 3CI8A 3N94A 5EYFA 3TDJA 1MPDA 3B6TA 1Y9UA 2P1SA 4PFUA 1FTJA 4G8HA 1B4ZA 4YMAA 2CMOA 1A99A 2XX8A 3G7WA 3MAMA 1JVXA 4IY6A 1BLFA 1IXIA 1N04A 2D3IA 4JB7A 4JBZA 3MVYA 4JWXA 1Q1KA 1B1HA 1URDA 4H0WA 4R73A 5EHMA 3EQ1A 2AL4A 3KBRA 4JSOA 1H45A 3IB1A 3KN8A 4ZEFA 2FNCA 2B3BA 2QRYA 2XXTA 4R6HA 4EDPA 3CFZA 4H1XA 3O2AA 4DDDA 4G68C 3UGWA 5I56A 3TQWA 2F5XA 1H3DA 1MG1A 1D9VA 1LCTA 3PMVA 3PPQA 4POXA 3FJMA 3N6UA 2THIA 1POTA 1A55A 4ZEIA 1LBBA 3KFMA 1N3WA 3RY3A 4R2FA 1QUJA 2XD2A 3MQ9A 5AA4B 5KZTA 3EF7A 4OXVA 1NMUA 1FQCA 1IQ7A 1ZJLA 2ANJA 1HSJA 2DVCA 2O7UA 2VP1A 2PT1A 3ECRA 3N26A 3PUZE 4OEVA 3QUJA 3OO6A 1CB6A 4ZE8A 2O68A 3B7DA 3UP9A 2OK2A 4Q0CA 3TCFA 1OLCA 4IY5A 4I62A 3FATA 3H4ZA 2ZMBA 4KCDA 4QSDA 4BDQA 3KOTA 4EQBA 1FCKA 4ZECA 4NF8A 3UN6A 3ILTB 5FHMA 5A5XB 4MF3A 1ATGA 1J1NA 2E1SA 4U21A 5DTBA 5DYHA 1FQAA 1B0HA 1B0LA 2NOOA 3H03A 3OSRA 1WDNA 2IA4A 2LAOA 2P2AA 2YJPA 4P0GA 1MXYA 2HFBA 4G2ZA 5CMMA 4DCXA 4IO6A 1DMBA 2G93A 3KZGA 3UK4A 5I2NA 3KSXA 2R71A 3KN7A 1YTVA 3A3UA 3HPIA 3K2DA 2F6GA 3LUYA 4RY1A 3IOUA 5I59A 4G68A 3MUQA 1DPEA 4U1OA 1FQEA 4PFWA 4TOZA 3OSQA 1P1QA 4NF4B 1S9TA 4MFIA 1MY2A 2H4IA 4GFRA 4HS7A 3E3KA 3SEXA 3LSXA 2VHAA 3SEYA 1B7HA 3ILUB 1RKMA 4OZ9A 4ZS9A 5KDTA 1ZBMA 3BKIB 4H8IA 1TT1A 2DXRA 2HZKA 3ZKKA 2F34A 1MM7A 1Y4CA 4OMBA 1B52A 1USYH 3DM0A 3HO7A 5AA4A 5L8DA 3G3GA 3K02A 1Z7ME 5K2YA 1JETA 1VFEA 1N7WA 4N13A 4Z0IA 5KCJA 1BIYA 1XC1A 3MP6A 4U4SA 3G3FA 3OOAA 3UIFA 2FYIA 1F9BA 4YAHX 3A09A 3G3JA 2V25A 1JQFA 1P1OA 1S50A 4RPOA 1WODA 3FD3A 4I1DA 3TZAA 1WVJA 5TP9A 4DCYA 4NE4A 2OCUA 1BKAA 1B9JA 2XXYA 5I57A 1XT8A 4NF6B 2DVZA 2F97A 3MZBA 4HCYA 1SYHA 3USDA 2ZYOA 5I58B 3V83A 3UA8A 4GLIA 4JWOA 3OEKA 4OENA 2UVIA 4IGRA 1JW1A 3GXAA 4XKRA 3EPEA 1FTLA 5F1QA 4X1BA 1R9LA 2AL5A 1OLAA 1QJMA 2DWIA 3IB2A 2X7QA 3K1MA 4XKNA 5FTIA 1XHYA 2F7AA 2QL3A 3FVKA 3I6VA 5JK4A 4EF2A 3VXBA 4H65A 3IB0A 4P11A 1D9YA 2O51A 1A8EA 1LFGA 1NKXA 3IR1A 4RK9A 5ELVA 1HSEA 3I3VA 3MJNA 3OO8A 1M5EA 1TFDA 2H25A 4OERA 3CG3A 4LONB 3PMWA 4NWCA 3T9HB 1QULA 1MQHA 1MY4A 2E0SA 3PV0E 4BLAA 3N6TA 3LSWA 1AMFA 3DP8A 1IIWA 4MBPA 4PQJA 4DXUA 4OYVA 3C34A 2W7YA 2Y84A 1UIUA 3SEWA 4AQ4A 1MM6A 4BDLA 1PB8A 3B6QA 5J1DA 4KPTA 5CMKA 1H44A 3RQTA 3WAFA 1MDQA 1TWYA 1PB7A 1FTKA 4P0IA 1MQGA 1POY1 4TLMB 1B58A 4U1ZA 2NWJA 3Q29A 3S9NC 3MVWA 3MZ9A 1MH4A 4YZZA 3RT6B 1YCJA 5I2KA 4KYEA 3VVDA 2XXQA 3H6TA 3TMGA 4R6YA 4O3BA 3TYHA 2Q9TA 3O9PA 4G4PA 4H8JA 1IXHA 2OWTA 5TP9B 4DZ1A 2H98A 5FTHA 1LAHE 4E0WA 1MPBA 3B6WA 3C33A 3SEUA 4F2OA 3CFLA 5F7VA 4DIGA 1OIBA 3K1PA 3THIA 2RC7A 5B7DA 1B3FA 3IOWA 4KCCA 4NTLA 4RK2A 1PEBA 1SW4A 4O3AA 4IB2A 3K0VA 4QFPA 4R6KA 2FA7A 3M8UA 1IXGA 3JYRA 4UACA 4HCWA 3S9LC 4U4XA 4YB7A 3C31A 1VSOA 3Q27A 2I3WA 2OZZA 3K6XA 4I9DA 4QRZA 4ESXA 5I58A 5ITPA 4R9GA 1QUIA 2HAUA 4WKMA 3BFUA 3FV2A 1S7YA 2HEUA 3CFXA 4LQ5A 4KD5A 5AA2A 2VOZA 3FJ7A 4QFLA 4KYSA 4G8MA 4R9FA 5M2VA 2Y7KA 1B5IA 3H6VA 3TCGA 4XKPA 2Z23A 4R2BA 3LR1A 4Q30B 2O6AA 4ELOA 3TCHA 1MXXA 2R6GE 3VLWA 2F7BA 3W9WA 3H3GA 3K6WA 4ZE9A 4OFJA 2I0BA 5JTYA 3D4GA 1JW5A 3PPNA 4PP0A 4G8NA 3P7IA 4NF4A 2DWJA 1M5BA 3MVZA 3TTMA 1R1NA 1PB9A 1AH5A 2GHAA 1VFDA 2Q88A 3D4CA 3F11A 3FJGA 4QFKA 1Y4TA 1MQJA 4OWDA 2VD3A 3RUMA 1ZLQA 2GHBA 1Y3NA 2G29A 4FEDA 4JSDA 4OTEA 3W15C 1FTOA 3M3LA 4X1DA 3VLUA 1URGA 3T66A 3HHFA 2PYYA 4GD5A 3R26A 1ANFA 2GH9A 2NXOA 4YB6A 4THIA 4MH5A 3K1NA 4OETA 3HV1A 3IAZA 4OQOA 4POWA 3AXFA 4BDOA 5AA3A 1T0KA 3PD9A 1SDXA 4BDMA 2RC9A 1B46A 3FVGA 4QF9A 1UIVA 4GF8A 3VXCA 5HBCA 3KG2A 5I59B 2I4CA 1LAGE 1MQIA 2QS4A 2R9JA 2ZNSA 2XX7A 3I5OA 4ELRA 3OXNA 4TLLB 4EF1A 3T22A 4F29A 2I4BA 4ZEDA 1LBCA 4EXKA 3KJ7A 4M4GA 3RTFB 2REJA 2Q2CA 1A8FA 2QS1A 4GL0A 4C1TA 3SETA 4MLVA 3IK6B 1GGGA 1QVSA 1B32A 1ZMGA 2I3VA 1CE2A 2REGA 2V93A 3IO4A 1TXFA 1VR5A 3MP1A 5CRYA 3PMXA 4U22A 5AE4A 5CBRA 3KGCA 4IO3A 2RF1A 1EU8A 1IITA 1H43A 1SI0A 1SW5A 2GRVA 5H8SA 2Z8EA 3PUWE 4I8CA 1AOVA 4PFTA 4HW8A 1GVCA 3MBPA 4U2RA 2HAVA 1HSLA 4QHQA 1DTGA 1ZTYA 2KLFA 5DVFA 3S2VA 2O84X 1LAXA 2Z8FA 4YKKA 1H76A 3FASA 3QIMA 4F1YA 3QK6A 3OEMA 4YU0A 3U8QA 3PGFA 3OELA 2H5YA 2IEEA 2F6PA 3TELA 1TFAA 2A5TA 1FQDA 1FTMA 5DT6A 3M3KA 1MXZA 1P1UA 4F3SA 1B40A 3KN3A 3KOSA 1DOTA 1LLSA 2H9BA 2V3TA 3DLNA 3O6GA 1QW0A 2PT2A 3UORA 3T9XB 5IKBA 2XXWA 4WEPA 1MS7A 1PBPA 1URSA 2Z8DA 5ITOA 3W9VA 2HQ0A 5H8NA 3MW0A 3O66A 1R9QA 4JWYA 2ONRA 2XXXA 5DVIA 4EUOA 2XXVA 3FXQA 5ICQA 4QSCA 5DVJA 1JEVA 4OESA 3G3KA 2WKYA 1SI1A 2ZYKA 4ND9A 2QS3A 4FECA 4F39A 1EZPA 3IOTA 3FVNA 5CI5A 5JEIA 4Q8RA 1IEJA 4KHZE 5KDTB 2UVGA 1NNPA 5CM6A 1AL3A 3Q26A 2CZLA 5DEXB 1YPNA 1OVBA 3U94A 3RGYA 1B3GA 1P1NA 2F8DA 3R7XA 2ZNTA 4TQUQ 4OHNA 1II5A 1UQWA 3FZVA 3PU5A 4Q5TA 1R6ZA 2Y7PA 1EH3A 3FXRA 1MXWA 3IOVA 4ZDMA 4BDNA 1EZOA 2Y7RA 3ODBA 1LB9A 4L17A 3VVEA 1MXUA 1B3EA 1I6BA 2PMSA 1PC3A 3S9MC 4LVQA 4YICA 3SKPA 4F19A 1DSNA 3CRBA 4ZZEA 4RXLA 3K6VA 5ICTA 1N0TA 2XD3A 3SDFA 2Z22A 2I6EA 4R75A 2O1LA 4F31B 5ISUA 1NH8A 4FJPA 5CC2A 4WXJA 4ISUA 2NVUB 4DE8A 2XXPA 2DE4A 4LQ2A 4QFOA 2DE3A 1MY0A 3R6UA 2ESNA 5TU0A 1GR2A 1B7ZA 2M8CA 5L9OA 2O69A 1IXCA 3H6WA 4NF6A 5EHSA 5I57B 1KWHA 1XVYA 4Z7EA 3EHSA 3PUYE 1MPCA 4YKPA 5L9MA 1P99A 1PBQA 1SQYA 3VFJA 5HPQA 1N7XA 2Y7WA 4IO4A 4R74A 5HM4B 4O3CA 4DLDA 5BUUA 3K4UA 4FEBA 3MPKA 1YAEA 1A40A 2ABHA 2YPNA 2DSFA 3K01A 2QS2A 4ECFA 4YB5A 4FATA 1QKBA 2VD2A 3BBRA 1LSTA 3KEIA 4GL8A 4IO5A 5TPAA 4F3GA 3C4MA 4KI0E 3TEPA 4RJZA 1Y1ZA 1ELJA 2PX1A 4ELPA 3TUSA 2ZYMA 1LCFA 2QMWA 4JXIA 3RT8A 1D3KA 3JZJA 4AB6A 3PPRA 3H6UA 2V3QA 3E13X 4ZZAA 3RPWA 5IAIA 5AA2D 1B1XA 3FUZA 2OWSA 2XXUA 3G3HA 2V3UA 3O6HA 4KR5A 4IO7A 2RKMA 1GV8A 4LZ8A 2RCAA 4FE8A 1B3LA 1US4A 4XXUA 1M5FA 1MRPA 4C0RA 3EHTA 1MXVA 2DE2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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