1LCTA

Structure of the recombinant n-terminal lobe of human lactoferrin at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
RSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Structure of the recombinant N-terminal lobe of human lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
total genus 97
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lctA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lctA02
1WVJA 5CM6A 3KJTA 4LZ8A 5K2XA 4G8NA 2P0SA 3CFXA 1XOCA 1O64A 3Q26A 3C32A 1JEVA 1BIYA 5H8SA 1AH5A 4HW8A 1JEUA 4R72A 4ECFA 1US5A 1DSNA 1FW0A 1BLFA 2ANJA 4EXKA 3C33A 2ZNUA 1MY1A 3TCHA 3CSGA 1ZLQA 4FATA 3E9XA 1B05A 1Y4TA 1WDNA 4KD5A 1B5HA 3RLFE 1P1WA 3MJNA 3N5LA 2XHDA 3PUZE 1MM7A 5DEXA 3KN3A 5KDTA 1UTBA 2H99A 1WODA 1I69A 1XT8A 4Q30B 1MXZA 4OHNA 3B7DA 4GWOA 1FQFA 5A5XB 4EQBA 5EHMA 3VVFA 3FXRA 4P0IA 1GTKA 2XXPA 3IORA 3C35A 3R7XA 2Q89A 1GVCA 3TZAA 1Y9UA 4JWYA 3OENA 1B6HA 1MQJA 3GBBA 3PV0E 4KYEA 5L9MA 4L17A 4GL8A 2PT2A 1PB8A 2ONSA 3I6VA 4GXAA 4BDRA 5I2NA 3H6WA 3T9VA 1H45A 1LCTA 3LSLA 2Y7IA 4H5FA 4OESA 2DWHA 4FIMA 2ZYOA 3FVOA 2V3TA 3FUZA 4DZ1A 3QAXA 4XTCQ 1FTJA 2QS1A 1N7WA 2DWJA 3HCQA 4QFNA 2F78A 2V84A 1XHYA 4XKNA 4F1VA 2QSXA 1AIVA 3QXMA 4WXJA 3SEVA 2F6GA 1BTJA 3EF7A 2OCUA 1F9BA 4F2OA 1B1HA 1HSLA 2UVHA 1URGA 3IJXB 2ZNTA 5F1QA 2V93A 3E3KA 4OWDA 1P1NA 1FQAA 5DEXB 5KDTB 1UTBB 1QW0A 2RC7A 3DLNA 4OXVA 3TFLA 2GHAA 1UTHA 2O68A 1VFEA 4RPOA 5K2YA 4QF9A 2VGQA 2GRVA 1D9YA 4G77A 4JDFA 1MPDA 1LLSA 3N6TA 3SESA 3MBPA 2Z8FA 1H76A 5KZTA 1OQHA 2QPQA 5I2NB 1B0LA 3KGCA 1CB6A 3OEMA 5ELVA 2XXVA 3R26A 3H7MA 3FD3A 4G68C 1B51A 2XXYA 5CMMA 1SI0A 3MP8A 1N04A 4FEDA 3RTWB 4K3FA 5JEIA 2FYIA 3C4MA 3Q28A 2ZMBA 4LA9A 3EHUA 5ICTA 1QVSA 3WAFA 5DYHA 3FASA 3TMGA 5IKBA 3UGWA 3QYTA 3V8XB 3B6WA 3KSJA 4C0RA 2RKMA 4BLAA 1Q35A 1QULA 2CMOA 4MH5A 4Z7EA 3L6GA 4DCXA 2O51A 4X48A 4ZE9A 5CMKA 4YKIA 4ELOA 2HZKA 4I62A 4DIGA 1DTGA 5I57B 3THIA 2I0CA 3V83A 1QKAA 3MUQA 4LQ2A 3PPOA 4RK2A 3TQWA 1GGGA 3IB0A 3U72A 1UTHB 2DYXA 3WAEA 5FHNA 4HCYA 1B5IA 1AOVA 3UA8A 5TPAB 1ATGA 3RUMA 4ND9A 4F1YA 3QUJA 3EPEA 3L6HA 4DLDA 1B7HA 4JB7A 2UYFA 1ANFA 4IGTA 4C1UA 3OELA 5BWJA 3B6TA 4YB7A 2QS4A 5AA2A 3FJGA 4QSCA 4YICA 4EUOA 3W15C 1CE2A 1MY0A 1OIBA 2E1SA 4ELPA 1L5TA 2XXHA 3UK4A 2DVZA 4OEUA 2D5WA 1DTZA 1B32A 1B7ZA 1USYH 1XVXA 4O3CA 3FVGA 3IJOB 4KCCA 2I3VA 4RK9A 3FXUA 3HO7A 4EF2A 3O29A 4H65A 2F7BA 1IXIA 4XKRA 5H8NA 2XX9A 3T9XB 3PGFA 5CI5A 1LBCA 1SQYA 4G4PA 3PPPA 1S7YA 1R1NA 3TTRA 2OBGA 3BFUA 1UIUA 3MPKA 3KSXA 1MXXA 1R9LA 2VP1A 1H44A 3F11A 4GLIA 2HAVA 1Z7ME 3K1MA 3H3GA 4EDPA 4F3GA 3FIRA 2VHAA 2XXQA 4THIA 5H8QA 5B7DA 2IEEA 1QUJA 3VDFA 1YCJA 1A99A 4F18A 2VD2A 3FXQA 2XX8A 3TODA 3ZSFA 4TLMB 1EZ9A 2DOJA 4OFOA 3W9VA 3G3JA 3A09A 1AMFA 4G68B 3CVGA 3FZVA 3OO9A 3OMBA 5AA2B 1PDAA 2UVJA 2DE4A 1IUDA 3KBRA 3PUYE 1YPNA 2M8CA 3JYRA 3RT6B 5AA3A 4E0XA 3H6UA 1SVXB 4QFKA 3HHFA 4ZZEA 3S9EA 4QFPA 3SDFA 4IO5A 4H5GA 1MS7A 2PVUA 2XX7A 3TAJA 5H8NB 4DDDA 1SW2A 1LBBA 4H67A 4IO6A 3RTFB 2P2AA 3K4UA 4MBPA 4PFTA 5A5XA 3K1NA 4E0WA 3KN7A 1SYHA 4OENA 2F35A 2G93A 1LCFA 3CI8A 2H9BA 1GR2A 5ITPA 4H6DA 3IAZA 1QKBA 2DS9A 1LFHA 3T22A 2VD3A 1M5CA 2I48A 1ZU0A 2R6GE 3Q25A 2AL4A 3G7WA 1VFDA 1SDXA 3RY3A 1TXFA 3KOSA 1A40A 5FHMA 4ESXA 2A5SA 5L9SA 3K1PA 4NEDA 4OYVA 1XVYA 3GLBA 3MQ9A 2RCBA 1PEBA 4H8JA 1I6QA 3KOTA 3Q29A 2REJA 3LUYA 3ONMA 1MXUA 1GV8A 3M3LA 3TELA 4IB2A 5CBRA 1B4ZA 2DSFA 4IO4A 1MDP1 2XD3A 5I59A 1SBPA 1MXVA 5HM4B 2LAOA 3IOVA 3VLVA 1M5EA 4H1XA 4JBZA 4JXIA 4F22A 1I6BA 3VLWA 3K01A 3TKDA 4LQ5A 3QK6A 4Q5TA 2FNCA 3FVKA 2ZYKA 4H0WA 2QS3A 2DE3A 4OETA 4R9FA 1NH8A 4DXBA 3VFJA 2QS2A 3K6XA 1JETA 4YMBA 1B58A 1IQ7A 1D3KA 5EYFA 2DXYA 3IB1A 3K6UA 2Y7WA 4OFLA 4ONYA 3C34A 3OO7A 5H8HB 4U4XA 3LSXA 3PPQA 3BBRA 4X9TA 1FCKA 1LFIA 1Y20A 4ZEDA 2V3UA 4PQJA 1N3XA 3IOTA 4UA8A 1FQDA 1ZIUA 4I1DA 5DVFA 2Y7PA 1N3WA 2THIA 4KCDA 1ZKBA 1S50A 4KPTA 2Q2AA 1RKMA 5ISUA 4EQ7A 1VSOA 1PC3A 1SW1A 1IZ1A 4P0GA 2HFBA 2A5TA 5FHOA 4ELRA 5I59B 1OMPA 3QIMA 5I57A 2O6AA 1MRPA 4LONB 3PMWA 2B3FA 3M3KA 4R74A 3H03A 3MZ9A 4DXUA 1YAEA 1A54A 3G3HA 2ESNA 1M5FA 5TPAA 4ZEFA 4O3BA 4BDLA 2Q2CA 1B9JA 4U21A 3OSQA 1PB9A 2I0BA 1MQIA 2I49A 2WKYA 1MQDA 1IEJA 3KJ7A 4X1BA 4LATA 3PD8A 1NNKA 2H25A 1IXHA 2O84X 3FV2A 3G3IA 3T9UA 4AQ4A 1LB9A 3KEIA 4G2ZA 4G8MA 2R71A 4F3SA 1MQHA 3HHGA 2Q9TA 4PFWA 1JQFA 5JK4A 4NF6A 1FTKA 4HS7A 2HAUA 2NVUB 1OVTA 2ABHA 3M8UA 5HBCA 2OWSA 3B6QA 1O7TA 3O97A 1LFGA 4R6HA 2DE2A 2QL3A 1ZMGA 1LAXA 4GD5A 3K02A 2A5TB 1N7XA 1IIWA 3PU5A 3E4RA 4OERA 4LZ5A 5M2VA 3DELB 3AXFA 4AB6A 2F6PA 3O28A 4ZZAA 1MPBA 1NL5A 1ZTYA 3S4UA 1EZOA 3N94A 4GVOA 4HTGA 4PP0A 4F2QA 3T9HB 1LSTA 3FJMA 4KHZE 2NXOA 4C1TA 3IX1A 4DE8A 2IA4A 1QUIA 1P1UA 1NMUA 3MP6A 4IO7A 1UIVA 4NF5A 3V5AA 5ITOA 5ICQA 1SW4A 1MG1A 4BDMA 4MLVA 2RF1A 2Z8EA 3OD7A 4RPNA 4G68A 5KCJB 3LSWA 3MVXA 4QFLA 4F29A 2AL5A 3KFMA 3SEYA 2QRYA 4F31B 2QMXA 3MW0A 2DQVA 4NF6B 3UN6A 4ZEBA 4R6YA 3RT8A 4GL0A 1JW1A 1ELJA 2F5XA 4N07A 2CZLA 4NWCA 3V89B 4R2BA 2NUVA 4UACA 4FJPA 2F36A 4QSDA 3GBAA 4RXLA 2QJEA 1I6AA 4WKMA 3MZBA 1H3DA 4GXSB 2DP8A 2FA7A 4YMAA 4OVJA 4IGRA 2O1MA 3DP4A 3ILTB 4TQUQ 4ZS9A 1B40A 3O9PA 4OFJA 2D3IA 2O7UA 4YB6A 2ALUA 4GIZA 1D9VA 3OO8A 2KLFA 2YJPA 4OEVA 2H4IA 2F97A 3RQTA 1LAFE 5FTHA 5I58B 1XS5A 4N13A 3IO4A 2ZYMA 4NF5B 3OSRA 5AE4A 5I2KA 3VXBA 3CFLA 3K6VA 3A3UA 3UORA 2XXXA 4R73A 1LB8A 3VVDA 1Q1KA 3FGSA 3U94A 3LC8A 1J1NA 1IITA 3RGYA 1KWHA 4YKKA 4KYSA 2D21A 4PE5B 3O66A 1XC1A 4POWA 2XXTA 4FECA 1USYE 4R6KA 2V25A 4YKJA 2AIXA 1MY4A 2DWAA 3MPLA 5H8FA 1OLAA 4NWDA 3S2VA 4ZDMA 1JVYA 3ILUB 2P1SA 3CSBA 4Q0CA 2I4BA 4NF4B 1EH3A 2Q88A 3E13X 2DVCA 3EQ1A 3IK6B 2GH9A 4RYAA 2I58A 4U1ZA 3MWBA 3H6TA 3S9NC 2X26A 2O1LA 2W7YA 4QFOA 1H43A 3OEKA 4M4GA 2HCAA 4GRKA 3M3FA 3OO6A 5H8HA 2R9JA 4U22A 2DXRA 4ZECA 3ECRA 4I8CA 1TWYA 4F1UA 1EZPA 3C31A 3N26A 4R75A 2XXIA 4KI0E 3RPWA 5I2KB 3H06B 3G3KA 1NH7A 3SKPA 4RA1A 1LGBC 2HZLA 1Y3PA 1Y1ZA 1N76A 1DOTA 1S9TA 3VLUA 3DP6A 1MH4A 3LSFB 1Y1MA 3FJ7A 1R6ZA 3W9WA 4XKQA 4PFUA 1FQEA 2YPNA 1MH3A 3HSTA 1SD3A 5H8FB 1MXYA 4AB5A 3MZ1A 3DM0A 4BDOA 4MF3A 3SERA 1BP5A 3VV5A 1SW5A 1OQGA 2ZXTA 1US4A 2V3QA 4JSDA 5JTYB 4XIGQ 3MAMA 4NF8A 1QJMA 4FEBA 4GF8A 4ZEKA 3N6UA 3C9HA 2DWIA 3IL1B 3TTMA 3R6UA 4JSOA 4JWXA 3C36A 3PMVA 2F8DA 3CG3A 4Z0IA 1A8FA 3CIJA 3HPIA 1TT1A 2HXWA 3GXAA 3H4ZA 4RJZA 2Q8JA 3MVWA 1P1QA 4M1VA 4YB5A 4F19A 3T66A 2HEUA 1B1XA 5BUUA 1NNPA 4LVQA 3KN8A 4GQOA 1IXGA 1URDA 1JW4A 4PETA 2UYEA 3TDJA 2G29A 2H5YA 4LZ7A 4H8IA 3MVZA 4I9DA 2ZNSA 2UXAA 1N84A 3IOUA 1DMBA 3U93A 1PBPA 4LP2B 5AA4A 4ESWA 3D4GA 4OZ9A 1B3HA 3TPAA 1DPEA 1FTLA 2RCAA 3TYHA 2XXUA 3G3GA 3MC2A 1JNFA 3FVNA 4YU0A 1EU8A 1RYXA 3PD9A 5CMBA 1P99A 3S9MC 1P1OA 4QSEA 5DVJA 1A55A 2ONRA 2ONKE 2RINA 1ZJLA 2Y84A 5L8DA 4Q8RA 1R9QA 4DCYA 1MDQA 4POXA 5TP9A 3OOAA 2OZZA 1Y3QA 4KYDA 2X7QA 4NF8B 4GOTA 2Z22A 2XXRA 4LUBA 2Y7KA 3ZKLA 3FV1A 5TU0A 2Y7RA 3UIFA 3HV1A 5J1DA 1M5BA 4IY5A 5AA1A 4YZZA 4QRZA 4KFQA 4OMBA 5KCJA 1LAGE 1Y4CA 1ZBMA 4ZE8A 2UVIA 1DPPA 4NMYA 2REGA 3MP1A 1MPCA 1B46A 2Z23A 4U4SA 1A7LA 2NWJA 3K0VA 1B3GA 3UP9A 1N0TA 2RC9A 1PBQA 3JZJA 3SEUA 3U8QA 3PUWE 5AA4B 1FQCA 2BJJX 3PMXA 1MXWA 3PUXE 2UVGA 1RYOA 2O69A 3O6HA 3OXNA 2HQ0A 3TCFA 3I3VA 5I56A 3QSLA 2PX1A 3QUFA 4IO3A 3LR1A 2XD2A 1T0KA 2GFEA 4YAHX 1B3FA 2PMSA 2GHBA 2I3WA 3MVYA 3PPNA 4MLQA 1UQWA 1URSA 4TOZA 5TP9B 4JWOA 2AYSA 3TTLA 1JVXA 1TFAA 2I6EA 3DP8A 3O2AA 3K2DA 3P7IA 1HSEA 4ELQA 3VXCA 5I58A 4RY1A 5B70A 5FTIA 3ZKKA 3TUSA 4TLLB 3ZS6A 2E0SA 4MFIA 1LAHE 3IO6A 3IB2A 1NNTA 3HN0A 1B3EA 3BFTA 1B5JA 2H98A 1OVBA 1FTMA 3GZGA 2RC8A 1SYIA 4NE4A 3JV9A 2VOZA 3I5OA 3CR9A 5CBSA 1II5A 1QUKA 3U92A 1MM6A 4FORA 5AA2D 3PPRA 3K6WA 2I4CA 1B2HA 4F3BA 4PFYA 1B0HA 3D4CA 2B3BA 4NTLA 1B4HA 2B65A 1A8EA 4OQOA 5LOMA 2XXWA 3SETA 4X1DA 5L9OA 3EN3A 4XXUA 4EQ9A 5I56B 3A3CA 4NF4A 4XKPA 3IR1A 2F34A 2OJTA 5DT6A 1NKXA 1YTVA 1O63A 3PUVE 4R9GA 1B7UA 3VE1B 1MQGA 4F39A 3TTKA 2X7PA 1B3LA 3LBSA 2PYYA 1B52A 1IXCA 5DVIA 3T93B 4O3AA 2OWTA 4ZEIA 5I84A 4U2RA 4EF1A 4FAJA 3ODBA 4HCWA 1POY1 2PBWA 1FQBA 3RN8A 4U1OA 3S9LC 1MY3A 3IOWA 4QHQA 1Y3NA 2ZYNA 3BKIB 2PT1A 1VR5A 5CC2A 4FE8A 3KZGA 4WEDA 3T96B 1D4NA 4U23A 1FTOA 5DTBA 4KR5A 3VVEA 4YKPA 3K00A 1NNFA 2OLBA 2F7CA 4RNSA 1TFDA 4P11A 2NOOA 3SEWA 2OK2A 1PB7A 5CMCA 3USDA 3TCGA 1JW5A 1NFTA 4ISUA 3CFZA 4BDNA 1BKAA 1MY2A 3KG2A 3EHTA 2YLNA 4IO2A 3CRBA 5JTYA 3TEPA 2Z8DA 3EHSA 5EHSA 3TQLA 5F7VA 4F3PA 1AL3A 2QMWA 2F7AA 1HSJA 1M5DA 4N6PA 4KQPA 1Z7NE 1OLCA 3U1OA 2O7IA 5IAIA 4EXLA 1SI1A 4G8HA 3CG1A 4DXCA 3O6IA 4GFRA 3H6VA 3O6GA 4BDQA 3SEXA 3TTNA 1POTA 4OTEA 5CRYA 4R2FA 3RNNA 1VE4A 4WEPA 5H8QB 3FATA 5HPQA 3Q27A 3G3FA 4IY6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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