1LCTA

Structure of the recombinant n-terminal lobe of human lactoferrin at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
RSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Structure of the recombinant N-terminal lobe of human lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
total genus 97
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lctA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lctA02
3TMGA 3RT6B 3TCFA 4N13A 3H03A 5AA2D 3RN8A 2WKYA 3CIJA 1S7YA 1SD3A 4GXSB 4QHQA 3W15C 2XXTA 4F39A 1UIUA 1I6AA 3TTNA 5L9OA 4EF2A 1OVBA 4M4GA 3UK4A 4NF4A 1Z7NE 4F19A 2H9BA 4ZZEA 4WKMA 1DSNA 3C36A 3PV0E 3FJ7A 4MF3A 4ELPA 4NMYA 3TODA 4M1VA 3H7MA 3KOTA 1AOVA 4O3AA 5FTIA 3SEVA 3N6TA 3H4ZA 2O69A 1FQBA 4R72A 4LONB 4K3FA 1JVXA 3CG1A 5CBSA 3DP6A 3FD3A 4YB5A 5I84A 2DVZA 2ZNSA 1YAEA 2Z22A 5EHMA 2E1SA 1Y3PA 3H6TA 3C33A 2ALUA 1FTLA 1JW1A 1UQWA 3S9MC 4AQ4A 2GRVA 1GR2A 4GL0A 4IO5A 2QSXA 3CSGA 4I62A 2VD2A 2Y7WA 3KN7A 3K1PA 2UXAA 3KBRA 1EZOA 4KFQA 3LC8A 3MC2A 1VE4A 4ZEBA 4G8HA 2XX9A 4PFTA 3KG2A 2ONRA 4NF5A 2B65A 2QS1A 2O51A 2NXOA 3Q26A 4POWA 1NNPA 2I6EA 3FATA 4QFLA 1QVSA 4F3SA 4YAHX 2IEEA 4OEUA 2XXIA 4FATA 1SYHA 4ND9A 1N04A 1LAFE 3PMWA 2XD3A 4GVOA 3QYTA 1H43A 1POY1 3EPEA 4DCYA 5I57B 4OZ9A 2PT1A 4X1DA 3PUZE 1AH5A 5FHOA 5A5XA 4XKPA 2RC9A 2DWAA 1GTKA 2F36A 1JVYA 1VFEA 5B7DA 1LFIA 3A3UA 3G3GA 4PFUA 1IXHA 5AA4A 5HPQA 4NE4A 3CVGA 1WODA 3IOVA 4Q0CA 2YLNA 4FORA 2P2AA 3Q29A 4OVJA 1URDA 5AA2A 3LBSA 2ZYKA 4QSEA 1Y3QA 2A5TB 3DP8A 5JK4A 3QSLA 3UA8A 3MAMA 3KEIA 4R2FA 4G68A 3GLBA 3OSQA 1B5HA 1VFDA 3HO7A 1UTHA 1B3HA 4G68C 1SDXA 4O3BA 3K4UA 5TPAB 2AIXA 1XVXA 4G8NA 1ANFA 1B3GA 1LB9A 1TFDA 3SESA 3K1NA 4WEPA 1SW2A 1XC1A 1RYOA 4NF8A 4ZEIA 1B5JA 4XIGQ 2I48A 3TTRA 2QS2A 2XXUA 1Y1MA 1B4HA 4TOZA 3GZGA 1IQ7A 2HZKA 3K6VA 4F2OA 1MXUA 2DXRA 4BLAA 1SW4A 2Z8EA 2I4BA 3N94A 3PUYE 4H6DA 3Q27A 4XTCQ 4YICA 4BDLA 3FIRA 2QPQA 1NH8A 3ZS6A 4PFWA 3B6QA 2V3TA 4NF4B 4U22A 4LZ5A 2XD2A 1P1NA 5ISUA 4QFNA 2H4IA 3M8UA 4N6PA 1QUIA 3H06B 4RYAA 3IJXB 4GIZA 2OK2A 1NKXA 1MXYA 3PPRA 3MZ1A 2OLBA 5ITOA 4BDQA 4GOTA 3UIFA 3U93A 4X1BA 3IO4A 3OSRA 4LATA 4LUBA 1LBBA 3SEYA 4ZEKA 5F1QA 1OIBA 2DE2A 4GL8A 5LOMA 3PU5A 2UYEA 4R6YA 3TCHA 1IEJA 3O9PA 1ZU0A 4PETA 4C0RA 3F11A 4KPTA 4QFPA 3RQTA 1WVJA 3RGYA 3P7IA 3VE1B 5EYFA 1R1NA 3KGCA 2F97A 1A7LA 1LCTA 4R9FA 3TQLA 3D4CA 2Y7RA 4NF5B 1VSOA 1JQFA 4GFRA 3QXMA 3ECRA 4EXLA 1TXFA 5CMMA 4Z0IA 4H5GA 2W7YA 4FIMA 2DE3A 4U1OA 4H65A 4OERA 2UYFA 1NFTA 3K02A 5DVIA 5JEIA 4F1VA 2V3QA 3USDA 2VOZA 3E3KA 4FEDA 1AIVA 3U72A 2HAUA 4H1XA 4ZE9A 3FV2A 4JXIA 4R73A 5A5XB 3JYRA 3JZJA 3FVKA 3IOWA 3SERA 3HV1A 3FJGA 2ABHA 5AA4B 4ESWA 2QMXA 3G3HA 3TEPA 3S4UA 1MY2A 4QSDA 4HCYA 2FNCA 4P0GA 4PFYA 2XXXA 5I58A 5AA2B 3HN0A 1GGGA 1A99A 4UACA 3K1MA 1IIWA 2QS3A 5HBCA 1QULA 1D4NA 5H8SA 4WEDA 1UTHB 3G3JA 4POXA 4QFKA 1LFGA 3GBAA 4MLVA 4OFLA 3RTWB 3MZBA 2VD3A 2NWJA 3K2DA 4LQ2A 3O28A 3GXAA 2UVHA 2NOOA 2XXYA 2DP8A 2RC7A 4HCWA 4LP2B 3ONMA 2I3VA 4OQOA 2UVIA 4JB7A 2I49A 4NF8B 5JTYA 4C1UA 5FTHA 5TP9A 3MP8A 4F1UA 3K0VA 1Q35A 3TFLA 4YU0A 4DXBA 1B7HA 3LSWA 3OENA 3OO6A 3EHTA 4OESA 2HAVA 1B32A 5EHSA 2V25A 3C35A 3AXFA 1Z7ME 4G4PA 3GBBA 3VLUA 1H76A 2HXWA 4NWCA 2PX1A 3VVFA 3MVZA 3IR1A 1MY3A 2LAOA 4XXUA 3MVYA 2F7CA 3PGFA 4JSDA 2CMOA 1I6QA 1USYE 3OO8A 3VFJA 1S50A 3E9XA 2Z23A 3N6UA 3O6GA 1SVXB 3DLNA 2GFEA 1DPEA 2BJJX 1FW0A 2QMWA 5ELVA 3RT8A 4OYVA 1J1NA 2ZMBA 1Y4CA 1DPPA 4GF8A 2OZZA 2XXWA 3PMVA 2O7IA 4ZEFA 4GQOA 4Q8RA 3IB2A 2D5WA 3MZ9A 1IXIA 1UIVA 1ZMGA 2F7AA 3QK6A 3K6UA 2F34A 2HZLA 2Q9TA 5AE4A 1FTKA 4OTEA 4MBPA 5KCJA 3VV5A 4ZE8A 3O66A 3ZSFA 2F35A 3KOSA 1MPCA 2AYSA 4OXVA 4MLQA 1JEUA 2O68A 5I2KA 4AB6A 3L6HA 4RY1A 3DP4A 1FQAA 1ZTYA 4NEDA 3SETA 2I4CA 1S9TA 2Y84A 1MS7A 3A09A 4YKIA 1D9VA 2GHAA 2RF1A 2V3UA 4F3GA 1PBPA 3JV9A 3W9WA 4EF1A 2KLFA 2DWJA 1MY0A 2XXHA 2B3FA 2PYYA 4IGTA 1GV8A 4IY5A 3MBPA 1B1XA 4DCXA 2Y7PA 3W9VA 5K2YA 1LCFA 2RCBA 2D3IA 3HSTA 3IJOB 1LFHA 3I3VA 1NH7A 3K00A 4HTGA 4U23A 1PDAA 3T93B 1UTBA 4YKKA 2DVCA 3FGSA 1B9JA 2YPNA 1BP5A 4JSOA 3A3CA 3MVWA 5I56A 1B58A 1ZBMA 4LA9A 3VXBA 3IK6B 4Q5TA 4GD5A 1NNFA 1OLAA 4R6HA 3C4MA 3CFZA 4OENA 1QUKA 4LVQA 1QUJA 3TKDA 3O2AA 1QW0A 4H5FA 1O7TA 3HCQA 3THIA 1MQIA 5AA3A 4H8JA 5I58B 2Y7KA 3FJMA 1EZ9A 1TWYA 3G7WA 3PMXA 3QUFA 4HS7A 3SEUA 1O63A 1MM7A 3E4RA 3E13X 2O7UA 4ZDMA 4DLDA 4FECA 1R9QA 1XS5A 1BTJA 4GWOA 4DIGA 4OFJA 4DXCA 1MH3A 1USYH 4F18A 4KQPA 2VP1A 4IB2A 3ILUB 2RKMA 4RA1A 5I2NB 2NVUB 4NF6A 2NUVA 3FXUA 3IO6A 5DVFA 3FZVA 3N26A 4XKRA 3T9VA 1BLFA 1OLCA 4PQJA 4BDMA 3S9NC 5JTYB 2AL5A 5TP9B 4ONYA 1H3DA 4JBZA 5KDTA 3S2VA 1URGA 3MP1A 1EH3A 2Z8FA 3HHFA 4IO3A 2G29A 5DYHA 4ZZAA 2V84A 3N5LA 3FVGA 3OEMA 3O6IA 1TFAA 2F6PA 3IORA 1ZLQA 3R7XA 3OO7A 1EZPA 4U21A 5HM4B 1PB9A 4JWOA 1MPBA 3KSXA 3RPWA 2REJA 1RKMA 1T0KA 3IL1B 4NTLA 3TAJA 2I58A 5DTBA 5H8FA 4F3PA 4EQ7A 3C9HA 1LLSA 3I6VA 4OHNA 3ZKKA 3Q25A 5KZTA 4ECFA 2Z8DA 1OMPA 4I8CA 1IXGA 3C31A 1SQYA 4IO2A 1B52A 1NNKA 4OEVA 1OQGA 4G2ZA 1Y20A 1MDQA 2PMSA 2V93A 4F29A 5KCJB 4BDNA 1IXCA 1B6HA 3ODBA 4TLLB 5IAIA 1URSA 3RLFE 2ZYOA 1FTMA 4U2RA 2O6AA 1B3EA 1A8FA 3LR1A 5I2KB 1Y1ZA 4XKQA 3MJNA 2X7QA 1SW1A 3RY3A 4LQ5A 2X26A 1PEBA 3S9LC 4NWDA 2H5YA 1ZIUA 1B40A 5H8QA 4KR5A 2ZNUA 1A40A 1PB8A 3LSFB 1NL5A 4KI0E 3MWBA 3SDFA 2Q2AA 5H8HA 3SEXA 3TYHA 3EHSA 3MQ9A 3T9UA 1R6ZA 2OWTA 4R6KA 2A5SA 4BDOA 2OJTA 3M3LA 4PE5B 3HHGA 2ONSA 4FAJA 2HQ0A 2XXVA 3V83A 5L8DA 3UN6A 1XOCA 1UTBB 1FTJA 3EQ1A 4RJZA 2DWHA 4ZECA 4FE8A 5I56B 1M5CA 4RPNA 2PVUA 4KYEA 2OCUA 3MVXA 4RK9A 1IUDA 3C34A 1Y9UA 3T66A 3IOUA 4G68B 2AL4A 4KHZE 1MY1A 2O1MA 2VGQA 4EQ9A 4PP0A 1BIYA 1H45A 4EDPA 2QS4A 2YJPA 4Q30B 4THIA 4N07A 4KCDA 3IOTA 4IO4A 4TLMB 5DVJA 5CM6A 4JWXA 3WAFA 4H8IA 1B2HA 2XHDA 3RTFB 1II5A 2F6GA 3CRBA 2OWSA 5ITPA 4QSCA 4GXAA 3RUMA 3KJ7A 3U92A 5KDTB 1IZ1A 1DMBA 4ISUA 3QAXA 3O97A 1NNTA 5CBRA 3C32A 3BFUA 3TCGA 1SYIA 2ESNA 1CE2A 1MXWA 3S9EA 3BBRA 2RC8A 4F22A 2F7BA 1AL3A 1N84A 1LBCA 4ZS9A 4E0WA 4EXKA 3MW0A 2DXYA 2DYXA 3O29A 1XVYA 1QJMA 2X7PA 1YPNA 2DWIA 5CC2A 3HPIA 1P1QA 3B6WA 5H8FB 2H25A 5FHNA 1B3FA 3KZGA 3CSBA 3VXCA 4U4XA 4QRZA 4IO6A 3SKPA 3U94A 1POTA 5K2XA 4KYSA 2HEUA 4ESXA 3FUZA 1B4ZA 1RYXA 4WXJA 1ZKBA 5L9MA 3TZAA 3PPOA 1MXXA 3TTKA 1B05A 1LGBC 4I1DA 1B5IA 3O6HA 4P0IA 4MH5A 1LSTA 3K01A 1DTZA 2HCAA 1DTGA 2PT2A 3FV1A 3B7DA 3D4GA 2R9JA 4HW8A 2ZYNA 1I69A 3PUWE 2B3BA 4IO7A 3QUJA 5IKBA 1MQDA 3U1OA 2G93A 1LAGE 1KWHA 4FEBA 4TQUQ 4DE8A 4F31B 3T9HB 3H3GA 1HSLA 1JW4A 1M5EA 4OFOA 4C1TA 4FJPA 3DELB 1SW5A 1MRPA 5H8QB 3ZKLA 5FHMA 4P11A 1B1HA 3IAZA 5DEXA 2REGA 4OWDA 5H8HB 2F8DA 2P1SA 3PPQA 4AB5A 3V8XB 3ILTB 3FXRA 1WDNA 2O84X 1HSJA 1FQCA 1US4A 3H6VA 3G3IA 4JWYA 1PB7A 3VLWA 3WAEA 3M3KA 3H6WA 3MPLA 3KJTA 2DOJA 3U8QA 3IB1A 1P1WA 1EU8A 1N3WA 5BUUA 4E0XA 2XX7A 1JEVA 2R6GE 5H8NA 4YMAA 3K6WA 1LB8A 3LSXA 3UP9A 3KN8A 2IA4A 4DDDA 2O1LA 3MP6A 3PUVE 4JDFA 1B46A 4YMBA 1P1OA 3OELA 3TTMA 3OMBA 1MDP1 4R2BA 1CB6A 4QF9A 2FA7A 1A8EA 1MM6A 3DM0A 2THIA 3R26A 1OVTA 3G3KA 2VHAA 1N7XA 2D21A 4ELOA 4ZEDA 4IY6A 2XXRA 2Q8JA 3TPAA 3PUXE 3FVNA 4KYDA 1O64A 4R74A 2DE4A 4KCCA 4R75A 4YKJA 3PPPA 3V89B 5ICQA 3MUQA 1MQJA 4MFIA 3TQWA 4YB6A 1M5FA 1SI1A 2QL3A 1GVCA 2QJEA 1ELJA 3K6XA 4F2QA 5I59A 1F9BA 3FXQA 2F5XA 1JW5A 1IITA 1YCJA 1P99A 1M5BA 5TU0A 2Q88A 1N0TA 1NMUA 3OO9A 1TT1A 1N76A 2Q2CA 1JNFA 3V5AA 1FQFA 3CFLA 1D3KA 3PD8A 5F7VA 3CR9A 1MY4A 2PBWA 3EN3A 1B51A 5B70A 3VDFA 1MXVA 3RNNA 2Q89A 1DOTA 1BKAA 2I0BA 1PBQA 4F3BA 5CI5A 4ELRA 3I5OA 3BFTA 1M5DA 1MQHA 3Q28A 1Q1KA 3IB0A 3TDJA 3BKIB 2ANJA 3M3FA 1MQGA 5CMCA 4YZZA 4X9TA 5CRYA 1ATGA 2QRYA 2RCAA 4F1YA 3VLVA 4BDRA 1MPDA 1B7UA 4H0WA 1MG1A 3CFXA 3T9XB 2OBGA 4DZ1A 4ELQA 2FYIA 1N3XA 1FCKA 4OETA 5M2VA 4U1ZA 4I9DA 3OXNA 1I6BA 1MXZA 1ZJLA 5DT6A 1D9YA 3OD7A 1H44A 3CI8A 1PC3A 1A54A 5J1DA 2F78A 1A55A 2E0SA 2ZYMA 4X48A 1B3LA 3VVDA 2GHBA 3KFMA 4EUOA 4U4SA 2DSFA 3TUSA 1N7WA 4RK2A 4L17A 3R6UA 2ZXTA 3PD9A 2R71A 2H98A 2UVGA 2Y7IA 5ICTA 5I57A 4OMBA 2HFBA 1Y3NA 3L6GA 1FTOA 3TELA 1XHYA 1B7ZA 1OQHA 1LAXA 4RPOA 3MPKA 5AA1A 3FVOA 3H6UA 1XT8A 5DEXB 5BWJA 1HSEA 3KSJA 4O3CA 1SI0A 1FQEA 4XKNA 3G3FA 3UGWA 2UVJA 4QFOA 3T22A 4KD5A 1AMFA 2XXPA 2A5TA 3OEKA 4RNSA 1FQDA 2ONKE 4DXUA 1R9LA 1B0LA 1SBPA 4Z7EA 1YTVA 4G77A 2DS9A 3CG3A 2XX8A 2I3WA 3B6TA 5H8NB 3IX1A 4UA8A 3OOAA 4GLIA 5TPAA 2P0SA 1QKAA 2GH9A 2CZLA 2H99A 5CMKA 4H67A 1B0HA 2RINA 4LZ8A 3SEWA 1QKBA 2DQVA 2ZNTA 1US5A 1Y4TA 4YB7A 1MH4A 3FASA 1P1UA 5CMBA 4YKPA 3TTLA 3KN3A 3LUYA 1JETA 3UORA 1L5TA 3PPNA 2XXQA 4G8MA 3LSLA 4IGRA 5I2NA 3EHUA 3VVEA 4RXLA 4NF6B 1LAHE 3T96B 5L9SA 1VR5A 4LZ7A 3EF7A 4GRKA 3QIMA 2M8CA 4R9GA 4EQBA 5I59B 2I0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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