1LCUA

Polylysine induces an antiparallel actin dimer that nucleates filament assembly: crystal structure at 3.5 a resolution
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Polylysine induces an antiparallel actin dimer that nucleates filament assembly: crystal structure at 3.5-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 95
structure length 361
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1lcuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1lcuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1lcuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1lcuA04
4EHUA 1NGGA 3AY9A 4IJNA 3GBTA 2CGJA 4EHTA 2D1KA 1HKCA 3CJ7A 4HWIA 3UKUA 2FLOA 5BRDA 3ZEUA 3HTVA 3HSCA 1E4FT 3JXUA 4FWQA 4LC9B 3M3ZA 2Q31A 4FWRA 2PBDA 1ATSA 1MWMA 4DCHA 2FF3B 3F9MA 1GLFO 3SJHA 3QICA 2E2QA 3WEEA 3KZBA 2E2OA 3O4WA 2FSNA 4B1WB 3AAPA 1JCFA 4H0YB 4WQ5C 1NLVA 2E1YA 3DXMB 4BGBA 4XH5A 5AQOA 3CETA 5EX5A 4BGAA 4BRKA 3H45C 2E2PA 4BROA 5AQYA 5AZJA 4JAXA 3KVGA 4BRDA 5E84A 1G99A 4CBUA 3UKUB 1HPMA 1TUUA 2DPNA 2J4RA 3HM8A 3LDLA 5FPMA 4E1JA 5E26A 3CJ1A 4XEIA 3CJCA 1U2VB 3CQYA 5F2RA 3O1BA 4IWVA 2QWPA 4M7YA 3U9DA 3L6QA 4B1UB 3W3DA 5LJWA 4BRNA 4XH4A 4BC2A 4CZIA 1V4TA 3EL2A 3VENA 2D0PA 3LM9A 4ISGA 4BREA 1HKGA 2QWQA 3UB5A 4JN4A 5KQDA 1HKBA 3WXIA 3L0QA 3O08A 3A5NC 5AQFA 3VPZA 1NGAA 4PL8A 1YXQA 1MA9B 2QWLA 5TKYA 4CZHA 4M7XA 2QXLA 4BRGA 4BQLA 1U6ZA 3CJ9A 2ITMA 3C0BA 3ZEUB 2E2NA 2FSKA 2GTDA 3VF2A 2WUSA 3BF3A 4H0XB 4QS7A 1XQSC 3EKSA 5EVZA 5AR0A 4JD2A 4BRAA 1SZ2A 3SLCA 1BA1A 3MN9A 1NGIA 3R9PA 4A2AA 3IMXA 5AQSA 5BR9A 4CZMA 4J8FA 1TYQB 5AQXA 1NWKA 4PKHA 3IFRA 3ATUA 3LL3A 5ADXH 2A40A 2V52B 3MN5A 3GL1A 3CJBA 5KQ8A 5JLFA 4FPBA 4BR2A 4GY2B 5AQQA 1Z05A 3BEXA 5KPZA 4FO0A 1GLEG 3ULEB 4BRLA 3HI0A 3MCPA 4MO5A 3VGMA 5AZJB 2ASPA 3SMPA 2I7PA 3A5LC 4IJAA 1MWKA 3VETA 3FZKA 3GE1A 3DXMA 2ZGZA 4FSVA 2UYTA 1SAZA 4FOIA 3CJAA 3U4LA 3ZETB 4RCHA 2KHOA 1LCUA 3R8EA 4BC5A 2P9UA 3FFKB 5FPEA 3WEEB 3A8YA 1NGEA 1HUXA 4PL7A 1GLBG 3CQXA 4BRFA 3MN6A 3H1QA 1BA0A 3FZHA 5AFUA 4QS8A 3MK6A 1HX1A 2YHXA 3S41A 3BF1A 4WQ4A 5AFUH 1T6DA 1TUYA 3VERA 1LOTB 1C0FA 1HJOA 4BRQA 4BR0A 5F0XA 2AA4A 3FGUA 1BU6O 2ASOA 5BPLA 1KAYA 4Y0WA 2ASMA 2HOEA 1ESVA 3HBTA 3VF6A 3FE1A 3BUZB 5BPNA 3FZFA 3FZMA 1YAGA 3H3OB 2ZF5O 3O8MA 4CI6A 4PKIA 4ISFA 3HZ6A 3C7NB 3VEWA 4ISEA 3J8AA 3ZX3A 5LJVA 2IVPA 3A5MC 1NGDA 3GOIA 4AM6A 2Q97A 2P9PB 2ZGYA 2Q0UA 4FWPA 2GUPA 5AQGA 3CHWA 1GLLO 2V51B 3EO3A 2YCHA 5AQMA 2E8AA 5BN9A 5AQLA 3H3NO 1RGIA 3SK3A 3U9ZA 3RSEB 3DWLA 4CZLA 1NGBA 1V4SA 4H0OA 3GDQA 1BWFO 2FXUA 2VCPA 5AQIA 3D2EA 5FPDA 1K8KB 5JICA 1YUWA 3UKRA 2D0OA 2YHWA 3ID8A 3W0LA 4CBWA 2PAVA 4FWOA 2F9WA 2E1ZA 4CJ7A 2IIRA 3KHYA 2NZTA 1IG8A 3VEYA 5BPMA 1YVNA 4CZFA 3QBWA 3UKRB 1K8KA 1BG3A 4H5RA 2P9IA 1NGHA 3LM2A 2NRHA 5KPTA 2P9NA 3FZLA 3RSEA 2H3GX 1IJJA 4JHDB 4KBOA 4BQZA 2I7NA 1P8ZA 4WQ5A 2E20A 5AQTA 1QHAA 4BVPA 1J6ZA 2ZWHA 2GEMA 4BC4A 3DXKA 1NMDA 3IUCA 5JMVA 1S22A 3FR0A 3U8XA 3WXJA 1NGJA 3VEXA 3UE5A 2P9KA 5EY4A 4CD3A 3MMVA 3MDQA 3QMLA 3O5BA 5BRHA 5AZIA 5BRFA 5AQNA 2P9KB 3WXKA 2P9LB 2VYPA 4B1VA 3D2FA 1ZBSA 4MLHA 4I6MA 4FWKA 4MLEA 1ZC6A 4XH1A 3VESA 3VEZA 3ENHA 4BRIA 3I8BA 4B1XB 3VEOA 2A5XA 4BVOA 5EXWA 4BR9A 4CZGA 4B1YB 4BR4A 5F1XA 1BUPA 4A62A 1KAXA 5BN8A 4CZEA 4MO4A 4CZKA 3O6WA 3DAWA 2P9IB 3SMSA 1T6CA 4WQ4C 4A2BA 4H0PA 2P9SB 4C23A 4I6MB 2VWBA 1GLJO 2Q1NA 4BRHA 2QWOA 1QZ6A 3H6EA 5AQKA 4DB3A 3EN9A 4DQ8A 3TU5A 2QWNA 3EKUA 5AQVA 2CH6A 4NO7A 3ZX0A 3WQUA 1NGFA 3WQTA 1XUPO 1BO5O 1NM1A 2W40A 5B8HA 2F9TA 5ELZA 3M6GA 1X3MA 3MN7A 2FSJA 2YHYA 4F9OA 1WOQA 3DJCA 3D7EO 3R6MA 1X9JA 3ENOA 4JHDA 1E4GT 5AQHA 4EIAA 4Z94A 2D4WA 1XC3A 4K41A 4HTLA 4BRMA 4FPAA 3IDHA 4JNEA 4PKGA 3LDOA 1D4XA 1RDWX 3EZWA 3OHRA 1R59O 5JLHA 4FWNA 2GWJA 2V7YA 5AQZA 4H0TB 4O8KA 2QWRA 1OKJA 3LDPA 5AQRA 4YDUC 5I9EB 4K42A 2P9SA 2NLXA 3D2EB 4RTFD 3QFPA 1SQKA 1QZ5A 1H1VA 1QQOA 3CERA 5AQJA 1EQYA 1Q18A 2A41A 4IO8A 4O5FA 1GLCG 2HF3A 3VGLA 1Y64A 4B9QA 2Q2RA 2YI1A 3QFUA 4L3QA 4YDUA 2YJFA 3D2FB 5ADXA 3WUHA 4BG9A 3VOVA 4H03B 2Q0RA 2QM1A 2P9LA 3I33A 3M1FA 3O1WA 4GNIA 4BR7A 1GLAG 4RWTA 5AZIB 2A6AA 4EFHA 3ZETA 1DEJA 1BOTO 5AQPA 2YJEA 4CZJA 2A3ZA 2IVNA 1ZXOA 4B1ZA 5EOYA 3O80A 3CIPA 3TPQA 1GLDG 3P4IA 3ZX2A 1QQMA 3FLCO 3DXKB 4IZ9A 4M63C 3L4IA 5AQUA 3A0IX 4K43A 1U2VA 3B8AX 2HF4A 3ULEA 3QDKA 2W41A 5LY3A 1T44A 1KAZA 4FOEA 4BRPA 2V7ZA 3H1VX 2P9NB 3VEVA 3LDNA 3VGKA 1BDGA 2QW9A 1Z6RA 2BTFA 1S3XA 2AP1A 4AM7A 1KXPA 1X3NA 1TYQA 4IXCA 5FPNA 4H5NA 3VF4A 4BR5A 2CGLA 2HMPA 4H0VB 1ATRA 2P9UB 2IVOA 5CE3A 5KPRA 4JD2B 5BREA 4H5WA 1HLUA 4FWMA 4BRCA 1DGKN 4FWSA 3H46O 4CBXA 3ATVA 2OANA 4NB4A 2CGKA 2E88A 3G25A 3JS6A 4BC3A 4QS9A 1JCEA 4DHYA 4CD1A 2FF6A 4EAHD 2QWMA 2A42A 1MDUB 2P9PA 3LDQA 2BUPA 3QB0A 3AAQA 3AARA 3C7NA 4K25A 4FL9A 1JCGA 1NGCA 2GELA 1ATNA 1DKGD 4H5TA 1C0GA 3WXLA 1WUAA 4H5VA 3CI5A 2CH5A 4FWLA 3A5OC 2Q36A 1QQNA 2EWSA 1RFQA 5AQWA 4WYBA 4A61A 1CZAN 3WT0A 4BG8A 2GWKA 3GG4A 1NBWA 3BP8A 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JVHL 1TAUA 3KK1A 3G71N 1HKCA 3SAHA 1S6PA 2FLOA 4FVUA 3JXUA 4FWQA 1XHXA 4CF0A 4DTUA 2WC9A 2PBDA 3CFPA 2ATQA 4HTUA 2X6SA 2QK9A 3WEEA 2E2OA 3T1YK 3V1QA 2FSNA 2JWKA 1NLVA 1VQMN 5HOOA 1NJXA 5MLCQ 3TR8A 1KLMA 1XI1A 4FJJA 5AZJA 5AQYA 4DU1A 2QKBA 1RT5A 2P5OA 1E3MA 4JYAK 1EP4A 3OJSA 3KVGA 1SKRA 4BRDA 4DV4K 1U4BA 1G99A 4ILJA 1TUUA 2OYQA 2QKKA 4FXDA 3KIOA 4E1JA 4MDBA 2FBXA 3CJ1A 1YF5L 1OH7A 4JI8K 1U2VB 2HHVA 3L3UA 4B1UB 3L6QA 4FJKA 5LJWA 2P51A 1L5UA 4FZYA 3C94A 3SUOA 4BC2A 4DSIA 4BDZA 4IDHA 1QVFM 3I8DA 4DFMA 3LM9A 2ZJRL 4IEEA 3BGRA 4FJGA 4ID1A 4IFEA 4W5RA 4DS5A 3TAEA 3O08A 3NHGA 4KAZA 2HHTA 1NGAA 4KHYA 4FW2A 4GV3A 1MA9B 3I56N 3P39A 4Z4HA 4M7XA 4BRGA 3V9UA 1U6ZA 4KTWA 2PYJA 3E1YA 3L2RA 4DV6K 3QEPA 3T3FA 2WUSA 1L3TA 3VQQA 2OZSA 5AR0A 4NCAA 1SZ2A 2JLEA 1X1PA 3MECA 4DQSA 4W5QA 2W6KA 1WBBA 3AA3A 3F2KA 3E9OA 3NH1A 1NWKA 3HOTA 4HHTA 3P31A 1VSIA 4R79A 2A40A 4FVMA 3P1GA 3K0SA 3AO3A 4DMNA 3BEXA 4PY5A 4ZTJA 1HR0K 4DQQA 5D3GA 1YI2N 5C15A 3HP9A 4MO5A 1Z26A 2I7PA 4IJAA 2I5JA 3FZKA 3GE1A 3QESA 3DXMA 4B3OA 5CR4A 4JKDA 3SQ0A 2UYTA 4CCHA 4NXNK 1SAZA 3CJAA 5CHIA 3ZETB 4N47A 3HSTB 4BC5A 4KHUA 1REVA 3K57A 1C1CA 1U48A 4FJ7A 1Q86O 3S5TA 4FLYA 3E9PA 1HX1A 4AQYK 3ZT3A 1TUYA 3VERA 1C0FA 2AA4A 5HRSA 1X9MA 3NMUA 1KAYA 4AHCA 3PSIA 3AVGA 5HROA 4KV8A 2ZJQL 3VF6A 1VQ6N 3I55N 2F7TA 2NRRA 2ZE2A 4ISFA 2RN2A 3HZ6A 4W5TA 3J8AA 1EX4A 3ZX3A 3GOIA 3G4SN 2WBNA 2KLAA 2ZGYA 4PWDA 1GLLO 2V51B 5M1QA 2E8AA 3NF8A 5BN9A 4FCYA 3AVNA 3SK3A 4EZ6A 3RSEB 3DWLA 1S72N 3G0ZA 3NBPA 2O8EA 5DK5A 3VQ6A 4W5OA 5FPDA 2KW4A 1BQNA 1YUWA 2YHWA 3VQ4A 3A2FA 4CJ7A 3TABA 3ITHA 1YVNA 4CZFA 3QBWA 3UKRB 4ELVA 1NKBA 3CD6N 3N4QA 3LM2A 5M1KA 4KHPK 3CG7A 4JHDB 4KBOA 3CMEN 5J2QA 4A59A 2E20A 1QHAA 3HPHA 2QXFA 2RPIA 4BVPA 1J6ZA 4WFAL 1Q9YA 4BC4A 3DXKA 1NMDA 4BDYA 4PA1A 1S22A 4JKEA 3FR0A 3WXJA 1NGJA 3VEXA 2P9KA 4FLVA 3QMLA 1JLGA 3ZT2A 1ILYA 5BRFA 4E1MA 3QNOA 5CZ1A 3CCJN 2F8TA 1VSJA 3G10A 3WXKA 2P9LB 4DV5K 1CXQA 1ZBSA 3OYJA 4XH1A 3VESA 1QQCA 3VEOA 5FROA 3K9JA 1DTTA 5DM6L 4A62A 1XC9A 4CZEA 4YOXA 1YTUA 3LPUA 4B08A 1YJ9N 5HRRA 3OS2A 4CJQA 1FKPA 4OKEA 3VQ5A 3MX5A 2C1IA 5T7BA 1YVUA 1NK4A 1ASUA 3CCMN 4BDPA 1C0TA 1NGFA 3WQTA 1JJ2M 1NM1A 5DMRA 2XY5A 4GV6A 2F9TA 3QEVA 4X66K 4CIFA 3MN7A 3TSPA 3L2WA 2IAJA 2YHYA 4F9OA 3KTQA 4IG3A 1X9JA 3KLFA 4DU3A 3M8QA 5DM7L 2BH1A 1ZBLA 3VQBA 1B92A 4LF6K 2D4WA 4K41A 4HTLA 4C8OA 2HHXA 2HHIA 3IDHA 4PKGA 4YOYA 1R59O 3AVMA 3HO1A 4CF9A 2V7YA 2O8FB 4H0TB 3ZSYA 3LDPA 4FLZA 4KTZA 4I2PA 4DSEA 4CJ4A 3OYMA 5I9EB 4K42A 3DLLL 4F2SA 2VGNA 2O8EB 4JI0K 3QFPA 2YNGA 1RDCA 4O5FA 2ITGA 3DM2A 4DUYK 2Q2RA 3MXIA 1U45A 5FLXO 2YJFA 3D2FB 5ADXA 3WUHA 3I33A 4BR7A 4F4KA 3JYTA 4LFCK 4RWTA 5AZIB 1YJNN 2O8CB 1BOTO 3S9HA 4RW8A 3OS0A 4CEQA 4I7FA 4LFAK 4DTRA 5EOYA 1WN7A 3O9QA 3O80A 2NRXA 5AQUA 2YX6A 3L4IA 3B8AX 1KVBA 1RDBA 3HK2A 2JWLA 2YV0X 4FK0A 2HB5A 4JI6K 4BRPA 1FXXA 1C1AA 5KTQA 3VEVA 2QW9A 4WFBL 1S3XA 4CJ3A 2XRIA 1HPZA 2O8DA 3UIQA 5FDLA 1S1TA 3KK2A 1N32K 4O4GA 1ATRA 4Z4FA 4ILGB 4X65K 2GUIA 1RBVA 2UUBK 2OZMA 4H5WA 3HP6A 4FLWA 2OCEA 1RNHA 4DU4A 3VQ8A 4CBXA 2OANA 1VRUA 3TAPA 3HPGA 3JS6A 1VQPN 4DHYA 1JCEA 4CD1A 4EAHD 4CJTA 4E1NA 2P9PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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