1LCUA

Polylysine induces an antiparallel actin dimer that nucleates filament assembly: crystal structure at 3.5 a resolution
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Polylysine induces an antiparallel actin dimer that nucleates filament assembly: crystal structure at 3.5-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 95
structure length 361
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1lcuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1lcuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1lcuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1lcuA04
2P9NB 2NLXA 2IVOA 3ZEUB 1X9JA 4DB3A 3I33A 4FO0A 2P9IA 4BRFA 2UYTA 1HUXA 2HOEA 2QWRA 2F9TA 1NGDA 3KZBA 3MN7A 3CI5A 4HTLA 2ZWHA 2ITMA 4YDUA 5BR9A 5AQSA 3GL1A 5AQQA 4BRLA 2P9UB 3IUCA 1HKGA 4IJNA 2EWSA 4WYBA 5JICA 5KPZA 2D0PA 1ATSA 4EAHD 3DXKA 3TU5A 4BRCA 1K8KA 1WUAA 2GEMA 1MDUB 4FWMA 4BR4A 1YAGA 2YI1A 1EQYA 3BP8A 4DHYA 1LCUA 4M63C 3ZETA 1XUPO 5JMVA 2Q36A 5TKYA 1QZ6A 3MN5A 2GELA 4DQ8A 3BF3A 2Q2RA 3VETA 5AZIA 1TUYA 1ATNA 3EN9A 1DKGD 4HWIA 1NGJA 2FSNA 4AM7A 1NGCA 3FFKB 2D4WA 1IJJA 1HX1A 3GG4A 3MN9A 3QDKA 4IJAA 4AM6A 1GLBG 3CJAA 3EKUA 4O5FA 5BRHA 1NGGA 3VESA 1BA0A 5F1XA 2QWMA 3GDQA 3QMLA 5AQJA 3DXKB 1SZ2A 2A6AA 5BPNA 1ZC6A 1BU6O 3WXJA 1GLAG 3FZKA 4FPBA 3LM2A 5ADXH 3D2FB 4RWTA 3GBTA 2YHXA 5AQUA 1RFQA 1SQKA 3QBWA 3WXIA 3BF1A 4IXCA 3ATVA 1QHAA 3UKUB 2J4RA 3JS6A 3H6EA 4XH1A 2Q1NA 4BQZA 3W0LA 3EL2A 4MO5A 4CI6A 4Y0WA 3MDQA 2CGKA 1TYQB 1GLLO 1HKBA 4FWNA 3W3DA 3TPQA 1HJOA 5AQLA 3VGKA 1OKJA 4CZMA 1JCFA 5FPEA 3WQTA 1KAZA 2VCPA 5AFUA 4CZKA 2P9KB 3WT0A 1BA1A 2E1ZA 5LY3A 1YXQA 4B1WB 3I8BA 1Q18A 1BWFO 3ULEA 3CQXA 3UKUA 5BRDA 5EXWA 2A41A 3FGUA 2Q0UA 5AQOA 3M3ZA 3CJ9A 4K41A 2D0OA 3EKSA 4JD2B 4K42A 4BC5A 2FF6A 4JHDA 2AP1A 1DGKN 1V4SA 1KAYA 4CZIA 1BUPA 1E4FT 3A0IX 3H3OB 4C23A 3LDQA 2A42A 3C0BA 4MLHA 2W41A 4FWRA 4B1ZA 3ZX0A 4JN4A 2KHOA 4CZEA 2I7NA 4CZGA 3WXKA 1DEJA 5AQPA 1QQMA 5BPMA 2A40A 3FZHA 3VEOA 2YHYA 3A5LC 4H03B 4WQ4A 4CZLA 2E2NA 1BO5O 2ZGZA 3B8AX 5BN8A 1JCGA 3CJBA 3QBXA 2CGLA 4K43A 4BGAA 3F9MA 3VPZA 1NLVA 3AAQA 1NGAA 3L6QA 3U8XA 3WEEB 1QZ5A 5FPDA 4H0OA 1C0GA 2E20A 3CIPA 4M7YA 1HPMA 1E4GT 5LJVA 2NRHA 3RSEB 2DPNA 1Z6RA 3O8MA 3O6WA 3U9ZA 5KQ8A 4YDUC 3HM8A 1GLFO 4B1UB 5EX5A 2QWOA 4B1VA 3A8YA 3CJ1A 4IO8A 3U9DA 4L3QA 1P8ZA 2Q0RA 4A62A 1NGBA 4KBOA 3VEWA 1H1VA 1JCEA 1T6CA 2F9WA 2HMPA 2A5XA 3VOVA 5AQTA 3ENHA 2P9SA 5AQKA 3LM9A 3QICA 2VYPA 4XH4A 4H5WA 3SJHA 1NGHA 2NZTA 1XC3A 5AR0A 3H3NO 2QXLA 2GWKA 4GY2B 3GOIA 4BRNA 4CBUA 4FL9A 5EOYA 2BUPA 2P9SB 1U2VA 3LDNA 1XQSC 5AQWA 4H0PA 5BREA 4FOEA 3A5OC 5AQIA 3O1BA 1HKCA 3H45C 3FZMA 1X3NA 3L4IA 3FZLA 3SMSA 1NM1A 2QWNA 1RDWX 3A5NC 3FE1A 3BEXA 3VEVA 3QFUA 2FLOA 2OANA 4IZ9A 1SAZA 3HZ6A 3M1FA 3MN6A 3UE5A 1MWKA 1Z05A 2ASMA 4BRPA 5AZJB 3OHRA 4BC2A 4M7XA 3MK6A 1CZAN 3IDHA 3O08A 4BC4A 3LDOA 4A2AA 4CZHA 2P9LB 3P4IA 2P9PB 1RGIA 3FZFA 3MCPA 2HF3A 4BVPA 2WUSA 2GTDA 5AQVA 4BGBA 2CGJA 5LJWA 5F2RA 2E1YA 2GUPA 3G25A 4FWOA 3ZX2A 4B1XB 4CD3A 4EFHA 4FSVA 4BRHA 5JLHA 3R8EA 3ULEB 3BUZB 4BG8A 4E1JA 5KPRA 1BDGA 3DJCA 4O8KA 1NMDA 4A61A 1WOQA 5EY4A 3M6GA 4MO4A 5KQDA 3L0QA 4QS7A 3CQYA 5ELZA 5AQZA 2QW9A 4CZJA 5B8HA 2CH5A 4BG9A 2FSJA 2YJEA 3ZEUA 2P9NA 3LDPA 1T44A 1K8KB 1YUWA 2FXUA 4JHDB 2CH6A 1J6ZA 3AARA 3A5MC 5BPLA 1GLCG 3MMVA 3D2EB 2IVPA 1MA9B 2YHWA 2H3GX 3IFRA 2E8AA 3VF4A 3EZWA 5AQYA 3WEEA 3WXLA 2QWQA 4IWVA 2ZF5O 2HF4A 3UB5A 4BRIA 3AY9A 5I9EB 4PKHA 2BTFA 3CERA 3C7NA 3H1QA 2D1KA 2QWLA 1QQOA 4WQ4C 1NGEA 3QB0A 4LC9B 4ISGA 3HBTA 3RSEA 1BG3A 5E84A 4QS8A 2QM1A 4CD1A 1IG8A 2ASOA 4BROA 3S41A 5FPNA 5FPMA 4Z94A 2AA4A 4CZFA 4BR0A 3VEZA 3C7NB 1NBWA 2V52B 4H0VB 4GNIA 3VEYA 2P9PA 1MWMA 4XEIA 4FWSA 1T6DA 4B1YB 1LOTB 3D2FA 5CE3A 1NWKA 4RCHA 3KHYA 3DXMA 4NO7A 1KXPA 1KAXA 3EO3A 2VWBA 3VENA 3VGLA 1G99A 1X3MA 3LDLA 4CBXA 2IIRA 3O80A 2YJFA 4K25A 4PKIA 3HSCA 5AQNA 2Q97A 4JNEA 2A3ZA 1GLDG 2GWJA 3J8AA 2W40A 2IVNA 3IMXA 1S22A 4BC3A 2E2PA 2FSKA 3WQUA 1U2VB 3VEXA 4BR2A 4I6MA 5EVZA 3SK3A 4BR7A 5F0XA 1ZBSA 1TYQA 1YVNA 4FWKA 3JXUA 3ZETB 4JD2A 3SLCA 4WQ5A 4BRMA 5AQMA 4J8FA 5BRFA 4PL7A 5BN9A 3ATUA 2P9KA 5AFUH 5ADXA 3LL3A 5AQXA 5E26A 4PL8A 2FF3B 3HTVA 2P9LA 1GLEG 3SMPA 1D4XA 3FR0A 4PKGA 2V51B 1QQNA 4CBWA 2E2OA 3UKRA 4ISEA 4NB4A 4H5RA 3FLCO 3H46O 3DAWA 3CJ7A 2P9IB 3O5BA 4H0YB 2I7PA 2P9UA 2E88A 4FPAA 2V7ZA 4EHTA 3VF6A 3HI0A 3KVGA 4EHUA 2Q31A 3ZX3A 4MLEA 1TUUA 3O1WA 1NGFA 3GE1A 3D7EO 4BR9A 5AQRA 3CJCA 4QS9A 3VGMA 1Y64A 4FOIA 3UKRB 2E2QA 4BRQA 3DXMB 1ATRA 3H1VX 4BRGA 3O4WA 1NGIA 3U4LA 4WQ5C 3DWLA 5KPTA 1BOTO 1C0FA 4I6MB 4BR5A 1U6ZA 3CHWA 4A2BA 3D2EA 2YCHA 3AAPA 3CETA 5AZJA 3ID8A 4H0XB 5AZIB 2PBDA 4H5VA 4H5NA 3QFPA 2ZGYA 4BVOA 4H5TA 5AQHA 4B9QA 2V7YA 3R6MA 3ENOA 5JLFA 1ZXOA 4FWLA 4BRDA 2ASPA 2QWPA 3VF2A 4BRKA 1V4TA 4FWQA 5AQGA 4EIAA 1R59O 4BQLA 4FWPA 4BRAA 4F9OA 4JAXA 3R9PA 3WUHA 4BREA 4H0TB 4ISFA 1GLJO 5AQFA 4RTFD 4XH5A 1S3XA 1ESVA 1HLUA 2PAVA 3VERA 4CJ7A 4DCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I33A 4WFAL 3KKRA 2HNDA 3MN7A 2ZWHA 2ITMA 1Q86O 2G8FA 4NCBA 2O8CA 4LH4A 3SPYA 1WAJA 4IJNA 4F2RA 3PO4A 2HHIA 1IH7A 4FK0A 3VQEA 1BI4A 3QIPA 1ATSA 1NJWA 1WUAA 4FWMA 4Y1DA 1BIUA 3PY8A 4M63C 3LP2A 2B4JA 3ZETA 4CE9A 2Q36A 4OGEA 3NAEA 4AQYK 2O8FB 3BF3A 2Q2RA 3VETA 3SUPA 1HPZA 4LD0A 3OYFA 2BE2A 1U48A 3ZSRA 4FJXA 2GUIA 4AM7A 1NGCA 4IJAA 1S1UA 1IJJA 2D4WA 4B9LA 2O8CB 2GV9A 3MCAB 3EKUA 4KHQA 4FJLA 1BA0A 5F1XA 2QWMA 4DR3K 5AQJA 4BDPA 4CF8A 2BH1A 3AVNA 3WXJA 3LM2A 1NNEA 3GBTA 3LWLA 1NK4A 4DFKA 1NG9A 3UKUB 4AF1A 4CF9A 5GAHP 2Q1NA 4DR6K 3CC7N 3N4PA 3EL2A 2A1RA 4MO5A 1OVQA 3MDQA 2CGKA 3AA5X 3CFPA 2G8IA 4HUFA 1GLLO 3S3NA 3W3DA 3TPQA 1EWQA 4M42A 3I0RA 1N36K 3MWTA 5I42A 1OKJA 3NFAA 1JCFA 1NOYA 1VK0A 1KAZA 3WQTA 2X6SA 4CZKA 2ZJPL 1X9MA 4YFUA 1BA1A 4DFMA 5LY3A 4FZZA 2RPIA 4PUOA 1UA1A 1KTQA 3IKMA 3RMCA 3UIQA 3KJVA 1QE1A 2D0OA 4JD2B 1FJGK 4O5BA 4JHDA 5E41A 2DFHA 1B92A 2YNFA 3TSPA 1BUPA 1JLQA 5KI6A 3DRSA 4LF8K 2RE2A 3V1QA 4FJ7A 3C0BA 2W41A 4FWRA 1T3VA 4AHTA 3CCEN 2KHOA 2I7NA 4CZGA 4GKKK 3T69A 3F2KA 3KLFA 3TAPA 1TAUA 2O4IA 1NJYA 1KVBA 2YHYA 3RVCA 3A5LC 4WQ4A 4FM0A 3PIOL 2ZGZA 4E7LA 1JCGA 4DV1K 3VPZA 2KQ2A 1NGAA 3RR7A 3U8XA 3OYLA 3WEEB 3AV9A 4FLXA 3BGRA 2E20A 2HHHK 3PO5A 1RT6A 4U67L 2NRWA 1Z6RA 5DMRA 3U9ZA 4YDUC 4K0KK 3NF6A 4B1VA 2C1GA 1SL1A 1P8ZA 3LAMA 4KHWA 2E6LA 2HMPA 4O8UA 1YT3A 2P9SA 4CGDA 3PX4A 2YHAA 4H5WA 1NGHA 1Q82O 1XC3A 3AO1A 4CJTA 2QXLA 4CHYA 1Q9XA 2PYLA 1IKXA 1G15A 1NK5A 4TSXA 3KTQA 3DOLA 3VQBA 2P9SB 1W9HA 5HBMA 4KB1A 4X65K 1ZBIA 4CECA 1EKEA 4H0PA 4MQ3A 5HRPA 3ZSZA 3AVCA 4KH4A 4DTPA 2I5JA 1X3NA 2G8KA 4CVNE 3ZSXA 3BEXA 3DMJA 1SAZA 2QI2A 4OPKA 4UY8O 1MWKA 2ASMA 3THXB 2OA8A 3MK6A 3LDOA 4A2AA 4CZHA 1QQCA 2P9LB 2P9PB 1RGIA 1Y97A 3VQ7A 4BE7B 4WCEL 3VTHA 3MXIA 4PA1A 4OPAA 1VQ4N 4BRHA 4DSIA 4B9UA 1BDGA 3CPWM 1NMDA 4MO4A 3ZSYA 4OKKA 5KQDA 3K59A 3L0QA 3DM2A 2FC0A 1XMQK 4B3TK 1CZ9A 2QXFA 2CH5A 4BG9A 1RTJA 2NNWA 2YJEA 2QEXN 4KPYA 3CC4N 2XY5A 5M1KA 3A5MC 4CEZA 3D2EB 2IVPA 1Z25A 1J53A 2FBXA 4NYFA 2H3GX 3SZ2A 4WF9L 2X6NA 4HCBA 2QWQA 5KGWA 2ZF5O 1UWBA 4CHQA 1RT2A 2OTLN 4Z4EA 4BEBA 4PKHA 2BTFA 3CERA 3V9ZA 2O8BA 1QQOA 1NGEA 3HPGA 3QB0A 5JS2A 3J7ZO 4IO9L 3BDPA 4LC9B 1S5JA 4JKBA 3HBTA 3RSEA 1IKYA 1XHZA 4KKOA 5K14A 1ASVA 2P1JA 4LF5K 5C42A 4DU3A 4E3SA 4CZFA 4QAGA 4H0VB 4GNIA 1NJZA 3C94A 4A59A 4DR2K 1NWKA 1KXPA 4ID5A 3EO3A 2VWBA 1G99A 1KSPA 3O4NA 3LPTA 2G8WA 3DLKA 4CBXA 2YJFA 1WBBA 4K25A 1WSJA 3SAFA 4CFDA 4CEDA 3VQ4A 4YORA 2GWJA 4NXMK 3TI0A 2IVNA 4FJMA 1S22A 2HBKA 3HO1A 1JL1A 4CJUA 4BR7A 5F0XA 2UXCK 1L3TA 3SUOA 1TYQA 4CEQA 1U04A 1YVNA 3AO2A 4FWKA 3ZETB 4FZXC 5CYQA 1VHXA 3M8PA 3V4IA 1HYVA 2VG5A 4KAZA 4DV4K 3RMAA 4LSNA 1T7PA 5AFUH 5M1FA 3HOSA 4DS4A 1BHLA 1GOAA 2P9LA 2ZJRL 3LDSA 4GV6A 4CEAA 3AO3A 1DT9A 1NK8A 1K73O 3DLEA 4U7BA 4PKGA 2V51B 4K8XA 4CIFA 3H46O 3CJ7A 1W97L 4MDAA 4KHUA 1RDBA 3C95A 3KVGA 2Q31A 3ZX3A 4MLEA 3DYAA 3N4QA 3V9UA 3SBTA 3D7EO 4FK4A 2E2QA 2ZE2A 4BRQA 4CGHA 1S72N 1ATRA 1NGIA 3ZSWA 2ITGA 2HHXA 4I6MB 1U6ZA 3VQDA 2HNZA 3MWPA 1JLAA 4CJ3A 4JI4K 3J7AP 2YNHA 3U6FA 3V9WA 4NLBA 1O13A 2F96A 1DTTA 4H0XB 1Q7YO 5AZIB 3IRXA 4EP4A 1JXBA 1REVA 5GAGP 4CERA 4IOAL 4CHOA 4CF0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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