1LFGA

Structure of diferric human lactoferrin
Total Genus 220
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
220
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSAQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPASNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of human diferric lactoferrin refined at 2.2 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferrin
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 220
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA03
2Q2CA 3H3GA 3IOWA 1N84A 2QRYA 2M8CA 3HCQA 3O2AA 1MDP1 3PPNA 1FQBA 4IO4A 3SEYA 3TTLA 5I2NA 2F7AA 1B7HA 4P0GA 3CFXA 4ZEDA 4R2BA 3FZVA 3C9HA 4F2QA 1N7XA 4KPTA 3PUXE 4POXA 3TODA 3BFTA 4C1UA 5H8HB 5CI5A 1HSEA 2DVZA 4OVJA 1FW0A 3CVGA 5TPAA 3TTKA 1USYE 4ZEBA 3Q28A 2VP1A 1MQHA 1XOCA 2H99A 2NUVA 2QS4A 1Y1MA 4KD5A 1XVXA 3QYTA 1JVYA 1TFDA 2DSFA 1JQFA 3K1MA 3V89B 5KCJA 4R6KA 1OMPA 5ELVA 4IO5A 4R74A 2I6EA 2O1MA 2RC7A 4RPOA 5AA2B 1TWYA 2Q88A 4G68A 5I59A 5HM4B 2YPNA 4Z0IA 4XXUA 4BDQA 3KJ7A 4GXAA 4XKRA 3Q25A 1I6BA 5I84A 2UVIA 1LGBC 4QRZA 1PEBA 3IOTA 1ATGA 3VDFA 5AA3A 1Q35A 4F19A 2DWHA 2DE3A 3OO9A 4H8IA 1A54A 3KJTA 3N6UA 4NF5B 4R6HA 4THIA 3TTMA 5AE4A 3ZKLA 5JK4A 4NWCA 1BIYA 4LQ2A 1P1UA 3U8QA 1ZJLA 5DT6A 3U72A 4C1TA 4YMAA 1OQHA 5H8HA 3TAJA 1QKAA 4I1DA 3IK6B 2QS1A 3IAZA 4HTGA 3V8XB 4IO2A 1Y1ZA 1Y4TA 2I0BA 3EHUA 3GXAA 3MUQA 4UACA 5K2YA 2PX1A 2A5SA 2QJEA 1M5FA 3EHSA 3A3CA 3MAMA 3C31A 4ONYA 1ZIUA 3E9XA 4JSOA 3C4MA 4OHNA 5I58B 5JTYA 3T96B 1IIWA 3EQ1A 2PVUA 1B3EA 1JNFA 3OEKA 2G93A 2OLBA 3MPKA 1IXGA 4G77A 2H5YA 1DMBA 2ONSA 2QL3A 1POY1 3MVZA 3SERA 4ELRA 1AOVA 2PYYA 4F3BA 3LSWA 2R9JA 3LBSA 4AQ4A 3PD9A 3PMVA 4ZECA 2HAUA 1NNKA 4RJZA 1FTOA 2ZYMA 5J1DA 1M5CA 1JW5A 1S9TA 3G3KA 3IJOB 3FVGA 2YLNA 3KN7A 2F6GA 4G8MA 4F3PA 1N3WA 1ZU0A 1AIVA 3S9EA 4HCWA 1H76A 3PPQA 1Z7ME 1FQDA 4P11A 2WKYA 4Q8RA 5FHOA 1HSLA 4WXJA 1B3HA 1B51A 3K1PA 3FJGA 3G3HA 2UVGA 3CR9A 4G2ZA 1UIVA 2ZYKA 3FVKA 4ZEFA 3OO6A 3MP1A 4IGTA 5L9SA 2RINA 1I6AA 4ISUA 4F1UA 1VFEA 4F18A 4OTEA 3IORA 3IOVA 3VLUA 1DTGA 2O1LA 3O97A 3GBAA 3MVXA 1MY4A 3THIA 4E0WA 1PDAA 4L17A 4OFOA 1UIUA 2Y7IA 4GFRA 3OOAA 5DEXA 4YB6A 1M5EA 2REGA 5JEIA 1B2HA 4ZZAA 3FJ7A 4P0IA 3N5LA 4ZE9A 5KDTA 1N04A 1MY0A 3IL1B 3Q27A 1BKAA 3MQ9A 4F3SA 1QJMA 2AL5A 4RNSA 1B7ZA 1QUKA 2GH9A 2XX8A 4O3CA 4ZZEA 4BLAA 4F3GA 2FNCA 1LB8A 2OCUA 5DTBA 3TTNA 2I48A 3UA8A 3TELA 3K0VA 1LFHA 1B0LA 3FD3A 1MQJA 1B46A 3FASA 1UTHB 4DCYA 1D9YA 5A5XA 1VFDA 1LLSA 2F6PA 3A3UA 2R6GE 3I5OA 5IKBA 2I3VA 3TYHA 3OELA 1MH3A 2VGQA 1POTA 2X7PA 2FYIA 4OEVA 4GXSB 5TU0A 3PV0E 4R9FA 1IEJA 1YCJA 3H6VA 1LCFA 2B3BA 4KQPA 3VVDA 4DLDA 5L9OA 1SI1A 2OZZA 1TXFA 2O84X 1OVTA 5FHMA 2GHAA 1DPEA 3SEXA 4ELQA 5K2XA 4H8JA 3N6TA 4JXIA 2F35A 4XKNA 5I57A 4PFUA 3S9MC 3O66A 1B0HA 2PT1A 3B6QA 2RCAA 3TMGA 2XXIA 1MXWA 3KOTA 4U1OA 1MPBA 3OD7A 4BDMA 4ZE8A 1EH3A 1MPCA 1FQEA 4LA9A 4LP2B 5ICTA 1UTHA 4G4PA 4AB5A 4LONB 4KHZE 3CSGA 4DZ1A 3EF7A 5TP9B 4ZDMA 3CG3A 1Y20A 3G3JA 3IB1A 1PB7A 1LBCA 2V3QA 2ONRA 3C35A 3FV2A 5FTHA 3PD8A 3FUZA 4WEDA 2IA4A 5HBCA 5DYHA 5EHSA 3K2DA 1RYXA 2H25A 3ZS6A 3F11A 4IGRA 1EZOA 4KCCA 3RPWA 1JVXA 3OEMA 4U2RA 1B3FA 3G3GA 4OESA 1NH8A 2DE2A 2XXHA 4XKQA 4H67A 3K6VA 3UGWA 3VFJA 4BDNA 3RTFB 3C36A 4EQ9A 2F7CA 1EU8A 5I57B 1OLAA 1UTBA 2E1SA 2D5WA 3R6UA 4RK2A 1SW1A 4H5FA 3PUYE 3H7MA 2IEEA 4U1ZA 3R7XA 1RKMA 3K6XA 1A8EA 3D4CA 2Z8DA 3RGYA 3OSRA 1Q1KA 3O9PA 1NMUA 3Q29A 4N6PA 1A55A 5CM6A 2NOOA 3AXFA 4KCDA 4QSEA 4GVOA 4OENA 1N76A 2HCAA 4OERA 3H06B 5H8NA 3TKDA 3VXBA 5CMKA 1FQFA 1MM6A 3UK4A 5KZTA 2GRVA 2Y7PA 1A8FA 2GFEA 4U4XA 2XXPA 1FQAA 1IXHA 3FXUA 5CMMA 5LOMA 3G7WA 4EXLA 3PMXA 4DDDA 4O3AA 2UYEA 5CBSA 2F97A 3VLWA 5BWJA 1B5JA 3CI8A 3PGFA 4F22A 4KYEA 1URGA 3ODBA 4FIMA 4H6DA 1GTKA 3MZBA 4FATA 1O64A 1CE2A 1F9BA 1SW5A 2DWAA 1XT8A 1WVJA 2HQ0A 2W7YA 1UTBB 1Z7NE 1Y3PA 3MZ1A 4OFJA 2FA7A 3T9XB 3OENA 1SYIA 1HSJA 2Q8JA 1JW1A 2VHAA 4GL0A 3HHFA 5AA2A 2REJA 1ANFA 2RKMA 3HO7A 2ZMBA 1ZLQA 3HV1A 4LZ7A 3DP8A 5B7DA 5I59B 2E0SA 1NNTA 5I56B 1SD3A 3TPAA 5I2KA 4PFTA 3T9UA 3PUZE 2F78A 4OQOA 5TPAB 3W15C 4YKIA 2AIXA 1M5DA 2O68A 1B3GA 3PU5A 3DELB 4OFLA 4LVQA 4F31B 3OXNA 3TDJA 2H9BA 1LAFE 4NF8B 4QFLA 3GBBA 1H45A 4JB7A 3SESA 3FATA 3T22A 3KZGA 4M1VA 3SEWA 4EDPA 5CRYA 4BDRA 2P2AA 3K00A 2Q9TA 3CRBA 1AH5A 1II5A 1NL5A 2F5XA 1FTLA 2Z22A 3VLVA 1N3XA 3KGCA 5H8QA 1R9LA 4OEUA 1QW0A 5H8FB 4BDOA 3IO6A 4ESXA 1A99A 1FQCA 2Y7WA 2BJJX 4FECA 3U92A 3FV1A 3H6WA 4ZS9A 1D9VA 5H8NB 1MM7A 2HZKA 3HN0A 2ZYNA 1O63A 4QHQA 3S9NC 1BLFA 2I3WA 1PB9A 2CMOA 1MS7A 3A09A 3EHTA 4LUBA 2YJPA 1URSA 1B9JA 2X26A 4NF4A 3U94A 1MRPA 1VE4A 3IB2A 4YB7A 3QUJA 1MDQA 1D4NA 1LAHE 1Y9UA 4FJPA 3KEIA 1VSOA 4GWOA 4H5GA 4PP0A 3B6TA 3VVEA 1O7TA 4MLQA 3TTRA 2P0SA 5CBRA 1MH4A 1XC1A 1USYH 1QUIA 2DYXA 1DSNA 4IY5A 3FVNA 4EF1A 3C32A 3MC2A 4FE8A 3PUWE 1QKBA 5DVIA 4U22A 3UIFA 1IQ7A 3MPLA 4G68C 5DVJA 3USDA 3FVOA 3OSQA 4O3BA 2UVHA 4ZEKA 3QXMA 1FTKA 4HCYA 1B5IA 3KN3A 3HSTA 3RNNA 4YKKA 1J1NA 3K1NA 5I56A 2PBWA 4YAHX 4PE5B 5H8SA 2ZYOA 4EQBA 1B32A 5B70A 1B05A 5I2KB 4HS7A 4NEDA 4QSDA 5AA1A 3IX1A 3LSXA 3JV9A 3ZSFA 2XX9A 2XXVA 3K6WA 2RF1A 4E0XA 3TCGA 1I6QA 3SKPA 2X7QA 3K02A 1JEVA 4H65A 3H03A 1UQWA 1JW4A 1M5BA 1OLCA 3N26A 1EZ9A 2XD3A 3UORA 1OVBA 3E13X 4MFIA 2HZLA 3MJNA 1QULA 2QSXA 4NWDA 2OK2A 2DWJA 1QUJA 1IXIA 5H8QB 4NTLA 2DXYA 4DCXA 4OYVA 4TOZA 1S7YA 4H1XA 1B4HA 3E3KA 1MXUA 1A40A 2Y7RA 4FORA 3UP9A 1P1NA 2ANJA 3W9WA 1MQIA 3KSXA 5I2NB 2ZNSA 1LFGA 2OJTA 2ESNA 5M2VA 4QFKA 1B58A 3H6UA 2DP8A 2ABHA 4F29A 3C34A 3KG2A 3ONMA 4K3FA 5CMBA 4DXUA 1SW4A 2V93A 2O51A 2XXXA 1Y3NA 3LC8A 2I58A 4LQ5A 3TQWA 4FAJA 3FJMA 2PT2A 3O6GA 4Q30B 1FCKA 3VE1B 3I6VA 1US5A 3O6HA 4R73A 4X48A 3MBPA 2UYFA 3FXQA 4R75A 1LAGE 4I8CA 4LATA 4QFOA 4C0RA 2Z23A 2P1SA 1SYHA 3M8UA 3VV5A 4ELPA 4GF8A 2QPQA 2NWJA 4WEPA 5KCJB 1YPNA 3DLNA 3KBRA 1ZTYA 1GV8A 4YMBA 1H43A 4YKPA 3JZJA 3KFMA 2O7IA 1MG1A 4DXBA 3CG1A 2DWIA 1PBQA 3OO8A 4GIZA 4Q0CA 5EHMA 4G68B 3QUFA 2O69A 4NE4A 1XHYA 2XX7A 1MQDA 4OMBA 2F8DA 4POWA 4YZZA 3S2VA 4LZ5A 4RPNA 3SEUA 4EXKA 4NF6A 4PFYA 1MPDA 3Q26A 4RYAA 5I58A 2Q89A 5ITPA 2I0CA 1SDXA 3FGSA 1LCTA 2R71A 3BBRA 1GVCA 3T9VA 1QVSA 2QS3A 5TP9A 3BFUA 3RLFE 1NH7A 3SEVA 4NF5A 2DS9A 1B6HA 4IO7A 3MZ9A 4OZ9A 4R72A 4PFWA 1XS5A 2F34A 1MY2A 4BDLA 2HFBA 1AMFA 2AYSA 2O7UA 3I3VA 3RT6B 1VR5A 1MXVA 5ITOA 3ILUB 2A5TB 3PUVE 4YICA 1SI0A 4F1YA 1IZ1A 1B3LA 2THIA 1AL3A 4EUOA 3KOSA 2LAOA 1CB6A 2ALUA 4ECFA 4U4SA 4IO6A 2O6AA 5JTYB 1JETA 2OWSA 3ZKKA 4M4GA 3QSLA 1SW2A 2I49A 2RC8A 2XXWA 4EF2A 5ICQA 3R26A 1LB9A 1RYOA 2DVCA 2V3TA 2XXRA 2I4BA 1H44A 3K01A 5AA4A 3MVYA 2QMXA 2VD3A 3DM0A 2ZNUA 3GLBA 4JDFA 2Z8EA 4F1VA 3TUSA 2HEUA 3ECRA 4R9GA 4G8HA 3RQTA 5IAIA 2DXRA 1P1OA 4QF9A 3GZGA 2HAVA 3CIJA 3RN8A 1R6ZA 1SVXB 2H4IA 4MF3A 4R6YA 4GQOA 1DTZA 1SQYA 4U21A 3ILTB 1OQGA 3M3KA 4OETA 3WAEA 1TT1A 1DOTA 1ZMGA 4GRKA 4I9DA 5HPQA 1DPPA 1MXYA 4ZEIA 1TFAA 5CMCA 3H6TA 3O28A 3TZAA 1LFIA 1GGGA 4FEBA 2H98A 3S9LC 3RUMA 1B40A 1GR2A 4KR5A 4FEDA 4DXCA 4QFNA 3FXRA 3L6HA 4RY1A 4NF6B 3G3FA 5F7VA 3TQLA 2D21A 3P7IA 2XD2A 3FIRA 3LSFB 2ONKE 4MBPA 4GD5A 4X9TA 3MW0A 3CSBA 3T66A 1B1HA 3B6WA 4G8NA 4PETA 5L8DA 4IB2A 3T93B 1IUDA 1P99A 1P1WA 2DE4A 3TCFA 4JBZA 5CC2A 4EQ7A 1ZKBA 5DEXB 4KFQA 4R2FA 5AA4B 1URDA 2QMWA 1Y3QA 1IXCA 3SDFA 1NNPA 4Z7EA 2V25A 4QFPA 4GLIA 3MP8A 2Z8FA 1XVYA 2RC9A 5F1QA 1SBPA 1YTVA 4JWYA 1IITA 1FTJA 4DIGA 1D3KA 4ESWA 2A5TA 2QS2A 4WKMA 3B7DA 3PPOA 2I4CA 1Y4CA 2ZNTA 5ISUA 3KSJA 1H3DA 1MQGA 3PMWA 5BUUA 2DOJA 3UN6A 4MH5A 1OIBA 4NF8A 3LR1A 1NKXA 4OXVA 1A7LA 2CZLA 4I62A 5A5XB 1R1NA 1MY3A 5DVFA 4RA1A 4OWDA 4TQUQ 1B52A 2XHDA 3IOUA 5FTIA 1B4ZA 3U1OA 3TEPA 4RK9A 1PB8A 2VD2A 3SETA 2XXTA 4TLLB 3IR1A 3PPPA 4N13A 2Q2AA 4IO3A 1PBPA 3M3LA 4YKJA 1L5TA 4U23A 1KWHA 1US4A 2G29A 3QAXA 4F39A 2Y84A 2PMSA 3KN8A 4RXLA 1LSTA 2B3FA 2F7BA 3N94A 1N7WA 3O29A 4XKPA 3RY3A 1MXZA 3HPIA 3OO7A 2D3IA 2XXUA 3K6UA 3RTWB 5KDTB 4YB5A 1S50A 1P1QA 4NF4B 1FTMA 3TCHA 1EZPA 2B65A 3CFLA 3IO4A 3H4ZA 1B1XA 4DE8A 2ZXTA 3LSLA 4JWOA 3W9VA 4YU0A 4ELOA 3M3FA 2OWTA 4X1DA 4X1BA 1LAXA 3V83A 3MP6A 4ND9A 2XXQA 4HW8A 2KLFA 4GL8A 3HHGA 3K4UA 3RT8A 1WDNA 5H8FA 4KI0E 2VOZA 3MWBA 3BKIB 4AB6A 2DQVA 4IY6A 4JSDA 3LUYA 1PC3A 4TLMB 4XIGQ 2V84A 1NFTA 5FHNA 2AL4A 5AA2D 1T0KA 4PQJA 1BP5A 1LBBA 4QSCA 2NVUB 2HXWA 2UVJA 1NNFA 4LZ8A 1BTJA 3L6GA 4NMYA 1JEUA 5L9MA 3D4GA 1R9QA 3V5AA 4F2OA 4JWXA 3S4UA 3O6IA 2NXOA 3WAFA 4XTCQ 2F36A 1N0TA 4UA8A 4KYDA 4KYSA 3MVWA 4GOTA 1ELJA 1I69A 2XXYA 4H0WA 3QK6A 4Q5TA 3G3IA 5EYFA 3IJXB 3U93A 1ZBMA 3OMBA 4MLVA 1MXXA 1YAEA 3EN3A 1MY1A 3VVFA 3DP6A 3PPRA 2V3UA 2Y7KA 3JYRA 3TFLA 2OBGA 4N07A 1WODA 2GHBA 3VXCA 3EPEA 3C33A 3CFZA 3E4RA 3T9HB 1B7UA 2RCBA 3QIMA 1B5HA 3IB0A 2UXAA 3DP4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IOWA 3O2AA 4R2BA 4F2QA 1N7XA 4KPTA 3PUXE 4POXA 3BFTA 4ZEBA 4NG7A 3Q28A 2QS4A 1Y1MA 1JVYA 1LBYA 1OMPA 4IO5A 5HM4B 4XXUA 4BDQA 5I7IA 4XKRA 3TTKA 2DE3A 3U65A 3ZKLA 4NWCA 4LQ2A 1ZJLA 5DT6A 4YMAA 4I1DA 3V8XB 3IAZA 1Y1ZA 3MUQA 4UACA 4ONYA 4JSOA 4UABA 1KZ8A 1DMBA 1POY1 4F3BA 3LSWA 4O94A 1FTOA 5J1DA 3FVGA 2F6GA 1ZU0A 4Q8RA 1B3HA 3K1PA 2ZYKA 4ZEFA 3MP1A 2Y5KA 1VFEA 4F1UA 3IOVA 3VLUA 3MVXA 4E0WA 1PDAA 4L17A 2PCRA 2REGA 4FBPA 3FJ7A 4P0IA 3N5LA 4ZE9A 3Q27A 1B7ZA 1CNQA 4ZZEA 2XX8A 2CEXA 4F3GA 2OCUA 1LB8A 2I48A 3FD3A 4DCYA 5A5XA 2F3DA 3TYHA 3OELA 1MH3A 4R9FA 1YCJA 5IGAA 3SEXA 5K2XA 4O7IA 4PFUA 1B0HA 2KQZA 3TMGA 3KBZA 1MXWA 1FQEA 4LA9A 4LP2B 5IZ3B 1LBWA 3E78A 4ZDMA 2V3QA 3C35A 4N8YA 3FUZA 5EHSA 2FIXA 1EZOA 4KCCA 3OEMA 2DE2A 3VFJA 2XXHA 4PAFA 3RTFB 3C36A 3MYUA 1UTBA 2CZHA 4H5FA 3PUYE 1RKMA 2NOOA 4KCDA 4GVOA 4OENA 4OERA 5H8NA 5CMKA 1MM6A 2GRVA 1A8FA 2GFEA 4U4XA 3FXUA 2UYEA 2F97A 1INPA 2R8TA 2HQ0A 1WVJA 3RYDA 3OENA 2Q8JA 1FPIA 3HHFA 5AA2A 3HO7A 4HE2A 5I2KA 3W15C 4YKIA 3DELB 4F31B 3HFUA 3OXNA 3TDJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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