1LFGA

Structure of diferric human lactoferrin
Total Genus 220
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
220
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSAQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPASNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of human diferric lactoferrin refined at 2.2 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Transferrin
source organism Homo sapiens
total genus 220
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA03
4OTEA 3VFJA 4DDDA 2F36A 2CZLA 3FVNA 4U21A 2DE2A 1PBQA 2Q88A 2OWSA 3TUSA 3VXBA 3RNNA 4F31B 4QFKA 4F3BA 2G93A 4NF8B 4DXCA 3C33A 1UIVA 4F1VA 1MY1A 5I57A 3SEVA 1B6HA 3KSJA 4QSCA 2DE3A 3V5AA 1Y3NA 2ZYKA 4NWCA 1FQFA 3CSBA 1P1WA 1ZTYA 3OSQA 1URDA 2BJJX 3PPQA 4H67A 4JSDA 4KCDA 5H8SA 4G8HA 3IO4A 1HSEA 4PFTA 3CR9A 3OXNA 3O9PA 1GR2A 3CI8A 4PE5B 1L5TA 5I59A 5J1DA 4EXKA 1XHYA 3TPAA 1OQGA 2I6EA 2G29A 2O6AA 2O69A 1JEUA 2OCUA 1LAHE 2PT1A 3KOSA 1A55A 4JBZA 3PPNA 3A3UA 3T9UA 2P0SA 5H8QA 2VD2A 2F7AA 2ZNUA 5F7VA 4Q0CA 2OJTA 5H8FB 2WKYA 2DWHA 3O6IA 1XVXA 2PYYA 2Y7RA 1OLAA 4F1YA 4POWA 4F18A 1IEJA 5JK4A 1DTZA 4EF1A 2H25A 2HZKA 3K1MA 4OERA 3SESA 4NF5B 3PUZE 1DOTA 3ZKKA 4OVJA 5ICTA 3M3FA 1B9JA 1MY2A 4R2BA 1B32A 4H8IA 2THIA 3ODBA 5I57B 4RY1A 1MQIA 4HCWA 4H65A 5CMKA 5LOMA 4KQPA 5KZTA 4NMYA 3K1PA 2HFBA 4R9FA 1B1XA 1B1HA 3LC8A 2O7IA 2X26A 5CM6A 3K01A 4WEDA 3G3FA 4ZE9A 3T9XB 4Q30B 5H8NA 3TTRA 1IUDA 4ZE8A 1WDNA 4GXAA 1I69A 3VV5A 2XXIA 3ILTB 3DP6A 3ECRA 1LBBA 2I0CA 3MQ9A 1US4A 3JZJA 4I9DA 1AMFA 3SEXA 3CG3A 3LSLA 1ATGA 3I3VA 2R6GE 5H8QB 4OQOA 3U93A 4NF4A 1USYH 1B46A 2D3IA 1MDP1 2PMSA 2ZYMA 4OEVA 3S9MC 3ILUB 2DQVA 3U8QA 4HS7A 4KCCA 1A8EA 3TFLA 3QYTA 1BLFA 4WKMA 2DOJA 2A5SA 4C1UA 2VGQA 3HSTA 2I49A 4QHQA 1M5EA 4IGRA 4R6KA 2F34A 2O1LA 2NVUB 3IB1A 1YAEA 3K4UA 3IR1A 3I6VA 4GF8A 1R1NA 3MZ9A 4JSOA 3VDFA 4THIA 1WVJA 3UORA 5IKBA 3FXQA 2OK2A 3V8XB 1B7UA 1QUJA 2CMOA 3PPPA 5L8DA 4BDNA 3MC2A 4ZEFA 3TAJA 5H8NB 3W9VA 2RINA 1IIWA 5A5XA 3R6UA 2DP8A 2Q8JA 4OZ9A 4FORA 1GV8A 2PBWA 5ITPA 4LZ7A 3H06B 3PMVA 4EQBA 5AA3A 3MPLA 1BIYA 1Y4TA 4QF9A 2QL3A 4NF4B 4QRZA 3K6VA 3I5OA 1ZBMA 5EHSA 3E3KA 2QS1A 3KZGA 1MH4A 4Z0IA 4YKKA 4F2QA 3B7DA 3MJNA 4BDQA 4NEDA 1BKAA 3PV0E 3RN8A 4FEBA 4NTLA 3T9HB 4AQ4A 5DTBA 3G3GA 1Y4CA 5FTIA 3VVFA 3TYHA 1PEBA 4F3SA 1ELJA 4RK2A 3IK6B 1I6AA 1GTKA 1XS5A 3IOUA 3S4UA 3FJGA 1N04A 5AA4B 3FGSA 4ZEDA 3HV1A 3C31A 4ELQA 3QIMA 4OYVA 1B4HA 4Q5TA 3QAXA 3OO8A 3K2DA 2RC9A 2UVGA 5BUUA 4R73A 5B70A 4C0RA 1Y3QA 3OENA 2ZMBA 1XC1A 2RCAA 1PBPA 1B3EA 2XXXA 1Y3PA 3U1OA 3QUFA 2RCBA 3TTLA 3BFUA 5A5XB 3EHUA 3G3JA 1SYIA 4ELOA 3S9EA 1CE2A 1MY4A 3TQLA 3KN7A 4POXA 1MDQA 1P1QA 3B6WA 5AA1A 4OMBA 3P7IA 3FVKA 3SEYA 5ITOA 2Y7IA 1IXIA 1ZU0A 3SKPA 1BP5A 5B7DA 1BTJA 3MAMA 5I84A 3PD8A 1B3GA 3RTFB 2F7BA 2O51A 3T9VA 1NL5A 5L9OA 1UTHA 3SERA 4YB7A 1Y9UA 1FTKA 1A8FA 3FD3A 3T22A 4EXLA 1T0KA 2ANJA 1NH7A 1NH8A 1P1OA 5AA2D 1B4ZA 3H6UA 3KEIA 1IZ1A 4LQ5A 2QMWA 4TQUQ 5KDTA 1N7XA 1MQDA 4RPOA 1DPPA 3LSFB 1LB8A 4LQ2A 3OO9A 1EZ9A 3PPOA 4EUOA 4DIGA 3E9XA 4RYAA 3FUZA 1TFDA 3C36A 1B40A 3C9HA 4G8MA 4R6YA 4OETA 2QS4A 1LFHA 4IO2A 1B0HA 3MVWA 4YZZA 4GL0A 1ZKBA 4MF3A 4G68C 5H8HA 4GRKA 3PPRA 1WODA 2RKMA 5TPAA 3OO7A 2FNCA 2XXTA 3UK4A 2XXVA 3Q29A 2Y7WA 4H6DA 2YLNA 4M1VA 2ZXTA 3L6GA 4OHNA 1TT1A 3O66A 5CMCA 2I4CA 4QFOA 2F35A 3PUYE 3C32A 5DVFA 4H5GA 4QFNA 1IQ7A 1NKXA 3EPEA 1S9TA 1B7ZA 1OVBA 1UTHB 3R26A 1SW2A 1FQCA 3IO6A 2ZNTA 4AB6A 4JWYA 1MQHA 3KN8A 4OXVA 1I6BA 1PB8A 4N6PA 3OEMA 2I3VA 1QUIA 4YICA 1FCKA 1B7HA 1NNKA 1Y20A 1LSTA 3IJXB 4YMBA 3QXMA 2YJPA 2W7YA 5KDTB 1P1UA 3KN3A 3K1NA 1IITA 2QRYA 4R6HA 3MZ1A 3PD9A 1FTJA 4JWOA 3MZBA 2UYFA 2V3QA 4R75A 3T93B 3ZKLA 5FHOA 3O2AA 4BDRA 2ZNSA 3LR1A 1SW5A 2B3BA 1SDXA 3TCGA 4F3GA 3TQWA 3O29A 4IB2A 3SEUA 5H8HB 2GFEA 1B5IA 2XX9A 3PUXE 5TPAB 1EU8A 1H76A 3IJOB 1D9VA 1MXXA 1H44A 1QKAA 3TKDA 1EZOA 5DT6A 1TXFA 4U22A 1RYOA 1PC3A 4KR5A 3B6TA 4XIGQ 3HCQA 4FAJA 3LUYA 3U72A 3CVGA 1H45A 5JTYA 3DM0A 1FW0A 1N3XA 5EYFA 4U1OA 3E4RA 1B5HA 3VLWA 1R9LA 2REJA 4GL8A 4ECFA 3RQTA 3USDA 2VD3A 4FATA 3K6XA 3WAEA 2UXAA 4UA8A 3H4ZA 3K02A 4IO6A 2H99A 1D9YA 1PB7A 4YB5A 2F8DA 5TU0A 2UYEA 3M3KA 1JVXA 1I6QA 3OSRA 5DVJA 2V84A 4E0WA 4YKJA 3TTKA 2V93A 3TZAA 4IO4A 5HM4B 1FTLA 3MP1A 4FECA 5I59B 3A09A 5HBCA 4G2ZA 1ZMGA 2DWJA 3LBSA 5CMMA 5BWJA 4LP2B 1B0LA 2NXOA 4GOTA 5AE4A 3U92A 3RLFE 1KWHA 5FHMA 4F19A 3GBBA 1MXZA 3MP6A 4GLIA 1OQHA 4KD5A 2RC8A 2XXYA 2H98A 3KOTA 4KPTA 4JWXA 5JTYB 1B3HA 1MY3A 3IORA 1OIBA 1Y1ZA 2GHBA 3EF7A 4X9TA 3TELA 4H1XA 3KJTA 2HQ0A 2P2AA 1GVCA 1SW4A 1XOCA 4FE8A 2AYSA 2QS3A 4C1TA 3SETA 4RK9A 4NE4A 3Q27A 1XT8A 3VLVA 3EN3A 2VHAA 3S9LC 4WEPA 1JQFA 2F5XA 1VE4A 3Q28A 2RF1A 4ND9A 1A54A 4Z7EA 2GH9A 2R9JA 3TTMA 1HSLA 4X1BA 4FJPA 4BDOA 3FATA 4F22A 3ONMA 1VFEA 2YPNA 3KFMA 5I2KA 4HCYA 4IY5A 2ESNA 1LGBC 3O6HA 2I3WA 3HO7A 1URSA 5DEXA 4G4PA 1B05A 4LZ5A 2AL5A 4KYSA 4ISUA 1LCFA 1TFAA 4H0WA 2Z8EA 4FIMA 3D4GA 2ONRA 2HAUA 1NMUA 1YPNA 1MPBA 3PGFA 3RT6B 1EZPA 4JB7A 3GBAA 1ZLQA 1URGA 1H3DA 3HN0A 4DZ1A 4OFLA 4MLVA 4U2RA 2DXRA 3FJMA 1B52A 3TDJA 1O64A 4F3PA 3OELA 3AXFA 1B58A 3C34A 2XXHA 4ZZEA 4PETA 2D5WA 1MPDA 2GRVA 1LLSA 2DXYA 1B51A 3RPWA 1MXWA 1QVSA 3CG1A 4U23A 1QKBA 3DLNA 3THIA 4BDMA 2NWJA 1AH5A 2QSXA 3H7MA 3OD7A 5DYHA 3FZVA 2XD2A 1N7WA 3RGYA 4O3CA 3ZSFA 5DEXB 4HW8A 1A7LA 5I56A 3FVOA 3TMGA 1MG1A 4PQJA 4KHZE 4EQ9A 1EH3A 3EHSA 3SDFA 3TCHA 4F39A 2I58A 1UIUA 3L6HA 1VR5A 1N3WA 3EQ1A 3T66A 2OZZA 1FQEA 1DMBA 1AOVA 2DS9A 4IO7A 1LAFE 3QK6A 2REGA 3GXAA 4GQOA 4KI0E 1MXVA 4KFQA 2I0BA 4O3BA 3KG2A 4YAHX 1P1NA 4YKIA 1J1NA 2UVIA 4XKQA 4IGTA 2AL4A 3MW0A 3HHFA 1UQWA 5L9MA 4QFPA 3F11A 2ALUA 5I58A 2XD3A 4MBPA 3TTNA 1N76A 4FEDA 2Q2CA 1OMPA 2DYXA 5CMBA 1HSJA 2XX8A 4F2OA 1CB6A 3N6TA 3MWBA 3V89B 1Q35A 3IOVA 3MUQA 3QSLA 3LSXA 2PX1A 4HTGA 2QJEA 4G77A 1NNFA 4ESXA 2F78A 4XXUA 1ANFA 2O1MA 2DVCA 3QUJA 3LSWA 4OWDA 2ONSA 2XXPA 4G8NA 4MH5A 2ABHA 4AB5A 4X1DA 3TEPA 1XVYA 3VLUA 2F6PA 3DP4A 3VVEA 4MLQA 3PUWE 3W9WA 5I56B 3KSXA 2I4BA 4PFWA 1A99A 1POTA 4G68A 4GWOA 4NF6A 5DVIA 2Y7KA 2B65A 4GD5A 3G3HA 2ZYOA 3VXCA 5AA2A 4ELPA 4RPNA 4NF5A 3CRBA 3IX1A 2H9BA 2KLFA 1D3KA 2X7QA 4ZEKA 2Z23A 3U94A 1NFTA 4I1DA 5I58B 2O84X 2QS2A 5CRYA 1FTMA 3PU5A 4GIZA 1M5FA 2I48A 5ELVA 1IXHA 2XXUA 1B5JA 3CFZA 4ZZAA 3GLBA 2V3UA 1Q1KA 2HXWA 4RA1A 2F6GA 1LFGA 1QJMA 4PFUA 3VVDA 4LATA 3B6QA 3K6WA 1RYXA 2O7UA 4ONYA 3T96B 1R6ZA 3E13X 3UGWA 3UN6A 4Q8RA 1II5A 4TLMB 4RNSA 4YB6A 1ZIUA 3FXUA 2ZYNA 3IOTA 4LONB 4LUBA 2IA4A 3IB0A 4I62A 1USYE 5KCJA 3G3KA 4U4XA 2HCAA 4G68B 5I2NA 1FQDA 4NF6B 2Y7PA 4ESWA 1OVTA 1POY1 1YTVA 2D21A 1QULA 1UTBA 2PVUA 4DXBA 1Y1MA 1JEVA 4F1UA 5AA2B 1LB9A 2HEUA 1OLCA 4TLLB 3RUMA 2A5TA 2Q89A 1MQJA 3O28A 1JETA 4YKPA 4XKPA 2NUVA 3BFTA 4ZECA 3OEKA 4EF2A 3IL1B 4E0XA 3RTWB 3S9NC 2Y84A 3GZGA 4N13A 1P99A 1AIVA 5IAIA 3C35A 2FYIA 3M3LA 4GXSB 2OWTA 3K0VA 2R71A 1FQBA 2B3FA 4OENA 3FJ7A 4ZDMA 4ZEIA 2XXRA 3HPIA 5FTHA 4ELRA 3MPKA 3UA8A 1MH3A 3W15C 3PMWA 5ICQA 3RT8A 1DSNA 4R9GA 2LAOA 3FXRA 4DE8A 3BKIB 2DWAA 5EHMA 4H5FA 1H43A 2HZLA 1JVYA 3UP9A 1MPCA 1MXUA 3CIJA 5K2YA 1S7YA 5KCJB 5CBSA 5I2NB 3IB2A 1UTBB 1B2HA 1DTGA 4EDPA 1R9QA 1FQAA 1JW5A 4JDFA 1FTOA 4LA9A 4XKRA 1MS7A 1VSOA 5ISUA 2A5TB 3D4CA 1AL3A 1M5BA 3H3GA 4ZEBA 1MM6A 3CFLA 1SW1A 4YMAA 4OESA 3CFXA 4O3AA 5TP9A 3O97A 3M8UA 4I8CA 4PFYA 2HAVA 4BLAA 5AA4A 1N84A 1GGGA 3ZS6A 2V3TA 2DE4A 3KGCA 2Z8FA 1QW0A 1IXCA 1PB9A 4DXUA 5FHNA 3A3CA 4H8JA 2O68A 3MBPA 4X48A 4PP0A 1MXYA 3DP8A 4U4SA 2Q9TA 3OO6A 4U1ZA 2NOOA 2RC7A 3TCFA 4TOZA 1A40A 3JV9A 4QFLA 4BDLA 2XXWA 3FV2A 3N26A 1LAGE 2X7PA 3RY3A 1YCJA 4DCXA 2OBGA 4QSEA 4P0IA 4GVOA 1RKMA 2Z22A 3IOWA 2QMXA 1ZJLA 4IO3A 3G7WA 5F1QA 5CC2A 2F7CA 3PMXA 2DVZA 1JW1A 4OEUA 4UACA 5JEIA 4F29A 1NNPA 3S2VA 3TODA 2PT2A 1SYHA 4RXLA 3WAFA 5TP9B 4YU0A 2E0SA 3V83A 4ZS9A 2F97A 2XHDA 2DWIA 1LFIA 4K3FA 3MVXA 2Q2AA 1QUKA 2E1SA 3EHTA 3N6UA 2ONKE 3N94A 2QPQA 3FASA 3K00A 4NWDA 4DLDA 1LAXA 1US5A 3UIFA 2VP1A 2V25A 3FV1A 4XKNA 3MVZA 3N5LA 4N07A 1O7TA 3H03A 5I2KB 1LCTA 3G3IA 3BBRA 1M5DA 3PUVE 1F9BA 1SBPA 4OFJA 1MY0A 1B3LA 3H6WA 1LBCA 1S50A 4P0GA 2Z8DA 3HHGA 1SI0A 1M5CA 4M4GA 4RJZA 3VE1B 1SD3A 3CSGA 4JXIA 4L17A 1PDAA 4WXJA 4MFIA 3FVGA 2FA7A 3MP8A 3KJ7A 2OLBA 2H4IA 4R2FA 1Z7NE 3SEWA 1MQGA 4GFRA 3DELB 1JNFA 5CBRA 4EQ7A 4KYEA 3O6GA 4P11A 4NF8A 2GHAA 1SQYA 2XX7A 2VOZA 3IAZA 1D4NA 1N0TA 4IY6A 2P1SA 5M2VA 2M8CA 5CI5A 3OMBA 5HPQA 1JW4A 1NNTA 1MRPA 1SVXB 3Q25A 1VFDA 2AIXA 3H6TA 4IO5A 3R7XA 2UVHA 3OOAA 2UVJA 2XXQA 1DPEA 4R74A 3H6VA 2IEEA 5L9SA 1O63A 4LVQA 1MM7A 3Q26A 4LZ8A 1IXGA 4OFOA 1TWYA 1B3FA 2DSFA 4QSDA 3JYRA 4KYDA 1SI1A 3MVYA 4R72A 2H5YA 4DCYA 3KBRA 3K6UA 1Z7ME 5H8FA 3C4MA 3FIRA 5K2XA 4XTCQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OTEA 3VFJA 4DDDA 2F36A 1FBHA 2CZLA 3FVNA 4U21A 2DE2A 1PBQA 2Q88A 2OWSA 3TUSA 3VXBA 3RNNA 4F31B 1FBPA 4QFKA 4HE2A 4MEVA 4F3BA 4NF8B 2G93A 1FPIA 4DXCA 1FBGA 3C33A 1UIVA 1YXIA 4F1VA 1MY1A 5I57A 3SEVA 1B6HA 3KSJA 4QSCA 2DE3A 3V5AA 1Y3NA 4OA4A 2ZYKA 4NWCA 1FQFA 3CSBA 1P1WA 2WYKA 1ZTYA 3OSQA 1URDA 2BJJX 3PPQA 4H67A 4JSDA 4KCDA 5H8SA 4G8HA 3IO4A 1HSEA 4PFTA 3CR9A 3OXNA 3O9PA 2WBBA 1GR2A 3CI8A 4PE5B 1L5TA 5I59A 5J1DA 4EXKA 1XHYA 3TPAA 1OQGA 2I6EA 2G29A 2O6AA 2O69A 1JEUA 2OCUA 1LAHE 2PT1A 3KOSA 1A55A 4JBZA 3PPNA 3A3UA 3T9UA 2P0SA 5H8QA 2VD2A 2F7AA 2ZNUA 1LEVA 5F7VA 1NUWA 4N8YA 4Q0CA 2PFYA 2OJTA 5H8FB 2WKYA 2DWHA 2VPNA 3O6IA 1XVXA 2PYYA 2Y7RA 1OLAA 2DDKA 4F1YA 4POWA 4F18A 2QVUA 1FJ9A 1IEJA 5JK4A 1DTZA 1D9QA 4EF1A 1NV3A 2H25A 2HZKA 3K1MA 4OERA 3SESA 4NF5B 3PUZE 1DOTA 3ZKKA 4OVJA 5ICTA 3M3FA 1B9JA 1MY2A 1SPIA 4R2BA 1B32A 4H8IA 4QBAA 2THIA 3ODBA 5I57B 4RY1A 1MQIA 4HCWA 4H65A 5CMKA 5LOMA 1KZ8A 4KQPA 5KZTA 4NMYA 3K1PA 2HFBA 4R9FA 1B1XA 1B1HA 3LC8A 2O7IA 2X26A 5CM6A 3K01A 4WEDA 3G3FA 5IZ3A 4ZE9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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