1LFGA

Structure of diferric human lactoferrin
Total Genus 220
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
220
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSAQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPASNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferrin
source organism Homo sapiens
publication title Structure of human diferric lactoferrin refined at 2.2 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 220
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA03
3A3CA 4PQJA 3UIFA 3I5OA 3EPEA 4OEUA 2Y7RA 4KI0E 3U93A 3C35A 2FA7A 2CMOA 5F1QA 1M5EA 3S9MC 4XTCQ 4H5GA 1O63A 2A5TA 4R9GA 4MFIA 4I8CA 1B51A 5I56A 3PD9A 4EXKA 4BDQA 5I2KA 1MS7A 1WDNA 1B3HA 3A09A 4POWA 1ZJLA 3I3VA 4G2ZA 5AA1A 3PGFA 3PUZE 4BLAA 2PYYA 4F3GA 1LAXA 2Q9TA 1N7XA 2AL5A 1RKMA 1Y9UA 3FXQA 3EQ1A 3M3KA 4R75A 1NL5A 3IO4A 1QW0A 3ECRA 3EHTA 3O9PA 4OENA 3OO8A 1Y3PA 4KQPA 1EU8A 3DP6A 2IEEA 3LSLA 2V84A 4F19A 5JK4A 4JB7A 2REGA 4DDDA 4QFPA 4H8IA 2NXOA 1MXXA 1RYOA 3USDA 2R6GE 2IA4A 4FAJA 3R7XA 3VV5A 3IOVA 4HW8A 3VXBA 1FTLA 4YU0A 3OMBA 3HPIA 2ESNA 3IJOB 5LOMA 3FVOA 3VLUA 2XXXA 3SEXA 1FW0A 1IQ7A 1B7ZA 3LSWA 2XXRA 4QSEA 1SI1A 4OTEA 5DVFA 4F2OA 3Q25A 3SDFA 2DWJA 2VD2A 3VDFA 2F6PA 1VFDA 2QS4A 5H8HA 2D21A 5I58A 2QS1A 4NF4B 3SETA 1URSA 4QRZA 3DLNA 3W15C 5TP9A 4GD5A 2ZXTA 1UTBA 2ZMBA 4EQ9A 2H25A 2RCAA 2H5YA 1R9QA 1ZIUA 4AB6A 3B6WA 4EXLA 2VD3A 1PC3A 1H76A 1P1QA 3IJXB 4TLLB 2DE3A 5BUUA 4OFLA 2GHAA 4XKQA 1N3WA 2XXUA 1HSLA 4PFWA 2F6GA 4DE8A 3FV1A 4QFKA 3TAJA 3FVKA 3C34A 5J1DA 1QJMA 3VE1B 4LZ8A 1MM7A 4FJPA 1A8EA 3SEVA 4GVOA 3KN7A 2D3IA 5HPQA 3B7DA 3U8QA 5AA3A 2X7QA 2XXQA 4OQOA 4PFUA 1B52A 1F9BA 2F7CA 2I0BA 3OD7A 2QPQA 3K1NA 5H8QB 4KYSA 3DM0A 1LBCA 1Y4TA 2I48A 2HZKA 3VXCA 3ZKLA 2HQ0A 4LVQA 4F2QA 1JNFA 4FATA 3V8XB 3O97A 2RF1A 4IY5A 4O3CA 4BDMA 2YLNA 2PT2A 1POY1 1OQGA 2O84X 3OSRA 4U1OA 1BIYA 3QAXA 2HZLA 1SVXB 3FGSA 2H9BA 1URDA 2GHBA 3KOTA 4G8MA 3AXFA 2XD2A 3CSBA 3E3KA 3U1OA 1EZPA 4KR5A 2F35A 3PMWA 1I6AA 4OVJA 2Y7KA 3S9EA 1QUKA 5CI5A 2HEUA 3RT6B 1IITA 4I1DA 3CR9A 5KZTA 4GIZA 4H8JA 3VLVA 1YPNA 1OVTA 3C9HA 4Z0IA 2PT1A 4GWOA 5TPAB 3SEWA 3CG3A 3O2AA 3LR1A 2QS3A 1MM6A 4P11A 4DCXA 1B4HA 4ELRA 2ZNSA 4ELQA 4OEVA 4U4SA 2UYFA 2PX1A 2M8CA 1H43A 3T9XB 2QMWA 4ESXA 1BKAA 3MBPA 3KN8A 4THIA 3GZGA 1SDXA 3TELA 1T0KA 1FTOA 1LAHE 5B70A 1D9YA 2UVJA 3TTLA 3LSFB 4QSDA 1TWYA 3OENA 4QHQA 4GLIA 4H5FA 4AQ4A 5I2NB 3FVGA 2H99A 1GTKA 3MWBA 4OERA 1M5FA 2VOZA 2OZZA 3FASA 2HFBA 3LC8A 1PBQA 1MY0A 4C0RA 4YKIA 2DWIA 1MQIA 4R6KA 2B65A 4DXCA 1R1NA 2DOJA 4O3BA 4PETA 4ZEBA 3TQLA 1PB9A 3IB2A 2VGQA 4GXSB 2BJJX 4IO7A 1LLSA 1B5HA 2O7UA 1B9JA 1S9TA 3ZSFA 2DS9A 3IO6A 4IO2A 1NH7A 1J1NA 1US5A 2RC8A 4NMYA 3H06B 1OQHA 4LUBA 2F5XA 3ONMA 3O6GA 1RYXA 1JEUA 3MVWA 3CIJA 3MC2A 3N26A 3VVFA 3TFLA 2F36A 5FHNA 1AL3A 1A54A 5DTBA 4FIMA 1B3LA 2A5TB 2V3TA 4U2RA 2O1MA 4QFNA 5I56B 2ZYNA 1XVXA 1VR5A 1DOTA 1H45A 5I2KB 2DSFA 1LFGA 2F8DA 1O7TA 4RK2A 1A99A 1MXVA 3FUZA 1KWHA 3TPAA 4RK9A 4YICA 2DXRA 2ANJA 2OWSA 4EQBA 3R26A 3LBSA 1CE2A 4RNSA 4YKJA 3RNNA 2O1LA 4IO3A 3C32A 4L17A 4TOZA 4X48A 3TTKA 3M3FA 2XD3A 3THIA 4BDRA 4KD5A 2I4BA 1DTGA 1WVJA 1ZTYA 4ONYA 2Q8JA 2DYXA 2RINA 1B46A 1Y1MA 1IIWA 4KYDA 1AMFA 1JQFA 4YB5A 2GH9A 3G3GA 5CMBA 3PUVE 2I0CA 4Q30B 1QUJA 2UVIA 1BP5A 1I6BA 2G93A 2H98A 3K4UA 1FQAA 4F18A 3GBBA 3TEPA 1B6HA 4IGRA 3FJGA 4ELPA 3K01A 4RPNA 4R6YA 1MQGA 4IB2A 1FTMA 5TU0A 1II5A 1GGGA 5K2YA 2I4CA 5H8HB 5I58B 3UN6A 5I84A 3Q28A 1UTHA 1EH3A 1SW1A 5TP9B 1PBPA 5CBSA 1N84A 1UTBB 1FQCA 1YCJA 3LUYA 4XXUA 1B3GA 3VFJA 3H03A 4OMBA 4BDOA 3QIMA 1XHYA 3CG1A 4RA1A 3G3JA 3D4CA 4JWOA 2Z22A 1P99A 1S7YA 1SQYA 4FE8A 5EHMA 1MQHA 2ABHA 1N0TA 4F1VA 4QF9A 1IUDA 2XXWA 3HHFA 2XXYA 1LFIA 5HBCA 3G3KA 3RUMA 5AA2A 4O3AA 4BDLA 2UXAA 1IEJA 4U1ZA 1IZ1A 1FQEA 3KFMA 3MAMA 3KSXA 3T9VA 4PE5B 2G29A 2Z8DA 4NF5B 2OBGA 2HXWA 1B1XA 1SW5A 1URGA 1NNKA 1MRPA 5AA4A 4F31B 5AE4A 4F3SA 1XT8A 2V3QA 4R73A 4E0WA 3FIRA 3FD3A 3G3IA 4JSOA 4TQUQ 5EHSA 1DMBA 4F39A 4NF6A 4ESWA 1CB6A 5I59A 1H3DA 3A3UA 3BKIB 4K3FA 4BDNA 4Q0CA 4NTLA 4JWYA 3HV1A 2UYEA 1JW5A 4H0WA 1OLCA 1Z7ME 2NUVA 5I57A 3EF7A 4YAHX 1D4NA 3ILUB 1B1HA 3PV0E 3TYHA 1DPPA 3VVDA 1HSEA 1A55A 3K6VA 1ZU0A 1MH4A 3H6WA 2F78A 3UGWA 1NMUA 4JSDA 2REJA 3W9WA 4ZEKA 3OO7A 1Q1KA 4EF2A 1ANFA 4H67A 5ITPA 2DWHA 4OYVA 3V89B 2X7PA 2I58A 2ONSA 1N7WA 3IOWA 5FHMA 1EZ9A 4YZZA 4PFTA 4DXUA 1Y1ZA 3M8UA 3DELB 1NNFA 4ZE9A 3HSTA 3SKPA 4RPOA 3QUFA 3T9UA 2RCBA 4IY6A 5DT6A 1ZMGA 2OCUA 1B2HA 4R9FA 4YMBA 3PUWE 3RTFB 3JV9A 5DVJA 3JZJA 4LZ5A 2ZYOA 4R2BA 3FATA 5ICTA 1MPCA 3GBAA 3VLWA 3FV2A 4R2FA 3IORA 3V83A 1VE4A 3H4ZA 3PMXA 4Q8RA 1H44A 4E0XA 3HN0A 4H6DA 3KJTA 2E1SA 3C4MA 1N76A 3FXUA 3U94A 3O29A 2HAVA 4LQ5A 4HCWA 5A5XA 5KDTA 2R71A 1MQJA 3H6VA 2ALUA 3RN8A 1P1WA 1B5IA 4WEDA 3E4RA 1SYHA 1B0HA 2Q89A 3MJNA 1AH5A 3GXAA 3H7MA 4POXA 2FNCA 1P1UA 3U92A 5L8DA 1MY2A 4IO4A 2Z8EA 5CRYA 1FTJA 4PFYA 1DPEA 3OO6A 1BTJA 4PP0A 5CC2A 4I9DA 4HTGA 5H8FA 4ZEIA 4M4GA 5FHOA 3S9NC 3SESA 1LAGE 3QYTA 4HS7A 2DWAA 3TDJA 5ICQA 1A8FA 2RC7A 1D9VA 4F29A 1B5JA 3MZ1A 1MXZA 5L9OA 4OXVA 5IKBA 4IO5A 2P0SA 4MH5A 3RY3A 3KGCA 1JVYA 4LONB 4OZ9A 1A7LA 2OWTA 3N6TA 4LATA 5K2XA 4RXLA 4NF8A 3KEIA 4UA8A 1M5CA 3OSQA 4OHNA 5KCJA 4KCDA 4MLQA 5DEXA 2Y7PA 1IXGA 1M5BA 3KN3A 1B3FA 3TZAA 5BWJA 4ZECA 4GF8A 4DLDA 3TQWA 2GRVA 3K0VA 4X1DA 1M5DA 4FEDA 3M3LA 3MP8A 3KG2A 1SD3A 1B05A 4DZ1A 4YB6A 3QSLA 4N6PA 4X9TA 1NNPA 3PMVA 1S50A 3ODBA 2CZLA 4YKKA 1LCFA 3WAEA 3DP8A 3KOSA 3FJMA 2ZNTA 1LB8A 3I6VA 2O68A 1NFTA 2R9JA 1FQBA 1DTZA 3K2DA 4RJZA 5TPAA 3DP4A 1Y4CA 3TKDA 5AA2D 2O7IA 3IX1A 2Q2CA 4WEPA 3HO7A 5B7DA 2XXPA 2O51A 3CFZA 2VHAA 3RTWB 3H3GA 2Z8FA 4DIGA 3UK4A 1PDAA 3TTRA 3S2VA 4XKPA 1B32A 3G3HA 3MVZA 3QK6A 4G68A 4EDPA 4XKNA 4LP2B 4XIGQ 1XS5A 2X26A 3K6XA 4GFRA 3K6UA 1SW4A 4ZS9A 3K02A 2W7YA 4P0IA 3CI8A 1IXHA 5CM6A 2OLBA 3RT8A 1Y3NA 1QKAA 1USYH 4N13A 3PPQA 3EN3A 1MDP1 2NOOA 4FORA 1D3KA 3EHUA 4MBPA 1NKXA 2P2AA 1UTHB 3MVYA 1JW1A 2O69A 1HSJA 4GOTA 4UACA 4ZEDA 1A40A 4QSCA 2F7AA 4NWDA 1LBBA 2ZYMA 1QKBA 3L6HA 5H8SA 2NWJA 1PB7A 1NNTA 2DP8A 4JWXA 3KBRA 3T9HB 4TLMB 3TODA 4X1BA 1P1NA 3K6WA 5AA2B 1XVYA 1IXIA 1I6QA 4G68C 4WKMA 1PB8A 1PEBA 4FEBA 1TXFA 3TCHA 4F3PA 4U22A 4F1YA 1QVSA 4NE4A 2PBWA 2ZYKA 4KFQA 3HCQA 2DVCA 2QL3A 1JVXA 5AA4B 4EUOA 2F97A 3PPOA 1MDQA 3MUQA 4XKRA 5ELVA 5L9MA 2NVUB 3K1PA 4Q5TA 1MPDA 1SI0A 2YJPA 1JW4A 4LQ2A 5JTYA 1NH8A 3OEKA 5H8NA 5IAIA 1SW2A 4NF6B 4ZZEA 5I59B 2I3VA 3KZGA 2QS2A 1UIUA 3OO9A 1R6ZA 1OIBA 1UIVA 1JEVA 2QMXA 3MQ9A 5F7VA 3ZKKA 5I57B 4KHZE 3E9XA 1ZBMA 2UVGA 4RYAA 4ZDMA 4ISUA 2DQVA 2XXHA 1SBPA 4MF3A 3H6TA 3OOAA 3PPNA 3SEUA 3RPWA 1B7UA 1XC1A 1AIVA 5CMMA 2VP1A 3WAFA 3RGYA 3R6UA 2AL4A 2DE4A 4I62A 3GLBA 3UP9A 4ZE8A 4RY1A 1R9LA 1LFHA 3G7WA 3O6IA 3Q26A 2DE2A 3PPPA 3MZ9A 4LA9A 4WXJA 4NWCA 2Y7WA 1ZKBA 2V3UA 2THIA 3F11A 3B6QA 2RC9A 1LSTA 4MLVA 3B6TA 1UQWA 1LB9A 4P0GA 2H4IA 2LAOA 5JEIA 3T96B 2XX8A 3MPKA 3C36A 1YTVA 2E0SA 3ILTB 1FCKA 3T22A 1POTA 4H65A 3U72A 3CVGA 3L6GA 4Z7EA 2O6AA 5FTHA 3BBRA 1GVCA 3TUSA 3PUXE 4G4PA 1MY3A 1Q35A 1MH3A 1EZOA 4R74A 3P7IA 2HAUA 3VVEA 5A5XB 5KDTB 4G77A 5ISUA 3OEMA 3PPRA 4NF5A 1US4A 4F3BA 3BFTA 3K00A 2B3BA 2GFEA 1JETA 4NF4A 3N94A 5DVIA 1LCTA 1FTKA 4YMAA 3BFUA 3MPLA 3PUYE 3W9VA 2ONKE 4ND9A 5H8FB 3IOUA 4DXBA 3KSJA 4ZEFA 3OXNA 1OVBA 1Z7NE 3CFLA 5FTIA 4JXIA 1IXCA 3ZS6A 1MPBA 1L5TA 1O64A 1N04A 1B40A 1WODA 4ECFA 4R6HA 4FECA 2HCAA 2WKYA 3JYRA 2I3WA 1VSOA 4M1VA 3KJ7A 4U21A 2OK2A 2XXTA 3FXRA 1ATGA 4EF1A 2ONRA 2XHDA 4DCYA 4NF8B 4NEDA 3OELA 1QULA 4KPTA 1LAFE 5EYFA 3O28A 5L9SA 4QFLA 4R72A 5KCJB 2P1SA 5DEXB 3TMGA 3C33A 2UVHA 1B0LA 1YAEA 3EHSA 4YKPA 2DVZA 3PD8A 4JDFA 1XOCA 3MZBA 3TTNA 2AYSA 2YPNA 3Q29A 3O66A 3RQTA 5H8QA 3IR1A 3TCGA 3CSGA 4GRKA 3FZVA 3PU5A 4ELOA 3S9LC 1N3XA 3N6UA 1MXYA 3K1MA 1MY4A 3IK6B 2D5WA 3IAZA 2QJEA 4C1TA 1FQFA 1ZLQA 2RKMA 2Q2AA 2OJTA 4KYEA 3SERA 3S4UA 3G3FA 1FQDA 2QSXA 1USYE 4N07A 4G8NA 2QRYA 1Y20A 3SEYA 5M2VA 4KCCA 4EQ7A 1Y3QA 4G8HA 3Q27A 2V93A 3IOTA 4C1UA 4G68B 2XX7A 1P1OA 3D4GA 3IL1B 4GL8A 1OMPA 4F22A 2KLFA 3C31A 1TT1A 1VFEA 4AB5A 2I6EA 3MP6A 3UORA 1B58A 2XXIA 3O6HA 5HM4B 2FYIA 2ZNUA 3TCFA 4OFJA 3HHGA 4U4XA 4JBZA 4YB7A 1TFDA 3MP1A 1MXUA 2V25A 4IGTA 3CRBA 3UA8A 4H1XA 1BLFA 2I49A 2F7BA 1MG1A 4GXAA 4U23A 2DXYA 3MVXA 3CFXA 2Q88A 3FVNA 3TTMA 1DSNA 3RLFE 3T66A 2XX9A 1SYIA 3N5LA 3T93B 1MXWA 1GR2A 1GV8A 2AIXA 2Y84A 5CMCA 1TFAA 3IB1A 5I2NA 1ELJA 1B7HA 1OLAA 1MQDA 1QUIA 3MW0A 3E13X 4OFOA 4OESA 2Y7IA 5CMKA 5ITOA 1B4ZA 4IO6A 3IB0A 1I69A 3QXMA 3FJ7A 2XXVA 4HCYA 4OETA 2A5SA 1B3EA 1LGBC 2PVUA 1AOVA 5JTYB 4GQOA 2PMSA 3H6UA 5H8NB 3QUJA 2B3FA 3LSXA 4GL0A 4OWDA 3V5AA 5CBRA 1MY1A 5DYHA 2Z23A 2F34A 4QFOA 4LZ7A 4ZZAA 4F1UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A3CA 4PQJA 3UIFA 3I5OA 3EPEA 4OEUA 2Y7RA 4KI0E 1FPBA 3U93A 3C35A 2FA7A 2CMOA 5F1QA 1M5EA 2FBPA 3S9MC 4XTCQ 4H5GA 1O63A 2A5TA 4R9GA 4MFIA 4I8CA 1B51A 5I56A 3PD9A 2VPOA 4EXKA 4BDQA 5I2KA 1MS7A 1WDNA 1B3HA 3A09A 4POWA 4PGNA 1ZJLA 3I3VA 4N6KA 4G2ZA 5AA1A 3PGFA 3PUZE 4BLAA 2PYYA 4F3GA 1LAXA 2Q9TA 1N7XA 2AL5A 1RKMA 4P3LA 1Y9UA 3LV0A 3FXQA 3EQ1A 3M3KA 3BIHA 4R75A 1NL5A 3IO4A 2ZZXA 1QW0A 3ECRA 3EHTA 3O9PA 4OENA 3OO8A 1Y3PA 4GWYA 4KQPA 1EU8A 3DP6A 2IEEA 3LSLA 2V84A 4F19A 1FRPA 5JK4A 4JB7A 2REGA 4DDDA 4QFPA 5IM2A 4H8IA 2NXOA 1MXXA 1RYOA 3USDA 2R6GE 2GQ1A 2IA4A 4FAJA 3R7XA 3VV5A 3IOVA 4HW8A 4PBQA 3VXBA 2QVVA 4I3EA 1FTLA 2L5VA 4YU0A 3OMBA 3HPIA 2ESNA 3IJOB 5LOMA 3FVOA 2XA5A 3VLUA 2XXXA 3SEXA 1FW0A 1IQ7A 1B7ZA 3LSWA 2XXRA 4I40A 1FPDA 4QSEA 1SI1A 4OTEA 5DVFA 4PCDA 3QMFA 4F2OA 3Q25A 3SDFA 2DWJA 2VD2A 3VDFA 2F6PA 1VFDA 2QS4A 5H8HA 2D21A 5I58A 2QS1A 4NF4B 3SETA 2CZKA 1URSA 4QRZA 3DLNA 3W15C 5TP9A 4GD5A 2ZXTA 2WYPA 1UTBA 2ZMBA 4EQ9A 2H25A 4PGPA 4DI4B 4MHFA 2RCAA 2H5YA 1R9QA 1ZIUA 4AB6A 2CZHA 3B6WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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