1LFGA

Structure of diferric human lactoferrin
Total Genus 220
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
220
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSAQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPASNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of human diferric lactoferrin refined at 2.2 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferrin
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 220
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfgA03
1KWHA 2Z8FA 1IXHA 3BFUA 3E9XA 4OETA 3FATA 3F11A 3PUXE 1Y9UA 3B6QA 3H6TA 1B51A 2P2AA 5CMMA 5HPQA 4OFOA 5CC2A 4C0RA 2XXQA 4RNSA 1AH5A 1FW0A 2F78A 3O29A 4BLAA 4G68A 3VV5A 2XXVA 1WODA 4ONYA 1B3FA 1VFEA 4KYEA 3KJTA 4PFWA 4ESWA 1SW5A 1MXUA 3OO6A 3A3CA 3TYHA 2B3BA 2ZYMA 2I3WA 1URGA 4FEDA 1B1XA 1OVBA 3GBAA 2DE2A 1GV8A 3MVXA 2XXUA 2ZYNA 1SW1A 4RJZA 3MVYA 5ICQA 4PP0A 1MQHA 3O2AA 1OMPA 3KN7A 4JWOA 2O1LA 2XXPA 1B3EA 4PFUA 1M5DA 2VOZA 4IO5A 5DEXA 3TCFA 4AB5A 4YKJA 3PPPA 1N76A 3TQWA 5EHMA 3ZKLA 2RCBA 2XXYA 3PUWE 1ZKBA 3QK6A 3THIA 4XIGQ 2DWAA 1LAGE 3TMGA 5M2VA 3DELB 1ZIUA 1D3KA 2A5TA 3C33A 4IO7A 4I62A 1O63A 2Y7PA 5H8NA 1FTJA 1MPBA 1OLCA 3HO7A 4X1DA 1FQCA 1MQJA 4BDQA 2GFEA 3SEVA 2O7IA 2O1MA 1TXFA 2ZYOA 3FJGA 4YKPA 3QYTA 2DYXA 1US4A 4PFTA 3TPAA 1M5BA 3E3KA 1MXWA 3OELA 1BLFA 1M5CA 2I4BA 1S50A 1M5EA 3K0VA 3S4UA 3ZKKA 1B9JA 1QKAA 4FAJA 2ALUA 4RY1A 2D3IA 1WDNA 4DCXA 3HHGA 3C36A 4NTLA 3S2VA 3MP6A 2FYIA 4N07A 1F9BA 1Q1KA 1QUKA 4GQOA 4F1VA 2O6AA 4U22A 4NF5A 2DWJA 3HSTA 4R2BA 4R6HA 1NNFA 4XKQA 4Z7EA 4R72A 4ZEIA 4FECA 2H4IA 1D9VA 2OCUA 3V83A 1OLAA 1SYIA 2HAUA 3MZ1A 2NWJA 3Q29A 1MXXA 3TCHA 2CZLA 1BKAA 3SETA 1USYE 2Q2CA 4OTEA 1D9YA 3CR9A 3KJ7A 3O6HA 4F1UA 2DWHA 3FUZA 3UA8A 4TLLB 4UA8A 1LBCA 1MXVA 3CSBA 4QFKA 5H8HB 4GF8A 4ZZEA 3TCGA 1GR2A 2YJPA 2I58A 2DXRA 1Y1ZA 3FJMA 3OSRA 4JSOA 4U23A 4KCDA 1S7YA 3DM0A 2I49A 4DXBA 5KDTA 3O6GA 4QFPA 3BKIB 4IGTA 1R9LA 3G3JA 2R6GE 4IO4A 5CMBA 3EHSA 1NNKA 4Q5TA 5A5XA 2XXWA 4R2FA 3R6UA 4LZ8A 4TQUQ 5BUUA 4HW8A 4U1ZA 1Y20A 5ITPA 3OEKA 3C32A 4XTCQ 4E0XA 4ZECA 1FCKA 3H3GA 3M3LA 3MUQA 2AYSA 5HM4B 2RC9A 4GXSB 5CMKA 2XX9A 3IORA 1VFDA 1BP5A 3CFXA 1Z7NE 2KLFA 1P1UA 2HZKA 2RC7A 1B7ZA 1R1NA 4RK9A 1GVCA 1MM7A 2Q2AA 2HEUA 3N6UA 5BWJA 3FV2A 3PPOA 1PEBA 4LA9A 4EXLA 4F2OA 5B7DA 3N94A 2ONSA 2X26A 3FVGA 3VVEA 5F7VA 1XVYA 2QMXA 4NF8B 2F7AA 3LSLA 4YAHX 3TODA 2XXIA 3E4RA 3O97A 4R73A 5I57A 4M1VA 5FHOA 2DXYA 1B0LA 3RT8A 4DZ1A 3HN0A 2THIA 2HXWA 1QJMA 3KZGA 2REJA 3A09A 1HSJA 3LBSA 1IITA 1P1QA 1TFDA 3CSGA 1PB9A 1QUJA 2DVZA 2F7CA 4U1OA 4YU0A 3SERA 4GXAA 4NF4A 5TPAA 3FVNA 3VLUA 5CM6A 2X7QA 3OO8A 4IO3A 5AA4B 1PB7A 1FQFA 1USYH 2QRYA 1AMFA 2XXTA 2Y7KA 5L8DA 1M5FA 2VHAA 2D21A 4ZE8A 1CE2A 1FTKA 4WEDA 4OENA 1MH3A 4TOZA 4TLMB 3VLVA 1MPCA 1LCFA 2F8DA 1MY1A 2PVUA 3H6UA 4FEBA 1JVXA 2V3QA 1A54A 2AIXA 3IO4A 1URSA 3OXNA 2O51A 3T9UA 4C1TA 3S9LC 2XX8A 3R7XA 1LFGA 4U4XA 3LR1A 4QFOA 1EH3A 1B0HA 2UYFA 5DVFA 1O64A 2Q8JA 4NF8A 5AA3A 2XX7A 1II5A 2B65A 3OEMA 4GFRA 1URDA 3EHTA 2YPNA 1QUIA 1IQ7A 3KFMA 4NWDA 2FA7A 4OERA 3MW0A 5FHMA 2DE3A 1QULA 3HCQA 3MJNA 4C1UA 3SDFA 4QF9A 4KQPA 4ZE9A 1N3WA 3MP8A 1HSEA 4DDDA 1A7LA 2H98A 2H9BA 1NL5A 2UXAA 3FXUA 4AQ4A 3FVOA 4GRKA 3U94A 1IEJA 4RPNA 4QSDA 4F22A 2GHAA 2NXOA 2BJJX 1OQHA 4G68B 5H8QA 3T9HB 1LFIA 4ZEBA 4ELPA 1MQGA 4OQOA 1UIVA 1XOCA 4KI0E 5K2XA 3LSFB 1IZ1A 1Y3NA 4R9FA 5FHNA 1B4HA 1LAFE 1LGBC 3Q25A 2RC8A 4DIGA 1MDQA 1IXCA 1N7XA 4RXLA 2F6GA 2UVIA 4KR5A 2V3TA 3KG2A 4FORA 2PT1A 3CIJA 4H8JA 4QHQA 4R6KA 3GLBA 1Y3PA 1VR5A 2UVJA 3IB1A 2Q89A 3KEIA 4KYDA 4OEUA 1L5TA 4O3CA 3OD7A 2OWTA 4O3BA 3PU5A 4DCYA 2OBGA 4PFYA 5ITOA 5AA2D 2OZZA 1NMUA 4IGRA 1JNFA 2Q9TA 3O66A 1H45A 4U4SA 4OFJA 4XKRA 1SD3A 2H25A 2I0CA 4H6DA 3SEWA 3RTWB 1JQFA 3G7WA 4LZ5A 2VD3A 1XT8A 4KFQA 5EHSA 3KSXA 3PUVE 3USDA 1UTHB 3RN8A 5I56B 5AE4A 1SI1A 4GL0A 4HTGA 3RY3A 4G8HA 1NH8A 2PT2A 4KD5A 1B46A 1DTZA 1R6ZA 3FGSA 3M8UA 3T9VA 4QRZA 1T0KA 4N13A 1B6HA 3K01A 2P1SA 1A55A 1VE4A 5DYHA 1POY1 4R9GA 2I4CA 1O7TA 2OWSA 2QL3A 1FQBA 3KOSA 4MH5A 1UQWA 4OFLA 1TWYA 3ONMA 1B1HA 3CG1A 4PE5B 1JW4A 4DLDA 4DXCA 4Q8RA 3ZSFA 3OO7A 1B7UA 2DE4A 1SDXA 2ABHA 4HCWA 4ZEFA 2HQ0A 3FV1A 1AOVA 3TFLA 2G29A 1D4NA 5TU0A 3U93A 3VFJA 4MF3A 1US5A 1JEUA 1MM6A 2F97A 1QVSA 2RINA 3MC2A 3MPKA 3QUFA 1EZ9A 3RT6B 4NF5B 3T9XB 1B52A 4BDNA 4LQ5A 2PX1A 2GRVA 4EDPA 2QJEA 4ZZAA 5L9MA 4BDMA 2O84X 3QUJA 4LONB 1SYHA 4EQBA 3UORA 4KPTA 3QIMA 4LP2B 3K1NA 4QSEA 3KOTA 5I56A 1P1NA 4KCCA 3ILUB 4BDRA 1IIWA 1ZTYA 5I59B 3Q26A 4H67A 5JTYB 4H1XA 4YKKA 2H99A 1TT1A 1EU8A 2NOOA 2QS3A 2Y84A 3OOAA 1LAXA 1N3XA 4GIZA 2F35A 4THIA 4H0WA 3O28A 5ICTA 5KDTB 2XHDA 4IY6A 3EHUA 2I0BA 4M4GA 4ECFA 2R71A 3MVZA 4G8MA 3C35A 4JXIA 3CG3A 3FVKA 4L17A 1B5JA 3UN6A 4RYAA 1WVJA 2AL5A 4DXUA 3TDJA 4GOTA 2Q88A 1AL3A 3DLNA 3LSXA 4FIMA 3WAFA 3W9WA 2DOJA 2QSXA 4F29A 4OEVA 5A5XB 2Z8DA 4RK2A 1VSOA 2A5TB 2VD2A 3MVWA 4YB6A 1B5IA 2XXRA 3SEXA 3U1OA 3PD9A 4ELQA 3ZS6A 1DOTA 3OSQA 1JW5A 1A8FA 2ONRA 2F7BA 4IO6A 3TUSA 5L9SA 4GD5A 4LZ7A 4ISUA 3HPIA 1RYOA 4NF6A 5DT6A 3O6IA 3UP9A 3G3IA 4BDLA 4F3GA 1FQAA 4X48A 5FTHA 3O9PA 3SKPA 2QPQA 1N7WA 3S9EA 2XD3A 4K3FA 3KGCA 3ILTB 1B2HA 4KYSA 3MZ9A 1ATGA 4I1DA 4F3SA 4I8CA 4YMBA 3IOTA 4NF4B 2PMSA 5CMCA 1B05A 5TPAB 5CBSA 3EQ1A 1DPPA 5DVIA 1QW0A 4NMYA 3UK4A 3C4MA 1Y1MA 4JWYA 1UTHA 1YAEA 4YB7A 1CB6A 3FXQA 3JYRA 4XXUA 3CFLA 1PBQA 4R75A 3PMVA 1N0TA 2REGA 1OIBA 3PGFA 4IB2A 3LC8A 5B70A 4F3BA 4MBPA 1NKXA 2IEEA 1EZOA 1ZU0A 2YLNA 1HSLA 2H5YA 3CVGA 4QSCA 3UIFA 1MY4A 4ND9A 4GL8A 3FJ7A 4JB7A 4ZEDA 1B58A 2E1SA 2F36A 4H65A 4YICA 3KN3A 3K00A 1B3LA 1B40A 2QS4A 3DP8A 4EF1A 3IO6A 3K1PA 4IO2A 4ZS9A 1B3HA 3IOVA 3V8XB 2DSFA 3K6UA 3QAXA 5JEIA 2HFBA 1ZBMA 2F5XA 4MLQA 3MZBA 4ESXA 3QSLA 2ZNTA 3H4ZA 3TTLA 4R74A 3KN8A 4RPOA 4Q0CA 3TAJA 3M3FA 4F2QA 2X7PA 3IB0A 3G3HA 5HBCA 3RQTA 3TTMA 5I2NA 1H3DA 2ANJA 1UIUA 3K6XA 3M3KA 2R9JA 2OJTA 1MQIA 2QMWA 4LATA 2I3VA 5ELVA 4ZDMA 4F19A 2ZYKA 1FQEA 5I57B 3V5AA 1BTJA 2O69A 2OK2A 4OHNA 2QS1A 3T96B 3VXCA 2Z23A 3S9NC 3TTNA 2B3FA 3A3UA 1TFAA 1PB8A 1DMBA 3K1MA 4MFIA 3FXRA 1A99A 1SVXB 2Y7IA 5I2KB 4FE8A 5CBRA 5ISUA 4G77A 2UYEA 1YPNA 1POTA 2VP1A 2ZMBA 3T22A 4U21A 3IB2A 3H7MA 3LUYA 3PPRA 3W9VA 5IAIA 3Q27A 4ELRA 5EYFA 1AIVA 4WEPA 1DTGA 2VGQA 3AXFA 4Z0IA 3V89B 3VDFA 3PPNA 3FIRA 1ZLQA 3EPEA 1FQDA 3Q28A 1MPDA 3H03A 5FTIA 2ESNA 5IKBA 4N6PA 4F18A 3S9MC 3GZGA 4HS7A 1B4ZA 2NVUB 1ELJA 1A40A 3SESA 2DS9A 5I2NB 4JBZA 1LAHE 3N6TA 3OMBA 1B32A 3BFTA 4OXVA 1NH7A 4LQ2A 3U8QA 3CRBA 4XKNA 3TKDA 4EF2A 3C34A 2Y7WA 2ZXTA 4H8IA 4P0GA 3MQ9A 2LAOA 3SEUA 2PYYA 4G8NA 2OLBA 3TELA 2V84A 4PETA 3IOWA 4RA1A 3CFZA 1N84A 2I48A 1YCJA 1S9TA 2I6EA 3GBBA 1LCTA 2XD2A 3FD3A 2G93A 3B7DA 3L6HA 5I2KA 1LFHA 1QKBA 3K2DA 2M8CA 2O7UA 4GVOA 5I58A 4EQ9A 4WXJA 1H76A 3OENA 3PMWA 3IR1A 2HCAA 1B3GA 1ZJLA 4MLVA 4F31B 4YMAA 1I6QA 3T93B 1RYXA 1JW1A 3MPLA 5J1DA 1XS5A 2FNCA 1GGGA 1DSNA 5I84A 1FTMA 1BIYA 3TQLA 1IUDA 5AA2B 2A5SA 4KHZE 4F1YA 3HHFA 4POWA 4WKMA 5JTYA 1UTBA 3R26A 3D4GA 5H8SA 2V93A 3K6WA 3PUZE 4OMBA 1MQDA 4YKIA 1P99A 3C31A 3C9HA 3I6VA 3IAZA 1MXYA 3OO9A 4GWOA 4I9DA 3KSJA 3P7IA 4HCYA 3VVFA 2F34A 2P0SA 2AL4A 3TTRA 4NEDA 4OZ9A 2XXXA 1IXIA 1MY2A 3IJOB 1N04A 3MBPA 4Q30B 1SI0A 2NUVA 2Z22A 2DWIA 3G3FA 4P0IA 5TP9B 1P1OA 1H44A 1RKMA 4IY5A 4OESA 4LVQA 3W15C 3EF7A 5I59A 3TEPA 3HV1A 5KZTA 3JZJA 1B7HA 4YZZA 3TTKA 3I3VA 1I6BA 3B6TA 3DP6A 1ZMGA 2QS2A 2XXHA 4X1BA 5H8HA 5JK4A 4E0WA 4H5FA 3D4CA 3H06B 4JWXA 4P11A 1MS7A 4UACA 2RKMA 1I6AA 2ONKE 1I69A 3K6VA 5AA2A 1A8EA 2DVCA 4FATA 1LB8A 1MG1A 4H5GA 4PQJA 4DE8A 3ODBA 3ECRA 3PMXA 1MY3A 1UTBB 2F6PA 2E0SA 3TZAA 2RF1A 4OWDA 3I5OA 3U72A 4NWCA 4EQ7A 3GXAA 2HAVA 5L9OA 1FTOA 1XHYA 3RLFE 1PC3A 2DQVA 3G3GA 3PUYE 5K2YA 1NNPA 2UVGA 3RGYA 4QFLA 5DEXB 2HZLA 3RUMA 3VLWA 3KBRA 4F3PA 1IXGA 1JVYA 4U2RA 2UVHA 4G2ZA 4JDFA 5H8FB 1PDAA 3MAMA 5TP9A 3H6WA 4GLIA 2D5WA 1P1WA 5KCJA 2GHBA 3VXBA 1GTKA 3K4UA 4EXKA 1YTVA 3DP4A 2WKYA 1B5HA 3CI8A 3IOUA 4NE4A 3VVDA 3UGWA 1EZPA 4XKPA 5H8NB 2CMOA 3EN3A 5H8QB 3BBRA 3QXMA 5DVJA 2PBWA 1OQGA 4G68C 1NFTA 3MWBA 2GH9A 3RPWA 4BDOA 5AA1A 1LB9A 1H43A 1Y4TA 2W7YA 1SW2A 1PBPA 3H6VA 1SW4A 2Y7RA 4OVJA 4EUOA 4LUBA 4POXA 4JSDA 1XVXA 3PV0E 1MRPA 2O68A 3N5LA 3FASA 5CI5A 4ZEKA 1J1NA 4AB6A 1Y4CA 1JETA 2ZNSA 1DPEA 3FZVA 2RCAA 3WAEA 3SEYA 3IL1B 4QFNA 3N26A 3VE1B 1Z7ME 5F1QA 5I58B 4O3AA 5AA4A 4X9TA 5LOMA 5DTBA 1MDP1 3IK6B 4OYVA 3E13X 4YB5A 3RTFB 2DP8A 2ZNUA 3L6GA 2V3UA 4ELOA 1MH4A 5H8FA 3T66A 3PPQA 5KCJB 1MXZA 1R9QA 3G3KA 1JEVA 1NNTA 1SBPA 3IX1A 3MP1A 3PD8A 1MY0A 3K02A 3RNNA 4F39A 1LLSA 3IJXB 2IA4A 1SQYA 4FJPA 4NF6B 5CRYA 4R6YA 3JV9A 2Z8EA 3B6WA 3U92A 1OVTA 1XC1A 3LSWA 4G4PA 1LBBA 1Y3QA 1LSTA 2V25A 1FTLA 1ANFA 1Q35A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IXHA 3BFUA 3FATA 1FJ6A 4XFEA 1Y9UA 3B6QA 1B51A 4OFOA 5CC2A 4RNSA 1FW0A 3O29A 1WODA 4ONYA 1VFEA 3KJTA 1SW5A 3NOHA 3RPLA 3TYHA 4OVRA 1URGA 2ZYNA 4RJZA 5ICQA 2XXPA 1B3EA 4PFUA 2VOZA 1N76A 3TQWA 5EHMA 3ZKLA 3THIA 3QK6A 5M2VA 2A5TA 3C33A 4MNCA 2Y7PA 3HO7A 5EYHA 4X1DA 2O1MA 5EQ8A 4YKPA 1US4A 3ZKKA 4P1LA 3C36A 4NTLA 4N07A 4Z7EA 1NNFA 3TCHA 4PGPA 3SETA 2Q2CA 1D9YA 3CR9A 3O6HA 3UA8A 4UA8A 3TCGA 4PBHA 1Y1ZA 3FJMA 3OSRA 4U23A 4DXBA 1R9LA 3G3JA 4IO4A 5CMBA 4IR8A 4HW8A 4U1ZA 4PAKA 4N4UA 5CMKA 1BP5A 1MM7A 2HEUA 3FV2A 4F2OA 5F7VA 4YAHX 3E4RA 3RT8A 5FHOA 2THIA 2HXWA 2REJA 2GQ1A 3LBSA 2DVZA 1FQFA 1USYH 5L8DA 1M5FA 2VHAA 4WEDA 4TOZA 1LCFA 1MY1A 3H6UA 3T9UA 2O51A 3R7XA 1NI9A 4QFOA 2Q8JA 5EQ7A 3KFMA 4ELRA 4QF9A 4KQPA 3MP8A 5T3JA 4DDDA 2H9BA 4AQ4A 4F22A 2GHAA 2NXOA 4HE0A 4G68B 3LSFB 1Y3NA 1B4HA 2L5VA 1LGBC 4DIGA 3KG2A 4H8JA 3CIJA 3IB1A 4O3CA 3OD7A 4O3BA 2OBGA 2OZZA 1EYIA 1H45A 1JQFA 1XT8A 5EHSA 1K9ZA 4PF6A 3PUVE 1NH8A 3KC0A 1R6ZA 3FGSA 1B6HA 1A55A 1VE4A 4R9GA 1FQBA 4MH5A 1UQWA 3ONMA 1B1HA 3CG1A 4P56A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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