1LFHA

Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
publication title Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 219
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA03
3N6UA 4AB6A 3SERA 3N94A 1MM7A 4NWCA 1B5HA 4KYSA 3FASA 4F2OA 1TT1A 1FQBA 2OWSA 3T9HB 3BBRA 3RN8A 1MXZA 3PPOA 2I4CA 3IOUA 3IOWA 3R26A 2F97A 3B6QA 4ZE8A 1B3EA 1I69A 4IO2A 1EZPA 1Z7NE 4MH5A 4G8NA 2Q9TA 3H6UA 4YB6A 4GWOA 5EYFA 3ODBA 4RK9A 1Y3NA 2OK2A 2DQVA 3KOTA 1N76A 2QL3A 3F11A 1JW5A 1LBCA 3MBPA 1B51A 2VHAA 4G8MA 2XXVA 4RJZA 4GXAA 1MXYA 4LVQA 1SI1A 5K2XA 1O7TA 3C36A 4LATA 2OZZA 2XXPA 2I4BA 3OEKA 4G4PA 4R9FA 4F3PA 3PUZE 4KYEA 3FVOA 3IJXB 5CMCA 4G2ZA 1S9TA 4JSOA 1T0KA 1UTHB 2RCBA 4ECFA 1P99A 2UVIA 3H6VA 3HV1A 5FTIA 3H7MA 4R9GA 5L9MA 3E9XA 4LZ7A 5CMKA 3CFXA 1MM6A 4OEVA 5I57A 5KCJA 1ATGA 4BDLA 3VXBA 3OO7A 2THIA 1IXGA 1HSJA 1QUKA 1B3GA 2F6GA 1FCKA 4IB2A 4ELQA 1YPNA 4H5GA 3CSBA 4BLAA 5ISUA 3E3KA 3Q28A 4GVOA 3LUYA 5HBCA 4U21A 2VGQA 4EXKA 3PUVE 4F3GA 1IIWA 1Y3QA 2ZYNA 3OSRA 4ZE9A 3KZGA 4OXVA 2ZNSA 4Q8RA 4DE8A 4DDDA 3ONMA 4H8JA 1H76A 3OELA 3HN0A 3MPLA 2HCAA 2V3TA 1O63A 4H8IA 5CI5A 2PT2A 2HAVA 4N6PA 1DTGA 3MP1A 3O66A 1US4A 4KI0E 4BDRA 3DP8A 4IY5A 1D4NA 4ND9A 4KCCA 2O1MA 5DVIA 2DXRA 3E13X 1A7LA 5JTYA 2Z23A 3TEPA 3QYTA 4OFJA 3KSXA 3MQ9A 2XXIA 1Q35A 3DELB 1JVYA 5L9SA 1YCJA 2RINA 3ECRA 1VE4A 3O6HA 3TQWA 1KWHA 2XHDA 3GLBA 4JDFA 5HPQA 1B40A 3L6HA 4WEPA 1B05A 2BJJX 3IB1A 4TLMB 4RNSA 3OXNA 4NF5B 5ITPA 5ELVA 4KR5A 3K6VA 4JB7A 2VOZA 4I1DA 3MUQA 3DM0A 2IEEA 1MPBA 5EHMA 3VVEA 3UORA 1DOTA 4YKJA 2PT1A 4XKPA 1PB7A 3VDFA 3T66A 4OEUA 2QS2A 3KN7A 4R73A 2Y7PA 2AL5A 1Y1ZA 3EQ1A 3SKPA 4ZECA 1N84A 1NH8A 1OVTA 2H5YA 2PYYA 4EF1A 5DTBA 2XX8A 2OLBA 4RYAA 1SW1A 3EN3A 5AA2B 1IXHA 3T22A 3IJOB 1P1NA 4MLVA 1B3FA 4GL8A 3IO6A 3KN8A 4YMBA 4LQ5A 3SETA 3GBAA 1B5JA 1NNTA 1TFDA 2P2AA 3QXMA 5H8QA 5HM4B 2QPQA 2F7CA 3MVWA 3K0VA 2Q2AA 3N6TA 4RPOA 4RXLA 5CBSA 4OENA 1LAFE 3TCGA 1GV8A 4ZS9A 5AA3A 2I0BA 3CR9A 2G93A 3MJNA 4GL0A 4R75A 3MVXA 2O7IA 4RY1A 4NF6A 3IL1B 1M5FA 3K1NA 5ICTA 1BP5A 2A5SA 4ZDMA 5BUUA 4O3AA 4TLLB 3MVYA 3O97A 1R6ZA 3TCFA 3G3KA 4LONB 4DCYA 4LP2B 1D9YA 4QFLA 4IGRA 4ZEBA 4G68B 1B6HA 1PDAA 4ONYA 2OJTA 1MDP1 1YAEA 3HHFA 1B32A 3LR1A 3OEMA 2B65A 1QKAA 3RTFB 4JWYA 1USYH 3G3IA 2QMXA 1B5IA 4QHQA 1HSEA 5KZTA 3M3KA 2I3WA 3MAMA 2ONRA 3EPEA 3OD7A 1MH4A 1OQGA 1H45A 1QUJA 2Y7WA 3HO7A 1SYIA 3MW0A 4DXUA 1CE2A 1WODA 4HS7A 5DT6A 4IO4A 1ZBMA 1N7WA 4R6KA 1QUIA 3T93B 1LB8A 3BFTA 3MPKA 4KD5A 4MLQA 3TELA 3I3VA 4OETA 3MZ9A 1Y9UA 4GD5A 1AH5A 2X7QA 1ZJLA 3FIRA 1QULA 1D3KA 5H8FA 3PD9A 3RY3A 3MP8A 3KJTA 4L17A 1FQDA 2IA4A 4F1UA 2VD3A 4MF3A 1DSNA 4EF2A 2NOOA 4IY6A 5DEXB 5J1DA 4R72A 3IB2A 1SDXA 4JWXA 1PBQA 1FTMA 4ZEIA 3RTWB 4OVJA 1B7HA 1JETA 1Y20A 2I3VA 1SQYA 4TQUQ 3LBSA 4ELRA 2DWIA 3C4MA 2I58A 1USYE 3QSLA 4GOTA 5H8NA 1POY1 1B4HA 1F9BA 3UK4A 1JEUA 1MY0A 3PPQA 3I5OA 2D21A 3U72A 3ILTB 1JW4A 1GVCA 3SEVA 1M5BA 4POXA 3KN3A 2QJEA 3SEUA 4R6HA 2O69A 3M3FA 4H67A 1MQHA 1OLAA 2XXRA 3TTNA 1LFHA 5FTHA 2A5TA 2VP1A 1MY2A 3ZKKA 4FIMA 1M5EA 2B3BA 1XC1A 2WKYA 3RPWA 3CG3A 3OMBA 2HEUA 1EZOA 1VFDA 1US5A 5I2KB 4NMYA 3G3JA 5LOMA 4QSEA 1LFIA 5JEIA 2PVUA 2E0SA 5IAIA 3HPIA 1B1XA 3K6XA 1GR2A 3G3HA 1DTZA 3JYRA 4C0RA 3TTLA 1A8EA 3WAFA 2Y84A 1LGBC 1UTBB 3G3GA 3TPAA 4FECA 2NXOA 5CMMA 3KBRA 1IXCA 1B46A 2RC9A 1IXIA 3RLFE 3SEXA 5I59B 2F7BA 4I8CA 1Z7ME 3Q25A 2V3UA 5I2NA 4NTLA 4DZ1A 2OBGA 1SYHA 2DXYA 3LSFB 3VE1B 1LBBA 5I56B 1SW5A 3T9XB 3TAJA 3FJMA 2ANJA 4EDPA 2XD3A 2REJA 4PFYA 3PMWA 4K3FA 4JWOA 4G68C 3OO9A 3T96B 3H3GA 4MFIA 1AIVA 1IITA 4E0WA 1URSA 2ALUA 1A54A 1P1QA 3Q27A 1B2HA 4KQPA 2DE4A 3FUZA 3DP6A 4RPNA 3FZVA 3PPPA 1I6BA 5H8SA 3PUWE 5F7VA 3S4UA 3MWBA 3RT6B 4KPTA 4YICA 2HZKA 1Q1KA 3TCHA 1SW2A 1AOVA 3IR1A 4DLDA 5M2VA 3K1PA 3KJ7A 4XXUA 3CRBA 4GIZA 2KLFA 4GFRA 4QSCA 3IX1A 1XOCA 4YKKA 5H8HB 3W9WA 4R2BA 1XHYA 4E0XA 4XKNA 3LC8A 1YTVA 4YAHX 5JK4A 1VSOA 2XD2A 1JVXA 1MXVA 1A8FA 1QKBA 3MVZA 3OSQA 1NKXA 1BLFA 3PU5A 1LCFA 2RF1A 3RUMA 2F7AA 4JSDA 4F22A 4FATA 2Y7KA 3CVGA 3UP9A 1OVBA 4F31B 1VR5A 4GRKA 1S7YA 1B52A 3TQLA 4R2FA 1XS5A 3IK6B 2O51A 2I6EA 1UTHA 3EHTA 1MQIA 4IO6A 2F36A 3K01A 4YMAA 2XXTA 1BTJA 1Y3PA 4NF4A 1OLCA 2DWJA 2GHBA 3SEYA 1HSLA 2Q8JA 1ANFA 4PFTA 4GF8A 1NFTA 3ZS6A 2PBWA 2X7PA 3PD8A 5B7DA 1JEVA 2LAOA 1MY4A 3U93A 3MC2A 4F3BA 4NEDA 4ZEFA 4XTCQ 3N26A 1JW1A 2GHAA 1LB9A 2HXWA 2ZNUA 3R6UA 2D5WA 1MS7A 3OOAA 4QF9A 4JXIA 4HCYA 1P1UA 3TZAA 2YPNA 4OZ9A 3IORA 4HW8A 4IO3A 3CFLA 1QJMA 1ZTYA 1H44A 4QRZA 4ELOA 3S9EA 1XVYA 3RGYA 5TPAB 1B9JA 2Z8DA 4WEDA 4LZ8A 4RK2A 4NF8B 4H5FA 3PUXE 2DE3A 1ZKBA 3VLUA 3IAZA 3KOSA 1P1WA 4ISUA 3H06B 1Y1MA 1N3WA 1R9LA 2I49A 2DYXA 3PV0E 4I62A 3Q29A 2Y7IA 1MQDA 3TODA 3A3CA 3EHSA 4POWA 4WKMA 3QUJA 3BKIB 3UIFA 5KDTB 1PC3A 4QFNA 1FQEA 2F34A 3KGCA 5TP9B 3BFUA 1MPDA 5AE4A 4X1DA 1A99A 5ICQA 2ESNA 4KHZE 4HTGA 2ZNTA 4Z7EA 3FXRA 5I58B 1B4ZA 3PMVA 2E1SA 3C33A 4OMBA 1NNFA 2RC8A 4OYVA 4NF5A 4LA9A 4YKIA 4F1YA 1D9VA 2P0SA 1FTLA 2X26A 2XXQA 3DP4A 3A09A 2AYSA 3PPNA 1L5TA 3IOTA 1M5DA 4LUBA 3QUFA 5B70A 1O64A 2Z8FA 2DE2A 5AA4A 1IUDA 3QK6A 2UXAA 2XX9A 3T9VA 3GXAA 1MDQA 3R7XA 4YKPA 2AL4A 3RT8A 3GZGA 4YB7A 1BKAA 4EUOA 3K02A 3K6UA 3V5AA 1TXFA 5FHMA 3H6WA 2F6PA 1I6AA 5FHOA 5AA2A 3O6IA 4M1VA 2DWAA 3VFJA 5A5XA 3KEIA 2B3FA 2V25A 2QRYA 1DMBA 4X1BA 1B0LA 3FVNA 1SBPA 1H3DA 2XXHA 4RA1A 3K4UA 4ESXA 4DXBA 2I48A 3HCQA 3S2VA 3C9HA 2D3IA 3I6VA 2G29A 1FQFA 4I9DA 2H25A 3USDA 3K1MA 4Q5TA 1MXUA 2OCUA 4BDMA 3H6TA 2H99A 3VVDA 3O9PA 1J1NA 1LCTA 3Q26A 2HZLA 3FD3A 3V83A 4G77A 4P0GA 1FTJA 1A40A 3G3FA 2RC7A 2OWTA 2DWHA 4WXJA 4OFLA 1FTKA 3M3LA 2CMOA 1B3LA 4OESA 3C32A 3FATA 4H6DA 1FQAA 3C31A 3TDJA 5I57B 3U1OA 2QMWA 1URGA 4IO7A 1RYOA 3KFMA 4AB5A 1R1NA 5KCJB 2H4IA 4GQOA 2PX1A 2GH9A 4P0IA 4LZ5A 5CRYA 2R6GE 4OERA 3UN6A 4OTEA 1MXWA 4AQ4A 3TTMA 1AMFA 4ELPA 1IZ1A 1WDNA 4R6YA 2REGA 1TFAA 4FORA 2F35A 2DP8A 4KCDA 4KFQA 1Y4TA 3H03A 1DPEA 2H98A 1SI0A 2V3QA 1VFEA 3UA8A 2F5XA 1LAXA 3MZ1A 2R71A 4NE4A 3A3UA 3P7IA 1MQJA 5DEXA 5DVJA 1AL3A 4MBPA 4GLIA 1B7ZA 1N04A 2O84X 3E4RA 1PEBA 2I0CA 5TU0A 2O68A 2H9BA 1H43A 5CMBA 1FTOA 3C34A 5JTYB 4ESWA 3JZJA 4U4SA 1RKMA 2QS4A 2XXUA 4FJPA 3D4CA 1A55A 2UVGA 4N13A 2M8CA 2YLNA 4HCWA 3D4GA 3JV9A 4EQ9A 3PPRA 5L9OA 3MP6A 4NF4B 5DVFA 4OWDA 4NWDA 2NUVA 3OO6A 3ILUB 1PB8A 1M5CA 4UA8A 1N3XA 3VV5A 3VVFA 2DS9A 1MY3A 3HHGA 2P1SA 1MXXA 2DOJA 1POTA 4R74A 3B6TA 2ZMBA 1MH3A 1B1HA 4FEBA 3RNNA 3FJGA 5I2KA 5AA1A 4H65A 2Q2CA 1GGGA 3IOVA 4QFOA 3IB0A 3DLNA 1ELJA 4DCXA 1S50A 3H4ZA 3QIMA 4ZZAA 1JQFA 3S9MC 5IKBA 4U23A 1ZMGA 1UQWA 3WAEA 5ITOA 1BIYA 4QFKA 1NNKA 3K00A 3KG2A 2RKMA 2HFBA 1LSTA 1UTBA 3N5LA 2HAUA 3O2AA 2ONSA 4U2RA 3FV2A 3THIA 3TUSA 5H8QB 3CIJA 2FYIA 4IGTA 2XX7A 2V84A 4OHNA 2O7UA 3CI8A 3V89B 4Q30B 5F1QA 5I59A 3CG1A 4BDQA 2NWJA 1JNFA 1Y4CA 4YZZA 4NF6B 3U8QA 1URDA 2UYFA 5I56A 2YJPA 3U94A 2PMSA 4KYDA 4YB5A 3TTRA 4U1OA 2V93A 3M8UA 3ZKLA 3B7DA 4N07A 2R9JA 4U1ZA 1SD3A 3FGSA 3IO4A 4DIGA 3VXCA 2DVZA 3B6WA 3HSTA 4GXSB 2VD2A 1NMUA 3K2DA 1OQHA 3S9NC 3TMGA 3MZBA 4UACA 3PMXA 5AA2D 2F78A 4H0WA 4PP0A 1WVJA 2ZYMA 4X48A 5AA4B 2XXYA 1NNPA 1B3HA 3KSJA 3SESA 3GBBA 1N0TA 1ZU0A 3TFLA 1UIUA 2Z8EA 3U92A 3CSGA 1II5A 3SEWA 2GRVA 5H8FB 1EU8A 1TWYA 2ONKE 4BDNA 1PBPA 5L8DA 2CZLA 3T9UA 3V8XB 5H8HA 2FA7A 1SW4A 2ZYOA 5A5XB 3O28A 2NVUB 3W9VA 4PQJA 1FQCA 3OENA 3TYHA 4YU0A 1EZ9A 1NL5A 1IQ7A 4U4XA 1FW0A 4H1XA 4OQOA 1PB9A 3G7WA 2FNCA 4PFWA 2AIXA 5H8NB 3OO8A 4F29A 4F39A 3FVKA 4XIGQ 1IEJA 5BWJA 1MQGA 4PFUA 1CB6A 4ZEDA 1B58A 3FJ7A 4F2QA 3SDFA 2Z22A 2UYEA 3S9LC 4THIA 4XKQA 2ZYKA 3PUYE 2GFEA 3C35A 1P1OA 1MRPA 2DSFA 1MY1A 4G8HA 1LFGA 3EF7A 4XKRA 1QVSA 2A5TB 3LSWA 4LQ2A 4Q0CA 5FHNA 2XXWA 2Q89A 4DXCA 4F1VA 4Z0IA 4M4GA 1LAGE 2O1LA 4FEDA 2XXXA 1SVXB 1B0HA 2Y7RA 3VLVA 4ZZEA 3FV1A 3O6GA 1B7UA 2W7YA 5CBRA 4IO5A 1RYXA 4QSDA 1I6QA 4F18A 2HQ0A 3PGFA 4O3BA 2DVCA 2QSXA 3EHUA 4BDOA 2ABHA 2RCAA 1LAHE 3L6GA 4FE8A 4F3SA 3UGWA 3W15C 4FAJA 1LLSA 4C1UA 4F19A 1ZIUA 1OMPA 5TPAA 4ZEKA 4EQ7A 4O3CA 1GTKA 2QS3A 2Q88A 3FXQA 4NF8A 3AXFA 2ZXTA 2O6AA 3FVGA 4PE5B 5K2YA 3VLWA 1R9QA 4TOZA 5EHSA 1MPCA 4QFPA 5I2NB 1NH7A 3TKDA 2UVJA 3LSLA 1N7XA 2UVHA 1UIVA 5CC2A 4JBZA 1MG1A 2F8DA 4P11A 3O29A 1XT8A 5KDTA 1QW0A 4X9TA 5DYHA 5I84A 3CFZA 4EQBA 3K6WA 5TP9A 3TTKA 2QS1A 1EH3A 4PETA 3RQTA 1OIBA 1XVXA 4G68A 3ZSFA 1ZLQA 5I58A 4EXLA 3QAXA 4U22A 1DPPA 3LSXA 4C1TA 5CM6A 4OFOA 3FXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N6UA 4AB6A 3SERA 3N94A 1MM7A 4NWCA 1B5HA 4KYSA 3FASA 4O94A 4F2OA 1TT1A 1IMEA 1FQBA 2OWSA 3T9HB 3BBRA 3RN8A 1MXZA 3PPOA 4O7IA 1FPGA 2I4CA 3IOUA 5IZ3B 3IOWA 3R26A 4GWUA 2F97A 3B6QA 4ZE8A 1B3EA 1I69A 4IO2A 4JVIA 1EZPA 1Z7NE 4MH5A 4G8NA 2Q9TA 2FIXA 3H6UA 4YB6A 4GWOA 5EYFA 3ODBA 4RK9A 1Y3NA 2OK2A 2DQVA 3KOTA 1N76A 2QL3A 3E79A 3F11A 1JW5A 1LBCA 3MBPA 2CEXA 1B51A 2VHAA 4G8MA 1RDZA 2XXVA 4MAGA 4PAKA 5IZZA 4RJZA 1FBFA 1LEVA 4GXAA 1MXYA 4O7MA 4LVQA 1SI1A 5K2XA 1O7TA 3C36A 4LATA 2OZZA 2HXRA 2XXPA 2I4BA 3OEKA 4G4PA 4R9FA 4F3PA 1RDXA 3PUZE 4UABA 4KYEA 2Q74A 3FVOA 3IJXB 5CMCA 4G2ZA 1S9TA 4JSOA 1T0KA 1UTHB 2RCBA 4ECFA 1P99A 2UVIA 4XEQA 3H6VA 4AS5A 3HV1A 5FTIA 3H7MA 4R9GA 5L9MA 3E9XA 4LZ7A 5CMKA 3CFXA 1MM6A 4OEVA 3PTYA 5I57A 4LN5A 1K9YA 5KCJA 1ATGA 1FTAA 4BDLA 3VXBA 3OO7A 2THIA 1IXGA 1HSJA 1QUKA 1B3GA 2F6GA 1FCKA 4IB2A 4ELQA 1YPNA 4H5GA 3CSBA 4BLAA 5ISUA 3E3KA 3Q28A 4GVOA 3LUYA 5HBCA 4U21A 2VGQA 4EXKA 3PUVE 4F3GA 1IIWA 1Y3QA 2ZYNA 3OSRA 4ZE9A 4QXDA 2QVRA 4MJOA 3KZGA 4OXVA 1IMDA 2ZNSA 4Q8RA 4OVRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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