1LFHA

Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
b'GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
total genus 219
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA03
1PB9A 4F18A 1DTZA 3OELA 2IEEA 4IGRA 3TQLA 2E1SA 3PPPA 3QIMA 4ELQA 3U92A 2XX9A 2XXIA 4G68A 4OHNA 3GBBA 4G2ZA 3R26A 2NWJA 5DT6A 2ZYOA 3M3LA 2AL4A 3QSLA 4X48A 4EXKA 1LB9A 4L17A 2Z23A 1POTA 3TFLA 1FTMA 2HXWA 4POWA 4LVQA 3GLBA 5KCJA 1MY3A 4R6YA 1P1UA 4THIA 1B05A 4G68B 4LONB 4Q0CA 2GRVA 3FVGA 3MPLA 3C4MA 2XD2A 1NFTA 3BFUA 1H76A 3SEWA 1T0KA 4HCWA 4GL8A 2YPNA 3PPNA 2AL5A 4ZE8A 2H98A 5EHSA 5BWJA 5KCJB 1MQGA 1GVCA 3IOTA 3HO7A 4LQ5A 4PFYA 4FEBA 4GWOA 3RUMA 2XXRA 4RPOA 2Q88A 3O28A 3RLFE 4F1YA 3TTNA 3S9LC 3RN8A 4ZEIA 3A09A 3TCGA 4H5GA 3IO6A 1B6HA 1SI1A 1ANFA 4NMYA 4IY5A 3VE1B 2PYYA 2F7AA 2UVHA 3H6TA 2ALUA 4DXBA 4F3BA 3O29A 1XHYA 3OO7A 4YKPA 1FTJA 2IA4A 2FA7A 2O68A 3U94A 3IR1A 4N6PA 2D21A 2PT2A 4QSCA 3P7IA 1SYHA 1O7TA 2G93A 1ELJA 3B7DA 1OMPA 2ONKE 2DWJA 4F3GA 4H65A 5KZTA 3MBPA 3UORA 1QVSA 2Y7WA 4DCYA 2CMOA 1QUJA 1VE4A 2H4IA 3I6VA 5FTHA 3H6WA 4FJPA 4ZEBA 5LOMA 1YAEA 2PMSA 3CG3A 4QFNA 4RPNA 4U21A 4JWOA 2VP1A 3KN8A 3CFXA 2HZLA 2VGQA 1XOCA 4ZDMA 1USYE 1Y20A 1A8FA 3H6UA 5JEIA 4ESWA 3SEXA 4DDDA 5I58B 3U1OA 1YPNA 3TELA 1AOVA 1OVBA 1EH3A 4UA8A 3C35A 3O2AA 4G8HA 2Y7RA 1PBPA 3VLVA 3UIFA 2X26A 3M8UA 2Z8FA 4ZZEA 3RNNA 3HHFA 1S9TA 4TLLB 2XXYA 1B40A 3CG1A 4I1DA 4PE5B 3IOVA 2NXOA 3H03A 2REGA 2F6GA 2X7QA 3PUVE 3FD3A 4DCXA 4GD5A 4YB6A 1NL5A 5DYHA 3MC2A 3H06B 4GVOA 1ZBMA 4ND9A 2V3UA 4HTGA 1P1OA 2OLBA 3QUJA 2ZNUA 4OQOA 2I0BA 4DXUA 2UXAA 3OEMA 2XXQA 4TLMB 3IK6B 4DZ1A 4YB7A 4N13A 3IOWA 5J1DA 4X1DA 4GLIA 1B1HA 3PUYE 4HCYA 2F34A 3SEYA 3C33A 1N3WA 3AXFA 1SI0A 4MLQA 3SERA 4KD5A 3GZGA 1SW2A 2OZZA 1B9JA 1MXVA 4R73A 1VR5A 1NNFA 3KZGA 4GXSB 5L9MA 4WEDA 1DMBA 4RK2A 2DP8A 2XXXA 5K2XA 1ATGA 2XXHA 4H67A 4FEDA 1OLAA 4G8NA 5A5XA 1MG1A 1SVXB 1IXCA 4QFOA 4LUBA 1JNFA 3SEVA 3TAJA 1B4HA 1GGGA 2F7BA 3Q25A 1N0TA 1RYOA 2M8CA 4R6HA 5A5XB 3EPEA 3G3HA 3USDA 4MF3A 3B6WA 3JZJA 3KJ7A 5DVIA 1GR2A 2OWSA 4KFQA 1ZKBA 1DTGA 5L9SA 1MQJA 2DVZA 1UQWA 4OEUA 3I5OA 1IXIA 3U72A 1TWYA 2Q9TA 1BP5A 1A7LA 2QL3A 4WKMA 5ICTA 3MZBA 1XC1A 3FXUA 2DS9A 2OCUA 1LGBC 2YLNA 2RC9A 1L5TA 4OESA 1JETA 3KOSA 1P1NA 4YICA 4H0WA 3H3GA 1N76A 1SYIA 1JW5A 3C32A 5ISUA 1MY2A 3C36A 3DELB 2FYIA 4K3FA 1R1NA 1B3GA 1IZ1A 1QUKA 2P2AA 4ESXA 3K02A 2HAUA 2F35A 1GTKA 1LCTA 5BUUA 4OYVA 4HS7A 3IB2A 5DEXA 5EHMA 2NVUB 3HN0A 3R7XA 2F5XA 4O3BA 4GL0A 4X9TA 3KSXA 3V83A 1USYH 1RYXA 3O6HA 2Y7IA 1B4ZA 3DP6A 2AYSA 5TP9A 2PX1A 3E13X 5FHOA 3FVOA 5B70A 4GF8A 2I4BA 1UTBA 3K01A 3LUYA 5DEXB 2HZKA 2H99A 4F1UA 3EQ1A 3RGYA 1H44A 1URDA 3W9WA 1Y3QA 3CI8A 1II5A 3TYHA 1B3FA 2H9BA 4M1VA 5TP9B 2F97A 1LFHA 1OIBA 3H4ZA 2I49A 1UTBB 1ZU0A 2R6GE 4G4PA 1UIVA 2VOZA 1JEVA 4QFKA 3MJNA 1SQYA 3G7WA 3KG2A 1O64A 3RTWB 3UN6A 4E0XA 3O6IA 4C1TA 4YB5A 3VFJA 4RK9A 5DTBA 3TPAA 4ISUA 1Y3PA 3VXBA 3HPIA 2ABHA 4LZ5A 3QAXA 5CRYA 2H5YA 1B5JA 3TODA 1HSJA 3OD7A 3ONMA 4IO7A 1ZLQA 1B3HA 3FJ7A 1R9LA 1UTHA 1MPBA 4PFWA 2XXPA 3S4UA 1WDNA 4XKPA 5CMKA 3K0VA 3N26A 4ELRA 1M5CA 1MXYA 3T93B 2ESNA 5CMCA 4DIGA 1IIWA 5ICQA 4KI0E 2O69A 1UTHB 3RY3A 4DLDA 1R6ZA 3TDJA 3QYTA 2G29A 1FQEA 3PU5A 3LSXA 4ZEFA 2ZNTA 2I58A 3SEUA 4FORA 4M4GA 3G3KA 1N84A 3FXRA 2QS2A 1XS5A 1VSOA 2RINA 1R9QA 4PP0A 3PD9A 1A8EA 3PMWA 5M2VA 4ELPA 3H6VA 1F9BA 4KQPA 5JK4A 3OSRA 2QS1A 1P1QA 2I0CA 4EUOA 1FTKA 3FJGA 1WVJA 3K1NA 2LAOA 4RXLA 1B0LA 3MP8A 3OO6A 2XX7A 1BLFA 2DE2A 1AL3A 3ZKKA 1DPEA 3KJTA 5EYFA 1I6QA 2REJA 1YCJA 4IO4A 2V25A 5TU0A 1B7ZA 5TPAA 1EZ9A 3FV2A 4U4SA 2ZMBA 4EXLA 3VLWA 1IITA 5I2KA 2R71A 4R75A 3TEPA 3G3GA 4H1XA 3V8XB 1H45A 3K6WA 4N07A 1B7UA 1D3KA 4LA9A 1MQIA 1MDP1 1DPPA 2D3IA 3OMBA 1SW4A 5ITOA 1LFGA 4DXCA 5TPAB 3HCQA 1AH5A 4IO6A 4C0RA 4POXA 3D4GA 4YMBA 3C31A 1US4A 3N94A 5H8FA 5HPQA 2ZXTA 2XX8A 3OSQA 1O63A 3RT8A 4U23A 3EF7A 4U22A 3ODBA 4O3AA 1MDQA 3R6UA 5I56A 4IO5A 2VD2A 4NTLA 3Q28A 3WAEA 1FCKA 1PB8A 2O51A 4LQ2A 4TQUQ 4QFLA 5H8FB 2O6AA 4EQ7A 4R6KA 1LFIA 1Y4CA 4F39A 2QPQA 5IKBA 1A40A 1N7XA 4EF1A 2WKYA 4MFIA 5HM4B 2DXRA 3MUQA 4YU0A 1LCFA 3G3FA 3BKIB 3QXMA 4F19A 1TT1A 4ZZAA 2I3VA 3RT6B 1JVXA 2F36A 1JW1A 1I6AA 4IGTA 3TTRA 1PBQA 3V89B 4ZS9A 4EQ9A 5AA1A 3O6GA 4OTEA 3LSFB 1SDXA 2P0SA 3U8QA 3IOUA 4GXAA 3GBAA 4O3CA 4U2RA 1N04A 5KDTA 1A99A 5B7DA 4F3SA 2RCBA 1M5EA 4QHQA 3HHGA 4RNSA 1JQFA 4KPTA 1MXWA 3RTFB 2Q89A 4E0WA 2I48A 3QUFA 3V5AA 3S9EA 3EN3A 1FQBA 4FE8A 4NEDA 5KDTB 4G68C 4RJZA 1URSA 4JWXA 4R9FA 4OZ9A 3TTLA 2HFBA 2V3QA 4OERA 3EHSA 4NF8A 1P1WA 1Y1MA 2Q8JA 3TZAA 4F31B 2O84X 1OLCA 2ONSA 4UACA 2B3BA 4GQOA 1J1NA 1POY1 1A54A 1P99A 2OBGA 3TMGA 4JB7A 1LSTA 5CBSA 1CE2A 1SW5A 3RPWA 3KEIA 2B65A 5H8QA 4FAJA 4Q30B 5H8SA 2I6EA 3G3IA 3FASA 1N7WA 3OEKA 1NKXA 4NF8B 3FVKA 2O7UA 3TKDA 4MLVA 5I59A 4DE8A 2ZYNA 3PMXA 1PDAA 1NH7A 4BDMA 4KR5A 5H8QB 4RA1A 1IXHA 4JBZA 2X7PA 2RKMA 5H8HA 1Y1ZA 3ZS6A 3KBRA 4JXIA 2QS3A 3EHUA 3MPKA 3KN7A 1FQDA 3MQ9A 5I59B 1IEJA 2VHAA 4FECA 3CFZA 3OENA 1NNPA 3UA8A 2UYFA 4Q8RA 4ZEKA 5JTYA 5H8HB 3G3JA 4OFOA 4NWDA 4JSDA 1MS7A 4F22A 1EZPA 4KYSA 1MY4A 2QSXA 1FQFA 1MY1A 2HQ0A 5FHNA 3K1PA 3W9VA 3T22A 5FHMA 4WXJA 3PGFA 1IQ7A 4QFPA 3FXQA 4JSOA 1MH4A 5JTYB 4JWYA 3N6TA 3K2DA 1YTVA 3B6QA 3O9PA 5DVJA 2ONRA 4KYEA 1B2HA 5CC2A 1H43A 2Y84A 1Q35A 4QSEA 4Z0IA 1D9VA 4TOZA 4XKRA 1JEUA 4IY6A 2XD3A 3UK4A 4ZEDA 5IAIA 3MVYA 2O1MA 2XXVA 3IJOB 3PD8A 1LB8A 4ZE9A 3C9HA 1MQHA 4OWDA 4KCCA 1B1XA 4YZZA 3SETA 3IB0A 3KSJA 2I4CA 2V3TA 3N6UA 4IO3A 2ZYMA 1Y4TA 4IB2A 1LBCA 2F78A 3PUWE 4RY1A 1LLSA 4R2BA 1QKAA 5L8DA 1B5IA 2DOJA 5AA2A 1MXXA 3D4CA 3FVNA 3C34A 1MQDA 3KGCA 3FV1A 2E0SA 1XVXA 1TFAA 3E9XA 1WODA 2QMWA 1LAGE 4EQBA 2DWHA 3IX1A 2F6PA 1RKMA 4NWCA 3VLUA 4YKKA 3FGSA 4LATA 3A3CA 4G77A 1B51A 4LZ7A 1N3XA 1Z7ME 5AA2B 1BIYA 1LAXA 4XXUA 3JV9A 3CVGA 4IO2A 3LSWA 5L9OA 1S50A 1MPCA 2UVJA 4OVJA 2DWAA 4OFJA 1QKBA 5F7VA 3KOTA 3UP9A 2VD3A 1IXGA 2OK2A 2Y7KA 4F29A 1LBBA 2RCAA 4I9DA 3VV5A 3S9MC 3M3FA 3VDFA 3H7MA 3Q29A 2KLFA 2OWTA 3PUZE 4BDQA 1MM6A 5FTIA 2XXWA 2Z8DA 1FQCA 5CMBA 3FATA 1DSNA 1NMUA 3SDFA 3PPQA 4LZ8A 3TTMA 5CM6A 4XTCQ 4U1ZA 1B58A 4ECFA 1TXFA 2QRYA 2BJJX 4FATA 1QW0A 4NF4A 4PETA 1IUDA 3CRBA 3T9XB 1URGA 5HBCA 3T9HB 1DOTA 1AMFA 3OXNA 5AA2D 1PEBA 1D9YA 4U1OA 3HV1A 3T9UA 4F1VA 3MVWA 5ELVA 4H5FA 3A3UA 3E4RA 3M3KA 3T96B 3MZ1A 4MBPA 2DSFA 4NF4B 1M5FA 3BFTA 1OVTA 3CSBA 3OO9A 1M5BA 4NF5A 2UVIA 2DE3A 1B3LA 3K4UA 4OFLA 1KWHA 1QULA 3PPOA 4GRKA 4ZECA 1ZJLA 1NNKA 5AE4A 4OENA 4EDPA 3IJXB 5I58A 3ZSFA 2H25A 4QF9A 2PT1A 5I2KB 2HAVA 1XT8A 4NF5B 4Z7EA 2V84A 4ELOA 2Y7PA 1SBPA 3F11A 3Q27A 3MP1A 2DE4A 4I62A 4I8CA 1MXZA 2A5SA 3FIRA 3EHTA 3ECRA 5K2YA 2QJEA 1I69A 3IL1B 1QUIA 4G8MA 3TQWA 4H6DA 1OQGA 3ILUB 1B7HA 4Q5TA 1B46A 3CR9A 2DQVA 2FNCA 4BDNA 3MAMA 2GH9A 3MVZA 3FJMA 3LBSA 1NH8A 3LSLA 1LAHE 5I56B 4RYAA 1MH3A 3LC8A 3TUSA 2GHBA 3KN3A 2DXYA 3VVFA 1SW1A 2XXTA 3O66A 4MH5A 2Q2AA 2HEUA 5F1QA 3IAZA 3N5LA 4BDOA 5DVFA 1ZMGA 4YMAA 5AA4A 2GFEA 4F2QA 2W7YA 5I57A 4P0GA 4NE4A 2Q2CA 4YKJA 5H8NA 4NF6A 4AQ4A 4BDRA 3MWBA 1BKAA 2ZNSA 4FIMA 2UYEA 1Z7NE 2YJPA 1XVYA 4R9GA 4AB5A 3L6HA 5AA4B 3IORA 2F8DA 4F2OA 5I2NA 5I57B 4X1BA 1EU8A 2Z22A 3PMVA 1Y9UA 3LR1A 3TTKA 4EF2A 4NF6B 5H8NB 1FTOA 1UIUA 4H8JA 4XKNA 3RQTA 2RF1A 2UVGA 2GHAA 3VVDA 3DLNA 4XIGQ 2PVUA 2XXUA 3ILTB 4BLAA 1Q1KA 4P11A 4QSDA 3GXAA 1B52A 3K1MA 1MXUA 4R74A 5I2NB 3SKPA 3VXCA 3HSTA 2ZYKA 3ZKLA 3OOAA 3PPRA 4PFTA 4WEPA 5CBRA 3DP4A 1ZIUA 3VVEA 2P1SA 2CZLA 1B0HA 3E3KA 4OXVA 2F7CA 1TFDA 3MP6A 1B5HA 3PV0E 2DYXA 1US5A 4GFRA 2DVCA 3CSGA 3K00A 1GV8A 3DP8A 2QS4A 4U4XA 1MPDA 4R72A 4BDLA 1BTJA 3Q26A 5CMMA 2NUVA 3IB1A 4F3PA 4ONYA 1ZTYA 3S2VA 3FZVA 3O97A 1OQHA 3MVXA 5CI5A 1H3DA 4GOTA 3K6UA 1JW4A 3W15C 1NNTA 2ANJA 4OEVA 2RC8A 2AIXA 3UGWA 4OMBA 3JYRA 1B32A 4HW8A 1B3EA 1FTLA 5ITPA 1CB6A 1S7YA 4JDFA 4QRZA 1FQAA 4LP2B 4GIZA 4YKIA 4P0IA 1Y3NA 3T66A 3B6TA 3I3VA 1JVYA 5AA3A 3MW0A 1QJMA 2V93A 2O1LA 2D5WA 5I84A 1AIVA 2R9JA 3KFMA 2PBWA 1I6BA 1LAFE 2OJTA 1SD3A 3IO4A 1MM7A 3CIJA 4H8IA 4AB6A 2O7IA 3TCFA 4R2FA 4XKQA 1HSEA 1PC3A 2XHDA 3U93A 2RC7A 1EZOA 3QK6A 3PUXE 2A5TA 2QMXA 3S9NC 4PQJA 3OO8A 4YAHX 2B3FA 1MY0A 3FUZA 1HSLA 1VFDA 4PFUA 3MZ9A 1VFEA 1FW0A 1D4NA 1PB7A 2THIA 2DWIA 1MRPA 3TCHA 2Z8EA 4KCDA 4OETA 3K6XA 2I3WA 2NOOA 3DM0A 2A5TB 3T9VA 4KHZE 3WAFA 4C1UA 3K6VA 4KYDA 1A55A 3L6GA 3CFLA 2HCAA 3BBRA 3SESA 1M5DA 3THIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NV7A 1PB9A 4F18A 3RPLA 1DTZA 5EYHA 4DI4B 3OELA 2IEEA 4IGRA 2QVRA 3TQLA 2E1SA 3PPPA 3QIMA 4ELQA 3U92A 2XX9A 2XXIA 4G68A 4OHNA 3GBBA 3IFCA 4G2ZA 3R26A 2V4CA 2NWJA 5DT6A 2ZYOA 3M3LA 2AL4A 3QSLA 4X48A 4EXKA 4PC9A 1LB9A 1FBGA 4L17A 2Z23A 2B4LA 1AWBA 1POTA 3RPLB 3TFLA 1FTMA 2HXWA 2PFYA 4POWA 4LVQA 3GLBA 1KZ8A 5KCJA 1MY3A 4R6YA 4GWZA 1P1UA 4THIA 1B05A 4G68B 4LONB 4Q0CA 2GRVA 1NI9A 3FVGA 3MPLA 3C4MA 4OA4A 4P9KA 3RYDA 2XD2A 1NFTA 3BFUA 1H76A 1FBEA 5ET7A 4PDDA 3SEWA 1T0KA 3EKIA 4HCWA 4GL8A 2YPNA 3PPNA 2AL5A 4ZE8A 2H98A 5EHSA 4N8YA 5BWJA 5EQ8A 5KCJB 1MQGA 1GVCA 3IOTA 3HO7A 4LQ5A 4PFYA 4FEBA 4GWOA 3RUMA 2XXRA 4RPOA 2Q88A 3O28A 3RLFE 4F1YA 3TTNA 3S9LC 3RN8A 4ZEIA 3A09A 3TCGA 4H5GA 3PTYA 3IO6A 1B6HA 2XXKA 1SI1A 1JP4A 1ANFA 4NMYA 4IY5A 4PBHA 3VE1B 1FPEA 2PYYA 2F7AA 2UVHA 3H6TA 2ALUA 5ESYA 4DXBA 4PAKA 4F3BA 3O29A 1XHYA 3OO7A 4YKPA 1FTJA 2IA4A 4H45A 2FA7A 2O68A 3U94A 3IR1A 4N6PA 4XEQA 4GX6A 2D21A 2PT2A 4QSCA 3P7IA 1SYHA 1O7TA 2G93A 3CHGA 1ELJA 3B7DA 1OMPA 2ONKE 4O7MA 2DWJA 4F3GA 4H65A 5KZTA 3MBPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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