1LGBC

Interaction of a legume lectin with the n2 fragment of human lactotransferrin or with the isolated biantennary glycopeptide: role of the fucose moiety
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
HYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Complex(lectin/transferrin)
publication title Structures of a legume lectin complexed with the human lactotransferrin N2 fragment, and with an isolated biantennary glycopeptide: role of the fucose moiety.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LEGUME ISOLECTIN II (ALPHA CHAIN)
total genus 40
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lgbC00
4G77A 1JVXA 1OMPA 5TPAA 3IJXB 3HN0A 3GLBA 4KCCA 2F7BA 4BDLA 2F35A 3FV1A 3CFXA 1POY1 3EHTA 1FTLA 1P1OA 1GV8A 3EN3A 4N07A 3U94A 1B7ZA 4KCDA 5H8FB 5CRYA 3V5AA 2DSFA 3K00A 5ITPA 1PBQA 3FV2A 2UYFA 3KJ7A 1MQIA 2PMSA 1Y4CA 3H7MA 4X1BA 4NF5A 1MXZA 1MXUA 4R6HA 3C34A 3O6HA 3N5LA 4NF6B 4F3GA 4FECA 1N3XA 1B5JA 2QL3A 5I56A 2V3QA 3VLWA 4YMBA 5B7DA 2XXXA 2ZYNA 2Q2CA 1USYH 3KG2A 5I2KB 1EZ9A 3W9WA 4AQ4A 3FIRA 2F36A 1ZU0A 3V89B 3H4ZA 5TPAB 2YJPA 3PMWA 1JW1A 3LR1A 1MQDA 1B9JA 4FE8A 1B3HA 2XD3A 1XS5A 2V84A 3IB2A 3CIJA 3IK6B 3ZS6A 4R73A 1N76A 4BDNA 2Z8EA 3Q29A 4OYVA 4IO7A 2NOOA 1IUDA 2UYEA 5L9SA 3MZBA 1B32A 5FHMA 3H6VA 2A5TA 1IQ7A 3BBRA 2QJEA 3G3KA 1A8EA 3MVXA 1M5FA 5I57A 3DLNA 1OQGA 1CB6A 4XIGQ 1B3GA 4M1VA 4F19A 3OO9A 1A55A 2I49A 2RKMA 4NF5B 1UTBB 2UVIA 4THIA 4EQ7A 1MQGA 1B3LA 2FYIA 2FA7A 1PEBA 4LVQA 1M5BA 5CMCA 4YZZA 1SW1A 4MLVA 3THIA 4Z7EA 3G3HA 3K01A 4JDFA 5I84A 3IB1A 1EZOA 3K1NA 1MXWA 1B52A 4R74A 3TTKA 1SI0A 4R72A 4HW8A 2H99A 5JTYB 4DCXA 2DWAA 5EYFA 3TUSA 4UA8A 1II5A 3WAEA 4BDRA 2DS9A 2GHAA 1MY0A 1AIVA 1F9BA 4F1UA 3KZGA 3K1MA 3O2AA 1D9VA 2D5WA 3UA8A 5I59A 3KGCA 4ZDMA 4ZECA 4ZZEA 1FW0A 3I5OA 2AYSA 1LB9A 4DXBA 2HZKA 4N6PA 1FQBA 3OXNA 3RGYA 1B2HA 3JZJA 1LAXA 3C32A 1P1QA 3HCQA 2Z8DA 3Q27A 3T9XB 4YKJA 3FXRA 3RT8A 1DTGA 3CSGA 3MBPA 5I57B 4YKKA 3UP9A 1JW4A 1LBBA 1HSEA 2NUVA 1JEUA 4GVOA 3TYHA 2XXPA 3T66A 4U1ZA 4GL8A 2UVJA 3IL1B 4FJPA 1A99A 4QHQA 3QXMA 1LBCA 4KR5A 2F7AA 4P11A 4OEUA 3L6HA 4F22A 5B70A 5DEXA 3N6UA 2XXQA 4F3SA 1US4A 1QKBA 1A54A 2I4BA 1MY2A 4X9TA 2PX1A 3U8QA 4QFKA 5CMKA 1LSTA 5CMMA 4GXSB 1MM7A 4TQUQ 2DWHA 2VD3A 4RPOA 3VV5A 2V25A 4LQ5A 1T0KA 3H03A 3IOVA 4LATA 4QFPA 3Q28A 4GLIA 3QSLA 4OHNA 2XX9A 5I59B 1ZBMA 1YAEA 4OERA 3Q25A 4NWCA 5CC2A 1FTMA 3RY3A 2DXYA 1DPEA 3I6VA 5ITOA 4GFRA 3SERA 4IGRA 2GRVA 1SW5A 3S9LC 2YPNA 4JWOA 3M8UA 1B6HA 4EDPA 1ZMGA 1JW5A 1P1NA 5DEXB 4C1TA 4PE5B 2HEUA 2DOJA 2B3FA 1FQCA 4FEDA 4IY5A 1MDP1 2V3UA 5FTHA 3A09A 4U1OA 4POWA 5A5XA 1POTA 2G93A 3KN8A 1FQFA 1N3WA 3IAZA 3TPAA 4F1VA 1LCTA 1LLSA 1B7UA 1DPPA 3K6UA 2I0CA 3OO8A 1LFGA 2REJA 2Y7WA 5AE4A 3MWBA 4JXIA 2G29A 1FTJA 2Z8FA 4GRKA 4H1XA 3S9EA 2ONSA 1P1UA 3TODA 2BJJX 4HCYA 2H5YA 2THIA 1TWYA 2WKYA 4F2OA 3LSLA 3RLFE 1TFDA 2Z23A 1B3EA 3MAMA 1HSJA 3QIMA 3QUJA 2QS3A 4IO3A 5FHNA 3SEXA 5H8QA 4ELPA 3FJMA 1ELJA 1ANFA 1ZLQA 2XXHA 4H5FA 1IITA 4FEBA 3C33A 1B05A 4LZ8A 4XKNA 5EHSA 2I6EA 3M3LA 3TTMA 5K2XA 1A40A 4EQBA 4QFOA 4NF4B 2REGA 2XXUA 1OVBA 2UVGA 3TELA 3N6TA 3OEKA 2DWIA 3FGSA 1B4HA 3Q26A 1VE4A 4OQOA 3O6IA 1LAFE 1EU8A 3PUZE 5A5XB 4C1UA 4P0GA 2RCAA 1URGA 2XXVA 4RK2A 3DM0A 5AA2D 3H6UA 3OSRA 3HPIA 1DMBA 2OBGA 1FCKA 3IOTA 4X1DA 3PMXA 1MY3A 3PMVA 4EUOA 2QSXA 2XX7A 3IO4A 4ELQA 5FHOA 1XOCA 1R9QA 2R6GE 1R1NA 4OXVA 2Y84A 2A5SA 4U22A 1JQFA 5I2NB 2R71A 1AOVA 4M4GA 1NH8A 4OMBA 3TQLA 3G3JA 1LB8A 4BDMA 5H8QB 3EF7A 4PFUA 3RTFB 1MY1A 4GF8A 1UIUA 1N7WA 4FATA 3T9VA 4GXAA 4QFLA 4OWDA 3CRBA 1OQHA 3IOWA 3U1OA 2DVZA 1MXYA 4OEVA 3IO6A 2ALUA 3TKDA 4DXCA 2AL5A 3G3GA 4O3CA 5AA2B 1Q35A 2VP1A 4I8CA 3U72A 5AA4A 4ZE9A 3LC8A 2ZNUA 4Q5TA 3LSXA 4R6KA 1JETA 1HSLA 2OK2A 4GOTA 5IAIA 3IOUA 1EH3A 3C31A 5DT6A 1SBPA 3OEMA 1S7YA 3H3GA 4Q8RA 1YCJA 1MH4A 3EHSA 4NTLA 3KBRA 2ONKE 2D21A 1BIYA 4TLMB 4QFNA 3MPLA 2OCUA 4QF9A 3K1PA 1D9YA 4JSOA 3CR9A 1SYHA 3MZ9A 1QUIA 3A3CA 3DP8A 2B65A 3I3VA 4H5GA 3ILTB 2XXTA 4Q0CA 3HHGA 1OIBA 5TP9A 1PC3A 3E9XA 4GD5A 4IO5A 1SI1A 1TT1A 2O68A 3K02A 1LAHE 1S50A 5KCJA 4JWYA 4ZZAA 4OENA 1JNFA 4U23A 4OVJA 3O97A 2ABHA 3FATA 2RINA 3FD3A 3HV1A 2ZYKA 4DDDA 3O6GA 4XTCQ 4I1DA 4OFJA 5JEIA 3ODBA 2M8CA 5CBSA 5I56B 1YTVA 3JYRA 3CFLA 3VE1B 2ZYOA 3KEIA 4F3PA 5AA4B 2XHDA 3MP8A 4NF8A 1OVTA 2F6GA 4H67A 2ANJA 4ESWA 4ZEDA 3ZKLA 3H6TA 1I6AA 4OFOA 1IXCA 4QSEA 1Y3NA 1LFHA 3W9VA 3EHUA 3PD8A 4NE4A 3VDFA 4DCYA 3F11A 4BLAA 1B58A 1PBPA 3T9UA 3FUZA 3M3FA 1Z7ME 2E1SA 1WDNA 3FVNA 3LSWA 5F1QA 2ZYMA 1LCFA 3PPNA 2YLNA 4KYEA 4ONYA 2H25A 1MG1A 2O69A 2A5TB 4ECFA 1US5A 3PGFA 3GBBA 3TTRA 3VFJA 1SW2A 3PU5A 2DVCA 2PT2A 1KWHA 2I4CA 1B4ZA 4G8MA 2Q9TA 2Q88A 2V93A 4DLDA 3VVDA 4IB2A 4U4SA 1MS7A 3TCGA 5JK4A 4F29A 3FVKA 2D3IA 2Q8JA 4I62A 3SESA 3IJOB 5KCJB 5F7VA 1MRPA 2XXRA 3OELA 4H0WA 4EXKA 4JBZA 2ONRA 2RC7A 3T22A 2DQVA 1NNTA 3KN7A 1A7LA 3MP6A 1WVJA 4YB7A 2B3BA 1ZTYA 3TMGA 1LAGE 4G2ZA 5IKBA 2O1LA 2NXOA 4DE8A 2QRYA 4R2FA 2HXWA 3G3IA 3QAXA 2P1SA 4BDQA 1FQDA 4DIGA 5M2VA 4NF8B 4XXUA 4LA9A 3TZAA 2V3TA 3SEWA 1URDA 3FVGA 1TXFA 1R6ZA 3KFMA 1DSNA 3DP4A 4GQOA 3OO6A 2F78A 1N7XA 1JVYA 4RPNA 2XXYA 4BDOA 3UORA 4ELOA 2F7CA 4RXLA 1XHYA 4KI0E 1QW0A 3BFTA 3PUXE 2GH9A 1SDXA 1MQJA 1YPNA 3T96B 4ZE8A 4R6YA 1BP5A 1XT8A 3M3KA 3LUYA 5HPQA 2DE3A 3QK6A 4H65A 2OZZA 2AIXA 1CE2A 1H76A 5J1DA 4L17A 3RUMA 2H4IA 1MXVA 4PETA 4Q30B 5CBRA 5EHMA 4G68A 4AB6A 2Q89A 1M5EA 3PD9A 3TFLA 1N04A 4GL0A 3K6XA 3ZSFA 2VOZA 3RQTA 4TOZA 1Z7NE 5I58A 3MQ9A 3D4GA 3R7XA 3O28A 4QRZA 1B7HA 3CG1A 4MBPA 2F5XA 4R9GA 4GIZA 2O7UA 4PFYA 1NNPA 4ZEFA 1MDQA 3WAFA 2VD2A 3ECRA 4RJZA 3PPRA 2NWJA 3GZGA 2GHBA 2IA4A 4WKMA 4ELRA 4K3FA 1NNKA 1QKAA 3N26A 4QSCA 2Z22A 3TTLA 1NH7A 3CG3A 1BTJA 3SEYA 4O3BA 2PYYA 3H6WA 1IXHA 1USYE 2I0BA 1Q1KA 1B3FA 5KZTA 3GBAA 4PP0A 4R75A 5H8FA 2Y7PA 3HSTA 1VR5A 4ESXA 2HFBA 1J1NA 2VGQA 3FZVA 3EPEA 3N94A 2RF1A 4R2BA 1L5TA 1O64A 2O1MA 1N0TA 1URSA 2X7QA 1MM6A 2UVHA 4AB5A 4G8HA 1VFDA 3MJNA 4FIMA 2CMOA 3CSBA 1VFEA 3OO7A 3TCHA 2ESNA 4C0RA 2HQ0A 2DE2A 4G68B 2HZLA 2QS4A 3V83A 4U2RA 4ISUA 2QMXA 1PB7A 4LP2B 2X7PA 3S2VA 3S4UA 3RTWB 1XVYA 3MZ1A 3R6UA 5I58B 4YB5A 2F97A 4IO4A 3PUWE 3FVOA 3IX1A 1AMFA 5DVJA 4U4XA 2O51A 1NL5A 3P7IA 2VHAA 1MPCA 3KJTA 5DTBA 3HHFA 2P0SA 4PFTA 4KD5A 4XKRA 4TLLB 5HBCA 2F8DA 4KFQA 3MC2A 4YAHX 2R9JA 2O84X 4POXA 3FJ7A 3KSXA 1B5HA 5AA3A 3OD7A 3K6WA 3FASA 1NKXA 3PV0E 3TAJA 5ISUA 4ND9A 1Y1ZA 2DP8A 1BLFA 3DELB 3OENA 5L9MA 3IORA 2O7IA 5DYHA 1UTBA 3C36A 3PUVE 3MVZA 4DXUA 2QPQA 2ZMBA 4JB7A 1B1XA 2DYXA 4FAJA 3SEUA 1SQYA 1FTKA 1I6QA 1RYOA 3RPWA 4YKPA 3G3FA 4LUBA 3SDFA 1QUKA 4G68C 1UQWA 3C35A 4O3AA 1OLCA 1IXGA 3CFZA 2UXAA 4RY1A 4OFLA 3B6TA 3G7WA 3DP6A 3MVWA 1ZJLA 2I58A 4YMAA 3VVEA 5JTYA 3B6QA 3RNNA 1EZPA 1R9LA 1I6BA 2I3VA 4WXJA 1UTHA 1B46A 3IB0A 1NMUA 1XC1A 1FTOA 1DOTA 3OMBA 1LGBC 4MFIA 1PDAA 1GR2A 4RA1A 2E0SA 1B51A 2P2AA 5LOMA 3KOTA 1MH3A 5BUUA 1FQAA 3PUYE 4G8NA 5L9OA 1GTKA 4H8IA 3S9NC 1Y3QA 4RYAA 2PT1A 3ILUB 4YICA 2PVUA 3TTNA 2Y7RA 3IR1A 5CM6A 1O63A 2HAUA 4KYDA 4IY6A 4PQJA 5BWJA 3O9PA 3K0VA 4E0XA 1PB9A 2QS2A 3UK4A 4YB6A 4UACA 3ONMA 1H45A 2CZLA 2F34A 3D4CA 3BKIB 3SKPA 4Z0IA 2LAOA 3C9HA 1BKAA 4OESA 3V8XB 4HS7A 1B1HA 5H8NA 4JWXA 4E0WA 2OLBA 4RK9A 4X48A 3L6GA 3TEPA 4WEDA 4JSDA 4EF2A 4F2QA 3JV9A 1OLAA 5ELVA 1M5DA 3SETA 1UTHB 2DE4A 2W7YA 3USDA 1Y3PA 4DZ1A 1D4NA 4IGTA 4OTEA 5L8DA 4F18A 4IO2A 2H98A 4R9FA 2Y7KA 1SVXB 1AL3A 1P1WA 3UIFA 2OWSA 1QJMA 1B5IA 4HTGA 4LONB 4F39A 5AA1A 5TP9B 3AXFA 2RC9A 2OJTA 1S9TA 1UIVA 3KSJA 2OWTA 4U21A 5CMBA 3FXUA 5DVFA 4LQ2A 2O6AA 4LZ7A 5KDTA 1SD3A 2DXRA 4ZS9A 3QUFA 1WODA 1VSOA 1B0HA 4XKQA 1P99A 4RNSA 1Y1MA 2FNCA 5ICTA 1ATGA 3O66A 4KYSA 3MUQA 1TFAA 4KPTA 1IEJA 1RKMA 4QSDA 1AH5A 5H8NB 1Y20A 3LSFB 3QYTA 2PBWA 1ZIUA 5TU0A 4GWOA 3OSQA 1IIWA 3LBSA 5K2YA 1H43A 3K6VA 3H06B 4XKPA 5H8HA 4MH5A 2XD2A 4MLQA 3S9MC 4ZEIA 2F6PA 2DWJA 3VVFA 1SYIA 4FORA 4NWDA 3UN6A 4EF1A 4YU0A 1QUJA 3ZKKA 2Q2AA 1N84A 3RT6B 3B6WA 2XXWA 2AL4A 2QMWA 3BFUA 5H8SA 1D3KA 4EXLA 3MVYA 3O29A 3T93B 4OETA 3TQWA 3C4MA 1O7TA 2RCBA 4F31B 3VXBA 2X26A 5ICQA 3PPQA 4IO6A 1MPDA 1QULA 2ZNSA 2IEEA 4G4PA 2ZXTA 4OZ9A 3FXQA 4NF4A 1JEVA 4F3BA 3U92A 5KDTB 3EQ1A 1MQHA 4ZEBA 3CI8A 4KQPA 1XVXA 2H9BA 4H8JA 1IZ1A 4ZEKA 1MXXA 1LFIA 3PPPA 4YKIA 3SEVA 1DTZA 4I9DA 4P0IA 3CVGA 1GVCA 3R26A 1IXIA 3U93A 3MW0A 3TDJA 1ZKBA 4HCWA 3OOAA 4WEPA 3GXAA 2NVUB 3FJGA 4NMYA 1Y9UA 2ZNTA 3T9HB 3KN3A 3VXCA 4LZ5A 3MP1A 3W15C 3RN8A 1SW4A 1RYXA 1H44A 1B0LA 3UGWA 2HCAA 1H3DA 4H6DA 1B40A 5HM4B 5H8HB 2RC8A 1GGGA 3K2DA 4PFWA 2HAVA 5I2NA 2KLFA 1MY4A 1I69A 3KOSA 4MF3A 3E13X 1QVSA 4KHZE 1NNFA 1M5CA 2I48A 3E3KA 4NF6A 4NEDA 2XXIA 3VLVA 5FTIA 4EQ9A 3TCFA 1NFTA 4N13A 2Y7IA 2XX8A 3A3UA 3VLUA 5CI5A 3MPKA 3PPOA 3B7DA 1MPBA 5AA2A 1Y4TA 3K4UA 1PB8A 2QS1A 1A8FA 5I2KA 2GFEA 5DVIA 3E4RA 3HO7A 1FQEA 2I3WA 4F1YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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