1LGBC

Interaction of a legume lectin with the n2 fragment of human lactotransferrin or with the isolated biantennary glycopeptide: role of the fucose moiety
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
HYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of a legume lectin complexed with the human lactotransferrin N2 fragment, and with an isolated biantennary glycopeptide: role of the fucose moiety.
pubmed doi rcsb
molecule tags Complex(lectin/transferrin)
molecule keywords LEGUME ISOLECTIN II (ALPHA CHAIN)
total genus 40
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lgbC00
4ZEKA 3HN0A 1ZMGA 3HV1A 1T0KA 1B4ZA 3FATA 4E0XA 3TODA 3SEVA 1MQIA 1A55A 3HPIA 4F3BA 4KR5A 5CBSA 2V84A 3BBRA 1R6ZA 5B70A 4JDFA 3TQLA 3LSLA 3V8XB 3CR9A 1IXHA 2R9JA 1MDQA 2F5XA 4ZEBA 1DTGA 4R9FA 2PVUA 2QRYA 1PEBA 1NL5A 3W9WA 3GBBA 4KPTA 2ANJA 3TYHA 4G8HA 5CMKA 5H8HA 2Z23A 3WAEA 2GHAA 4BDQA 5J1DA 2XXWA 3IOTA 3PUXE 4KI0E 3O2AA 1DPPA 2OZZA 3C4MA 2O1MA 4HCYA 3RY3A 3K1NA 2F7AA 4IGTA 2DWJA 2HAUA 1UTBA 3N26A 3T22A 4KHZE 1B1HA 2OCUA 4R2FA 4P11A 4ZE9A 1OVBA 3DLNA 4PQJA 2D3IA 2Y7IA 1IQ7A 2XXPA 4F19A 4KD5A 4TQUQ 3KJ7A 3FGSA 4R74A 3VXCA 3K1PA 3T9UA 3I6VA 3JZJA 2NOOA 4O3AA 1YCJA 3MC2A 2O68A 2X7PA 3OENA 4QSEA 5A5XB 1A40A 5I56A 1URSA 4RYAA 1URDA 4XKPA 2Y7RA 1J1NA 4QF9A 1H3DA 3UORA 3H06B 4C0RA 1CB6A 1B58A 3R26A 1MQJA 1MH3A 4XIGQ 1B3HA 3FVOA 4GOTA 1IIWA 2D21A 4FAJA 5K2YA 4YKIA 3CSGA 1AL3A 4GVOA 2I4CA 2G29A 4LONB 2OWTA 5AA4B 4X1DA 1Q35A 2XD2A 2DQVA 2P0SA 4G77A 1GR2A 4GL0A 4PFUA 1DMBA 4F1VA 1GGGA 4Q8RA 3DM0A 4YB6A 2XXIA 3CSBA 4K3FA 5DVIA 4U21A 4YAHX 5JEIA 4OFLA 3U92A 1NNTA 3C34A 2QS4A 4Q5TA 3C9HA 1IXGA 1M5DA 2NVUB 1ELJA 3EPEA 1KWHA 1QKBA 3SEWA 2YLNA 3HHGA 3C35A 1ZKBA 3T96B 3FD3A 4R6YA 3RT8A 4DLDA 1MH4A 1VFDA 4R6KA 2X26A 4WEDA 4NF8B 3O28A 1SW4A 1MY3A 1XVYA 1Y9UA 2E0SA 3TEPA 5ITOA 1XHYA 3TAJA 4RPNA 1JW5A 4H5GA 3I5OA 1XT8A 5H8FB 3MVYA 4HS7A 2UYFA 5I59B 4IO7A 2XXHA 3GZGA 3N6TA 4NMYA 3CIJA 3TCGA 3UN6A 1MXWA 2OWSA 1IUDA 1MPBA 4IO3A 3O6HA 3S9NC 1SI1A 4ZZAA 1MXXA 1SBPA 2D5WA 2XXRA 4RK2A 3FJ7A 3KN8A 2P1SA 5CMCA 4LQ2A 1PB7A 1XS5A 4EQ7A 1SD3A 1MY1A 4RJZA 3Q27A 1Y3QA 2UVJA 1QUKA 3A3CA 3IJXB 3TQWA 4C1TA 2ZYOA 2AYSA 4RNSA 3H03A 3QIMA 1B5HA 2ZNSA 4ESXA 1B5IA 2ONSA 1MY4A 1FQCA 4NF6B 1D3KA 1MXYA 3U93A 4POXA 4H8JA 5DTBA 3G3GA 3PPOA 1L5TA 2XX9A 1LBCA 2O7IA 4ONYA 1BIYA 4KYSA 1DSNA 2FYIA 3ZSFA 4FIMA 4R6HA 2Y7PA 4IY5A 1M5BA 2VD3A 4QFPA 2XXXA 3IAZA 2XHDA 4LZ7A 4X9TA 4I9DA 5B7DA 3PPNA 1LFHA 2DWAA 1I6QA 2F36A 4Q0CA 4AB5A 3SERA 1SYIA 5I2KA 3PPQA 2V93A 2UVHA 3H6VA 4ZEDA 1B9JA 1LAGE 3Q28A 1MXZA 4QRZA 1UIVA 1YAEA 2DE2A 2UYEA 1JEUA 4G8NA 3S9MC 3S4UA 3UGWA 3MP6A 4IO4A 5H8QB 3IOWA 4XKRA 3VVEA 2DYXA 3O6IA 4MF3A 3GXAA 3KG2A 4M1VA 1OLCA 1P1QA 3OSQA 2ZNTA 1FTMA 1NH8A 2P2AA 1O64A 4LVQA 3P7IA 3ZS6A 4H8IA 1A99A 4G68A 4QSCA 4ELQA 3PMWA 4OEUA 4IO2A 2YPNA 2M8CA 4EQ9A 1EZOA 4OVJA 1EU8A 4WXJA 1B7HA 3G3FA 4OETA 3N94A 3V5AA 2RKMA 3QK6A 2DE4A 5LOMA 2RINA 3FUZA 4XTCQ 2F6GA 1BKAA 4ZEIA 3FXRA 3E9XA 3K0VA 3QYTA 4HTGA 2H25A 2YJPA 1JVYA 3ILUB 1JEVA 1LCFA 2QMXA 1USYE 1R9QA 3WAFA 3IOVA 2REGA 5DEXB 3QAXA 4NF4A 3LSFB 2I49A 1N7XA 4U4SA 2NUVA 1FQAA 3QSLA 4F3SA 2UVGA 1WDNA 1B7ZA 4BDNA 1N3WA 3MZBA 1TXFA 1B1XA 5TPAB 3O66A 4JXIA 3JYRA 3FZVA 3H6UA 1LAHE 4O3BA 4FECA 3TDJA 5CM6A 3K2DA 4NWDA 1AIVA 4X48A 3S9LC 3B6QA 2B3BA 4HCWA 4F39A 3MVZA 1TWYA 1POY1 1D4NA 2HCAA 1Z7ME 2DXRA 3IL1B 3UP9A 2Y7WA 1MDP1 4H5FA 3RPWA 1FTLA 4GL8A 1XVXA 1MXVA 5KCJB 1B51A 3OXNA 1B4HA 1BTJA 3C36A 2B3FA 1NNFA 2OJTA 2PYYA 3FASA 4QSDA 1NKXA 1MQDA 2F97A 4ISUA 4KYDA 4LZ8A 1ATGA 1B0LA 4ZEFA 5KZTA 4OXVA 3CG3A 2QMWA 1A54A 1IITA 1QUIA 5M2VA 4U4XA 2DS9A 1LCTA 3G3KA 4PFTA 5JTYB 4H0WA 1B52A 1B3GA 1JQFA 3KSJA 3ZKKA 3PPRA 4YKPA 5I57B 3ONMA 1MXUA 4ND9A 3B6WA 3IO4A 3HCQA 2PT2A 1B3FA 3PMVA 5HM4B 2IA4A 4JB7A 1FW0A 4MFIA 2RCAA 1OVTA 4YKKA 3VE1B 2DP8A 4NTLA 4R2BA 2PT1A 3E3KA 3TTMA 3LBSA 4M4GA 3FV2A 5F7VA 3L6GA 4DE8A 2V3TA 2HXWA 2R6GE 3OD7A 4RA1A 3IK6B 3QUFA 2O84X 3W9VA 5A5XA 5CMBA 1F9BA 4OFOA 1B6HA 1JW4A 3IB0A 4NWCA 3EQ1A 4GF8A 3LSXA 1D9YA 3O9PA 3CG1A 3OO9A 4JWXA 1MG1A 3O6GA 2VOZA 4PFWA 2W7YA 2XX8A 4OYVA 4E0WA 4MH5A 4F2QA 1DOTA 1DPEA 3IR1A 4BDMA 5I84A 2A5TB 4DCXA 3G7WA 3TKDA 2O7UA 3MQ9A 1B05A 1OMPA 2HZLA 4FEBA 1PBPA 1UTHB 2I58A 3Q29A 5AA4A 1B46A 1LBBA 3OO8A 4G8MA 1YPNA 4DDDA 1Z7NE 3FJMA 1BLFA 3CFZA 4JWYA 5BWJA 4WEPA 4FEDA 1MS7A 4OERA 3MZ9A 5AA3A 3R7XA 3BKIB 3IX1A 2E1SA 3EHUA 3QXMA 4POWA 3RT6B 3UK4A 4GRKA 5AA2B 1IXIA 2Z8EA 3KZGA 1LB8A 1EZPA 4AQ4A 1H45A 1MQHA 1R1NA 1N0TA 1Y3PA 3MPLA 3PD9A 1FCKA 1EH3A 2F35A 3CRBA 2Z8FA 3VVDA 2ZYKA 1OQHA 4TLLB 3IB2A 4P0IA 1M5FA 3TELA 4GLIA 3I3VA 1URGA 2LAOA 3IORA 1XC1A 4F31B 4N07A 3PGFA 2H99A 1O7TA 3A3UA 1PB9A 4NF8A 4NF5B 2O1LA 5CC2A 2OBGA 3MVXA 3M8UA 1ZIUA 1PBQA 2ZYMA 2HQ0A 3TMGA 5H8FA 5I59A 1SI0A 1MQGA 2AIXA 1IXCA 1LB9A 2HFBA 5EYFA 2ONRA 1JVXA 4LQ5A 3D4CA 2CMOA 2AL4A 4EXLA 3QUJA 2H5YA 1D9VA 3K6UA 4PP0A 3KEIA 5I2NB 3EHSA 3VVFA 1LAXA 3RN8A 2REJA 5TP9B 1R9LA 3BFTA 4FATA 2ZXTA 3PUWE 1MY0A 4OWDA 3KN3A 1FTKA 1MRPA 2I48A 1US4A 4ZDMA 1FTOA 2Z8DA 1VSOA 4JWOA 3V83A 5BUUA 5CI5A 4BDOA 3SEYA 2QS2A 3K00A 2Q8JA 4H1XA 5L9OA 5CRYA 4NF6A 1B3LA 4Z0IA 3KFMA 4GIZA 1OIBA 4MLVA 3V89B 4OENA 3RTFB 4R75A 3TTRA 1Y3NA 2OLBA 1M5CA 5AA1A 2PX1A 3KN7A 4FJPA 4R9GA 1O63A 4TOZA 3ECRA 2DVCA 2G93A 4YICA 2DSFA 2VGQA 1VR5A 4LP2B 4YMBA 4G68C 4I62A 4UA8A 3VLVA 1II5A 2VD2A 4LA9A 3KGCA 4C1UA 1NFTA 1LFGA 3TPAA 3RNNA 5FHMA 3KSXA 2KLFA 5FTIA 4BDLA 3CFLA 2GH9A 4MBPA 1JETA 1A8FA 1H43A 3H7MA 2HZKA 3MP1A 4PFYA 3TUSA 1H44A 5H8QA 1B40A 5F1QA 5IKBA 1N76A 4YB5A 1FQBA 1A8EA 1MM7A 2UXAA 1SW1A 4F2OA 3T9VA 5ICQA 2ONKE 1LGBC 3FVGA 1UIUA 4N6PA 4F18A 4ESWA 1N3XA 4OFJA 3RUMA 1AH5A 1ZBMA 4XKNA 1MPCA 5KDTB 2GHBA 2I3VA 2PMSA 4GQOA 3IJOB 3MW0A 2O69A 1JNFA 4ECFA 3B6TA 2Q89A 3FXQA 4FE8A 3RTWB 3PPPA 5HBCA 3KOTA 2H98A 3H6TA 2XD3A 4YMAA 3HSTA 4H65A 4QHQA 4U22A 2XXTA 1RYXA 4DZ1A 4QFLA 3T9HB 4QFNA 2Q88A 4YZZA 3GBAA 2CZLA 4H6DA 2VP1A 3Q26A 4F3PA 4KCDA 2X7QA 3E4RA 1SW5A 2BJJX 4KYEA 2ALUA 2Y7KA 4EUOA 5DEXA 3DELB 4IGRA 1N84A 4GXSB 4IB2A 1FTJA 4IO5A 4NE4A 1LLSA 5H8HB 2Y84A 2FA7A 3FIRA 5FTHA 5TPAA 1QKAA 2QL3A 1GVCA 3H3GA 3MUQA 1S7YA 3C33A 3RLFE 3KBRA 4R73A 1B5JA 3G3IA 3MP8A 4MLQA 4F22A 1UTBB 5L9MA 3VV5A 1NNKA 3OOAA 3SEXA 4RPOA 4U23A 3O97A 2H4IA 3K01A 5DVJA 3OEKA 4LZ5A 1AOVA 1B2HA 1ZLQA 4ELRA 3LC8A 3HO7A 2HEUA 2F34A 5KCJA 1M5EA 1I6BA 1NH7A 2H9BA 3HHFA 3DP8A 3IOUA 4YKJA 2I0CA 5TU0A 3PMXA 3SDFA 4KQPA 2HAVA 2WKYA 4GFRA 3RQTA 3EHTA 4IY6A 1N04A 3TZAA 3H6WA 5ITPA 5H8SA 2NXOA 3OO7A 1HSEA 1SDXA 5CBRA 2UVIA 5I56B 1MY2A 1P1NA 2VHAA 3CVGA 1QVSA 3M3KA 5JTYA 1NNPA 3N6UA 1P99A 1Y1ZA 2RC9A 5HPQA 3SEUA 1BP5A 1TFAA 4F3GA 3ZKLA 1IZ1A 2Q2CA 5L9SA 1SVXB 3LUYA 3K4UA 1POTA 4PETA 5H8NB 5I57A 3DP6A 1S9TA 3K6VA 4O3CA 4JSOA 2RF1A 3GLBA 3OEMA 4PE5B 2ZNUA 3U72A 5ELVA 3O29A 4OHNA 1UQWA 3U8QA 1VE4A 4IO6A 2F78A 3K02A 3UIFA 3TTLA 4ZECA 5ICTA 1QJMA 3PD8A 4H67A 2RC7A 3D4GA 5H8NA 3MPKA 4U2RA 3RGYA 1B32A 3K6WA 1ZTYA 2I3WA 2F7CA 4F1YA 2I6EA 3VXBA 3B7DA 4NEDA 4L17A 1IEJA 3AXFA 1US5A 1FQDA 2GRVA 4HW8A 4GD5A 1Y4CA 1PDAA 3N5LA 2RC8A 1RKMA 3MBPA 4Z7EA 3VFJA 2XXVA 3U1OA 2A5TA 5JK4A 2I4BA 3BFUA 1FQFA 3IO6A 1PB8A 5DYHA 3IB1A 5CMMA 2F7BA 5EHMA 2XX7A 2ESNA 3K6XA 3KJTA 1UTHA 3PUZE 5L8DA 4OEVA 3Q25A 3U94A 3FJGA 4OTEA 2DE3A 3FXUA 2B65A 3E13X 4R72A 3MVWA 1QW0A 3MZ1A 4EF1A 4OESA 3OSRA 2R71A 4EXKA 2QS3A 2I0BA 3L6HA 2Q2AA 4RK9A 2V3QA 5AA2A 4WKMA 2Q9TA 4QFKA 1EZ9A 2AL5A 2RCBA 2DVZA 3M3LA 1B0HA 1B3EA 2F6PA 3F11A 3R6UA 4EQBA 3T93B 4FORA 1SYHA 4F1UA 1Y4TA 5EHSA 1I6AA 4RY1A 4DXBA 4NF5A 4XXUA 4KCCA 2DWIA 3TTKA 2XXQA 1QUJA 2DWHA 1P1OA 1OLAA 3PUYE 4X1BA 5AE4A 2Z22A 3FVNA 3G3JA 4JBZA 3CFXA 3MWBA 3DP4A 1H76A 1TFDA 1P1UA 4ZE8A 4DIGA 4THIA 3SESA 4ZZEA 1WODA 2F8DA 2V3UA 3M3FA 1SW2A 4UACA 1XOCA 3T66A 4RXLA 4LUBA 3H4ZA 2A5SA 3LR1A 5I58B 5I2NA 2XXUA 4KFQA 4YB7A 4N13A 3SKPA 3VDFA 1MM6A 4ZS9A 4XKQA 5TP9A 2ZYNA 1AMFA 1WVJA 5I2KB 1FQEA 4DXUA 2O6AA 5IAIA 1A7LA 4ELOA 1OQGA 3S2VA 5I58A 1CE2A 2QJEA 1JW1A 2IEEA 3CI8A 1LSTA 3K1MA 1MPDA 3KOSA 5DT6A 4JSDA 3S9EA 5AA2D 3VLWA 3FV1A 4GWOA 4TLMB 2PBWA 2GFEA 1TT1A 3FVKA 3THIA 1QULA 3TCFA 2ZMBA 1Y1MA 2QS1A 2ABHA 3C32A 1LAFE 3A09A 1DTZA 1GTKA 1PC3A 4OQOA 1ZU0A 1YTVA 4G68B 2QPQA 3ILTB 3USDA 4Q30B 4U1ZA 4YU0A 3MJNA 3SETA 1Y20A 5FHOA 2V25A 4U1OA 1LFIA 4LATA 4ELPA 1GV8A 1HSLA 4EF2A 1USYH 4EDPA 3ODBA 2OK2A 3EN3A 1P1WA 3JV9A 3TCHA 3VLUA 2FNCA 3C31A 5DVFA 4QFOA 1S50A 4AB6A 3W15C 4BDRA 1ZJLA 3OMBA 5FHNA 1VFEA 1RYOA 3LSWA 2O51A 3EF7A 4G2ZA 4F29A 3OELA 1NMUA 1Q1KA 2XXYA 4OZ9A 4I8CA 4DCYA 4G4PA 4NF4B 1ANFA 4BLAA 5ISUA 3OO6A 4DXCA 1HSJA 3PU5A 2DXYA 4GXAA 3TFLA 2DOJA 5K2XA 3T9XB 3TTNA 2THIA 5KDTA 1B7UA 3MAMA 3G3HA 4OMBA 3UA8A 3PV0E 2NWJA 2QSXA 1N7WA 1SQYA 3PUVE 4I1DA 4P0GA 1I69A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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