1LGBC

Interaction of a legume lectin with the n2 fragment of human lactotransferrin or with the isolated biantennary glycopeptide: role of the fucose moiety
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
b'HYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLAR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of a legume lectin complexed with the human lactotransferrin N2 fragment, and with an isolated biantennary glycopeptide: role of the fucose moiety.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LEGUME ISOLECTIN II (ALPHA CHAIN)
molecule tags Complex(lectin/transferrin)
total genus 40
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lgbC00
2XXRA 2X7PA 3VVFA 1CE2A 4OZ9A 2DS9A 5AA2B 3TQWA 2Q89A 1Q1KA 3TDJA 4GF8A 4OEVA 4QSEA 3ECRA 3M8UA 3UN6A 4DZ1A 1LAFE 4P11A 1JNFA 1TXFA 2NUVA 1NNPA 4JDFA 4U1OA 2Z8DA 2B65A 1SVXB 1N7XA 5H8HA 2Z8EA 3LSLA 2RCAA 2PBWA 3T9HB 3D4GA 3C9HA 2DWHA 4DCYA 4IY5A 5KDTB 3PPQA 2Y7IA 3JV9A 4F31B 1B40A 3PMXA 4JSDA 1LAHE 1CB6A 3KN7A 4G4PA 3HHFA 1SI0A 1VSOA 1B4HA 1BKAA 4KYDA 3N6UA 1JW4A 4H5GA 3PV0E 3R26A 3M3KA 4EQBA 2QSXA 1MPCA 1LGBC 4KYEA 2DE3A 2V3TA 1ZU0A 4R6YA 5I84A 4FAJA 3RY3A 3TEPA 3RN8A 3CFXA 1MM7A 3SETA 4LA9A 1MQIA 1MQGA 1NKXA 2HQ0A 3RT8A 1JEVA 1NNTA 3B6QA 4EF2A 2ZYMA 2DXYA 3EHUA 3PUZE 3OSRA 2CMOA 1LFGA 1UTBA 2F35A 3O9PA 2WKYA 2XXXA 3K2DA 2F7AA 1M5FA 4QFOA 1HSEA 2XXIA 3TZAA 1JW5A 5HPQA 3TCFA 4GIZA 1USYH 4LQ5A 2DYXA 4H67A 3B6TA 4ESXA 3MVYA 1N76A 3CRBA 3PUVE 1Y4TA 3K1NA 1D4NA 1JVYA 3BKIB 2VOZA 4FEBA 2O68A 2R6GE 3PUWE 1GTKA 3K6WA 4FE8A 1LCTA 2I4BA 3IB1A 1OQHA 2O7UA 1LSTA 3FXRA 1JQFA 2HCAA 1WVJA 4O3BA 3ILTB 1Y9UA 3O66A 3TELA 4GQOA 2QMWA 3TTLA 4RJZA 2DVCA 1YCJA 1MPDA 1SI1A 2XXHA 1H43A 3HSTA 3IK6B 3TCHA 2VGQA 1VR5A 5KZTA 1FQCA 3PD9A 1R1NA 1XS5A 4FECA 1N7WA 2RCBA 4F1VA 4ZEKA 5AA4A 3RGYA 1IIWA 5HM4B 4ZEIA 1QJMA 5DVIA 1HSJA 1POTA 4KI0E 3E13X 2F8DA 3FIRA 3OSQA 4EF1A 4ELPA 5CMCA 4F39A 1OVBA 1MQHA 4R2FA 1Y20A 5DTBA 5ISUA 4LONB 1XHYA 3H6WA 5DEXB 5H8FA 2V3UA 4NF8B 3FVGA 2CZLA 3TPAA 4QSCA 4NWCA 4FIMA 3IX1A 2GRVA 3VXBA 4G77A 4DXUA 3V5AA 5IAIA 4U1ZA 4U22A 4OFLA 2DVZA 1TFDA 2GHAA 1SQYA 5TP9A 4F22A 2FNCA 3QYTA 4AB6A 3K1PA 4MBPA 2I4CA 2F7CA 2PMSA 4G8NA 4POXA 4GRKA 1NFTA 5JTYA 5DVJA 2H25A 4G68C 4Z0IA 2P0SA 3G3FA 1P1WA 2ZMBA 3KN8A 4OFJA 3L6HA 3T93B 3SEVA 4G68A 1FQFA 1URSA 2Z22A 5BUUA 1O64A 3MBPA 3MW0A 3VLUA 1PB9A 2Q88A 4DLDA 3DELB 3O29A 1GGGA 3M3FA 2I3WA 4O3AA 4BDRA 1MXVA 4OWDA 1B52A 4OTEA 3RQTA 3UIFA 4QSDA 1LAXA 2O84X 3H03A 1WODA 5K2XA 5H8HB 1UIUA 2V25A 1USYE 1PC3A 5FHOA 3G3JA 1TFAA 4YICA 3TKDA 2VD2A 5I59B 3FXUA 4PFYA 3C32A 5I57A 4F1YA 4H0WA 4OQOA 1FTKA 1B2HA 4NF4A 4GWOA 4PFTA 3CFZA 4BDNA 2VP1A 3SESA 1UIVA 2ZNSA 3U94A 3RTWB 3FATA 1FQBA 3T9XB 3TYHA 2OZZA 1MG1A 1PBPA 1VFEA 2PT2A 3T22A 2HXWA 4EQ7A 3O2AA 2F36A 4OXVA 3K01A 3SDFA 1ZLQA 5TU0A 1PBQA 4HTGA 1XOCA 4G2ZA 4F3PA 4DXBA 2XX9A 1ATGA 1QUIA 5CM6A 3WAEA 3W9VA 4R74A 4TQUQ 1JVXA 4BLAA 2HZLA 3C34A 2ZYNA 5CMBA 5B7DA 2DE4A 4JBZA 4RA1A 4F19A 3CIJA 4F2QA 3TFLA 1MY1A 2IEEA 3O6IA 2QS3A 4ECFA 3TTMA 4F1UA 4PFUA 3IO4A 4R6HA 5J1DA 1R9LA 5ITPA 4RXLA 3IOWA 1L5TA 1MH4A 3PGFA 2E1SA 2RC9A 1MM6A 2F34A 1MRPA 2RKMA 3G3KA 3OXNA 2Q8JA 4F3SA 5CRYA 2AYSA 1P1NA 4JXIA 5LOMA 1EZPA 4YZZA 3TUSA 3T66A 3OEKA 1H76A 1B5IA 5CI5A 1NMUA 1GVCA 3QIMA 3B6WA 4K3FA 1B7UA 2I3VA 4QFPA 4X48A 1B5HA 3VLWA 3ZKLA 3OEMA 3OO8A 4JWOA 3CFLA 5AA4B 5CMKA 1FW0A 1N84A 4RNSA 2UYFA 3N6TA 4NTLA 5ICTA 4KYSA 1QKAA 2XXPA 1M5CA 2FA7A 3ONMA 3KEIA 4GLIA 4EDPA 2H9BA 4YKJA 1LAGE 3PD8A 4C1UA 4JWYA 1PB8A 3VE1B 1BP5A 3PPRA 1HSLA 4RK9A 5H8QA 1MY2A 3IB0A 3QK6A 3TMGA 3OD7A 1AH5A 2PVUA 2NOOA 5ICQA 4U21A 1KWHA 3DM0A 1MY0A 3VVEA 3FVOA 1OIBA 3DP4A 4Q0CA 2ONRA 4N07A 3GBBA 3K4UA 3RT6B 4NEDA 3S4UA 1XVXA 2DOJA 1SW2A 5F1QA 3FJMA 1S9TA 4Q30B 5TP9B 1JEUA 5A5XA 2PYYA 3UP9A 1TWYA 4N6PA 2XXQA 4DDDA 3TTNA 3A09A 3GXAA 3EF7A 2LAOA 5JTYB 4GXAA 4U4SA 3O97A 4IB2A 1B3HA 3PMWA 3SEWA 1J1NA 3GBAA 1B4ZA 4UACA 1B46A 3E4RA 4R72A 1S50A 3U72A 2H5YA 4HW8A 5I56A 3S9EA 2VD3A 1XT8A 4FJPA 2DXRA 5IKBA 1LB8A 5HBCA 5I2NA 3LSWA 1RKMA 4DE8A 2Y7KA 1US5A 2ZNTA 4IO4A 1FQDA 4FEDA 4LQ2A 4BDQA 5I57B 4AQ4A 1RYXA 3HO7A 3HV1A 1QULA 4QFNA 1YPNA 3SERA 1A7LA 4GOTA 4WEDA 4IO6A 4ISUA 3DLNA 1NH8A 2AL4A 2A5TA 4UA8A 1IZ1A 3RPWA 3OELA 4XKNA 4Q8RA 4H8JA 5KCJA 1A8FA 1BLFA 3U92A 5DVFA 3IB2A 4RYAA 1LB9A 1MDP1 1B05A 3UGWA 1OLCA 4F29A 3S9MC 4LUBA 1YTVA 3EQ1A 4XIGQ 2O1MA 1B58A 3Q28A 3OMBA 5AE4A 4I1DA 5CBRA 3R7XA 1URGA 2THIA 4OFOA 4LZ5A 4BDLA 3OENA 2ZYKA 3T96B 3MVXA 4GD5A 3SEXA 1P99A 4MF3A 4EXLA 1SBPA 2O7IA 5L9MA 4H65A 3OO6A 4PFWA 5H8SA 2DWIA 3E3KA 4NF5B 1IUDA 3RNNA 3H6VA 3HHGA 4DIGA 4EXKA 4RY1A 2F78A 3USDA 3JZJA 3A3CA 2Z8FA 1B6HA 3U93A 5KDTA 3K6VA 4OYVA 4H1XA 2OCUA 3QUFA 1FQEA 4R73A 2GHBA 5L9SA 4IO5A 2NWJA 2QMXA 3GLBA 3R6UA 4LATA 3O28A 1MDQA 3EHSA 4X1DA 2B3BA 4ELRA 2ZXTA 1B5JA 4P0GA 3C31A 1LLSA 2F5XA 4PE5B 3CI8A 4F3BA 3Q27A 2NXOA 5CC2A 5EYFA 4RPOA 1UTHA 2UVIA 4LZ8A 3LSFB 3FXQA 4MFIA 2M8CA 1XC1A 3UA8A 1SW4A 1TT1A 5EHMA 5DT6A 1AOVA 4OEUA 3F11A 2Y7WA 1A99A 2RF1A 2Y7RA 3A3UA 3WAFA 1FTMA 3FUZA 4F18A 3EHTA 1OQGA 1PB7A 1B3GA 3KJ7A 4Q5TA 3FVNA 1Y4CA 4MLVA 4E0WA 5L9OA 4YU0A 3H4ZA 1WDNA 2RC8A 3C33A 3RLFE 4I9DA 1NL5A 4NWDA 1MXWA 5H8QB 3AXFA 1NNFA 2GFEA 3EPEA 2G93A 1Q35A 4IO7A 1MY4A 4OERA 1B0LA 1ZJLA 1Y1MA 1IXIA 2DSFA 2ANJA 3B7DA 1Z7NE 2I0CA 3Q25A 4KD5A 4OESA 3FASA 1SD3A 1A8EA 3KSJA 4MLQA 3H7MA 4KCDA 5AA3A 4YMBA 1POY1 1B3LA 1O7TA 5F7VA 4AB5A 2HFBA 5A5XB 3K0VA 1ANFA 4LVQA 2B3FA 2UYEA 3IO6A 4Z7EA 1I6QA 2YLNA 2ALUA 2RINA 3KBRA 3U1OA 3N5LA 4YB5A 1AL3A 3N94A 2RC7A 3OO9A 3H6TA 4BDMA 1VFDA 2XX7A 1GV8A 3VV5A 3KSXA 3V83A 1UTBB 2BJJX 4I8CA 1FTOA 3IORA 3FV1A 3KN3A 1SYIA 2H4IA 2YPNA 1B0HA 2QL3A 2HZKA 3G3HA 3M3LA 2I6EA 3HPIA 3ZKKA 4R2BA 2OWTA 5I56B 4QFKA 4WEPA 3RTFB 4HCYA 3QXMA 2G29A 4RK2A 5DEXA 3K6UA 1DTZA 4QF9A 1H44A 2XXWA 4POWA 3SEYA 3CSGA 2E0SA 4YB6A 1DMBA 2XD2A 2UVHA 3GZGA 3Q26A 1OMPA 3BBRA 1AMFA 4LP2B 2O51A 2UVGA 2DE2A 3D4CA 4QHQA 1I69A 4C0RA 3VDFA 3LR1A 3N26A 2REGA 2A5TB 3H06B 4XXUA 3QUJA 4IGRA 1M5EA 4M1VA 5JEIA 4KCCA 1ELJA 4L17A 1IEJA 2HAUA 3K00A 1EH3A 2P2AA 2PX1A 1FTJA 2Y84A 4H8IA 3MP8A 3MZ1A 1MQDA 1N04A 1JW1A 4ELOA 4R6KA 3KG2A 1ZTYA 3IAZA 3IOVA 3ILUB 3K1MA 1LCFA 4IO3A 3T9VA 4I62A 2F6GA 3G7WA 1I6AA 4X1BA 1MXYA 3K02A 5I58A 3S9NC 1ZIUA 3LSXA 4DCXA 4H6DA 1GR2A 5H8NA 3MC2A 1R6ZA 3MPLA 5H8FB 1BIYA 1O63A 1N0TA 2ZYOA 5I59A 1EU8A 2O6AA 3PPNA 5I2KA 3KGCA 2R9JA 1OLAA 1OVTA 1MXZA 1EZOA 3UORA 2F97A 2QS1A 3V89B 1IXHA 1M5BA 4U4XA 5ELVA 5JK4A 3THIA 3CSBA 4JSOA 2UVJA 4R9GA 4YKPA 4ZS9A 3K6XA 4P0IA 3OO7A 3KOTA 2Q2AA 4IO2A 4KQPA 3CVGA 4OENA 2AIXA 5EHSA 1LFHA 4EUOA 4ESWA 3LUYA 2D21A 2AL5A 4OVJA 4WXJA 1B32A 3IL1B 5ITOA 1MQJA 1UTHB 4G68B 1Y3NA 1YAEA 4PP0A 3OOAA 2FYIA 5K2YA 3EN3A 4EQ9A 1VE4A 3L6GA 3PU5A 1JETA 3TODA 3BFTA 4KR5A 4YB7A 1QW0A 4TOZA 3LC8A 3W9WA 1S7YA 4ONYA 5TPAA 1A54A 1MPBA 1QVSA 4WKMA 3E9XA 4O3CA 2Q2CA 2HAVA 1LBCA 2HEUA 4R75A 4PETA 5FHMA 2XX8A 3IJXB 4KHZE 4TLMB 1D3KA 4NF4B 2I0BA 4KFQA 1P1UA 5M2VA 2ZNUA 4NF6A 2H99A 4QFLA 1H45A 2QS4A 2XXYA 1Y3QA 3MVWA 2V93A 4G8HA 1IXCA 5FHNA 3MP6A 1LBBA 2VHAA 3FJ7A 4H5FA 3UK4A 2GH9A 3T9UA 3BFUA 1BTJA 2F7BA 5AA2A 3PUYE 1Y1ZA 1IQ7A 2X26A 4G8MA 1MXXA 4ZZEA 3S2VA 1R9QA 3G3IA 3QAXA 3KJTA 4QRZA 1FQAA 4OHNA 3C4MA 2Q9TA 1DPPA 2Y7PA 4OMBA 3LBSA 2QPQA 4C1TA 1I6BA 3MWBA 2PT1A 1T0KA 4IY6A 1AIVA 2KLFA 5CMMA 4ZEFA 5AA2D 3O6GA 2OJTA 3C35A 5BWJA 2D3IA 4ELQA 4ZEBA 4FATA 2X7QA 3TTKA 1B1XA 1UQWA 4ZECA 3CG3A 1SDXA 3VXCA 5CBSA 1DTGA 1URDA 3KOSA 1QKBA 3H6UA 4XKRA 4F3GA 1DOTA 2QJEA 1PDAA 4BDOA 1ZKBA 1Y3PA 3MQ9A 3P7IA 1Z7ME 2R71A 3CR9A 2P1SA 2O1LA 3O6HA 3FVKA 1QUKA 4JWXA 2Z23A 1IXGA 1P1OA 2ESNA 2OK2A 4KPTA 1B51A 3PPPA 1N3XA 2DWJA 3FGSA 2XHDA 1P1QA 1SYHA 4PQJA 2NVUB 1PEBA 4RPNA 3IOUA 3MZ9A 3KFMA 1QUJA 2DWAA 3QSLA 3S9LC 1A40A 3VVDA 3FD3A 1II5A 2I49A 3VLVA 1NH7A 3V8XB 2UXAA 4ZEDA 5L8DA 3TAJA 4LZ7A 5I58B 2I48A 5FTHA 4YMAA 4R9FA 1B3EA 3I5OA 1LFIA 5H8NB 3IOTA 5FTIA 3MZBA 1RYOA 3U8QA 3IJOB 3ZS6A 1M5DA 4XTCQ 3MUQA 5I2KB 3ZSFA 4ZZAA 3SKPA 1DPEA 4FORA 3JYRA 1FCKA 1EZ9A 4GL8A 4E0XA 5AA1A 4GFRA 4OETA 2ONKE 1ZMGA 2YJPA 2IA4A 3G3GA 4THIA 3MVZA 3MAMA 4U2RA 3RUMA 3C36A 3PPOA 1A55A 1MY3A 4YKKA 2W7YA 3KZGA 4GVOA 3TCGA 3HCQA 4YKIA 3DP6A 3I3VA 2A5SA 2OWSA 3DP8A 2REJA 4IGTA 1DSNA 1F9BA 1XVYA 3I6VA 2XXUA 1D9YA 4MH5A 4ZDMA 4X9TA 4NMYA 4NE4A 1SW1A 2QRYA 1NNKA 3TTRA 1B7ZA 1FTLA 5B70A 2OBGA 4ZE9A 2DQVA 4HCWA 3MPKA 1N3WA 4U23A 5TPAB 3FV2A 2QS2A 3HN0A 3W15C 4NF5A 4HS7A 5I2NB 1IITA 2V3QA 2V84A 2ONSA 4DXCA 4NF8A 4TLLB 5DYHA 3PMVA 3ODBA 1MS7A 2ABHA 3MP1A 4JB7A 1H3DA 3FJGA 1SW5A 3H3GA 2O69A 2XD3A 3FZVA 1B9JA 2XXTA 4GXSB 3VFJA 3IR1A 4ND9A 2XXVA 4NF6B 2H98A 3TQLA 1D9VA 3Q29A 4M4GA 3SEUA 4N13A 4XKPA 2D5WA 1US4A 2DP8A 1B1HA 5KCJB 2OLBA 2F6PA 4ZE8A 1B7HA 2I58A 1MH3A 3MJNA 1B3FA 4XKQA 3PUXE 4GL0A 4F2OA 1ZBMA 1MXUA 4YAHX 3CG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1LSTA 3FXRA 2QFLA 1JQFA 2CZIA 2HCAA 2FIEA 1WVJA 4N6DA 4O3BA 3ILTB 1Y9UA 3O66A 3TELA 4GQOA 2QMWA 1FBDA 3TTLA 1FBPA 3CHGA 4RJZA 2DVCA 1IMFA 1YCJA 4P56A 1MPDA 1SI1A 2XXHA 1H43A 3HSTA 3IK6B 3TCHA 2VGQA 1VR5A 5KZTA 4PF6A 4MHFA 1FQCA 3PD9A 1R1NA 1XS5A 4FECA 1N7WA 2RCBA 2FVZA 4ZEKA 4F1VA 5AA4A 5LTCA 3RGYA 1IIWA 2WBBA 5HM4B 5I3SA 4ZEIA 1QJMA 5DVIA 1HSJA 1POTA 4KI0E 3E13X 2F8DA 3FIRA 3OSQA 4EF1A 4ELPA 5CMCA 4F39A 1OVBA 4H45A 1MQHA 2OX3A 4R2FA 1Y20A 5DTBA 5ISUA 4LONB 4OANA 4HE1A 1FBFA 1XHYA 3H6WA 5DEXB 5H8FA 2V3UA 4NF8B 3FVGA 2CZLA 4N6KA 3TPAA 4QSCA 4NWCA 4OVSA 4FIMA 4NQ8A 3IX1A 2P3VA 2GRVA 2HHMA 3VXBA 4G77A 4DXUA 3V5AA 5IAIA 4U1ZA 1FJ6A 4U22A 4OFLA 2DVZA 1TFDA 2GHAA 1SQYA 5TP9A 4F22A 2FNCA 3QYTA 4AB6A 1FPEA 3K1PA 4MBPA 2I4CA 2F7CA 2PMSA 3BIHA 4G8NA 4XFEA 4POXA 4GRKA 1NFTA 5JTYA 5DVJA 2H25A 4G68C 4Z0IA 2P0SA 3G3FA 1P1WA 2ZMBA 4NGUA 3KN8A 4QBAA 4OFJA 3L6HA 3SEVA 4G68A 3T93B 1FQFA 1URSA 2XWVA 2Z22A 5BUUA 1O64A 3MBPA 3MW0A 3VLUA 2VT5A 1PB9A 2Q88A 4DLDA 3DELB 3O29A 4N8YA 1FBEA 1GGGA 3M3FA 2I3WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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