The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (NITROSOBENZENE)
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
61
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y0C A; 1Y83 A; 1QXE B; 5HU6 A; 3LQD A; 3WCU D; 1XZ5 B; 2W72 A; 1HHO A; 1HGB A; 2ZSX A; 3W4U B; 1SWM A; 5CN8 A; 2EKT A; 1JZL A; 1COH A; 1F5O A; 1G09 B; 2ZS1 A; 1OR6 A; 1QI8 B; 2MGH A; 3G4Y A; 1XZ5 A; 2YRS A; 3HXN B; 1X46 A; 1KD2 A; 1G9V B; 2GRZ A; 1X9F D; 1YOG A; 1DO4 A; 3ED9 A; 1GLI A; 2AUO A; 1V5H A; 3QM9 A; 1YDZ B; 2D2M A; 1YEU B; 3O7N A; 4MQH B; 3LB2 A; 1IBE B; 1XZU A; 1YCB A; 1BZP A; 2R4W A; 2QU0 A; 1J3Y A; 3GLN A; 5HY8 A; 1NEJ A; 5JDO F; 1BIN A; 3PI8 A; 3UHT A; 1UX8 A; 3EDA A; 2ZLX B; 3CIU B; 1BZ6 A; 1YVT A; 1HDS A; 1YG5 B; 2ZFO B; 1KR7 A; 3SZK B; 1XYE A; 2BLJ M; 3UHS A; 2DN1 A; 3VRE B; 2O5B X; 1B86 B; 1WMU A; 3K8B B; 3R5I B; 4XDI A; 2H8F A; 1UVX A; 1F63 A; 2H35 B; 1Q1F A; 1O1P B; 1Y4R B; 4MPM A; 1G0A B; 2ZLX A; 1BBB B; 1DWS A; 4O2G A; 2D5X A; 1CMY A; 4JYQ A; 3UBV A; 5CN5 A; 1O1M B; 1O1L B; 4ROM A; 3QJB B; 3OVU C; 3D1A A; 3AQ9 A; 1URY A; 2AV3 A; 1NZ2 A; 1MBD A; 5F0B A; 3FS4 B; 1YE0 B; 2FRK X; 1YZI B; 3A9M A; 1EWA A; 2MYE A; 3AQ8 A; 1YE2 B; 4NXA A; 1MYH A; 2HBE B; 1NS9 A; 3UHN A; 1R1Y B; 4ROL B; 3PI9 A; 1J7S B; 1JP8 A; 1M6C A; 1A4F A; 2XKH A; 3BCQ B; 3PT8 A; 3UHC A; 1S5X A; 3WCW B; 1YE0 A; 1XQ5 B; 1RPS A; 2VM0 A; 1FLP A; 107M A; 3WCV A; 4N8T A; 2V1E A; 2HBE A; 2ZLV B; 3BJ1 B; 3WI8 A; 1MKO B; 1MTK A; 3GQP B; 5JDO D; 2D2N A; 3UHK A; 3D17 B; 1BIJ B; 1FHJ B; 2PEG A; 3WTG B; 1Y0T B; 5EE4 C; 2OHB A; 3WHM B; 1DKE A; 3E4N A; 1YEN A; 2DN2 B; 4FWZ A; 1RSE A; 1Y09 B; 2G12 A; 1Y8I B; 1SHR A; 1V75 A; 2V1H A; 4B3W A; 1QSI A; 1G08 B; 2DXM A; 1K0Y A; 3HEN A; 1VXA A; 1UFJ A; 2FRI X; 3A2G A; 1IRD B; 2ZLT B; 3G4U A; 4F68 A; 1MBN A; 1GCV A; 3HC9 A; 3ARK A; 3GKV B; 1UIW B; 1YIE B; 5CNG A; 2LH2 A; 1KFR A; 1ECA A; 3SDN A; 2XYK A; 1NPG A; 1HGA B; 2HBS A; 4MXL A; 3A0G A; 1ECN A; 1GDK A; 2BKM A; 1Y4Q A; 2C0K A; 1JEB A; 1DXU B; 1EMY A; 2W6W A; 5EE4 D; 1LH1 A; 1OR4 A; 2R4X A; 2G0Z A; 2Z6S A; 3UHH A; 3A59 B; 109M A; 1HRM A; 1MYM A; 5B84 A; 1Y2Z A; 1YFF B; 2ZS0 A; 2EVK A; 1LH7 A; 1Y85 B; 2QSS A; 2XKI A; 1DXU A; 3GYS A; 3VRF A; 1M6M A; 5CNB A; 3V2Z A; 4N7O B; 1FDH A; 2M6Z B; 5JGG A; 2W72 C; 1XCH A; 1MNH A; 1CPW A; 1SI4 A; 1OBM A; 4NI0 A; 4FH7 A; 1S6A A; 2Z8A A; 1DXV B; 1K1K B; 2ZS1 C; 1FAW A; 3AT6 B; 4MQJ A; 2GTL A; 4VHB A; 3ECZ A; 1HBH B; 1BJE A; 4XS0 A; 3UH7 A; 3ECX A; 4L7Y A; 3UHV A; 1O1O A; 3MJP A; 1N9I A; 2ZLU B; 1GCW B; 2D60 B; 2G14 A; 1XY0 B; 3EOK A; 1MOA A; 1OUT B; 1JPB A; 2D2M C; 3B75 A; 1MCY A; 1Y0D A; 1Y4G A; 4OF9 A; 3UBC A; 4F6B A; 1BZ0 A; 3VAU A; 1O1K B; 3S65 A; 3OO5 B; 2VYY A; 4FH6 A; 1O1J A; 1BZZ A; 3HF4 B; 111M A; 1DUO A; 1RTE A; 2VLZ A; 1JY7 B; 2MGF A; 1CP0 A; 1I3E A; 1LFT A; 4M4B B; 1NS6 A; 1A0Z B; 4HHB B; 2PGH B; 3VHB A; 1J41 A; 1DXT A; 3WR1 A; 1OFK A; 1O1I A; 1VXC A; 1JL6 A; 3GKT A; 3HF4 A; 3QQR A; 1RVW A; 1J7Y B; 3GOU B; 5E29 B; 1LFQ A; 1IWH B; 1MTI A; 1Y7Z B; 1V9Q A; 4DC7 A; 4F6G A; 2MYB A; 3ECL A; 1SDL B; 3ARJ A; 2VLX A; 4MQI A; 5HLQ A; 2G10 A; 3EU1 B; 1DLW A; 3NG6 B; 5CN9 A; 3WCT B; 2D2M D; 3GOU A; 1MYT A; 4QAU A; 1DTM A; 5KER B; 1HSY A; 3LR9 A; 4G51 B; 3PI4 A; 1D8U A; 1YIH A; 4MAX A; 1R1X A; 1Y0A B; 3CY5 A; 3AT5 A; 1NWN A; 5EU2 A; 2WTH A; 2CMM A; 3GDJ A; 3OZW A; 4F4O A; 4MQC B; 1BZR A; 1GZX A; 3PEL B; 1SDL A; 1HDB A; 4X0L A; 2HBF B; 3KMF C; 2HHB A; 1EBT A; 4N7P A; 5KDQ B; 4TYX A; 3NG6 A; 2LH7 A; 3D4X B; 5KER A; 2D5Z A; 4G51 A; 4F6D A; 4KN3 A; 5ILM A; 2NRL A; 1GVH A; 3WCV C; 2FAL A; 1EBC A; 3IA3 B; 2MGB A; 1HCO A; 1C7D B; 2AUR A; 1LFV B; 1HBR A; 1LFZ B; 2ZSP A; 2D2N C; 2QMB B; 2BNL A; 2O5L X; 3ARL A; 1YEQ A; 3HEO A; 3NML A; 1MLK A; 2HBC B; 1UC3 A; 1BUW B; 1DO1 A; 3QJC A; 2MGI A; 3IC0 B; 1RQ3 B; 1RQ4 A; 2HHE A; 1YVQ B; 1A3O B; 2AA1 A; 3MYM A; 1XZ4 B; 5HAV A; 3WFW A; 1LFZ A; 1Y4F A; 2GRF A; 1V4U B; 2H8D B; 3S1J A; 4MBA A; 1O1N B; 1OUU A; 1Y46 B; 1SDK A; 4HRT B; 2G0X A; 4ODC A; 2LH5 A; 4HSX A; 1A3N B; 2ZT0 A; 2RAO A; 2VHB A; 4IRO B; 3UHG A; 2G11 A; 1MWC A; 3G52 A; 1CG8 A; 3LHB A; 1PMB A; 4ILZ A; 2H8D A; 3WCV D; 1MOH A; 2VYZ A; 4MQG B; 2R1H A; 1YGD B; 2GNV A; 1S0H A; 4KMV A; 1M9P A; 1J52 A; 2R4Z A; 2MHB A; 2OH9 A; 5EOH A; 2W6V A; 5EUI B; 1CBL A; 2Z6N B; 1T1N B; 3GQR A; 5ILR A; 1RQA B; 1VRF A; 3MBA A; 2ZSZ A; 2ZS0 C; 3ZOL A; 1YGD A; 2BLH A; 1THB B; 1HBA B; 2GKN A; 1QSH B; 3TM3 A; 4YU3 B; 3A5B A; 1YMB A; 4NS2 A; 1Y22 B; 1LFY B; 6HBW A; 2OLP A; 1HGC B; 1A00 A; 4PNJ A; 3FH9 B; 4WJG 1; 1CIK A; 2Z6T A; 1HAB B; 2MGL A; 1A9W A; 4F6F A; 1QXE A; 2LH3 A; 4NK1 A; 5C6Y A; 2GTL C; 1YHU D; 2IG3 A; 1GJN A; 1MBO A; 1A6G A; 2HCO B; 3HEP A; 1CH5 A; 1MYJ A; 2R4Y A; 5C6E B; 3P5Q B; 1AZI A; 3W4U A; 1F5P A; 2VRY A; 1MWD A; 3UHD A; 1XZ7 B; 1G09 A; 1QI8 A; 1GBU B; 3D1K B; 3IC2 B; 1LH6 A; 3RGK A; 2O5S X; 3LB1 A; 3HXN A; 1Y0W B; 1G9V A; 3PI1 A; 4ESA B; 1YHE B; 1S5Y B; 3ASE A; 2G0S A; 5E6E B; 1VWT B; 1YDZ A; 1YEU A; 1GDI A; 1Y31 B; 4MQH A; 3DHR B; 1IBE A; 2VEB A; 1ABY B; 1YGF B; 3O89 A; 4WJG A; 3LB4 A; 3M39 A; 1MDN A; 1XZ2 B; 1V4W B; 4MXK A; 4ESA A; 1JDO A; 2GTL D; 5ILE A; 1JP6 A; 3CIU A; 4AVD A; 4UIQ A; 1YG5 A; 1MNJ A; 5CHQ A; 2ZFO A; 3GK9 A; 3SZK A; 4KJT A; 1Y7G B; 3VRE A; 2HBD B; 1A6M A; 1B86 A; 3MOU A; 3K8B A; 3R5I A; 1V4W A; 3UGZ A; 3DUT B; 2H35 A; 1MYG A; 1O1P A; 1Y4R A; 4U8U B; 3ODQ B; 3ZJN A; 1G0A A; 2DN3 B; 1BBB A; 3E5I A; 3S48 C; 2Z85 A; 5CMV A; 1LFL B; 2EB8 A; 1O1M A; 1O1L A; 3LR7 A; 3QJB A; 2VLY A; 5EET A; 1MLH A; 4FC3 B; 1HAC B; 3FS4 A; 3QZZ A; 1CBM A; 2HZ2 A; 101M A; 1HBB B; 1MLG A; 4PQB A; 1YZI A; 1FDH G; 3QJD B; 1J40 B; 2SPM A; 1YE2 A; 1A6K A; 4MQK B; 3QMA A; 1R1Y A; 6HBI A; 4ROL A; 1J7S A; 1CP5 A; 2D6C A; 3MYN A; 3BCQ A; 2EB9 A; 3WCW A; 1XQ5 A; 1C40 B; 1UX9 A; 1CLS B; 4NK2 A; 2ZLV A; 3K9Z A; 3AQ5 A; 3BJ1 A; 3G46 A; 3PIA B; 1MKO A; 3GQP A; 2DHB B; 5JDO E; 2MGD A; 3WCU B; 3D17 A; 1BIJ A; 1FHJ A; 1MBC A; 2ZSR A; 3WTG A; 1LA6 B; 1Y0T A; 4TWU A; 3UHW A; 5HLX A; 2BWH A; 3WHM A; 2LH6 A; 1HV4 B; 2DN2 A; 3PI2 A; 1Y09 A; 1MYZ A; 4AVE A; 1Y8I A; 3UHZ A; 4WCH D; 3E55 A; 3NL7 B; 3IXF A; 1NXF A; 1ABW B; 1IT2 A; 1G08 A; 1YCA A; 1YHU B; 1Y35 B; 3OO4 B; 2G3H A; 1YMC A; 1IRD A; 1Y8W B; 2ZLT A; 3NFE B; 1QXD B; 2HZ1 A; 2B7H B; 1X9F B; 1ASH A; 2DC3 A; 3MKB B; 1ABS A; 1MOD A; 3NL7 A; 1LH5 A; 3GKV A; 1UIW A; 1YIE A; 1MNI A; 4HSW A; 1YOH A; 1J3Z B; 1HGA A; 3OJ1 A; 1MLM A; 1CH3 A; 2O5Q X; 5EQM A; 1G0B B; 1MBS A; 2AUP A; 1FN3 B; 2OHA A; 1MLS A; 5IKS A; 110M A; 1XZV B; 1S56 A; 3U3E A; 1CQ2 A; 3ZJQ A; 1YH9 B; 5SW7 B; 1UT0 A; 5AB8 A; 3A59 A; 1CH7 A; 4H07 A; 1NZ4 A; 1YFF A; 3RJ6 A; 2O5T X; 3M3B A; 1Y85 A; 1IDR A; 2XKG A; 1DWR A; 1S69 A; 4HRR B; 5MBN A; 2VEE A; 3ZJJ A; 5MBA A; 4N7O A; 1JF4 A; 2M6Z A; 3D7O B; 3MJU B; 2ZWJ A; 2G0R A; 1A0U B; 104M A; 1PBX B; 1YHR B; 2R80 B; 2ZLW B; 2ZSO A; 3BJ3 B; 2R50 A; 3BOM B; 1NWI A; 1MYI A; 4ZVA A; 1DXV A; 1K1K A; 3GQG B; 1V4X B; 1V07 A; 3UHE A; 3AT6 A; 3ZOM A; 1HBH A; 1HBI A; 1HLB A; 1HBG A; 1DUK A; 3PT7 B; 5CNE A; 2ZLU A; 1YHR A; 1GCW A; 2D60 A; 3G4Q A; 1YMA A; 1XY0 A; 1OUT A; 5D5R A; 3KUN A; 3GQG A; 3UHX A; 103M A; 3A5G A; 1O1K A; 1Y5F B; 2GRH A; 3OO5 A; 4GZG A; 4NZI A; 1JP9 A; 4N7N B; 3SDH A; 3QM8 A; 4UUR A; 1AJ9 B; 1LH2 A; 1VXF A; 3DHT B; 3QM7 A; 3ORD A; 1A9W E; 2MYA A; 2ZS1 D; 3A5A A; 3QM6 A; 1JY7 A; 1TES A; 1CIO A; 2O5O X; 4M4B A; 4FWX A; 2ZFO C; 4HHB A; 1A0Z A; 4H2L B; 2PGH A; 1N9F A; 3HHB B; 4NI1 B; 1DM1 A; 3BJ2 B; 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1ECD A; 1Y0C B; 102M A; 1Y83 B; 3V2V A; 5HU6 B; 3LQD B; 1MTJ A; 1HLM A; 3TM9 A; 1N9X A; 1MGN A; 2MGK A; 1MLU A; 1Y4P A; 5EUI A; 2Z6N A; 2QFK A; 4HBI A; 1T1N A; 2W72 B; 1RQA A; 3PI3 A; 1HHO B; 1HGB B; 1BVD A; 1DWT A; 1THB A; 1HBA A; 1HJT A; 2MGE A; 1CO9 A; 1IRC A; 1QSH A; 3AQ7 A; 1COH B; 2ZSN A; 2ZS1 B; 4YU3 A; 1WLA A; 1Y22 A; 1MBA A; 2WY4 A; 1LFY A; 2YRS B; 5EYJ A; 1B0B A; 1MOB A; 1MWB A; 1KD2 B; 1HGC A; 3FH9 A; 4SDH A; 1GLI B; 2D2M B; 1HAB A; 1XZU B; 1ITH A; 3E5O A; 2ZSQ A; 2GLN A; 2ZS0 D; 2QU0 B; 1J3Y B; 2HCO A; 5HY8 B; 2V1J A; 5C6E A; 3P5Q A; 1NEJ B; 3PI8 B; 3M3A A; 3LB3 A; 1RTX A; 106M A; 1YVT B; 2ZT1 A; 1HDS B; 2W31 A; 1XZ7 A; 1XYE B; 1GBU A; 2DN1 B; 3D1K A; 3IC2 A; 1TU9 A; 2V1F A; 3QM5 A; 1WMU B; 1Y0W A; 2H8F B; 4O4Z A; 1NIH B; 1CH4 A; 1YHE A; 1S5Y A; 5E6E A; 1VWT A; 2D5X B; 1CMY B; 1Y31 A; 2HHD B; 4ROM B; 3DHR A; 5EV5 A; 1ABY A; 1C7C B; 1YGF A; 3D1A B; 1XZ2 A; 5JDO C; 1NIH A; 1AJG A; 2HHD A; 1NS9 B; 1YOI A; 3PI9 B; 1C7C A; 2ZSS A; 1VXB A; 1A4F B; 1Y7G A; 1X3K A; 2HBD A; 3PT8 B; 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