1LHKA

Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with x-ray structure analysis of proline mutants
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIAPAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with X-ray structure analysis of proline mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lhkA00
1HF4A 1JKBA 2LYZA 1C43A 5LVIA 1VFBC 1HHLA 4DC4A 2G4PA 3P68A 3WL2A 4M4OA 1DZBX 4DD7A 4ETEA 3A67Y 2W1MA 2Z37A 1YANA 1GEZA 4PJ2C 5KXPA 1SLYA 1XGUC 4N5RA 4M6DA 3WPLA 4ET9A 1G7LC 5HNCA 1NMMA 4IASA 2HTXA 2D4JA 5FEKA 4MR1A 1GFVA 4NFVA 3TXGA 3LYMA 1DI4A 1GAZA 4G49A 1GB7A 4XADA 4LT0A 1CKFA 2BPUA 4YEMA 2F2NA 2W1YA 4HV1A 5LYZA 4B4EA 4EMNA 5KXOA 1WQOA 1NBZC 4YM8A 2F30A 4NSJA 4CFPA 5I4YA 4LYTA 4UWUA 5FELA 1OUBA 1F6RA 5K7OA 2Z19A 1LSPA 4RLNA 3B0IA 4HJYA 4HJZA 1PS5A 1RCMA 1B7NA 1BGIA 4WLTA 1H6MA 5HNLA 5II3A 3MGWA 2BQKA 3WUAA 1AT5A 1B5UA 1LHLA 2C8OA 154LA 1YAPA 3ZVQB 1FBIX 4H9BA 4H91A 2W1LA 3ZEKA 4GN4A 4NSIA 2Z39A 4WM5A 1GEVA 2BQNA 3SP3A 4E3UA 3WPJA 5L9JA 1JKCA 1LZYA 3AJNA 3W6DA 6LYTA 1GF3A 4HPIA 1ALCA 1LHMA 3E3DA 3TXBA 3W6AA 1VDQA 1HNLA 3D3DA 1KXWA 3D9AC 1UIBA 4LYOA 4RDSA 1HFXA 3BKVA 4TSCA 3WU8A 4TWSA 4BAPA 5KXWA 1GFUA 1GF7A 2FBDA 1KXYA 1YL1X 2HEAA 1UIEA 1CKDA 2DQJY 3A6CY 1A2YC 3AW7A 4P2EA 3WYHA 1JUGA 4WM6A 2Z38A 1MELL 4J0LA 3AYQA 4DYGA 5A3EA 1EQEA 4OWBA 1LMAA 2ZQ4A 6LYZA 3AW6A 3G3AB 1LHHA 3LZ2A 4WL7A 3TXHA 2RSCA 2EKSC 1LSCA 1CKHA 1P2CC 1XGRC 1LTMA 3N9EA 4G4BA 2H5ZA 3CT1A 3K3TA 3B0KA 3P64A 4H9AA 2DQEY 3P65A 4PGJB 1QSWA 4HP0A 1HEMA 3GXRA 1OP9B 4N1EI 4B1AA 3QE8A 3W6CA 1LJJA 1LZAA 1GF6A 3AZ4A 1G7HC 2G4QA 2WARA 3LN2A 2D91A 1QTKA 4D9ZA 3ATOA 1BB5A 1HMKA 1JIYA 5HMJA 5KJ9A 3WUNA 4GCFA 1N4FA 4WM3A 1V7SA 5LYMA 2I6ZA 1F6SA 1LSFA 1IC7Y 1IOTA 1G7MC 3M3UA 4QGZA 5FDJA 2BAAA 3AGGG 134LA 4LYBA 1TDYA 1IR8A 1JTPL 3WU7A 3N9AA 3IWRA 1YKZX 1AM7A 1GB8A 4DDCA 1O23A 4HJVA 3A34A 4FDYA 1GFJA 1FLUA 5AMYA 4ETCA 1WQQA 4ML7A 4NHQA 1REMA 4TTDA 4ZFPA 4NWHA 4G4CA 1HENA 1B5VA 1IC4Y 1GB6A 2BLXA 2LHMA 5DL9A 2MECA 1BB7A 4YEOA 1WTMA 2Z12A 4B0DA 2BQAA 3HBDA 1NBYC 2D4IA 1RFPA 2YDGA 1LYZA 1TCYA 2NWDX 3B6LA 4W94A 1YKXX 4GCDA 2MEDA 4NHSA 1FDLY 1BWIA 4WO6A 4R6CA 3OJPA 4IATA 1DKKA 1BQLY 1HSWA 2D4KA 3RNXA 2LYOA 4Z98A 1UIDA 1OUGA 1DKJA 3EO5A 4OW1A 1GPQC 1IOCA 1WVVA 4NWEA 4AXTA 3KAMA 4NGIA 2DKVA 1BWJA 1GE2A 1T3PA 4ETDA 5LIOA 1LSGA 1LZ1A 1FN5A 3AGHA 5ILCA 5HMVA 1WQNA 1BVXA 5I53A 1IP4A 1LSBA 1D0KA 2FYCA 4WLXA 1LZCA 1XEIA 1IP1A 1B7PA 1JJ1A 4NG8A 4GLVA 2BQBA 3FE0A 1C7PA 1GB0A 1UIFA 1B5XA 1LJEA 2BQJA 5C6IA 1IVMA 1BB3A 1VDPA 1C10A 2BQHA 4LT1A 4LT2A 4XJGA 3QNGA 5B59A 2I25L 5D5CA 2A7DA 1B7RA 3TXEA 4A7DA 4XENA 3CT0A 3WVXA 4DT3A 1GE4A 4WO9A 4XJBA 3AZ7A 3AZ5A 1OUDA 4H9CA 1IWVA 1LJFA 5FCPA 5KXXA 1NWGA 1VEDA 2BQDA 5I4WA 2YBNA 1JHLA 133LA 1G7JC 4L41A 3LYTA 1QDTA 4NGOA 2MEEA 2H9KA 3WXUA 2MEGA 2Q0MX 1IOSA 1XGPC 1LYYA 1JTTL 1YKYX 4TUNA 1GFEA 3WH1A 1IWUA 1OUAA 1LSNA 2BQGA 1F10A 5ILFA 4LT3A 1QQYA 1ZMYL 1DI5A 1KIPC 4W96A 3A3QA 1B9OA 1YIKA 4N1CC 1FLQA 3RT5X 1LZ8A 1QUSA 1EQ4A 208LA 4UWVA 4WLYA 5C6JA 5HQ1A 4CHXA 1WQMA 2A7FA 1LJIA 4MSTA 4OWCA 8LYZA 1XEKA 2BLYA 2HU1A 1I56A 1HFZA 5IDDA 4KL7A 4PHIA 3A8ZA 1HC0A 2HEEA 1VDTA 1B7LA 2BQIA 3AB6A 1FKQA 5KXYA 1C08C 1CJ8A 1CKCA 3WVYA 5EBHA 3ZVQA 5I54A 1HEQA 1GFRA 1LZGA 3F6ZA 1EQ5A 2DQAA 1JPOA 4NGYA 4N9RA 3TMUA 1HERA 4DD9A 4J1BA 5B1FA 3A93A 4NGVA 1OUCA 3OK0A 2BQFA 1C46A 4ETBA 2VB1A 4B4IA 4B4JA 5KKIA 2LZ2A 1LAAA 5DN4A 5I5QA 2X0AA 4AGAA 4XYYA 1YL0X 2YBIA 1BB6A 2ZNXY 3LYZA 4HTQA 4NHTA 2MEAA 4NSHA 4BADA 5J7CA 1BVKC 4KT3A 1IX0A 1LJHA 4ET8A 1OUIA 1VATA 1LKSA 1IP5A 4KXIA 1JJ0A 4LYZA 3W3EA 5LVHA 3B0OA 4NGZA 3J4GA 1JSFA 3ATNA 1GDWA 1RE2A 2XBSA 3A96A 2IFFY 4RW2A 5JENB 1GBXA 2FBBA 1BB4A 1KIQC 3TXFA 1JWRA 1LHJA 1YAOA 1IWTA 1LPIA 4HSFA 1F0WA 2YBJA 1NKHA 1JKAA 2HEDA 5B1GA 1OUFA 5B07A 5L3HA 1XSFA 5KXMA 1LSYA 2FYDA 5HLLA 1IY4A 1GF8A 1IR7A 2LZTA 5IELA 1NDGC 1BWHA 1LSEA 2Y8PA 2ZWBA 1LMOA 1UIAA 1VAUA 5LAGA 4GLAA 4DWXA 1GD6A 4PPOA 2MEIA 1GB9A 1CJ6A 5C6LA 1KIRC 1LZ5A 2ZYCA 2DQCY 4H9IA 5KKJA 2Z2EA 4WM1A 1HEOA 4ETAA 4GN5C 3ULRA 5KXKA 1YAMA 1I20A 4GCEA 1GE0A 1IO5A 2YBMA 4WOAA 4XJIA 5LVKA 4EOFA 1UC0A 1REYA 5L3IA 3B72A 4IJ4A 2AUBA 4TSBA 1QSAA 4TX7A 1W6ZA 1GBYA 3CT5A 2I26L 1LZRA 1QDRA 1TAYA 5F9UA 1D9UA 4QDNA 1B7QA 1DQJC 207LA 4C5FA 1GE1A 4II8A 1IR9A 1J1XY 4MCKA 3WU9A 1D6PA 1KXXA 1OUHA 2BQEA 1Z55A 2F4AA 1WQRA 2ZILA 1IP2A 1I1ZA 1LMNA 3A90A 2Z18A 1AT6A 4DD3A 1GB3A 1SQ2L 4YOPA 4NSGA 1LJ4A 1B0DA 3IJVA 1JEFA 1UIHA 1JTOL 1G7IC 3N9CA 4NY5A 5A3ZA 3RU5A 1DPXA 5F16A 2DQDY 5T3FA 3TMXA 1GB5A 1HEWA 1B5WA 1LZSA 4U3XB 4OWEA 5I4XA 1IWZA 1IWXA 3A6BY 3EXDA 2CJLA 4RLMA 1H87A 1GBZA 4PRQA 2CDSA 3HFMY 5E4PA 1YAQA 3VWOA 1QIOA 1LJGA 1LJKA 2XJWA 4WM4A 5APCA 1JJ3A 4GN3A 1AKIA 1LMPA 1DXJA 1HMLA 4ANRA 4NGJA 1FKVA 4LYCA 5LAFA 2ZIKA 1J1OY 1LZBA 1WTNA 1GBWA 1LZTA 1OQMA 3M18B 4NGWA 2CWIA 5FHWA 4Z3MA 2XTHA 4H8ZA 3T36A 2LYMA 3GXKA 1LYOA 4UWNA 1XGQC 2YSSC 4NG1A 4HV2A 4DD1A 1XFPL 1UBZA 1HSXA 4QEQA 1QUTA 5KXTA 3W6FA 1TEWA 2F4GA 4N8ZA 5LVGA 3LZTA 1EL1A 4Z41A 1JSEA 1GFGA 2MEHA 1FLYA 1GDXA 3A3RX 7LYZA 1HEPA 1IIZA 3WMKA 4KPMA 2DQIY 1GFTA 4H9HA 5LA8A 2ZQ3A 1D6QA 1IWWA 1GWDA 4H93A 2YBLA 4LYMA 2YBHA 1GF9A 3TXJA 4J7VA 2MEBA 4WG7A 4ZEEA 1B7MA 1LZNA 1YQVY 2HECA 3CSRA 5F9XA 5F14A 1GE3A 1DI3A 1YROA 2DQGY 2EIZC 5APEA 1LSAA 1INUA 1JITA 4H9FA 3TMWA 5LA5A 1LZDA 1GF4A 2BQMA 3QY4A 1RI8B 4DD2A 4H92A 1D0MA 1A4VA 4BAFA 3AZ6A 3TMVA 4DD0A 1WQPA 1ZVYB 2ZNWY 4NGLA 5DN5A 2CGIA 1REZA 3WPKA 3CB7A 1IP3A 3CSZA 4WL6A 1VDSA 3G3BB 4LZTA 1UACY 4X3BA 4NEBA 4HTKA 1LYSA 3HBEX 4FJRA 4YF2A 5KY1A 1IORA 1OUJA 4H1PA 1ZV5L 3RW8A 5APDA 4GCBA 4PRUA 1GHLA 3EBAB 3RZ4A 2HEFA 1ZVHL 3BKHA 3LHMA 3W6EA 2DBTA 1DPWA 1GXV2 1NF5A 2DQFC 5KXNA 2Z2FA 1CKGA 5B06A 194LA 2PC2A 2G4NA 9LYZA 5KXRA 3FI7A 2EQLA 1GFKA 1UA6Y 4N0JA 1LSZA 1IOQA 1LOZA 4NGKA 1J1PY 1HELA 3CSQA 5KXZA 1GBOA 1GFHA 1JKDA 1MLCE 1FLWA 3TXKA 153LA 3T6UA 2D6BA 2MEFA 3W6BA 3IJUA 3TXDA 1T6VL 1W08A 1B7SA 2HEBA 1LKRA 4H90A 5E9RA 2BQOA 1CJ9A 1LHIA 1XEJA 4G9SA 1OUEA 4LGKA 1LCNA 2HU3A 4OOTA 3WXTA 1UUZC 1UICA 2BQLA 5IHGA 1JISA 5DM9A 1B5YA 1LZ9A 3WW6A 4O34A 4C3WA 4DDBA 1GAYA 1IEEA 1LZ6A 1IY3A 4OOOA 1LMQA 1LSDA 193LA 1REXA 4NHPA 5LXWA 4OWAA 4XJDA 5DLAA 3WULA 1IC5Y 2W1XA 2GV0A 1UCOA 1HFYA 1NDMC 4YENA 5FSTA 3WUMA 1RJCB 1E8LA 4Z46A 5KXSA 3WW5A 3A92A 2ZYPA 1LMTA 1TBYA 4OWHA 3LYOA 1LZEA 4I0CA 4I8SA 4CFOA 2XBRA 4H8YA 1LJ3A 5LVJA 3A94A 2EPEA 1PZYA 132LA 1GF0A 3J6KA 3A91A 2C8PA 5B05A 1LHKA 5D5FA 3P66A 1YILA 4CJ2A 1IP7A 2HUBA 3A95A 4BS7A 1IWYA 2B5ZA 4XJHA 1NQIA 4NHIA 3HBHA 4H8XA 3AGIA 135LA 4DDAA 1AZFA 1IP6A 1B2KA 1UIGA 1QTEA 1LZ4A 4WM2A 4ZIXA 4LFPA 4RW1A 1LJNA 5M1YA 5F81A 2H9JA 1WVUA 4H94A 1XGTC 3P4ZA 2N5ZA 4J1AA 1B7OA 1GF5A 1LMCA 4WG1A 4XN6A 5APFA 3TXIA 1CJ7A 5LYTA 4CGEA 3EMSA 1BHZA 5LINA 4R0FA 4G4HA 2BQCA 1GXXA 2ZIJA 4H9EA 1V7TA 3CQLA 1B5ZA 1C45A 1GBSA 4XJFA 2IHLA 1GB2A 4GCCA 4B49A 1CNSA 1LSMA 1NHEA 2YVBA 4HTNA 4QY9A 5KXLA 4HPEA 4WMGA 4LFXA 1GFAA 2DQHY 4NIJA 4WLDA 1D0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LYZA 3P68A 4ETEA 139LA 4PJ2C 3WPLA 4IASA 3TXGA 1DI4A 1GAZA 4G49A 1GB7A 1L41A 4LT0A 4YEMA 1L67A 4B4EA 205LA 1WQOA 201LA 2Q9EA 4LYTA 1LSPA 1XEPA 4HJZA 1P36A 1BGIA 5HNLA 1B5UA 1LHLA 1YAPA 3ZVQB 4H9BA 3C8QA 2OU9A 4GN4A 2Z39A 1DYGA 4E3UA 3WPJA 5L9JA 4ARQB 3AJNA 3GUPA 184LA 1ALCA 1C6HA 1VDQA 1HNLA 3L2XA 4BAPA 1L97A 1L21A 1TLAA 1KXYA 2DQJY 3A6CY 3AW7A 3WYHA 1JUGA 1MELL 4DYGA 3AW6A 3G3AB 1PQKA 4WL7A 2RSCA 2EKSC 4G4BA 4I7RA 3P64A 4HP0A 1HEMA 3QE8A 1LJJA 1GF6A 3LN2A 2D91A 3WUNA 1LSFA 1IOTA 3M3UA 2BAAA 3AGGG 1SX2A 134LA 1TDYA 4DDCA 4HJVA 3A34A 5AMYA 4ZPUA 3PBLA 4NWHA 1C63A 1LPYA 2OE4X 1KW5A 1LI6A 217LA 2Z12A 1OYUA 2YDGA 1LYZA 3B6LA 1YKXX 2MEDA 1FDLY 1BWIA 4I7QA 4R6CA 4IATA 1HSWA 2D4KA 1UIDA 4OW1A 1WVVA 3KAMA 1G0JA 1BWJA 1C6TA 1LGUA 1LSGA 1LZ1A 3ODUA 1WQNA 5I53A 1D0KA 4I7SA 4OO9A 1IP1A 4GLVA 1UIFA 192LA 5C6IA 4LT1A 5D5CA 2A7DA 1L23A 4DT3A 4XENA 3WVXA 4WO9A 4XJBA 4W53A 1IWVA 1LGXA 1QUGA 1VEDA 3HT6A 1G7JC 111LA 1YKYX 129LA 1GFEA 1IWUA 1LI3A 4I7JA 3WH1A 114LA 1F10A 1L54A 1ZMYL 181LA 1CV4A 209LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HF4 A;  1JKB A;  2LYZ A;  1C43 A;  5LVI A;  1VFB C;  1HHL A;  4DC4 A;  2G4P A;  3P68 A;  3WL2 A;  4M4O A;  1DZB X;  4DD7 A;  4ETE A;  3A67 Y;  2W1M A;  2Z37 A;  1YAN A;  1GEZ A;  4PJ2 C;  5KXP A;  1SLY A;  1XGU C;  4N5R A;  4M6D A;  3WPL A;  4ET9 A;  1G7L C;  5HNC A;  1NMM A;  4IAS A;  2HTX A;  2D4J A;  5FEK A;  4MR1 A;  1GFV A;  4NFV A;  3TXG A;  3LYM A;  1DI4 A;  1GAZ A;  4G49 A;  1GB7 A;  4XAD A;  4LT0 A;  1CKF A;  2BPU A;  4YEM A;  2F2N A;  2W1Y A;  4HV1 A;  5LYZ A;  4B4E A;  4EMN A;  5KXO A;  1WQO A;  1NBZ C;  4YM8 A;  2F30 A;  4NSJ A;  4CFP A;  5I4Y A;  4LYT A;  4UWU A;  5FEL A;  1OUB A;  1F6R A;  5K7O A;  2Z19 A;  1LSP A;  4RLN A;  3B0I A;  4HJY A;  4HJZ A;  1PS5 A;  1RCM A;  1B7N A;  1BGI A;  4WLT A;  1H6M A;  5HNL A;  5II3 A;  3MGW A;  2BQK A;  3WUA A;  1AT5 A;  1B5U A;  1LHL A;  2C8O A;  154L A;  1YAP A;  3ZVQ B;  1FBI X;  4H9B A;  4H91 A;  2W1L A;  3ZEK A;  4GN4 A;  4NSI A;  2Z39 A;  4WM5 A;  1GEV A;  2BQN A;  3SP3 A;  4E3U A;  3WPJ A;  5L9J A;  1JKC A;  1LZY A;  3AJN A;  3W6D A; 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 3WXT A;  1UUZ C;  1UIC A;  2BQL A;  5IHG A;  1JIS A;  5DM9 A;  1B5Y A;  1LZ9 A;  3WW6 A;  4O34 A;  4C3W A;  4DDB A;  1GAY A;  1IEE A;  1LZ6 A;  1IY3 A;  4OOO A;  1LMQ A;  1LSD A;  193L A;  1REX A;  4NHP A;  5LXW A;  4OWA A;  4XJD A;  5DLA A;  3WUL A;  1IC5 Y;  2W1X A;  2GV0 A;  1UCO A;  1HFY A;  1NDM C;  4YEN A;  5FST A;  3WUM A;  1RJC B;  1E8L A;  4Z46 A;  5KXS A;  3WW5 A;  3A92 A;  2ZYP A;  1LMT A;  1TBY A;  4OWH A;  3LYO A;  1LZE A;  4I0C A;  4I8S A;  4CFO A;  2XBR A;  4H8Y A;  1LJ3 A;  5LVJ A;  3A94 A;  2EPE A;  1PZY A;  132L A;  1GF0 A;  3J6K A;  3A91 A;  2C8P A;  5B05 A;  1LHK A;  5D5F A;  3P66 A;  1YIL A;  4CJ2 A;  1IP7 A;  2HUB A;  3A95 A;  4BS7 A;  1IWY A;  2B5Z A;  4XJH A;  1NQI A;  4NHI A;  3HBH A;  4H8X A;  3AGI A;  135L A;  4DDA A;  1AZF A;  1IP6 A;  1B2K A;  1UIG A;  1QTE A;  1LZ4 A;  4WM2 A;  4ZIX A;  4LFP A;  4RW1 A;  1LJN A;  5M1Y A;  5F81 A;  2H9J A;  1WVU A;  4H94 A;  1XGT C;  3P4Z A;  2N5Z A;  4J1A A;  1B7O A;  1GF5 A;  1LMC A;  4WG1 A;  4XN6 A;  5APF A;  3TXI A;  1CJ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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