1LHLA

Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with x-ray structure analysis of proline mutants
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNPGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
publication title Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with X-ray structure analysis of proline mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
total genus 49
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lhlA00
1FKQA 1JWRA 4R6CA 2BQMA 1IWVA 5DL9A 5KXSA 4DDCA 1BB7A 1LSCA 2FBDA 4Z41A 1HEQA 3W6BA 154LA 3A6CY 2EIZC 1BB6A 1GB2A 5II3A 4IJ4A 1CJ8A 4NFVA 4B4EA 1IORA 2LYMA 1YANA 2XTHA 4ETBA 5LXWA 2I26L 1QTKA 4WM4A 2XBRA 4WL6A 1GPQC 1BHZA 4WMGA 4Z3MA 1OP9B 3B6LA 1HEWA 1LZEA 4LYOA 2W1YA 4ANRA 1LZ1A 3ATOA 4WOAA 4H9FA 1LOZA 4NGIA 1IP5A 134LA 2YBIA 2MEDA 5I5QA 1LZBA 2ZIJA 3OJPA 1D9UA 2D91A 4UWNA 1B2KA 1YIKA 2MEAA 1LJFA 3AW7A 3LN2A 4QY9A 153LA 1GB3A 1F10A 4WG7A 1C7PA 3RZ4A 1HMLA 1ZVHL 4B4JA 1ZV5L 4H9EA 4H91A 3VWOA 1IEEA 5M1YA 5B1FA 132LA 1BB3A 4WLDA 1LJGA 1GAYA 3LZ2A 1JITA 2MEFA 1GFKA 1QDTA 3TXDA 1LMCA 1OUAA 2F4GA 5IELA 1GB7A 1HC0A 2ZQ3A 4BADA 3W6FA 1TDYA 4H1PA 1LTMA 1LHHA 3EXDA 4OWBA 1TEWA 3E3DA 2EPEA 1KIRC 4R0FA 1CKGA 4QGZA 2G4QA 3TXGA 1BWHA 4GN4A 4TSBA 4BAPA 1B5XA 1OUDA 4N0JA 1HMKA 3WXTA 4UWVA 4DD2A 1JSEA 1GE0A 3WUAA 4TUNA 4M6DA 1B5VA 1GFUA 1NHEA 1IO5A 4NGWA 5APDA 4LT3A 5KXPA 5B07A 194LA 1YAPA 1C10A 3W6CA 1UIDA 1D0LA 3RT5X 1QSWA 4BAFA 1CNSA 1GFVA 3EMSA 2Z37A 3A3RX 5APFA 1GEZA 1GF0A 3WUMA 4CJ2A 1CJ7A 3AZ4A 3HBEX 5DN4A 1ZVYB 1FDLY 1LYOA 1YL1X 4DT3A 6LYTA 1LZNA 1GFTA 1LJIA 2DQJY 1JTPL 1LSDA 1B7PA 1DZBX 1UUZC 3TXIA 1QQYA 2DQGY 1GE2A 1LHKA 3OK0A 3AJNA 1UIGA 3IWRA 3WH1A 1W6ZA 4LYTA 1CKDA 2BQGA 4KXIA 5LA5A 1FLYA 1AM7A 4KT3A 5DM9A 4H9IA 3WPKA 4LFXA 1XGPC 4NWHA 1IP2A 2CDSA 4KPMA 1VFBC 1GE3A 5F9UA 4W94A 1ALCA 1JTTL 2G4PA 4YF2A 1YL0X 1D0KA 4OOOA 1JKCA 1GBZA 2GV0A 1EQEA 5KXYA 1NDMC 1HEOA 1VDPA 2FYCA 3A90A 4H90A 1FLUA 1J1XY 2DKVA 4HTKA 1DI4A 1LJ3A 1LSMA 1QUSA 1SQ2L 193LA 1FKVA 5LINA 1LSYA 1CKFA 1LZAA 2W1LA 4J7VA 4G49A 4AGAA 4CFPA 1LMAA 3N9CA 1YILA 2BQJA 4HTNA 4NSGA 3ZVQA 2MEEA 5HNLA 1OUBA 3TMUA 1VAUA 3A94A 2IHLA 1OUIA 3EBAB 1IOQA 5T3FA 4RW1A 1JUGA 5APEA 1F6SA 1NKHA 1HFZA 8LYZA 5A3EA 3TMVA 5KXWA 1I1ZA 4G4CA 1GXXA 4RW2A 2CJLA 2BPUA 1BGIA 3CT5A 1T3PA 3MGWA 1O23A 133LA 3A93A 3HFMY 1B7QA 1JKBA 1LSBA 1WQNA 4PHIA 5APCA 4XYYA 2BQBA 2Z2EA 1RJCB 4GLVA 7LYZA 1WQRA 4B1AA 1DQJC 3G3AB 1J1PY 1CKCA 5E4PA 2DQEY 3CSZA 3TXBA 4AXTA 1VDTA 1YKXX 2BQDA 4N5RA 3AW6A 1B9OA 4J0LA 5FDJA 1B7LA 5LAGA 4LYCA 2BQNA 5I4XA 1I20A 3N9AA 1LJKA 1I56A 1LSAA 1QUTA 2Z12A 2ZNXY 3G3BB 4LYBA 4LZTA 1IC4Y 1G7JC 4XN6A 4NGLA 4BS7A 1UBZA 4Z46A 1FLWA 1VEDA 3GXRA 2Z2FA 4ETAA 2DBTA 1LHIA 4GCFA 4CHXA 1IX0A 4H9AA 1YQVY 2ZQ4A 4ET9A 1LYYA 1T6VL 1WTMA 1OUFA 4H8XA 2Z38A 4U3XB 4ETEA 5B1GA 5KXOA 1IWYA 2H9JA 1LKRA 1LSFA 1HHLA 4WM2A 2HU1A 4G9SA 4J1BA 4TX7A 2HEEA 1DKKA 3LHMA 1ZMYL 1LZ8A 1VATA 1LSGA 1JKAA 1XSFA 2D4KA 2ZWBA 4NGKA 1GWDA 4DD7A 1B7RA 5LVHA 5DLAA 1GAZA 2CGIA 5L9JA 4H92A 2MECA 4XJGA 4DD1A 4GCCA 4CGEA 1YAMA 4NSHA 1YKYX 3QNGA 1LZYA 5KY1A 1UC0A 3D3DA 1YAQA 4ZIXA 3WYHA 2FYDA 1RCMA 5C6LA 5F16A 1DKJA 5D5CA 1LZ6A 1GF9A 1GBYA 1RFPA 2ZNWY 1GE4A 1D6PA 1KXXA 1UICA 2BQHA 5F81A 1H87A 5C6JA 2C8OA 1AT6A 4H8YA 1PZYA 1D6QA 3TXFA 1IR9A 3LYTA 1A2YC 1IR8A 2HECA 4OWHA 5B05A 2ZILA 3N9EA 4N9RA 1F6RA 2EQLA 2HUBA 4NGYA 4XJBA 1C46A 1JEFA 2DQAA 2X0AA 5KJ9A 4DDBA 4EMNA 2ZYPA 1V7TA 4N1CC 4NHIA 5LVKA 3FI7A 1IP7A 4NHSA 1XGRC 4DYGA 1LSEA 4LGKA 5I4YA 1RE2A 2YBMA 4YM8A 4M4OA 1GBOA 3RW8A 3BKVA 1GD6A 1UIEA 2CWIA 1IWWA 4EOFA 2BQEA 3T36A 4N8ZA 1IY3A 4DC4A 1QDRA 5IDDA 1Z55A 4P2EA 5HMJA 3K3TA 4NG1A 4XENA 1JTOL 2YBHA 3HBHA 1KIPC 1GF3A 1LJJA 1IY4A 1VDSA 1XEJA 2I6ZA 207LA 3J6KA 3P68A 2IFFY 4WLYA 5DN5A 4G4HA 2HTXA 2H9KA 5L3IA 3D9AC 2HEBA 1LZCA 2AUBA 3IJUA 5LYTA 1NBZC 1P2CC 1JJ1A 1B5ZA 1XGQC 3A6BY 2Z39A 1IWXA 1C45A 2BQKA 2D6BA 2ZYCA 4D9ZA 1WVUA 1IP6A 5FELA 4IASA 1UIFA 4OOTA 1HEMA 5KXRA 1LZRA 3F6ZA 1UIHA 1GFHA 1FN5A 1XFPL 4NGVA 3W6AA 2HEAA 3WU9A 1LYZA 3FE0A 3WXUA 4DD3A 4ETCA 1B5YA 3AZ5A 5LIOA 4MR1A 5L3HA 3T6UA 3W6EA 3WVYA 5JENB 3CB7A 4XJDA 3TXHA 1HSWA 4GCDA 4TSCA 4ETDA 1LZTA 3AYQA 4PRQA 2BQAA 4TTDA 4B0DA 2I25L 4HJYA 4WLXA 1INUA 2PC2A 3TXJA 1LJHA 1IC7Y 2Q0MX 1W08A 4WM5A 3WVXA 4PJ2C 1JHLA 1J1OY 1LPIA 1WQQA 4J1AA 4ZEEA 1E8LA 2C8PA 3TXEA 1G7LC 4B4IA 2B5ZA 2YVBA 2LZTA 2Z19A 4FDYA 1CJ6A 1GB5A 4GN3A 2MEGA 2YSSC 1LYSA 1DI5A 1HEPA 1REYA 2VB1A 2WARA 1LMTA 1IWUA 1JISA 2BQOA 4HJZA 3LYZA 1BVKC 2N5ZA 4OW1A 2BLXA 3CSQA 4PRUA 2W1XA 4I0CA 1DPWA 4HSFA 5FCPA 1G7HC 1NMMA 5FHWA 2MEHA 5HLLA 2NWDX 1JSFA 2ZIKA 4YEOA 5I4WA 4GCEA 1IOCA 1LMNA 3QE8A 5FEKA 4NGOA 1TBYA 3TMXA 3WPJA 5C6IA 2F30A 5KXNA 4XJHA 1GEVA 1IVMA 4B49A 1KXYA 5HMVA 1GBSA 1YROA 3B0OA 1GF4A 1HFYA 4RLMA 4YENA 1GFEA 1SLYA 1B7OA 5B59A 3WL2A 1GDXA 4WM6A 1LZSA 1IP4A 5KXKA 5A3ZA 2LYOA 4HV1A 3AZ6A 4XADA 3WPLA 3WULA 2YBLA 5LA8A 2F2NA 1LCNA 4NGJA 5LAFA 4ML7A 1MELL 1DPXA 1LZ5A 4DDAA 2BAAA 4LT2A 1XGUC 1GXV2 1LMOA 3LZTA 1BVXA 3QY4A 1IOTA 1LSPA 4WO9A 3ZVQB 1GF7A 2DQFC 1G7IC 5HQ1A 4NSJA 3B0KA 4GLAA 1LAAA 2Y8PA 1UIAA 1B7NA 4LFPA 3A34A 3W3EA 5LYZA 4HTQA 4YEMA 1REMA 1WQOA 2BQIA 1HFXA 3BKHA 1TCYA 4OWEA 4I8SA 2HEFA 1YAOA 1BWIA 1OUGA 3CT1A 5D5FA 1H6MA 3EO5A 1XEKA 1G7MC 1KIQC 5E9RA 4OWCA 2BQLA 1NF5A 1GDWA 6LYZA 2DQCY 3AZ7A 4DD0A 3CT0A 3A96A 3A8ZA 5ILFA 1LHLA 2G4NA 2YBJA 4QEQA 1LJ4A 3B0IA 4WG1A 4QDNA 4RDSA 2DQIY 1GB9A 3M3UA 1OUEA 1GF8A 5I53A 2D4IA 1IP1A 3WW6A 1B7MA 1LMQA 1BWJA 4MCKA 4WL7A 3KAMA 4H9HA 1YKZX 1GFJA 1LMPA 3AB6A 1IIZA 3W6DA 4DWXA 4HPEA 208LA 4ZFPA 1LJEA 1REZA 2BQCA 2A7FA 135LA 1QSAA 1AKIA 1HF4A 1EQ5A 4L41A 3WMKA 1B0DA 4H94A 1NDGC 1GFAA 1GFGA 2LYZA 1LSNA 4CFOA 1JIYA 4II8A 5B06A 1GF6A 3HBDA 4FJRA 3P64A 3A92A 2MEIA 5I54A 2YDGA 3WUNA 3A3QA 1AT5A 4WLTA 4WM1A 1QIOA 2HEDA 4HJVA 4H93A 2HU3A 1JJ0A 1OUHA 1B5WA 4NSIA 5J7CA 1HSXA 3LYOA 2BQFA 3P65A 3WW5A 4WM3A 1IWTA 1D0MA 3A67Y 2DQDY 5K7OA 4C3WA 5KKJA 1XEIA 1OUJA 1HERA 3M18B 1REXA 1C43A 1JPOA 2W1MA 1HNLA 3A95A 4HP0A 1HELA 4G4BA 3CSRA 4GN5C 4LYMA 1IOSA 1LZGA 3CQLA 4OWAA 4O34A 1DI3A 4Z98A 3SP3A 3TXKA 1KXWA 1UCOA 4H9CA 5IHGA 9LYZA 1GHLA 1LSZA 5KXXA 1B5UA 4LYZA 3ATNA 4NHQA 1XGTC 4X3BA 4H9BA 1NBYC 4KL7A 1LZ9A 1UIBA 3J4GA 1UA6Y 1FBIX 4NEBA 1GB8A 2LHMA 2DQHY 1JKDA 1LZDA 4UWUA 4ET8A 2Z18A 2A7DA 1NQIA 3AGGG 3A91A 1BQLY 1GF5A 1LJNA 4YOPA 5FSTA 2MEBA 5KXZA 1GFRA 2XBSA 4W96A 1WQMA 2FBBA 4A7DA 3P66A 1GB6A 3AGIA 3WU7A 5LVJA 4LT1A 4C5FA 2LZ2A 1F0WA 1MLCE 1NWGA 5HNCA 1PS5A 3GXKA 1EQ4A 5AMYA 5F14A 4TWSA 4PGJB 3ULRA 3P4ZA 1B7SA 3RU5A 1BB5A 1CKHA 1WTNA 3LYMA 4DD9A 2RSCA 4NY5A 4HV2A 4H8ZA 5KXLA 1BB4A 1GBXA 5LVIA 2H5ZA 5KXTA 1HENA 4N1EI 3WU8A 1A4VA 1GB0A 4NHPA 4NHTA 3RNXA 5F9XA 1IR7A 1N4FA 4MSTA 1LHJA 1WVVA 1IP3A 4NG8A 5KKIA 4XJFA 1UACY 3TMWA 1EL1A 2D4JA 5KXMA 4WO6A 5LYMA 2F4AA 1C08C 1AZFA 1LKSA 3AGHA 5LVGA 1TAYA 2YBNA 3IJVA 4NIJA 4XJIA 1FLQA 3B72A 1WQPA 1DXJA 4GCBA 5EBHA 1JJ3A 4RLNA 1OUCA 2XJWA 4IATA 5ILCA 1VDQA 2BLYA 4PPOA 1GE1A 1IC5Y 1LZ4A 1QTEA 4HPIA 4E3UA 1OQMA 1IWZA 1V7SA 2EKSC 4NGZA 1CJ9A 3ZEKA 1GBWA 4NWEA 1RI8B 1LHMA 4LT0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OVKA 227LA 1BB7A 3A6CY 118LA 2XTHA 235LA 5LXWA 1KS3A 4WM4A 2XBRA 1BHZA 4WMGA 1G0JA 1LZ1A 3ATOA 1LOZA 4NGIA 134LA 1L05A 1LZBA 1D9UA 3LN2A 4WG7A 3RZ4A 2O4WA 1LGUA 182LA 1BB3A 1LJGA 4EKRA 1JITA 2MEFA 2OE9X 5IELA 3DN8A 4BADA 4LDLA 192LA 3E3DA 1L38A 1OUDA 1L81A 113LA 3WXTA 1B5VA 244LA 194LA 3RT5X 2Z37A 3A3RX 4CJ2A 5DN4A 166LA 1ZVYB 1DZBX 3TXIA 1QQYA 3AJNA 1UIGA 231LA 1FLYA 1AM7A 4LFXA 1L77A 1IP2A 1L86A 2CDSA 4KPMA 1VFBC 140LA 2G4PA 1YL0X 1QS9A 2GV0A 5KXYA 1NDMC 4H90A 2DKVA 1LSMA 1QUSA 1L15A 1SQ2L 1LSYA 2RB2X 2W1LA 4G49A 4NSGA 246LA 4HTNA 1L13A 3ZVQA 1WTHA 3TMUA 1VAUA 3A94A 4RW1A 1C6EA 3DN6A 161LA 3HT8A 4I7SA 4RW2A 1BGIA 3HDEA 133LA 1LYIA 5APCA 1WQRA 3C8QA 1DQJC 5E4PA 1VDTA 2IGCA 4N5RA 1B9OA 5FDJA 5LAGA 219LA 1LSAA 1C68A 2Z12A 4LYBA 1DYDA 3HWLA 1UBZA 1IX0A 2ZQ4A 1T6VL 3PBLA 1OUFA 4H8XA 4U3XB 4EPIA 4TX7A 3HT9A 1DKKA 1CV4A 1LSGA 1LW9A 1GWDA 1B7RA 4DD1A 2MECA 4GCCA 222LA 4LDOA 2Q9EA 1YAQA 4ZIXA 1KW7A 3HT6A 1GE4A 5C6JA 111LA 5F81A 2C8OA 1PZYA 2LCBA 1IR9A 3N9EA 4N9RA 1F6RA 1L90A 4NGYA 2O7AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FKQ A;  1JWR A;  4R6C A;  2BQM A;  1IWV A;  5DL9 A;  5KXS A;  4DDC A;  1BB7 A;  1LSC A;  2FBD A;  4Z41 A;  1HEQ A;  3W6B A;  154L A;  3A6C Y;  2EIZ C;  1BB6 A;  1GB2 A;  5II3 A;  4IJ4 A;  1CJ8 A;  4NFV A;  4B4E A;  1IOR A;  2LYM A;  1YAN A;  2XTH A;  4ETB A;  5LXW A;  2I26 L;  1QTK A;  4WM4 A;  2XBR A;  4WL6 A;  1GPQ C;  1BHZ A;  4WMG A;  4Z3M A;  1OP9 B;  3B6L A;  1HEW A;  1LZE A;  4LYO A;  2W1Y A;  4ANR A;  1LZ1 A;  3ATO A;  4WOA A;  4H9F A;  1LOZ A;  4NGI A;  1IP5 A;  134L A;  2YBI A;  2MED A;  5I5Q A;  1LZB A;  2ZIJ A;  3OJP A;  1D9U A;  2D91 A;  4UWN A;  1B2K A;  1YIK A;  2MEA A;  1LJF A;  3AW7 A;  3LN2 A;  4QY9 A;  153L A;  1GB3 A;  1F10 A;  4WG7 A;  1C7P A;  3RZ4 A;  1HML A;  1ZVH L;  4B4J A;  1ZV5 L;  4H9E A;  4H91 A;  3VWO A;  1IEE A;  5M1Y A;  5B1F A;  132L A;  1BB3 A;  4WLD A;  1LJG A;  1GAY A;  3LZ2 A;  1JIT A;  2MEF A;  1GFK A;  1QDT A;  3TXD A;  1LMC A;  1OUA A;  2F4G A;  5IEL A;  1GB7 A;  1HC0 A;  2ZQ3 A;  4BAD A;  3W6F A;  1TDY A;  4H1P A;  1LTM A;  1LHH A;  3EXD A;  4OWB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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