1LSGA

Three-dimensional structure of the platelet integrin recognition segment of the fibrinogen gamma chain obtained by carrier protein-driven crystallization
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MKVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRLQQHHLGGAKQAGDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hybrid protein
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Three-dimensional structure of the platelet integrin recognition segment of the fibrinogen gamma chain obtained by carrier protein-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 44
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-10-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lsgA00
1OP9B 4MR1A 4GN4A 4GCFA 5LVGA 5HMVA 1GF7A 1PS5A 3FI7A 2Z2FA 1C10A 5LA8A 1LMAA 4YM8A 2H9KA 1WQOA 1NF5A 1LZGA 4GCBA 1B7NA 1GB8A 4WM4A 4WM1A 2C8OA 1GAYA 2ZIJA 4QDNA 1CJ8A 1XGTC 1EQ5A 3WMKA 1TBYA 5IHGA 4YEMA 4OWCA 2DKVA 1GFUA 1GB2A 1FLUA 1GF9A 1ALCA 4XJDA 3W6FA 1C46A 1SLYA 2DQCY 1LMQA 1IWXA 1JSFA 4OWAA 1XFPL 1JKCA 3TMWA 5F16A 4LFXA 2HUBA 4GCCA 5KXXA 4H8ZA 1GB7A 1I56A 3P4ZA 4U3XB 3WVXA 5HQ1A 5KXKA 4RDSA 1IP6A 1GFEA 1REYA 1GBOA 3CT1A 4Z3MA 1LSYA 1UBZA 1XGPC 3A67Y 4ETCA 3QNGA 1KIQC 3F6ZA 5B59A 4HPEA 1F6SA 5LYMA 5F9UA 3A90A 1LYZA 4XJBA 1BWHA 1REXA 9LYZA 5KJ9A 3BKHA 1FKVA 1KIPC 1J1PY 5KXWA 2FBDA 5HMJA 1LZRA 1GXXA 1QSWA 5KKIA 1C08C 4CFPA 3WULA 2IHLA 1BWIA 1DPWA 4KT3A 2FBBA 1QQYA 5IDDA 2DQDY 4LYTA 2BQCA 1XEIA 3G3BB 1B7OA 1T6VL 4DD7A 4BAPA 3WUAA 2MEGA 1BB7A 1GBXA 2ZILA 1GEZA 1NMMA 1CKCA 3ATOA 1WQRA 2YBJA 5LAGA 1HEQA 1OUFA 4NHTA 2LZ2A 1IOCA 4TSCA 2C8PA 4EMNA 3A3RX 1LHLA 4N0JA 2I6ZA 4LT0A 1BB5A 5AMYA 4H9HA 1TCYA 1LSCA 3BKVA 4GCEA 1QSAA 5C6LA 4DT3A 4CFOA 2HTXA 1CKDA 1RI8B 4LYOA 1GFHA 1LSBA 1QDRA 4OOTA 3OJPA 3GXKA 1B5XA 1BWJA 1WVVA 1GFJA 2ZYPA 3A34A 1HEWA 1IP5A 5J7CA 1JJ0A 4HPIA 1IOQA 1PZYA 4PJ2C 5M1YA 4OOOA 1INUA 3A93A 1RE2A 5DN5A 4XJHA 3AGHA 1HFZA 4NHQA 2ZQ4A 4H1PA 1DKKA 1EL1A 1GF0A 5LAFA 1JJ1A 1OUGA 4YF2A 207LA 4DYGA 2BQIA 4MCKA 5I53A 4H8YA 4NHSA 1JWRA 1F10A 1JTOL 1H87A 1IVMA 1BGIA 2DQHY 4TTDA 2MEDA 5I4XA 1GBSA 4Z41A 4PPOA 1ZMYL 1B5UA 1LSFA 1JIYA 1HELA 1YKXX 4WLYA 5B06A 1GF3A 2Z19A 2N5ZA 5LA5A 1B0DA 1JUGA 1B7PA 1DQJC 3WU9A 1BB4A 5KXPA 5LVKA 2BQKA 2BQNA 1GFTA 2MEFA 1B2KA 1JKDA 3MGWA 1VDQA 4YENA 3WXTA 3WXUA 3ZVQA 1G7MC 4KPMA 3HBDA 3AZ4A 1GE4A 2F4AA 1LMTA 3AW6A 1IP2A 4J1AA 4Z46A 1DI5A 1B7RA 1LJFA 2BQGA 2DQIY 4OW1A 5APEA 4UWNA 1G7JC 4DD3A 2HEEA 5LVJA 1HMLA 3E3DA 4NG8A 1DI4A 3AB6A 3TXJA 1BVXA 3WPJA 5KXOA 4AGAA 1HC0A 3TXGA 2D4KA 135LA 1HEOA 1LJGA 2XJWA 2YBHA 4LGKA 1EQ4A 4DDCA 4LT1A 4XYYA 1JHLA 1IEEA 2I26L 2BQDA 2F4GA 2H5ZA 4H93A 1GE0A 1GFGA 2VB1A 3ATNA 1LAAA 1YIKA 4HJVA 3RU5A 4ANRA 1BHZA 1NKHA 1VEDA 1BVKC 2ZIKA 1OUBA 3B0OA 1MELL 4LYMA 1WTNA 5B1FA 1LSGA 3CT0A 3WL2A 4NG1A 4WO6A 3AZ5A 3B0KA 4H9CA 4W96A 1I1ZA 1HSWA 1NBZC 1IX0A 4ETBA 1O23A 5KXMA 1IP4A 1FN5A 2CWIA 2BQBA 2D6BA 1JTTL 4DDAA 1IC5Y 3QE8A 4OWEA 1LMPA 1LZNA 2F2NA 1C45A 1LZDA 1LZSA 1YILA 3G3AB 4HTQA 1LHJA 3B0IA 1LZYA 3P65A 5KXZA 4BAFA 3AW7A 4WM2A 2H9JA 5F81A 4P2EA 4H9AA 4XN6A 1OUHA 2Z39A 5HLLA 3RT5X 4WM6A 4NGLA 2MEBA 4WLXA 4GN3A 1LSAA 1XSFA 5C6JA 1B7QA 5FDJA 1D6QA 4IATA 4FDYA 3HBHA 1YAMA 5F14A 1B5VA 1NQIA 2Z37A 3LYOA 2YBNA 4TUNA 4XJGA 1J1XY 2CDSA 1IP3A 1OUAA 1RFPA 1GE1A 4UWVA 3CB7A 4HTNA 4ET9A 2HEDA 4WL7A 5DLAA 5LVIA 3W6CA 1CKHA 4HV1A 1IR8A 1UC0A 4A7DA 1JKBA 4EOFA 1G7IC 3HBEX 1KXYA 3A92A 4OWHA 4DWXA 2BQMA 4QY9A 3W6AA 5I4YA 4X3BA 1NWGA 3ZVQB 2ZWBA 4BADA 1N4FA 1IWYA 4NGIA 3EBAB 4H9IA 4B49A 1SQ2L 4CGEA 1GAZA 4M4OA 1GB0A 4DD2A 3K3TA 4ETDA 1XGQC 2WARA 1CNSA 1GB5A 2PC2A 4LT3A 5HNLA 1BQLY 2YBMA 2XBSA 1D0KA 2G4NA 3P68A 4NGZA 208LA 4HTKA 1DPXA 4YEOA 1UACY 1QTEA 1LSEA 4NHIA 1J1OY 3N9AA 3TMXA 1CJ9A 1GF8A 1LMCA 2D4IA 4II8A 4OWBA 2IFFY 1GF4A 3M3UA 4MSTA 4H90A 2LHMA 1MLCE 1ZV5L 4HJYA 2MECA 3AZ7A 1LZ1A 4CJ2A 3IJUA 2YVBA 4NGKA 3TXEA 4I0CA 5DM9A 2Y8PA 5KY1A 1LHIA 4LYBA 1AT6A 3RW8A 5LIOA 1UIGA 1UIHA 2ZQ3A 1XEKA 1LSNA 1CKGA 1GF6A 1DKJA 2DBTA 3W6BA 3KAMA 5FHWA 4IJ4A 4RLMA 3AZ6A 1LSZA 1VDSA 4NGOA 4G4CA 1CKFA 1OUIA 2ZNXY 4NIJA 3TXHA 5A3ZA 2BAAA 3LZTA 1GDWA 1UIBA 2BQFA 5B07A 3TMVA 4C5FA 4KL7A 6LYTA 3AYQA 1LZ6A 2BQEA 1JISA 4WM5A 1VDTA 1C7PA 3WPKA 1CJ7A 1YQVY 2A7FA 2W1LA 4XENA 2D4JA 5I4WA 2A7DA 1P2CC 2AUBA 3B72A 1B5ZA 1FDLY 2CJLA 4W94A 1GFKA 2HU3A 2HEBA 1LZ9A 1HERA 4BS7A 2BQOA 3N9EA 4H91A 1B5YA 4N1EI 1HENA 5B1GA 8LYZA 1AM7A 132LA 2YDGA 1YANA 1REZA 3IWRA 5ILFA 1G7LC 1LZAA 2NWDX 3LYMA 1LMNA 1B7LA 1RJCB 2YSSC 1RCMA 3AGGG 4ETEA 1IWVA 1LSPA 1V7TA 4XJFA 5KXSA 1F0WA 1LSMA 3D3DA 3FE0A 1LJNA 5F9XA 3A6BY 2LZTA 1LZTA 4WM3A 2HU1A 4Z98A 5LVHA 1FKQA 2F30A 4LYCA 133LA 1NBYC 1VAUA 2Q0MX 1AZFA 1DI3A 2ZYCA 1GD6A 3T6UA 3W6DA 3WPLA 1IWUA 1HEMA 1OUEA 4HP0A 1KXXA 1LKSA 1LZCA 1GBYA 1XGRC 4QGZA 2DQEY 1HSXA 5APCA 4WG7A 4N8ZA 4NHPA 1HF4A 2W1MA 4AXTA 4B4EA 2DQFC 3EO5A 2HEFA 6LYZA 1YAOA 1D0LA 1EQEA 1YAQA 1UIAA 3CSRA 3RNXA 4DD0A 4H94A 5K7OA 134LA 1IP1A 1F6RA 1JSEA 1LKRA 1LJIA 3N9CA 4NWHA 4NY5A 4D9ZA 3D9AC 1G7HC 3P64A 3WW5A 1GF5A 5DN4A 4TSBA 1YAPA 4TWSA 4KXIA 4J1BA 4M6DA 4NWEA 1LZ5A 3TXFA 4RW1A 1B9OA 1OQMA 2BQAA 4H92A 1LJKA 1LCNA 3ZEKA 4H9FA 4PRQA 1FLQA 4G49A 1OUDA 3CSZA 4R6CA 3TXBA 4PHIA 1GEVA 1GXV2 1H6MA 2FYDA 3OK0A 4ML7A 1JITA 4GLVA 5A3EA 5KXLA 5FSTA 3A94A 1IR7A 1IY3A 5LYTA 1GE2A 1XEJA 1GHLA 2LYZA 3WVYA 1Z55A 4N1CC 2MEHA 4DC4A 4ET8A 3GXRA 1GBWA 3ULRA 2YBLA 4LT2A 2I25L 1WVUA 4DD1A 1LJHA 1LTMA 3EMSA 3TXDA 1IC4Y 1LSDA 2XTHA 2EPEA 193LA 1GB6A 3WUNA 2W1XA 1LJEA 4J0LA 4B4JA 5APFA 1LZEA 1FLWA 4ETAA 2BLXA 1A4VA 5HNCA 1LZ8A 1BB6A 3A96A 1WQNA 1NDGC 1LHHA 2BQJA 1GPQC 4I8SA 3TXKA 4NGYA 2B5ZA 1D0MA 2DQGY 5IELA 2BPUA 2Z38A 2G4PA 4L41A 3LYTA 5KXRA 5JENB 3A8ZA 5LXWA 5EBHA 1TDYA 3J4GA 3B6LA 5I54A 1B5WA 1IY4A 1IIZA 1GBZA 1VFBC 5KKJA 5APDA 1D9UA 1HNLA 1T3PA 1LHMA 3HFMY 1LMOA 1QDTA 1LJJA 4H9BA 4CHXA 4QEQA 3IJVA 1GB9A 2BLYA 1IWZA 1BB3A 1OUJA 2G4QA 2LYMA 4NEBA 1IOSA 1IORA 1GFAA 1AT5A 1YKZX 1WQPA 3LHMA 4NGJA 2EKSC 1V7SA 1JKAA 1GB3A 4B0DA 4ZFPA 1C43A 5II3A 3RZ4A 1VATA 3EXDA 4E3UA 1QTKA 1ZVHL 1XGUC 4DDBA 5T3FA 3A3QA 1HEPA 1LHKA 1REMA 2HECA 2XBRA 3CT5A 2Z18A 5D5FA 3VWOA 3TMUA 4B1AA 154LA 4NSGA 4ZIXA 1LPIA 3A6CY 4ZEEA 1FLYA 1GFVA 4WO9A 1JEFA 1ZVYB 2ZNWY 5D5CA 4PRUA 3W6EA 1UA6Y 5FCPA 4RW2A 2RSCA 5LINA 153LA 4LYZA 1HFYA 4NFVA 4B4IA 4DD9A 4LZTA 4GCDA 4NGWA 194LA 5KXTA 1LYOA 4NSHA 1IWWA 1W6ZA 1A2YC 5E9RA 1YKYX 4GLAA 4G9SA 4WLTA 1FBIX 5LYZA 1UIEA 1DZBX 4IASA 7LYZA 1DXJA 2MEAA 4G4BA 4NSJA 3WUMA 5I5QA 1KIRC 2DQAA 1IP7A 3AJNA 3J6KA 5FELA 1QIOA 3QY4A 1I20A 3WU7A 1WQQA 4WOAA 5KXNA 4HV2A 5ILCA 3AGIA 1D6PA 1GE3A 1GWDA 2Z12A 1LYSA 1QUTA 4WLDA 4XADA 3TXIA 1YROA 1YL1X 1YL0X 3WH1A 4C3WA 3W3EA 1LYYA 3CQLA 4HJZA 1VDPA 3WU8A 4NSIA 5C6IA 3LYZA 2X0AA 1TAYA 1IOTA 3SP3A 1UIDA 3A95A 4J7VA 2HEAA 2BQLA 1UUZC 4H8XA 1LJ4A 4WG1A 1E8LA 1CJ6A 1HHLA 3P66A 2BQHA 5L3IA 2FYCA 1IWTA 1WTMA 3LN2A 4LFPA 2DQJY 4WL6A 1JPOA 4O34A 1QUSA 5L3HA 2MEIA 2EQLA 2Z2EA 1IR9A 5L9JA 5B05A 5FEKA 4TX7A 1JJ3A 1KXWA 4NGVA 4N9RA 1LJ3A 1IC7Y 1NHEA 1OUCA 2LYOA 4WMGA 2EIZC 4UWUA 1W08A 4GN5C 4YOPA 3T36A 1TEWA 4FJRA 4RLNA 4H9EA 5E4PA 2MEEA 1GDXA 1JTPL 2W1YA 1UIFA 1HMKA 3CSQA 1UCOA 3M18B 4XJIA 1IO5A 4R0FA 1LZBA 1NDMC 3WYHA 1HFXA 4HSFA 3A91A 2GV0A 5DL9A 2CGIA 1UICA 4N5RA 1B7MA 1B7SA 1LZ4A 3WW6A 1LOZA 2YBIA 4G4HA 1WQMA 5KXYA 1GFRA 2D91A 4PGJB 3LZ2A 1AKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OP9B 4MR1A 243LA 5HMVA 1PS5A 1LMAA 2H9KA 1L57A 1L74A 3VW7A 3GULA 1LZGA 1B7NA 1GB8A 181LA 2C8OA 1TBYA 223LA 4OWCA 1B6IA 2DKVA 1GF9A 2B6WA 3W6FA 4K5YA 3DN8A 3C7WA 1XFPL 3DN1A 2RB0X 5F16A 1GB7A 5HQ1A 1PQMA 4Z3MA 1LSYA 5B59A 1QUHA 1L43A 1L62A 2O7AA 1LYZA 9LYZA 139LA 3HT6A 1J1PY 3LZMA 5KKIA 2Q9DA 3WULA 2HUKA 4KT3A 1QQYA 1L40A 2DQDY 2BQCA 187LA 3G3BB 3WUAA 1BB7A 224LA 1OUFA 1C6GA 2LZ2A 1IOCA 1OWZA 4N0JA 257LA 2I6ZA 1LSCA 1RI8B 4LYOA 1LSBA 3GXKA 1BWJA 1L52A 1HEWA 1LI2A 1L55A 1PZYA 236LA 1INUA 3AGHA 4I7RA 1L18A 4NHQA 1CV0A 1OUGA 207LA 5I53A 1L0JA 188LA 1JWRA 2MEDA 4Z41A 1ZMYL 1P36A 4WLYA 5B06A 1JUGA 1DQJC 1BB4A 5KXPA 4OO9A 2BQKA 1GFTA 1B2KA 1JKDA 3MGWA 216LA 4KPMA 2F4AA 3HH6A 1LMTA 182LA 1B7RA 5APEA 1DYCA 1L0KA 1L91A 1CVKA 5LVJA 1HMLA 3TXJA 1HEOA 1IEEA 2H5ZA 1GE0A 1D2WA 3ATNA 1LAAA 241LA 146LA 180LA 1BVKC 1L23A 1KY0A 2ZIKA 2CUUA 1LGWA 4NG1A 1L73A 2Z6BA 2D6BA 1IC5Y 2F2NA 5KXZA 156LA 1LZYA 3C82A 4WM2A 1LYDA 252LA 2H9JA 5HLLA 4GN3A 1LSAA 2HUMA 4FDYA 3HTBA 5F14A 2Z37A 1L41A 3C80A 4XJGA 1J1XY 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OP9 B;  4MR1 A;  4GN4 A;  4GCF A;  5LVG A;  5HMV A;  1GF7 A;  1PS5 A;  3FI7 A;  2Z2F A;  1C10 A;  5LA8 A;  1LMA A;  4YM8 A;  2H9K A;  1WQO A;  1NF5 A;  1LZG A;  4GCB A;  1B7N A;  1GB8 A;  4WM4 A;  4WM1 A;  2C8O A;  1GAY A;  2ZIJ A;  4QDN A;  1CJ8 A;  1XGT C;  1EQ5 A;  3WMK A;  1TBY A;  5IHG A;  4YEM A;  4OWC A;  2DKV A;  1GFU A;  1GB2 A;  1FLU A;  1GF9 A;  1ALC A;  4XJD A;  3W6F A;  1C46 A;  1SLY A;  2DQC Y;  1LMQ A;  1IWX A;  1JSF A;  4OWA A;  1XFP L;  1JKC A;  3TMW A;  5F16 A;  4LFX A;  2HUB A;  4GCC A;  5KXX A;  4H8Z A;  1GB7 A;  1I56 A;  3P4Z A;  4U3X B;  3WVX A;  5HQ1 A;  5KXK A;  4RDS A;  1IP6 A;  1GFE A;  1REY A;  1GBO A;  3CT1 A;  4Z3M A;  1LSY A;  1UBZ A;  1XGP C;  3A67 Y;  4ETC A;  3QNG A;  1KIQ C;  3F6Z A;  5B59 A;  4HPE A;  1F6S A;  5LYM A;  5F9U A;  3A90 A;  1LYZ A;  4XJB A;  1BWH A;  1REX A;  9LYZ A;  5KJ9 A;  3BKH A;  1FKV A;  1KIP C;  1J1P Y;  5KXW A;  2FBD A;  5HMJ A;  1LZR A;  1GXX A;  1QSW A;  5KKI A;  1C08 C;  4CFP A;  3WUL A;  2IHL A;  1BWI A;  1DPW A;  4KT3 A;  2FBB A; 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 4WLT A;  1FBI X;  5LYZ A;  1UIE A;  1DZB X;  4IAS A;  7LYZ A;  1DXJ A;  2MEA A;  4G4B A;  4NSJ A;  3WUM A;  5I5Q A;  1KIR C;  2DQA A;  1IP7 A;  3AJN A;  3J6K A;  5FEL A;  1QIO A;  3QY4 A;  1I20 A;  3WU7 A;  1WQQ A;  4WOA A;  5KXN A;  4HV2 A;  5ILC A;  3AGI A;  1D6P A;  1GE3 A;  1GWD A;  2Z12 A;  1LYS A;  1QUT A;  4WLD A;  4XAD A;  3TXI A;  1YRO A;  1YL1 X;  1YL0 X;  3WH1 A;  4C3W A;  3W3E A;  1LYY A;  3CQL A;  4HJZ A;  1VDP A;  3WU8 A;  4NSI A;  5C6I A;  3LYZ A;  2X0A A;  1TAY A;  1IOT A;  3SP3 A;  1UID A;  3A95 A;  4J7V A;  2HEA A;  2BQL A;  1UUZ C;  4H8X A;  1LJ4 A;  4WG1 A;  1E8L A;  1CJ6 A;  1HHL A;  3P66 A;  2BQH A;  5L3I A;  2FYC A;  1IWT A;  1WTM A;  3LN2 A;  4LFP A;  2DQJ Y;  4WL6 A;  1JPO A;  4O34 A;  1QUS A;  5L3H A;  2MEI A;  2EQL A;  2Z2E A;  1IR9 A;  5L9J A;  5B05 A;  5FEK A;  4TX7 A;  1JJ3 A;  1KXW A;  4NGV A;  4N9R A;  1LJ3 A;  1IC7 Y;  1NHE A;  1OUC A;  2LYO A;  4WMG A;  2EIZ C;  4UWU A;  1W08 A;  4GN5 C;  4YOP A;  3T36 A;  1TEW A;  4FJR A;  4RLN A;  4H9E A;  5E4P A;  2MEE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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