1LU4A

1.1 angstrom resolution crystal structure of a secreted mycobacterium tuberculosis disulfide oxidoreductase homologous to e. coli dsbe: implications for functions
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
b'ADERLQFTATTLSGAPFDGASLQGKPAVLWFWTPWCPFCNAEAPSLSQVAAANPAVTFVGIATRADVGAMQSFVSKYNLNFTNLNDADGVIWARYNVPWQPAFVFYRADGTSTFVNNPTAAMSQDELSGRVAAL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gram-positive DsbE Proteins Function Differently from Gram-negative DsbE Homologs: A STRUCTURE TO FUNCTION ANALYSIS OF DsbE FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SOLUBLE SECRETED ANTIGEN MPT53
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 40
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-05-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1lu4A00
2CT6A 2H76A 1OKTA 2H8LA 4G9HA 1ST9A 2B7JA 2GSQA 2B5XA 4MP4A 3EVIA 2DJ0A 4GF0A 4K8MA 1R5AA 1VGLA 3WD6A 4ECBA 3CSHA 5F07A 4MZCA 5B8AA 3HDCA 2CX4A 3LQ7A 4KGIA 3US3A 1AIUA 1TU8A 4NHWA 3A2XA 12GSA 1DE1A 3QOUA 4L5LA 1U88A 3CXGA 2L4QA 5DALB 5DQSA 2HSYA 3LORA 4ECJA 5D8IA 1TK0B 1GTUA 2B7KA 4XTSA 4HJ2A 3DGQA 2JADA 5IMVA 2WB9A 4HQZA 2AB6A 1G0TA 4WXTA 3ZLPA 2G2QA 4WR4A 2C8UA 4TR3A 1BAYA 3LG6A 2TRCP 5ECNB 1AW9A 5B8BA 5B6MA 3FZ9A 1A2JA 4NPBA 2PERA 3N9JA 3TJBA 1X0RA 2DJ3A 4Q5NA 5ECRB 5KN2A 4N10A 2O87A 5HFGA 1X5DA 4AGSA 4K0NA 1XBSA 3CMIA 4LLRA 1KNGA 4HOJA 4MJCA 3F4RA 5D73A 5CRDA 5LNKe 3QR6A 3D6IA 4X0XA 3LEFA 2GLRA 3GV1A 1GSEA 3FZAA 3BCKA 2MYGA 5IPHA 4ECIA 4V2NA 3GSTA 9GSSA 2L5OA 1TRWA 5ECQB 1ZYEA 3A5WA 3CRTA 4IS0A 2H71A 2WCIA 1V98A 2WDUA 1JHBA 2FHEA 1TW9A 2CZ3A 1HYUA 2P0GA 1HNCA 1OYJA 3D21A 2FA8A 2C0EA 3DVWA 1F9MA 2E0QA 2I9HA 2V2GA 3RHBA 4EVMA 4L5OA 4FH8A 4POBA 2WRTA 4ZXGA 3D5JA 1SKWB 3A2VA 3UMAA 3ZITA 1Z6NA 2TRXA 4TXOA 1GSSA 2PUKC 4IN0A 3BCIA 3KP8A 3DVXA 4ECCA 1XPVA 3FRCA 3UOMA 4PNGA 1A23A 1TJDA 5KN1A 1PL2A 2B1KA 1X9WB 3G7IA 3TJJA 2FLSA 2QC7A 1K0OA 1SYRA 3SBCA 3D4MA 4ZL7A 4MH3A 5HFIA 5DQYA 3HZ4A 4ZBBA 3WGEA 4F82A 2FWHA 1ZMAA 4KDUA 6GSSA 3VPQA 2F9SA 4ZB6A 1GTBA 3PINA 3CSIA 1G6WA 3HZ8A 4TVEA 4JE1A 5LCZA 2F8FA 3O3TA 4NHZA 1XWCA 1SKRB 3BBYA 2LS5A 3BJ5A 2CVKA 2WGRA 3IXRA 4OCFA 4PGTA 2HLSA 3M9JA 2YNXA 2X8HA 1F3BA 3H79A 5E4WA 4NWYA 5H5QA 3FZ4A 2H0IA 1LJRA 4ML6A 19GSA 1TRUA 2ES7A 1V57A 1VF3A 1CQHA 2OE0A 5E59A 5ELGA 2E2MA 1A0RP 2DJKA 5JCUA 4OMVA 1QMVA 1GTAA 1U6TA 3WT1A 2V41A 3ZTLA 3S9FA 2VLUA 4WKWA 1XW9A 5HR3A 2AHEA 2ZUPA 3VWWA 5A5KA 4K0GA 1YY7A 1GLPA 3TRQA 1GSQA 10GSA 1GSYA 3TKRA 2F51A 2WJUA 4AJ7A 5F0GA 4EXJA 3UBKA 5D9VA 1AXDA 1O6JA 2ON7A 3DWVA 1ERTA 3F4SA 4EDYA 2ZCTA 1PKZA 1ZCPA 2L4CA 3KZQA 4EKZA 2PPTA 2RUEA 3UBLA 3M8NA 1TDIA 2VUPA 2OJLA 2DBCA 3HY2A 3ZFBA 1XWKA 4G10A 1TKDB 2H72A 1XVQA 5GAND 3VFIA 3RHCA 1GL8A 5H5RA 1X9MB 1B4PA 5IMDA 4KCAA 2LKUA 2FGXA 3HD5A 2DSAA 1AC1A 1GNEA 4GCIA 3LGCA 5DAKA 3BD2A 1WPIA 2VM2A 1FVJA 4K1FA 2KP2A 4Q5QA 2YANA 3APOA 5IOWA 2L5LA 2FWEA 3ZL5A 4DSSA 4X1UA 6GSXA 4GRFA 4OO5A 4PXOA 1GRXA 4I2UA 4OFMA 1EGRA 4FYUA 2GTUA 2PWJA 1QFNA 2YN1A 2R37A 1EEJA 2H74A 3EU3A 1B9YC 2QKEA 1AQVA 4PUFC 1K0CA 2EC4A 1A8LA 3ERWA 6GSWA 1HQOA 2KP1A 1MEKA 2C3NA 6GSVA 1VF4A 3GKXA 3IE3A 2H01A 2B3SA 3GKMA 4TN8A 3E0UA 1O73A 5AN1A 4YQUA 4JRRA 1PRXA 3RPPA 2L57A 2VAFA 3G9BA 5CO3A 2HZFA 2GT6A 4HJMA 1TOFA 1QK8A 3C71A 2LRTA 2RM6A 3L9VA 3L9SA 1AAZA 2CA8A 4ULXA 5G1KA 3QDNA 2J9HA 5IQYA 5IPGA 1GTIA 4F9ZA 2IIYA 3QAGA 1TXXA 1X5CA 2MMAA 2C80A 1A2MA 1R7HA 1M9BA 3QFAC 2YJ7A 4K7NA 3EWLA 3KP9A 2VLTA 22GSA 4N0VA 1BJXA 3NOFA 2P5RA 2YOIA 5ABRA 2PU9C 4K2DA 1KBNA 3WT2A 3TB2A 1X5EA 5B7CA 1IYIA 5CYYA 2P31A 2HZEA 4Q5FA 1PD21 1F6MC 2MBTA 4IKHA 4CW9A 2CQ9A 4MZWA 1M2DA 3JCML 4MF6A 4XS4B 1XVWA 3IK7A 4TR1B 5CNWA 4NXIA 3G7JA 1T1VA 4V1Ap 3VWXA 2OKAA 3QAVA 3EYTA 3FY7A 2FCHA 3ZRDA 4XRAA 1R5PA 4HZ2A 2REMA 3MAKA 1Q4JA 3ME8A 4PUAA 5C00A 3FEUA 3KCMA 1JZRA 1I9DA 1SD9A 1K0AA 1O8WA 4JU5A 2L59A 1O8XA 4PQHA 3U6VA 4BVXA 3KD0A 1GSDA 1WOUA 2P5QA 1PKWA 5L71A 1THXA 3FK8A 1XWAA 2DJJA 4BWSA 3TJKA 3VWVA 3ZFLA 4GQCA 4N11A 2HI7A 2H1GA 3GH9A 4MF7A 1YEXA 1XZOA 1TTZA 3MDKA 2JZTA 5GZZB 1JLWA 4MF5A 5JCWA 5ID2A 1A0FA 1ZGNA 1WWJA 2O7KA 2VLVA 3IC4A 3C7MA 2EIQA 4IQAA 5J4UA 1WE0A 1DBYA 4GWRA 5CAXA 1HNBA 3UAPA 1X9SB 3GUSA 1AUCA 5FT3A 2DIZA 4GQFA 4KNDA 1B8XA 1XWBA 2LTKA 1J9BA 1EV4A 4F03A 3G7YA 2HRNA 14GSA 3IPZA 2YWMA 3ERFA 3H93A 1PGTA 1N2AA 2DJ2A 2E7PA 1TI3A 2H0HA 2J23A 1NM3A 2B5YA 3TGZA 1WRYA 1G7OA 3FZ5A 2LJAA 2X8GA 5DJLA 5DVBA 1RQMA 3GN3A 2RM5A 3HJOA 4DVCA 1URMA 1JZWA 2D2ZA 1XWGA 2H6XA 17GSA 4J57E 3UVHA 2PVQA 2X64A 2KUCA 3I9V2 2ZNMA 2H66A 3H8QA 2JU5A 2QGVA 3KGKA 1UN2A 3D4TA 4FYBA 2FWGA 1XOBA 1XIYA 5AIVA 1K3YA 3KM6A 3WYWA 2YCDA 4KH7A 4I5QA 4IP1A 5JWRB 1SENA 4EUYA 5A4VA 1DUGA 2FY6A 5KN0A 5A4UA 3HCZA 1EEMA 1EOHA 1THOA 2HZEB 2H30A 1VF2A 2RIIA 2OA7A 4H86A 4HI7A 5EVOA 2H0GA 1K0MA 1VF1A 2C3TA 4LMVA 3A2WA 3EINA 4ZILA 2HRFA 5DJMA 4MCUA 2LV3A 3APSA 3QCPA 3HKRA 1U87A 1B9XC 5EPFA 3KMOA 1S3AA 3GKKA 3FHKA 3IAS2 2M72A 2OACA 1QQ2A 2OBKA 3DIEA 2B1LA 1CQGA 2O8VB 4MPFA 2GSTA 4KA0A 4EL1A 2BTOT 2NDOA 2YV7A 1JFUA 2GZPA 1ACVA 1T00A 2MMZA 4FYCA 2A4VA 3CYNA 4EC0A 3DEXA 2R4VA 2C1YA 3ZIJA 2VL3A 2LJRA 1O85A 2YP6A 4F0CA 2K18A 2IMDA 4DSQA 4K6XA 1B4QA 2DMMA 4GSNA 3C1SA 3GTUA 2GSSA 3LSZA 2B6MA 5JWQB 5DCGA 5HR0A 2JZSA 2IMIA 2WFCA 4K7OA 5HQPA 1ML6A 4X43A 3TKSC 4RI7A 4K9ZA 2EIOA 2OE3A 2MMNA 1WMJA 2I81A 4HQSA 5ID2B 1U3AA 2CVBA 3IRAA 2DMLA 3GHAA 1V2AA 4PQ1A 3U5RE 2JACA 4IVFA 3ED3A 1R26A 3H1NA 4JEDA 3SWLA 4FIWA 4BA7A 4KE3A 4TRXA 3VURA 1TP9A 2E2GA 3L78A 3D0ZA 4KCEA 3LYKA 5CP1A 3OR5A 1EP8A 1FW1A 1WIKA 4I2TA 5IOXA 5JCGA 1Z3EA 2AJQB 1SKSB 3ZVJA 4XCSA 4KDYA 1WJKA 2DIYA 1ZZYA 3J7Yb 1SYXA 3A3TA 2R2JA 4YQVA 3KTBA 3W6GA 4GXZA 1FHEA 3LYPA 2F3MA 4O92A 3CBUA 2VCQA 4ZB8A 4ISDA 5IMCA 5DCHA 1OE8A 1B48A 2CZ2A 1ABAA 1Z7RA 1V40A 2N5FA 6GSUA 3UARA 1A24A 3Q6OA 2RUFA 4DSRA 5KEJA 2DLXA 3ZMKA 4O32A 2V1MA 5FHIA 5G2ZA 3P7XA 1FOVA 5HFKA 1TRSA 1OC9A 1O7UA 3F3QA 3HXSA 2AYTA 2QSIA 3ERGA 2VD1A 3ZVJD 3EMPA 2GQMA 5LD0A 3M3MA 2GZZA 1G6YA 4IBPA 1ZYQB 2AAWA 2YWOA 4ZB9A 3DRNA 3MNGA 4RQXA 2MZCA 1YKAA 4TR4A 4HDEA 1BYEA 5IMAA 4TXOB 1ERVA 3PH9A 1LBKA 2M46A 3J7Yk 2WULA 1NHYA 7GSSA 3N5OA 2JL4A 4MPGA 3RAZA 1A2LA 4O7HA 3UEMA 1SJIA 1DE2A 2M80A 1E6BA 3DD3A 4PURA 1M2BA 3EMXA 1JLVA 3DYRA 20GSA 2VL2A 1ZL9A 1SU9A 2VCZA 2H19A 3E9JB 4GSSA 2FD3A 1YEPA 3GYKA 1T4ZA 4LL1B 5CRHA 2Z9SA 4GLTA 2IMFA 11GSA 4HUAA 2ON5A 1SL2B 4KDXA 4TXVA 3I69A 1SK1A 1M2AA 1UVZA 1W89A 3GTUB 2C0GA 2ALBA 18GSA 4LMWA 1ERUA 3HHVA 1S3DA 1ON4A 2IMEA 2GQKA 2PBJA 4LL4B 3RDWA 4ID0A 3GSSA 1FB0A 4CDOA 2GSRA 2MBSA 4ILFA 2LUSA 1MDIA 4G19A 3VI5A 2K9FA 1T8EB 3GX8A 1GUHA 1MDKA 1F3AA 2AV4A 4MLYA 2KHPA 4L8EA 3HVSA 2NBSA 2LQOA 2FUG2 2XHFA 2OADA 3FYGA 5D93A 3UJ1A 4XRDA 4WBRD 4MDCA 3TCOA 2H75A 3MWHA 4YAPA 4PX1A 2N5BA 2LNTA 3F9UA 3LXZA 4V2MA 4AJ6A 3HVXA 3L9UA 2HT9A 5HR1A 1RK4A 1QGVA 4L0UA 2NPBA 4F2IA 3C8EA 4V1Ag 1F37A 4EE0A 1YF1A 4BVYA 5G5FA 5F8BA 2V6KA 5D9WA 2IFQA 3QMXA 4XHMA 5IMFA 4YAVA 2DJ1A 1QUWA 5AISA 2XBQA 3HVVA 4QL7A 2HFDA 2KLXA 3F3RA 2CAIA 1YJ6A 3TOUA 2VCWA 4EO3A 4OD7A 2IJYA 1OAZA 3W8JA 2C0DA 5J3RA 2H1BA 3F6DA 5F06A 2NTOA 1R4WA 2H1AA 1H75A 5ECPB 1T3BA 2CV4A 1M9AA 5G5EA 1MD3A 4IW9A 5ECOB 4GTUA 3NZNA 2LJKA 4MA9A 5G30A 4MABA 1OC9B 3KTLA 5DAKB 4AJ8A 5IO0A 3QFBC 3ZYWA 3CTGA 4HEA2 5ELAA 1PSQA 1ILOA 1VRSD 2LQQA 3Q19A 5F05A 1OC8A 4MJAA 4E8EA 4DSSB 3KIJA 3GRXA 4K7IA 4POLA 4QQ7A 2MMOA 3Q74A 3CTFA 3F4TA 1MTCA 1WP0A 1YF0A 1KEBA 2LSTA 4KX4A 3GA4A 4KSOA 4YH2A 1PX7A 4AF2A 2L6CA 4I97A 2DC5A 1GUMA 2VD0A 1XW6A 4MZBA 1SK0A 1DSBA 2XC2A 3F63A 5GSSA 3FKFA 3IDVA 3KH9A 3VLNA 4KAEA 3GFKA 3DXBA 4JR4A 4PQIA 4Q5RA 4F0BA 1SJZA 3Q18A 3KMNA 1EV9A 1PA3A 1F2EA 3IHQA 3WGXA 4ML1A 2V32A 1OE7A 4JBBA 3UVTA 2OBIA 3H4KA 2R6KA 4J56E 5INYA 4L0WA 3KJYA 4DEJA 2IN3A 2HYXA 4ACSA 2XPDA 4IJ3A 4ZL8A 1J08A 2XBIA 4XIHA 1FB6A 3QAWA 1GP1A 2R5GA 4MMMA 3ZIVA 3K8NA 2GDRA 3C73A 1EOGA 1A8YA 2HXKA 4JZQA 4IHUA 2GGTA 3VWUA 2L6DA 2LRCA 3F8UA 4YQMA 1SK2A 3MSZA 3O76A 2IWTA 5ECHB 1OC3A 1Z5YE 4LA1A 4IP6A 4KB3A 2I4AA 1MD4A 2I3YA 2OE1A 1Z7PA 5GSTA 4TR0A 4OWYA 4HU7A 1PX6A 1Q98A 1EWXA 2O89A 2FWFA 5D96A 3IK9A 2A2RA 4E8HA 3V1WA 1GWCA 2VOCA 3DMLA 3D22A 2O85A 1TRVA 3IV4A 4WR5A 5IIZA 1PL1A 3QPMA 2CAQA 3TJGA 2VIMA 4HZ4A 2PGTA 3F0IA 2YZUA 1NHOA 2KOKA 2CVDA 2C3QA 2YZHA 2VL2C 1SD8A 3PGTA 3TKSE 3TOTA 3TRPA 1GSFA 2VCTA 1K0NA 2YWNA 3TDGA 3HJPA 4ZL9A 4P3YB 1Z9HA 3DKSA 1M0UA 1Y6EA 1SL1B 1PQNA 4XS1A 1H4OA 1GSUA 2IFQB 2C0FA 1YKCA 5CRGA 4NAXA 1T7PB 2WZ9A 2G0FA 1GULA 4RQRA 5B6NA 4I6XA 2PMTA 3M9KA 4WF5A 5J9BA 3KH7A 1J0FA 2H6ZA 2K6VA 4MJBA 1ERWA 4IJIA 5ECLB 1HNAA 3GX0A 5D9XA 3FR3A 16GSA 1ZOFA 1C72A 1NW2A 2B5EA 4BPYA 5J9CA 2K8VA 5IO2A 3GL5A 3IAM2 2VL9A 3P8WA 3GH6A 1W4VA 1Z6MA 3UL3A 3IA1A 4MJEA 4PNFA 4XS6A 5ECIB 3P2AA 1AQXA 1XFLA 3NIVA 1XW5A 1UC7A 3E3EA 1YDKA 5C04A 1LU4A 1K0BA 4Z7XA 3QD9A 3RBTA 1BX9A 3VI7A 5CREA 1EZKA 1QXHA 3L0HA 1K0DA 3ZMLA 3AY8A 5A4WA 2EIRA 5H5SA 4XS4A 1GH2A 3KEBA 2VO4A 4ZIJA 1XXUA 2FNOA 3LJRA 1FVKA 4TR1A 2AUVA 2WS2A 1SL0B 3HA9A 1UA5A 1S3CA 4POMA 5AGYA 1NSWA 4MK3A 4D73A 1MDJA 3LWAA 5JWOB 5DBQA 4MH2A 2HE3A 1U3IA 3TKQA 4BWQA 1T4YA 2RLIA 3GL3A 1K3LA 4OCEA 2HSHA 2GQLA 2N5AA 3GNJA 2H6YA 4CHSA 1IYHA 1BEDA 4JR6A 4RUVA 4EDZA 3TRXA 4QL9A 1V9WA 4NV2A 3ME7A 4OO4A 4OFTA 4ZBDA 5J41A 4IGJA 4WF4A 3CSJA 1Y25A 2A2SA 3APQA 5IM9A 2H73A 4KUNA 3WGDA 2R3XA 3HYPA 1E2YA 4RI6A 2XPEA 5GAPD 2GVPA 4N0ZA 2JSZA 2V6OA 5KN3A 2YPMA 4WBJA 4IELA 4V2LA 3P90A 5DALA 2NVLA 5G1LA 3L4NA 1BG5A 3KXOA 4O5RA 3LXTA 5IMZA 3TUEA 2JSYA 2VCXA 1FG4A 3ISOA 2CX3A 3EU4A 2IMKA 5DDLA 4FO5A 2IPAA 4TKYA 4EF0A 6GSYA 3EE2A 3M1GA 6GSTA 3IBHA 3GKNA 5ECMB 3ZREA 1YZXA 5EY6A 4TOPA 1XCCA 1O81A 2GT5A 1JZDA 3LFLA 5EL8A 5G31A 2X8CA 5ECKB 2VCVA 4G2EA 3CRUA 5AIXA 2IL3A 1FAAA 1TI1A 8GSSA 2VM1A 2F8AA 4KW6A 5ECSA 1PMTA 2GZYA 1AQWA 4HS1A 2TIRA 2C4JA 2GS3A 2H70A 1SJ6A 2YWIA 1EGOA 1G7EA 3GIXA 5FWGA 4IQ1A 3FW2A 2PN8A 4WETA 5J5NA 1EP7A 1USBA 2LRNA 3I6AA 4WEYA 4TW5A 3C1RA 3GURA 1N8JA 4NV5A 2H1DA 4POKA 3FR9A 4HU9A 3PR8A 1OKDA 2K8SA 1TK5B 3HJMA 1OVNA 1HD2A 3EC3A 1FO5A 2BJXA 1RW1A 3FR6A 3R2QA 4KSMA 3W8SA 3VK9A 1JZOA 1M99A 3O6TA 1K3OA 1TK8B 1BQ7A 1V58A 5D9TA 5COHA 1TU7A 4J2FA 2BMXA 3IR4A 3TKSA 4N30A 2FA4A 3RPNA 1M7TA 3UIWA 3IOSA 2JZRA 3EURA 3I43A 3TKPA 1PN9A 4GSTA 2PVOC 1YQ1A 2HNLA 1GLQA 13GSA 2LNSA 5ENUA 3BOAA 3TJFA 2YJHA 4ZBAA 5HR2A 3ZZXA 4OFNA 2YV9A 5CRWA 1XOAA 2X99A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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