1LU4A

1.1 angstrom resolution crystal structure of a secreted mycobacterium tuberculosis disulfide oxidoreductase homologous to e. coli dsbe: implications for functions
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
ADERLQFTATTLSGAPFDGASLQGKPAVLWFWTPWCPFCNAEAPSLSQVAAANPAVTFVGIATRADVGAMQSFVSKYNLNFTNLNDADGVIWARYNVPWQPAFVFYRADGTSTFVNNPTAAMSQDELSGRVAAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gram-positive DsbE Proteins Function Differently from Gram-negative DsbE Homologs: A STRUCTURE TO FUNCTION ANALYSIS OF DsbE FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords SOLUBLE SECRETED ANTIGEN MPT53
total genus 40
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-05-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1lu4A00
2C0GA 3C1SA 1TTZA 1U87A 4NMUA 2CAQA 4ZB9A 2I4AA 4RQRA 1Z9HA 1C72A 3NIVA 1URMA 1YEPA 4FO5A 4G9HA 4Q5RA 1XPVA 1IYIA 4HQZA 5DALA 4V2NA 2VCVA 1MD4A 3ZRDA 4BPYA 3CBUA 4FYUA 5IOWA 5ENUA 1ML6A 1ERTA 2IN3A 4KSOA 1E6BA 3A2XA 3O6TA 3ED3A 1MEKA 3QDNA 2C1YA 5IMCA 1GSDA 1ZMAA 2GS3A 1THOA 5GAND 4PXOA 3L4NA 3DD3A 4JBBA 2AUVA 1ILOA 1X9MB 4MZCA 3WT2A 2X8CA 3QFAC 1WMJA 2M80A 1PKWA 2OBKA 2EIQA 1JHBA 4EO3A 4OD7A 2MBTA 1EV4A 3L9UA 1TDIA 2VO4A 2I81A 4V2LA 5G30A 4I2TA 4PUAA 4EKZA 2CQ9A 1FHEA 2JU5A 2LSTA 1O6JA 3BOAA 2FGXA 2O8VB 1ON4A 3QAWA 2H70A 4MJEA 10GSA 3ZZXA 1TRSA 2PMTA 4TOPA 3IAS2 2LRTA 2H73A 3WYWA 3VI7A 5JWOB 4GSNA 2ZNMA 2IMFA 1TRWA 2V32A 3M8NA 3TDGA 2R6KA 3A3TA 4OO5A 1I5GA 1ZYEA 4BVYA 3TRQA 2I3YA 3KJYA 2I9HA 2H71A 1TK8B 16GSA 1XVWA 2H0HA 4WR5A 3Q19A 3W8SA 2X8GA 1FG4A 2WFCA 2XPDA 4POKA 3TB2A 4IQ1A 3ERFA 1USBA 3LXTA 4IQAA 4GTUA 4XTSA 5D9WA 2XPEA 2H72A 2HZEA 1GNWA 2FWEA 2VD1A 1SJ6A 2HLSA 3HXSA 5KN1A 1OE8A 1T00A 4NXIA 4EF0A 3BCIA 1GSQA 4OMVA 1TI3A 2LRCA 1A0FA 1JZDA 1JZWA 2L5OA 2VCXA 4ACSA 4V1Ag 5D73A 4J57E 1HNAA 3US3A 2GSQA 1TP9A 5IMVA 1T4YA 2AYTA 3E0UA 3P2AA 2WJUA 3VPTA 1AIUA 2RLIA 2OE3A 5IMZA 3A5WA 4CDOA 5J9CA 4ILFA 3BBYA 2B7KA 2GSRA 4WKWA 1SD9A 3GUSA 2QSIA 2YWIA 1PX7A 1MDIA 1XZOA 1ZCPA 3P90A 2OKAA 3RBTA 2TIRA 3GRXA 5IMDA 1GSEA 4KDXA 4EXJA 3WGDA 2HE3A 2YV7A 3KH7A 3UBLA 5FWGA 1YY7A 3IOSA 2WB9A 2P5QA 2PVOC 5ECNB 3WGXA 2IPAA 2MMNA 2C3QA 1PKZA 1GNEA 2FCHA 1EGOA 3QD9A 5ECPB 3GYKA 1YJ6A 1XWBA 5IPGA 1RW1A 4LLRA 1SK2A 4F0BA 3ZYWA 6GSVA 4XHMA 2GT6A 4DEJA 3Q6OA 2C4JA 4X43A 5DJMA 2DSAA 2HZFA 3WGEA 4ZL8A 4K0NA 2K6VA 1SKSB 2FY6A 5F0GA 3IXRA 5D9VA 3DRNA 1SJIA 1ST9A 2GDRA 5ECIB 2OJLA 2VOCA 4JE1A 4ZBDA 2L6DA 1EOHA 3KTBA 1X0RA 2CZ2A 2GQKA 2RUEA 4MH3A 3RPPA 4ZIJA 9GSSA 2C8UA 2GQMA 5HFGA 4MMMA 2LKUA 2NTOA 4ECJA 4N10A 2FA4A 1A8YA 3RHCA 1XVQA 4EC0A 5INYA 1GTAA 3F3QA 2JZTA 4GF0A 4ZBBA 2YWMA 4ULXA 4TR1A 3QFBC 4LL1B 4PNGA 2VAFA 3F4SA 2FUG2 2AV4A 1CQHA 5IO0A 4OFTA 2YJHA 3EWLA 2IWTA 3ZMLA 1X9SB 4KX4A 1DSBA 2HSYA 4WF5A 2YZUA 3PGTA 3IDVA 4HQSA 5DJLA 4PGTA 1M9AA 2I1UA 5ELGA 1U88A 3BJ5A 5B8BA 2C3TA 2XBQA 3LYKA 4P3YB 4N30A 2BTOT 1J0FA 3ZFBA 4HUAA 3DEXA 19GSA 5CAXA 4MJBA 3FHKA 4O7HA 2CVDA 3UL3A 4XRDA 5CYYA 2DJ2A 2DJJA 2YN1A 3TKSA 2JACA 3LEFA 2WS2A 3EURA 1K3OA 3H93A 2CZ3A 1BQ7A 1THXA 5ECQB 1KTEA 5IMAA 4WF4A 2A2RA 3DVXA 5G31A 4HZ2A 4YAVA 2B5EA 3M0FA 3I6AA 2DLXA 4GSSA 1XFLA 3MWHA 4MF5A 1M99A 2M46A 1Y6EA 3CTGA 2WZ9A 2VCQA 2CV4A 3LORA 1NM3A 3TKPA 2E2GA 3GL5A 4GLTA 2L57A 3GSSA 1K0CA 1ZZYA 2GGTA 4NV5A 3GN3A 2HRFA 2AJQB 1QGVA 3HCZA 2VL3A 4H86A 1BJXA 2WGRA 3CTFA 1B8XA 1UC7A 1SD8A 2YWOA 4KW6A 4JR6A 1WE0A 3L0HA 3HJOA 3HVSA 1G7EA 3GTUB 5COHA 5ECSA 4D73B 4IW9A 5EY6A 4MF6A 5F06A 1Z6NA 1A23A 1M2DA 3G9BA 4GQFA 3TKQA 2R5GA 3IPZA 1V2AA 1V57A 3LYPA 3TKRA 1AQXA 1U3AA 1YF1A 3QR6A 3UEMA 2KLXA 1Z7RA 3VPQA 3L78A 3FR6A 3P7XA 1GUMA 1AQVA 3IK7A 3UAPA 2HZEB 4TR0A 4HU9A 4QL7A 1SU9A 2CVKA 1G6WA 3NOFA 2LV3A 4EVMA 1GULA 1UA5A 2HXKA 2IFQB 2K18A 5HR1A 3UJ1A 3TKSC 4IKHA 4IVFA 5LNKe 2VCWA 4NWYA 3H4KA 3OR5A 5FHIA 3RPNA 3QCPA 1Z5YE 1T7PB 4WEYA 3SWLA 2GZZA 2PWJA 1VGLA 1QFNA 1H75A 2IL3A 2K9FA 1Y25A 2K8SA 4JR4A 4OFMA 4YQUA 2H1BA 1OAZA 4JZQA 4XS4A 3ISOA 1T1VA 3GKMA 1GL8A 1OC8A 4WETA 2PGTA 2KP1A 2C3NA 3TJFA 1FOVA 4KA0A 1BG5A 2PPTA 3FRCA 1XOBA 5G1LA 4IGJA 3LGCA 3HHVA 1LU4A 4I6XA 2NDOA 5DDLA 2HT9A 5CP1A 4F0CA 1GP1A 2AB6A 1YDKA 5KN3A 5DQYA 1O7UA 4KCEA 4L0UA 1UN2A 2H1GA 2MBSA 4F03A 4PQHA 3GNJA 5JWRB 1PN9A 2VCTA 4TN8A 2B1LA 3KM6A 3N5OA 2XC2A 4O92A 5DAKA 4HJMA 2A2SA 4K0GA 4F82A 5HR0A 4MH2A 2MMZA 2BJXA 1XBSA 1EWXA 3CXGA 3EMXA 1A24A 18GSA 4PX1A 1O81A 2GVPA 2HYXA 3IBHA 2MYGA 3DWVA 1TU8A 1WP0A 3DVWA 4KE3A 5IMFA 2DC5A 1GH2A 4K2DA 4JEDA 4HZ4A 2DBCA 4PQIA 3IR4A 20GSA 1QK8A 1XCCA 3CRTA 3DMLA 4G10A 3SBCA 4POBA 3GHAA 2PBJA 1PL1A 1WPIA 3A2VA 3FZ4A 3ERWA 1V58A 2EIOA 1GTUA 2WCIA 3FY7A 2WRTA 4XRAA 3UIWA 3EINA 1R5PA 4X1UA 2VD0A 1RQMA 2HNLA 1N2AA 5JCUA 1SL1B 4X0XA 4HI7A 2FA8A 2PU9C 1YZXA 3MSZA 1TU7A 1S3DA 1J08A 2B6MA 5DBQA 5G1KA 3W6GA 2TRXA 1SK1A 5GAPD 1HQOA 4EE0A 1TOFA 4RUVA 1O73A 2DMLA 4IHUA 5E4WA 1BEDA 1TXXA 5B7CA 1EOGA 3H79A 5A5KA 2GSSA 3IK9A 1K0NA 2VLTA 3LG6A 2YANA 1QUWA 4MJCA 2M72A 3I43A 3W8JA 5B6NA 4GCIA 1FB0A 3GV1A 1BX9A 1OC9B 3UOMA 4LMVA 3KMOA 1OC3A 1VF4A 1B9XC 2LS5A 2AAWA 3NZNA 1MDKA 5KEJA 1PRXA 3GKNA 4JU5A 2B5XA 1X9WB 3FEUA 1A2MA 11GSA 3DKSA 1ERUA 1F37A 4MJAA 1EZKA 2ZCTA 6GSSA 5IOXA 5AIVA 1X5DA 1AQWA 2KHPA 3P8WA 2P5RA 1ZYQB 3PR8A 2WULA 3ME7A 3FZAA 3C1RA 2YJ7A 3EE2A 3D0ZA 1U6TA 3F6FA 1FVJA 2H30A 1SYRA 3L9VA 4PQ1A 4RI6A 3EC3A 5IQYA 2MZCA 4CW9A 2NBSA 2JSYA 4F2IA 3MNGA 3TGZA 4KDUA 5ECOB 2IMDA 1B9YC 1GSSA 4ML1A 2L4QA 2P0GA 1DBYA 5CRWA 1PGTA 1B4PA 2OE0A 2J23A 1Z3EA 4HJ2A 2H8LA 2F8FA 3QAVA 3H1NA 2X99A 3TUEA 4BWSA 3VI5A 2JZRA 3F9UA 3LXZA 1M2AA 5AN1A 8GSSA 3IE3A 4O32A 4WBJA 1YEXA 5J3RA 3UMAA 1KBNA 2V2GA 2F51A 7GSSA 4Z7XA 4Q5QA 1XW6A 1YF0A 3KH9A 3HJPA 2H6YA 3M9JA 1Q98A 5IIZA 5JCWA 2GT5A 4IBPA 2RUFA 3EMPA 5D9XA 1PSQA 1DE1A 5KN2A 4IELA 3IRAA 4K1FA 3CSJA 3F8UA 5B6MA 4ISDA 2PVQA 3F4RA 3HKRA 2QKEA 1SKRB 2FD3A 2O85A 1GUHA 4K7IA 4E8EA 3KMNA 1AUCA 4RI7A 3EU3A 2JZSA 4HU7A 1R7HA 2LJAA 1FB6A 3GL3A 5KN0A 13GSA 3D5JA 5C04A 3HVXA 4GQCA 2V6KA 5HFIA 2C80A 2MMOA 3HD5A 3ERGA 2DIZA 3QPMA 3APQA 4XS4B 2B7JA 5CO3A 4GWRA 1PMTA 2VUPA 2C0FA 1QXHA 2RM5A 1T3BA 1ZGNA 4G2EA 5DQSA 1XIYA 4MZWA 1VRSD 4XS6A 4KB3A 4MA9A 4OO4A 3VFIA 3C8EA 5DALB 3HZ4A 1K0MA 2FWHA 3HYPA 1N8JA 3J7Yb 2LJKA 4KAEA 1U3IA 4K7OA 1GSUA 1ZL9A 5HR2A 4K7NA 4LA1A 3ZIVA 3UARA 1R26A 5GSSA 1G7OA 2H1AA 2IJYA 3KP8A 6GSYA 4LMWA 2E0QA 2N5FA 5CNWA 2XHFA 3H8QA 5A4WA 5DAKB 4MZBA 2FNOA 1YQ1A 1ERWA 2FWGA 3TJGA 2NPBA 2CT6A 3IAM2 2CX3A 4N0ZA 3D4MA 2ES7A 3QMXA 4FYCA 4L0WA 4CHSA 2ON5A 4DSSA 4J56E 2Z9SA 2H0GA 2H6ZA 4RQXA 5DVBA 4HDEA 4I5QA 2VL2A 1DE2A 2DIYA 3EYTA 2BMXA 2IMEA 4KH7A 2YP6A 2R4VA 4MLYA 2C0EA 3IC4A 1M9BA 3VWWA 3DIEA 5JCGA 2VCZA 3QOUA 3WD6A 5A4VA 1K0BA 1HYUA 2C0DA 2JADA 1PA3A 3A2WA 4OWYA 5ECLB 5AISA 4ZXGA 1ACVA 4N0VA 1EEMA 2L59A 2F8AA 5HQPA 1JLVA 3LQ7A 3I9V2 1B48A 4I8BA 1A2LA 1XOAA 1QQ2A 2GZPA 3IA1A 6GSTA 2H19A 4YQMA 4NPBA 3ZVJD 3DXBA 1EP8A 2A4VA 3F6DA 3GIXA 1TW9A 4BVXA 2R37A 1JZOA 1LBKA 3HZ8A 4POMA 2H0IA 1K3LA 4TXOA 5ELAA 3LJRA 2H75A 1KEBA 4YQVA 1FAAA 3HA9A 3MAKA 2H66A 2IMKA 5CRGA 1FO5A 1OYJA 4MABA 1XWGA 5F8BA 1EV9A 1XW5A 2YZHA 1XWCA 3ME8A 1K0AA 5IPHA 1E2YA 3GH9A 1XWAA 3TJBA 3TJKA 1GLQA 2L5LA 1IYHA 5D93A 1F3AA 1GWCA 3KGKA 3JCML 2JSZA 4MPGA 1SK0A 2MMAA 3KXOA 4YH2A 2JL4A 2YV9A 4NAXA 2IMIA 5ECHB 1A8LA 5J4UA 4MPFA 1TI1A 2VL2C 4KNDA 4AJ6A 4KUNA 1DUGA 1GTIA 3UBKA 1YKCA 4OFNA 1G0TA 3CMIA 12GSA 3GKKA 2GSTA 4HS1A 2G0FA 5LD0A 1TRVA 3IV4A 3PH9A 2PERA 3IHQA 2GZYA 4ZL9A 5DCGA 3RAZA 1WIKA 2D2ZA 2R2JA 4ML6A 4O5RA 3TOUA 4NHWA 3HVVA 1GTBA 4I2UA 3ZIJA 2LNSA 4F9ZA 4TVEA 1K0DA 4KDYA 4HEA2 2ALBA 1NSWA 2XBIA 2PUKC 1SENA 4XS1A 3R2QA 5AGYA 1W4VA 5H5SA 2N5AA 1OKDA 3F4TA 5G5FA 3FR3A 1TK5B 2G2QA 3F3RA 2LNTA 3D21A 1HD2A 1PQNA 4PNFA 5CRHA 3GMFA 3VWUA 1B4QA 3VWVA 1T4ZA 1NHOA 4XIHA 1GLPA 2V1MA 3J7Yk 3KZQA 3M9KA 3D4TA 4WBRD 4JRRA 1V98A 5IM9A 5ID2A 3LSZA 2J9HA 3O3TA 3UVHA 4FYBA 1UVZA 5JWQB 4ECIA 4BL7A 2H1DA 3GTUA 3HDCA 1ABAA 4D73A 1PD21 4J2FA 1BYEA 3APOA 5B8AA 1WJKA 3KIJA 4TR1B 3N9JA 1HNBA 3PINA 1GSFA 6GSWA 3ZFLA 2R3XA 3WT1A 3GSTA 1SL2B 5AIXA 3S9FA 2O89A 3CSIA 2HFDA 1EEJA 1A2JA 4ZB8A 1AAZA 2GTUA 3F0IA 5CRDA 4NHZA 3DYRA 1J9BA 1YKAA 3EVIA 5E59A 3I69A 5FT3A 3FKFA 2YWNA 2IFQA 2QGVA 2OADA 3MDKA 1SYXA 3FZ5A 4TR4A 4MP4A 2E2MA 4IJIA 4OCEA 2FLSA 2B3SA 1G6YA 2OACA 3E3EA 2KOKA 1Z7PA 4AF2A 3FW2A 5EVOA 4G19A 3GX8A 1M2BA 2PN8A 2DJ1A 3CRUA 3E9JB 3KCMA 5A4UA 3ZMKA 5H5QA 2H6XA 5J41A 5HR3A 2F9SA 1WWJA 3F63A 1GSYA 1SJZA 1WOUA 3TRPA 3VWXA 4DSRA 1KNGA 4MK3A 1F9MA 4ZL7A 2LJRA 4V2MA 2OA7A 1TKDB 3QAGA 3HY2A 1BAYA 1SKWB 3Q18A 4ZBAA 3LFLA 5ECRB 3C71A 1QMVA 4ECBA 3C7MA 4OCFA 2CAIA 1W89A 1Q4JA 2O87A 2RM6A 1MDJA 4FH8A 1LJRA 3V1WA 4DSSB 4KSMA 1MD3A 3D6IA 2P31A 4BWQA 2WDUA 5D96A 1TJDA 5G5EA 3VLNA 2TRCP 3DGQA 3KD0A 4L8EA 3FK8A 4BA7A 1F2EA 4HOJA 4KGIA 4MDCA 2CVBA 1A0RP 5C00A 1K3YA 2HSHA 1SL0B 1MTCA 4E8HA 1Z6MA 3RHBA 4EDYA 1ZOFA 5GZZB 4QQ7A 3RDWA 1JZRA 3TCOA 4PUFC 4DVCA 1R4WA 5ECKB 1VF1A 1CQGA 3FZ9A 3O76A 1NHYA 2DJ0A 2VLUA 4ECCA 4ZILA 2GLRA 3U6VA 5EL8A 3AY8A 4K6XA 1FVKA 4WR4A 3ZREA 2LTKA 1M7TA 2V6OA 5G2ZA 2LUSA 5IO2A 1K0OA 3LWAA 22GSA 3KEBA 2CX4A 1TK0B 2E7PA 3GH6A 5ABRA 1AW9A 2LRNA 4AJ7A 3VURA 3TRXA 3ZL5A 4ZB6A 2B5YA 5GSTA 2KP2A 4MF7A 2AHEA 5J9BA 4TXOB 5D9TA 5LCZA 4TR3A 3FR9A 2RIIA 4POLA 3D22A 1TRUA 2KUCA 2YCDA 4FIWA 1O8WA 4TKYA 5F05A 5F07A 3GKXA 1GRXA 4Q5NA 4K8MA 2L4CA 3APSA 1O8XA 2GQLA 1JLWA 1F6MC 3FYGA 1OC9A 3ZLPA 3K8NA 2VL9A 2ZUPA 3BD2A 2O7KA 3G7YA 2ON7A 2OE1A 4V1Ap 2N5BA 3KP9A 2YPMA 3GFKA 3CSHA 2DJKA 4XCSA 4DSQA 3ZITA 2CA8A 1V40A 1O85A 2K8VA 4GRFA 2DJ3A 2LQQA 2F3MA 1WRYA 3ZTLA 3UVTA 1F3BA 2NVLA 4ID0A 4NV2A 1OKTA 2YOIA 4L5LA 1ERVA 2LEGA 4KCAA 2L6CA 4K9ZA 3L9SA 3HJMA 4QL9A 3Q74A 4GSTA 2VLVA 4N11A 4PURA 2HRNA 3CYNA 4WXTA 3M1GA 2YNXA 4IN0A 1S3AA 3KTLA 2EIRA 3G7IA 1XXUA 2LQOA 2VIMA 5ECMB 6GSXA 4I97A 1H4OA 1I9DA 4IP6A 1FW1A 1RK4A 4Q5FA 2REMA 14GSA 4IS0A 5ID2B 1NW2A 1X5CA 4AJ8A 3C73A 3GX0A 1XW9A 2OBIA 4GXZA 1AC1A 2FHEA 3GURA 1PX6A 5CREA 4L5OA 5DCHA 4AGSA 6GSUA 5H5RA 3TKSE 1OE7A 2VM2A 4TRXA 1V9WA 4LL4B 1S3CA 3TOTA 1AXDA 3BCKA 4EDZA 1R5AA 4EL1A 1X5EA 1EGRA 2FWFA 1JFUA 2IIYA 3EU4A 3VK9A 4TXVA 2DMMA 3ZVJA 2HI7A 3TJJA 1HNCA 2VM1A 2V41A 4IJ3A 5HFKA 1PL2A 3GA4A 1EP7A 1GUKA 5L71A 2H76A 2B1KA 5D8IA 5EPFA 1M0UA 1VF3A 1VF2A 3M3MA 2QC7A 4YAPA 4MCUA 2X8HA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite