1LZBA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzbA00
2ZQ3A 1JKAA 1LHHA 4DWXA 2BQIA 5KXNA 1YAOA 1YAMA 5KXXA 3WL2A 1LZBA 1JKBA 2F2NA 2EQLA 3A34A 2BQEA 1LSGA 1YILA 1GFHA 3WH1A 1GFEA 3B0IA 2G4NA 4QEQA 4ETDA 1XSFA 1F0WA 1FKQA 1LYZA 1NF5A 1HSXA 3A3RX 1QUTA 154LA 1LZ4A 1HMLA 2D4JA 2W1YA 5KKJA 5L9JA 5D5FA 4HSFA 4LGKA 2W1XA 4M4OA 1W08A 1GD6A 1WVVA 5F14A 4CFPA 4YENA 3J4GA 4NSGA 3TMVA 4H8YA 4WLTA 1NHEA 3A96A 5KXMA 4NSIA 4M6DA 4GCDA 1LJGA 4H9IA 1LZTA 3B0OA 1E8LA 2HEBA 4NY5A 4WM2A 1SQ2L 1HFZA 1LZ8A 4GCEA 4WO9A 5FELA 1JWRA 4DDBA 5FDJA 1LYOA 4XYYA 1GFAA 2HU3A 1GFTA 1KXWA 1YKZX 4CFOA 2D4IA 4MR1A 2I25L 1UIAA 1LZCA 1GEZA 2PC2A 4DDAA 4HJYA 3BKHA 4NHTA 1BWIA 1J1OY 3A6BY 1VEDA 3W6EA 4KL7A 2DQIY 4OWCA 4G9SA 4NIJA 4NGJA 2Z38A 3ZVQA 5II3A 4NSHA 1LCNA 5FSTA 3WU9A 132LA 3BKVA 1DPWA 4WLDA 1C08C 4DD9A 4NHIA 1KXXA 1C10A 5ILCA 1B5WA 1TEWA 4NGKA 2BQGA 3HBDA 4OOTA 4LFXA 1HF4A 4LT0A 4H91A 1XGUC 3A6CY 1JISA 2Z2EA 2MEBA 1IY4A 2ZWBA 2C8OA 1QSAA 1D9UA 2C8PA 3ATNA 1IOQA 1PZYA 3OK0A 1EQEA 3RW8A 4GCBA 3W6FA 1BHZA 1OUJA 2AUBA 3WVYA 1B5ZA 1LJIA 1VDQA 4L41A 4QDNA 5APFA 3RU5A 3A67Y 3WYHA 1BB4A 1AKIA 1D0KA 1VFBC 4LYCA 5HQ1A 1JEFA 2LZTA 4NFVA 4YEOA 1LMPA 4FDYA 1LSAA 1KIRC 3TXBA 1YKXX 2FYDA 3P64A 1GDWA 4NHPA 1LJJA 4TX7A 4B1AA 1CKHA 1UACY 3A92A 4KPMA 8LYZA 1NKHA 1GBZA 1LSEA 4LT2A 1GEVA 1HMKA 4RLNA 5LAGA 3EMSA 4TTDA 4TSCA 3WXUA 1AZFA 2YSSC 5AMYA 134LA 3E3DA 2YBLA 5KJ9A 1C43A 3WPKA 1FBIX 1GF7A 1GE4A 2YBNA 4NEBA 4DYGA 5I53A 3CSZA 5A3EA 5KXKA 1FN5A 2BQFA 4EMNA 3WMKA 2HU1A 3CB7A 2W1MA 1GE0A 1B7OA 1GBYA 1V7SA 4X3BA 1CKDA 1REMA 1GF8A 4N1CC 2BQKA 4H9AA 5C6LA 5IDDA 2DQJY 1WVUA 1QIOA 1ZVYB 1VAUA 4W94A 1QDTA 1O23A 5E9RA 1B7RA 5B1FA 3QNGA 5HLLA 4ETAA 4YM8A 2YBHA 4N1EI 1YANA 3TXKA 1OUEA 1LJKA 4OWHA 3AYQA 2BQBA 2BQCA 1IP1A 1LSBA 1GF3A 1GB3A 2HECA 1LMAA 3W6CA 4B0DA 1HFYA 1A2YC 2DQDY 1JKCA 1CNSA 1DI5A 1GF6A 4NSJA 1G7MC 2LYZA 1DXJA 3A93A 4P2EA 4OWBA 3M3UA 1GFUA 1DQJC 3EBAB 4N8ZA 5FEKA 1UC0A 1LMCA 5DN5A 1UICA 5B06A 5I5QA 5I4WA 2D4KA 5KXOA 1LMQA 1CJ8A 3WUMA 5LAFA 1P2CC 2MEGA 4BADA 9LYZA 2YDGA 3WUNA 3ULRA 1LYSA 2CGIA 1RCMA 4RW1A 4WMGA 4XADA 3EO5A 1BB6A 2HUBA 2B5ZA 5HNLA 4B4IA 4NWHA 1YQVY 1REXA 4AXTA 2BQOA 4LZTA 1CJ6A 1GF0A 1XGRC 4HTNA 2CDSA 2MEFA 1FLYA 5F9XA 4TWSA 4ET9A 2EPEA 5B05A 1DZBX 2DKVA 1DI4A 2EKSC 2ZIKA 1EL1A 3N9CA 1YL0X 1I1ZA 5LINA 2ZYPA 4WL6A 4NGLA 4XJFA 5FCPA 5J7CA 1LZGA 4H9BA 4EOFA 2FYCA 1IR9A 1F6RA 1ALCA 1HERA 1LHKA 2BQAA 4MSTA 4DD3A 4ETBA 4NHQA 1LHIA 1T3PA 4J7VA 1JHLA 4NGYA 1IO5A 4I8SA 5IELA 1H6MA 2X0AA 1JJ0A 4ET8A 4GN5C 1JJ3A 3CSRA 3GXRA 4IATA 4CHXA 2DQEY 5JENB 1GBSA 1IP2A 1BVXA 1TCYA 4NGWA 1IWUA 1HNLA 2BQDA 4MCKA 4U3XB 1RFPA 1KIQC 4B4JA 1JUGA 2ZILA 2I6ZA 4NG1A 3HBEX 1GB9A 1UIDA 2W1LA 2D91A 2YBMA 1LSDA 2FBDA 1IP4A 5LVGA 1GB5A 3KAMA 1GE1A 1IVMA 1B9OA 4IASA 1KXYA 2Y8PA 4H93A 1UUZC 1GFVA 1LZ5A 2HEAA 1YIKA 5APEA 3WVXA 1HEWA 4BAPA 1JJ1A 3LZTA 4WM1A 4KT3A 1JITA 4HTKA 1AT5A 1BB7A 1XGPC 1YROA 1WQNA 3FE0A 4OWEA 4WO6A 2MECA 3K3TA 1B0DA 4H92A 3LYZA 1IWTA 1KIPC 1REYA 2Z37A 3A3QA 4H8ZA 4TSBA 1D0MA 1IP7A 2MEIA 5B1GA 4E3UA 1LZ9A 4PPOA 1GB6A 2N5ZA 4G4BA 1RE2A 1XFPL 3G3BB 4WG7A 5KXZA 4DT3A 3AJNA 4QY9A 1LHJA 1XEKA 5D5CA 1B7LA 1QQYA 3TMUA 1LSNA 4PHIA 1IWXA 4Z46A 1B5YA 3P4ZA 1RI8B 4HV2A 1DKKA 4J1AA 4TUNA 1A4VA 4ANRA 4ZIXA 2WARA 1HELA 1UIEA 4W96A 1LMTA 4H8XA 194LA 1LKRA 2BQHA 2XBSA 2YBJA 1FLWA 4XJIA 4Z3MA 4NG8A 1LHMA 5HMJA 4YF2A 1IX0A 1LJ4A 2G4QA 4XN6A 3WPJA 1Z55A 3P65A 3TXHA 4DC4A 4R0FA 5KXPA 1IWYA 4NGIA 2DQHY 4NHSA 1LZ6A 2A7FA 1LZ1A 1IIZA 4QGZA 1OUGA 5LVKA 1XEIA 1JSFA 4I0CA 1BB3A 1NQIA 1NDGC 2DQFC 2ZQ4A 4A7DA 3M18B 4N5RA 3T6UA 3LYOA 3P68A 4PRQA 4B4EA 153LA 1B5XA 4IJ4A 1LTMA 2XJWA 2CJLA 1CJ7A 1DI3A 1HHLA 4WM4A 3TXGA 3RNXA 1WTNA 4HJZA 1IC5Y 1T6VL 2A7DA 1CKFA 1UIFA 5T3FA 3W6BA 5HNCA 1ZMYL 5KY1A 5LYTA 1B5UA 1GE3A 6LYZA 3LZ2A 1IR7A 5KXSA 1LSFA 5LYZA 3SP3A 4LT3A 193LA 1YKYX 1UIBA 5LA8A 4BAFA 2F4GA 5KXLA 1IOTA 1NBZC 2IHLA 4DD1A 1B7NA 1PS5A 2HEFA 7LYZA 1LKSA 3OJPA 3TXJA 4H9FA 1NBYC 5K7OA 2XBRA 3A91A 133LA 2Z18A 1B7QA 1N4FA 1LZSA 3HBHA 1XGTC 1LAAA 3N9EA 1LSMA 3W6DA 1OUIA 1SLYA 1IEEA 1FDLY 3AW6A 3ZEKA 3IJUA 3WXTA 1AM7A 4HV1A 5ILFA 5I4XA 2Z12A 1QUSA 4KXIA 3B72A 1F10A 2HEDA 1GFGA 3W3EA 1IWZA 2IFFY 1GBXA 2HEEA 1GF5A 1G7IC 1JTTL 1LMOA 2Z39A 1GBWA 4B49A 2ZIJA 1D0LA 2D6BA 1HEPA 6LYTA 5L3IA 1FLQA 2BQMA 5KXRA 3AGHA 4OOOA 1UIGA 2BLYA 1IWVA 1LYYA 3WULA 3ZVQB 1EQ5A 1OP9B 2LZ2A 1YAQA 2DQCY 3QE8A 3D9AC 1QDRA 3RT5X 5EBHA 3P66A 2VB1A 1ZVHL 3CT5A 1V7TA 4HP0A 208LA 2H9JA 2LYOA 5DN4A 1B2KA 4DD0A 1LSPA 4ZFPA 1H87A 5KXTA 1IC4Y 1FKVA 4OWAA 3AGIA 2BAAA 2BQLA 1TBYA 1LPIA 1LJNA 5I4YA 4DDCA 1GXV2 3CQLA 4ML7A 1LZYA 3CT0A 1UCOA 1QSWA 3N9AA 1LSCA 4FJRA 4GN3A 5APDA 3TXDA 1C46A 5KXWA 1JTOL 1INUA 4CGEA 4II8A 2YVBA 2BLXA 4H1PA 1D6PA 1C7PA 3LHMA 1VDTA 4HJVA 3WW6A 4PJ2C 2XTHA 4WL7A 4LFPA 3TXFA 1CKGA 4GLAA 1D6QA 1JTPL 1LZRA 2MEHA 5F9UA 1REZA 1LMNA 3WUAA 1HEOA 5APCA 1OUFA 2ZYCA 3B0KA 1GB8A 4H9HA 4WG1A 1GFRA 3A90A 4NWEA 3TXIA 3ATOA 1VDPA 4N9RA 1GFJA 2MEAA 4D9ZA 1NWGA 5LIOA 4RW2A 4PGJB 2BPUA 4DD7A 1WQMA 3QY4A 1NDMC 5F16A 5LVIA 1GBOA 1HFXA 1LHLA 3G3AB 3J6KA 3LYTA 3VWOA 1HENA 3B6LA 2LYMA 4LYOA 3HFMY 2RSCA 3F6ZA 4DD2A 1GE2A 1OQMA 3WU7A 4R6CA 1RJCB 2FBBA 5LVJA 4N0JA 3T36A 4UWNA 3TMXA 5C6JA 1OUCA 4LYBA 1IP5A 4GCFA 4UWUA 1IP6A 1F6SA 2MEDA 1WTMA 207LA 1B7SA 4OW1A 3WW5A 3AZ5A 1GAZA 4G4CA 4NGZA 1LJHA 1XEJA 4J1BA 2LHMA 1AT6A 1DKJA 4WLXA 1LZDA 1GHLA 1I56A 1QTEA 1TAYA 1YAPA 2EIZC 4UWVA 4O34A 1GF4A 4H9EA 1LZNA 1BVKC 2HTXA 4H90A 3TXEA 1IC7Y 1HC0A 2Z2FA 1JIYA 2BQJA 3GXKA 1CJ9A 1MELL 4GCCA 4HPEA 4XENA 2Q0MX 1ZV5L 3FI7A 5DL9A 1TDYA 1B5VA 4ETCA 3AZ7A 1C45A 2BQNA 2ZNXY 1G7HC 5C6IA 5B59A 1OUBA 1UIHA 1I20A 1LSYA 2G4PA 1GAYA 2ZNWY 4XJHA 4LT1A 2CWIA 5DLAA 1DPXA 135LA 4LYMA 3AB6A 3W6AA 1NMMA 5LYMA 1WQRA 4AGAA 1IY3A 3CSQA 1GPQC 4LYTA 4NGOA 1JPOA 4WM3A 2F4AA 1OUDA 4YOPA 3EXDA 2YBIA 1HEMA 1XGQC 2DQGY 1EQ4A 2NWDX 4GLVA 3IJVA 4GN4A 5E4PA 2F30A 1GB0A 4G49A 5B07A 5L3HA 4WM5A 4Z41A 5DM9A 4ZEEA 1JKDA 4WM6A 2GV0A 5M1YA 1UA6Y 3AZ4A 1B7MA 4J0LA 2DQAA 1GWDA 1IR8A 1BWJA 1BB5A 1BWHA 2I26L 3LN2A 1LJ3A 1MLCE 1LJEA 3AW7A 4HTQA 4H94A 3AGGG 1WQPA 4PRUA 1GXXA 1VATA 1WQQA 4C3WA 1OUAA 4Z98A 3WPLA 1IOCA 1CKCA 1G7LC 2Z19A 5LA5A 1BQLY 1FLUA 4LYZA 4XJGA 1GB7A 5LVHA 1LJFA 3A94A 1JSEA 1J1PY 1WQOA 5HMVA 1GB2A 1LZEA 2DBTA 3RZ4A 4CJ2A 3TMWA 5LXWA 1GFKA 1GF9A 4BS7A 1B7PA 1VDSA 1LZAA 3LYMA 5FHWA 4C5FA 4H9CA 4HPIA 1HEQA 1QTKA 1LOZA 5KXYA 4G4HA 5A3ZA 4ETEA 1IOSA 1G7JC 4RLMA 1LSZA 5KKIA 3D3DA 3MGWA 1IP3A 1IORA 4YEMA 1J1XY 5F81A 5IHGA 1YL1X 1BGIA 4WLYA 2H9KA 1GDXA 3WU8A 1OUHA 3AZ6A 4XJDA 1UBZA 2H5ZA 4RDSA 1HSWA 3A95A 2MEEA 1W6ZA 3A8ZA 3CT1A 4WOAA 4NGVA 4XJBA 3IWRA 5I54A 1IWWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZQ3A 1LHHA 5KXNA 1YAMA 3WL2A 125LA 223LA 2EQLA 1OVHA 2BQEA 1CU6A 143LA 150LA 1FKQA 1NF5A 3A3RX 154LA 2W1YA 4M4OA 5D5FA 2W1XA 1W08A 3J4GA 1L50A 4H8YA 4WLTA 141LA 2HEBA 3DN4A 157LA 1C64A 1CX6A 4DDBA 3OE6A 1YKZX 4MR1A 1L84A 1K28A 1L06A 2DQIY 1T6HA 167LA 3BKVA 1P64A 1KXXA 3HBDA 231LA 1L98A 1G0QA 3G3XA 2Z2EA 3DKEX 5APDA 2C8PA 3ATNA 4GCBA 2AUBA 1LJIA 5APFA 2LZTA 1OWZA 4NFVA 4YEOA 1LMPA 257LA 1L55A 1PQOA 2RB1X 1CVKA 4NHPA 1LJJA 4TX7A 1UACY 3A92A 1NKHA 1GBZA 5LAGA 216LA 4TSCA 1AZFA 1L61A 5KJ9A 3WPKA 1FBIX 4NEBA 5I53A 1L24A 1C6PA 1GE0A 4H9AA 173LA 1C6LA 1D9WA 1L79A 1B7RA 3QNGA 4YM8A 2YBHA 1SSWA 1GF3A 2HECA 3W6CA 2Q9EA 2A4TA 1HFYA 102LA 1DYFA 4NSJA 2LYZA 1DXJA 3EBAB 4N8ZA 3FI5A 1UC0A 5DN5A 5KXOA 1LMQA 3WUMA 2MEGA 4BADA 2O7AA 2YDGA 3ULRA 1LYSA 4RW1A 3EO5A 2HUBA 4NWHA 1C60A 2BQOA 2OU9A 2CDSA 2DKVA 2EKSC 3C80A 5J7CA 191LA 3F9LA 1L37A 1LHIA 5IELA 1IO5A 4I8SA 2X0AA 1JJ0A 4PK0A 4GN5C 118LA 2DQEY 5JENB 1IP2A 1TCYA 1IWUA 1HNLA 4U3XB 1RFPA 2ZILA 2RBSA 2YBMA 1LSDA 1B9OA 4IASA 1KXYA 2OEAX 4H93A 241LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZQ3 A;  1JKA A;  1LHH A;  4DWX A;  2BQI A;  5KXN A;  1YAO A;  1YAM A;  5KXX A;  3WL2 A;  1LZB A;  1JKB A;  2F2N A;  2EQL A;  3A34 A;  2BQE A;  1LSG A;  1YIL A;  1GFH A;  3WH1 A;  1GFE A;  3B0I A;  2G4N A;  4QEQ A;  4ETD A;  1XSF A;  1F0W A;  1FKQ A;  1LYZ A;  1NF5 A;  1HSX A;  3A3R X;  1QUT A;  154L A;  1LZ4 A;  1HML A;  2D4J A;  2W1Y A;  5KKJ A;  5L9J A;  5D5F A;  4HSF A;  4LGK A;  2W1X A;  4M4O A;  1W08 A;  1GD6 A;  1WVV A;  5F14 A;  4CFP A;  4YEN A;  3J4G A;  4NSG A;  3TMV A;  4H8Y A;  4WLT A;  1NHE A;  3A96 A;  5KXM A;  4NSI A;  4M6D A;  4GCD A;  1LJG A;  4H9I A;  1LZT A;  3B0O A;  1E8L A;  2HEB A;  4NY5 A;  4WM2 A;  1SQ2 L;  1HFZ A;  1LZ8 A;  4GCE A;  4WO9 A;  5FEL A;  1JWR A;  4DDB A;  5FDJ A;  1LYO A;  4XYY A;  1GFA A;  2HU3 A;  1GFT A;  1KXW A;  1YKZ X;  4CFO A;  2D4I A;  4MR1 A;  2I25 L;  1UIA A;  1LZC A;  1GEZ A;  2PC2 A;  4DDA A;  4HJY A;  3BKH A;  4NHT A;  1BWI A;  1J1O Y;  3A6B Y;  1VED A;  3W6E A;  4KL7 A;  2DQI Y;  4OWC A;  4G9S A;  4NIJ A;  4NGJ A;  2Z38 A;  3ZVQ A;  5II3 A; 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 4LYM A;  3AB6 A;  3W6A A;  1NMM A;  5LYM A;  1WQR A;  4AGA A;  1IY3 A;  3CSQ A;  1GPQ C;  4LYT A;  4NGO A;  1JPO A;  4WM3 A;  2F4A A;  1OUD A;  4YOP A;  3EXD A;  2YBI A;  1HEM A;  1XGQ C;  2DQG Y;  1EQ4 A;  2NWD X;  4GLV A;  3IJV A;  4GN4 A;  5E4P A;  2F30 A;  1GB0 A;  4G49 A;  5B07 A;  5L3H A;  4WM5 A;  4Z41 A;  5DM9 A;  4ZEE A;  1JKD A;  4WM6 A;  2GV0 A;  5M1Y A;  1UA6 Y;  3AZ4 A;  1B7M A;  4J0L A;  2DQA A;  1GWD A;  1IR8 A;  1BWJ A;  1BB5 A;  1BWH A;  2I26 L;  3LN2 A;  1LJ3 A;  1MLC E;  1LJE A;  3AW7 A;  4HTQ A;  4H94 A;  3AGG G;  1WQP A;  4PRU A;  1GXX A;  1VAT A;  1WQQ A;  4C3W A;  1OUA A;  4Z98 A;  3WPL A;  1IOC A;  1CKC A;  1G7L C;  2Z19 A;  5LA5 A;  1BQL Y;  1FLU A;  4LYZ A;  4XJG A;  1GB7 A;  5LVH A;  1LJF A;  3A94 A;  1JSE A;  1J1P Y;  1WQO A;  5HMV A;  1GB2 A;  1LZE A;  2DBT A;  3RZ4 A;  4CJ2 A;  3TMW A;  5LXW A;  1GFK A;  1GF9 A;  4BS7 A;  1B7P A;  1VDS A;  1LZA A;  3LYM A;  5FHW A;  4C5F A;  4H9C A;  4HPI A;  1HEQ A;  1QTK A;  1LOZ A;  5KXY A;  4G4H A;  5A3Z A;  4ETE A;  1IOS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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