1LZCA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzcA00
3WPJA 3CB7A 1GFAA 1IWZA 1LKRA 3AZ7A 5LYTA 1OUEA 2A7FA 4OOOA 2BQOA 4LFPA 4G4CA 4NG8A 4B4EA 132LA 3N9CA 1LSDA 4GLAA 1GBWA 1YL1X 1FLQA 1LYYA 1B2KA 1XEKA 3A3QA 4II8A 4PHIA 4ET8A 4QY9A 1IC5Y 1YAMA 1A4VA 3EBAB 1UIAA 4HJYA 4LYTA 4TSCA 4WO6A 1J1PY 1HFXA 1LMQA 3WYHA 4WLYA 1FLUA 2MEFA 2BQAA 4DD0A 3TMXA 1D0LA 3W6AA 4YOPA 2BQIA 1T3PA 1BB5A 4PJ2C 2CDSA 1FBIX 1LSBA 1RFPA 4HJVA 3D9AC 3M3UA 1LJIA 4NGWA 4NWEA 5DN5A 1LHIA 5FDJA 1HMLA 4H9IA 1IORA 5DM9A 208LA 1UIBA 4NSIA 4OWBA 1OUAA 4H9BA 1LJ3A 1WQRA 2CWIA 1GF8A 4OOTA 2DQEY 1LSPA 1IY4A 4UWVA 1XGQC 154LA 1CJ7A 4WO9A 5F9UA 4WM5A 1IOCA 2C8OA 1O23A 3CQLA 1GBYA 1JKDA 4TWSA 4BS7A 1LSYA 1D9UA 2XTHA 5IDDA 3WH1A 4UWNA 5LAGA 1NDMC 1HFYA 3B0OA 2MEGA 1OUJA 3AZ4A 2Z2EA 4I8SA 2YSSC 2Q0MX 1C43A 4H8YA 4LT0A 4ZEEA 5I4YA 1BWJA 3IJUA 2LYZA 4L41A 1YKZX 1DKKA 5IELA 2YBJA 5KXTA 4NHPA 1LHMA 3EO5A 1G7LC 1XGTC 1BHZA 4YEOA 8LYZA 3P64A 1FDLY 1KXYA 2FBDA 1IC4Y 1LZCA 9LYZA 3CSZA 5ILCA 4G9SA 4J1BA 3WW5A 1INUA 3ATOA 1C46A 3TXDA 1FLWA 2DQCY 5LVIA 3ZVQB 1W6ZA 3LHMA 2BQFA 3B0IA 4RLNA 1EQ5A 1W08A 4G4HA 1OUHA 1TAYA 4H9EA 4XENA 1GFEA 4NG1A 133LA 1CKHA 1IEEA 4R6CA 4ANRA 3CT1A 1DI3A 4DWXA 1GB3A 3LZ2A 5LVHA 3A8ZA 1JKAA 4HPIA 1B5ZA 1B7RA 4GCCA 4LT2A 1QDRA 1LJ4A 1IP7A 1HMKA 2XBRA 4DD2A 5KXXA 1JKBA 4NSGA 4Z3MA 2ZNXY 1IR7A 1BVXA 4WM2A 1GE2A 1OUDA 4WL6A 1GF0A 1QSAA 2W1XA 1JTPL 4H8ZA 4NSHA 1GFKA 3E3DA 1LJFA 1IP2A 1JITA 1HENA 1C45A 1TCYA 4Z46A 4P2EA 2PC2A 1LSCA 4H91A 1GF6A 3HBDA 1HSWA 1NHEA 1JSFA 4MR1A 2X0AA 5F16A 5FEKA 1IO5A 1UICA 1JIYA 2FYCA 1GHLA 5II3A 4H9HA 4NFVA 1GFGA 2DKVA 4B1AA 1QDTA 3TXIA 4B4JA 1LMCA 3AGHA 1DPWA 3IWRA 5KXYA 5FCPA 1GWDA 4XJDA 2HU3A 4O34A 1V7SA 5KY1A 3W6BA 1RI8B 1VDTA 5B05A 1IWXA 1OUFA 5L9JA 4KXIA 1LJGA 1C7PA 1D6QA 1BVKC 4H8XA 1I56A 3HFMY 4TSBA 1UC0A 4EOFA 1AZFA 3TMUA 3QY4A 4GN4A 1LYSA 1GPQC 3P66A 2Z18A 4R0FA 5ILFA 1B5VA 1HEOA 1UIDA 5LYMA 3RT5X 4XYYA 1KIQC 3W6EA 1YKYX 1LZ9A 3N9AA 2BLXA 4XJBA 4HPEA 1N4FA 3A95A 2H9KA 5KXNA 5KKIA 1IR9A 1KIPC 1LMAA 3LYMA 4LYBA 1CKFA 1JWRA 2ZIKA 2Z19A 5LINA 2MEEA 2F4AA 2AUBA 1BWIA 4U3XB 4HTKA 1AKIA 5APDA 3WMKA 1F0WA 3WPLA 3TXFA 4NHIA 4XADA 1HFZA 1WVUA 2MECA 3P65A 1JEFA 2Z37A 1CJ6A 4N1EI 1LSAA 4LT1A 1QTEA 5LAFA 1AT5A 3WXTA 1LMOA 2IHLA 1NMMA 5KXLA 1RE2A 3W6DA 4GN3A 2GV0A 1GB7A 4E3UA 5KXWA 1HSXA 2VB1A 4Z98A 1BB7A 3EMSA 193LA 1QUSA 3B6LA 2EKSC 4YF2A 1G7IC 4LFXA 1ZMYL 1LZNA 5FELA 2ZQ4A 3AZ5A 2BPUA 1JPOA 1CJ8A 3WU7A 1LZTA 1LSMA 4H90A 5B1GA 5C6LA 1LHKA 2DQJY 1LOZA 4LGKA 1GB5A 3WU9A 2EIZC 2I26L 1LSNA 1QTKA 1YAPA 4NGJA 4WMGA 5HMVA 5KXKA 4C3WA 3WULA 1DPXA 1GBXA 1TEWA 4GCEA 4WG7A 4CFPA 3D3DA 2MEIA 4CHXA 5IHGA 2BQCA 4GLVA 1YAOA 3A6CY 2F30A 1GEVA 4WL7A 1GFUA 1YQVY 1IWWA 2W1LA 2Z2FA 3P4ZA 3W6CA 1FN5A 1LPIA 2YBLA 3A91A 2D6BA 1YANA 3K3TA 1NF5A 1VAUA 4CGEA 1YKXX 4MSTA 1D6PA 1J1OY 1YL0X 4GCBA 1GBSA 1GEZA 1GXXA 3LYOA 5DL9A 4N9RA 194LA 4H1PA 4H94A 3TXHA 1KXWA 1MELL 1UACY 3OK0A 1GB8A 3AW6A 1GF7A 1WVVA 5LYZA 1IWTA 4NGZA 4BAPA 2BQJA 1B7PA 3A92A 1OP9B 3N9EA 4NGYA 3T6UA 4DT3A 2Y8PA 2BQEA 1H6MA 3CSQA 3WUNA 1HHLA 3A34A 4BAFA 5LA5A 1IP1A 2YVBA 1GE1A 4YEMA 5M1YA 1LHHA 1LSEA 2FYDA 1B7QA 1IWVA 3SP3A 4ZFPA 5D5FA 1B7MA 4LT3A 1GB2A 4UWUA 4DYGA 3WXUA 1JJ0A 1LMNA 3A90A 5DLAA 5KXPA 4YM8A 5C6JA 1BB4A 1JKCA 1I1ZA 3QE8A 3TXGA 4B0DA 4GN5C 1LZ4A 1LTMA 1PZYA 3M18B 4OWCA 4PPOA 2C8PA 1SQ2L 4NHTA 5KXMA 4WLTA 2D4KA 4W96A 4XJHA 4NGOA 4RW2A 4DDBA 4J0LA 1ZVYB 1C08C 1MLCE 2D91A 4H92A 4NGIA 1OUBA 2YBMA 1AT6A 1TDYA 1IX0A 1J1XY 1LMPA 1OUCA 2B5ZA 1NQIA 3CT5A 3BKHA 4M4OA 3TXJA 1B5WA 4WM3A 5FHWA 4IJ4A 7LYZA 4OWAA 4DD7A 1GD6A 2DQGY 1YILA 1WQPA 4B4IA 2HUBA 1HEWA 1BQLY 1TBYA 1HEQA 1QSWA 4OW1A 4PGJB 5C6IA 2DQAA 1WTMA 1GF5A 1DI5A 1GBOA 4DC4A 1JJ1A 4WM6A 5A3EA 3HBEX 4WM4A 4QDNA 1LZSA 5B07A 1BWHA 4BADA 1IOTA 1QIOA 2W1MA 1IOSA 4HSFA 5KXOA 2A7DA 1IR8A 1LJHA 4TX7A 1XSFA 3CSRA 5F9XA 1GDXA 1XGRC 3WVXA 1KXXA 1EQ4A 1JUGA 2MEHA 134LA 1GAZA 5LVGA 4YENA 4LYOA 4GCDA 5LVKA 3LZTA 3A94A 4NEBA 4NHSA 5E9RA 4G49A 3LN2A 5LXWA 5A3ZA 2D4JA 1REZA 1F6SA 2XBSA 1LYOA 5APEA 2LHMA 4ML7A 1OQMA 1IOQA 1NBZC 2HU1A 4NIJA 1UBZA 5LA8A 1OUGA 1EQEA 3W3EA 4Z41A 5I4WA 1B5UA 1HELA 2BQMA 3A67Y 4FJRA 4PRUA 3B72A 1B7SA 1GFHA 1A2YC 1GFVA 2F2NA 5T3FA 3WUMA 1UUZC 1JTOL 3RU5A 1GAYA 4H9AA 4LYCA 4H9CA 4CFOA 4ETCA 1QQYA 3QNGA 1IVMA 5APFA 3BKVA 2IFFY 3WVYA 2BQGA 4DDAA 4NWHA 1GF4A 5L3IA 1E8LA 2F4GA 4NGVA 4RLMA 3T36A 1G7HC 1HNLA 4RW1A 1IWUA 2YBHA 5K7OA 1B7OA 1JTTL 2DQIY 1XEJA 4HP0A 4OWHA 1LHLA 1LZGA 1OUIA 1JJ3A 2DQFC 3VWOA 4ETBA 1DKJA 3AYQA 3F6ZA 4KPMA 1GF9A 4HV2A 4W94A 1BB6A 2ZQ3A 1IY3A 1RCMA 2BQDA 2I6ZA 5B59A 1CKDA 3A3RX 4WG1A 1C10A 1RJCB 2ZWBA 1LKSA 1B7NA 2HEFA 3LYTA 4DD3A 1B5YA 1GDWA 1VATA 1NDGC 4NHQA 4CJ2A 5EBHA 2CJLA 2WARA 1AM7A 1CNSA 2LZTA 4N8ZA 3TXKA 1GFRA 1YIKA 2ZYPA 1JSEA 4AXTA 4LZTA 1GFTA 1HERA 1PS5A 2HEDA 3CT0A 1GXV2 4DD1A 2BQLA 1IP5A 1HF4A 3WUAA 4NGLA 1NBYC 2EQLA 5AMYA 3ZVQA 1GE4A 3TXEA 5LIOA 1GE3A 4A7DA 3W6FA 2BQNA 1NKHA 4J7VA 1VDPA 1IP6A 2MEAA 1LZEA 4XJGA 1CKGA 153LA 5F81A 5KXSA 5HMJA 5HNCA 1LZBA 1ZV5L 2EPEA 5DN4A 5JENB 1I20A 1LZ6A 1LZYA 1LZAA 4FDYA 1WQOA 4XJFA 6LYZA 1IP3A 3G3AB 1LJNA 4X3BA 3WU8A 1YROA 1F10A 2YDGA 4AGAA 4LYZA 1CKCA 4GCFA 2LZ2A 3AJNA 2BQHA 3J6KA 1LJEA 3RNXA 2Z38A 1UIHA 3GXKA 4D9ZA 1XEIA 5KXRA 1XFPL 1LMTA 4DDCA 2HECA 2Z39A 3ATNA 4J1AA 1VFBC 4N5RA 4WLXA 1UIFA 3A96A 4I0CA 1G7JC 3ZEKA 207LA 2BAAA 2LYMA 2FBBA 3OJPA 1REXA 1NWGA 3FI7A 4NGKA 4WM1A 3AGIA 5FSTA 1LHJA 3AGGG 1DXJA 1VDSA 4QGZA 1HEPA 2N5ZA 2YBIA 1WQMA 4QEQA 4ETDA 6LYTA 1FKQA 1WTNA 1UCOA 2DQDY 4ETEA 1ZVHL 4HTNA 4WOAA 1XGUC 3IJVA 5KXZA 2G4PA 5LVJA 1QUTA 5J7CA 4WLDA 4KT3A 3WL2A 3FE0A 4DD9A 1CJ9A 1LZ8A 1XGPC 4HV1A 2RSCA 2ZNWY 3TMWA 4PRQA 2LYOA 1KIRC 4HJZA 2G4NA 3G3BB 1YAQA 2ZIJA 1GE0A 1UIGA 2W1YA 1EL1A 2BLYA 2YBNA 3GXRA 4B49A 5HLLA 1F6RA 4H93A 4NY5A 2Z12A 3TXBA 4N1CC 3RZ4A 3ULRA 5E4PA 1GB9A 2HEBA 2H5ZA 4LYMA 1SLYA 1DQJC 5HNLA 2H9JA 1DZBX 1LSFA 5KJ9A 4N0JA 1D0MA 1REYA 1UA6Y 2ZILA 1IIZA 4XJIA 1GF3A 1WQQA 1LCNA 1LSZA 5F14A 3P68A 1IC7Y 2ZYCA 4MCKA 2XJWA 4G4BA 1B7LA 3AB6A 1VEDA 4ZIXA 3WPKA 1P2CC 5I54A 5I5QA 5I53A 4IASA 1FKVA 2MEBA 3MGWA 1GB0A 3AW7A 1LJJA 1LZRA 4C5FA 135LA 1VDQA 4EMNA 3TMVA 5B06A 2MEDA 1G7MC 1LAAA 1LZDA 2HTXA 3B0KA 3EXDA 4H9FA 3RW8A 1T6VL 3LYZA 4ETAA 5KKJA 1JISA 4M6DA 1LSGA 1IP4A 3A6BY 4HTQA 1JHLA 1WQNA 2DBTA 4ET9A 2HEEA 5D5CA 3HBHA 5HQ1A 2NWDX 4NSJA 3J4GA 2D4IA 1LZ5A 1D0KA 1FLYA 2CGIA 3KAMA 1V7TA 5B1FA 1IWYA 1GB6A 1GFJA 1LZ1A 1GBZA 1HEMA 1B9OA 5APCA 1ALCA 2HEAA 1B0DA 2BQKA 4KL7A 1LYZA 3A93A 3AZ6A 1UIEA 1H87A 1LJKA 1BB3A 2I25L 4RDSA 4XN6A 1BGIA 1Z55A 4IATA 4TUNA 5L3HA 2G4QA 1B5XA 3WW6A 1HC0A 1REMA 2DQHY 5I4XA 2BQBA 1DI4A 4TTDA 4OWEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
251LA 3WPJA 1L10A 4LFPA 4G4CA 4NG8A 132LA 115LA 3GUKA 260LA 1C6IA 1YL1X 1LYYA 1B2KA 1JQUA 1YAMA 4HJYA 4TSCA 4LYTA 1J1PY 2MEFA 4YOPA 1FBIX 4HJVA 1LJIA 5DN5A 1HMLA 1IORA 1UIBA 4OWBA 1O23A 1PQMA 4TWSA 1D9UA 4UWNA 5LAGA 3AZ4A 2MEGA 4I8SA 2Z2EA 4ZEEA 1C43A 1KW5A 1G0GA 1YKZX 226LA 2LCBA 1KNIA 3HDEA 5IELA 4NHPA 1DYGA 1LHMA 3EO5A 1L0JA 1BHZA 3L64A 158LA 1KXYA 1L53A 1LZCA 5ILCA 4G9SA 4J1BA 3WW5A 3ATOA 165LA 3TXDA 3NY9A 145LA 3ZVQB 3LHMA 1EQ5A 4NG1A 1P64A 133LA 4R6CA 3LZ2A 2LZMA 4HPIA 4GCCA 1QDRA 1L29A 1L39A 1GE2A 1GF0A 2W1XA 3SN6R 1GFKA 3E3DA 1DYAA 4LDLA 1IP2A 1C45A 1L94A 1CX6A 3HBDA 1G1WA 4MR1A 1JIYA 2FYCA 4B4JA 1DYFA 1L66A 1LMCA 5KY1A 3W6BA 1L51A 1OUFA 5L9JA 1C7PA 1D6QA 1OVKA 3L2XA 4EKPA 4GRVA 4E97A 1UC0A 3TMUA 3QY4A 223LA 1L38A 3P66A 245LA 2Z18A 3RUNA 1B5VA 1HEOA 1UIDA 1L31A 1SX2A 3W6EA 1YKYX 1L71A 1LZ9A 1P3NA 2BLXA 1XJTA 2Z19A 5LINA 2F4AA 2AUBA 4HTKA 174LA 1F0WA 3WPLA 1HFZA 3DMVA 137LA 129LA 1JEFA 3C82A 4I7KA 1LSAA 4LT1A 1L09A 199LA 4GN3A 5KXWA 3EMSA 3GUJA 141LA 1G7IC 4LFXA 1LZNA 5FELA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WPJ A;  3CB7 A;  1GFA A;  1IWZ A;  1LKR A;  3AZ7 A;  5LYT A;  1OUE A;  2A7F A;  4OOO A;  2BQO A;  4LFP A;  4G4C A;  4NG8 A;  4B4E A;  132L A;  3N9C A;  1LSD A;  4GLA A;  1GBW A;  1YL1 X;  1FLQ A;  1LYY A;  1B2K A;  1XEK A;  3A3Q A;  4II8 A;  4PHI A;  4ET8 A;  4QY9 A;  1IC5 Y;  1YAM A;  1A4V A;  3EBA B;  1UIA A;  4HJY A;  4LYT A;  4TSC A;  4WO6 A;  1J1P Y;  1HFX A;  1LMQ A;  3WYH A;  4WLY A;  1FLU A;  2MEF A;  2BQA A;  4DD0 A;  3TMX A;  1D0L A;  3W6A A;  4YOP A;  2BQI A;  1T3P A;  1BB5 A;  4PJ2 C;  2CDS A;  1FBI X;  1LSB A;  1RFP A;  4HJV A;  3D9A C;  3M3U A;  1LJI A;  4NGW A;  4NWE A;  5DN5 A;  1LHI A;  5FDJ A;  1HML A;  4H9I A;  1IOR A;  5DM9 A;  208L A;  1UIB A;  4NSI A;  4OWB A;  1OUA A;  4H9B A;  1LJ3 A;  1WQR A;  2CWI A;  1GF8 A;  4OOT A;  2DQE Y;  1LSP A;  1IY4 A;  4UWV A;  1XGQ C;  154L A;  1CJ7 A;  4WO9 A;  5F9U A;  4WM5 A;  1IOC A;  2C8O A;  1O23 A;  3CQL A;  1GBY A;  1JKD A;  4TWS A;  4BS7 A;  1LSY A;  1D9U A;  2XTH A;  5IDD A;  3WH1 A;  4UWN A;  5LAG A;  1NDM C;  1HFY A;  3B0O A; 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 2ZIJ A;  1GE0 A;  1UIG A;  2W1Y A;  1EL1 A;  2BLY A;  2YBN A;  3GXR A;  4B49 A;  5HLL A;  1F6R A;  4H93 A;  4NY5 A;  2Z12 A;  3TXB A;  4N1C C;  3RZ4 A;  3ULR A;  5E4P A;  1GB9 A;  2HEB A;  2H5Z A;  4LYM A;  1SLY A;  1DQJ C;  5HNL A;  2H9J A;  1DZB X;  1LSF A;  5KJ9 A;  4N0J A;  1D0M A;  1REY A;  1UA6 Y;  2ZIL A;  1IIZ A;  4XJI A;  1GF3 A;  1WQQ A;  1LCN A;  1LSZ A;  5F14 A;  3P68 A;  1IC7 Y;  2ZYC A;  4MCK A;  2XJW A;  4G4B A;  1B7L A;  3AB6 A;  1VED A;  4ZIX A;  3WPK A;  1P2C C;  5I54 A;  5I5Q A;  5I53 A;  4IAS A;  1FKV A;  2MEB A;  3MGW A;  1GB0 A;  3AW7 A;  1LJJ A;  1LZR A;  4C5F A;  135L A;  1VDQ A;  4EMN A;  3TMV A;  5B06 A;  2MED A;  1G7M C;  1LAA A;  1LZD A;  2HTX A;  3B0K A;  3EXD A;  4H9F A;  3RW8 A;  1T6V L;  3LYZ A;  4ETA A;  5KKJ A;  1JIS A;  4M6D A;  1LSG A;  1IP4 A;  3A6B Y;  4HTQ A;  1JHL A;  1WQN A;  2DBT A;  4ET9 A;  2HEE A;  5D5C A;  3HBH A;  5HQ1 A;  2NWD X;  4NSJ A;  3J4G A;  2D4I A;  1LZ5 A;  1D0K A;  1FLY A;  2CGI A;  3KAM A;  1V7T A;  5B1F A;  1IWY A;  1GB6 A;  1GFJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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