1LZEA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRYWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzeA00
4ZEEA 1JKCA 1GF8A 1HEOA 2F4AA 1LTMA 4H90A 4NEBA 4CJ2A 4PJ2C 3A3QA 1GBZA 1YL0X 1LKRA 1WVVA 3TMWA 4B4EA 2BQFA 2MEBA 4XN6A 2D6BA 1GDXA 1F6SA 1QTKA 2LZ2A 4O34A 1BHZA 1IP1A 1WTNA 1LAAA 1RCMA 2BQLA 2H9KA 1LMAA 4H9FA 5EBHA 4HJZA 1C08C 1D6PA 5APEA 1IP2A 1QQYA 3EMSA 1FN5A 3WMKA 2F2NA 4G9SA 4IASA 2BQCA 4LFXA 1JJ1A 1LZEA 1TBYA 4QGZA 4DDAA 1GD6A 2ZILA 1GAYA 2FYDA 4NGYA 3SP3A 3A67Y 4NGJA 1NQIA 4WM3A 5KXXA 1UIGA 1J1XY 2EIZC 4CGEA 5II3A 1UBZA 1CKFA 1ZV5L 3WPKA 2MEAA 3E3DA 1Z55A 1B5VA 2RSCA 3G3BB 1WQOA 5KXYA 3GXRA 1GF4A 5D5CA 3A8ZA 2YBJA 5B1FA 2Z39A 4J7VA 1J1OY 1VEDA 4YEMA 1LYSA 4XJGA 4B1AA 4C5FA 4DT3A 2BQNA 1QIOA 3WXUA 5KXLA 1YAOA 4LFPA 1HEMA 2DQIY 1JJ0A 4NG8A 4NWHA 1I20A 1LYYA 1NBZC 4HJVA 4TUNA 5APDA 2ZQ4A 5LVIA 6LYZA 3WVXA 1DPXA 1FLWA 5HNLA 4OWHA 1LSGA 1TEWA 2C8PA 2DQJY 3WXTA 4E3UA 5B1GA 1JTTL 3A93A 5KXTA 1CKDA 1FLQA 3TXDA 2DQFC 4GN3A 134LA 1LJHA 1NDMC 1XGTC 1VDQA 1DQJC 2BPUA 1RJCB 1IIZA 3CT0A 4G4CA 2HECA 4WM2A 5F81A 1LZ9A 1KIQC 2D4IA 1B7NA 2XJWA 3A92A 1SLYA 1B5UA 1GBSA 4H9IA 1BWJA 1I56A 5I5QA 1CKHA 1LYZA 4EMNA 1KXXA 2ZNWY 2YVBA 1XSFA 3AGGG 4RLNA 1C7PA 4LYTA 1LSCA 2G4PA 3WL2A 1IR9A 3FE0A 5FDJA 1LKSA 4NSIA 4LT3A 1GE2A 3EBAB 5I53A 3W6AA 4FDYA 3QNGA 2BQOA 4OWAA 3AZ4A 1LMTA 3A6CY 5F16A 3TMVA 3RNXA 4WOAA 4XENA 1HHLA 2Z37A 4EOFA 4HSFA 4RLMA 3ZEKA 1FBIX 1OUCA 3LHMA 4XJIA 2BQHA 4CFOA 1OUGA 4ETAA 4YF2A 4A7DA 1GAZA 3P64A 1IWXA 2Z12A 3TMXA 1B7LA 1VDTA 3GXKA 4OWEA 4R0FA 4TSBA 5ILFA 1BVXA 5KKJA 1DZBX 1LJ3A 1BB7A 1JEFA 4DD1A 1OUDA 1DI5A 1LHKA 2YBIA 4LZTA 5ILCA 1YAQA 5B07A 4R6CA 154LA 3CT5A 1B7QA 5LYTA 1YROA 4CHXA 1B7PA 4NFVA 4WLDA 2BQMA 4WG1A 3AJNA 1GBYA 1OUJA 2G4QA 3HFMY 2BAAA 2HUBA 1GFTA 207LA 1IX0A 2MEDA 4J1AA 5E9RA 4OOOA 1YL1X 1LCNA 4LGKA 5L3IA 1GFVA 1WVUA 1UIBA 5LAFA 1GB9A 1C45A 4B4JA 3TXGA 3LZ2A 5HMVA 1HEWA 5FHWA 1XEIA 2MEFA 3LYTA 4YOPA 1GWDA 1JKAA 1GB0A 1IEEA 3QE8A 4WM4A 5LA8A 4G49A 4DC4A 4G4BA 4ANRA 1LHIA 1HELA 4Z46A 3BKVA 1LPIA 2DQHY 1GB2A 3B0OA 5KXNA 1YKYX 1HFXA 3RZ4A 1IVMA 1IP6A 1GFUA 1REMA 1LSFA 2LZTA 2BQKA 2ZQ3A 1JTOL 4GCFA 4MCKA 1J1PY 1LSZA 4DD0A 4C3WA 4ETEA 5L9JA 1HC0A 1HF4A 2EPEA 3B72A 4OOTA 5KXPA 3TXEA 132LA 4H8YA 3TXIA 193LA 2YDGA 4CFPA 1PZYA 4H9AA 1LZYA 1JSFA 1YAMA 1HMLA 1LZSA 3AZ7A 3WU7A 1GFGA 5J7CA 1HERA 2DQEY 1IOCA 3EO5A 1LZ8A 1GE1A 2LYMA 1GF5A 2IHLA 4H93A 4M4OA 3WYHA 1IC5Y 5F9UA 1C46A 1OUFA 5B06A 2BQGA 1BWHA 3LYZA 3TMUA 2D4JA 1NBYC 1LZCA 2ZYCA 5I4XA 1CJ7A 1UIDA 3ZVQA 1OUHA 4Z3MA 2XTHA 3K3TA 5A3EA 3W3EA 4XJDA 1UC0A 1LJIA 1XFPL 1B7OA 1NF5A 4DD9A 1JIYA 9LYZA 4GCBA 4WM5A 2ZWBA 4IATA 4WO6A 3B0KA 3ULRA 4NGOA 153LA 4UWNA 1GHLA 1IOSA 1KXWA 2EQLA 5C6LA 5KXWA 2W1YA 1B5YA 1B7SA 1A4VA 4L41A 1ZMYL 1HFZA 1HENA 5LVKA 4XYYA 1RE2A 2BQEA 1C43A 2XBSA 4GLAA 4RDSA 1LZDA 1LJ4A 3HBHA 1LOZA 2HEBA 5KXKA 2NWDX 4NHIA 1YILA 4H9BA 2YBLA 2Z38A 4AGAA 3P4ZA 4FJRA 4N1EI 4WLTA 1JKBA 5FEKA 1HEPA 2DBTA 4N0JA 1LSPA 1VATA 1GF6A 1BB6A 1LHLA 1WQQA 4YM8A 5L3HA 3IWRA 4NWEA 4BAPA 4GN4A 2BQJA 1B9OA 2A7DA 3J6KA 4GCDA 5APCA 1JHLA 3WW6A 3MGWA 1LSNA 1FDLY 4NHPA 1D9UA 5KXOA 4H92A 1FKQA 1LZTA 3W6DA 1LZ4A 1QSAA 2DQCY 2I25L 1XEKA 5KXZA 1JWRA 1LZ6A 1VDSA 3WPJA 1OUIA 1IY3A 1H6MA 5DL9A 1DKKA 2IFFY 208LA 1TDYA 1ALCA 4KXIA 3J4GA 4IJ4A 4NGZA 1AT6A 4OW1A 1KIRC 1JITA 3WU8A 3WUAA 4ZFPA 4MR1A 4ETBA 5KXRA 1B5ZA 3P68A 5I54A 1HFYA 1JPOA 2EKSC 2CWIA 2I26L 3IJVA 5LVHA 1VDPA 3OK0A 4B4IA 3VWOA 2H9JA 4NSJA 2YBNA 5E4PA 1DXJA 1GE4A 4QDNA 1LJEA 2BLYA 1KIPC 1CKGA 2YBMA 194LA 2MEGA 3AYQA 1XGUC 4WG7A 3A6BY 2C8OA 4Z41A 1IWTA 1ZVHL 4ML7A 4N9RA 1LZRA 4TSCA 5DLAA 5C6IA 4DDCA 2BQDA 3ATNA 1DI3A 1OUEA 4NGIA 1IOQA 1GPQC 2BLXA 2CGIA 2FBBA 3A34A 1F6RA 1AM7A 4NSGA 4ZIXA 1JSEA 1IOTA 1LSMA 1WQRA 4H9EA 1FLUA 3A3RX 5HMJA 5LVGA 4LYBA 1TCYA 1RI8B 1REXA 4UWVA 1LMCA 4WM1A 2ZYPA 1LSDA 3TXFA 1IWUA 4H94A 4MSTA 4YENA 5K7OA 1GEVA 1QUSA 2XBRA 1LHJA 1O23A 1IWYA 4ETCA 1IR8A 4WM6A 2Z2FA 1HEQA 1RFPA 1CJ8A 2BQIA 4U3XB 4XADA 4DD3A 1D0MA 1XEJA 4PRQA 1GB7A 4ETDA 1NWGA 1D0LA 4NGKA 2ZIJA 3AW7A 4QY9A 133LA 4W96A 1LSBA 4J1BA 4LYOA 5LINA 1INUA 3LZTA 4NIJA 4BAFA 1GFAA 4I8SA 1YKZX 5JENB 5DM9A 2DQGY 2F30A 2D4KA 4DD7A 1GDWA 1LZ5A 1IP5A 4ET8A 4D9ZA 1T6VL 2W1LA 1JTPL 2DKVA 1V7SA 2Z19A 4WL7A 3G3AB 4RW2A 2CJLA 5C6JA 3CSZA 4DDBA 2ZIKA 4WLYA 4WMGA 4M6DA 2I6ZA 1PS5A 1IWVA 5DN4A 4GLVA 1IORA 1VAUA 2HEDA 1JJ3A 1LZNA 4OWCA 5LYZA 1GXV2 1UIFA 4B0DA 1G7LC 1LHMA 1QDRA 1UACY 4XJFA 5KXSA 5T3FA 1KXYA 4NY5A 1BB5A 4B49A 3W6EA 3CT1A 1GB8A 1GF3A 3CB7A 2Q0MX 3LYOA 3RW8A 1HSWA 4BS7A 1IY4A 5LA5A 5KKIA 1GB5A 4Z98A 5FELA 1GBOA 3AW6A 3IJUA 1BGIA 1DPWA 1LHHA 1EQEA 1JKDA 1EQ5A 1WTMA 1REYA 4H9HA 1IC4Y 1DI4A 2HEEA 4RW1A 1CJ9A 3WH1A 1B5WA 1LSEA 4HTKA 5AMYA 5IELA 1IR7A 1W6ZA 2HTXA 3A95A 2D91A 4I0CA 1LJFA 1UIEA 1ZVYB 4HTNA 4NHQA 4J0LA 1GB6A 4W94A 5HQ1A 5APFA 3W6FA 4H8ZA 1GF7A 4HJYA 1P2CC 3M18B 2BQBA 2H5ZA 3A90A 1NMMA 1XGPC 3AZ6A 1DKJA 1LZAA 4WLXA 5I4WA 1A2YC 3HBEX 1TAYA 1LSAA 1F0WA 2YBHA 4LT1A 4DD2A 5LVJA 1BB4A 2CDSA 1FLYA 2HEAA 3TXHA 3AB6A 1UIHA 1YIKA 4X3BA 3TXJA 3T6UA 1LZBA 4NHTA 5FCPA 2W1MA 5FSTA 1B5XA 4HPEA 1B7RA 3BKHA 2DQDY 3TXBA 1HNLA 1EQ4A 4GCCA 5I4YA 1AT5A 3WU9A 1GE3A 5IDDA 1UA6Y 8LYZA 2HU1A 7LYZA 3KAMA 2FBDA 1LMOA 1GFKA 1LMNA 4N8ZA 1JUGA 1YQVY 3ATOA 4NGWA 1CJ6A 1WQMA 3LYMA 3AGIA 1UICA 2X0AA 1NKHA 2Z18A 4II8A 4UWUA 5B59A 4LT2A 2W1XA 2MEIA 1UIAA 1MELL 3CQLA 3AZ5A 3P66A 3WPLA 5M1YA 1T3PA 4PGJB 2LYZA 5HLLA 2GV0A 1AKIA 1YKXX 3WUMA 1C10A 2B5ZA 4H9CA 4WO9A 2DQAA 4H8XA 1W08A 3A91A 1LSYA 5HNCA 1GFHA 3TXKA 2HU3A 1XGRC 4GN5C 4HPIA 1AZFA 3EXDA 4NHSA 4YEOA 5A3ZA 1LMPA 3F6ZA 1D0KA 1BQLY 1QDTA 4G4HA 4LYZA 5LIOA 3ZVQB 1GFJA 5KXMA 4HP0A 1JISA 5DN5A 4GCEA 4OWBA 4NGVA 5KY1A 1VFBC 4H1PA 4HTQA 2G4NA 1F10A 3T36A 2Y8PA 1HSXA 1GFEA 3HBDA 3QY4A 3B0IA 1LJGA 1OP9B 1IWWA 4WL6A 2F4GA 5D5FA 1XGQC 2AUBA 2ZNXY 1EL1A 1BB3A 3OJPA 1I1ZA 4AXTA 2YSSC 1IC7Y 3FI7A 1CNSA 1GE0A 1SQ2L 1GBXA 3WUNA 1LMQA 4HV2A 1GB3A 1UCOA 4PPOA 1B7MA 5LAGA 3RT5X 5F14A 1OQMA 4P2EA 4N1CC 4PRUA 3RU5A 3B6LA 4BADA 3CSRA 1YANA 4ET9A 4N5RA 1D6QA 1G7IC 2BQAA 3N9EA 1E8LA 4PHIA 1GEZA 1NDGC 1IP3A 1G7MC 4KT3A 1GF0A 6LYTA 4HV1A 4TX7A 1GBWA 3AGHA 1OUAA 135LA 1WQNA 3D9AC 1YAPA 4KL7A 3N9CA 4NGLA 5F9XA 1N4FA 2HEFA 3CSQA 1WQPA 4LYCA 3M3UA 5IHGA 1B2KA 1GFRA 1LJKA 5B05A 4LT0A 1BWIA 1G7HC 1GXXA 4H91A 1IP7A 3LN2A 3A96A 2N5ZA 3WULA 1QSWA 4TTDA 3D3DA 1LYOA 4NSHA 1OUBA 1QTEA 1IWZA 2MECA 2MEEA 1H87A 1CKCA 1BVKC 1LZGA 4DWXA 1B0DA 4NG1A 2LYOA 1MLCE 1QUTA 3A94A 1REZA 2VB1A 1G7JC 1UUZC 4LYMA 3WW5A 4DYGA 3N9AA 1FKVA 2Z2EA 5LYMA 3WVYA 1IO5A 1GF9A 1V7TA 4XJBA 5KJ9A 3P65A 2A7FA 2FYCA 4TWSA 3W6BA 3W6CA 1LZ1A 2LHMA 2MEHA 1LJNA 4KPMA 4XJHA 5LXWA 1HMKA 2PC2A 1NHEA 1IP4A 2WARA 4QEQA 1LJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JKCA 1GF8A 1PQKA 4H90A 4PJ2C 1WVVA 3HTGA 1P37A 1F6SA 1QTKA 2LZ2A 1WTNA 2BQLA 192LA 1L34A 1P36A 4IASA 1LZEA 1G0MA 4DDAA 1GD6A 2ZILA 1NQIA 4CGEA 1J1XY 1P3NA 3WPKA 123LA 219LA 2MEAA 1B5VA 2HUMA 4W59A 2RBRA 1VEDA 247LA 2RB2X 170LA 1LYHA 1QIOA 1YAOA 4NG8A 4NWHA 2ZQ4A 5LVIA 6LYZA 3WVXA 4EKRA 4OWHA 2DQJY 223LA 1JTTL 3A93A 2O79A 5KXTA 1CKDA 1PQMA 103LA 3CT0A 4G4CA 2D4IA 1B7NA 1OV7A 1B5UA 1SLYA 1I56A 1QUHA 3C81A 3AGGG 1C7PA 1LSCA 2G4PA 5I53A 3W6AA 2OTZX 258LA 3A6CY 3TMVA 1QT7A 4XENA 1SX2A 159LA 1KW7A 1FBIX 4CFOA 4ETAA 3C8QA 4EJ4A 5KKJA 1VDTA 1LWGA 169LA 1L48A 1L43A 1LJ3A 1JEFA 249LA 3GUPA 4WLDA 1LWKA 3HT7A 2OU9A 2BAAA 1LPYA 1IX0A 5E9RA 1QTVA 1YL1X 1LCNA 4LGKA 2OEAX 5LAFA 4B4JA 1L64A 1JKAA 3QE8A 4ANRA 1LPIA 1GB2A 5KXNA 1HFXA 1REMA 2LZTA 1CV4A 4C3WA 4H8YA 2YDGA 4CFPA 1L10A 3WU7A 3HTDA 3EO5A 119LA 1LZ8A 2LYMA 2IHLA 1L50A 5F9UA 5B06A 1L82A 5I4XA 143LA 233LA 2XTHA 1NF5A 4DD9A 1C67A 153LA 1KXWA 1QT8A 205LA 2W1YA 1B5YA 1A4VA 1CUPA 1XJUA 1L16A 225LA 112LA 2BQEA 4GLAA 4RDSA 1LZDA 1LOZA 2HEBA 5KXKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ZEE A;  1JKC A;  1GF8 A;  1HEO A;  2F4A A;  1LTM A;  4H90 A;  4NEB A;  4CJ2 A;  4PJ2 C;  3A3Q A;  1GBZ A;  1YL0 X;  1LKR A;  1WVV A;  3TMW A;  4B4E A;  2BQF A;  2MEB A;  4XN6 A;  2D6B A;  1GDX A;  1F6S A;  1QTK A;  2LZ2 A;  4O34 A;  1BHZ A;  1IP1 A;  1WTN A;  1LAA A;  1RCM A;  2BQL A;  2H9K A;  1LMA A;  4H9F A;  5EBH A;  4HJZ A;  1C08 C;  1D6P A;  5APE A;  1IP2 A;  1QQY A;  3EMS A;  1FN5 A;  3WMK A;  2F2N A;  4G9S A;  4IAS A;  2BQC A;  4LFX A;  1JJ1 A;  1LZE A;  1TBY A;  4QGZ A;  4DDA A;  1GD6 A;  2ZIL A;  1GAY A;  2FYD A;  4NGY A;  3SP3 A;  3A67 Y;  4NGJ A;  1NQI A;  4WM3 A;  5KXX A;  1UIG A;  1J1X Y;  2EIZ C;  4CGE A;  5II3 A;  1UBZ A;  1CKF A;  1ZV5 L;  3WPK A;  2MEA A;  3E3D A;  1Z55 A;  1B5V A;  2RSC A;  3G3B B;  1WQO A;  5KXY A;  3GXR A;  1GF4 A;  5D5C A;  3A8Z A;  2YBJ A;  5B1F A;  2Z39 A;  4J7V A;  1J1O Y;  1VED A;  4YEM A;  1LYS A;  4XJG A;  4B1A A;  4C5F A;  4DT3 A;  2BQN A;  1QIO A;  3WXU A;  5KXL A;  1YAO A;  4LFP A;  1HEM A;  2DQI Y;  1JJ0 A;  4NG8 A;  4NWH A;  1I20 A;  1LYY A; 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 1LZB A;  4NHT A;  5FCP A;  2W1M A;  5FST A;  1B5X A;  4HPE A;  1B7R A;  3BKH A;  2DQD Y;  3TXB A;  1HNL A;  1EQ4 A;  4GCC A;  5I4Y A;  1AT5 A;  3WU9 A;  1GE3 A;  5IDD A;  1UA6 Y;  8LYZ A;  2HU1 A;  7LYZ A;  3KAM A;  2FBD A;  1LMO A;  1GFK A;  1LMN A;  4N8Z A;  1JUG A;  1YQV Y;  3ATO A;  4NGW A;  1CJ6 A;  1WQM A;  3LYM A;  3AGI A;  1UIC A;  2X0A A;  1NKH A;  2Z18 A;  4II8 A;  4UWU A;  5B59 A;  4LT2 A;  2W1X A;  2MEI A;  1UIA A;  1MEL L;  3CQL A;  3AZ5 A;  3P66 A;  3WPL A;  5M1Y A;  1T3P A;  4PGJ B;  2LYZ A;  5HLL A;  2GV0 A;  1AKI A;  1YKX X;  3WUM A;  1C10 A;  2B5Z A;  4H9C A;  4WO9 A;  2DQA A;  4H8X A;  1W08 A;  3A91 A;  1LSY A;  5HNC A;  1GFH A;  3TXK A;  2HU3 A;  1XGR C;  4GN5 C;  4HPI A;  1AZF A;  3EXD A;  4NHS A;  4YEO A;  5A3Z A;  1LMP A;  3F6Z A;  1D0K A;  1BQL Y;  1QDT A;  4G4H A;  4LYZ A;  5LIO A;  3ZVQ B;  1GFJ A;  5KXM A;  4HP0 A;  1JIS A;  5DN5 A;  4GCE A;  4OWB A;  4NGV A;  5KY1 A;  1VFB C;  4H1P A;  4HTQ A;  2G4N A;  1F10 A;  3T36 A;  2Y8P A;  1HSX A;  1GFE A;  3HBD A;  3QY4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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