1LZTA

Refinement of triclinic lysozyme
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Refinement of triclinic lysozyme: I. Fourier and least-squares methods.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 36
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1985-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lztA00
1QSAA 2ZYCA 1D0MA 1D6QA 4ET8A 1OUAA 4BS7A 2ZIJA 1J1PY 5T3FA 193LA 4HPEA 5KJ9A 1GE2A 1C7PA 1LZYA 3A34A 1YANA 3A92A 4GCEA 1B5VA 1BWIA 1C45A 4LT2A 1CJ6A 1OP9B 5C6IA 5M1YA 1FDLY 8LYZA 2HEAA 3J6KA 1FLQA 5APEA 1LSYA 1QDTA 1IWXA 1BB7A 4GN3A 1WTMA 3N9AA 1EQ5A 1LZ9A 1JTPL 4PRUA 1UIEA 4P2EA 2EIZC 4CJ2A 1GWDA 132LA 3AZ7A 1OUDA 1LZ1A 2BLYA 1HEOA 1QDRA 1XFPL 1IP2A 1IP1A 4AGAA 1LYZA 3CT1A 3WU7A 3W3EA 4OOTA 1LSZA 4G4HA 1GDWA 4NHQA 4NHPA 1IO5A 5KKJA 2ZQ4A 1LZAA 5KXYA 4M6DA 2BQHA 1HNLA 3WXUA 1YAOA 4GLVA 2ZYPA 5F14A 1EL1A 1LJ3A 2DQFC 1LSFA 3RW8A 5I54A 2BQDA 2ZIKA 5KXNA 2BPUA 1TEWA 1UA6Y 3ATOA 3J4GA 1XGQC 1QTEA 4CHXA 1IC4Y 1LMPA 1GBYA 3TXFA 4HV2A 1AKIA 1JKAA 2FBDA 3TXBA 3IWRA 1IWTA 4GN4A 1IWZA 4H9AA 3AGIA 4HP0A 4NSHA 5KXSA 1DQJC 1JKDA 3HBHA 3HBDA 1HSWA 1ALCA 1IOQA 1A2YC 1LZDA 2DQEY 4NHTA 4W94A 5F9UA 2ZNWY 1LZ8A 4AXTA 2DQGY 4WO6A 4GCCA 1TBYA 1XEJA 3B6LA 3EXDA 2HEEA 1HFZA 2IFFY 5LA8A 3ZEKA 1IIZA 4I0CA 3T6UA 1BGIA 1PZYA 1GBXA 1W6ZA 2YVBA 3EO5A 4H94A 4HPIA 4N0JA 1GFAA 4NGKA 4WM2A 1UIBA 3LHMA 1FKVA 5DN4A 3MGWA 2DQDY 3W6EA 154LA 1YKYX 1GB7A 1JISA 4NHIA 5FELA 4LFPA 3E3DA 4XJHA 4DYGA 4A7DA 2Z12A 1GBOA 1LSNA 1VDSA 5HMJA 4BAFA 4G4CA 3HFMY 1C43A 2BQOA 2F2NA 1JJ0A 3CSQA 4MCKA 4YENA 1IVMA 5DL9A 1REMA 4WM6A 5KXKA 1CKFA 1RJCB 1VATA 1OUFA 3TMUA 1AT6A 1B7MA 2EPEA 1QUSA 5LAFA 1REZA 5D5CA 1WQNA 1XGTC 3LZTA 3AGGG 1G7HC 3AYQA 2C8OA 3P65A 4ZFPA 4H9EA 1EQ4A 4LT3A 3WPKA 1YILA 1LSDA 4PGJB 1CNSA 1JKCA 1GF7A 1JUGA 2BQAA 3AB6A 1GB8A 4NIJA 4YF2A 2G4QA 5LXWA 4XJIA 1XGPC 4H9HA 4QDNA 1VDQA 1BHZA 4NGVA 1O23A 1RFPA 1LSCA 3RNXA 1W08A 5KXRA 1CJ7A 2D6BA 1GAZA 3A93A 1GFEA 1VDTA 1GBZA 1IOTA 3ZVQA 3LYZA 3M3UA 5I4XA 2EQLA 2CDSA 4XJGA 1V7SA 3F6ZA 4TUNA 4BADA 1UCOA 3AW6A 5DLAA 4N1CC 5F81A 4WL7A 1Z55A 3GXRA 1LCNA 1NF5A 4B49A 4RLNA 1DKJA 2A7DA 4WOAA 1CKDA 1B9OA 1GFKA 133LA 1I56A 1LMTA 1EQEA 4NWHA 4ZEEA 4ET9A 1D9UA 4U3XB 2Z37A 3WU9A 9LYZA 3D3DA 4B4EA 2YBJA 5JENB 3G3AB 1GE1A 1QUTA 1WTNA 4FDYA 4N8ZA 4BAPA 1KXYA 1VEDA 4G4BA 1YKXX 2HTXA 2LZTA 1VFBC 3CB7A 4GCDA 1GBSA 1KXWA 3W6BA 1WVUA 5L3HA 6LYZA 1NDGC 1GF6A 1IC5Y 4HJYA 3CT0A 5DN5A 5LINA 4RW2A 2DQCY 1LHHA 1TCYA 1LSEA 3TXIA 1GXXA 1LHMA 1J1XY 1IORA 5KXZA 4DD3A 1NHEA 2BQKA 4LYCA 2BQLA 4XN6A 1LZRA 1LHIA 2FYDA 1GHLA 5LVKA 1IWVA 2X0AA 2D4IA 5C6LA 1YAPA 2LYZA 2VB1A 1GF5A 1PS5A 5I4YA 1IEEA 4IATA 1UUZC 3A8ZA 4LZTA 1MLCE 1XEIA 3K3TA 207LA 1JTOL 5DM9A 4Z98A 5J7CA 1YL0X 5B05A 4N1EI 1DI3A 1HEMA 2DQAA 1IP7A 2BAAA 3P68A 1VAUA 2BQFA 3TMVA 4DDAA 1JSFA 3QE8A 4PPOA 1A4VA 4H8XA 2XTHA 1ZVYB 4XENA 2LZ2A 4J1BA 1H6MA 3AZ6A 4UWVA 1QTKA 4HV1A 5AMYA 2XJWA 1IR8A 1E8LA 1YIKA 5LA5A 2CJLA 3WH1A 5B1GA 1BB3A 194LA 4O34A 3VWOA 1LTMA 3FE0A 1B7QA 4NGLA 5IDDA 4KT3A 1T6VL 4DT3A 1OUJA 4G49A 1LMCA 1F6RA 3GXKA 4LYTA 3WPJA 1IX0A 1LYSA 1IWWA 2Q0MX 4WLYA 5APDA 4GLAA 1WVVA 4NG1A 4WM4A 3WULA 1NKHA 4NWEA 4RLMA 4EMNA 4I8SA 4PHIA 4C3WA 5KXTA 1UIAA 2F4GA 1HEWA 3A3QA 3LYTA 5F16A 2XBRA 1B7PA 1YAQA 2W1LA 4OWCA 1LZSA 4ETDA 4WM3A 2LHMA 1BVXA 4NSJA 4J1AA 5LVJA 1LSGA 1OQMA 4H90A 1CKCA 2BQGA 4YM8A 4R6CA 1NMMA 3LN2A 4H9BA 2BLXA 4WL6A 2MEGA 3CT5A 1HSXA 4H1PA 4MSTA 1B7OA 1YQVY 2W1XA 4DD0A 3B0KA 4YEOA 1B5UA 3WMKA 1BB6A 5ILCA 1UC0A 1WQPA 2YSSC 3G3BB 1GE0A 4NG8A 1B0DA 2H9KA 4QY9A 1BQLY 2YDGA 3TXHA 1IWUA 2IHLA 3RZ4A 5LIOA 3FI7A 5HQ1A 2F4AA 3CQLA 5LVGA 1GEVA 1GB3A 1BWHA 1SQ2L 3TMXA 1RE2A 5D5FA 3TXEA 1IP6A 1LKSA 1F10A 1XSFA 6LYTA 1GEZA 3A90A 4NGJA 4PRQA 3A91A 3WUMA 2I26L 2G4NA 3TXGA 1GB6A 2Z38A 5LYMA 3A96A 2ZWBA 3EMSA 1GF9A 1CJ9A 2YBHA 4ETCA 1G7JC 2W1YA 3W6DA 2BQMA 2Z2FA 3A3RX 2DKVA 4DD7A 2DBTA 4OWHA 5A3ZA 1REYA 2EKSC 5I4WA 1OUGA 1HHLA 1LMQA 4C5FA 1LHKA 4IJ4A 1LMNA 4ZIXA 1CKHA 1KIRC 1LSAA 2BQBA 3N9CA 3AZ4A 4LT1A 5KKIA 4DDCA 1JPOA 4CFOA 5B59A 2NWDX 135LA 1XGRC 4MR1A 4X3BA 4J7VA 2HEBA 4W96A 1BWJA 2MEHA 1FLYA 1JJ1A 1I20A 3M18B 4LT0A 3WXTA 2MEEA 2Y8PA 5FDJA 1UIFA 1P2CC 2YBIA 2XBSA 1LMAA 4Z41A 1BB5A 4RW1A 1IOCA 4B0DA 1HERA 1C10A 2WARA 4XADA 1TDYA 1NWGA 1JJ3A 4OWAA 1T3PA 1LMOA 4WM5A 1KXXA 1NQIA 1UIHA 1NBYC 2D4KA 1AT5A 1F0WA 1WQMA 4PJ2C 2Z2EA 4HTQA 4LYZA 5I5QA 1FLWA 2HEDA 2Z39A 4H9FA 3BKVA 3QNGA 1DKKA 4OOOA 1D6PA 3QY4A 1SLYA 1KIPC 2GV0A 4LGKA 1GE3A 2W1MA 1GF3A 2D91A 5L9JA 4TSCA 1CKGA 1JWRA 3WVYA 1C46A 3P4ZA 1LYYA 134LA 3EBAB 5APFA 1IP4A 5I53A 3OJPA 1B7LA 4NGZA 4QEQA 4XJDA 1WQQA 4NEBA 1AM7A 4ANRA 4EOFA 4TWSA 4WM1A 1G7MC 3AZ5A 4DC4A 4II8A 1NBZC 2MEBA 2DQIY 5FEKA 3WW5A 1G7LC 1OUIA 4NSIA 3WU8A 1GFUA 4CGEA 2FBBA 4HJVA 1ZMYL 1LJIA 3WUAA 4GCFA 1GFRA 3W6FA 4H92A 4DWXA 4H8YA 1UBZA 4GCBA 1AZFA 1LHJA 1RI8B 3ATNA 5IHGA 2HEFA 1IR9A 1GBWA 3IJVA 3WUNA 1IP5A 2A7FA 3RT5X 1HFXA 1GB5A 1IY3A 1UACY 3A67Y 5FHWA 1LSBA 1YROA 1QSWA 4R0FA 4TX7A 3D9AC 1FN5A 2HUBA 2LYOA 1GAYA 3A95A 5LVIA 1HF4A 3TXKA 5II3A 1NDMC 2YBMA 1LJGA 2Z18A 3N9EA 1B7SA 1HEPA 1LJFA 1XEKA 5EBHA 5FSTA 2YBLA 3T36A 3WYHA 4DD2A 1LZGA 4H9IA 3P64A 5L3IA 3CSRA 1YL1X 5HMVA 1LZTA 3B72A 1GD6A 1ZV5L 4HSFA 4OWBA 1KIQC 5C6JA 4WO9A 4ETBA 3ZVQB 3A94A 4J0LA 4DDBA 2MECA 4ETAA 1YAMA 4L41A 2FYCA 3BKHA 1GF0A 1IY4A 1HMLA 1LJJA 2DQJY 4WG1A 4WLXA 5IELA 1VDPA 4IASA 1DPXA 4NSGA 3RU5A 1JKBA 4N9RA 5E4PA 5B06A 2ZILA 5KXLA 1OUCA 1GFGA 1TAYA 4OWEA 3SP3A 1JSEA 2BQEA 1HFYA 4KPMA 1B5YA 3IJUA 1JITA 1DI5A 1BB4A 1FLUA 3AW7A 3WL2A 153LA 1H87A 1HC0A 4B4JA 4H91A 4HTNA 5KXXA 1LZ5A 3OK0A 5KXOA 2CWIA 3WW6A 4B4IA 3WPLA 1HELA 1MELL 2Z19A 2ZNXY 1B5ZA 2I6ZA 5LAGA 1LJ4A 4D9ZA 1IP3A 1LJHA 3B0IA 2AUBA 4WG7A 4XJFA 1FBIX 4NFVA 3ULRA 5A3EA 3TMWA 3P66A 4UWNA 5KXMA 1GB2A 1GF4A 1LZEA 2PC2A 4GN5C 3WVXA 1DZBX 5LYTA 4M4OA 1GXV2 1DI4A 2LYMA 1J1OY 4YEMA 1LAAA 2HECA 5HNCA 3B0OA 5K7OA 1B2KA 2HU3A 2MEAA 4RDSA 1LSMA 2BQCA 1LHLA 4N5RA 2C8PA 1GDXA 4CFPA 4NHSA 1DPWA 4ETEA 2HU1A 3A6BY 1IR7A 2H9JA 2MEIA 1LJKA 1JTTL 4KL7A 1QQYA 4YOPA 4LYOA 4NGWA 2CGIA 5KY1A 4FJRA 1GF8A 4E3UA 1JEFA 208LA 2BQJA 4Z3MA 5KXWA 1IC7Y 4H9CA 1UICA 1LOZA 4LYMA 5FCPA 4NGOA 1REXA 1V7TA 3AGHA 3CSZA 4LFXA 5ILFA 2N5ZA 1INUA 4H8ZA 2MEDA 1OUEA 1LZ4A 2F30A 2H5ZA 1C08C 1GFVA 1D0LA 3A6CY 4LYBA 4NGYA 4UWUA 1GB9A 4ML7A 1N4FA 1OUHA 5KXPA 3LYMA 1GFJA 1LJNA 1JHLA 1LJEA 1GPQC 1LYOA 1BVKC 4NY5A 1D0KA 4KXIA 2I25L 2BQNA 7LYZA 1LZBA 1WQOA 4H93A 4XYYA 1LKRA 1LZCA 1UIDA 4DD9A 2ZQ3A 4XJBA 1LZNA 5HLLA 4OW1A 4TTDA 1GB0A 3HBEX 1B5WA 1WQRA 1DXJA 1ZVHL 4HJZA 1B7NA 4DD1A 2RSCA 1OUBA 1F6SA 4B1AA 1IOSA 2G4PA 1RCMA 2YBNA 1HMKA 1HENA 1FKQA 1UIGA 4WLTA 3TXDA 3W6CA 1LPIA 3LYOA 4QGZA 5F9XA 4HTKA 3W6AA 5B07A 5LYZA 2BQIA 2B5ZA 4G9SA 1LSPA 1JIYA 1QIOA 1B5XA 1HEQA 1LZ6A 1GE4A 2D4JA 3KAMA 4Z46A 1YKZX 3AJNA 1I1ZA 1B7RA 1XGUC 5HNLA 1CJ8A 2MEFA 4TSBA 3TXJA 5APCA 1IWYA 1G7IC 1GFHA 1GFTA 4WLDA 5LVHA 5E9RA 5B1FA 2DQHY 3LZ2A 4NGIA 4WMGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QSAA 1D0MA 4ET8A 4BS7A 1GE2A 104LA 4LT2A 4ARQB 1FDLY 3J6KA 1LSYA 1IWXA 2OE9X 3D4SA 1EQ5A 3CDOA 1UIEA 4P2EA 4CJ2A 1LZ1A 2BLYA 1XFPL 1IP2A 3WU7A 1L25A 1GDWA 4NHPA 2ZQ4A 2BQHA 2ZYPA 1P36A 1EL1A 1LJ3A 5I54A 1UA6Y 2B75A 3ATOA 4CHXA 3HH6A 4HV2A 1DYAA 3IWRA 1IWTA 1IWZA 3AGIA 1DQJC 1LZDA 4W94A 1L58A 1LZ8A 1SX2A 1TBYA 2HEEA 1HFZA 1QT6A 3C7WA 1PZYA 2YVBA 4H94A 3LHMA 1FKVA 5DN4A 3MGWA 3W6EA 154LA 3CDRA 4XJHA 1LSNA 4BAFA 3HFMY 3CSQA 1REMA 1AT6A 1XGTC 2C8OA 3P65A 3AB6A 4W56A 1L82A 1RFPA 1W08A 1LI6A 2D6BA 3M3UA 5I4XA 1NHBA 4TUNA 1UCOA 3AW6A 211LA 1QT5A 1CX7A 4K5YA 3HU9A 242LA 1DKJA 249LA 4W59A 4NWHA 4OO9A 1L91A 2RB2X 5JENB 3G3AB 1GE1A 1QUTA 1EPYA 1VEDA 3VW7A 1NDGC 3CT0A 5DN5A 2DQCY 3TXIA 1LHMA 1J1XY 1IORA 3PBLA 1NHEA 4LYCA 1L31A 198LA 1L17A 5LVKA 5C6LA 2X0AA 2D4IA 1T97A 1PS5A 3A8ZA 4LZTA 1MLCE 1XEIA 5DM9A 4N1EI 1HEMA 1LGWA 2BAAA 170LA 3QE8A 1A4VA 4H8XA 4XENA 4J1BA 4UWVA 1QTKA 169LA 1IR8A 3F8VA 1L92A 5B1GA 2B6WA 4O34A 3VWOA 1TLAA 4KT3A 1C6HA 1OUJA 2OEAX 1IX0A 1L41A 1CV1A 2Q0MX 139LA 3WULA 1NKHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QSA A;  2ZYC A;  1D0M A;  1D6Q A;  4ET8 A;  1OUA A;  4BS7 A;  2ZIJ A;  1J1P Y;  5T3F A;  193L A;  4HPE A;  5KJ9 A;  1GE2 A;  1C7P A;  1LZY A;  3A34 A;  1YAN A;  3A92 A;  4GCE A;  1B5V A;  1BWI A;  1C45 A;  4LT2 A;  1CJ6 A;  1OP9 B;  5C6I A;  5M1Y A;  1FDL Y;  8LYZ A;  2HEA A;  3J6K A;  1FLQ A;  5APE A;  1LSY A;  1QDT A;  1IWX A;  1BB7 A;  4GN3 A;  1WTM A;  3N9A A;  1EQ5 A;  1LZ9 A;  1JTP L;  4PRU A;  1UIE A;  4P2E A;  2EIZ C;  4CJ2 A;  1GWD A;  132L A;  3AZ7 A;  1OUD A;  1LZ1 A;  2BLY A;  1HEO A;  1QDR A;  1XFP L;  1IP2 A;  1IP1 A;  4AGA A;  1LYZ A;  3CT1 A;  3WU7 A;  3W3E A;  4OOT A;  1LSZ A;  4G4H A;  1GDW A;  4NHQ A;  4NHP A;  1IO5 A;  5KKJ A;  2ZQ4 A;  1LZA A;  5KXY A;  4M6D A;  2BQH A;  1HNL A;  3WXU A;  1YAO A;  4GLV A;  2ZYP A;  5F14 A;  1EL1 A;  1LJ3 A;  2DQF C;  1LSF A;  3RW8 A;  5I54 A;  2BQD A;  2ZIK A;  5KXN A;  2BPU A;  1TEW A;  1UA6 Y;  3ATO A;  3J4G A;  1XGQ C;  1QTE A;  4CHX A;  1IC4 Y;  1LMP A;  1GBY A;  3TXF A;  4HV2 A;  1AKI A;  1JKA A;  2FBD A;  3TXB A;  3IWR A;  1IWT A; 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 2H9J A;  2MEI A;  1LJK A;  1JTT L;  4KL7 A;  1QQY A;  4YOP A;  4LYO A;  4NGW A;  2CGI A;  5KY1 A;  4FJR A;  1GF8 A;  4E3U A;  1JEF A;  208L A;  2BQJ A;  4Z3M A;  5KXW A;  1IC7 Y;  4H9C A;  1UIC A;  1LOZ A;  4LYM A;  5FCP A;  4NGO A;  1REX A;  1V7T A;  3AGH A;  3CSZ A;  4LFX A;  5ILF A;  2N5Z A;  1INU A;  4H8Z A;  2MED A;  1OUE A;  1LZ4 A;  2F30 A;  2H5Z A;  1C08 C;  1GFV A;  1D0L A;  3A6C Y;  4LYB A;  4NGY A;  4UWU A;  1GB9 A;  4ML7 A;  1N4F A;  1OUH A;  5KXP A;  3LYM A;  1GFJ A;  1LJN A;  1JHL A;  1LJE A;  1GPQ C;  1LYO A;  1BVK C;  4NY5 A;  1D0K A;  4KXI A;  2I25 L;  2BQN A;  7LYZ A;  1LZB A;  1WQO A;  4H93 A;  4XYY A;  1LKR A;  1LZC A;  1UID A;  4DD9 A;  2ZQ3 A;  4XJB A;  1LZN A;  5HLL A;  4OW1 A;  4TTD A;  1GB0 A;  3HBE X;  1B5W A;  1WQR A;  1DXJ A;  1ZVH L;  4HJZ A;  1B7N A;  4DD1 A;  2RSC A;  1OUB A;  1F6S A;  4B1A A;  1IOS A;  2G4P A;  1RCM A;  2YBN A;  1HMK A;  1HEN A;  1FKQ A;  1UIG A;  4WLT A;  3TXD A;  3W6C A;  1LPI A;  3LYO A;  4QGZ A;  5F9X A;  4HTK A;  3W6A A;  5B07 A;  5LYZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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