1LZYA

X-ray structure of turkey egg lysozyme complex with di-n-acetylchitobiose. recognition and binding of alpha-anomeric form
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
publication title X-ray structure of monoclinic turkey egg lysozyme at 1.3 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Meleagris gallopavo
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzyA00
3W3EA 1OUEA 1JTPL 5FCPA 1GBOA 1LMOA 1NBZC 2HEAA 1KXWA 2D91A 4KXIA 2YDGA 4B1AA 5DN4A 1GB0A 1IEEA 3RU5A 3W6BA 1JTOL 1FKVA 1IWUA 2MEBA 5HMVA 5C6JA 3P66A 2D4IA 4DD7A 1UCOA 2CDSA 2YSSC 4DC4A 5LA8A 5EBHA 4GCDA 4NIJA 3A3RX 3F6ZA 3A6CY 4H9EA 5K7OA 1LYOA 4H9HA 1GAZA 1H6MA 1HFZA 4HSFA 1G7HC 3HFMY 5LVGA 1KIQC 1IWWA 3LYTA 4MR1A 1BB5A 1GB5A 2IFFY 4WLXA 5DLAA 3TXIA 1GB7A 1JWRA 3BKHA 4LFXA 4DDCA 4NGJA 1LYYA 3A94A 2HEBA 1PZYA 2MEAA 1D9UA 5F81A 1IIZA 4TX7A 1BB3A 1LZ9A 1ZVHL 2YBIA 4J1AA 5DM9A 3P68A 4DDBA 1FLYA 1N4FA 4ZEEA 4HP0A 2BQNA 4XENA 4BAFA 1OUCA 1XSFA 3EXDA 4WG1A 5FSTA 5KXPA 1HF4A 3A92A 1G7MC 3CT0A 5I53A 5KJ9A 1XEKA 1EL1A 1Z55A 4BAPA 1B7NA 3CT1A 4WLYA 4LT0A 1REYA 4W94A 2HU3A 3G3AB 5KXWA 1B5XA 2CJLA 3MGWA 4WM4A 1WQNA 2BQJA 4I8SA 2WARA 1E8LA 1LZEA 3FI7A 1C10A 2Z37A 3AGGG 4WG7A 1B5VA 5LYTA 4KPMA 1PS5A 5KXXA 4HTNA 4ZFPA 1YQVY 1B0DA 1CJ6A 3IJUA 4DD9A 3WH1A 4DD0A 1HFYA 3N9CA 1LCNA 4OOTA 1T3PA 4LT2A 1QDRA 5APCA 1GE1A 3AB6A 5DN5A 4AGAA 1OUHA 4NHIA 2LZTA 3N9AA 5B06A 1GF8A 4WM5A 5KXZA 1JKAA 1REXA 3EMSA 1JJ3A 4J1BA 4LYBA 4NGIA 3AYQA 1D6PA 4YEOA 4GCFA 5LYZA 4CFPA 4Z46A 1G7LC 134LA 4GN5C 2XTHA 1YL0X 5J7CA 193LA 208LA 2ZYCA 4IASA 3P64A 1XGPC 3CSRA 1CKCA 1REMA 1UIEA 3LHMA 4NEBA 3TXKA 5I4YA 3LYMA 1LZ8A 4RW1A 1JKDA 2BLXA 2MEEA 1CJ9A 2DQHY 1GPQC 1IP6A 1LSGA 1XGRC 1B7OA 2I25L 4OW1A 1GB2A 1LHLA 5L9JA 1MLCE 1GB6A 2GV0A 3QE8A 3HBDA 1UACY 1UIGA 2FBBA 4I0CA 4L41A 3TMXA 5IELA 1XEIA 1LZDA 4C3WA 1BVKC 1IP3A 1JJ0A 1YIKA 4G4BA 1LZBA 3RT5X 5LYMA 1GB8A 5A3ZA 1UIHA 4PGJB 1C08C 3J4GA 1YANA 3EBAB 3WW5A 5JENB 4WM3A 3B0IA 2CGIA 4H91A 2ZILA 1NMMA 2I6ZA 1IY4A 4GLAA 3BKVA 3LZTA 1NF5A 1VDQA 3WL2A 3TMWA 4RDSA 2XBRA 1DI3A 4H9FA 5KKIA 1GD6A 1A2YC 1J1OY 1LZ4A 2BPUA 4N1EI 1ALCA 1LZAA 4UWNA 1LKRA 1QSWA 5LAFA 4NGWA 1LZRA 1CNSA 1F6SA 1UIBA 4PRUA 3QY4A 5F16A 1LSEA 4ETCA 4B4JA 1REZA 3A90A 1LJJA 4GN3A 5LAGA 4LYCA 4NSHA 1VAUA 2YBJA 3B0KA 3WUMA 1B5UA 4NY5A 4TWSA 1B2KA 1LMCA 1RFPA 1VATA 1WQMA 1B7RA 2F2NA 4GCCA 1CKHA 3W6FA 1SQ2L 4GN4A 4LT1A 1G7IC 4LT3A 1H87A 3TXEA 2BQIA 1GE4A 4XJBA 1BWHA 1LZGA 1B7PA 3N9EA 5A3EA 1B5ZA 1BB6A 1C46A 1NKHA 1XGTC 1FBIX 9LYZA 4CHXA 3VWOA 1IY3A 4HV2A 4ETEA 2BQDA 1B7LA 1BVXA 6LYZA 2I26L 1LHHA 3A6BY 1LZ1A 1OUIA 1ZVYB 1GE2A 5LIOA 3WUNA 4Z3MA 3W6AA 4OWEA 1B5YA 1AZFA 1YROA 1RCMA 1JPOA 1LAAA 2DQEY 4PPOA 2CWIA 3W6CA 5KY1A 1UBZA 1QIOA 4WM6A 1GFUA 1LJFA 2IHLA 3CT5A 1LSAA 1UUZC 1F6RA 3TXBA 1FDLY 3W6DA 1IR7A 1B7SA 1GF3A 1IX0A 2DQGY 4XJFA 5L3IA 1IC7Y 1HEPA 2G4QA 2Y8PA 2YBHA 4LYZA 4J7VA 1TDYA 2DKVA 1IOTA 4PHIA 3IWRA 1FKQA 1IR9A 2HU1A 4RLNA 1GBWA 4WL6A 1UA6Y 4NHSA 1TEWA 1AT5A 3WU9A 1HNLA 2DQFC 1IVMA 1JSEA 1IWXA 1D0KA 4OWBA 4X3BA 1JKBA 3LZ2A 5I5QA 1SLYA 3TXGA 5HNLA 2BQHA 2G4NA 3KAMA 1GF0A 1QQYA 3D3DA 4DYGA 1HMKA 3TXJA 1TAYA 2FBDA 1B7MA 1D0MA 4QY9A 4EMNA 1GE3A 4ML7A 4N9RA 1NWGA 1FLUA 4II8A 2C8OA 2ZIKA 1LPIA 4WO9A 3J6KA 4N5RA 5KXSA 1VFBC 1WQQA 4D9ZA 4NGOA 4YEMA 1D0LA 1VDPA 4GCEA 4DT3A 4XJDA 2ZQ3A 6LYTA 4XJGA 5LVHA 1MELL 5KXLA 1WQOA 1JEFA 1LSYA 1LZYA 1GFEA 2A7FA 3P65A 4H9CA 4DWXA 5I4XA 1D6QA 3RW8A 1OUJA 1LHJA 1LJNA 1LSCA 1UC0A 1V7SA 1OUBA 1W6ZA 2BQMA 1LSMA 3AZ7A 3EO5A 4HTKA 4UWVA 5LA5A 2LYOA 4H1PA 1DXJA 4H94A 1JHLA 5DL9A 1IWVA 1HENA 1HC0A 3WXUA 3K3TA 4BS7A 5D5CA 1LSPA 1LJ3A 4N8ZA 1IWTA 1UICA 3A93A 1HMLA 2BQEA 2DQJY 2Q0MX 4NFVA 4HTQA 3T36A 1I1ZA 1LZ6A 5II3A 4WLDA 1NDGC 1BB4A 5FELA 5LXWA 4B4IA 1GDWA 1UIAA 1YKZX 2C8PA 1LZCA 4H90A 5AMYA 1FLWA 3AZ6A 4XJIA 133LA 2ZIJA 3A3QA 3WUAA 1QUTA 4MCKA 1RJCB 3G3BB 3A8ZA 4QEQA 4NG1A 3WPKA 1GDXA 3AGHA 5LVKA 4UWUA 4M6DA 4WO6A 3HBHA 3ULRA 4HV1A 1XGQC 2F30A 4B49A 1ZMYL 2HEEA 4H8XA 1QSAA 1CJ8A 1DQJC 1LMPA 2H5ZA 4N0JA 3WPLA 3TMUA 1LSBA 4YF2A 5IHGA 1GBSA 1KIRC 1GFAA 2Z2EA 4G49A 4O34A 2W1XA 1KXXA 4H9AA 4G4HA 1LOZA 4WMGA 1IR8A 1EQ4A 5I4WA 1DI5A 1QTKA 4WOAA 1HEMA 2ZYPA 1HERA 1BQLY 1OP9B 4Z41A 3CB7A 1C7PA 1DPWA 4R6CA 4LZTA 4RLMA 2DQIY 1GF9A 1LSNA 5KXTA 2HECA 5FDJA 1BGIA 1HSWA 154LA 4R0FA 2BQGA 4E3UA 2DQCY 2BQCA 2LZ2A 2HUBA 2RSCA 1LZSA 5C6LA 1HEOA 4XN6A 1O23A 1JJ1A 4ETBA 1LZNA 2BQBA 3A95A 1GAYA 1LMQA 1GBXA 3B72A 2HTXA 1GF7A 1GF6A 4Z98A 1EQ5A 194LA 2YBNA 1YKYX 1KIPC 1YAQA 2DQDY 3HBEX 3TXFA 1XEJA 4CFOA 1EQEA 2MEDA 4OWCA 2ZNWY 5LVJA 1JSFA 1IC5Y 5E9RA 5LVIA 4NSJA 1I56A 1GXV2 1WTMA 1IOQA 1AKIA 2ZQ4A 5HMJA 2LYMA 1FLQA 2H9KA 1T6VL 3AJNA 2HEDA 1IOCA 2YVBA 1GFVA 2D4KA 3OJPA 3D9AC 3AGIA 3AZ5A 4ANRA 1JITA 1GFJA 2DQAA 1YKXX 4YOPA 5F9XA 4NGZA 1XGUC 1LJGA 1RI8B 4NWHA 1B7QA 1IC4Y 2MEHA 1GHLA 3M3UA 4J0LA 5B1GA 1LSDA 3WYHA 2HEFA 4NHTA 1GWDA 2ZNXY 1LZ5A 2Z2FA 135LA 2LHMA 4NGLA 3ZVQA 1NQIA 1B9OA 3TXHA 2W1YA 4ETAA 3ATNA 4HJYA 4PJ2C 4KT3A 3ZEKA 2BQKA 2Z19A 4NGVA 4RW2A 1LMTA 3B6LA 4QGZA 1YL1X 3GXRA 3WXTA 5KXKA 1I20A 5FHWA 4KL7A 5ILFA 4TSBA 1TCYA 2BAAA 4ET8A 1OUDA 2EIZC 1BWIA 2MEGA 5L3HA 1GF5A 1C45A 2DBTA 2N5ZA 3A67Y 3GXKA 4N1CC 1LJKA 1F0WA 5HQ1A 1DZBX 1YAOA 4TSCA 1LKSA 4XADA 1UIFA 1WTNA 4YM8A 2XJWA 4H93A 1GFTA 5APFA 1HEWA 4LFPA 1BB7A 2W1MA 1IWYA 4NGYA 4ZIXA 4WL7A 8LYZA 1GFGA 1LJIA 1XFPL 2EQLA 4LYMA 1IP2A 1RE2A 4DD2A 1C43A 1KXYA 1WQRA 1LMAA 1QUSA 2FYDA 3LYZA 1NHEA 1GFHA 7LYZA 2MEIA 4OWAA 1GBZA 1HEQA 1J1XY 3P4ZA 1LJEA 1VEDA 3WPJA 1IP5A 4ET9A 4H8YA 4XYYA 5E4PA 3A91A 5M1YA 5KXNA 1B5WA 1GXXA 1DI4A 1ZV5L 5LINA 2YBLA 1AM7A 1WQPA 3E3DA 5KXOA 1GEVA 3AW7A 4H9IA 1IP4A 5ILCA 3ATOA 3LN2A 3WMKA 4CGEA 1IORA 3T6UA 1GFRA 4H9BA 4DD1A 3CSQA 3AW6A 4TUNA 4FDYA 4B4EA 4LYOA 3FE0A 5HNCA 2H9JA 3CQLA 4CJ2A 1GB3A 2MECA 4GLVA 3WULA 5KXRA 1YAPA 1LHMA 1QTEA 3TXDA 1BHZA 2EPEA 1JISA 4OWHA 2BQFA 5APEA 2BQLA 4LGKA 1LSZA 1WVUA 4HPIA 2A7DA 1OQMA 1VDSA 1JKCA 4NG8A 5B07A 3WVYA 2Z12A 2AUBA 4QDNA 3A96A 1NDMC 2B5ZA 2BLYA 4MSTA 4WM2A 4NSGA 3QNGA 2NWDX 4TTDA 3W6EA 4IATA 2MEFA 2W1LA 5C6IA 4WM1A 5KXMA 4HPEA 1IP7A 1P2CC 4BADA 5FEKA 1OUGA 1LZTA 4IJ4A 1F10A 2ZWBA 2EKSC 1CKDA 1GEZA 5B1FA 4P2EA 1HFXA 4HJZA 3SP3A 1LTMA 153LA 4U3XB 1IWZA 3OK0A 4A7DA 3M18B 1J1PY 3LYOA 1CJ7A 5F14A 4WLTA 4XJHA 3WW6A 1AT6A 1QDTA 4B0DA 1G7JC 1LSFA 2F4GA 2Z18A 4YENA 4DDAA 4G9SA 1FN5A 2BQOA 1TBYA 2Z39A 1V7TA 4DD3A 1LJ4A 1BWJA 4H8ZA 1HHLA 1VDTA 3IJVA 5HLLA 2LYZA 1GBYA 1UIDA 5B05A 1LMNA 1GFKA 5APDA 1HELA 5B59A 2D6BA 4OOOA 4W96A 1WVVA 3WU8A 1GF4A 1LYZA 4GCBA 2PC2A 4NHPA 1DKKA 4NSIA 132LA 4H92A 1YAMA 2Z38A 4G4CA 2X0AA 4NGKA 3RNXA 1JIYA 5KKJA 4EOFA 1CKFA 1OUAA 5I54A 1GE0A 3RZ4A 4LYTA 4AXTA 1DKJA 3B0OA 1NBYC 1YILA 5KXYA 2G4PA 1LHKA 2XBSA 4C5FA 4NHQA 5F9UA 1IO5A 1HSXA 2BQAA 2D4JA 4NWEA 1A4VA 1LJHA 2FYCA 4FJRA 3A34A 4HJVA 1DPXA 4PRQA 5D5FA 5T3FA 1OUFA 1JUGA 2VB1A 3AZ4A 1INUA 1IP1A 207LA 5IDDA 3WVXA 3WU7A 4ETDA 4M4OA 3CSZA 2F4AA 3TMVA 1IOSA 1LHIA 1GB9A 1JTTL 1W08A 2YBMA 3ZVQB 1CKGA 1LYSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L58A 1L97A 126LA 2HEAA 4I7SA 3W6BA 1C60A 1IWUA 5HMVA 4DD7A 1UCOA 2YSSC 5LA8A 4GCDA 2NTHA 3A3RX 3F6ZA 3A6CY 1LYOA 1G7HC 1P36A 251LA 4MR1A 1GB5A 1L88A 4WLXA 3TXIA 1OYUA 1B6IA 1GB7A 3BKHA 3RZEA 1IIZA 1LZ9A 5DM9A 4J1AA 4DDBA 252LA 1DYCA 4WG1A 5FSTA 1HF4A 4BAPA 3CT1A 165LA 2BQJA 4I8SA 1L31A 5LYTA 1PS5A 1CJ6A 1T97A 4DD0A 4OOTA 3PBLA 5APCA 142LA 1QDRA 3AB6A 2L78A 1L41A 2B6XA 159LA 3HU9A 1CVKA 1L30A 4YEOA 1L93A 4GCFA 1G7LC 4GN5C 1YL0X 5J7CA 193LA 1XGPC 3CSRA 1CKCA 1REMA 3LHMA 1JKDA 2BLXA 2MEEA 1GPQC 2I25L 1LSGA 4OW1A 5IELA 4I0CA 1JJ0A 1YIKA 5LYMA 1SSYA 1GB8A 3EBAB 3B0IA 1OV7A 1NMMA 1NF5A 3WL2A 2F2QA 4RDSA 1LZ4A 1QTHA 4N1EI 1LZRA 1QSWA 1CNSA 4PRUA 4ETCA 1LSEA 4B4JA 1REZA 3CDOA 1VAUA 4TWSA 1B2KA 1RFPA 4GN4A 4XJBA 4E97A 1L98A 1QT5A 3VWOA 4HV2A 4DQJA 1G0LA 1ZVYB 1GE2A 3W6AA 1D3NA 1LAAA 2QARC 139LA 217LA 3W6CA 1UBZA 1UUZC 3TXBA 4ARQA 2YBHA 1L63A 1IOTA 1L37A 1TEWA 113LA 2A4TA 1JSEA 129LA 4OWBA 3TXGA 3C83A 4X3BA 3LZ2A 1JTMA 187LA 1L65A 4DYGA 1D0MA 1L79A 1GE3A 1FLUA 1L96A 248LA 4WO9A 3J6KA 4N5RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W3E A;  1OUE A;  1JTP L;  5FCP A;  1GBO A;  1LMO A;  1NBZ C;  2HEA A;  1KXW A;  2D91 A;  4KXI A;  2YDG A;  4B1A A;  5DN4 A;  1GB0 A;  1IEE A;  3RU5 A;  3W6B A;  1JTO L;  1FKV A;  1IWU A;  2MEB A;  5HMV A;  5C6J A;  3P66 A;  2D4I A;  4DD7 A;  1UCO A;  2CDS A;  2YSS C;  4DC4 A;  5LA8 A;  5EBH A;  4GCD A;  4NIJ A;  3A3R X;  3F6Z A;  3A6C Y;  4H9E A;  5K7O A;  1LYO A;  4H9H A;  1GAZ A;  1H6M A;  1HFZ A;  4HSF A;  1G7H C;  3HFM Y;  5LVG A;  1KIQ C;  1IWW A;  3LYT A;  4MR1 A;  1BB5 A;  1GB5 A;  2IFF Y;  4WLX A;  5DLA A;  3TXI A;  1GB7 A;  1JWR A;  3BKH A;  4LFX A;  4DDC A;  4NGJ A;  1LYY A;  3A94 A;  2HEB A;  1PZY A;  2MEA A;  1D9U A;  5F81 A;  1IIZ A;  4TX7 A;  1BB3 A;  1LZ9 A;  1ZVH L;  2YBI A;  4J1A A;  5DM9 A;  3P68 A;  4DDB A;  1FLY A;  1N4F A;  4ZEE A;  4HP0 A;  2BQN A;  4XEN A;  4BAF A;  1OUC A;  1XSF A;  3EXD A;  4WG1 A;  5FST A;  5KXP A;  1HF4 A;  3A92 A;  1G7M C;  3CT0 A;  5I53 A;  5KJ9 A;  1XEK A;  1EL1 A;  1Z55 A;  4BAP A;  1B7N A;  3CT1 A;  4WLY A;  4LT0 A;  1REY A;  4W94 A;  2HU3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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