1M2AA

Crystal structure at 1.5 angstroms resolution of the wild type thioredoxin-like [2fe-2s] ferredoxin from aquifex aeolicus
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AEFKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGCMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structures of the wild type and Cys-55-->Ser and Cys-59-->Ser variants of the thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
molecule keywords [2Fe-2S] ferredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
total genus 34
structure length 103
sequence length 103
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m2aA00
5GSSA 3ZIVA 1GSFA 5D73A 6GSUA 4K9ZA 2FA8A 3ME8A 4KSOA 4MZBA 5F8BA 3DKSA 1GP1A 4TR4A 1SJIA 1JZOA 3EMXA 1YKAA 4XS1A 2HE3A 1G7OA 4JRRA 4F0BA 2HSHA 2GS3A 2KHPA 2TIRA 2L4CA 4TR3A 2OE0A 4YQUA 5E4WA 5ECHB 2B5XA 5ECRB 3DMLA 2DC5A 1GTAA 5DQSA 1BG5A 5IMZA 3TCOA 6GSTA 3IXRA 1HNCA 2BMXA 4ZILA 3QFAC 3CSIA 4POBA 1MTCA 3QPMA 1PQNA 4MF5A 3EWLA 1GTUA 5KN2A 1XZOA 2I9HA 1E6BA 1BYEA 3MNGA 1B4QA 2HZEA 4IGJA 3UOMA 3J7Yk 1TRWA 4Q5QA 4EUYA 4OO5A 4MH3A 2HZEB 5G2ZA 2YN1A 18GSA 1AQWA 3LYPA 1XFLA 5ELAA 3HJOA 1SYRA 2YV7A 2VL2C 3UBLA 4EO3A 3Q74A 2PN8A 1X5DA 1GUKA 2C0GA 3E0UA 1XIYA 3QMXA 2H0IA 2O85A 3A2WA 2O87A 3VI5A 4MLYA 3D22A 3O3TA 3IAM2 2C3NA 2DSAA 2VD0A 4PQIA 3GYKA 3VWVA 1OE8A 2GQMA 1YF1A 2GSTA 3SWLA 1F3AA 4MH2A 5G5EA 1DSBA 3RPNA 3CTFA 1W89A 4MF7A 3HVVA 4PGTA 4XCSA 1N2AA 1Q4JA 3FZAA 5ECIB 3Q18A 3ZFBA 1WOUA 1EP8A 1PD21 3FR3A 3TKSE 5DALA 4E8EA 2ZNMA 4I5QA 1XPVA 1PMTA 5B7CA 1PGTA 3RHCA 3KTBA 1R5AA 5DALB 4WR4A 4MZWA 1EV4A 3GSTA 2H0GA 4JEDA 3ZTLA 2LV3A 1EOGA 4OFNA 1MD3A 2OE1A 1EGRA 1K0OA 2N5FA 4JBBA 4Q5RA 3MWHA 3IR4A 3I6AA 1OC3A 4ECIA 1T00A 1Z5YE 5J41A 1M99A 1ZYQB 1TRSA 2JSYA 2L59A 1X9SB 4EE0A 5JWQB 5ECKB 4TRXA 4IBPA 1V2AA 1NSWA 1Z7PA 3IE3A 4FYCA 3ZLPA 4Q5FA 1EOHA 2GQLA 2V1MA 1K0MA 1Z3EA 2F9SA 1GSEA 3G9BA 4IP1A 2J9HA 2EIRA 1X0RA 2WS2A 3ZMKA 2RM5A 14GSA 4OCEA 2MBSA 3KH7A 1MDIA 3TKRA 1V9WA 1M2DA 2GVPA 4PXOA 1XVQA 1HQOA 4IW9A 1Z6MA 4GTUA 4POLA 2RIIA 4PX1A 1U6TA 4I6XA 5AGYA 3QAWA 2IMEA 4GWRA 2AAWA 1NM3A 1FVJA 1B48A 2CV4A 5ECOB 1GULA 1X5EA 1GSYA 3F3RA 1Y25A 4JR6A 4GXZA 2V41A 4FIWA 4KNDA 2CVDA 1AUCA 1WWJA 1Z6NA 2WRTA 2KLXA 2GZZA 5ECLB 2KUCA 4X0XA 2IFQA 1XWAA 3D0ZA 1M9AA 3FEUA 1J0FA 5COHA 1AQXA 2IFQB 4WF5A 1DE2A 2PVQA 5D9XA 3FZ4A 1PA3A 2V6KA 3K8NA 2H1AA 1JLWA 4HU9A 1YQ1A 3QD9A 3H1NA 1T3BA 1K0BA 2FA4A 4KH7A 5IPHA 4NV2A 2GTUA 3APQA 2IWTA 4ML1A 1G6WA 2WZ9A 3ZIJA 5DCHA 2NDOA 2YCDA 2H1GA 1TKDB 2X8GA 2LRNA 2CVBA 3ME7A 4EDYA 1LU4A 5JCWA 4HEA2 4ZBDA 3TJBA 1KTEA 1A0RP 1GWCA 2KP1A 4G2EA 5EVOA 2RUEA 1I5GA 2VM1A 6GSYA 20GSA 1VF2A 2LSTA 1PX7A 5H5SA 4HS1A 3IDVA 5DJLA 3HY2A 1LJRA 2LJRA 3A2VA 2CAQA 5GZZB 1JLVA 5IMCA 3APOA 4K1FA 1DBYA 1K0NA 3D4MA 1JZDA 3S9FA 1BJXA 3V1WA 2VCWA 5IO2A 4Q5NA 2REMA 2BTOT 2ZUPA 3R2QA 2PGTA 1TXXA 3OR5A 2H6YA 2VLTA 3UVTA 3PH9A 5DCGA 5A4WA 4ULXA 3QAGA 4ZBAA 4ISDA 1T7PB 1G0TA 1ZL9A 1B4PA 2PUKC 4MJCA 3DYRA 3HXSA 3P90A 3CMIA 2VAFA 3TUEA 3CSHA 2YOIA 1ABAA 4GSTA 3GX0A 1EZKA 2GZYA 3L78A 2H8LA 4FYUA 4XRAA 1XWCA 4NV5A 4BA7A 4ECCA 3LGCA 2IIYA 4K0NA 4TXVA 2EIQA 4K8MA 3E3EA 5A4UA 4EKZA 5B8BA 3KIJA 1K0AA 1YDKA 2L6DA 3FY7A 3M1GA 2MBTA 3GSSA 3FR6A 2JL4A 4OO4A 3QOUA 4K6XA 4EVMA 2GSSA 2VCZA 2GZPA 4G10A 2H72A 5DVBA 3I69A 1TU7A 2GDRA 1K0DA 1X9WB 2AHEA 6GSVA 3LFLA 1VRSD 4ZL8A 2B7JA 2I3YA 3D21A 4N30A 3CRTA 2IN3A 5IPGA 4JE1A 1YEXA 4WBRD 2WGRA 5E59A 4E8HA 4KA0A 1T8EB 2WFCA 2GSRA 4IHUA 3IC4A 2H1DA 2ALBA 2X8HA 2C0DA 2B3SA 2YWIA 4BWSA 3QAVA 2WJUA 5ECQB 4HOJA 3GA4A 3F6FA 19GSA 1VF3A 4TKYA 3TKSA 3IOSA 4O7HA 2IL3A 2WDUA 2F51A 1CQHA 2DMMA 5G1LA 1R5PA 1GL8A 2B5EA 4IJIA 1IYHA 2GT5A 1AW9A 3WT2A 3APSA 3GTUA 4PURA 5D93A 3A3TA 3WT1A 4ECJA 3GNJA 2PBJA 2CX3A 3O76A 4MJEA 3GTUB 2CAIA 1WJKA 1R4WA 2D2ZA 1XWGA 3KP8A 2XBQA 4TOPA 3F6DA 4TXOA 2PU9C 4PQ1A 2VD1A 4F03A 1E2YA 4PNGA 3VPTA 4TXOB 1UA5A 4N11A 4KDUA 2VLVA 2OE3A 3RBTA 2N5AA 1Z9HA 4MJBA 3Q19A 2VL9A 3DVXA 4L5LA 4GLTA 5B8AA 1A23A 3UBKA 7GSSA 1OYJA 2FHEA 1T4YA 3A5WA 2OJLA 1THOA 1A0FA 4H86A 2A2SA 1R7HA 2DIYA 2C4JA 1ZOFA 3IHQA 1QQ2A 4HQZA 4IS0A 1SD9A 5F07A 1GNEA 2YNXA 3IRAA 4ZB9A 1XWKA 3EU3A 3H79A 4AJ7A 3QCPA 1J9BA 3GMFA 1KBNA 1QGVA 1MDKA 5G1KA 4NMUA 4V1Ap 3LORA 2GGTA 2X8CA 4ILFA 2LJKA 1OC8A 1DUGA 3CTGA 2CA8A 4YAPA 3KMOA 3PR8A 3QFBC 3ZRDA 3W6GA 4L0WA 5JCGA 3KMNA 1ZYEA 1X5CA 3F4RA 3VLNA 3WGXA 3DIEA 1B9XC 4KB3A 5D9VA 3TOTA 5D96A 2C3TA 2EC4A 4OCFA 4G19A 1K3LA 2A2RA 2DIZA 4MPFA 2YZHA 3KD0A 2VL2A 2NVLA 1GRXA 3GKNA 1G7EA 3HZ4A 1GSQA 2V32A 2V2GA 4NHZA 5ECNB 3TDGA 2OBIA 3HJPA 1M2BA 2OKAA 2VL3A 1KNGA 3QDNA 2VCTA 5ECMB 4EDZA 2WB9A 2H1BA 4PUFC 4ZL9A 3CYNA 1SK2A 2IPAA 5AN1A 1BAYA 2FY6A 2VOCA 4I2UA 1U88A 1WPIA 2WULA 1O85A 3KCMA 2CZ2A 1GLQA 2LQOA 1XBSA 4IVFA 1TJDA 3FYGA 1BQ7A 5J4UA 3F4SA 3ZVJA 4I8BA 4J57E 3LJRA 1S3DA 3CBUA 4HI7A 5LNKe 3ERWA 1JZWA 4CW9A 4DVCA 2LTKA 4XRDA 5CRWA 1SJZA 1SKWB 1MEKA 5IMDA 5IMAA 1PKWA 3BOAA 1FAAA 1ST9A 5HR1A 2P31A 3TJKA 4XHMA 1GUMA 1EWXA 4WXTA 9GSSA 1TP9A 1GUHA 3BCIA 3F63A 2FGXA 2OACA 4K7NA 2FWHA 2F8AA 4GSSA 3J7Yb 5JCUA 3ZREA 2Z9SA 3G7JA 3GFKA 5ECSA 1MDJA 1YKCA 2C0FA 2P5RA 5CP1A 2IMKA 4EF0A 3L9UA 2K8VA 3JCML 3GKKA 1ML6A 3DWVA 1ON4A 5G31A 2PVOC 3L0HA 2AB6A 3TB2A 1ERTA 1YJ6A 1GH2A 3GRXA 4P3YB 2HZFA 1U3IA 2MMAA 1EGOA 1GTBA 1TRUA 5H5RA 3RHBA 1HD2A 2LEGA 1QXHA 1TDIA 1RQMA 1V40A 3ZL5A 3HKRA 4TR0A 2E2GA 2DJKA 1X9MB 1NW2A 1A8YA 1F6MC 1GLPA 3GKMA 3VWUA 2F3MA 4ZL7A 1O8WA 1K0CA 4GF0A 5IOWA 4DSSA 3ERFA 4RQRA 2FWGA 3LWAA 1GSUA 1O73A 4AGSA 2YPMA 1BEDA 4L5OA 1UVZA 4N10A 4DSSB 5HQPA 2IJYA 1FG4A 4OFTA 2PMTA 1ZMAA 4FH8A 2FWFA 3HVXA 4YQVA 1OE7A 4KE3A 3IV4A 3GL5A 1SENA 4GSNA 5ABRA 3WD6A 1B8XA 2OA7A 5D8IA 3A2XA 1OC9A 3LXZA 3UIWA 4V2NA 3HJMA 5HFGA 2H19A 1OC9B 2XPEA 5C00A 3U6VA 1F2EA 4MJAA 3GKXA 5LD0A 3C1SA 2TRCP 3Q6OA 5G30A 4F0CA 2QSIA 2JZSA 2VIMA 3UARA 3F0IA 1JHBA 2M72A 2JACA 4LMVA 3L4NA 2DJJA 3VPQA 1FVKA 1GTIA 3VK9A 1GSSA 4AF2A 3LXTA 1F3BA 4WBJA 1AIUA 1M2AA 2G2QA 2C8UA 4JZQA 1MD4A 3FR9A 1PRXA 4HQSA 5ENUA 4D73A 3HDCA 2DBCA 3TOUA 4V2LA 2FCHA 2MZCA 4D73B 5F0GA 1ERWA 5IIZA 1FOVA 3VI7A 1A8LA 2VLUA 3BCKA 1AQVA 3E9JB 3BD2A 2RUFA 3IK9A 2C3QA 4MF6A 4GQFA 17GSA 3P7XA 5KN0A 3LYKA 5JWRB 1M0UA 3M3MA 4KUNA 4IELA 4GCIA 3D5JA 5AIVA 4NWYA 4NXIA 4V2MA 4LL1B 1XXUA 2LKUA 4L0UA 1SL0B 2DJ0A 2A4VA 2J23A 4EC0A 3ZFLA 3EYTA 3DVWA 1SL2B 4BWQA 4MK3A 1T4ZA 2R5GA 5DBQA 13GSA 1Y6EA 4MP4A 1VF1A 4QQ7A 4HDEA 4ECBA 3M0FA 3H4KA 4BL7A 16GSA 3WYWA 2H6ZA 2YWOA 2ON5A 3IA1A 4HZ2A 4L8EA 3CSJA 3PGTA 1QUWA 5CO3A 3DXBA 2DJ1A 4MABA 1CQGA 2VO4A 4MMMA 2PWJA 2AV4A 2DLXA 3UJ1A 3D6IA 3WGEA 1Z7RA 4HJ2A 1TRVA 4KDXA 2GSQA 4X43A 5L71A 2HXKA 4MDCA 4MPGA 3CXGA 3HVSA 1XWBA 2YZUA 5A5KA 5HR0A 5IMFA 2H71A 2X99A 1QFNA 4WF4A 5GAND 2B1LA 2FWEA 1V98A 4J2FA 4KCEA 2RLIA 3EVIA 4FYBA 3KZQA 5B6MA 1PL2A 4ZB6A 2I1UA 2PPTA 2LRTA 3GV1A 1V58A 5JWOB 2B7KA 2O8VB 5LCZA 1G6YA 2B6MA 4MCUA 1K3YA 5ELGA 3FZ5A 1HNBA 1J08A 1A2LA 4XS4A 1OKTA 2YWMA 5DQYA 1B9YC 3EC3A 1S3AA 4XS4B 4PQHA 4QL7A 3GH9A 4WETA 4FO5A 1VGLA 1XOBA 2KOKA 2ZCTA 2JADA 1JZRA 2JZRA 2H75A 3N5OA 2HSYA 2L4QA 2XBIA 1XW5A 2HRNA 2H6XA 3KTLA 3VWWA 5KN1A 3CRUA 3P8WA 4OFMA 3KXOA 1HYUA 2HLSA 4IKHA 2K8SA 4LA1A 1S3CA 4V1Ag 3C73A 3EMPA 4HU7A 3F3QA 2LRCA 2YJHA 3TRQA 1PL1A 3ZITA 3U5RE 1A24A 4CHSA 5DDLA 1TK8B 1FO5A 1M9BA 2GLRA 6GSWA 1TK0B 4RI7A 2DMLA 4RQXA 6GSSA 2AUVA 2YV9A 2AJQB 2G0FA 3HZ8A 1GNWA 2H74A 4K2DA 3UVHA 2HRFA 2AYTA 4BVYA 1O81A 5J9BA 2DJ2A 3D4TA 4AJ6A 4YAVA 2MMZA 5G5FA 2OADA 1SKSB 4TVEA 4XIHA 1HNAA 3UMAA 1OKDA 1SK1A 1WRYA 4EXJA 5CREA 3BJ5A 1NHYA 4G9HA 4HUAA 1YY7A 2C80A 1XW9A 2KP2A 1FB6A 2FUG2 3I9V2 2R4VA 2P0GA 2GT6A 3KEBA 1SD8A 1XW6A 2M80A 4POKA 3GHAA 4NAXA 5HFIA 1K3OA 4DSQA 1A2JA 1F9MA 1O8XA 1U3AA 3WGDA 2GQKA 4N0VA 4JU5A 4N0ZA 5INYA 2I81A 1QK8A 5F06A 4OWYA 1USBA 1RW1A 3F8UA 3HHVA 3W8SA 5CRHA 2QKEA 3NZNA 3VWXA 3G7IA 2H01A 1C72A 2CX4A 2R3XA 4CDOA 5CRGA 4OMVA 5F05A 4ACSA 3ERGA 3GH6A 1TK5B 1THXA 2TRXA 4AJ8A 3RDWA 3GX8A 2MYGA 5CRDA 2RM6A 5IQYA 4PUAA 2NPBA 1DE1A 1URMA 2L57A 5D9WA 1FW1A 1LBKA 2LQQA 5AISA 1O7UA 4DSRA 2CQ9A 2VCXA 3H93A 4NHWA 3O6TA 2IMFA 4RI6A 3TJJA 3M8NA 2O89A 2XHFA 2BJXA 4I2TA 4O92A 5IO0A 4ZXGA 2HT9A 2K9FA 2HI7A 4J56E 1T1VA 3I43A 1EEJA 4X1UA 1ZGNA 2OBKA 2HFDA 2YWNA 5EL8A 5C04A 4ZIJA 4KSMA 1M7TA 1OAZA 2MMOA 2H76A 5IMVA 1EP7A 1SU9A 3F4TA 3ZYWA 3TGZA 5KEJA 1H4OA 4GRFA 5IM9A 1SYXA 1I9DA 2VM2A 1A2MA 4QL9A 3DRNA 3VURA 5CAXA 4RUVA 2R37A 3ISOA 2CZ3A 1TTZA 3HA9A 3H8QA 4PNFA 1EEMA 5KN3A 1AAZA 2FNOA 2LS5A 4JR4A 4ML6A 2DJ3A 2ON7A 3W8JA 1TOFA 5CNWA 1O6JA 2FD3A 2YJ7A 3GUSA 5A4VA 4LLRA 2JSZA 2E2MA 3MAKA 1JFUA 3L9SA 4OD7A 4F2IA 1VF4A 3US3A 2JZTA 1V57A 2FLSA 1SL1B 1ZCPA 1ACVA 1PN9A 1YF0A 4KDYA 5ID2A 2E0QA 4XTSA 2B1KA 1FB0A 1FHEA 5ID2B 2E7PA 2JU5A 2NBSA 4Z7XA 5FT3A 3SBCA 1U87A 4KW6A 3EURA 3N9JA 1NHOA 1BX9A 3RAZA 5J9CA 3UAPA 3ED3A 4K7OA 3PINA 1TI1A 3KJYA 4POMA 1SKRB 2O7KA 2L6CA 2LUSA 1TU8A 3MDKA 1Q98A 1XVWA 1IYIA 3UL3A 3EINA 4YQMA 3IAS2 4ZBBA 3IK7A 1UC7A 2H73A 4EL1A 2MMNA 1SK0A 2M46A 2EIOA 5J5NA 5B6NA 3FKFA 3FW2A 2P5QA 2XPDA 2LNSA 3LEFA 3TRPA 3C7MA 3DEXA 2L5OA 4IN0A 3IPZA 4BVXA 1PX6A 5EY6A 2K18A 3QR6A 4BPYA 3ZZXA 2XC2A 2VUPA 2YP6A 4ID0A 3F9UA 1QMVA 3LG6A 3EE2A 4IQ1A 2IMDA 3GIXA 4WEYA 2NTOA 5AIXA 4O32A 1PKZA 2IMIA 1GSDA 3M9JA 2CT6A 4I97A 3HD5A 2VCQA 4TN8A 11GSA 1YEPA 3BBYA 4GQCA 4K7IA 4KCAA 3ZMLA 3G7YA 12GSA 2N5BA 4KGIA 3NIVA 1F37A 3KGKA 3AY8A 3TKQA 3KP9A 2C1YA 3GN3A 2H0HA 2ES7A 3FHKA 2R2JA 2C0EA 3FK8A 2LJAA 5DAKA 1AXDA 5GSTA 4F9ZA 3RPPA 3FZ9A 3TJGA 4KAEA 2HYXA 4WR5A 5DAKB 4HZ4A 4K0GA 8GSSA 2B5YA 1XCCA 2YANA 3IBHA 4WKWA 4HJMA 4ZB8A 2X64A 5FWGA 5HFKA 4YH2A 4MZCA 1W4VA 1AC1A 3TRXA 1TI3A 3KH9A 4DEJA 4TW5A 10GSA 4XS6A 3C1RA 1ILOA 4MA9A 5DJMA 3HCZA 3EU4A 4O5RA 3GL3A 2PERA 4TR1A 5ECPB 3TKPA 1EV9A 1WIKA 1PSQA 3P2AA 3VFIA 4TR1B 1SJ6A 2V6OA 4IJ3A 3FRCA 5J3RA 2LNTA 2QGVA 1ERUA 3TJFA 2CVKA 1N8JA 3KM6A 1UN2A 1WE0A 22GSA 3C8EA 1H75A 4LMWA 1WMJA 6GSXA 3TKSC 2H30A 5IOXA 1YZXA 3NOFA 1R26A 4F82A 2L5LA 4LL4B 3MSZA 3LQ7A 2H66A 5GAPD 2WCIA 1KEBA 3DGQA 3M9KA 5FHIA 4KX4A 4NPBA 3ZVJD 1ERVA 2R6KA 3C71A 3GURA 2VCVA 1RK4A 3LSZA 5HR3A 3L9VA 5D9TA 1OVNA 1ZZYA 5HR2A 2QC7A 5H5QA 1WP0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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