1M5DA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j-y702f) in complex with br-hibo at 1.73 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5dA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5dA01
3UA8A 1SBPA 4DXBA 4GRKA 1P99A 4LVQA 3H6TA 1ZJLA 4PE5B 1AOVA 3ZKKA 5DVFA 2H9BA 1B4ZA 2DVCA 2FA7A 1SQYA 4EQBA 1B2HA 3KEIA 1Y3QA 3A09A 3PV0E 1US4A 4QSDA 3MPLA 3B6QA 5AA1A 4IGRA 3K1MA 3O9PA 3W9VA 3OMBA 3HPIA 2RKMA 4O3BA 3GLBA 2QMWA 2VGQA 4KYEA 3IOWA 4GXSB 3IO4A 3W15C 2B65A 3SETA 1F9BA 5I57B 1UTHB 1R9LA 4OYVA 3KOSA 3ILUB 4U2RA 5L9MA 5KDTB 1SDXA 2F7AA 3C9HA 3A3CA 1JNFA 2VOZA 1DSNA 3FV1A 4YB6A 2R9JA 1JETA 1MM6A 3S9MC 3IOVA 4YB7A 3FXRA 5I84A 3EHUA 3T9XB 2H5YA 1JW4A 1R9QA 1LB9A 1Y4CA 2VD2A 4YB5A 3R7XA 2I3WA 4M4GA 3N5LA 1USYE 3KJTA 2I4CA 1BLFA 1MH4A 2Q9TA 3Q26A 2ZYKA 4DCXA 2Z8EA 2ZXTA 4L17A 1A8FA 1LFIA 4ZEDA 3PUZE 3MVYA 1SW1A 4F3BA 4MF3A 2BJJX 2Z8DA 3G3JA 4EXLA 4XIGQ 3G3IA 4ZEBA 2RF1A 3H6UA 1I6QA 1QW0A 2I0BA 2DP8A 5A5XA 4Q30B 3MPKA 4LONB 1URSA 4UACA 4JWYA 1FQDA 3C31A 3MW0A 4FEDA 5DVIA 3VVFA 2ZNTA 3VLVA 5EYFA 3HHGA 5ICQA 1DTZA 1FTJA 1B7HA 3EHSA 3KSXA 4OXVA 3KN7A 1EZPA 3RPWA 3RT8A 2P0SA 3IO6A 4F2OA 3CSBA 1N0TA 5FTHA 4F29A 1TT1A 1O63A 3IB1A 4RYAA 4NF5A 1OVTA 2F78A 3S9EA 1MG1A 4HS7A 3K6VA 4ZZAA 3SEUA 3FD3A 4FIMA 4R6KA 3KN3A 3ZSFA 4F22A 2THIA 2O7UA 1B1HA 1NH8A 2XXYA 4DZ1A 5JK4A 3K6WA 4BDMA 3K2DA 1IIWA 2I58A 5DT6A 2I6EA 3IJOB 3QXMA 1B3GA 3G3FA 1AH5A 5AA3A 2XX8A 1URGA 1SYIA 5CM6A 2XX7A 5L8DA 1JEVA 5EHSA 4F1YA 4GIZA 4IO5A 1B6HA 5ITPA 5I2KB 4RXLA 3TCFA 1QJMA 1XC1A 1MXWA 3CFZA 1M5CA 3PPRA 4FAJA 4RPNA 4ZS9A 1XS5A 1MPCA 3PPOA 1SVXB 3IX1A 4FORA 1TFAA 4JWXA 4AB6A 1B3HA 1ZTYA 4H6DA 4LZ5A 2ESNA 2YPNA 2GRVA 1IXCA 5KCJB 4XKPA 1ZBMA 2F36A 4ONYA 1B7UA 3ZS6A 5TP9B 3TCGA 3FVKA 3MP1A 3CRBA 1HSJA 1A8EA 1N3WA 3H03A 2F5XA 3T9UA 1H44A 1NMUA 4AB5A 2X7PA 3TODA 2O1MA 4NEDA 3FZVA 2DWHA 1OVBA 4I8CA 3FXQA 1Y3NA 2H98A 2PBWA 3VV5A 2D21A 1GVCA 4MLVA 5FTIA 3LSFB 3T93B 2ONKE 4UA8A 1D9VA 1IXIA 1JW1A 3C33A 1MY4A 1JEUA 4YMBA 3UIFA 3TZAA 1LAFE 2QRYA 4YKKA 3TAJA 5AE4A 1ZKBA 5B70A 2QS3A 3C36A 3VXBA 4JDFA 1Z7ME 2F7BA 2O1LA 3H06B 5AA4B 1MPDA 3PD9A 5IAIA 2QJEA 1N7XA 4GOTA 5FHMA 3OO6A 2M8CA 4QFLA 1MXYA 4XKRA 1PC3A 2I0CA 3FV2A 2A5SA 3TUSA 4THIA 1J1NA 2OCUA 3MJNA 1B46A 4EUOA 3U72A 1EZ9A 2Y7IA 2G93A 4H0WA 5DVJA 1M5FA 3RTFB 4DXCA 4EF2A 1A55A 4GL8A 4BDNA 2UVIA 3TELA 3T66A 3Q28A 4ZZEA 4R9FA 5CMCA 4NF8A 2Q89A 4HCWA 3IB0A 1RKMA 1EZOA 4ELRA 4DDDA 3GXAA 4OENA 3TDJA 2RC9A 1N3XA 3N6UA 3WAEA 4H67A 3CVGA 2X7QA 2F35A 1GV8A 3GBBA 3CG1A 4P0IA 4EQ7A 3ODBA 4P0GA 2ABHA 4IO4A 2GH9A 4ZE9A 2XXRA 3UORA 2B3BA 1B5IA 3K0VA 5I59B 2Y7PA 1BTJA 1UIVA 1SI0A 1MH3A 3RT6B 1N76A 5JTYB 1Q35A 2ZMBA 2F6PA 4HTGA 2F34A 3IOUA 3R6UA 4QRZA 1UTHA 3U92A 2QSXA 4QSEA 2DVZA 3MP8A 4GXAA 4ZEKA 1A54A 4OESA 3CFXA 2LAOA 1B0LA 5TPAB 2NUVA 2Q2CA 2XXPA 3UK4A 2Q88A 1ZLQA 1MQIA 3K1PA 5HPQA 3E3KA 2F7CA 1UTBB 4R72A 1I69A 4EQ9A 3IL1B 1Y3PA 4QFNA 1AL3A 3QUFA 1PDAA 2I3VA 5FHNA 3O2AA 3I6VA 1D9YA 4O3CA 3FXUA 4ELOA 3KJ7A 4NMYA 4E0XA 3EPEA 3KOTA 2DWJA 1US5A 4IO7A 4N6PA 4PQJA 4U1OA 4BDOA 5H8QB 1B52A 5H8NA 1O64A 2I49A 2V3TA 3C34A 1B7ZA 3THIA 4U1ZA 3W9WA 4K3FA 1GTKA 2NVUB 2F97A 4PFWA 4NF4B 2E1SA 1B40A 3OD7A 1B4HA 3RY3A 2AL5A 3FVOA 2AIXA 1YCJA 3M3LA 4F3GA 4OETA 1IQ7A 4KQPA 2DE4A 1OQGA 3TQLA 1QULA 4Q0CA 4DE8A 1Y20A 2Q8JA 3PU5A 1DPPA 1MXXA 1B58A 1USYH 2V3UA 3ILTB 2XHDA 1LAXA 1ATGA 2HEUA 3SEXA 3L6HA 2DXRA 2Y84A 4PP0A 1RYXA 4WEDA 3DP8A 3ONMA 3O29A 4OQOA 4X9TA 3C35A 4AQ4A 4EF1A 1POTA 4F3PA 3B6TA 3QK6A 1LLSA 3KZGA 4GFRA 4ELQA 5I2NA 4Q5TA 1B3EA 1MY2A 3RUMA 3N6TA 1S7YA 4F19A 4PFTA 2R71A 1MQHA 3TCHA 3RQTA 1MDP1 2XD3A 2IEEA 4LATA 4NF6A 3OO9A 2HZKA 4G68A 5I58A 3MBPA 3S9NC 1BIYA 2DXYA 3FUZA 1VSOA 2QPQA 4I62A 4QSCA 2OWTA 3USDA 2D5WA 3Q29A 4U23A 3IORA 3CI8A 5KCJA 1NNFA 2XXHA 1SI1A 1LFHA 2QS1A 3O66A 3OO7A 2RC8A 3TFLA 4RK2A 2W7YA 5BWJA 2GHBA 2Y7RA 1FTLA 5J1DA 4BLAA 3LUYA 4NE4A 4OMBA 3QIMA 1QKBA 3PUWE 1NNPA 4F3SA 3TKDA 2RC7A 2Q2AA 1JVXA 1B1XA 3CSGA 3LBSA 2HAVA 3SEYA 3TTNA 5I56A 4QHQA 4XXUA 2XXWA 4ZDMA 4NTLA 1B05A 1M5EA 4RNSA 4OZ9A 1VR5A 3FVGA 4OEUA 5HBCA 3OEKA 4H8JA 5ICTA 3SESA 1B9JA 1SW5A 5AA4A 1LCTA 5B7DA 4JBZA 3CG3A 3ECRA 3QUJA 3SEVA 1S50A 5A5XB 4KPTA 3BFUA 1LB8A 3UN6A 4H1XA 4G77A 3VVDA 1GGGA 4E0WA 2Z22A 1LBBA 2OBGA 3PPPA 5AA2D 1YTVA 4PETA 1UIUA 1MQDA 4H8IA 2H25A 3PGFA 4U22A 3IR1A 2ZYNA 4G8MA 4OEVA 1PB7A 5K2YA 2O6AA 4JXIA 2E0SA 4NF5B 3FATA 2O68A 3IAZA 1MY3A 2VP1A 5DEXA 5TU0A 1AIVA 3KN8A 2I4BA 4QF9A 1R1NA 4GF8A 1DTGA 1LBCA 3P7IA 5CRYA 4I9DA 5H8HA 4OHNA 4EXKA 4Q8RA 3TQWA 4MH5A 4H5GA 2UVGA 1MPBA 2QS2A 5AA2A 1IZ1A 4WEPA 4G8HA 4R6YA 3B7DA 5JTYA 3MP6A 2DE3A 5K2XA 2F6GA 4ISUA 3IK6B 3TYHA 2F8DA 3D4CA 1NH7A 3SERA 3LSLA 2R6GE 1I6AA 2FYIA 2XXVA 3O28A 4FE8A 4OERA 3MZBA 1P1OA 1B32A 3V5AA 2NWJA 1R6ZA 1XT8A 4FATA 3MC2A 3FJ7A 2Y7KA 1JVYA 1JW5A 4RPOA 3TMGA 1FCKA 4HW8A 3M8UA 1OLAA 2XXQA 4IGTA 4KCDA 2VD3A 2DOJA 4ZECA 3MQ9A 2V25A 3RNNA 3EHTA 2ZNUA 1Y1MA 5HM4B 3O6IA 2AL4A 1H45A 3D4GA 4LQ5A 2KLFA 3G3GA 1MXUA 1N04A 1PB9A 2ONRA 1QUIA 1IITA 4OFLA 5CMMA 3TTRA 1LAHE 1NL5A 4IO6A 4WKMA 3I5OA 3GZGA 3BBRA 3TTLA 4NWDA 2ZYOA 1EU8A 2O7IA 4G2ZA 3RN8A 2G29A 1HSLA 4F31B 4OVJA 1FQFA 4KCCA 4HCYA 3HHFA 2QL3A 5I57A 3CFLA 4ESWA 3FASA 3JYRA 3OXNA 2OJTA 5KDTA 4RA1A 1FTOA 2XXXA 4FJPA 4GVOA 1NNKA 1DMBA 2DSFA 1MXZA 3SEWA 1NFTA 3KSJA 4JSDA 3H4ZA 4ZEFA 4R2BA 1EH3A 3T96B 3PUXE 4C1TA 2ZYMA 4DIGA 4ZE8A 5LOMA 3VDFA 2HAUA 4F39A 3BKIB 4U21A 3V89B 4GL0A 4YKJA 5M2VA 4XKQA 2OK2A 1Y4TA 1WDNA 2UVHA 1P1QA 3T9HB 2ONSA 1MQGA 4RJZA 1O7TA 2UYFA 3AXFA 2HQ0A 3PD8A 4TLMB 3MZ9A 3OEMA 3OSRA 3RGYA 4ZEIA 1A99A 3R26A 1D4NA 1ANFA 4NF8B 2V84A 1UQWA 4QFOA 4GLIA 4Z0IA 2HFBA 4OTEA 4POXA 2Z23A 2PT2A 1IUDA 2HXWA 3MAMA 4X1BA 2RINA 4X1DA 2ANJA 5BUUA 2PX1A 3VVEA 2DS9A 1MY0A 3HN0A 2IA4A 2UXAA 4MLQA 3TPAA 4FECA 1P1UA 3H6VA 4YAHX 1PEBA 2A5TB 1H76A 1PB8A 3PMXA 1SW4A 1PBPA 1B3FA 4QFKA 3SKPA 3U1OA 5CMKA 1YAEA 3PPNA 3PUYE 4YU0A 1LCFA 1CB6A 3K00A 3DP6A 2HZLA 5DTBA 2WKYA 2XXTA 3O6HA 5H8FB 2V3QA 1LGBC 1POY1 1QUKA 3DELB 1ZU0A 2OWSA 1WVJA 3LSWA 3PUVE 1Y1ZA 3G3HA 3UGWA 2DE2A 3MZ1A 3HSTA 1L5TA 2ZNSA 4F1VA 3JV9A 3HCQA 1SYHA 4IO3A 2H99A 3F11A 3G7WA 1MQJA 2DQVA 1HSEA 4NWCA 5I2KA 5H8NB 3M3FA 1M5DA 1M5BA 4OWDA 5F1QA 3C4MA 4EDPA 2Y7WA 4R2FA 3FIRA 3O6GA 2QMXA 3JZJA 4JSOA 2PYYA 3O97A 1OIBA 3HO7A 5JEIA 3LSXA 2HCAA 1FQAA 3A3UA 3H6WA 2GFEA 4YICA 2REJA 5KZTA 1N84A 3VE1B 1RYOA 2XXIA 2CZLA 3KG2A 1URDA 4KFQA 3QYTA 4R75A 1FQCA 4GQOA 1FQEA 3DM0A 3PMVA 5TP9A 4G8NA 1MDQA 3VLUA 4KHZE 2D3IA 1MS7A 2NOOA 3K6UA 3KFMA 3T22A 1TXFA 2PT1A 3K1NA 4RK9A 1WODA 1NNTA 1JQFA 3QSLA 2H4IA 1MY1A 4R9GA 2OZZA 3KBRA 1LSTA 2UYEA 4XKNA 3EQ1A 1QUJA 1T0KA 3S2VA 1TWYA 2AYSA 2XX9A 1P1WA 2B3FA 1FW0A 3LR1A 1XHYA 1KWHA 5I2NB 1Q1KA 3E13X 1XVXA 2Z8FA 5L9SA 3PPQA 1ELJA 4X48A 4F2QA 4IY6A 4LUBA 3MVWA 2I48A 4LZ8A 1VFEA 4M1VA 4MBPA 4LP2B 3V8XB 4YKPA 4NF6B 1I6BA 1FTMA 1IXHA 3S9LC 1II5A 1MM7A 1PBQA 2FNCA 3VFJA 3U8QA 3V83A 3CIJA 4G68B 5I58B 1LFGA 3OELA 3K01A 1FQBA 3MUQA 3H3GA 2V93A 4KD5A 4LZ7A 1IXGA 1D3KA 2ALUA 4TOZA 4R74A 4I1DA 1DOTA 1TFDA 3IB2A 3DLNA 3E9XA 1SW2A 2NXOA 1H43A 3EN3A 4OFOA 4KR5A 5ELVA 1SD3A 1BKAA 1N7WA 1P1NA 3N94A 3QAXA 4Z7EA 1YPNA 3Q27A 4JB7A 5CBSA 3TTKA 2XD2A 4ESXA 2P1SA 4DXUA 3GBAA 4IO2A 3OENA 5CC2A 3PMWA 4KYSA 2O84X 3I3VA 3H7MA 4R73A 3RTWB 3FJMA 2O69A 4N13A 4IB2A 3M3KA 3FVNA 5I59A 5I56B 1OQHA 4G4PA 5CBRA 4LQ2A 4F1UA 3TEPA 3LC8A 4TLLB 2DWAA 4BDLA 5H8SA 2PVUA 2UVJA 4FEBA 1Z7NE 1MRPA 4IY5A 3DP4A 4G68C 4H65A 3RLFE 3K4UA 4ECFA 3HV1A 3UP9A 1ZIUA 1A40A 5L9OA 3MWBA 4O3AA 4GD5A 5TPAA 3TTMA 2PMSA 4ND9A 1QKAA 5EHMA 3U94A 3EF7A 1UTBA 4YKIA 3U93A 4XTCQ 3VLWA 1XVYA 3Q25A 4TQUQ 5ITOA 4JWOA 3WAFA 3G3KA 3IOTA 1AMFA 4POWA 1VE4A 3VXCA 1B51A 4H5FA 4YZZA 4P11A 3OSQA 4PFUA 5H8QA 4RY1A 5DEXB 3SDFA 5CI5A 4YMAA 1OMPA 1MXVA 4U4SA 3IJXB 3OO8A 1S9TA 3E4RA 4DCYA 4WXJA 3MVXA 5H8HB 4R6HA 3FJGA 4NF4A 1Y9UA 2X26A 4PFYA 4GWOA 4N07A 1VFDA 4F18A 2VHAA 1IEJA 3N26A 4DLDA 3L6GA 1QVSA 4U4XA 2OLBA 5AA2B 1ZMGA 1H3DA 1B3LA 2XXUA 1A7LA 2P2AA 3T9VA 4QFPA 2YJPA 1CE2A 1DPEA 3K02A 5DYHA 2A5TA 4C1UA 2CMOA 5F7VA 1LAGE 2DYXA 3S4UA 4MFIA 1B0HA 3MVZA 2GHAA 1NKXA 3CR9A 2RCAA 1OLCA 4KYDA 3BFTA 2O51A 3OOAA 1GR2A 2DWIA 5H8FA 3C32A 1B5HA 4LA9A 2QS4A 4BDQA 4C0RA 5IKBA 4KI0E 5FHOA 1FTKA 4BDRA 3K6XA 1XOCA 1B5JA 5ISUA 5CMBA 4ELPA 2YLNA 3B6WA 4OFJA 1BP5A 3KGCA 2REGA 2RCBA 3ZKLA 3FGSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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