1M5DA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j-y702f) in complex with br-hibo at 1.73 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5dA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5dA01
1Y9UA 4F31B 3E9XA 3RNNA 2CMOA 2GRVA 3MVYA 5H8NB 3Q25A 2HEUA 2REGA 2Q89A 5AA2B 3T9HB 3A3UA 2B3BA 1SI0A 2RF1A 3FGSA 3EN3A 1MPCA 2XXHA 4N6PA 2QS1A 4RK2A 2OWTA 3IOUA 4JWOA 1POTA 1QJMA 5KZTA 4JSOA 3RUMA 2XXIA 1CB6A 5AA2A 3C33A 3OD7A 3CR9A 3G7WA 4F3PA 3PMVA 3DP8A 1VSOA 4MBPA 3K01A 1II5A 4YKKA 4YU0A 1OQGA 3TCGA 3B7DA 1JW5A 1UIUA 2OJTA 3N6UA 3OEKA 3IK6B 1Z7NE 1FQFA 3UORA 3EF7A 3MC2A 3ILTB 2BJJX 4R73A 2ABHA 1MRPA 2H98A 4O3AA 3VLVA 3KN3A 1SDXA 4ZEIA 5H8QB 2D21A 3UK4A 1O63A 2HCAA 3MP6A 3OO9A 4IO7A 4Q8RA 4QHQA 4NF6A 4FEBA 4KCCA 4R6HA 2GHBA 2R6GE 2PT1A 5H8QA 3C9HA 1PB7A 1R6ZA 2P0SA 4N07A 1SW1A 2D3IA 3LC8A 2Y7PA 3LSLA 3O6HA 1QUKA 3T96B 3RN8A 2DP8A 4QSDA 1VE4A 2DS9A 1DSNA 2V84A 1B0HA 4XKQA 3TZAA 2ZYOA 3R6UA 4H1XA 5L9MA 4R2FA 2DVZA 5AA3A 5H8HB 4TQUQ 2Z8FA 2I4CA 2XHDA 3LR1A 3LUYA 1XVYA 4U1OA 4RYAA 3CFXA 2DXRA 1Q1KA 5CMMA 2Z8DA 4F3SA 1RYOA 1UTBB 1IXGA 3Q29A 2YJPA 1O64A 3FV2A 5I56B 5H8HA 1XVXA 3TPAA 1SBPA 2DVCA 4RJZA 4IB2A 3UIFA 4LONB 1UTBA 1GVCA 3ODBA 4NTLA 1B3EA 1H3DA 4ISUA 1H44A 4U4XA 3IB1A 3THIA 3KOSA 1LB8A 4IO3A 3BKIB 1I69A 4XIGQ 3FZVA 4DLDA 4F2QA 1GR2A 2OWSA 3PPNA 4ZEDA 4F2OA 3A09A 1FCKA 4OESA 4GD5A 1MXXA 1JEUA 4YB6A 3S9MC 4DCXA 1IITA 3TCFA 1B1XA 4EXKA 3PD9A 3CIJA 1B3FA 3KSJA 1B5HA 3WAEA 3QYTA 2A5TB 4IGRA 5KDTA 3G3KA 4U22A 5FTHA 4OMBA 3IJXB 5DVFA 1FQBA 5HPQA 1PDAA 5CMCA 3PMXA 3S2VA 4PFYA 1MQJA 4G4PA 5L8DA 1AOVA 2E0SA 4FATA 3ONMA 4EF2A 1FTMA 1B58A 3O6GA 2DOJA 2ESNA 1DTZA 1S9TA 3HHFA 4LATA 1Y4CA 3HO7A 4H6DA 3BBRA 1IQ7A 4NF5B 3OSQA 5JK4A 1D9VA 4IY5A 1H45A 4GRKA 3FJGA 3RLFE 1LBBA 4YMAA 1O7TA 4MLVA 1B9JA 3VV5A 3U94A 3TTNA 2QMWA 4I9DA 4ZEKA 3FD3A 3TTLA 1US4A 3VVFA 2X26A 3VXBA 4U23A 3L6GA 1UTHB 5AA1A 1US5A 3VLWA 1NMUA 4XXUA 5K2YA 5CMBA 1TT1A 4R74A 4LQ5A 2H4IA 1MXUA 4QSEA 1UTHA 4Q0CA 3O6IA 4DDDA 4BDOA 4FAJA 1LAXA 1A54A 3EHTA 1N04A 1DPPA 1AMFA 3H03A 3K02A 3FATA 1JEVA 1AH5A 2F7AA 4K3FA 5ITPA 2HAUA 3TFLA 2DSFA 1UIVA 3CRBA 3IOTA 4OETA 5H8SA 3T9XB 3V5AA 1POY1 2DWHA 4AB6A 2PBWA 2Q8JA 3HN0A 1B5JA 1N7XA 5TPAB 3PU5A 2O68A 4ZECA 1OVTA 3RQTA 2AL5A 2H5YA 1MS7A 3V83A 1B7ZA 2F8DA 2YPNA 2YLNA 5I57A 2UVIA 4Q5TA 5FHNA 1I6AA 4BLAA 1JNFA 3FVKA 4KI0E 4NEDA 2F6PA 2DXYA 3DELB 2ZXTA 1PB8A 2NXOA 3UGWA 4DCYA 1Y1ZA 4GFRA 2Z22A 4KYSA 4TLMB 1QULA 2ZYNA 4NF8B 2M8CA 2DYXA 3GZGA 2O1LA 3FVNA 2F36A 3I3VA 2I49A 3UP9A 3I6VA 1EZPA 5I58A 2GFEA 3KJTA 3PMWA 4F22A 1B5IA 3SEXA 1LGBC 3PD8A 1MQGA 5I2NB 4GL0A 4OVJA 2PVUA 5LOMA 1OVBA 3GXAA 4QFKA 3FIRA 5I2NA 2VHAA 2NVUB 1MXYA 2ONKE 4R75A 1QVSA 2GH9A 1QUJA 4X1BA 5IKBA 4HW8A 4X9TA 4PETA 2XXXA 2UVHA 3OEMA 5CMKA 4P0GA 5HBCA 2KLFA 4KR5A 1B46A 4UA8A 3N26A 3N5LA 3IO4A 4ND9A 3EHUA 3M8UA 2DE3A 2DWIA 3FASA 4FORA 1R1NA 2FNCA 1USYH 3KSXA 4GF8A 2ZNSA 4KQPA 4RK9A 2QSXA 4E0WA 1B0LA 1N7WA 1NH8A 1ZTYA 2HXWA 3EHSA 3IAZA 3PPQA 4OFJA 3O66A 2XXVA 4EQ7A 5FHOA 4BDNA 4WEDA 1YTVA 4Z7EA 4F1VA 4YMBA 5ICTA 3KBRA 4PE5B 3FJ7A 4GQOA 1Y3NA 4AB5A 4DXCA 4O3CA 4BDQA 4KD5A 1TXFA 5FTIA 4YICA 1B6HA 1MXVA 3CI8A 4PFTA 3DM0A 4PFUA 5H8NA 5JEIA 2H9BA 3H4ZA 3D4GA 4U2RA 3V89B 2XX8A 3IX1A 2B3FA 4JBZA 3JV9A 3KN8A 2DE4A 2DWAA 3FV1A 2VD3A 5IAIA 4QFLA 2X7PA 4G2ZA 1MH3A 3O29A 2B65A 1MPBA 1WDNA 4BDLA 1WVJA 3VXCA 1EH3A 4ELQA 3VLUA 1D4NA 2OCUA 4TOZA 4GWOA 1Z7ME 4ESXA 3T66A 2OLBA 1SD3A 2XD2A 3CG3A 2UYFA 5BUUA 3CG1A 3F11A 3JZJA 3HHGA 1ELJA 1MG1A 2ANJA 3JYRA 4GXSB 2NWJA 3H3GA 2ZNTA 3U93A 1BLFA 3TQLA 4FE8A 3SESA 3B6WA 1FQCA 1ZIUA 2IA4A 5I84A 4H5GA 4UACA 5ISUA 4KYEA 1B7UA 1LFGA 3TELA 3K1PA 1PC3A 3U72A 3K4UA 5EHSA 1N3XA 3S9NC 3B6QA 4M4GA 2AYSA 4ZDMA 3N6TA 2HAVA 2F97A 3K6VA 4N13A 4QFPA 3BFTA 2ZYKA 1H43A 1JW4A 5AA4B 4C0RA 4OFOA 2O84X 3DP4A 3FXRA 5I56A 2HQ0A 3S9EA 4YKIA 3FVGA 3CFZA 4HS7A 1MQHA 3UA8A 4YZZA 4RPOA 3U8QA 4QRZA 3TUSA 1WODA 1SQYA 1JQFA 3O28A 1S50A 4OZ9A 2DQVA 4G77A 4ELPA 3HPIA 1OIBA 4YB5A 2QS4A 3Q27A 4PQJA 4F29A 3W9VA 3H6UA 5F1QA 4YB7A 1HSJA 4R6YA 3KZGA 4H8IA 3RTFB 1IXCA 5DVIA 3KG2A 4NWDA 3EPEA 1ANFA 5KCJB 2A5TA 2X7QA 1HSLA 4U1ZA 3MW0A 4P0IA 1Y4TA 3C32A 4MLQA 3TEPA 4G8NA 5F7VA 5KCJA 2H25A 4IO2A 1LAGE 3OSRA 1B4ZA 2O1MA 4QSCA 3PUWE 3PV0E 4H5FA 4H65A 4ELRA 5ICQA 2ONRA 4X48A 1D3KA 1LBCA 3KEIA 4ECFA 3M3LA 4F18A 1IZ1A 2P2AA 3S9LC 4EDPA 4NF5A 3IB0A 4FIMA 4JWXA 2I3WA 1MM6A 1TFAA 5B7DA 1NNKA 4LUBA 3CSGA 1URSA 1F9BA 4RXLA 3R26A 4ONYA 2VGQA 3H7MA 5CRYA 4LZ8A 1B3GA 1JW1A 3DP6A 3KN7A 3QUJA 1JVXA 2P1SA 1LCFA 3H6WA 4HCYA 3SETA 1AIVA 3Q26A 2PYYA 1M5FA 4LVQA 2O69A 2I0BA 4IO4A 4KYDA 2NUVA 2CZLA 5DVJA 3IOWA 3QK6A 3K1MA 3KFMA 2FA7A 1N76A 1RKMA 4PP0A 3O9PA 3C31A 1IXHA 2XXYA 3T22A 1VFEA 3SEYA 3QUFA 2Y84A 4JWYA 4R9GA 1GGGA 3K6XA 1N84A 3VFJA 3SEVA 3SEUA 4YKJA 2ALUA 5DEXB 3VE1B 1JETA 5TPAA 1B4HA 3H6TA 4IO5A 4FEDA 3MJNA 3K6UA 3D4CA 4RY1A 3RTWB 3O2AA 2D5WA 3C4MA 4LQ2A 4QFNA 3TKDA 2Q88A 2F5XA 3K0VA 4EXLA 2VP1A 4R6KA 2O7IA 3G3FA 3PPOA 1LAFE 4NF4B 1B1HA 3H6VA 3CVGA 5FHMA 3TQWA 2F35A 1ATGA 3MPLA 3TTKA 5TU0A 1M5EA 3N94A 4M1VA 4NF4A 3A3CA 1BTJA 2RINA 1ZLQA 4DXUA 3GLBA 3FJMA 4G68B 4MH5A 1FTKA 4NF8A 3P7IA 4OXVA 4JXIA 2Z8EA 1B3HA 3B6TA 1PBQA 2QJEA 4G68A 4R9FA 1IIWA 5B70A 2UVGA 1AL3A 3QSLA 3IJOB 4ZEFA 3BFUA 2V3UA 4H67A 3T9VA 2Y7IA 3CFLA 4F1UA 4WEPA 2G29A 4H0WA 1P1WA 4BDRA 2O7UA 1S7YA 1J1NA 1P1OA 1Y1MA 1OLAA 1FTOA 1L5TA 3GBBA 1QKAA 2I48A 2THIA 5M2VA 1MQDA 3QIMA 1HSEA 2PT2A 3H06B 2Y7WA 3T9UA 4LZ7A 4R2BA 2XXTA 4G8MA 2ZNUA 4MFIA 4TLLB 4O3BA 1XHYA 3G3JA 1JVYA 1MY4A 1I6BA 4DZ1A 5DYHA 3C34A 3MPKA 3Q28A 1A55A 4E0XA 1BIYA 4GOTA 1NNTA 3TTRA 4LP2B 2QS3A 4MF3A 4OFLA 3K6WA 1Y20A 4GXAA 1NFTA 3MP1A 2QRYA 1D9YA 4XTCQ 2HZLA 3T93B 4C1UA 2I6EA 3PUVE 2REJA 4RNSA 4ZE8A 4OYVA 3LSWA 2R71A 1XC1A 4G8HA 4ZE9A 4Z0IA 3OMBA 5DT6A 3U1OA 5HM4B 2R9JA 4PFWA 1YCJA 4R72A 2Z23A 4ZS9A 3OO7A 3QXMA 5TP9B 1BKAA 3L6HA 2LAOA 3MVWA 1SVXB 3E13X 1DOTA 4XKPA 2Q2AA 2HZKA 4F39A 1M5DA 3RY3A 1FW0A 5TP9A 5DTBA 5A5XB 4U21A 2DE2A 4HTGA 3LBSA 3USDA 4L17A 3LSXA 4KCDA 3ZS6A 5A5XA 1YPNA 1EZOA 4NF6B 1SW2A 3R7XA 2RC7A 5AA2D 1B2HA 2F78A 2Q9TA 2I58A 1LFHA 4U4SA 3SERA 1IEJA 1P99A 5I2KB 2V25A 4POWA 4EQ9A 1ZMGA 1SI1A 4KHZE 3ILUB 1QUIA 2WKYA 3MQ9A 5I2KA 3C35A 4QF9A 1NKXA 3IR1A 3ZSFA 2ZYMA 1URGA 1LFIA 1B3LA 3RPWA 2RCAA 5BWJA 2V3TA 1MY1A 2QS2A 5EHMA 5K2XA 2XX9A 1LSTA 4NWCA 3MZ9A 3PUXE 5AA4A 2QPQA 3MAMA 4FJPA 4GIZA 1MDP1 3TTMA 1I6QA 3MUQA 3K1NA 4QFOA 3FXQA 1FQAA 4EF1A 1PEBA 1QW0A 4ZZAA 1MXZA 5ITOA 3ZKKA 2XXPA 4RPNA 1EZ9A 2XXRA 1UQWA 2A5SA 3E4RA 4ZEBA 1EU8A 3ECRA 1ZU0A 1FTLA 4G68C 3O97A 3RT6B 3TODA 3KGCA 2OBGA 1PBPA 1MDQA 2V3QA 3IL1B 3ZKLA 1B32A 3K2DA 1Y3PA 2HFBA 5KDTB 1LLSA 4I1DA 1Y3QA 3I5OA 2PMSA 4EQBA 4F19A 1R9LA 4OENA 3M3FA 1XS5A 4XKRA 1NNFA 1A8EA 1LCTA 3MVZA 3PPPA 1FTJA 3OELA 3PPRA 4Q30B 4JB7A 4YAHX 4DIGA 1DMBA 1IXIA 3RGYA 3C36A 4NE4A 4GL8A 5EYFA 2AL4A 5L9OA 4I8CA 1H76A 4BDMA 4FECA 1USYE 3LSFB 4F3GA 4ESWA 1FQEA 1IUDA 2XX7A 3FUZA 3VVEA 1LAHE 3K00A 3MWBA 2RKMA 4DE8A 3PGFA 1CE2A 4KFQA 1MXWA 3TYHA 2O51A 4GLIA 3DLNA 1XOCA 2I0CA 1MY2A 1B05A 1ZKBA 1T0KA 3RT8A 3OXNA 1ZBMA 3OOAA 4F3BA 3G3GA 1B52A 1MPDA 5JTYB 1RYXA 2G93A 3FVOA 3MZBA 5CM6A 4IGTA 3EQ1A 4RA1A 4EUOA 2AIXA 2H99A 3IB2A 4AQ4A 4OTEA 1N3WA 5JTYA 3VVDA 4HCWA 4WKMA 5ELVA 4X1DA 1N0TA 2UVJA 4OQOA 4P11A 1QKBA 1SYIA 1ZJLA 4OWDA 3HV1A 1P1NA 2OK2A 4OEUA 1PB9A 1VR5A 4YKPA 4POXA 3SKPA 3CSBA 2F6GA 1SW5A 1NH7A 2ZMBA 3TDJA 1NNPA 1A7LA 5L9SA 2DWJA 3S4UA 3M3KA 2Q2CA 3W15C 2RC9A 3G3IA 2QL3A 4IO6A 3TCHA 5H8FB 1Q35A 5I57B 1NL5A 1DPEA 5DEXA 4F1YA 5CBSA 4ZZEA 4LZ5A 3VDFA 3HSTA 5H8FA 3W9WA 2Y7RA 2Y7KA 2NOOA 1MY3A 1P1UA 3U92A 3TMGA 4LA9A 2VD2A 2XXWA 4GVOA 2E1SA 1KWHA 1MY0A 4NMYA 2XXUA 2O6AA 3MVXA 4OHNA 2F34A 1B7HA 4JSDA 1OLCA 2I4BA 3IOVA 3V8XB 1OQHA 2ONSA 3FXUA 5CBRA 3PUZE 5I58B 1B40A 4H8JA 1MM7A 3MZ1A 1BP5A 1MH4A 2F7CA 3MBPA 2PX1A 1M5CA 1YAEA 2XXQA 3SDFA 4JDFA 5CC2A 1URDA 1SYHA 4XKNA 2V93A 1R9QA 3KJ7A 2XD3A 2GHAA 3QAXA 3SEWA 1A40A 1TWYA 5I59B 5J1DA 4C1TA 3HCQA 1FQDA 2UYEA 4DXBA 3OO6A 1VFDA 2IEEA 3OENA 4ELOA 4I62A 1A99A 3WAFA 5I59A 3IORA 3G3HA 3OO8A 1P1QA 4WXJA 1A8FA 3MP8A 2UXAA 5AE4A 4OEVA 4THIA 2FYIA 3GBAA 1B51A 3TAJA 2RCBA 1XT8A 1GTKA 2VOZA 3IO6A 1M5BA 4IY6A 2QMXA 3KOTA 1TFDA 3PUYE 2OZZA 3E3KA 3UN6A 2W7YA 2F7BA 3AXFA 2I3VA 5CI5A 4OERA 4KPTA 1LB9A 1MQIA 2RC8A 1OMPA 1GV8A 1DTGA 1SW4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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